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Citogenética básica e molecular em espécies de pimelodidae (siluriformes) coletadas nas bacias do rio paraná e do rio uruguai: uma abordagem na taxonomia e sistemática. / Basic and molecular Cytogenetic in pimelodidae species ( siluriformes ) collected in the Paraná River and the Uruguay river basins: an approach on taxonomy and systematics .Girardi, Simone Cristina 27 February 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Pimelodidae is a family of fishes of South America, and although several taxonomic and molecular studies have been conducted, the phylogenetic relationships among the genera are not still fully understood. In order to provide data to assist in the understanding of the relationships within this family, cytogenetic studies were performed in two species of Iheringichthys and seven species of Pimelodus from three river systems. The specimens were collected in the Piquiri River, Upper Paraná River basin; in the Iguaçu River, downstream to the Iguaçu Falls in the Middle Paraná River basin; in the Iguaçu River, Lower Iguaçu River basin and in the Ijuí River, Upper Uruguay River basin. The analysis showed the presence of 2n=56 chromosomes for all species, corroborating the hypothesis of this basal diploid number for the family. The AgNORs, confirmed by 18S rDNA-FISH, were localized in the terminal position on long arm of a chromosome pair for all analyzed species, which has been reported for all species of Pimelodidae and may indicate a basal trait for the family. The heterochromatin distribution pattern found herein is similar to those described for other Pimelodidae, and allowed us to differentiate most of the species, becoming an important marker. The location of 5S rDNA sequences in Iheringichthys species allowed their differentiation, and can be used as a taxonomic marker. In Pimelodus species, it was verified a variation in the number and position of 5S rDNA sites. In P. britskii and P. maculates, sites of 5S rDNA and 18S were found in synteny, which may indicate a derived condition for these species, considering that they are the only for pimelodids species till now studied that have this feature. The results of this study provided data that contribute to the knowledge of the evolutionary history of the species for Pimelodidae; establishing phylogenetic relationships and assisting in the identification of these species. / Pimelodidae é uma família de peixes da região Neotropical, e embora vários estudos taxonômicos e moleculares tenham sido realizados, as relações filogenéticas entre seus gêneros ainda não são totalmente compreendidas. Com o intuito de fornecer dados para auxiliar no entendimento das relações dentro desta família, foram realizados estudos citogenéticos em duas espécies de Iheringichthys e em sete espécies de Pimelodus de três sistemas hidrográficos. Os exemplares foram coletados no rio Piquiri, Bacia do Alto rio Paraná; no rio Iguaçu, jusante às Cataratas do Iguaçu na Bacia do Médio rio Paraná; no rio Iguaçu, Bacia do Baixo rio Iguaçu e no rio Ijuí, Bacia do Alto rio Uruguai. As análises mostraram a presença de 2n=56 cromossomos em todas as espécies, reforçando a hipótese de número diplóide basal para a família. As AgRONs, confirmadas pela FISH-DNAr 18S, foram localizadas na região terminal do braço longo de um par de cromossomos em todas as espécies estudadas, sendo que posição terminal desta região é observada em todas as espécies de Pimelodidae e pode indicar um caracter basal da família. O padrão de distribuição de heterocromatina encontrado é semelhante ao observado em outros Pimelodidae, e permitiu diferenciar a maioria das espécies, sendo um importante marcador. A localização das sequências de DNAr 5S nas espécies de Iheringichthys permitiu diferenciá-las, podendo ser utilizado como marcador taxonômico. Em Pimelodus, variação quanto ao número e posição de sítios do DNAr 5S foi observada. Em P. britskii e P. maculatus os sítios de DNAr 5S e 18S foram localizados em sintenia, o que pode indicar uma condição derivada para estas espécies, visto que são as únicas espécies de Pimelodidae que apresentam esta característica até o momento. Os resultados do presente estudo fornecem dados que contribuem para o conhecimento da história evolutiva das espécies de Pimelodidae, permitem estabelecer relações filogenéticas e auxiliam na identificação destas espécies.
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Uma abordagem sistemática em espécies de astyanax (characiformes, characidae, incertae sedis) da bacia do alto-médio rio Uruguai através da análise citogenética básica e molecularGavazzoni, Mariane 22 February 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-02-22 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Astyanax is a polyphyletic taxon with richness of species and wide geographic distribution. Astyanax comprises species that are morphologically very similar with poorly detailed taxonomic delimitations, which makes it difficult to identify and to establish phylogenetic relationships. In order to provide data to contribute to cytogenetic, taxonomy and systematics of Astyanax, cytogenetics analyzes were carried out on ten Astyanax species from three river basins. Astyanax altiparanae and A. aff. fasciatus were collected on the Upper Paraná River basin; A. abramis and A. asuncionensis were collected on the Middle-low Paraná River basin; and A. cf. aramburui, A. eigenmanniorum, A. aff. fasciatus, A. jacuhiensis, A. aff. laticeps, A. cf. paris and Astyanax sp. were collected on the Upper-Middle Uruguai River basin. The results show interespecific variation in diploid number, 2n=46 chromosomes for A. cf. aramburui and A. aff. fasciatus, 2n=48 chromosomes for A. eigenmanniorum, and 2n=50 chromosomes for the remaining species. NORs (Ag-staining and 18S rDNA-FISH) showed species bearing single sites and species bearing multiple sites (up to 10 cistrons in Astyanax sp.), confirming the high variability reported for the genus. The species from A. bimaculatus complex (A. abramis, A. altiparanae, A. jacuhiensis e A. asuncionensis) showed single NORs, a plesiomorphic condition for the complex. FISH with 5S rDNA probes revealed a more conserved condition, with centromeric sites in at least one metacentric chromosome pair and one subtelocentric/acrocentric chromosome pair, however with interspecific variation, which proves it to be an important marker in the characterization and differentiation of these species. Heterochromatin distribution pattern was distinct for all species, except for A. cf. aramburui and A. aff. fasciatus (Ijuí River). This demonstrates that cytogenetic similarities may indicate closer relationship between each other than among to the other analyzed species; on the other hand, 5S rDNA genes showed to be important in differentiation of these cryptic species. The results reported the first cytogenetic data for A. cf. paris and reinforce their cytogenetic similarity with other congenus species, and we also report the occurrence of a Astyanax species that has not been taxonomically described yet. Thus, the results of this study provide data that assist taxonomy and systematic of Astyanax clade and Astyanax paris clade , reinforcing the need for extensive revisions, especially in A. bimaculatus and A. fasciatus complex, including markers such as 5S rRNA and heterochromatin distribution pattern, forthe better understanding of the phylogenetic relationships in Astyanax. / Astyanax é um taxon polifilético com grande riqueza de espécies e ampla distribuição geográfica. Compreende espécies com formas bastante semelhantes e delimitações taxonômicas pouco detalhadas que dificultam a identificação e o estabelecimento das relações filogenéticas. Com o objetivo de fornecer dados que contribuam com a citogenética, taxonomia e sistemática de Astyanax, foram realizadas análises citogenéticas em dez espécies de Astyanax de três bacias hidrográficas. Foram coletados exemplares de Astyanax altiparanae e A. aff. fasciatus na bacia do Alto rio Paraná; A. abramis e A. asuncionensis na bacia do Médio-Baixo rio Paraná; e A. cf. aramburui, A. eigenmanniorum, A. aff. fasciatus, A. jacuhiensis, A. aff. laticeps, A. cf. paris e Astyanax sp. na bacia do Alto-Médio rio Uruguai. Os resultados mostraram variação interespecífica no número diplóide, de 2n=46 cromossomos em A. cf. aramburui e A. aff. fasciatus, 2n=48 cromossomos em A. eigenmanniorum, e 2n=50 cromossomos nas demais espécies. As AgRONs, confirmadas pela 18S rDNA-FISH, evidenciaram espécies portando sítios simples e espécies portando sítios múltiplos (até 10 cístrons em Astyanax sp.), confirmando a alta variabilidade encontrada no gênero. Nas espécies do complexo A. bimaculatus (A. abramis, A. altiparanae, A. jacuhiensis e A. asuncionensis), foram evidenciadas RONs simples, característica plesiomórfica para o complexo. FISH com sonda de 5S rDNA evidenciou uma condição mais conservada, com cístrons centroméricos em pelo menos um par de cromossomos metacêntricos e em um par de cromossomos subtelocêntricos/acrocêntricos, porém com variação interespecífica, demostrando ser um importante marcador na caracterização e diferenciação destas espécies. O padrão de distribuição da heterocromatina mostrou-se distinto para as espécies, com exceção de A. cf. aramburui e A. aff. fasciatus (rio Ijuí), onde foi verificado semelhanças citogenéticas que podem indicar maior proximidade entre estas espécies quando comparadas com as demais analisadas, sendo que a distribuição dos genes 5S rDNA se mostrou importante na diferenciação destas espécies crípticas. Os resultados relatam os primeiros dados citogenéticos para A. cf. paris e reforçam sua semelhança citogenética com outras espécies congêneres, além de relatar a ocorrência de uma espécie de Astyanax ainda não descrita taxonomicamente. Em suma, os resultados do presente estudo fornecem dados que auxiliam na taxonomia e sistemática do clado Astyanax e clado Astyanax paris , reforçando a necessidade de revisões amplas, principalmente nos complexos A. bimaculatus e A. fasciatus que incluam marcadores como 5S rDNA e padrão de distribuição da heterocromatina, para melhor compreensão das relações filogenéticas em Astyanax.
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