Submitted by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2017-06-20T18:39:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) RODRIGO SANTOS DA SILVA.pdf: 820325 bytes, checksum: 6786b39416cadf53b4a9f31fca57c924 (MD5) / Approved for entry into archive by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2017-06-20T18:40:30Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) RODRIGO SANTOS DA SILVA.pdf: 820325 bytes, checksum: 6786b39416cadf53b4a9f31fca57c924 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-20T18:40:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) RODRIGO SANTOS DA SILVA.pdf: 820325 bytes, checksum: 6786b39416cadf53b4a9f31fca57c924 (MD5) Previous issue date: 2017-05-15 / O objetivo do presente trabalho foi comparar o desempenho bioeconômico simulado de três sistemas de manejo reprodutivo para bovinos de corte. Para a presente simulação utilizou-se como parâmetro um rebanho de 1.300 fêmeas Bos taurus taurus e Bos taurus indicus (novilhas e vacas multíparas), submetidas a três diferentes cenários: 1- monta natural (MN); 2- inseminação artificial em tempo fixo (IATF) seguida de repasse com touros; 3- inseminação artificial com detecção de estro e em tempo fixo (IAETF) seguida de repasse com touros. Primeiramente foi realizada a compilação dos dados de artigos científicos envolvendo protocolos de inseminação artificial (IATF e IAETF) e monta natural relativo ao percentual de prenhez obtido em cada grupo para as categorias de novilhas e vacas multíparas. A partir da compilação dos resultados já publicados e o somatório de animais e respectivas prenhes obteve-se para o grupo MN a média ponderada de prenhez de 83,7%, já para o grupo IATF+MN a média ponderada foi de 90,1% e para o grupo IAETF+MN foi de 91,7%. Considerando-se os percentuais obtidos na simulação, perdas (8% entre morte embrionária e abortos e 2,5% pós-nascimento) e custos chegou-se aos resultados produtivos, que foram de 171.512,07 (MN), 258.089,62 (IATF+MN) e 278.616,06 (IAETF+MN) Kg de bezerros desmamados. O custo para implantação de cada manejo na propriedade foi de R$ 209.092,00, R$ 168.521,72 e R$ 164.169,17 e o lucro bruto de R$ 785.678,00, R$ 1.328.398,05 e R$ 1.451.803,94 para os manejos de MN, IATF+MN e IAETF+MN, respectivamente. A comparação econômica entre os grupos MN e IATF gerou vantagem econômica de 40,9% em prol da IATF que corresponde a R$ 542.720,05. Quando foi comparada a MN versus IAETF a superioridade de retorno econômico em prol do segundo grupo foi de 45,8%, correspondendo a R$ 666.125,94. Portanto, tanto a IATF+MN quanto a IAETF+MN mostraram-se ferramentas úteis para incrementar o retorno econômico através da venda de mais Kg de bezerros desmamados, apresentando substancial incremento na lucratividade do sistema de cria na bovinocultura de corte. / The aim of present study was to carry out a simulated bioeconomic performance of three systems of reproductive management for beef cattle. For the present simulation, a herd of 1,300 Bos taurus taurus and Bos taurus indicus females (heifers and multiparous cows) were submitted to three different scenarios: 1 - natural mating (MN); 2 - artificial insemination at fixed time (IATF) followed by transfer with bulls; 3 artificial insemination with estrus detection and at fixed time (IAETF) followed by transfer with bulls. Firstly, the compilation of the data of scientific articles involving artificial insemination protocols (IATF and IAETF) and natural selection relative to the percentage of pregnancy obtained in each group for the categories of heifers and multiparous cows. From the compilation of the results already published and the sum of animals and their pregnancies, the weighted mean of pregnancy was 83.7% for the MN group, whereas for the IATF + MN group the weighted mean was 90.1% And for the IAETF + MN group was 91.7%. Considering the percentages obtained in the simulation, losses (8% between embryonic death and abortions and 2.5% post-birth) and costs reached the productive results, which were 171,512.07 (MN), 258,089.62 ( IATF + MN) and 278,616.06 (IAETF + MN) kg of weaned calves. The cost to implement each management in the property was R $ 209,092.00, R $ 168,521.72 and R $ 164,169.17 and gross profit of R $ 785,678.00, R $ 1,328,398.05 and R $ 1,451 .803,94 for MN, IATF + MN and IAETF + MN, respectively. The economic comparison between the MN and IATF groups generated an economic advantage of 40.9% in favor of the IATF, which corresponds to R $ 542,720.05. When compared to MN versus IAETF, the superiority of economic return in favor of the second group was 45.8%, corresponding to R $ 666,125.94. Therefore, both the IATF + MN and the IAETF + MN were useful tools to increase the economic return through the sale of more kg of weaned calves, presenting a substantial increase in the profitability of the beef breeding system.

A forma com que indivíduos de uma população composta são acasalados, inuencia diretamente na produção e na variabilidade da população gerada pelos acasalamentos. Identicar quais composições raciais são mais convenientes para determinadas características e viáveis economicamente, além dos efeitos de cada raça ou grupo racial, é de fundamental importância para estabelecer os rumos da produção e uma melhor estratégia para os produtores. Buscou-se, com este trabalho, identicar os efeitos que os grupos raciais N, A, B e C fornecem sobre o mérito médio de uma população composta por todas as combinações destes quatro grupos raciais, na presença e na ausência da padronização das características do índice Montana, possibilitando assim, informar a proporção racial que fornece mérito médio ótimo. Além disso, foi desenvolvida uma metodologia que calcula, por meio das informações raciais de uma população apta ao acasalamento, a combinação ótima a ser acasalada, tornando possível, desta forma, maximizar os desempenhos e os lucros para a geração seguinte. A metodologia foi implementada computacionalmente e testada para a população Montana apta ao acasalamento em 2011, e a superioridade do método, comparado a outros sistemas de acasalamento, foi comprovada. Um programa que calcula o coeciente de endogamia das possíveis futuras progênies geradas pelos acasalamentos de uma população, foi implementado com objetivo de contribuir na tomada de decisão como restrição em programas de acasalamento. / The way in which individuals of a composite population are mated has directly inuence in the production and in the variability of the population generated by mating. Identify which racial compositions are more convenient for certain traits and economically feasible, and also the eects of each breed or racial group, has a fundamental importance to establish the direction of production and a better strategy for producers. The aim of this work was to identify the eects of racial groups called N, A, B e C to provide on the average merit of a composite population for all combinations of these four racial groups, in the presence and absence of standardization of traits of Montana index, thus enabling, to inform the racial proportion that provides great average merit. Furthermore, it was developed a methodology that calculates on the basis of racial information of a population ready to mate, the optimal combination to be mated, making possible, in this way, to maximize performance and prots for the next generation. The methodology was computationally implemented and tested in the Montana\'s population able to mate in 2011, and the superiority of the method compared to other breeding systems has been proven. A program that calculates the inbreeding coecient of the possible future generations\' progeny by mating of a population was implemented in order to contribute in decision making as a constraint on mating programs.

O Brasil é o maior exportador de carne bovina mundial com aproximadamente 1,7 mil toneladas, e o segundo em produção, estando atrás apenas dos Estados Unidos. A produção brasileira está embasada em técnicas extensivas de produção. No entanto, esse sistema de produção exige rebanhos resistentes as grandes adversidades encontradas no ambiente. Os bovinos da raça Nelore, de origem Bos taurus indicus, são predominantes no rebanho brasileiro, devido sua elevada resistência ao ambiente tropical e seu potencial de produção. Estudos sobre a ciência da carne estão sendo realizados para avançar na seleção de animais que atendam com qualidade os consumidores, pois bovinos de origem Bos taurus indicus são conhecidos por produzirem carne de menor maciez quando comparado as raças de origem taurina. Com o objetivo de descobrir possíveis genes que estejam associados a força de cisalhamento da carne de animais da raça Nelore, foi avaliada no presente estudo, em uma primeira população (n=76), a expressão de genes que codificam proteínas da família de heat shock: CRYAB, HSPB1 e DNAJA1, e genes envolvidos na proteólise do tecido muscular: -calpaína (CAPN1), calpastatina (CAST) e duas isoformas do gene da calpastatina. A maior expressão do gene CRYAB foi associada a maior maciez da carne (menor força de cisalhamento) aos sete e 14 dias de maturação, enquanto a maior expressão do gene CAPN1 foi associada negativamente com a menor força de cisalhamento, na análise de 24 horas após abate, e positivamente com 14 dias de maturação da carne. No estudo também foi avaliado uma distinta população (n=138), quanto a diferença do perfil proteômico de amostras do músculo Longissimus dorsi, com auxílio da eletroforese bi-dimensional (2-DE), seguido do sequenciamento peptídico por espectrometria de massas (EM), para identificação das proteínas com diferentes quantidades nos extremos fenotípicos de força de cisalhamento da carne. Foram observados 17 spots com diferentes volumes entre os extremos fenotípicos (P0,05), sendo 13 deles identificados. Entre as identificações estão proteínas estruturais, relacionadas a proteção celular, metabolismo energético e lipídico, e proteínas não caracterizadas. Baseado nos resultados existe a possibilidade de traçar um perfil protéico, ou com fragmentos protéicos, para identificar amostras que proporcionem carne de maior maciez. / Brazil is the largest beef exporter of the world with approximately 1.7 tons per year and the second in production, behind only the United States. The brazilian system production is based on extensive techniques. However, this system requires herds resistant to environmental adversities. The Nelore cattle, (Bos taurus indicus) is predominant in the Brazilian herd due to its high resistance to the tropical environment and its potential to meat production. Studies on meat science are being made to evolve the selection of animals that meet quality consumers. Bos taurus indicus cattle are known to produce less tender meat compared to Bos taurus breeds. In order to find possible genes that are associated with the shear force of meat, this study evaluated in a first study population (n = 76) the expression of genes that encode proteins of the \"heat shock\" family: CRYAB, HSPB1, DNAJA1, and genes involved in proteolysis of the musclular tissue: -calpain (CAPN1), calpastatin (CAST) and two isoforms of the calpastatin gene. The higher expression of CRYAB was associated with increased meat tenderness (smaller shear force) at seven and 14 days of maturation, while the CAPN1 gene expression was negatively associated with lower shear force in the analysis 24 hours after slaughter and positively with 14 days of maturation. The study also evaluated a different population (n = 138) and the difference in the proteomic profile of Longissimus dorsi muscle samples using twodimensional electrophoresis (2-DE), followed by peptide sequencing by mass spectrometry (MS) to identify proteins expressed in the two meat shear force extremes. It was verified 17 differentially expressed spots between the phenotypic extremes (P 0.05), but only 13 were could be identified. Among the identifications, there are structural proteins related to cell protection, lipid and energy metabolism and uncharacterized proteins. Based on these results, it is possible to trace a protein expression profile, or protein fragments in ordem to identify samples to provide meat more tender.

O presente trabalho avaliou índices reprodutivos e características de desempenho em fêmeas bovinas de corte, infectadas e não infectadas pelo HVB-1, criadas sob manejo extensivo, em uma fazenda na região norte do Estado de São Paulo, Brasil. Animais das raças Gir, Guzerá, Nelore e Caracu foram avaliados no início da estação de monta e a ocorrência de touros e fêmeas reagentes ao HVB-1 pelo teste ELISA foi, respectivamente, 92,5% (37/40) e 54,2% (386/712), sendo o número de touros reagentes maior do que o de fêmeas (p < 0,0001). Foi verificado um aumento na proporção de fêmeas reagentes nas diferentes faixas etárias: 23,2% (32/138) de 2 a 3 anos; 45,2% (57/126) de 3 a 4 anos; 54,6% (59/108) de 4 a 5 anos e 70,0% (238/340) para &#61619; 5 anos (p < 0,0001). O número de matrizes que soroconverteram no período de um ano foi igual a 10,3% (58/561). O HVB-1 não reduziu o índice de prenhez de matrizes reagentes - 80,3% (310/386) e não reagentes - 74,5% (243/326) (p > 0,05) e nem a taxa de parição de matrizes reagentes - 97,7% (300/307) e não reagentes - 93,8% (225/240) (p < 0,05). O índice de prenhez e parição de fêmeas reagentes não diferiu segundo a raça, soroconversão, grupo genético do rebanho Nelore e faixa etária (p > 0,05). O coeficiente de natimortalidade de matrizes reagentes ao HVB-1 - 1,3% (4/300) não diferiu da encontrada para as não reagentes - 2,2% (5/225) (p > 0,05) e não foram observados efeitos de raça, soroconversão, grupo genético do rebanho Nelore e faixa etária (p > 0,05). O HVB-1 não afetou a média de algumas características de desempenho de fêmeas reagentes e não reagentes (p > 0,05), respectivamente, como ganho de peso médio diário durante a estação de monta (459,90 &#61617; 2,82 g e 466,63 &#61617; 2,87 g), condição corporal na entrada da estação de monta (6,89 &#61617; 0,08 e 6,99 &#61617; 0,08), condição corporal na saída da estação de monta (7,73 &#61617; 0,06 e 7,71 &#61617; 0,06) e peso à parição (419,17 &#61617; 3,34 kg e 425,97 &#61617; 3,22 kg). Concluiu-se que matrizes de corte infectadas pelo HVB-1 e não vacinadas, criadas sob condições adequadas de manejo zootécnico, apresentaram bons índices de prenhez, parição e natalidade, independente da raça, grupo genético e faixa etária. / This work evaluated reproductive rates and performance traits in beef cattle females, infected and non infected by BHV-1, bred under extensive management conditions, in a farm in the northern region of São Paulo State, Brazil. Gir, Guzerá, Nelore and Caracu purebred animals were monitorated at the beginning of the breeding season and the occurrence of bulls and females reagent to BHV-1 by ELISA test was, respectively, 92.5% (37/40) and 54.2% (386/712), with positive cases among bulls higher than among females (p < 0.0001). There was an increase in the proportion of reagent females in the different ages analyzed: 23.2% (32/138) from 2 to 3 years old; 45.2% (57/126) from 3 to 4 years old; 54.6% (59/108) from 4 to 5 years old and 70.0% (238/340) above 5 years old (p < 0.0001). The rate of females that seroconverted was 10,3% (58/561). BHV-1 did not interfere in the pregnancy rates of both reagent - 80.3% (310/386) and non-reagent - 74.5% (243/326) females (p > 0.05). It did not reduce the parturition rate of both reagent - 97.7% (300/307) and non-reagent - 93.8% (225/240) females, either (p < 0.05). The pregnancy and parturition rates of reagent females did not differ according to breed, seroconversion, Nelore herd genetic group and age (p > 0.05). Total rate of stillbirths in BHV-1 reagent females - 1.3% (4/300) did not differ from that found in non-reagent females - 2.2%(5/225) (p > 0.05) and did not differ acording to breed, seroconversion, Nelore herd genetic group and age (p > 0.05). BHV-1 did not affect performance traits for reagent and non-reagent females (p > 0.05), respectivelly, to daily weight gain during the breeding season (459.90 &#61617; 2.82 g and 466.63 &#61617; 2.87 g), body condition score at the beginning of the breeding season (6.89 &#61617; 0.08 and 6.99 &#61617; 0.08), body condition score at the end of the breeding season (7.73 &#61617; 0.06 and 7.71 &#61617; 0.06), weight at parturition (419.17 &#61617; 3.34 kg and 425.97 &#61617; 3.22 kg). It was concluded that non-vaccinated beef cattle females infected by BHV-1 and bred under adequate management conditions, presented good pregnancy, parturition and birth rates, no matter the breed, genetic group and age.

O presente estudo teve por objetivo estudar os efeitos da interação genótipos x ambientes sobre as características peso à desmama, peso ao sobreano e ganho de peso da desmama ao sobreano em bovinos de corte da raça Nelore. Foram analisados 45.697 registros de peso à desmama ajustados para 205 dias (PD), 34.773 registros de peso ao sobreano ajustados para 550 dias (PS) e 34.753 registros de ganho de peso da desmama ao sobreano (GP), originários de três fazendas localizadas nas regiões sudeste e centro-oeste do Brasil. Os componentes de variância foram estimados utilizando-se o programa MTDFREML. Os dados foram submetidos a análises de duas formas distintas: primeiramente processaram-se análises de características únicas para os dados de cada fazenda e para conjuntos de dados formados por pares de fazendas. Em seguida, processaram-se análises de características múltiplas, em que a mesma característica foi considerada como variáveis distintas em cada par de fazendas. A partir da obtenção dos valores genéticos dos animais, foram calculadas as diferenças esperadas na progênie (DEPs) dos mesmos, bem como as correlações de Pearson entre os valores das DEPs dos touros para as três características estudadas. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade variaram de 0,17 a 0,33 para a característica PD, 0,31 a 0,48 para a característica PS e 0,11 a 0,32 para a característica GP. Os coeficientes de correlação genética encontrados variaram de 0,82 a 1,00, enquanto as correlações de Pearson entre as DEPs dos touros variaram de 0,89 a 0,99. Os resultados levam a sugerir pequeno ou nenhum efeito da interação genótipo x ambiente nos rebanhos incluídos neste estudo. / The objective of the present study was to evaluate the genotype x environment interaction effect on weaning weight, post-weaning weight and weight gain post-weaning in Nellore beef cattle herds. There were analyzed 45,697 data of weaning weight adjusted to 205 days (PD), 34,773 data of post-weaning weight adjusted to 550 days (PS) and 34,753 data of weight gain post-weaning (GP), which were collected from three farms localized in southwest and middle-east of Brazil. The variance components were estimated by MTDFREML. Those data were analyzed applying two different methods: the first proceeding was of considering single traits to the data of each farm and also to the data-set originated by pair of farms. The second method was performing the analysis of multiple traits once the same trait was considered as a distinct variable in each pair of farms. Since genetic values were obtained there were calculated the expected breeding values (EPD) of the sires as the Pearson correlations between the EPD values and the traits analyzed. The estimative of heritability coefficients ranged from 0.17 to 0.33, 0.31 to 0.48 and 11 to 0.32 to PD, PS and GP respectively. The genetic correlations varied from 0.82 to 1.00, while the Pearson correlation between the EPDs ranged from 0.96 to 0.99. The results suggest a modest or inexistent genotype x environment interaction effect in the herds evaluated.

Orientador: Cristiana Andrighetto / Coorientador: Gustavo Pavan Mateus / Banca: Leda Gobbo de Freitas Bueno / Banca: Paulo roberto de Lima Meirelles / Resumo: O Brasil se destaca no cenário mundial de produção de bovinos em pastagens. No entanto, grande parte destes pastos apresenta algum grau de degradação, necessitando serem recuperados, nesse sentido os sistemas integrados podem ser uma ferramenta para a recuperação de áreas degradadas e contribui para amortizar, em parte os custos da recuperação das pastagens, pela venda dos grãos e o aproveitamento dos nutrientes residuais das lavouras para produção de forragem. Além, da lavoura e da pastagem, utiliza-se o componente arbóreo, que possibilita o aumento de renda da propriedade. Sendo assim o objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho de novilhos da raça Nelore e a massa de forragem e composição morfológica do capim-marandu em áreas recuperadas com sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta (ILPF) nas densidades de 196 e 448 Eucalyptus spp. por hectare e em sistema de integração lavoura-pecuária (ILP), nas estações verão e inverno. O delineamento experimental foi em blocos com 4 repetições. O experimento foi conduzido na APTA - Andradina, SP. Foi avaliado na forragem: massa seca de capim-marandu, porcentagem de folhas, colmo e material senescente, relação folha:colmo; nos animais foi avaliado: ganho de peso, ganho de peso diário, ganho de peso por área, taxa de lotação. A massa seca de forragem foi superior no sistema ILP à ILPF com 448 árvores.ha-1. No inverno a massa seca de forragem foi superior ao verão. Houve interação entre tratamento e estação para porcentagem de folhas e material senescente, enquanto para colmos houve apenas efeito de estação, sendo a porcentagem de colmos no inverno 5% superior ao verão. Não foram observadas diferenças entre os tratamentos para ganho de peso diário, ganho de peso e ganho de peso por área, no entanto houve diferença para estação em todos os parâmetros avaliados, exceto para a taxa de lotação. O peso final dos animais foi maior no... / Abstract: Brazil stands out on the world stage cattle production in pastures. However, most of these pastures have some degree of degradation and needs to be recovered, accordingly, the integrated system can be a tool for the recovery of degraded areas and contributes to repay in part the costs of recovery of pastures, the sale of grain and the use of residual nutrients of crops for forage production. Therefore the aim of this study was to evaluate the performance of Nellore steers and forage mass and morphological composition of marandu grass in areas retrieved systems crop-livestock-forest integration system (ICLF) in densities 196 and 448 Eucalyptus spp. per hectare and system integration crop-livestock (ICL), during the rainy and dry. The experimental design was in blocks with four repetitions. The experiment was conducted at APTA - Andradina, SP. It was evaluated in forage: dry matter Marandu grass, percentage of leaves, stem and senescent material, leaf: stem ratio; the animals were evaluated: weight gain, daily weight gain, weight gain per area, stocking rate. The dry forage mass was greater in the ICL than ICLF system with 448 trees.ha-1. In the dry season the dry forage mass was higher than the rainy season. There was an interaction between treatment and season to percentage of senescent leaves and material, while there were only station to stalk effect, the percentage of stems and 5% in the dry season than the wet season. No differences were observed between treatments for daily weight gain, weight gain and weight gain per area, however there were differences for season in all evaluated parameters, except for the stocking rate. The final weight of the animals was greatest in the ILP treatment. The dry forage mass and stocking rate is reduced by greater density of trees and morphological composition is changed by ILPFs and ILP systems / Mestre

Visando a determinar se a seleção para características que são incluídas em um índice de seleção utilizado no programa de melhoramento genético poderia aumentar o peso adulto (PA) das fêmeas, procurou-se analisar a associação entre o PA e as quatro características do índice, a saber: peso à desmama (PD), ganho de peso pós desmama em 345 dias (GP), perímetro escrotal (PE) e musculosidade (MUSC). Visando também a determinar a relação entre o PA e a precocidade sexual, analisou-se a relação entre o PA e a probabilidade de prenhez aos quatorze meses (PP14). O banco de dados utilizado incluiu 134.185 animais da raça Nelore nascidos entre 1984 e 2012, pertencentes à Agropecuária CFM, em fazendas situadas nos Estados de São Paulo, Mato Grosso do Sul e Goiás. Foram estimados os coeficientes de herdabilidade para as seis características e as correlações entre essas características, principalmente o coeficiente de correlação entre o PA e as outras cinco características. Os componentes de (co) variância foram estimados por máxima verossimilhança restrita, utilizando o pacote computacional VCE. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade encontradas foram 0,22; 0,19; 0,50; 0,20 e 0,50 para PD, GP, PE, MUSC, PP14, respectivamente. As correlações genéticas entre PA e as características de desenvolvimento ponderal foram positivas, 0,55 (PD); 0,67 (GP); 0,07 (PE); 0,46 (MUSC). A seleção para PD e para GP poderia estar relacionada com aumento do PA das vacas. A correlação entre o peso adulto e a probabilidade de prenhez aos quatorze meses foi negativa e de baixa magnitude ( -0,03). O coeficiente de herdabilidade estimado para PP14 mostra que esta característica pode ser incluída em programas de melhoramento genético para aumentar a precocidade e fertilidade da população. O pequeno aumento constatado no peso adulto não foi suficiente para causar alteração na precocidade sexual da população. As referências na literatura sobre a correlação entre as estimativas do peso adulto e PP14 são escassas. Recomendam-se outros estudos, usando diferentes conjuntos de dados e outras abordagens. As tendências genéticas demonstram o progresso no programa de seleção ao longo dos anos para as características de crescimento estudadas aqui. / In order to determine whether selection for traits included in the selection index used in a breeding program would increase the mature weight (MW) of females, this study analyzed the association between MW and four traits composing the index: weaning weight (WW), post-weaning weight gain in 345 days (PWG), scrotal circumference (SC), and muscling score (MUSC). Additionally, the genetic relationship of MW with probability of pregnancy at 14 months (PP14) was analyzed to evaluate the association between MW and sexual precocity. The database included 134,185 Nellore animals from Agropecuária CFM born between 1984 to 2012 on farms in the states of São Paulo, Mato Grosso do Sul, and Goiás. The heritability for the six traits and the correlations between them were estimated, with special importance being given to the correlation of MW with the other five traits. The (co)variance components were estimated by the restricted maximum likelihood method. The heritability coefficients were 0.22, 0.19, 0.50, 0.22 and 0.50 for WW, PWG, SC, MUSC and PP14, respectively. The genetic correlations of MW with the growth traits were positive: 0.55 (WW), 0.67 (PWG), 0.07 (SC), and 0.46 (MUSC). Selection for WW, PWG and MUSC might be related to an increase in the MW of cows. The correlation between MW and PP14 was negative and of low magnitude (-0.03). The heritability estimates and the genetic correlations of MW with the growth traits were moderate and positive. Thus, the current selection for WW, PWG and MUSC should contribute to increase the MW of cows. MW monitoring of females is important because heavy and larger animals can be associated with higher maintenance costs. The correlation between MW and PP14 was negative and of low magnitude. This association suggests that the increase in MW of cows has no important effect on reproductive performance of the heifers and vice versa. The genetic trends obtained here demonstrate that the adopted selection index has been effective to promote genetic progress for traits related to growth.

O monitoramento da endogamia é fundamental para o estabelecimento de um programa de melhoramento animal. Os coeficientes de endogamia foram estimados a partir de segmentos de homozigose (FROH), matriz de parentesco genômico com frequências alélicas derivadas dos dados (FGRM), frequências alélicas ajustadas a 0,5 (FGRM05), excesso de homozigose (FHOM) e informação de pedigree (FPED) em bovinos Nelore e ovelhas Santa Inês. Os dados genotípicos para a população Nelore foram obtidos de 2.569 animais utilizando um painel de 725,293 polimorfismos de nucleotídeo único e um pedigree composto por 15.846 indivíduos. Para a população de ovinos Santa Inês, 576 animais foram genotipados para 47.033 polimorfismos de nucleotídeo único, juntamente com dados de pedigree de 32.266 indivíduos. Picos notáveis nos cromossomos 7, 12 e 21 dos bovinos e no cromossomo 16 das ovelhas, representavam ilhas de ROH (&gt; 47%), destacando regiões possivelmente afetadas pela pressão seletiva. Os valores médios para FPED, FROH, FGRM e FGRM05 foram 0,005, 0,058, -0,007 e 0,40, respectivamente no caso do Nelore, enquanto valores medias de 0,32, 0,049, 0,015, 0,287 e 0,015 para FPED, FROH, FGRM, FGRM05 e FHOM, respectivamente no caso das ovelhas. Esses coeficientes de endogamia foram associados negativamente com peso ao nascer, peso à desmama, ganho de peso pós-desmame, escore de muscularidade, precocidade, conformação e circunferência escrotal em bovinos Nelore e para todas as características analisadas em Santa Inês. Também foi encontrada uma correlação negativa entre depressão endogâmica e estimativas de variâncias genômicas de dominância variando de -0,35 a -0,98 para Nelore e -0,89 a -0,91 para ovinos Santa Inês. Nós afirmamos que as descobertas relatadas podem ser usadas para manter a diversidade genética em bovinos Nelore e ovelhas Santa Inês sob uma perspectiva genômica. / Monitoring inbreeding is critical for establishing a sustainable breeding program. Inbreeding coefficients were estimated from runs of homozygosity (FROH), genomic relationship matrices coupled with allele frequencies derived from data (FGRM), allele frequencies set to 0.5 (FGRM05), excess of homozygosity (FHOM), and pedigree information (FPED) from Nellore cattle and Santa Ines populations. Genotypic data for the Nellore population were obtained from 2,803 animals using a panel of 725, 293 single-nucleotide polymorphisms and a pedigree consisting of 15,846 individuals. For the Santa Ines sheep population 576 animals were genotyped for 47,033 single-nucleotide polymorphisms along with pedigree data of 32,266 individuals. In cattle noticeable peaks on chromosome 7, 12, and 21, and in sheep on chromosome 16, represented hotspots of autozygosity (&gt; 47%), highlighting putative regions affected by selective pressure. The mean values for FPED, FROH, FGRM, and FGRM05 were 0.005, 0.058, -0.007, and 0.40, respectively for Nellore, while for Santa Ines were 0.32, 0.049, 0.015, 0.287 and 0.015 for FPED, FROH, FGRM, FGRM05 and FHOM, respectively. These inbreeding coefficients were negatively associated with birth weight, weaning weight, post-weaning weight gain, muscularity score, finishing score, conformation score, and scrotal circumference on Nellore and for all traits analyzed on Santa Ines. Also, a negative correlation was found between inbreeding depression and estimates of dominance genomic variances ranging from -0.35 to -0.98 for Nellore and -0.89 to -0.91 for Santa Ines sheep. We contend that the findings reported here can be used to maintain genetic diversity in Nellore cattle and Santa Ines sheep from a genomic perspective.

Visando a determinar se a seleção para características que são incluídas em um índice de seleção utilizado no programa de melhoramento genético poderia aumentar o peso adulto (PA) das fêmeas, procurou-se analisar a associação entre o PA e as quatro características do índice, a saber: peso à desmama (PD), ganho de peso pós desmama em 345 dias (GP), perímetro escrotal (PE) e musculosidade (MUSC). Visando também a determinar a relação entre o PA e a precocidade sexual, analisou-se a relação entre o PA e a probabilidade de prenhez aos quatorze meses (PP14). O banco de dados utilizado incluiu 134.185 animais da raça Nelore nascidos entre 1984 e 2012, pertencentes à Agropecuária CFM, em fazendas situadas nos Estados de São Paulo, Mato Grosso do Sul e Goiás. Foram estimados os coeficientes de herdabilidade para as seis características e as correlações entre essas características, principalmente o coeficiente de correlação entre o PA e as outras cinco características. Os componentes de (co) variância foram estimados por máxima verossimilhança restrita, utilizando o pacote computacional VCE. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade encontradas foram 0,22; 0,19; 0,50; 0,20 e 0,50 para PD, GP, PE, MUSC, PP14, respectivamente. As correlações genéticas entre PA e as características de desenvolvimento ponderal foram positivas, 0,55 (PD); 0,67 (GP); 0,07 (PE); 0,46 (MUSC). A seleção para PD e para GP poderia estar relacionada com aumento do PA das vacas. A correlação entre o peso adulto e a probabilidade de prenhez aos quatorze meses foi negativa e de baixa magnitude ( -0,03). O coeficiente de herdabilidade estimado para PP14 mostra que esta característica pode ser incluída em programas de melhoramento genético para aumentar a precocidade e fertilidade da população. O pequeno aumento constatado no peso adulto não foi suficiente para causar alteração na precocidade sexual da população. As referências na literatura sobre a correlação entre as estimativas do peso adulto e PP14 são escassas. Recomendam-se outros estudos, usando diferentes conjuntos de dados e outras abordagens. As tendências genéticas demonstram o progresso no programa de seleção ao longo dos anos para as características de crescimento estudadas aqui. / In order to determine whether selection for traits included in the selection index used in a breeding program would increase the mature weight (MW) of females, this study analyzed the association between MW and four traits composing the index: weaning weight (WW), post-weaning weight gain in 345 days (PWG), scrotal circumference (SC), and muscling score (MUSC). Additionally, the genetic relationship of MW with probability of pregnancy at 14 months (PP14) was analyzed to evaluate the association between MW and sexual precocity. The database included 134,185 Nellore animals from Agropecuária CFM born between 1984 to 2012 on farms in the states of São Paulo, Mato Grosso do Sul, and Goiás. The heritability for the six traits and the correlations between them were estimated, with special importance being given to the correlation of MW with the other five traits. The (co)variance components were estimated by the restricted maximum likelihood method. The heritability coefficients were 0.22, 0.19, 0.50, 0.22 and 0.50 for WW, PWG, SC, MUSC and PP14, respectively. The genetic correlations of MW with the growth traits were positive: 0.55 (WW), 0.67 (PWG), 0.07 (SC), and 0.46 (MUSC). Selection for WW, PWG and MUSC might be related to an increase in the MW of cows. The correlation between MW and PP14 was negative and of low magnitude (-0.03). The heritability estimates and the genetic correlations of MW with the growth traits were moderate and positive. Thus, the current selection for WW, PWG and MUSC should contribute to increase the MW of cows. MW monitoring of females is important because heavy and larger animals can be associated with higher maintenance costs. The correlation between MW and PP14 was negative and of low magnitude. This association suggests that the increase in MW of cows has no important effect on reproductive performance of the heifers and vice versa. The genetic trends obtained here demonstrate that the adopted selection index has been effective to promote genetic progress for traits related to growth.

Submitted by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-26T13:15:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) MARIA ANTONYELA LOPEZ CARVALHO.pdf: 1217737 bytes, checksum: 58730de0e4054e95174b485388d0ab66 (MD5) / Approved for entry into archive by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-26T13:15:54Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) MARIA ANTONYELA LOPEZ CARVALHO.pdf: 1217737 bytes, checksum: 58730de0e4054e95174b485388d0ab66 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-26T13:15:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) MARIA ANTONYELA LOPEZ CARVALHO.pdf: 1217737 bytes, checksum: 58730de0e4054e95174b485388d0ab66 (MD5) Previous issue date: 2016-08-15 / A bovinocultura de corte apresenta uma ampla relevância socioeconômica, tanto no mercado externo quanto interno, porém possui importantes entraves a serem diagnosticados e corrigidos. Nas últimas décadas a economia brasileira passou por inúmeras transformações, que fizeram com que a eficiência produtiva e econômica se tornassem características primordiais para se estabelecer em um mercado pecuário cada vez mais competitivo e globalizado. Esta pesquisa tem como objetivo gerar um método que vise avaliar a competitividade interna dos sistemas de produção de cria na bovinocultura de corte, no que tange ao ambiente tecnológico, gerencial, mercadológico e institucional. Para isso, foram definidas etapas para a execução da presente pesquisa: revisão bibliográfica relacionada com a temática competitividade e eficiência inserida no contexto da cadeia produtiva da carne bovina; definição do foco de pesquisa (bovinocultura de cria); formatação e posterior validação do método a partir da aplicação de questionários in loco em sistemas de produção e a posterior mensuração da competitividade interna dos sistemas de produção, através de direcionadores, fatores e subfatores por meio de equações matemáticas. O índice de competitividade do sistema de cria terá uma amplitude de 0 (zero) a 10 (dez), conforme segue: 0-2,0 (não competitiva); 2,1-4,0 (pouco competitiva); 4,1-6,0 (neutro); 6,1-8,0 (competitiva) e 8,1-10,0 (muito competitiva). O método se mostrou eficaz para o diagnóstico inicial de empresas rurais que trabalham com sistemas de cria da bovinocultura de corte, demonstrando estar alinhada com planejamento estratégico de propriedades rurais. A metodologia permite que os pecuaristas conheçam os principais pontos fortes e fracos do seu ambiente interno, permitindo a correta tomada de decisão. Por fim o método é de fácil aplicabilidade e pode ser utilizado nas diversas regiões onde a pecuária de corte é desenvolvida, podendo ser uma importante ferramenta de diagnóstico setorial da atividade através da identificação dos entraves ao desenvolvimento da cadeia produtiva, sobretudo “dentro da porteira”. / The beef cattle presents a broad socio-economic relevance, both external and internal market, but has major obstacles to be diagnosed and corrected. In recent decades the Brazilian economy has numerous transformations, that made the productive and economic efficiency became primary caracteristics to establish in a meat market increasingly competitive and globalized. This research aims to generate a method to assess the internal competitives of creating production systems in beef cattle, with respect to technological, managerial, marketing relations and institutional environment. For this, steps were defined for the implementation of this research: literature review related to the theme competitiveness and inserted efficiency in the context of the production chain of beef; definition of research focus (cattle of create); formatting and subsequent validation of the method from the application of on-site surveys in production systems and the subsequent measurement of the internal competitiveness of production systems through drivers, factors and sub-factors by mathematical equations. The competitive index creates system will have an amplitude of zero (0) to ten (10) as follows: 0-2.0 (no competitive); 2.1 to 4.0 (uncompetitive); 4.1 to 6.0 (neutral); 6.1 to 8.0 (competitive) and 8.1 to 10.0 (very competitive). The method was effective for the initial diagnostic of rural enterprises working with creates the beef cattle systems, demonstrating to be aligned with strategic planning of rural properties. The methodology allows farmers to know the main strengths and weaknesses of your internal environment, enabling the correct decision-making. Finally the method is easy to apply and can be used in the various regions where beef cattle is developed and can be an important sector diagnostic tool activity through the identification of barriers to the development of the productive chain, especially "inside gate" .