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Caracterização da droga Zeyheria montana Mart. (Bignoniaceae) e fracionamento biomonitorado de seus constituintes ativos /

Seito, Leonardo Noboru. January 2008 (has links)
Orientador: Luiz Claudio Di Stasi / Clélia Akiko Hiruma / José Mauricio Sforcin / Jairo Kenupp Bastos / João Ernesto de Carvalho / Doutor
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Agricultura tradicional e a manutenção da agrobidiversidade em comunidades rurais do município de Santo Antonio de Leverger - MT

Marchetti, Fábio Frattini [UNESP] 01 March 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-01Bitstream added on 2014-06-13T18:09:10Z : No. of bitstreams: 1 marchetti_ff_me_rcla.pdf: 1375998 bytes, checksum: b0aa7b1a2a80dbaaacc50a02e4cebfcf (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A disseminação da agricultura moderna promoveu transformações socioambientais impactantes no meio rural, desencadeando o processo de erosão genética das plantas cultivadas e consequente perda de diversidade nos agroecossistemas. Comunidades rurais, que ainda mantêm práticas e conhecimentos locais às margens da agricultura moderna, representam um importante contraponto na contemporaneidade e desempenham relevante papel na produção e diversificação de alimentos, na conservação dos recursos fitogenéticos de plantas cultivadas e, consequentemente, na segurança alimentar em escala local e global. Buscamos, por meio da abordagem etnobotânica, analisar o manejo agrícola e a diversidade intra-específica de mandioca junto aos agricultores tradicionais da Comunidade Barreirinho, em Santo Antônio do Leverger, Mato Grosso, e comparar a diversidade atual com a encontrada por Amorozo, em 1992, nas Comunidades Morro Grande (somente em 1992), Barreirinho, Varginha e Estraíra. Para a coleta dos dados foram realizados questionários socioeconômicos, inventário etnobotânico e entrevistas semi-estruturadas sobre as variedades de mandioca, além de observação participante e entrevistas abertas sobre os trabalhos agrícolas. Todas as roças foram medidas e parcelas de 40m2 foram montadas, em cada roça, para análise de abundância das variedades de mandioca. Os índices de diversidade de Brillouin (H), Shannon (H’) e Simpson (1-D) foram utilizados para se avaliar a diversidade de mandioca. Os agricultores da Comunidade Barreirinho têm idade média de 61 anos e poucos são os descendentes dos atuais agricultores que estão disponíveis e interessados em continuar as atividades agrícolas. O uso da terra tem se modificado em parte das propriedades rurais, que atualmente servem mais de moradia... / Modern agriculture dissemination cause socio-environment changes with impacts in rural areas bring about crop genetic erosion and loss of diversity in agroecosystems. Rural communities that still maintain local practices and knowledge, appears as a important counterpoint to the contemporaneity and have a relevant role in food production and diversification, crop fitogenetic resources conservation and, consequently, food security in local and global scales. We have searched through an ethnobotanical view to analyses the agricultural management and cassava‘s intraspecific diversity maintained by traditional farmers of Barreirinho Community, in the municipality of Santo Antonio do Leverger, State of Mato Grosso, as well to compare the actual diversity to that found by Amorozo, in 1992, in Morro Grande (only 1992), Barreirinho, Varginha and Estraíra communities. To collect data, socioeconomic questionnaires, ethnobotanical inventory and semi-structured interviews about cassava varieties, participant observation and open interviews about agricultural works were made. Every field area (roça) was measured and plots of 40m2 were made in each area to analyses cassava varieties abundance. Brillouin (H), Shannon (H’) and Simpson (1-D) indexes were used to assessment cassava diversity. Average age of farmers in Barreirinho is 61 years old and only few descendents of them are interested in those agricultural works. The use of the land has been modified in some properties, that are nowadays serving more as dwellings and dormitories than to food production. Furthermore, the number of farms used to leisure time has increased. 37 cassava ethnovarieties were identified in 14 farms in Barreirinho. Simpson (1-D=0.92) and Brillouin (H=1.19) indexes indicate high diversity managed by local farmers, if compared... (Complete abstract click electronic access below)
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Estudo fitoquímico e avaliação das atividades antioxidante e anticolinesterásica de Tabernaemontana catharinensis

Nicola, Carla 25 January 2013 (has links)
Tabernaemontana catharinensis ADC é uma planta arbórea da família Apocynaceae encontrada no Brasil, Argentina, Uruguai, Paraguai e Bolívia. O gênero Tabernaemontana tem despertado interesse devido à importante atividade biológica dos seus extratos, particularmente, atividade antimicrobiana, antitumoral, antioxidante, anticolinesterásica, anti-inflamatória, entre outras, as quais têm sido associadas à presença de alcalóides indólicos. Embora diversas atividades biológicas tenham sido relatadas em extratos de T. catharinensis, poucas substâncias que combinem atividade antioxidante e anticolinesterásica têm sido descritas. A associação destas propriedades pode representar uma das alternativas para estudos visando o controle de desordens neurodegenerativas como a doença de Alzheimer. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo analisar o conteúdo de alcalóides presentes em extrato etanólico e frações de T. catharinensis, assim com avaliar a sua atividade antioxidante e anticolinesterásica. A análise do extrato etanólico de T. catharinensis por espectrometria de massas permitiu identificar a presença dos alcalóides 16-epi-affinina, coronaridinahidroxiindolenina, voachalotina, voacristina-hidroxiindolenina e 12-metoxi-n-metilvoachalotina, além de um alcalóide com m/z 385,21 cujo espectro é compatível com derivado de voacristina ou voacangina. O extrato e suas frações ricas em alcalóides apresentaram atividade antioxidante, especialmente aquelas contendo o alcalóide com m/z 385,21 ou com 16-epi-affinina com capacidade de varredura de 50% do radical DPPH• da ordem de 37,18 a 74,69 μg/ml. Da mesma forma, tanto o extrato como as suas frações apresentaram atividade anticolinesterásica, sobressaindo as frações caracterizadas pela presença de 12-metoxi-n-metilvoachalotina, com IC50 de 2,1 e 2,5 μg/ml. Frações contendo 16-epi-affinina combinaram boa atividade antioxidante (IC50= 65,59 a 74,69μg/ml) e anticolinesterásica (IC50= 7,7 a 8,3 μg/ml), representando uma opção para futuras pesquisas envolvendo o tratamento de doenças neurodegenerativas. / Submitted by Marcelo Teixeira (mvteixeira@ucs.br) on 2014-06-12T11:29:28Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Carla Nicola.pdf: 1671799 bytes, checksum: 6c5dd51b8992f3e784048beed7a0039d (MD5) / Made available in DSpace on 2014-06-12T11:29:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Carla Nicola.pdf: 1671799 bytes, checksum: 6c5dd51b8992f3e784048beed7a0039d (MD5) / Tabernaemontana catharinensis A.D.C. is a small tree of the Apocynaceae family currently found in Brazil, Argentina, Uruguay, Paraguay and Bolivia. The genus Tabernaemontana has evoke interest due the important biologic activity of their extracts, particularly, antimicrobial, anti-tumoral, antioxidant, anti-cholinesterasic and anti-inflammatory activities, most of which have been associated to indolic alkaloids. Although several biological activities of T. catharinensis extracts have been reported, few substances with both antioxidant and anticholinesterasic activities have been identified. The association of these properties may represent an alternative for the studies involving the control of neurodegenerative disorders as Alzheimer disease. In this context, the present work aimed to analyze the alkaloid content of the ethanolic extract of T. catharinensis and its fractions, as well as to evaluate their antioxidant and anticholinesterasic activities. The analyses of the ethanolic extract of T. catharinensis by mass spectrometry allowed identifying the presence of the alkaloids 16-epi-affinine, coronaridine-hydroxyindolenine, voachalotine, voacristine-hydroxyindolenine, and 12- methoxy-n-methyl-voachalotine, as well as an alkaloid with m/z 385.21 which spectrum suggest a derivative of voacristine or voacangine. The extract and its alkaloid rich fractions showed antioxidant activity, especially those that contain the alkaloid m/z385.21 or 16-epi-affinine with DPPH scavenging activity (IC50) between 37.18 and 74.69 μg/ml. Moreover, the extract and its fractions exhibited anticholinesterasic activity, particularly the fractions characterized by the presence of 12-methoxy-nmethyl- voachalotine, with IC50 = 2.1 e 2.5 μg/ml. Fractions with 16-epi-affinine combined good antioxidant (IC50= 65.59 to 74.69 μg/ml) and anticholinesterasic (IC50= 7.7 to 8.3 μg/ml) activities, representing an option for further studies aimed at treating neurodegenerative diseases.
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Filogenia e biogeografia de Droseraceae inferidas a partir de caracteres morfológicos e moleculares (18S, atpB, matK, rbcL e ITS) /

Miranda, Vitor Fernandes Oliveira de. January 2006 (has links)
Resumo: A família Droseraceae está organizada taxonomicamente em quatro gêneros: Drosera L., Dionaea Ellis, Aldrovanda L. e Drosophyllum Link, sendo que estes três últimos são monotípicos. Entretanto, análises de caracteres morfológicos, anatômicos e moleculares levaram à inclusão de Drosophyllum numa nova família. O gênero Drosera está representado por aproximadamente 130 espécies, sendo a maior parte espécies perenes. As espécies podem ser encontradas em regiões temperadas e tropicais, apresentando elevado grau de endemismo, embora várias espécies sejam cosmopolitas. As relações filogenéticas de Droseraceae são pouco conhecidas, resultando em uma classificação sujeita a muitas controvérsias. As classificações propostas são conflitantes e estudos filogenéticos têm demonstrado que diversos táxons infragenéricos (subgêneros e seções) de Drosera não são monofiléticos. A obtenção de uma hipótese filogenética robusta para o grupo pode, potencialmente, resolver inúmeras questões sistemáticas para Droseraceae. O presente estudo se divide em duas partes (representadas pelos capítulos) nos quais o primeiro visa (1) verificar a posição filogenética de Droseraceae dentro de Caryophyllales s.l.; (2) verificar as relações de Aldrovanda, Dionaea e Drosera e (3) identificar a posição de Drosera (Freatulina) regia em Droseraceae. A segunda parte (segundo capítulo), por sua vez, visa elucidar as relações filogenéticas das diversas seções e subgêneros de Drosera, empregando-se dados moleculares do gene plastidial matK, dos espaçadores internos transcritos (ITS1 e ITS2) do DNA nuclear ribossomal (DNAnr), bem como o estudo de 61 caracteres morfológicos / Abstract: The family Droseraceae includes four genera: Drosera L., Dionaea Ellis, Aldrovanda L., and Drosophyllum Link, the last three of which are monotypic. However analyses of morphological, anatomical, and molecular data corroborate the exclusion of Drosophyllum to a new family. The genus Drosera includes nearly 130 species, mostly perennial. Species are found in temperate and tropical regions, with endemic and cosmopolitan distribution. There are few studies regarding phylogenetic relationships of Droseraceae, and the recent classifications are questionable. The classifications are controversial and phylogenetic studies have shown that many sections and even subgenera of Drosera are not monophyletic. The aim of this study is to obtain a robust phylogenetic hypothesis to Droseraceae. This study consists of two sections (chapters): the goals of the first chapter are (1) to analyze the relationship of Droseraceae considering Caryophyllales s.l., (2) to analyze the relationship of Aldrovanda, Dionaea, and Drosera and (3) to verify the position of Drosera (Freatulina) regia in Droseraceae; the goals of the second chapter are to analyze the phylogenetic relationships of sections and subgenera of Drosera, based on morphological (61 characters) and molecular (matK and ITS region) sequence data. Sensitivity analysis was performed using a range of analytical parameters in attempt to verify the parameter set which minimized the homoplasies in each data partition (morphological and molecular datasets). The final cladogram based on combined datasets was employed to produce an area cladogram trying to elucidate the historical events related to the distribution pattern of Droseraceae / Orientador: Antonio Furlan / Coorientador: Maurício Bacci Júnior / Banca: Marco Antonio de Assis / Banca: Reinaldo Monteiro / Banca: Fernando Portella de L. Marques / Banca: Vinícius A. de Oliveira Dittrich / Doutor
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Agricultura tradicional e a manutenção da agrobidiversidade em comunidades rurais do município de Santo Antonio de Leverger - MT /

Marchetti, Fábio Frattini. January 2012 (has links)
Orientador: Maria Christina de Mello Amorozo / Banca: Maria Antonia Carniello / Banca: Teresa Lousada Vallle / Resumo: A disseminação da agricultura moderna promoveu transformações socioambientais impactantes no meio rural, desencadeando o processo de erosão genética das plantas cultivadas e consequente perda de diversidade nos agroecossistemas. Comunidades rurais, que ainda mantêm práticas e conhecimentos locais às margens da agricultura moderna, representam um importante contraponto na contemporaneidade e desempenham relevante papel na produção e diversificação de alimentos, na conservação dos recursos fitogenéticos de plantas cultivadas e, consequentemente, na segurança alimentar em escala local e global. Buscamos, por meio da abordagem etnobotânica, analisar o manejo agrícola e a diversidade intra-específica de mandioca junto aos agricultores tradicionais da Comunidade Barreirinho, em Santo Antônio do Leverger, Mato Grosso, e comparar a diversidade atual com a encontrada por Amorozo, em 1992, nas Comunidades Morro Grande (somente em 1992), Barreirinho, Varginha e Estraíra. Para a coleta dos dados foram realizados questionários socioeconômicos, inventário etnobotânico e entrevistas semi-estruturadas sobre as variedades de mandioca, além de observação participante e entrevistas abertas sobre os trabalhos agrícolas. Todas as roças foram medidas e parcelas de 40m2 foram montadas, em cada roça, para análise de abundância das variedades de mandioca. Os índices de diversidade de Brillouin (H), Shannon (H') e Simpson (1-D) foram utilizados para se avaliar a diversidade de mandioca. Os agricultores da Comunidade Barreirinho têm idade média de 61 anos e poucos são os descendentes dos atuais agricultores que estão disponíveis e interessados em continuar as atividades agrícolas. O uso da terra tem se modificado em parte das propriedades rurais, que atualmente servem mais de moradia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Modern agriculture dissemination cause socio-environment changes with impacts in rural areas bring about crop genetic erosion and loss of diversity in agroecosystems. Rural communities that still maintain local practices and knowledge, appears as a important counterpoint to the contemporaneity and have a relevant role in food production and diversification, crop fitogenetic resources conservation and, consequently, food security in local and global scales. We have searched through an ethnobotanical view to analyses the agricultural management and cassava's intraspecific diversity maintained by traditional farmers of Barreirinho Community, in the municipality of Santo Antonio do Leverger, State of Mato Grosso, as well to compare the actual diversity to that found by Amorozo, in 1992, in Morro Grande (only 1992), Barreirinho, Varginha and Estraíra communities. To collect data, socioeconomic questionnaires, ethnobotanical inventory and semi-structured interviews about cassava varieties, participant observation and open interviews about agricultural works were made. Every field area (roça) was measured and plots of 40m2 were made in each area to analyses cassava varieties abundance. Brillouin (H), Shannon (H') and Simpson (1-D) indexes were used to assessment cassava diversity. Average age of farmers in Barreirinho is 61 years old and only few descendents of them are interested in those agricultural works. The use of the land has been modified in some properties, that are nowadays serving more as dwellings and dormitories than to food production. Furthermore, the number of farms used to leisure time has increased. 37 cassava ethnovarieties were identified in 14 farms in Barreirinho. Simpson (1-D=0.92) and Brillouin (H=1.19) indexes indicate high diversity managed by local farmers, if compared... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Estudos taxonômicos no gênero Blechnum L. (Pterophyta : blechnaceae) para as regiões sudeste e sul do Brasil /

Dittrich, Vinícius Antonio de Oliveira. January 2005 (has links)
Orientador: Reinaldo Monteiro / Banca: Alexandre Salino. / Banca: Antonio Furlan / Banca: Carlos A Sanchez Villaverde / Banca: Paulo H. Labiak Evangelista / Resumo: Foram realizados estudos taxonômicos acerca do gênero Blechnum L. nas regiões Sul e Sudeste do Brasil, como uma contribuição ao conhecimento da flora pteridofítica brasileira. São aceitos 29 táxons, sendo 24 espécies, duas subespécies, duas notoespécies e uma variedade. Quanto aos padrões de distribuição geográfica, 11 táxons são amplamente distribuídos na América Tropical, sete estão restritos ao sudeste do Brasil, cinco são amplamente distribuídos na América do Sul, três ocorrem apenas no cone sul da América do Sul, um é endêmico do Brasil central, um é encontrado nos Andes e no sudeste do Brasil e um é gonduânico. Novos registros são apresentados para alguns táxons em estados do Sul e Sudeste, em estados de outras regiões do país e para a Venezuela. São apresentadas descrições para o gênero como um todo e para as espécies, notoespécies e variedades presentes na área de estudo, principais sinônimos, lectotipificações, uma chave para determinação dos táxons infragenéricos, comentários e distribuição geográfica para cada um dos táxons e um glossário com termos específicos da pteridologia, utilizados no presente trabalho. / Abstract: It was carried out a taxonomic study of the fern genus Blechnum L. in Southern and Southeastern Brazil. Thirty taxa were accepted, of which 24 are species, two are subspecies, one is a variety and two are hybrids. The geographical distribution patterns were also analysed, showing that 11 taxa are widely distributed in Tropical America, seven are restricted to Southeastern Brazil, five are widely distributed in South America, three are exclusive to Southern South America, one is a Central Brazilian endemic, one occurs at the Andes and in Southeastern Brazil and, finally, one is gondwanic. New records are presented for several taxa in Southern and Southeastern Brazil, in other regions of the country, and in Venezuela. Taxonomic descriptions are presented for the whole genus and for all infrageneric taxa occurring at the study area as well as sinonimies, lectotypifications, a key for the identification of infrageneric taxa, comments and geographic distribution for each taxon and a glossary containing specific terms from pteridology used in the present work. / Doutor
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Reflexões sobre ciência e tecnologia e suas implicações sociais em aulas de botânica aplicada à farmacologia

Bordignon, Kione Baggio 23 February 2012 (has links)
Acompanha: Reflexões sobre ciência e tecnologia e suas implicações sociais em aulas de botânica aplicada a farmacologia / O objetivo desse estudo foi propor estratégias de ensino que estimulem a reflexão sobre ciência, tecnologia e suas implicações sociais nas aulas de Botânica Aplicada à Farmacologia no curso de Farmácia. A abordagem metodológica foi a qualitativa de natureza interpretativa. As técnicas de coleta de dados utilizadas foram anotações em diário de campo, fotografias, filmagens. Também em alguns momentos foram utilizados questionários com perguntas abertas. Participaram do estudo 23 alunos do segundo período do Curso de Farmácia da instituição de ensino superior União de Ensino do Sudoeste do Paraná – UNISEP, do município de Francisco Beltrão, estado do Paraná, na disciplina de Botânica Aplicada a Farmacologia. No decorrer do estudo houve o desenvolvimento das atividades: visita técnica ao “O Boticário”, discussões sobre ciência e tecnologia, leitura de notícias, produção do herbário institucional, confecção de folders, seminário final com apresentação para toda a comunidade acadêmica. No final do estudo, percebeu-se que os alunos evoluíram em relação as suas concepções sobre as questões sociais da ciência e da tecnologia e a influência científica e tecnológica no cotidiano das pessoas. Como produto final do estudo foi elaborado um guia didático a partir das atividades desenvolvidas, para que outros professores possam utilizá-lo como referência e/ou façam adaptações na aplicação de outros estudos. / The aim of this study was to propose teaching strategies that stimulate reflection on science, technology and its social implications in the classes of Botany Applied Pharmacology for the Pharmacy course. The methodological approach was qualitative interpretive in nature. The data collection techniques were used on field notes, photographs and films. Also in some instances, were used questionnaires with open questions. The study involved 23 students of the second period of the Course of Pharmacy institution of higher education Union of Education in southwestern Paraná - UNISEP, the municipality of Francisco Beltran, state of Paraná, in the discipline of Botany Applied Pharmacology. In the course of the study was the development of activities: technical visit to "The Apothecary", discussions on science and technology, reading news, production of the institutional herbarium, making folders, with final seminar presentation for the entire academic community. At the end of the study, it was noticed that the students have developed regarding their views on social issues of science and technology and the influence of science and technology in daily life. As a final product of the study has drawn from the teaching guide activities, so that other teachers can use it as a reference and / or make adjustments in the application of other studies.
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Reflexões sobre ciência e tecnologia e suas implicações sociais em aulas de botânica aplicada à farmacologia

Bordignon, Kione Baggio 23 February 2012 (has links)
Acompanha: Reflexões sobre ciência e tecnologia e suas implicações sociais em aulas de botânica aplicada a farmacologia / O objetivo desse estudo foi propor estratégias de ensino que estimulem a reflexão sobre ciência, tecnologia e suas implicações sociais nas aulas de Botânica Aplicada à Farmacologia no curso de Farmácia. A abordagem metodológica foi a qualitativa de natureza interpretativa. As técnicas de coleta de dados utilizadas foram anotações em diário de campo, fotografias, filmagens. Também em alguns momentos foram utilizados questionários com perguntas abertas. Participaram do estudo 23 alunos do segundo período do Curso de Farmácia da instituição de ensino superior União de Ensino do Sudoeste do Paraná – UNISEP, do município de Francisco Beltrão, estado do Paraná, na disciplina de Botânica Aplicada a Farmacologia. No decorrer do estudo houve o desenvolvimento das atividades: visita técnica ao “O Boticário”, discussões sobre ciência e tecnologia, leitura de notícias, produção do herbário institucional, confecção de folders, seminário final com apresentação para toda a comunidade acadêmica. No final do estudo, percebeu-se que os alunos evoluíram em relação as suas concepções sobre as questões sociais da ciência e da tecnologia e a influência científica e tecnológica no cotidiano das pessoas. Como produto final do estudo foi elaborado um guia didático a partir das atividades desenvolvidas, para que outros professores possam utilizá-lo como referência e/ou façam adaptações na aplicação de outros estudos. / The aim of this study was to propose teaching strategies that stimulate reflection on science, technology and its social implications in the classes of Botany Applied Pharmacology for the Pharmacy course. The methodological approach was qualitative interpretive in nature. The data collection techniques were used on field notes, photographs and films. Also in some instances, were used questionnaires with open questions. The study involved 23 students of the second period of the Course of Pharmacy institution of higher education Union of Education in southwestern Paraná - UNISEP, the municipality of Francisco Beltran, state of Paraná, in the discipline of Botany Applied Pharmacology. In the course of the study was the development of activities: technical visit to "The Apothecary", discussions on science and technology, reading news, production of the institutional herbarium, making folders, with final seminar presentation for the entire academic community. At the end of the study, it was noticed that the students have developed regarding their views on social issues of science and technology and the influence of science and technology in daily life. As a final product of the study has drawn from the teaching guide activities, so that other teachers can use it as a reference and / or make adjustments in the application of other studies.
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Utilização da espectroscopia em reflectância no infravermelho próximo para discriminação de espécies da família Myrtaceae

Mendes, Reneida Aparecida Godinho 04 April 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Departamento de Botânica, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-12-15T18:19:45Z No. of bitstreams: 1 2014_ReneidaAparecidaGodinhoMendes.pdf: 5304897 bytes, checksum: b73df79d5e99fedd8f61dab0455179a6 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2014-12-15T19:25:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_ReneidaAparecidaGodinhoMendes.pdf: 5304897 bytes, checksum: b73df79d5e99fedd8f61dab0455179a6 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-15T19:25:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_ReneidaAparecidaGodinhoMendes.pdf: 5304897 bytes, checksum: b73df79d5e99fedd8f61dab0455179a6 (MD5) / As plantas terrestres apresentam uma grande diversidade, cuja identificação e caracterização das espécies vegetais é fundamental para o conhecimento e conservação da biodiversidade. Isso demanda ferramentas complementares de identificação que são de grande importância no estudo e conservação das espécies. Com esse intuito, o potencial da espectroscopia em reflectância do infravermelho próximo (NIRS) foi avaliado para a discriminação de dezesseis espécies da família Myrtaceae, distribuídas em três tribos das dezessete existentes da subfamília Myrtoideae. As espécies estudadas foram: jambo (Syzygium jambos), pitanga (Eugenia uniflora), cagaita (Eugenia dysenterica), goiaba (Psidium guajava), jabuticaba (Myrciaria cauliflora), murta (Blepharocalyx salicifolius), jamelão (Syzygium cumini), nove espécies do gênero Eucalyptus (Eucalyptus grandis, E. urophylla, E. citriodora, E. botryoides, E. resinifera, E. pellita, E. pilularis, E. deglupta, E. brassiana). Foram adicionados três meio-irmãos de sete híbridos de Eucalyptus spp. Folhas desenvolvidas foram coletadas para todas as espécies, sendo também coletadas nos estádios iniciais e intermediários para o jambo e jamelão. As folhas foram coletadas em diferentes plantas, em oito pontos do Distrito Federal, em duas coletas nos anos de 2012 e 2013. A aquisição dos espectros foi no comprimento de onda de 1100 a 2500 nm em intervalos de 2nm. Foram analisadas um total de 194 plantas resultando 1023 espectros, de folhas moídas não-peneiradas (FMNP) e peneiradas (FMP). A análise de componente principal (PCA) agrupou as espécies após eliminação de ruído e com pré-tratamentos combinados, onde a correção do sinal multiplicativo (MSC) com a segunda derivada sempre melhorava o agrupamento. A PCA das FMP, não se mostraram melhor que das FMNP. O que dispensaria uma etapa laboriosa que é o peneiramento. Por outro lado, a análise linear discriminante (LDA) teve uma boa discriminação e identificação das espécies sem a necessidade dos pré-tratamentos e eliminação dos espectros com ruído eliminados na PCA. A predição pela LDA para as amostras não usadas no modelo, do mesmo ano, teve acurácia de 100%. O modelo da LDA com maior amostragem (682 espectros) identificou 90% das espécies coletadas no ano anterior. Folhas em diferentes estádios de desenvolvimento tiveram um agrupamento nítido por estádio na PCA. Na PCA a retirada dos estádios iniciais e intermediários permitiram uma melhor discriminação das espécies. PCA teve uma boa discriminação das espécies de eucalipto e seus híbridos analisados. A tecnologia do NIRS se mostrou eficaz para a discriminação de espécies da família Myrtaceae, devendo ser estendida para um número maior de espécies da família e de grupos externos. ______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Land plants are very diverse, with identification and characterization fundamental for both conservation and biodiversity analysis. This demands complementary identification tools that are of great importance in the study of species. With this purpose, the potential of near infrared reflectance spectroscopy (NIRS) was evaluated for discrimination of sixteen species members of the Myrtaceae family, distributed in three of the seventeen existing tribes from the subfamily Myrtoideae. The species studied were: jambo (Jambos syzygium), pitanga (Eugenia uniflora), cagaita (Eugenia dysenterica), guava (Psidium guajava), jabuticaba (Myrciaria cauliflora), murta (Blepharocalyx salicifolius), jamelão (Syzygium cumini) and nine species of Eucalyptus (Eucalyptus grandis, E. urophylla, E. citriodora , E. botryoides, E. resinifera, E. pellita, E. pilularis, E. deglupta, E. brassiana). Three half-brothers of seven hybrids of Eucaliptus spp. were also included. Developed leaves were collected for all species, as well as leaves in the initial and intermediate stages of development for jambo and jamelão. Leaves were collected from different plants at eight points in the Distrito Federal. Two collections were conducted, one in 2012 and the other in 2013. Acquisition of spectra was performed at a wavelength between 1100-2500nm at 2nm intervals. From a total of 194 plants, 1023 spectra were obtained from ground leaves, non-sieved (FMNP) and sieved (FMP). Principal component analysis (PCA) grouped the species after noise elimination and combined pretreatments, where the multiplicative signal correction (MSC) with the second derivative always improved the grouping. The PCA of the FMP were not better than those of the FMNP. This indicates that a laborious step of sieving is not necessary. On the other hand, the linear discriminant analysis (LDA) showed good discrimination and identification of species without the need of pretreatments and elimination of the noise spectra, as in PCA. The prediction by LDA for samples not used in the model, but the same year, had 100% accuracy. The LDA model with larger samples (682 spectra) identified 90% of the species collected in the previous year. Leaves at different stages of development showed a clear grouping in PCA. PCA without the initial and intermediate stages allowed a better discrimination of the species. PCA showed a good discrimination of the eucalyptus species and their hybrids. The NIRS technology was therefore effective for discriminating species of the Myrtaceae family, and should be extended to a greater number of species of the family and outside groups.
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O uso de um fragmento do marcador matk como sequência dna barcode em araceae

Cemin, Luciano Coêlho Milhomens 24 February 2012 (has links)
Tese (Doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Botânica, 2012. / Submitted by Sabrina Silva de Macedo (sabrinamacedo@bce.unb.br) on 2012-06-22T13:33:05Z No. of bitstreams: 1 2012_LucianoCoelhoMilhomensCemin.pdf: 8570536 bytes, checksum: 4b4edb3b81a616dacb859d177664b5e8 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-08-09T13:29:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_LucianoCoelhoMilhomensCemin.pdf: 8570536 bytes, checksum: 4b4edb3b81a616dacb859d177664b5e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-08-09T13:29:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_LucianoCoelhoMilhomensCemin.pdf: 8570536 bytes, checksum: 4b4edb3b81a616dacb859d177664b5e8 (MD5) / O uso de código de barras de DNA ou DNA barcodes pode, teoricamente, permitir aidentificação de qualquer material biológico portador de DNA intacto. As dificuldadesde identificação e circunscrição taxonômica, o número insuficiente de especialistas eo crescente interesse no uso e na comercialização de suas espécies fazem dasAraceae um grupo ideal para o estabelecimento de uma ferramenta de identificaçãomolecular como esta. Assim, o principal objetivo deste estudo foi avaliar aaplicabilidade e o funcionamento de um fragmento do marcador matK como códigode barras de DNA, utilizando como modelo a família Araceae. Pela primeira vezdentro de Araceae, o uso de um marcador como sequência barcode foi avaliado emgrande escala. O fragmento-alvo de matK, de aproximadamente 725pb, mostrou-sesuficientemente variável para tal tarefa, sendo capaz de recuperar, na maioria doscasos, identificações inequívocas para os diferentes gêneros e espéciesamostrados. A busca BLAST® mostrou-se mais eficiente que o método de distânciaem recuperar identificações ao nível específico (68% e 81,5%, respectivamente). Ofragmento-alvo apresentou ainda forte sinal filogenético, refletindo grande parte dasrelações entre os diferentes táxons de Araceae. Embora o fragmento-alvo apresentelimitações no reconhecimento de espécies proximamente relacionadas, osresultados obtidos apontam para uma nova circunscrição taxonômica emXanthosoma Schott, na qual as principais espécies cultivadas de taioba seriam, naverdade, uma única espécie, com marcada amplitude de variação fenotípica,alcançada tanto por processos naturais quanto pela intervenção do homem. Ofragmento-alvo de matK mostrou-se ainda como uma ferramenta capaz de procedera identificação de um táxon desconhecido, servindo como base para a descrição deum novo gênero em Araceae: Lorenzia E.G. Gonç. gen. nov. inéd., instituído pelacriação da espécie Lorenzia umbrosa E.G. Gonç. sp. nov. inéd. Finalmente, autilização de uma abordagem DNA barcoding pode, futuramente, auxiliar naconservação e o uso sustentável das espécies de Araceae. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The use of DNA barcodes can, theoretically, allow the identification of any biologicalmaterial carrier of DNA intact. The difficulties of identification and taxonomiccircumscription, the insufficient number of specialists and the growing interest in theuse and marketing of species make Araceae an ideal group for the establishment ofa molecular identification tool. Thus, the main objective of this study was to evaluatethe applicability and operation of a marker fragment of matK as a barcode DNA,using the family Araceae as a model. For the first time in the Araceae, the use of amarker as barcode sequence was evaluated on a large scale. The target fragment ofmatK, approximately 725pb, was sufficiently variable for the task, which was able torecover in most cases, unambiguous identification of different genera as well asspecies level. The BLAST® search was more efficient than the method of retrievingdistance identification specific level (68% and 81.5%, respectively). The targetfragment presented a strong phylogenetical signal, largely reflecting the relationshipsbetween different taxa of Araceae. Although the target fragment showed limitations inthe recognition of closely related species, the results suggested a new taxonomiccircumscription of Xanthosoma Schott, in which the most cultivated species of tarowere, in fact, a single species, with large phenotypical variation as a result of bothnatural processes and human intervention. The target fragment of matK was capableof identifying an unknown taxon, which was as the basis for the description of a newgenus of Araceae: Lorenzia E.G. Gonç. gen. nov. ined., established by the creationof Lorenzia umbrosa E.G. Gonç. sp. nov. ined. Finally, the use of a DNA barcodingapproach may further assist in the conservation and sustainable use of Araceaespecies.

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