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Estudos genômicos de características indicadoras de eficiência alimentar em duas populações de bovinos da raça Nelore /

Santos, Samuel Wallace Boer dos. January 2018 (has links)
Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Daniel Gustavo Mansan Gordo / Coorientador:Gerardo Alves Fernandes Júnior / Coorientador: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Ana Fabrícia Braga Magalhães / Banca: Rodrigo Pelicioni Savegnago / Resumo: Características de eficiência alimentar estão diretamente associadas com a lucratividade e sustentabilidade da bovinocultura de corte. Conversão alimentar, consumo alimentar residual, consumo de matéria seca, eficiência alimentar e ganho em peso, são características importantes para a seleção de animais mais eficientes dentro de um sistema de produção, porém, com exceção do ganho em peso, as demais não vêm sendo consideradas como critérios de seleção devido à dificuldade de obtenção de fenótipos para as mesmas. Com o avanço nas tecnologias de genotipagem e sequenciamento, foram desenvolvidos chips de alta densidade de marcadores do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphism) espalhados pelo genoma. Estas informações moleculares vêm sendo utilizadas em estudos de associação genômica ampla (GWAS) e de seleção genômica (SG). Basicamente, o GWAS permite a identificação de variações genéticas de maior efeito sobre a expressão fenotípica de características de interesse, enquanto a SG visa a predição do valor genômico direto dos candidatos à seleção utilizando apenas a informação molecular, o que tem revolucionado o melhoramento genético por proporcionar a diminuição do intervalo de geração e o aumento da acurácia de predição dos valores genéticos dos animais. Assim sendo, os objetivos do presente trabalho foram: 1) encontrar regiões cromossômicas de maior efeito sobre características de eficiência alimentar em animais Nelore provenientes de dois programas de melhoramento (Instituto d... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Feed efficiency traits are directly associated with the profitability and sustainability of beef cattle. Feed conversion rate, residual feed intake, dry matter intake, feed efficiency and average daily gain are important traits for the selection of more efficiency animals within a production system, but, except for weight gain, the others have not been considered as selection criteria due to the difficulty of obtaining phenotypes. With the advance in genotyping and sequencing technologies, high density chips of SNP (Single Nucleotide Polymorphism) have been developed. This molecular information has been used in genome-wide association (GWAS) and genomic selection (GS) studies. Basically, GWAS allows the identification of genetic variations with major effects on the phenotypic expression of traits of interest, while SG aims at the prediction of direct genomic value for the selection candidates using only their molecular information, which has revolutionized the animal breeding by providing a decrease in generation interval and increases in the prediction accuracies of breeding values. Thus, the objectives of the present study were to: 1) identify chromosomal regions with major effects on feed efficiency traits in animals from two Nellore breeding programs (Instituto de Zootecnia and Nellore Qualitas), in order to find possible differences/similarities between the populations; 2) evaluate the existence of candidate genes in common to populations; and 3) evaluate the possibility... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Efeito do tempo de confinamento sobre o desempenho, ganho em carcaça e rendimento de desossa de bovinos Nelore /

Moreira, Aline Domingues. January 2018 (has links)
Orientador: Flávio Dutra de Resende / Banca: Saulo da Luz e Silva / Banca: Otávio Rodrigues Machado Neto / Banca: João Marcos Beltrame Benatti / Banca: Laura Franco Prados / Resumo: Objetivou-se avaliar o efeito do tempo de confinamento sobre o desempenho, ganho em carcaça e rendimento de desossa (padrão brasileiro) de tourinhos Nelore. Trezentos e sessenta animais (peso inicial= 389± 33.8 kg e 26 meses de idade) foram distribuídos em 36 baias (unidade experimental) para avaliar os tempos de confinamento, que consistiram em 61, 89, 117 e 145 dias. Foram utilizadas 9 baias por tempo de confinamento. Ao final de cada tempo de confinamento todos os animais foram abatidos. O delineamento experimental foi em blocos casualizados (o peso corporal inicial foi o critério de blocagem). As médias foram comparadas por contrastes ortogonais polinomiais, linear e quadrático, sendo considerado o nível de significância de 5% de probabilidade. Ao longo dos dias de alimentação os animais não diferiram no CMS, em kg/dia, porém quando expresso em porcentagem do peso corporal observou-se redução linear no consumo, no GMD, no GMDcar e nas EA e EAc a medida que o peso corporal aumentou linearmente (P < 0,0001). Os pesos de abate foram de 498, 533, 555 e 583 kg, para 61, 89, 117 e 145 dias de confinamento, respectivamente. Foram observados ganhos de 1,28, 1,21, 1,10 e 1,01 kg de carcaça/dia. O RC, RG e peso de carcaça final apresentaram comportamento quadrátido (P < 0,0001) com o aumento nos dias de alimentação. O RG foi de 71,2, 75,4, 77,7 e 75,4 % e o peso de carcaça foi de 285, 315, 336 e 354 kg, para os respectivos tempos de confinamento. A composição química foi influencia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective was evaluate the effect of feedlot time on the Nellore young bulls performance, carcass gain and meat cust yield . Three hundred and fifty - two animals (initial body weight (BW) = 389 ± 33.8 kg and 26 months old) were assigned into 36 pens (experimental unit) where was evaluated the feedlot times, which consisted in 61, 89, 117 and 145 days. Da ta were obtained from all bulls into nine pens for each feedlot time. At the beginning of the study, nine animals were slaughtered (one representative of each weight block) to determine the initial carcass weight. The carcass daily gain was calculated as t he difference betwe en the final weight hot carcass and initial estimated by reference slaughter. Carcass gain ( CG ) expressed in percentage, is the amount of casing per unit weight gain. The datas were analized using orthogonal polynomial contrasts in a ran domized block design (blocked by initial body weight) in the SAS PROC MIXED (9.0). Significance was declared at P ≤ 0. 05 . During the feeding days the animals did not differ in the DMI, in kg / day, however when expressed as a percentage of body weight, a l inear reduction in consumption, ADG, ADG car and FE and FE c was observed as body weight increased linearly (P < 0.0001). There was a linear increase (P < 0.01) for BW with increasing feedlot time. Final body weights were 498, 533, 555 and 583 kg, in their f eedlot times. There were gains of 1.28, 1.21, 1.10 and 1.01 kg of carcass / day. The dressing percen... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Estudos de meta-análise e validação cruzada de QTLs associados com características reprodutivas em bovinos de corte de raças tropicais /

Melo, Thaise Pinto de. January 2018 (has links)
Orientador: Roberto Carvalheiro / Coorientador: Marina Rufino Salinas Fortes / Coorientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Ricardo Vieira Ventura / Banca: Yuri Tani Utsunomiya / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Gerardo Alves Fernandes Júnior / Resumo: O poder estatístico de um único estudo de associação genômica ampla (GWAS) para detectar loci de características quantitativas (QTL) é esperado ser menor do que combinando resultados de GWAS independentes de múltiplas raças, isto é, de diferentes raças, especialmente para características complexas, como as de puberdade. Utilizar populações independentes e métodos para detectar novas regiões genômicas e validar regiões previamente conhecidas como associadas com a característica de interesse em populações independentes é uma estratégia viável para identificar QTLs mais acuradamente. O objetivo deste estudo foi detectar regiões genômicas controlando características de precocidade sexual em três raças de gado de corte tropical (Nelore, Brahman e Composto Tropical - CT), utilizando duas estratégias, meta-analise utilizando diferentes raças e validação cruzada de QTL entre raças. No estudo de meta-análise as características incluídas foram idade ao primeiro parto (IPP), prenhez precoce (PP), e circunferência escrotal (CEN) medida aos 18 meses de idade no Nelore, e a idade ao surgimento do primeiro corpo lúteo (IPCL), intervalo do primeiro anestro pós-parto (IPAPP) e circunferência escrotal medida aos 18 meses de idade (CE18B) para o Brahman. A meta-análise foi realizada utilizando um método multi-característica. Um total de 108 polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) significativos a um P-valor empírico de 1.39 × 10−5 (FDR < 0.05), foram encontrados neste estudo. Tais SNP signific... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The statistical power of an individual genome-wide association study (GWAS) to detect quantitative trait loci (QTL) is expected to be lower than combining independent GWAS results from multi-breed, i.e., from different breeds, especially for complex traits, as puberty traits. Using independent populations and methods to detect new genomic regions and validate in independent populations known regions associated with the trait of interest is a feasible strategy to identify QTLs more accurately. The aim with this study was to detect genomic regions controlling sexual precocity traits across three tropical beef cattle breeds (Nellore, Brahman and Tropical Composite - TC) by using two approaches, meta-analysis using different breeds and QTL validation across different breeds. In the meta-analysis study the traits included were age at first calving (AFC), early pregnancy (EP), and scrotal circumference (SCN) measured at 18 months of age for Nellore, and age at first corpus luteum (AGECL), first postpartum anoestrus interval (PPAI), and scrotal circumference measured at 18 months of age (SC18B) for Brahman cattle. The meta-analysis was performed using a multi-trait method. A total of 108 significant single-nucleotide polymorphisms (SNPs), at an empirical threshold P-value of 1.39 × 10−5 (FDR < 0.05), were found in this study. Those significant SNP were distributed over 19 out of 29 autosomes, and the major of them were located on BTA14. In the meta-analysis study we identified five association regions harbouring the majority of the significant SNP (76%), namely: BTA2 (5.55%) from 95 to 96 Mb, BTA4 (5.55%) from 94.1 to 94.8 Mb, BTA14 (59.26%) from 24 to 25 Mb and 29 to 30 Mb, and BTA21 (5.55%) from 6.7 Mb to 11.4 Mb. In the acr... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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A genomic association and prediction of principal components of growth traits and visual scores in Nellore cattle /

Vargas, Giovana. January 2018 (has links)
Orientador: Roberto Carvalheiro / Coorientador: Danísio Prado Munari / Coorientador: Haroldo Henrique de Rezende Neves / Resumo: A análise de componentes principais (ACP) é uma técnica da estatística multivariada usada para avaliar as relações entre diferentes características a fim de eliminar a redundância resultante de suas correlações. No melhoramento genético animal, a ACP tem sido usada para explorar possíveis interpretações biológicas associadas aos componentes principais (CPs) que podem levar a caracterização de diferentes biotipos de animais. Os objetivos do presente estudo foram: i) avaliar as relações entre características de crescimento, escore visual e reprodutiva, por meio de ACP; ii) identificar, por meio de estudo de associação genômica ampla (GWAS), regiões genômicas que diferenciam os animais quanto aos diferentes componentes; e iii) avaliar a habilidade de predição de valores genéticos genômicos (GEBVs) obtidos para os CPs. Foram utilizados dados fenotípicos de 355.524 animais da raça Nelore provenientes da base de dados Aliança Nelore. Destes, foram genotipados 3.382 animais em painel lllumina® BovineHD (HD, ~777.000 SNPs) e 137 animais em painel GeneSeek Genomic Profiler Bovine HD (~76.000 SNPs). Os animais genotipados com o painel GGP-HD tiveram seus genótipos imputados para o painel mais denso (HD). Após o controle de qualidade, 3.519 animais com informações genotípicas de 471.880 SNPs permaneceram nas análises. A ACP foi realizada utilizando-se a matriz de (co)variância genética aditiva (AT) obtida a partir de análise multi-característica. As estimativas dos efeitos dos SNPs fora... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Principal component analysis (PCA) is a multivariate statistical technique that allows evaluating relationships among different traits in order to eliminate the redundancy resulting from their correlations. In animal breeding, PCA has been used to explore possible biological interpretations associated with the principal components (PCs) that can lead to the characterization of distinguished animal's biotype. The objectives of the present study were: i) to evaluate relationships among growth, visual scores, and reproductive traits by performing a PCA; ii) to identify genomic regions associated with PCs by performing a genome-wide association study (GWAS) on the main PCs; and iii) to evaluate the prediction ability of genomic breeding values (GEBVs) obtained for the PCs. Phenotypic data from 355,524 Nellore animals provided by the Alliance Nellore database, were used in this investigation. A total of 3,382 Nellore animals were genotyped using the lllumina® BovineHD chip (HD, ~777,000 SNPs) and 137 animals were genotyped using the GeneSeek Genomic Profiler Bovine HD chip (~76,000 SNPs). The GGP-HD genotypes were imputed to the HD genotypes. After genomic data quality control, 471,880 SNPs from 3,519 animals were available. The PCA was applied on the additive genetic (co)variance matrix (AT) obtained using multi-trait analysis. For GWAS, SNP effects were estimated using the weighted single-step GBLUP and the BayesC methods. The genes identified within the top-10 ranking windows that explained the highest proportion of variance were used for further functional analyses. For the genomic prediction study, the GEBVs were predicted using three distinguish response variables: EBV of the original traits, EBV of the PCs, and EBV of a selection index used by some Nellore cattle commercial breeding programs. The geno... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Estimation of genotype-environment interaction using genomic reaction norm and analysis of gene network for reproductive traits in Nellore cattle /

Mota, Lúcio Flávio Macêdo. January 2019 (has links)
Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Mário Luiz Santana Júnior / Banca: Fernando Sebastian Baldi Rey / Banca: Ana Fabrícia Braga Magalhães / Banca: Roberto Carvalheiro / Abstract: Genotype-environment (GxE) interactions could be an important source of variation in reproductive traits with a striking effect on the onset of animal puberty. Thus, the objectives of the present study were: i) to assess the GxE interaction in Nellore sexual precocity indicator traits under different environmental conditions (EC) and ii) to identify, genomic regions and biological pathways associated to Nellore sexual precocity indicator traits and to investigate whether their effects changes according to EC levels. Phenotypic records for age at first calving (AFC), heifer early pregnancy (HP), heifer rebreeding (HR) and scrotal circumference (SC) were collected on 128,994; 85,339; 90,831 and 151,053 animals, respectively. From those, 1800 heifers, 3050 young bulls, and 800 sires were genotyped with BovineHD BeadChip. A reaction norm model was used to estimate the animal's response to environmental conditions changes. To assess the predictive ability the younger scheme and environment-specific scheme were used. For genome-wide scan, the SNP effects for reproductive traits were estimated in three EC levels: Low (EC = -3.0), Medium (EC = 0.0) and High (EC = 3.0) using a linear transformation of the genomic breeding values. The pleiotropic regions associated to reproductive traits (AFC, SC, HP and HR) in three EC levels, were identified using the statistical combination of the single-trait GWAS results and considered significant when -log10(p-valor)>6.0. The inclusion of genomic... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: A interação genótipo-ambiente (GxE) pode ser uma importante fonte de variação em características reprodutivas com um efeito notável no início da puberdade animal. Desta forma, os objetivos do presente estudo foram: i) Avaliar a interação GxE em características indicadores de precocidade sexual em animais da raça Nelore em diferentes condições ambientais (EC) e ii) identificar regiões genômicas e vias biológicas associadas a características indicadores de precocidade sexual e verificar se seus efeitos mudam de acordo com os níveis de EC. Informações fenotípicas para idade ao primeiro parto (AFC), ocorrência de prenhez precoce (HP), reconcepção de novilhas (HR) e perímetro escrotal (SC), foram coletados em 128.994, 85.339, 90.831 e 151.053 animais, respectivamente. Destes, 1800 novilhas, 3050 touros jovens e 800 touros foram genotipados com BovineHD BeadChip. Um modelo de norma de reação foi usado para estimar a resposta do animal às mudanças nas condições ambientais. Para avaliar a capacidade preditiva, foram utilizados os esquemas de validação em animais jovens e em ambiente específico. Para varredura genômica ampla os efeitos dos marcadores SNP para as características reprodutivas foram estimados em três níveis de EC Baixo (EC = -3.0), Médio (EC = 0.0) e Alto (EC = 3.0) usando uma transformação linear dos valores genômicos genéticos. As regiões pleiotrópicas associadas com características reprodutivas (AFC, SC, HP e HR) em três EC foram identificadas utilizando a combinação ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor
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Diversidade genética de Anaplasma marginale em bovinos de corte no Pantanal brasileiro /

Ramos, Inalda Angélica de Souza. January 2018 (has links)
Orientador: Marcos Rogério André / Coorientador: Rosangela Zacarias Machado / Banca: Estevam Guilherme Lux Hoppe / Banca: Darci Moraes Barros-Battesti / Banca: Heitor Miraglia Herrera / Banca: Isabel Kinney Ferreira de Miranda Santos / Resumo: Poucos são os estudos acerca da diversidade genética de Anaplasma marginale nos rebanhos bovinos brasileiros, principalmente no que diz respeito a bovinos de corte. O presente estudo teve como objetivo avaliar a diversidade genética de A. marginale, com base nos genes msp1α e msp4, em Bos taurus indicus amostrados no Pantanal brasileiro. Alíquotas de sangue com e sem EDTA foram colhidas de 400 bovinos (200 vacas e 200 bezerros) em cinco propriedades de cria e recria extensiva. Enquanto as amostras de soro foram submetidas ao Ensaio Imunoenzimático Indireto (iELISA) para detecção de anticorpos IgG anti-A. marginale, amostras de sangue total foram submetidas à avaliação do hematócrito e confecção de esfregaços sanguíneos corados pelo Giemsa, PCR em tempo real quantitativa (qPCR) baseada no gene msp1β, semi-nested (sn)PCR baseada no gene msp1α e PCR convencional (cPCR) baseada no gene msp4 para A. marginale. Os produtos amplificados nos ensaios de snPCR e cPCR foram purificados e sequenciados pelo Método de Sanger. Sequências do gene msp1α foram submetidas à análise de diversidade pelo software RepeatAnalyser. Sequências do gene msp4 foram submetidas à análise de distância Network pelo software Splitstree e de genótipos pelo Software DnaSP5 e PopART. Cinco animais (duas vacas e três bezerros) apresentaram corpúsculos de A. marginale em esfregaços sanguíneos. As frequências de animais positivos pelo iELISA, qPCR e snPCR foram de 72,25% (289/400), 56,75% (227/400) e 22,9% (52/227)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: There are few studies about the genetic diversity of Anaplasma marginale in Brazilian cattle herds, especially with regard to beef cattle. The present study aimed to evaluate the genetic diversity of A. marginale based on the msp1α and msp4 genes in Bos taurus indicus, sampled in the Brazilian Pantanal. Blood aliquots with and without EDTA were collected from 400 cattle (200 cows and 200 calves) in five extensive breeding and rearing properties. While the serum samples were submitted to the Indirect Immunoenzyme Assay (iELISA) for the detection of anti-A. marginale IgG antibodies, whole blood samples were submitted to the evaluation of hematocrit and Giemsa-stained blood smears, quantitative real-time PCR (qPCR) based on the msp1β gene, semi-nested (sn) PCR based on the msp1α gene and conventional PCR (cPCR) based on the msp4 gene for A. marginale. The amplified products obtained in the snPCR and cPCR assays were purified and sequenced by the Sanger Method. Sequences of the msp1α gene were submitted to diversity analysis by the RepeatAnalyser software. msp4 gene sequences were submitted to Network distance analysis using the Splitstree software and genotypes analysis by the DnaSP5 and PopART software. Five animals (two cows and three calves) presented A. marginale corpuscles in blood smears. The frequencies of iELISA positive animals, qPCR and snPCR were 72.25% (289/400), 56.75% (227/400) and 22.9% (52/227), respectively. The iELISA and qPCR tests showed weak kappa concordance. Cows (154/200) were statistically more seropositive than calves (135/200) (P <0.05). In the qPCR, the number of calves (138/200) and mean value of quantification (1.3 x 106 copies msp1α A. marginale/μL) were higher when compared to those found for cows (89/200; 3.9 x 104) (P <0.05). The rickettsemia estimated by qPCR showed no corr... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Estimativas de parâmetros genéticos para perímetro escrotal, volume testicular e aptidão reprodutiva e de biometria testicular em uma população de bovinos compostos /

Fernandes Junior, José Antonio. January 2006 (has links)
Orientador: Paulo Henrique Franceschini / Banca: César Roberto Esper / Banca: Renato Campanarut Barnabé / Banca: Joanir Pereira Eler / Banca: Francisco Guilherme Leite / Resumo: Os objetivos do presente trabalho foram: verificar o estádio de maturação sexual em animais compostos com idade ao redor de 22 meses; determinar os parâmetros médios de biometria testicular para o composto Montana; estimar os coeficientes de herdabilidade das características perímetro escrotal ajustado para 390 (PE390) e 730 (PE730) dias de idade, volume testicular na colheita (VT) e aptidão reprodutiva (AR); e estimar as correlações genéticas das características PE390, PE730, VT e AR. Os resultados obtidos da análise de 3636 animais foram: aptidão reprodutiva aos 22 meses de idade de 66%, formato testicular tipo longo de 99%, correlação de Pearson entre perímetro escrotal e volume testicular na colheita de 0,78, herdabilidade genética para aptidão reprodutiva de 0,27 e correlação genética entre perímetro escrotal aos 390 dias de idade e volume testicular de 0,62. Desta forma foi possível concluir que: o formato testicular dos animais Montana avaliados neste estudo estão contribuindo positivamente para a adaptação destes animais ao clima tropical; a presença das raças adaptadas na composição racial deste composto deve estar influenciando decisivamente para a obtenção do formato testicular longo destes animais; a aptidão reprodutiva do Montana está muito mais próximo de animais 80S taurus primigerus indicus do que de 80S taurus primigerus taurus; a análise de regressão logística demonstrou ser extremamente importante como forma complementar e auxiliar no descarte de animais jovens, como potenciais candidatos a touros; os valores de aptidão reprodutiva neste estudo foram satisfatórios para se iniciar um trabalho de predição da aptidão reprodutiva de todos os touros. (DEPs para aptidão reprodutiva). / Abstract: The objectives of this work were: to verify the sexual maturity stage of bovine composed with age average of 22 months; to determine the parameters of testicular biometric to composed Montana; to estimate the coefficients of inheritability of the characteristics scrotal perimeter adjusted to 390 (Sp390) and 730 (SP730) days of age, testicular volume on harvest (TV) and reproductive ability (RA); and to estimate the genetic correlations of the characteristics Sp390, Sp730, TV and RA. The results obtained from the analysis of 3636 animais were: reproductive ability at 21 months of age of 66%, testicular format type long of 99%, Pearson correlation between scrotal perimeter and testicular volume on harvest of 0.78, genetic inheritability to reproductive ability of 0.27 and genetic correlation between scrotal perimeter at 390 days of age and testicular volume of 0.62. The conclusions were: the testicular format of the animais Montana are contributing positively to the adaptation of these animais to the tropical climate; the presence of races adaptated in the racial composition should be influenced decisively on the obtention of the testicular format type long of these animais; the Montana reproductive ability was closer to the animais 80S taurus primigerus indicus than the animais Bos taurus primigerus taurus; the analyse of the logistics regression demonstrated it is extremely important as a supplementary and auxiliary way on the discard of the young animais, which were potential candidates to buli; the values of reproductive ability were satisfactory to begin a work of prediction of the reproductive ability of ali bulls (DEPs to reproductive ability). / Doutor
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Associações genéticas entre características reprodutivas em bovinos da raça Guzerá /

Grupioni, Natalia Vinhal. January 2012 (has links)
Orientador: Danísio Prado Munari / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Joslaine Noely dos Santos Gonçalves Cyrillo / Resumo: Características reprodutivas e de crescimento testicular como idade ao primeiro parto (IPP), primeiro intervalo de partos (IP1), período de gestação (PG), perímetro escrotal aos 365 dias (PE365) e aos 450 dias (PE450) podem ser consideradas na avaliação da eficiência reprodutiva de bovinos de corte. Neste trabalho, o objetivo foi estimar parâmetros genéticos em bovinos da raça Guzerá para as características citadas com o intuito de fornecer subsídios para o programa de avaliação genética dos animais desta raça. A estimação dos parâmetros genéticos foi realizada pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), em modelo animal bi-característica. O modelo animal utilizado incluiu os efeitos fixos de grupos de contemporâneos para IPP, IP1, PG, PE365 e PE450, além da co-variável idade da vaca ao parto (efeitos linear e quadrático) para as características PE365 e PE450. A covariável idade ao primeiro parto (efeito linear) foi incluída no modelo animal para IP1 nas análises bi-característica, exceto entre IPP e IP1. Os efeitos aleatórios genético aditivo e residual foram considerados para todas as características. Para PG, foi considerado efeito genético aleatório materno. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,08±0,05 (IP1) a 0,48±0,11 (PG). As correlações genéticas observadas entre PE365 e IPP (-0,41±0,12) e entre PE450 e IPP (-0,23±0,14) indicaram que a seleção para perímetro escrotal, principalmente ao ano, poderá favorecer a seleção indireta de fêmeas sexualmente mais precoces. As tendências genéticas foram... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Testicular growth and reproductive traits such as age at first calving (AFC), first calving interval (CI), gestation period (GP), scrotal circumference at 365 days (SC365) and at 450 days of age (SC450) can be considered in the evaluation of reproductive efficiency in beef cattle. In this work, the goal for the aforementioned traits was to estimate genetic parameters in Guzera cattle in order to provide support for the program of genetic evaluation of animals of this breed. The genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood method (REML) in two-trait animal model. The animal model included fixed effects of contemporary groups for AFC, CI, GP, SC365 and SC450, and the covariate age of cow at calving (linear and quadratic effects) to SC365 and SC450. The covariate age at first calving (linear effect) was included in animal model for CI in two-trait analysis, except between AFC and CI. Random additive genetic and residual effects were considered for all traits. Random maternal genetic effect was considered for GP. The heritability estimates ranged from 0.08 ± 0.05 (AFC) to 0.48 ± 0.11 (GP). Genetic correlation observed between SC365 and AFC (-0.41 ± 0.12) and SC450 and AFC (-0.23 ± 0.14) indicated that selection for scrotal circumference, mainly at 365 days of age, may favor the indirect selection of females sexually earliest. Genetic trends were significant (p <0.0001) for all traits, except for the GP maternal... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Estimativa de componentes de (co)variância de características de crescimento na raça Brahman utilizando inferência bayesiana /

Acevedo Jiménez, Efraín Enrique. January 2012 (has links)
Orientador: Humberto Tonhati / Coorientador: Rusbel Raúl Aspilcueta Borquis / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Anibal Eugênio Vercesi Filho / Resumo: Este trabalho teve como objetivo estimar parâmetros genéticos para características de crescimento, utilizando-se um modelo multi-característica. Foram analisados registros de 14956 animais da raça Brahman, participantes do programa de melhoramento da raça Brahman, desenvolvido pela Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP). Por meio de inferência bayesiana foram obtidas estimativas de componentes de variância para os pesos nas idades padrão aos 60 (P60), 120 (P120), 210 (P210), 365 (P365), 450 (P450) e 550 (P550) dias. As análises foram realizadas empregando-se o software GIBBS2F90, assumindo um modelo animal. Para os pesos às idades padronizadas estudadas foram considerados os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (rebanho - ano nascimento - estação de nascimento - sexo - manejo) e idade do animal no momento da pesagem (linear e quadrático) como covariável, e os efeitos aleatórios genético aditivo direto, genético aditivo materno e residual. As estimativas de herdabilidade genética direta foram 0,31 (P60), 0,37 (P120), 0,34 (P210), 0,38 (P365), 0,37 (P450) e 0,45 (P550). As estimativas de herdabilidade genética materna foram 0,18 (P60), 0,19 (P120), 0,22 (P210), 0,14 (P365), 0,11 (P450), e 0,08 (P550). Os valores de correlação genética direta variaram de 0,79 (P60 / P450) a 0,94 (P365 / P450). Em vista dos parâmetros estimados, verifica-se que as características aqui estudadas apresentam variabilidade genética suficiente para realizar a seleção dos animais. As correlações genéticas indicam que a seleção simultânea para as características em estudo pode ser eficiente / Abstract: The objective of this work was to estimate genetic parameters for growth traits using a multiple-traits model. Were analyzed records of 14956 animals of Brahman Breed, participants of Breeding Program of Brahman cattle, developed by Breeders and Researchers National Association (ANCP). Using Bayesian inference were obtained estimations of variance components for standardized weights at 60 (W60), 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365), 450 (W450) and 550 (W550) days. Analyzes were done using Gibbs2f90 Software, assuming an animal model. For standardized weights were considered fixed effects of contemporary group (herd - birth year - birth season - sex - management) and animal age at weighting moment (linear and quadratic) as covariate, and randomized effects of direct additive genetic, maternal additive genetic and residual. Direct Heritability estimations were 0,31 (W60), 0,37 (W120), 0,34 (W210), 0,38 (W365), 0,37 (W450) and 0,45 (W550). Maternal heritability estimations were 0,18 (W60), 0,19 (W120), 0,22 (W210), 0,14 (W365), 0,11 (W450), and 0,08 (W550). Genetic correlation values varied from 0,79 (W60 / W450) a 0,94 (W365 / W450).. According estimated genetic parameters, was verified that standardized weights presented enough genetic variation for animal selection. Genetic correlations indicate that a simultaneously selection for all the traits of this study could be efficient / Mestre
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Estudo da interação genótipo-ambiente por meio de modelos de normas de reação em bovinos de corte da raça Nelore /

Bonifácio, Alexandre da Silva. January 2012 (has links)
Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Lúcia Galvão Albuquerque / Banca: Newton Tamassia Pégolo / Resumo: No presente trabalho objetivou-se verificar a interação genótipo-ambiente (IGA) e a sensibilidade ambiental em bovinos da raça Nelore, quantificando as normas de reação para os pesos ajustados aos 120 (P120), 205 (P205), 365 (P365), 450 (P450) por meio de regressão aleatória do peso sobre grupos ambientais definidos de diferentes formas. Foram utilizados dados de 437.681 animais participantes Programa de Melhoramento Genetic° da Raça Nelore (Nelore Brasil), cedidos pela ANCP (Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores). As análises foram realizadas através do software AIREML, assumindo um modelo touro, que incluiu como efeito fixo os grupos de contemporâneos e, como efeitos aleatórios, touro e resíduo. A IGA foi verificada através da magnitude da correlação genética (rg) entre os diferentes grupos ambientais. As interações foram consideradas importantes quando os valores de rg, entre os grupos ambientais, estavam abaixo de 0,80. As estimativas de herdabilidade variaram entre 0,05 e 0,28 ao longo do gradiente ambiental nos diferentes descritores ambientais estudados. Os maiores valores foram encontrados nos ambientes mais favoráveis e os menores em ambientes intermediários. Correlações genéticas de baixa magnitude obtidas entre ambientes extremos opostos menores que 0,80 indicaram importante IGA. Os resultados obtidos confirmam a importância da IGA para todas as características estudadas / Abstract: The present study aimed to verify the importance of genotype by environment interaction and environmental sensitivity in Nelore cattle, quantifying the reaction norms for weight adjusted to 120 (P120), 205 (P205), 365 (P365), 450 (P450) days of age using the environment sensitivity predicted by random regression model in different environmental groups. Data from 437,681 Nellore animals collect to Nellore Cattle Breeding Program (Nelore Brazil), assigned by the ANCP (National Association of Breeders and Researchers) were analyzed. Were considered animals raised on pasture. Analyses were performed using the software AIREML, assuming a sire model, which included the fixed effect of contemporary groups and, as random effects, sire and residual. The genotype by environment interaction between environmental groups, was measured by the genetic correlation (rg). Interactions were considered significant when values of correlation were below 0.80. Heritability estimated ranged from 0.05 to 0.28 along the environmental gradient. The highest values were found in more favorable environments. Genetic correlations of low magnitude lower than 0.80 obtained between opposite extreme environments indicated significant IGA. The results confirm the importance of genotype by environment interaction for Nellore cattle weight traits / Mestre

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