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Efeitos de agentes estressores sobre os níveis séricos de cortisol e taxa de prenhez em vacas nelore (Bos Indicus) submetidas à IATF

Algayer, Nathalie Silva January 2016 (has links)
Orientador : Prof. Dr. Paulo Rossi junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Defesa: Curitiba, 10/05/2016 / Inclui referências : f. 48-59;76-80 / Área de concentração : Nutrição e produção animal / Resumo: A pecuária de corte é uma atividade representativa no Brasil e contribui expressivamente para a economia. No entanto, os índices de produtividade estão abaixo do desejado e do potencial do país, de modo que a baixa eficiência reprodutiva do rebanho tem colaborado para isto. A dificuldade de se obter um bezerro/vaca/ano, atrelada à alta incidência de anestro pós-parto atua fortemente nesta eficiência reprodutiva insatisfatória. Assim, protocolos que buscam sincronizar o estro dos animais e aumentar a taxa de serviço, os chamados protocolos de Inseminação Artificial em Tempo Fixo (IATF), vêm sendo empregados, oferecendo inúmeras vantagens. Paralelo ao uso dos protocolos de sincronização, que buscam melhorar a eficiência reprodutiva, um fator que comprovadamente diminui a fertilidade e acontece rotineiramente na pecuária é o estresse. Os fatores liberados nesse mecanismo agem diretamente sobre o eixo hipotálamo-hipófise-gonadal, inibindo a reprodução. Os objetivos deste trabalho foram verificar se os agentes estressores que ocorrem no manejo da IATF (Inseminação Artificial em Tempo Fixo) e os níveis séricos de cortisol têm efeito sobre as taxas de prenhez em fêmeas Bos indicus. Foram utilizadas 261 vacas Bos indicus, multíparas, saudáveis, lactantes paridas (30 a 45 dias pós-parto), com idade média de 6,6 (± 1,45) anos e escore de condição corporal (ECC) entre 2,5 e 3 (na escala de 1 a 5, em que 1= muito magra e 5= muito gorda). O mesmo protocolo de IATF foi aplicado a todos os animais. Foram utilizados três inseminadores e sêmen de um único touro. O diagnóstico de gestação foi realizado de 28 a 32 dias após a inseminação, com uso de ultrassom transretal. Foram considerados agentes estressores: Tempo no Brete, Tempo no Tronco, Tempo Total, Distância Invernada Curral, Distância Curral Invernada, Distância Total Percorrida, Tempo sem Bezerro e Tempo no Curral. Para verificar se houve correlação entre o horário de coleta e os níveis de cortisol foi realizada a correlação de Spearman. O efeito dos agentes estressores sobre a probabilidade de gestação foi aferido por meio da análise de regressão logística, enquanto que o efeito dos níveis de cortisol sobre a gestação foi determinado pelo teste Mann- Whitney. Houve efeito do meio (inseminador, fazenda e mês) e do Tempo no Tronco sobre as chances de prenhez (p<0,05), de maneira que, quanto maior o Tempo no Tronco, menor a chance da prenhez. Isto mostra que esse agente estressor foi eficaz em inibir a reprodução, afetando a eficiência reprodutiva em vacas Bos indicus submetidas a um protocolo de IATF. A taxa de prenhez não foi afetada pelos níveis séricos de cortisol (p>0,05). Palavras-chave: eficiência reprodutiva; estresse; IATF; manejo no curral; reprodução; tempo no tronco. / Abstract: The beef cattle livestock is a representative activity in Brazil and contributes significantly to the economy. However, productivity rates are below desired and below the potential of the country, so that the herd's low reproductive efficiency has contributed to this. The difficulty of obtaining a calf / cow / year, linked to the high incidence of postpartum anestrus acts strongly on this poor reproductive efficiency. Therefore, the protocols that seek synchronize the animals estrus and increase the service charge, the so called protocols of Fixed-Time Artificial Insemination (FTAI), have been employed, offering numerous advantages. Parallel to the use of synchronization protocols which seek the improvement of the reproductive efficiency, a proven factor that decreases the fertility and happens routinely in livestock is stress. The factors released in this mechanism act directly on the hypothalamic-pituitary-gonadal axis by inhibiting the reproduction. The objectives of this work were to verify if the stressing agents occurring during the handling of the Fixed-Time Artificial Insemination (FTAI) and the serum cortisol levels have an effect on the pregnancy rate of female Bos indicus. There were used 261 suckling cows Bos indicus (30 to 45 days postpartum), multiparous, healthy, with ages averaging 6.6 (± 1.45) years and with body condition score between 2.5 and 3 (in the scale of 1 to 5, in which 1=very thin and 5=very fat). The same FTAI protocol was applied to all animals. Three inseminators and the semen of one only bull were used. The pregnancy diagnosis was made by transrectal ultrasonography 28 to 32 days after the insemination. The following stressing agents were considered: time in the pen, time in the chute, total time, distance between pasture and corral, distance between corral and pasture, time without calf, time in the corral. The Spearman correlation was used to verify if there was a relation between the collection time and the cortisol levels. The effect of the stressing agents on the pregnancy probability was measured by logistic regression analysis, while the effect of the cortisol levels on pregnancy was determined by the Mann-Whitney test. There was an effect of the means (inseminator, farm and month) and the time in the chute on the pregnancy rates (p<0.05), in a way that the longer the time in the chute, the smaller the pregnancy rate. This shows that the time in the chute was able to inhibit the reproduction, affecting the reproductive efficiency of Bos indicus cows subjected to a FTAI protocol. The pregnancy rate was not affected by the serum cortisol levels (p>0.05). Keywords: FTAI; handling in the corral; reproduction; reproductive efficiency; stress; time in the squeeze chute.
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Interação genótipo ambiente sobre características reprodutivas de fêmeas da raça Nelore /

Ferrari, Fabio Borba. January 2012 (has links)
Orientador: Lúcia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Resumo: As características reprodutivas são as principais determinantes da eficiência biológica e econômica dos sistemas de produção de carne bovina. Do ponto de vista econômico, na bovinocultura de corte, a eficiência reprodutiva é a característica mais importante, seguida das características de crescimento e, por último, das características de carcaça. Além desses aspectos, as características reprodutivas também influenciam o ganho genético ou resposta à seleção, pois estão relacionadas à intensidade de seleção.Os objetivos deste trabalho foram verificar a presença de interação genótipo - ambiente (IGA) para idade ao primeiro parto (IPP) e para dias para o primeiro parto (DPP) em rebanhos de bovinos da raça Nelore criados a pasto em diferentes condições ambientais utilizando modelos de normas de reação. Foram utilizados dados de idade ao primeiro parto e dias para o primeiro parto de 27.448 fêmeas da raça Nelore, filhas de 647 touros, e nascidas entre 1984 a 2005, pertencentes a 29 rebanhos que participam do Programa de Melhoramento Genético da Conexão Delta G. No modelo de normas de reação, os componentes de variâncias e valores genéticos são regredidos sobre alguma característica ou indicador de variabilidade ambiental (gradiente ambiental). Para a formação dos gradientes ambientais (GA), foram consideradas as variáveis de fazenda (nascimento e sobreano), estação de nascimento (verão; outono; inverno; primavera) e grupo de manejo (ao nascimento, a desmama e ao sobreano). Posteriormente, os GA com médias de ganho de peso pós-desmama semelhantes foram agrupadas em oito classes. O modelo incluiu o efeito genético aditivo direto como efeito aleatório e, como fixo, o grupo de contemporâneos (GC). O software WOMBAT foi utilizado para realizar as analises para as... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this study were to verify the presence of genotype-environment interaction for age at first calving (AFC) and days to the first calving (DFC) in Nelore cattle raised on pasture under differents environmental conditions. Data for age at first calving and days to the first calving from 27,448 Nelore females, daughters of 647 bulls and born between 1984 to 2005, belonging to 29 participating herds in the Program for Genetic Improvement Conexão Delta G. In the model of reaction norms, the variance components and breeding values are regressed on some characteristics or environmental variability indicator (environmental gradient). For the formation of the environmental gradients (EG), the variables farm (birth and yeaning), birth season (summer, autumn, winter and spring) and management group ( birth, weaning and yearling) were considered . Subsequently, the EG with similar mean post-weaning weight gain were grouped into eight classes. The model included the direct genetic effect as random effect and as fixed the contemporary group (CG). The WOMBAT software was used to perform the analysis for AFC and DFC, using an animal model, which includes as fixed effect the contemporary group and as random the animal and residual, while for DFC the model included as fixed effects the contemporary group, type of service, calf sex and variable qualifying the sexual precocity of females (early/late) and as random the animal and residual. The CG was formed by the farm (birth and yeaning), birth season (summer, autumn, winter and spring) and management group (birth, weaning and yearling). In the random regression analysis (reaction norms), we used linear Legendre polynomials, regressed on the post-weaning weight gain adjusted for each class of EG (eight classes). Linear Legendre polynomials were also... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Associação entre polimorfismos de base única e precocidade sexual em fêmeas da raça Nelore /

Regatieri, Inaê Cristina. January 2013 (has links)
Orientador: Lúcia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Arione Augusti Boligon / Banca: Fernando Sebástian Baldi Rey / Banca: Simone Cristina Méo Niciura / Resumo: As características reprodutivas estão relacionadas à eficiência econômica e à produtividade dos sistemas de criação de bovinos. A idade ao primeiro parto (IPP) e a ocorrência de prenhez precoce (OP) são empregadas em sistemas de melhoramento genético com a finalidade de antecipar a vida reprodutiva dos animais. A medida (r²) de desequilíbrio de ligação (LD) é empregada em estudos de associação genômica, para detecção de marcadores genéticos e genes que influenciam características quantitativas (quantitative trait loci: QTL). O objetivo deste estudo foi determinar o grau de desequilíbrio de ligação no genoma de fêmeas da raça Nelore e verificar a existência de associações entre polimorfismos de base única (SNP) e as características IPP e OP, utilizando um painel de SNPs de alta densidade. Foram utilizadas 1.182 fêmeas da raça Nelore nascidas em 2007 e 2008, pertencentes à Agropecuária Jacarezinho LTDA. Foram formados 13 grupos de contemporâneas (GC) constituídos por fazenda, estação e ano de nascimento, com média de 90 animais por grupo. Para o estudo de associação genômica, foram excluídos SNPs que apresentaram frequência do alelo menor (MAF) inferior a 0,05 e animais com Call Rate menor que 0,90, totalizando 431.885 SNPs. Para as análises estatísticas, foi utilizado um modelo linear para IPP e um modelo de limiar para OP. Para a estimativa da significância das associações, em ambas as características, o modelo incluiu como efeitos fixos classificatórios, o GC e os SNPs. Para estimativa do efeito de substituição alélica, foi utilizado o mesmo modelo considerando os SNPs como covariável. A correção de Bonferroni foi aplicada para ajustar o limite de significância (1,16x10-7). A média de LD (r²) para todos os autossomos foi de 0,18, a uma distância média de 4,8 kb, e a média da MAF foi de 0,25 ± 0,13... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Reproductive traits are related to economic efficiency and productivity of cattle systems. Age at first calving (AFC) and occurrence of early pregnancy (OP) are used in beef breeding programs in order to anticipate the reproductive life. The measure (r²) of linkage disequilibrium (LD) is used in genome wide association studies to detect genetic markers and genes affecting quantitative traits (QTL). The aim of this study was to determine the extent of LD in the genome of Nellore cattle, and examine associations between single nucleotide polymorphisms (SNP) and AFC and OP, using a panel of high-density SNPs. Data from 1.182 Nellore born in 2007 and 2008, belonging to Agropecuária Jacarezinho were used. A total of 13 contemporary groups (CG) consisting of farm, season and year of birth, with an average of 90 animals per CG were formed. For genomic-wide association, SNPs with minor allele frequency (MAF) below 0.05, and animals with Call Rate below 0.90 were excluded, totaling 431,885 SNPs. For the statistics analyses, a linear model was used for IPP and a threshold model was used for OP. To estimate the significance of the associations, for both traits, the model included the classificatory fixed effects of GC and SNPs (0,1, and 2). To estimate the allelic substitution effect, the same model was used, considering the SNP effects as covariable. The Bonferroni correction was applied to adjust the limit of significance (1.16 x10-7). The average r ² for all autosomes was 0.18 at a distance of 4.8 kb and the average MAF was 0.25 ± 0.13. The LD decreased as the distance between markers increased: 0.35 (1 kb) to 0.12 (100 kb). Eleven significant associations were detected in seven different chromosomes (BTA1, BTA4, BTA6, BTA11, BTA17, BTA21, and BTA22). Among these, seven SNPs were associated with AFC and four were linked to the OP. Three SNPs were significant for both traits... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Associações genéticas entre características reprodutivas em bovinos da raça Guzerá /

Grupioni, Natalia Vinhal. January 2012 (has links)
Orientador: Danísio Prado Munari / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Joslaine Noely dos Santos Gonçalves Cyrillo / Resumo: Características reprodutivas e de crescimento testicular como idade ao primeiro parto (IPP), primeiro intervalo de partos (IP1), período de gestação (PG), perímetro escrotal aos 365 dias (PE365) e aos 450 dias (PE450) podem ser consideradas na avaliação da eficiência reprodutiva de bovinos de corte. Neste trabalho, o objetivo foi estimar parâmetros genéticos em bovinos da raça Guzerá para as características citadas com o intuito de fornecer subsídios para o programa de avaliação genética dos animais desta raça. A estimação dos parâmetros genéticos foi realizada pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), em modelo animal bi-característica. O modelo animal utilizado incluiu os efeitos fixos de grupos de contemporâneos para IPP, IP1, PG, PE365 e PE450, além da co-variável idade da vaca ao parto (efeitos linear e quadrático) para as características PE365 e PE450. A covariável idade ao primeiro parto (efeito linear) foi incluída no modelo animal para IP1 nas análises bi-característica, exceto entre IPP e IP1. Os efeitos aleatórios genético aditivo e residual foram considerados para todas as características. Para PG, foi considerado efeito genético aleatório materno. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,08±0,05 (IP1) a 0,48±0,11 (PG). As correlações genéticas observadas entre PE365 e IPP (-0,41±0,12) e entre PE450 e IPP (-0,23±0,14) indicaram que a seleção para perímetro escrotal, principalmente ao ano, poderá favorecer a seleção indireta de fêmeas sexualmente mais precoces. As tendências genéticas foram... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Testicular growth and reproductive traits such as age at first calving (AFC), first calving interval (CI), gestation period (GP), scrotal circumference at 365 days (SC365) and at 450 days of age (SC450) can be considered in the evaluation of reproductive efficiency in beef cattle. In this work, the goal for the aforementioned traits was to estimate genetic parameters in Guzera cattle in order to provide support for the program of genetic evaluation of animals of this breed. The genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood method (REML) in two-trait animal model. The animal model included fixed effects of contemporary groups for AFC, CI, GP, SC365 and SC450, and the covariate age of cow at calving (linear and quadratic effects) to SC365 and SC450. The covariate age at first calving (linear effect) was included in animal model for CI in two-trait analysis, except between AFC and CI. Random additive genetic and residual effects were considered for all traits. Random maternal genetic effect was considered for GP. The heritability estimates ranged from 0.08 ± 0.05 (AFC) to 0.48 ± 0.11 (GP). Genetic correlation observed between SC365 and AFC (-0.41 ± 0.12) and SC450 and AFC (-0.23 ± 0.14) indicated that selection for scrotal circumference, mainly at 365 days of age, may favor the indirect selection of females sexually earliest. Genetic trends were significant (p <0.0001) for all traits, except for the GP maternal... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Sincronização do estro e da ovulação após prévio uso de progesterona intravaginal e gonadotrofina coriônica equina em bovinos de corte visando à inseminação artificial em tempo fixo = Timing and ovulation estro after prior use of progesterone intravaginal and equine chorionic gonadotropin (eCG) in beef cattle aiming to fixed-time artificial insemination / Francisco Romano Gaievski ; orientador, Luiz H. Kozicki / Timing and ovulation estro after prior use of progesterone intravaginal and equine chorionic gonadotropin (eCG) in beef cattle aiming to fixed-time artificial insemination

Gaievski, Francisco Romano January 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2012 / Bibliografia: f.26-30 / A diversidade e grandiosidade da pecuária Brasileira revelam enormes contrastes e particularidades, seja nas tecnologias adotadas, nos rebanhos existentes, na topografia, na mão de obra e no clima, que ocorrem em um país com dimensões continentais. Dentre / The diversity and grandiosity of Brazilian?s livestock, reveals giants contrasts and particularities, at adopted technology, existing herds, topography, labor force and weather that occur in a country with continental dimensions. Among the production fact
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Sincronização do estro e da ovulação após prévio uso de progesterona intravaginal e gonadotrofina coriônica equina em bovinos de corte visando à inseminação artificial em tempo fixo = Timing and ovulation estro after prior use of progesterone intravaginal and equine chorionic gonadotropin (eCG) in beef cattle aiming to fixed-time artificial insemination / Francisco Romano Gaievski ; orientador, Luiz H. Kozicki / Timing and ovulation estro after prior use of progesterone intravaginal and equine chorionic gonadotropin (eCG) in beef cattle aiming to fixed-time artificial insemination

Gaievski, Francisco Romano January 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2012 / Bibliografia: f.26-30 / A diversidade e grandiosidade da pecuária Brasileira revelam enormes contrastes e particularidades, seja nas tecnologias adotadas, nos rebanhos existentes, na topografia, na mão de obra e no clima, que ocorrem em um país com dimensões continentais. Dentre / The diversity and grandiosity of Brazilian?s livestock, reveals giants contrasts and particularities, at adopted technology, existing herds, topography, labor force and weather that occur in a country with continental dimensions. Among the production fact
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Avaliação da reatividade de bovinos de corte e sua relação com caracteres reprodutivos e produtivos

Aguilar, Natalia Maria Alejandra [UNESP] 28 February 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-28Bitstream added on 2014-06-13T19:53:09Z : No. of bitstreams: 1 aguilar_nma_me_jabo.pdf: 405095 bytes, checksum: dee9eb8b1fa4fba95c652da707f4b2e0 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Secretaria General de Ciência Y Tecnica (Secyt) / O objetivo de nosso estudo foi de compreender a característica reatividade e seus efeitos sob características produtivas e reprodutivas de rebanhos de bovinos de corte. Com este propósito foram desenvolvidos dois trabalhos. O primeiro, avaliando a reatividade de 149 bovinos pelo método de escore de agitação na balança (EA), durante a pesagem e após o manejo de rotina. Os dados analisados pelo procedimento multivariado de ACM (Análise de Correspondência Múltipla). Os resultados indicaram que os componentes deslocamento (DESL) e tensão (TEN) dos escores de reatividade são os que mais contribuem na formação dos EA. O peso final (PF) foi ligeiramente associado à reatividade. Também foi encontrada alguma diferença na expressão de reatividade pelo tipo racial entre as novilhas. Ao analisar a expressão da reatividade em bezerros observou-se que existe instabilidade na expressão entre machos e fêmeas. Ao considerar o sexo em novilhos, novilhas e bezerros observaram-se uma tendência das fêmeas serem mais calmas que os machos. No segundo trabalho foram avaliadas 297 fêmeas de raça Nelore, por dois métodos: escore de agitação (EA: aplicado com as fêmeas contidas na balança ou no tronco de contenção) e teste de velocidade da saída (VS: com utilização de um equipamento que mede a velocidade de saída do animal após contenção). Os dados analisados pelo procedimento GLM do SAS, com dois modelos estatísticos: 1) para as variáveis dependentes EA, DESL (deslocamento), TEN (tensão) e RESP (respiração), considerando como efeito fixo idade do animal e local de avaliação (balança e tronco), 2) para EA, considerando como efeito fixo categoria animal (novilha e vaca) e tipo de manejo (invasivo e não invasivo); as médias foram comparadas pelo teste de Tukey... / Reactivity most probably influences the productive of bovine beef cattle, affecting therefore its final performance. The objectives of this study were to interpret the influence of the reactivity on productive traits of beef cattle and also how this characteristic is influenced by the animal category. For this purpose, 149 bovine animais were studied, among them female and male of weaning calves, steers and heifers (averaging in between 7 to 14 months). The reactivity was evaluated by the agitation score method, when the animais were inside a weighing crate (EA), for weighing. Data were examined through the multivariate statistical proceedings of the ACM (Multiple Correspondence Analysis). Results indicated that the components DESL and TEN of the reactivity scores surely contribute to the formation of the EA scores. The final weight was lightly related to the reactivity, with high PF being related to less reactive animais, medium PF to more reactive animais and low PF to animais with score 2 for TEN. The animal categories presented low relationship with the reactivity, with calm animais presenting a tendency to present a better performance, and vice-versa. Also, it was found out some differences in the expression of the reactivity according to the breed of heifers. The analyses calves reactivity showed some instability, for both, males and females. Considering the sex in both steers, heifers and calves, it was observed that the females were quieter than males. The results of this study evidenced that cattle performance is influenced by its reactivity, and therefore, both category and sex have effects on the expression of the reactivity.
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Associação entre polimorfismos de base única e precocidade sexual em fêmeas da raça Nelore

Regatieri, Inaê Cristina [UNESP] 28 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-06-13T18:54:02Z : No. of bitstreams: 1 regatieri_ic_me_jabo.pdf: 347561 bytes, checksum: 0ceedd7351a78c3c74de3d03c22faae1 (MD5) / As características reprodutivas estão relacionadas à eficiência econômica e à produtividade dos sistemas de criação de bovinos. A idade ao primeiro parto (IPP) e a ocorrência de prenhez precoce (OP) são empregadas em sistemas de melhoramento genético com a finalidade de antecipar a vida reprodutiva dos animais. A medida (r²) de desequilíbrio de ligação (LD) é empregada em estudos de associação genômica, para detecção de marcadores genéticos e genes que influenciam características quantitativas (quantitative trait loci: QTL). O objetivo deste estudo foi determinar o grau de desequilíbrio de ligação no genoma de fêmeas da raça Nelore e verificar a existência de associações entre polimorfismos de base única (SNP) e as características IPP e OP, utilizando um painel de SNPs de alta densidade. Foram utilizadas 1.182 fêmeas da raça Nelore nascidas em 2007 e 2008, pertencentes à Agropecuária Jacarezinho LTDA. Foram formados 13 grupos de contemporâneas (GC) constituídos por fazenda, estação e ano de nascimento, com média de 90 animais por grupo. Para o estudo de associação genômica, foram excluídos SNPs que apresentaram frequência do alelo menor (MAF) inferior a 0,05 e animais com Call Rate menor que 0,90, totalizando 431.885 SNPs. Para as análises estatísticas, foi utilizado um modelo linear para IPP e um modelo de limiar para OP. Para a estimativa da significância das associações, em ambas as características, o modelo incluiu como efeitos fixos classificatórios, o GC e os SNPs. Para estimativa do efeito de substituição alélica, foi utilizado o mesmo modelo considerando os SNPs como covariável. A correção de Bonferroni foi aplicada para ajustar o limite de significância (1,16x10-7). A média de LD (r²) para todos os autossomos foi de 0,18, a uma distância média de 4,8 kb, e a média da MAF foi de 0,25 ± 0,13... / Reproductive traits are related to economic efficiency and productivity of cattle systems. Age at first calving (AFC) and occurrence of early pregnancy (OP) are used in beef breeding programs in order to anticipate the reproductive life. The measure (r²) of linkage disequilibrium (LD) is used in genome wide association studies to detect genetic markers and genes affecting quantitative traits (QTL). The aim of this study was to determine the extent of LD in the genome of Nellore cattle, and examine associations between single nucleotide polymorphisms (SNP) and AFC and OP, using a panel of high-density SNPs. Data from 1.182 Nellore born in 2007 and 2008, belonging to Agropecuária Jacarezinho were used. A total of 13 contemporary groups (CG) consisting of farm, season and year of birth, with an average of 90 animals per CG were formed. For genomic-wide association, SNPs with minor allele frequency (MAF) below 0.05, and animals with Call Rate below 0.90 were excluded, totaling 431,885 SNPs. For the statistics analyses, a linear model was used for IPP and a threshold model was used for OP. To estimate the significance of the associations, for both traits, the model included the classificatory fixed effects of GC and SNPs (0,1, and 2). To estimate the allelic substitution effect, the same model was used, considering the SNP effects as covariable. The Bonferroni correction was applied to adjust the limit of significance (1.16 x10-7). The average r ² for all autosomes was 0.18 at a distance of 4.8 kb and the average MAF was 0.25 ± 0.13. The LD decreased as the distance between markers increased: 0.35 (1 kb) to 0.12 (100 kb). Eleven significant associations were detected in seven different chromosomes (BTA1, BTA4, BTA6, BTA11, BTA17, BTA21, and BTA22). Among these, seven SNPs were associated with AFC and four were linked to the OP. Three SNPs were significant for both traits... (Complete abstract click electronic access below)
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Associações genéticas entre características reprodutivas em bovinos da raça Guzerá

Grupioni, Natalia Vinhal [UNESP] 29 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-29Bitstream added on 2014-06-13T20:14:39Z : No. of bitstreams: 1 grupioni_nv_me_jabo.pdf: 221088 bytes, checksum: 685a9df392d2aa5d8eb3645175fa9508 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Características reprodutivas e de crescimento testicular como idade ao primeiro parto (IPP), primeiro intervalo de partos (IP1), período de gestação (PG), perímetro escrotal aos 365 dias (PE365) e aos 450 dias (PE450) podem ser consideradas na avaliação da eficiência reprodutiva de bovinos de corte. Neste trabalho, o objetivo foi estimar parâmetros genéticos em bovinos da raça Guzerá para as características citadas com o intuito de fornecer subsídios para o programa de avaliação genética dos animais desta raça. A estimação dos parâmetros genéticos foi realizada pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), em modelo animal bi-característica. O modelo animal utilizado incluiu os efeitos fixos de grupos de contemporâneos para IPP, IP1, PG, PE365 e PE450, além da co-variável idade da vaca ao parto (efeitos linear e quadrático) para as características PE365 e PE450. A covariável idade ao primeiro parto (efeito linear) foi incluída no modelo animal para IP1 nas análises bi-característica, exceto entre IPP e IP1. Os efeitos aleatórios genético aditivo e residual foram considerados para todas as características. Para PG, foi considerado efeito genético aleatório materno. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,08±0,05 (IP1) a 0,48±0,11 (PG). As correlações genéticas observadas entre PE365 e IPP (-0,41±0,12) e entre PE450 e IPP (-0,23±0,14) indicaram que a seleção para perímetro escrotal, principalmente ao ano, poderá favorecer a seleção indireta de fêmeas sexualmente mais precoces. As tendências genéticas foram... / Testicular growth and reproductive traits such as age at first calving (AFC), first calving interval (CI), gestation period (GP), scrotal circumference at 365 days (SC365) and at 450 days of age (SC450) can be considered in the evaluation of reproductive efficiency in beef cattle. In this work, the goal for the aforementioned traits was to estimate genetic parameters in Guzera cattle in order to provide support for the program of genetic evaluation of animals of this breed. The genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood method (REML) in two-trait animal model. The animal model included fixed effects of contemporary groups for AFC, CI, GP, SC365 and SC450, and the covariate age of cow at calving (linear and quadratic effects) to SC365 and SC450. The covariate age at first calving (linear effect) was included in animal model for CI in two-trait analysis, except between AFC and CI. Random additive genetic and residual effects were considered for all traits. Random maternal genetic effect was considered for GP. The heritability estimates ranged from 0.08 ± 0.05 (AFC) to 0.48 ± 0.11 (GP). Genetic correlation observed between SC365 and AFC (-0.41 ± 0.12) and SC450 and AFC (-0.23 ± 0.14) indicated that selection for scrotal circumference, mainly at 365 days of age, may favor the indirect selection of females sexually earliest. Genetic trends were significant (p <0.0001) for all traits, except for the GP maternal... (Complete abstract click electronic access below)
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Interação genótipo ambiente sobre características reprodutivas de fêmeas da raça Nelore

Ferrari, Fábio Borba [UNESP] 17 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-17Bitstream added on 2014-06-13T19:33:23Z : No. of bitstreams: 1 ferrari_fb_me_jabo.pdf: 288487 bytes, checksum: c949a26a1bf54b00648136a7fc851cf1 (MD5) / As características reprodutivas são as principais determinantes da eficiência biológica e econômica dos sistemas de produção de carne bovina. Do ponto de vista econômico, na bovinocultura de corte, a eficiência reprodutiva é a característica mais importante, seguida das características de crescimento e, por último, das características de carcaça. Além desses aspectos, as características reprodutivas também influenciam o ganho genético ou resposta à seleção, pois estão relacionadas à intensidade de seleção.Os objetivos deste trabalho foram verificar a presença de interação genótipo – ambiente (IGA) para idade ao primeiro parto (IPP) e para dias para o primeiro parto (DPP) em rebanhos de bovinos da raça Nelore criados a pasto em diferentes condições ambientais utilizando modelos de normas de reação. Foram utilizados dados de idade ao primeiro parto e dias para o primeiro parto de 27.448 fêmeas da raça Nelore, filhas de 647 touros, e nascidas entre 1984 a 2005, pertencentes a 29 rebanhos que participam do Programa de Melhoramento Genético da Conexão Delta G. No modelo de normas de reação, os componentes de variâncias e valores genéticos são regredidos sobre alguma característica ou indicador de variabilidade ambiental (gradiente ambiental). Para a formação dos gradientes ambientais (GA), foram consideradas as variáveis de fazenda (nascimento e sobreano), estação de nascimento (verão; outono; inverno; primavera) e grupo de manejo (ao nascimento, a desmama e ao sobreano). Posteriormente, os GA com médias de ganho de peso pós-desmama semelhantes foram agrupadas em oito classes. O modelo incluiu o efeito genético aditivo direto como efeito aleatório e, como fixo, o grupo de contemporâneos (GC). O software WOMBAT foi utilizado para realizar as analises para as... / The objective of this study were to verify the presence of genotype-environment interaction for age at first calving (AFC) and days to the first calving (DFC) in Nelore cattle raised on pasture under differents environmental conditions. Data for age at first calving and days to the first calving from 27,448 Nelore females, daughters of 647 bulls and born between 1984 to 2005, belonging to 29 participating herds in the Program for Genetic Improvement Conexão Delta G. In the model of reaction norms, the variance components and breeding values are regressed on some characteristics or environmental variability indicator (environmental gradient). For the formation of the environmental gradients (EG), the variables farm (birth and yeaning), birth season (summer, autumn, winter and spring) and management group ( birth, weaning and yearling) were considered . Subsequently, the EG with similar mean post-weaning weight gain were grouped into eight classes. The model included the direct genetic effect as random effect and as fixed the contemporary group (CG). The WOMBAT software was used to perform the analysis for AFC and DFC, using an animal model, which includes as fixed effect the contemporary group and as random the animal and residual, while for DFC the model included as fixed effects the contemporary group, type of service, calf sex and variable qualifying the sexual precocity of females (early/late) and as random the animal and residual. The CG was formed by the farm (birth and yeaning), birth season (summer, autumn, winter and spring) and management group (birth, weaning and yearling). In the random regression analysis (reaction norms), we used linear Legendre polynomials, regressed on the post-weaning weight gain adjusted for each class of EG (eight classes). Linear Legendre polynomials were also... (Complete abstract click electronic access below)

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