Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:48:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 327921.pdf: 1272848 bytes, checksum: dd886f6510d61728925ecb4830ed698b (MD5) Previous issue date: 2014 / Juvenis de sardinha-verdadeira (Sardinella brasiliensis) são capturados e utilizados como isca-viva na pesca do atum Katsuwonus pelamis. Para poder aumentar o rendimento desta pescaria, seria necessário produzir iscas em cativeiro. Nesse sentido, esse trabalho avaliou o desenvolvimento zootécnico e a resistência ao manejo das sardinhas-verdadeiras criadas em tanque-rede com diferentes dietas. O experimento foi realizado em tanques-redes de 3,5 m3 instalados na Enseada da Armação do Itapocoroí Â Penha/SC. Inicialmente os peixes tinham 47,16 ± 0,32 mm de comprimento total (CT) e 0,62± 0,016 g de peso. Durante 40 dias os peixes foram submetidos a três tratamentos, no Tratamento A - TA foi utilizado uma ração comercial para peixes onívoros e no Tratamento B - TB uma ração para peixes carnívoros marinhos, o Tratamento C - TC não foi alimentado, dispondo apenas do plâncton natural. Os dados de CT e peso foram obtidos em intervalos de 10 dias e calculados: o Ganho em comprimento e peso, a taxa de crescimento específico do peso, a relação do peso com o CT, o fator de condição relativo (Kn) e estimado o crescimento pelo modelo de von Bertalanffy. A resistência dos peixes foi testada com manejo com puçá e mudança brusca na temperatura da água. A sobrevivência foi de 81% nos Tratamentos A e B e de 55% no TC. O desempenho no TB foi significativamente melhor (P<0,05) que os demais e no final o CT foi de 78,7 ± 0,25 mm, no TA 69,8 ± 0,11 mm e no TC 61,5 ± 0,1 mm e o peso final foi de 3,75 ± 0,43 g no TB, 2,53 ± 0,06 g no TA e no TC 1,63± 0,1 g. Em todos os tratamentos o crescimento foi alométrico positivo e os peixes estiveram em boas condições de higidez. A taxa de crescimento, estimada pelo modelo de von Bertalanffy, foi maior no TB (0,93 ano-1) contra 0,83 e 0,78 ano-1 nos Tratamentos A e C respectivamente. Todos os peixes utilizados no teste de manejo sobreviveram. A S. brasiliensis juvenil teve uma boa adaptação aos tanques-rede e, embora o alimento natural possa contribuir, o uso de ração é indispensável. A qualidade nutricional da ração para carnívoros promoveu um crescimento mais rápido. De maneira geral, os peixes criados em tanques-rede estavam aptos ao embarque como isca-viva.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:52:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 331640.pdf: 924954 bytes, checksum: eb0e9200591eb8f127b05e63797b14e5 (MD5) Previous issue date: 2014 / Estudos em Santa Catarina demonstraram a viabilidade do cultivo da macroalga Kappaphycus alvarezii (Rhodophyta, Gigartinales) em águas subtropicais, entretanto as temperaturas do inverno são limitantes para a sobrevivência da espécie. O cultivo em tanques nos períodos de baixas temperaturas pode ser considerado como solução para esse entrave. Esse trabalho teve como objetivos: estabelecer um método de aclimatação e regime de pulso de nutrientes para o cultivo em tanques de K. alvarezii por meio de ensaios in vitro e determinar o melhor método de movimentação de água para o cultivo em tanques circulares da espécie com o uso de aeração constante por meio de ar difuso ou air lift. Para o primeiro objetivo, aproximadamente 12 g de tetrasporófito verde foram aclimatados por uma semana, sendo que metade da biomassa foi aclimatada em ausência de luz (AL) e a outra metade em presença de luz (PL). Posteriormente à aclimatação, foi realizado um pulso de nutrientes de 1 hora com solução von Stosch a 50 % (VS50) e como controle foi realizado o mesmo pulso apenas com água do mar esterilizada. Após esse período, as algas foram cultivadas por 42 dias sem adição de nutrientes. No tratamento VS50, algas aclimatadas com AL apresentaram taxa de crescimento média de 2,20 % dia-1 significativamente maior que as algas aclimatadas com PL, que apresentaram taxa de crescimento de 1,54 % dia-1. No controle, não foram observadas diferenças significativas. Os ensaios in vitro mostraram que a aclimatação por uma semana em ausência de luz e com pulso de 1h em VS50 é o melhor tratamento para a manutenção de linhagens. Para o segundo objetivo, exemplares de tetrasporófito verde de K. alvarezii foram aclimatados conforme a metodologia escolhida no primeiro objetivo. O cultivo foi realizado em tanques circulares de 100 L, em fotoperíodo natural, temperatura de 22±0,3 °C, em densidade de 5 g L-1 por 28 dias. Semanalmente as algas eram pesadas e havia renovação de 20 % da água do mar. Temperatura, salinidade e oxigênio dissolvido foram medidos duas vezes por dia, três vezes por semana. Dois tratamentos foram testados para a circulação da água nos tanques: aeração constante por meio de ar difuso (AD) e air lift (AL). Como controle (C) foi realizado o cultivo das algas sem aeração. Cada tratamento e controle possuíam três réplicas. Em todo período de cultivo foi observado ganho de biomassa, porém não foram observadas diferenças significativas entre os tratamentos e o controle. A taxa de crescimento foi de 0,47±0,1 % dia-1; 0,41±0,1 % dia-1; 0,30±0,1 % dia-1 nos tratamentos de AD, AL e controle, respectivamente. No controle ocorreram maiores alterações nas concentrações de oxigênio dissolvido, enquanto nos tratamentos AD e AL não foram observados variações expressivas no período de tempo estudado. A salinidade se manteve na faixa dos 35,5Â 35,8 Â em todos os tratamentos. Foi observado que no controle as algas começaram a apresentar sinais da enfermidade ice-ice em algumas regiões do talo. As algas cultivadas no tratamento AL apresentaram despigmentação nas extremidades e no tratamento AD mantiveram a coloração padrão da linhagem verde. Mesmo não havendo diferenças significativas nas taxas de crescimento entre os tratamentos e controle, no sistema de ar difuso (AD) as algas aparentaram estar mais saudáveis, sendo esse o sistema escolhido para o cultivo em tanques circulares para manutenção de matrizes de K. alvarezii. Com base nos resultados obtidos no presente trabalho, foi possível concluir que a aclimatação no escuro por uma semana, seguida de pulso de nutrientes de 1h em solução VS50 e posterior cultivo em tanques circulares com circulação de água proveniente de sistema de ar difuso foram adequadas para a manutenção da espécie em épocas desfavoráveis ao cultivo no mar, embora não sejam adequados para o cultivo massivo em tanques.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:13:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 329962.pdf: 1247971 bytes, checksum: b4d9aad48a74ddf0b0fbd7296ec1e93b (MD5) Previous issue date: 2014 / O presente trabalho objetivou avaliar os efeitos da suplementação da bactéria probiótica Weissella cibaria no trato intestinal e na saúde de surubins híbridos (Pseudoplatystoma corruscans e P. reticulatum ). Os 96 peixes foram distribuídos em 12 tanques circulares de 100 L, em sistema de recirculação de água. Os peixes foram alimentados com 3% da biomassa total durante 45 dias, sendo os peixes do tratamento alimentados com ração comercial suplementada com probiótico, e os peixes do grupo controle com ração comercial sem suplementação. O número de eritrócitos totais, trombócitos e linfócitos se apresentaram maiores nos peixes alimentados com a suplementação probiótica (p<0,05). A porcentagem de fagocitose, o título aglutinante e a concentração total de imunoglobulinas foram maiores nos peixes alimentados com a suplementação probiótica (p<0,05). Através de técnicas de microscopia de luz e eletrônica, foi possível verificar a alteração na microbiota autóctone dos peixes, além do incremento, daqueles que receberam suplementação probiótica, no comprimento e largura das vilosidades intestinais, do número de células caliceformes por vilo, além do perímetro dessas vilosidades. A bactéria W. cibaria foi capaz de colonizar e alterar a microbiota intestinal, assim como sua ultraestrura, além de modular os parâmetros hemato-imunológicos.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:23:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 332350.pdf: 1934521 bytes, checksum: 93cfba87fe4f5c3f18fec10d91a5b259 (MD5) Previous issue date: 2014 / Atividades relacionadas á aquicultura marinha, tais como, a ostreicultura tem sido ameaçada em função do comprometimento da qualidade da água. O fenantreno é um dos hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (HPAs) mais abundantes e distribuídos no ambiente aquático. Bivalves expostos a este composto mostraram efeitos nos diferentes tecidos. Este estudo avaliou em laboratório, os efeitos e alterações moleculares e histológicas que o fenantreno exerce sobre a ostra Crassostrea brasiliana (Lamarck, 1819), ao longo de 10 dias de exposição nas concentrações de 100 e 1000 µg.L-1. Técnicas histológicas, histoquímicas, e a técnica de hibridização in situ (ISH) foram utilizadas para localizar os principais tecidos que apresentam transcrição do gene citocromo P450 (CYP2AU1). Foi realizada também a identificação sexual e do estádio reprodutivo dos animais. Independente da concentração de exposição ao fenantreno, os níveis de bioacumulação pelas ostras aumentou com o passar do tempo de exposição. Foram observadas alterações histológicas na glândula digestiva e no manto dos animais expostos por 10 dias a fenantreno. As ostras expostas à maior concentração de fenantreno apresentaram um aumento significativo de células mucosas (p<0,05) em relação ao controle e aquelas expostas a menor concentração de fenantreno tiveram uma maior atrofia na glândula digestiva. Quanto à localização dos transcritos do gene do CYP2AU1 observamos reação positiva na brânquia, glândula digestiva, manto, intestino e gônadas. Os resultados encontrados neste trabalho demonstraram que o uso da técnica de ISH foi eficaz para localizar os transcritos do CYP2AU1 em diferentes órgãos da ostra C. brasiliana, além da importância na identificação de possíveis alterações histopatológicas decorrentes da exposição a fenantreno.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aqüicultura, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2015-10-20T03:10:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 335063.pdf: 1234403 bytes, checksum: 64f95da61507ef51963afaa08ddd138f (MD5) Previous issue date: 2015 / O objetivo deste estudo foi estabelecer protocolo para seleção de fêmeas de suruvi Steindachneridion scriptum aptas ao tratamento hormonal para indução à desova. No capítulo 1 foi determinado o padrão de distribuição de frequência dos diâmetros ovocitários que melhor representaram as fêmeas maduras através de biópsia ovariana. As fêmeas que apresentavam ovócitos nas amostras obtidas por biópsia ovariana (n=33) foram selecionadas e submetidas ao tratamento hormonal com extrato hipofisário de carpa para induzir a maturação final e desova dos ovócitos. De acordo com a resposta à indução hormonal e as taxas de fertilização e eclosão as fêmeas foram divididas em três distintos grupos definidos. Grupo A (n=12): Fêmeas que desovaram e produziram ovócitos viáveis, havendo fertilização dos ovos e eclosão de larvas; Grupo B (n=6): Fêmeas que responderam ao tratamento hormonal, desovaram, mas produziram ovócitos que praticamente não fertilizaram ou não eclodiram; Grupo C (n=15): Fêmeas que não responderam ao tratamento hormonal e não liberaram ovócitos. As fêmeas do Grupo A apresentaram padrão da distribuição de frequência dos diâmetros dos ovócitos exclusivamente unimodal, com valores modais entre 1624,20 e 1777,70 µm. No capítulo 2 as fases de desenvolvimento ovocitário de suruvi foram descritas. Ovócitos de 21 fêmeas maduras ou em maturação e gônadas de 12 fêmeas imaturas, mantidas em sistemas de cultivo, foram fixados em solução de Karnovsky por 4 e 12h, respectivamente, e em seguida processados com técnicas histológicas de rotina. Foi possível caracterizar cinco fases que compõem o ciclo completo do desenvolvimento ovocitário de suruvi.

SOUZA, D. A. Desempenho bioeconômico e características de carcaça de cordeiros mestiços Dorper-Santa Inês e Dorper-Somalis brasileiro submetidos a um modelo de produção precoce. 2011. 103 f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2011. / Submitted by Daniel Eduardo Alencar da Silva (dealencar.silva@gmail.com) on 2014-12-05T21:29:43Z No. of bitstreams: 1 2011_dis_dasouza.pdf: 3812823 bytes, checksum: d80054e1b304a005c28eb5544bef05a5 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-12-22T16:18:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_dis_dasouza.pdf: 3812823 bytes, checksum: d80054e1b304a005c28eb5544bef05a5 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-22T16:18:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_dis_dasouza.pdf: 3812823 bytes, checksum: d80054e1b304a005c28eb5544bef05a5 (MD5) Previous issue date: 2011 / The experiment was conducted to evaluate the bioeconomic performance and the carcass traits of ½ Dorper-Santa Inês and ½ Dorper-Brazilian Somali lambs under an early production model. Twenty non castrated lambs were distributed in a completely randomized design with two treatments (genetic group) of ten replicates. In pre-weaning phase, the lambs were confined under creep feeding system with overnight breastfeeding, from 7th post-birth day until the weaning at 60 days old, when their followed to the finishing phase at feedlot with high concentrate diet. The lambs were slaughtered when achieved 3 mm of subcutaneous fat thickness, which was monitored and measured by ultrasonography. ½ Dorper-Santa Inês lambs were superior to body weight gain in pre-weaning and finishing phases, while the ½ Dorper-Brazilian Somali lambs were earlier as the growth and finishing. There was significant difference between genetic groups for hot carcass weight, chilled carcass weight, cooler shrink, ribeye area, carcass compactness index, hindlimb compactness index and cuts weight. However, ½ Dorper-Santa Inês and ½ Dorper-Brazilian Somali lambs had similar results for ribeye area:chilled carcass weight ratio and proportion of commercial cuts. ½ Dorper-Brazilian Somali lambs had greater subcutaneous fat thickness:chilled carcass weight and GR:chilled carcass weight ratios. From data of performance of the 20 crossbred lambs (weaning weight, average daily gain and dry matter intake) and of regression analysis (slaughter weight in function of the 3 mm subcutaneous fat thickness) was projected a feedlot for finishing of weaned lambs with static capacity for 100 animals by finishing cycle. The economic analysis showed positive results for all indexes evaluated. The compounds with highest influence on production cost of the feedlot were the purchase of weaned lambs and the feeding. ½ Dorper-Santa Inês and ½ Dorper-Brazilian Somali lambs have satisfactory results for performance and for production of quality sheep meat, beyond economic viability, under an early production model. / A presente pesquisa teve como objetivo avaliar o desempenho bioeconômico e as características quantitativas da carcaça de cordeiros ½ Dorper-Santa Inês e ½ Dorper-Somalis Brasileiro submetidos a um modelo precoce de produção. Vinte cordeiros não castrados foram distribuídos em um delineamento inteiramente casualizado com dois tratamentos (grupo genético) de dez repetições. Na fase de cria, os cordeiros foram mantidos confinados sob sistema de creep feeding com amamentação noturna, a partir do 7o dia após o nascimento até o desmame aos 60 dias de idade, quando seguiram para a fase de terminação em confinamento com dieta de alto concentrado. Os cordeiros foram abatidos quando alcançaram 3 mm de espessura de gordura subcutânea, a qual foi monitorada e mensurada por meio de ultrassonografia. Os cordeiros ½ Dorper-Santa Inês foram superiores quanto ao ganho de peso corporal nas fases de cria e terminação, enquanto, os ½ Dorper-Somalis Brasileiro foram mais precoces quanto a crescimento e acabamento. Houve diferença significativa entre os grupos genéticos para peso da carcaça quente, peso da carcaça fria, perda por resfriamento, área de olho de lombo, índice de compacidade de carcaça, índice de compacidade da perna e peso dos cortes. No entanto, os cordeiros ½ Dorper-Santa Inês e ½ Dorper-Somalis Brasileiro apresentaram resultados similares para quantidade de músculo por unidade de peso de carcaça fria e rendimentos dos cortes comerciais. Os cordeiros ½ Dorper-Somalis Brasileiro apresentaram maior quantidade de gordura por unidade de peso de carcaça fria. A partir dos dados de desempenho dos 20 cordeiros (peso ao desmame, ganho médio diário e consumo de matéria seca) e da análise de regressão (peso de abate em função do grau de acabamento de 3 mm de espessura de gordura subcutânea) projetou-se um confinamento para terminação de cordeiros desmamados com capacidade estatíca de 100 animais por ciclo de terminação. A análise econômica mostrou resultados positivos para todos os indicadores avaliados. Os componentes de maior influência sobre o custo de produção no confinamento foram a compra de cordeiros desmamados e a alimentação. Cordeiros mestiços ½ Dorper-Santa Inês e ½ Dorper-Somalis Brasileiro apresentam resultados satisfatórios quanto ao desempenho e a produção de carne ovina de qualidade, além de viabilidade econômica, quando submetidos a um modelo de produção precoce.

FEIJÓ, Rubens Galdino. Prospecção de genes relacionados à ocorrência de enfermidades no camarão Litopenaeus Vannamei (Boone, 1931) sob condições de cultivo. 2009. 106 f. Dissertação (Mestrado em Ciencias Marinahs Tropicais) - Instituto de Ciencias do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2009. / Submitted by Debora Oliveira (deby_borboletinha@hotmail.com) on 2012-01-26T12:36:04Z No. of bitstreams: 1 2009_dis_rgfeijó.pdf: 1571381 bytes, checksum: 22972f2932df950ac476b4312cbfd726 (MD5) / Approved for entry into archive by Debora Oliveira(deby_borboletinha@hotmail.com) on 2012-01-26T14:08:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_dis_rgfeijó.pdf: 1571381 bytes, checksum: 22972f2932df950ac476b4312cbfd726 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-01-26T14:08:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_dis_rgfeijó.pdf: 1571381 bytes, checksum: 22972f2932df950ac476b4312cbfd726 (MD5) Previous issue date: 2009 / The marine shrimp culture has achieved great importance in the global economy as an agriculture business, not only for jobs and income generation, but especially because it represents a viable alternative source of animal protein for the growing global food demand. However, the occurrence of diseases in shrimp culture, especially those of viral aetiology, has significantly compromised the activity, causing high mortality rates and consequent economic loss. The identification and characterization of genes related to shrimp diseases has helped understanding the immune responses triggered in the infectious processes, and mechanisms related to host-pathogen interaction, about which very little is known at the moment. The main objective of the present work was the prospection and characterization of genes related to diseases of the shrimp species Litopenaeus vannamei under typical rearing conditions. The health status investigation of 40 shrimps by histopathological and molecular methods of diagnosis resulted in the detection of IMN, IHHN, WSS, NHP, vibriosis and gregarines in various degrees and combinations. Shrimps have been grouped in classes for gene prospecting through the technique of Differential Display RT-CR (DDRT-PCR). The analysis of differential gene expression in the profiles produced resulted in the identification of three previously undescribed gene sequences potentially related to the occurrence of diseases in shrimp L. Vannamei. Two of these sequences (882-A1R2 and 730-A4R10) have not had homologies to any annotated invertebrate sequences. Fragment 842-A2R6 however, showed 99% nucleotide similarity with the mut-7 gene, which encodes a type of RNAse involved in the mechanism of post-transcriptional gene silencing through RNAi in the nematode Caenorhabditis elegans. It is suggested hare that this kind of mechanism may be involved in the silencing of double stranded RNA from viruses like the IMNV. / A carcinicultura marinha vem assumindo um papel de grande relevância na economia mundial, não somente pela geração de empregos e rendimentos, mas especialmente por representar uma alternativa viável para o atendimento da crescente demanda mundial por alimentos. No entanto, a ocorrência de enfermidades nos cultivos de camarões, principalmente as de etiologia viral, vem comprometendo significativamente a atividade, por provocarem elevados índices de mortalidade e conseqüente perda econômica. A identificação e caracterização de genes relacionados a enfermidades de camarões têm auxiliado significativamente na compreensão das respostas imunes desencadeadas nos processos infecciosos, assim como dos mecanismos relacionados à interação patógeno-hospedeiro, ainda de pouco conhecimento científico. O presente trabalho teve como objetivo principal a prospecção e caracterização de genes relacionados a enfermidades de camarões da espécie Litopenaeus vannamei sob condições de cultivo. A investigação sanitária de 40 camarões por métodos histopatológicos e moleculares de diagnóstico resultou na detecção da IMN, IHHN, WSS, NHP, vibrioses e gregarinas, o que permitiu o agrupamento destes camarões em classes diferenciais destinadas ao estudo de prospecção gênica através da técnica de Differential display RT-PCR (DDRT-PCR). A análise da expressão diferencial de genes nos perfis de expressão dos camarões agrupados de acordo com o status sanitário resultou na identificação de três sequências genéticas inéditas e potencialmente relacionadas à ocorrência de enfermidades no camarão L. vannamei, sendo duas sequências (882-A1R2 e 730-A4R10) de homologias indeterminada e uma (842-A2R6) com 99% de similaridade nucleotídica com o gene mut-7 que codifica um tipo de RNAse envolvida no mecanismo de silenciamento póstranscricional de genes do nematóide Caenorhabditis elegans. Este resultado sugere que o gene 842-A2R6 pode estar relacionado ao mecanismo de silenciamento de dsRNA associadas ao IMNV.

NASCIMENTO, A.S. F. Expressão, purificação e caracterização estrutural da bdh-2 recombinante, uma espermadesina presente no plasma seminal de bode (Capra hircus). 2010. 84 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Curso de Medicina, Campus de Sobral, Universidade Federal do Ceará, Sobral , 2010. / Submitted by Djeanne Costa (djeannecosta@gmail.com) on 2016-03-21T14:38:25Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_asfnascimento.pdf: 1191373 bytes, checksum: f4b810e909dd91a96830f8959962a48a (MD5) / Approved for entry into archive by Djeanne Costa(djeannecosta@gmail.com) on 2016-03-22T16:00:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_asfnascimento.pdf: 1191373 bytes, checksum: f4b810e909dd91a96830f8959962a48a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-22T16:00:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_asfnascimento.pdf: 1191373 bytes, checksum: f4b810e909dd91a96830f8959962a48a (MD5) Previous issue date: 2010-02-02 / The Bdh-2 bodhesin cDNA present in seminal plasma of goat was subcloned in the expression plasmid pTrcHis TOPO used to transform E. coli Top10 One shot cells. The recombinant clones were selected by growth in 50 μg/mL ampicillin-containing LB-Broth medium and PCR amplifications. The recombinant protein synthesis was monitored by SDS-PAGE followed by immunoblotting using monoclonal anti-His antibody. The production of the rBdh-2 through low temperature was not satisfactory. A greater production of the rBdh-2 occurred with IPTG 1.5 mM after 2 h of induction. The method utilized to the purification of the rBdh-2 was realized in affinity chromatography on a His-Trap column following ion-exchange chromatography on a DEAE-Sephacel column. The secondary structure of the rBdh-2 was evaluated through spectral profile circular dichroism (CD) and confirmed the prevalence of secondary structures like β-sheets, the presence of a low content of unfolded structures and helices-. The rBdh-2 structure remained stable up to 35 °C. However, significant changes were observed from 40 °C related to a distortion of the spectrum of CD. / O cDNA da bodesina Bdh-2 presente no plasma seminal de caprino (Capra hircus) foi subclonado no vetor de expressão pTrcHis TOPO utilizado para transformar células E.coli Top 10 One Shot. Os clones recombinantes foram selecionados através de crescimento em meio LB-Broth contendo 50 μg/mL de ampicilina e amplificação do gene por PCR. A síntese da proteína recombinante rBdh-2 fusionada com cauda de histidina foi monitorada através de SDS-PAGE seguido por immunobloting usando anticorpo monoclonal anti histidina. A produção da rBdh-2 através da indução a baixas temperaturas não se mostrou satisfatória. A maior produção da rBdh-2 ocorreu com IPTG 1,5 mM após 2 horas de indução. O método utilizado para a purificação da proteína recombinante rBdh-2 foi através de cromatografia de afinidade em coluna His-Trap seguida por cromatografia de troca-iônica em coluna de DEAE-Sephacel. A estrutura secundária da rBdh-2 foi avaliada através do perfil espectral de dicroísmo circular (CD) que confirmou a predominância de estruturas secundárias do tipo folhas-β, a presença de um baixo conteúdo de estruturas não-ordenadas e de hélices-. A rBdh-2 manteve sua estrutura estável até 35 °C. No entanto, mudanças significativas foram observadas a partir de 40 °C referentes à descaracterização do espectro de CD.

VETTORAZZI, M. B. Caracterização do sêmen de ariacó, Lutjanus synagris (LINNAEUS, 1758). 2012. 90 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2016-03-29T14:32:31Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_mbvettorazzi.pdf: 11189419 bytes, checksum: 0033413fdc0b60502b51591fc7a56e6e (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid(nadsa@ufc.br) on 2016-03-30T14:29:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_mbvettorazzi.pdf: 11189419 bytes, checksum: 0033413fdc0b60502b51591fc7a56e6e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-30T14:29:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_mbvettorazzi.pdf: 11189419 bytes, checksum: 0033413fdc0b60502b51591fc7a56e6e (MD5) Previous issue date: 2012 / Aquaculture has become an important source of protein. Lutjanus synagris, lane snapper, is amongst the ten main species caught in the Brazilian central coast fisheries and, in the U.S., generated $ 157,745 in 2010. One of the prerequisites for the industry settlement of sustainable fish farming is the ability to control reproduction in captivity. The intensive breeding and artificial propagation requires appropriated technologies for gametes handling, which include short-term storage to supply the activity or even to improve its effectiveness. The knowledge of the species biology is important to complete the fertilization process and to develop techniques for semen storage in a short and long term. This study aim was to characterize quantitative and qualitatively the L. synagris fresh semen using the Computed Assisted Semen Analysis (CASA). Semen samples were analyzed regarding the sperm concentration, ejaculated volume, osmolality, pH, morphology, morphometry and sperm motility. The average sperm concentration, ejaculated volume, osmolality and pH was 2.43 ± 0.42 x 1010 sperm / mL, 0.39 ± 0.2 mL, 378.5 ± 65.1 mOsm / kg and 7.9 ± 0.17, respectively. L. synagris semen presented 34.6% of primary abnormalities and 24.25% of secondary abnormalities, the mean spermatozoa length, width, area and perimeter were3.06 μm, 2.73 μm, 7.63 μm2 and 9.70 μm, respectively. The total sperm motility of fresh semen was 78.8% being 22.32% considered of high velocity; the mean straightness and wobble were 63.24 and 67% respectively; the average of curvilinear velocity was 35.13 μm/s, the main straight line velocity was 13.04 μm / s, the main path velocity was 22.14 μm / s, the main lateral displacement of spermatozoa head was 2.84 μm and beat cross frequency was 4.04 Hz. The use of CASA for evaluation of sperm morphology and motility was successful and proved to be a practical method for the evaluation of large numbers of sperm. / A aquicultura tem assumido crescente importância como fonte de alimentos ricos em proteína. O ariacó, Lutjanus synagris está entre as dez principais espécies capturadas nas pescarias da costa central do Brasil e nos EUA movimentou 157,745 mil dólares nas pescarias de 2010. Um dos pré-requisitos para a domesticação e o estabelecimento da indústria sustentável é a capacidade de controlar a reprodução em cativeiro. O cultivo intensivo e a propagação artificial requerem tecnologias próprias de manipulação dos gametas, as quais incluem o armazenamento em curto prazo para facilitar a reprodução artificial ou mesmo para melhorar sua eficácia. O conhecimento da biologia da espécie é importante para concluir o processo de fertilização e para o desenvolvimento de técnicas de estocagem de sêmen a curto e longo prazos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar quantitativa e qualitativamente o sêmen fresco de ariacó, L. synagris utilizando o sistema computadorizado de análise seminal (CASA). As amostras de sêmen foram analisadas quanto à concentração espermática, volume ejaculado, osmolaridade, pH, morfologia, morfometria e motilidade espermática. As médias de concentração espermática, volume ejaculado, osmolaridade, pH foram 2,43 ± 0,42 x 1010 sptz/mL, 0,39 ± 0,2 mL, 378,5 ± 65,1 mOsm/Kg e 7,9 ± 0,17, respectivamente. O sêmen de L. synagris apresentou 34,6% de patologias primárias e 24,25% de patologias secundárias; os espermatozóides apresentaram comprimento, largura, área e perímetro médio de 3,06 μm, 2,73 μm, 7,63 μm2 e 9,70 μm respectivamente. A motilidade espermática total do sêmen fresco foi de 78,8%, sendo 22,32% considerados de velocidade rápida; a retidão e oscilação médias foram 63,24 e 67% respectivamente; a velocidade curvilinear média foi de 35,13 μm/s, a velocidade média em linha reta foi 13,04 μm/s, a velocidade média de percurso foi 22,14 μm/s; o deslocamento lateral médio da cabeça dos espermatozóides foi 2,84 μm e a frequência de batimento lateral da cauda foi de 4,04 Hz. A utilização do sistema CASA para avaliação da morfologia e motilidade espermáticas foi bem sucedida e mostrou ser um método prático e objetivo para a avaliação de grandes números de espermatozoides.

GIRÃO, P. R. N. V. Um enfoque imunológico sobre infecção viral em Litopenaeus vannamei coletados em fazenda de cultivo do Nordeste do Brasil. 2013. 92 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2016-04-25T12:45:57Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_prnvgirao.pdf: 1576027 bytes, checksum: e07181370bfba28cd170dfce62960e38 (MD5) / Approved for entry into archive by Nadsa Cid (nadsa@ufc.br) on 2016-04-25T17:36:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_prnvgirao.pdf: 1576027 bytes, checksum: e07181370bfba28cd170dfce62960e38 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-25T17:36:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_prnvgirao.pdf: 1576027 bytes, checksum: e07181370bfba28cd170dfce62960e38 (MD5) Previous issue date: 2013 / The shrimp farming has become an important aquaculture industry in the world. Brazil is becoming a leading global producer of shrimp Litopenaeus vannamei. However, outbreaks of viral diseases are affecting the aquaculture industry worldwide, causing significant economic losses. Among the viral agents that affect the marine shrimp Infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus (IHHNV) and infectious myonecrosis virus (IMNV) are prevalent epizootic viral agents in Brazil. Within this context, this study aimed to analyze samples of virus-infected shrimp collected from farms in northeastern Brazil, as well as analyzing the expression levels of molecules of immunity during infection of animals. After a period of unusual rains in a routine monitoring program for the diagnosis of diseases were collected gills of juvenile shrimp with signs of viral disease. For the diagnosis of infection were employed molecular techniques such as conventional PCR, reverse transcription coupled with PCR (RT-PCR) and quantitative PCR (qPCR). Through a combination of different molecular techniques has shown that most of shrimp patients were co-infected with both viruses, IHHNV and IMNV. This study was the first to demonstrate the occurrence of a natural co-infection, caused by IHHNV and IMNV in penaeid shrimp cultured in northeastern Brazil. The reciprocal values for viral load may suggest that competition is occurring between the two viruses to infect the host. To understand how the key molecules of innate immunity respond to this double infection, the level of HSP-70, crustin, peneidinas-3a and C-type lectin-br1 were assessed by quantitative PCR. In tests using linear correlation, HSP-70 expression is regulated by the presented IHHNV in doubly infected shrimp gills, however, transcripts of other genes analyzed showed no statistically significant regulated expression. These results suggest that HSP-70 may be a differential modulator co-infection viral in shrimp, L. vannamei. / O cultivo de camarão tornou-se uma importante indústria na aquicultura mundial. O Brasil está se tornando um dos principais produtores mundiais de camarão Litopenaeus vannamei. Entretanto, surtos de doenças virais estão afetando o setor aquícola em todo o mundo, causando perdas econômicas significativas. Entre os agentes virais que afetam os camarões marinhos, o vírus da necrose infecciosa hipodermal e hematopoiética (IHHNV) e o vírus da mionecrose infecciosa (IMNV) são os vírus epizoóticos mais prevalentes no Brasil. Dentro desse contexto, este trabalho teve como objetivo analisar amostras de camarão infectado por vírus coletadas de fazendas de cultivo no Nordeste do Brasil, bem como analisar os níveis de expressão de moléculas da imunidade dos animais durante a infecção. Após um período incomum de chuvas, em um programa de monitoramento de rotina para o diagnóstico de doenças, foram coletadas brânquias de camarões juvenis com sinais de doença viral. Para o diagnóstico da infecção foram utilizandas técnicas moleculares como PCR convencional, a transcrição reversa acoplada com PCR (RT-PCR) e PCR quantitativo (qPCR). Através da combinação das diferentes técnicas moleculares foi demonstrado que a maioria dos camarões doentes estavam co-infectados com ambos os vírus, IHHNV e IMNV. Este estudo foi o primeiro a demonstrar a ocorrência de uma co-infecção natural, causada por IHHNV e IMNV, em camarões peneídeos cultivados no nordeste do Brasil. Os valores recíprocos para carga viral sugeriram que pode está ocorrendo uma competição entre os dois vírus para infectar o hospedeiro. Para compreender como as moléculas-chave da imunidade inata respondem a esta dupla infecção, os níveis de HSP-70, crustinas, peneidinas-3a e lectina br-1 do tipo-C, foram avaliados por PCR quantitativo. Em testes de correlação linear, a HSP-70 apresentou a expressão regulada por IHHNV em brânquias de camarão duplamente infectado; no entanto, as transcrições dos demais genes analisados não apresentaram expressão regulada estatisticamente significativa. Esses resultados indicam que a HSP-70 pode ser um modulador diferencial de co-infecção viral no camarão, L. vannamei.