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Avaliação do iogurte produzido com leite contendo diferentes níveis de células somáticas. / Evaluation of yoghurt produced from milk with different somatic cell counts.Fernandes, Andrezza Maria 09 January 2004 (has links)
O objetivo do presente estudo foi avaliar as características físico-químicas, microbiológicas, índices de proteólise, lipólise e viscosidade do iogurte natural batido, elaborado a partir de leite integral contendo três níveis de células somáticas (CS): <400.000 células/mL, 400.000-800.000 células/mL e >800.000 células/mL. Cada tipo de leite foi obtido da ordenha de animais previamente selecionados de acordo com o nível de CS e a composição do leite. Para a fabricação do iogurte, o leite foi padronizado quanto ao teor de sólidos totais (ST) e transferido para tanque multi-uso, no qual foi submetido à pasteurização (90ºC, 15 minutos), seguida da adição da cultura starter, incubação (42ºC, aprox. 3 horas) e envase do produto. O iogurte foi mantido em câmara fria a 5ºC, sendo que os parâmetros de qualidade foram avaliados mediante a colheita de amostras nos dias 1, 10, 20 e 30 após a fabricação. A seqüência de elaboração foi repetida seis vezes, no período de março a agosto/2003. As análises efetuadas no produto incluíram: pH, acidez, percentuais de gordura, ST, sólidos não-gordurosos (SNG), nitrogênios total (NT), não caseinoso (NNC) e não protéico (NNP), ácidos graxos livres (AGL), viscosidade aparente, contagem de bactérias láticas e coliformes a 30º e 45ºC. Não foram constatadas diferenças (P > 0,05) entre os parâmetros físico-químicos e microbiológicos obtidos no leite e no iogurte. Os índices de proteólise dos iogurtes, estimados através da relação NT NNC / NT NNP, mantiveram-se constantes, não apresentando diferenças entre os tratamentos (P > 0,05). A viscosidade do iogurte produzido com leite contendo mais de 800.000 células/mL foi maior (P < 0,05) em relação aos outros tratamentos nos dias 10, 20 e 30 após a fabricação, observando-se uma correlação positiva (P < 0,05) com os níveis de CS no 10º e 20º dia de armazenamento. A concentração de AGL foi maior (P < 0,05) no iogurte de alta contagem de CS no 1º e 30º dia de armazenamento, sendo observada uma correlação positiva (P < 0,05) com o nível de CS nos mesmos dias. Os resultados indicam que o aumento dos níveis de CS no leite não apresenta efeitos sobre a proteólise do iogurte, porém origina um aumento na viscosidade e no grau de lipólise do produto durante o armazenamento por 30 dias. / The aim of the present study was to evaluate physical, chemical and microbiological characteristics, as well as proteolysis, lipolysis and viscosity of plain stirred yoghurt produced from whole milk with somatic cell counts (SCC) at levels of < 400,000 cells/mL, 400,000-800,000 cells/mL and > 800,000 cells/mL. Each milk treatment was obtained from selected cows, according to its SSC status and milk composition. Yoghurts were produced after standardisation of milk total solids (TS), followed by pasteurisation (90ºC, 15 minutes), addition of starter culture, incubation (42ºC, approx. 3 hours) and packaging. Yoghurts were stored at 5ºC, and quality evaluation was conducted in samples collected on days 1, 10, 20 and 30 after production. Manufacturing procedures were repeated for six times, from March to August/2003. Yoghurt analyses included: pH, acidity, fat, protein, TS, solids non-fat (SNF), total nitrogen (TN), non-casein nitrogen (NCN) and non-protein nitrogen (NPN), free fatty acids (FFA), apparent viscosity, lactic bacteria counts and coliforms at 30 and 45ºC. There were no differences (P > 0.05) in physical, chemical and microbiological parameters of milk and yoghurt among treatments. Proteolysis, as estimated by TN NCN / TN NPN relation, was constant for all treatment yoghurts (P > 0.05). Viscosity of high SCC yoghurt (> 800,00 cells/mL) increased (P < 0.05) on 10, 20 and 30 days storage, and a positive correlation (P < 0.05) with SCC was observed on days 20 and 30. FFA content was higher (P < 0.05) on days 1 and 30 of storage, and besides there was a positive correlation (P < 0.05) between SCC and FFA levels on the same days of storage. Results indicate that high SCC milk do not affect proteolysis of yoghurt, although it increases viscosity and lypolisis during storage for 30 days.
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Sensibilidade da microalga marinha Dunaliella tertiolecta BUTCHER a diferentes substâncias químicas utilizadas como referência em ensaios ecotoxicológicos / Sensitivity of the marine microalgae Dunaliella tertiolecta BUTCHER to the different chemical substances utilized as toxicity test referenceMinei, Claudia Camila 31 October 2011 (has links)
Os ensaios ecotoxicológicos com o fitoplâncton marinho têm sido uma importante ferramenta para o monitoramento da qualidade de águas devido à sua relevância ecológica. A variabilidade dos resultados dos ensaios ecotoxicológicos também pode ser atribuída à sensibilidade do lote de organismos-teste. O presente trabalho traz informações da sensibilidade de Dunaliella tertiolecta para as substâncias de referências, dicromato de potássio, dodecil sulfato de sódio, cromato de potássio, sulfato de zinco e sulfato de cobre, e dois métodos de determinação da biomassa. As concentrações inibitórias com a densidade celular foram CI50-48h= 177,1, CI50-72h= 129,8 e CI50-96h= 108,5 mg/L de K2Cr2O7; CI50-48h= 0,97, CI50-72h= 1,25 e CI50-96h= 1,18mg/L de DSS e CI50-96h= 273,3mg/L de K2CrO4. Para o conteúdo de clorofila-a (96h), foram CI50-Cl-a= 113,0mg/L de K2Cr2O7; CI50-Cl-a= 1,26mg/L de DSS e CI50-Cl-a= 150,6mg/L de K2CrO4. A sensibilidade da microalga foi maior ao DSS, altamente degradável, em relação aos compostos metálicos, com potencial carcinogênico. As 96h de exposição resultaram em melhor repetibilidade, não havendo diferença significativa entre os métodos utilizados. Na seleção da substância de referência e do método também devem ser considerados os resíduos gerados e a periculosidade dos reagentes, visando à qualidade dos resultados e um menor impacto ao ambiente / The toxicity tests with marine phytoplankton have been an important tool for the water quality monitoring due to its ecological relevance. The variability of the toxicity tests results can also be attributed to the test-organisms batch sensitivity. This study provides information about the sensitivity of Dunaliella tertiolecta to the reference substances potassium dichromate, sodium dodecyl sulfate, potassium chromate, zinc sulfate and copper sulfate, and two methods of biomass determination. The inhibitory concentrations were IC50-48h= 177.1, IC50-72h= 129.8 and IC50-96h= 108.5mg/L of K2Cr2O7; IC50-48h= 0.97, IC50-72h= 1.25 and IC50-96h= 1.18mg/L of DSS and IC50-96h= 273,3mg/L of K2CrO4. For the chlorophyll-a content (96h) were IC50-Cl-a= 113.0mg/L of K2Cr2O7, IC50-Cl-a= 1.26mg/L of SDS and IC50-Cl-a= 150,6mg/L of K2CrO4. The microalgae sensibility was higher to DSS, highly degradable related to metallic compounds, with carcinogenic potential. The 96h of exposure resulted in better repeatability, with no significant difference between the tested methods. In the reference substance and method selection the generated residues and the hazard reagent must be considered, due to the results quality and a lower impact on the ambient.
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Aplicação do controle estatístico de processo (CEP) como ferramenta para a melhoria da qualidade do leite / Application of statistical process control (SPC) as a tool for improvement of milk qualityFabio Henrique Takahashi 01 September 2011 (has links)
Objetivou-se utilizar o controle estatístico de processo (CEP) como ferramenta de melhoria da qualidade do leite. O objetivo do primeiro estudo foi avaliar o CEP como ferramenta de identificação de variações não naturais, na qualidade do leite, passíveis de serem manipuladas. Para este estudo, foram utilizados dados de produção de leite, de contagem de células somáticas (CSS) e de contagem bacteriana total (CBT) de 384 fazendas, obtidos do banco de dados da Clínica do Leite - ESALQ/ USP no ano de 2009. Avaliou-se os efeitos naturais (época do ano e produção de leite) sobre a variação de CCS e CBT, e adicionalmente, foram gerados gráficos de controle para escore de células somáticas (ECS) e contagem bacteriana total transformada (tCBT), com a finalidade de identificar fontes de variação não naturais em um grupo de quatro fazendas. A variabilidade das informações foi avaliada pelo estimador do desvio padrão (sigma), calculado com base na amplitude móvel. Verificou-se que a época do ano influenciou significativamente o ECS e a tCBT. Os gráficos de controle, dentro de cada época, indicaram a presença de variações não naturais no ECS e na tCBT no grupo de fazendas avaliadas. Além disso, os gráficos de controle também caracterizaram fazendas em controle estatístico de processos. No segundo estudo objetivou-se utilizar o CEP como ferramenta de identificação e classificação de fazendas com maiores probabilidades de violarem os padrões de qualidade utilizados pela indústria. Foram utilizados dados de CCS e CBT de 452 fazendas, no período de janeiro de 2009 a março de 2010. Calcularam-se as proporções de violação nos padrões de qualidade, considerando os limites de CCS = 400.000 céls./ mL e CBT = 100.000 UFC/ mL. Foram calculados os índices de capacidade (Cpk) e classificaram-se as fazendas segundo quatro categorias de médias e de índices Cpk. As fazendas que apresentaram maiores médias e desvios obtiveram maiores frequências de violação. As fazendas com médias inferiores aos limites propostos para CCS e CBT representaram, respectivamente, 25,05 % e 97,78 % das fazendas. Entretanto, a proporção de fazendas que forneceram leite consistentemente dentro dos padrões de qualidade avaliados (Cpk 1) representou 4,65 % e 35,17 % das propriedades para CCS e CBT respectivamente. Portanto, a aplicação do CEP dentro das fazendas é uma ferramenta adicional para monitorar a qualidade do leite produzido, o índice Cpk pode ser utilizado em conjunto com os atuais modelos de caracterização da qualidade do leite de fazendas pelas indústrias, uma vez que identifica rebanhos mais consistentes em produzir leite dentro de um padrão de qualidade. / This study aimed to employ statistical process control (SPC) as a tool to improve milk quality. The first objective of the study was to evaluate SPC as tool to identify non-natural variation of milk quality that are possible to be manipulated. In this study, data on milk production, somatic cell count (SCC), and total bacterial count (TBC) of 384 farms were used, provided by database of Clínica do Leite ESALQ/ USP in 2009. Natural effects (time of year and milk production) trough SCC and TBC variation were evaluated, and additionally, control charts for score cell somatic (SCS) and total bacterial count transformed (TBCt) were built aiming to identify sources of non-natural variations in a group of four farms. The variability of information was evaluated trough standard deviation estimator (sigma), calculated with basis of moving range. It was observed that time of year influenced significantly SCS and TBCt. The control charts, in each period, indicated signs of non-natural variation in SCS and TBCt in the group of herds evaluated. Furthermore, the control charts characterized the farms in statistical process control. The second study aimed to use SPC as a tool for identification and rating farms with larger probabilities of infraction on quality standard used by industry. Data of SCC and TBC from 452 farms, from January 2009 to March 2010, were used. The proportion of violation in quality standard, regarding the limits of SCC = 4000,000 cells/ mL and TBC = 100,000 CFU/ mL was calculated. Capability indices (Cpk) were calculated and farms were categorized into four classes of Cpk means and indices. Farms that presented larger means and deviation shoed superior frequencies of violation. Herds with means below the proposed limits of SCC and TBC represented, respectively, 25.05 % and 97.78 % of farms. However, proportion of farms that delivered milk consistently within the standards of quality evaluated (Cpk 1) represented 4.65 % and 35.17 % of farms for SCC and TBC, respectively. Therefore, application of SPC on farms is an additional tool for monitoring milk quality produced, the index Cpk can be used, by industries, associated with the current models to characterize milk quality from farms, since it identifies herds more consistent in producing quality-standard milk.
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Correlação entre ácido ascórbico plasmático, contagem de células somáticas no leite e o perfil metabólico de vacas secas e em lactação / Correlation between plasma ascorbic acid, milk somatic cell count and metabolic profile in lactating and dry cowsSantos, Marcos Veiga dos 26 October 1998 (has links)
Vacas em lactação apresentam capacidade de síntese endógena de ácido ascórbico para suprir os seus requerimentos, no entanto, sob condições estressantes como altas temperaturas e umidade, elevadas produções de leite, parasitoses e incidência de doenças, pode haver produção insuficiente de ácido ascórbico para as demandas metabólicas do animal. Foram objetivos do presente estudo avaliar o efeito do estágio de lactação e número de lactações sobre a concentração plasmática de ácido ascórbico de 153 vacas em lactação e 40 vacas no período seco em 3 fazendas leiteiras, e sua correlação com: a contagem de células somáticas (CCS) no leite, níveis de glicose plasmática, níveis de ácidos graxos não-esterificados (AGNE), níveis de insulina plasmática, níveis de beta-hidroxibutirato (BHBA) plasmático, níveis de aspartato-aminotransferase (AST) plasmática, níveis de produção de leite e escore de condição corporal. Os animais foram escolhidos ao acaso e agrupados em 5 grupos de acordo com o estágio de lactação (estágio 1: 1-28 dias; estágio 2: 29-56 dias; estágio 3: 57-140 dias; estágio 4: 141-280 dias e estágio 5: vacas secas) e de acordo com o número de lactações (primíparas ou multíparas). Amostras de sangue foram coletadas para determinação de ácido ascórbico plasmático utilizando técnica de cromatografia líquida de alta pressão. A análise estatística foi realizada com o uso do programa computacional SAS. A concentração média (mg/L) de ácido ascórbico plasmático foi de 2,67; 2,60; 2,46; 2,63 e 2,60 para os estágios de 1 a 5 respectivamente, e de 2,52 e 2,63 para multíparas e primíparas. Foi identificada correlação negativa entre o ácido ascórbico plasmático e glicose e AGNE plasmáticos, e correlação positiva entre ácido ascórbico plasmático e produção de leite. Não foram registradas correlações entre ácido ascórbico plasmático e demais parâmetros. Baseado nos resultados do presente estudo, foi possível concluir que o ácido ascórbico plasmático não sofreu efeito de estágio de lactação ou número de lactações, e ainda que identificada correlação entre ácido ascórbico plasmático e as variáveis glicose, AGNE e produção de leite não foi possível identificar o fator determinante da variabilidade do ácido ascórbico plasmático em vacas leiteiras. / Dairy cows are totally dependent of endogenous synthesis of ascorbic acid to meet their requirements. Therefore, any condition that decrease the availability of ascorbic acid precursors like glucose and galactose, may result in insufficient synthesis of ascorbic acid. High producing dairy cows may be predisposed to subclinical ascorbic acid deficiency due to the elevated demand for glucose to lactose synthesis by mammary gland. The purpose of this study was to determine the effects of stage of lactation and number of lactations on plasma ascorbic acid concentration, and to establish the association between plasma ascorbic acid level and glucose, insulin, non-esterified fatty acids (NEFA), beta-hydroxybutyrate (BHBA), aspartate-amino transferase (AST), milk somatic cell count (SCC), milk yield and body condition score in dairy cows. One hundred and ninety three dairy cows (153 lactating and 40 dry cows) from 3 different herds were used in this study. Animals were randomly selected, and assigned to 5 groups according the stage of lactation (stage 1: 1-28 days; stage 2: 29-56 days; stage 3: 57-140 days; stage 4: 141-280 days and stage 5: dry cows) and the number of lactation (primiparous or multiparous). Blood samples were taken for ascorbic acid determination by HPLC technique. Statistical analysis was performed using the SAS program. Statistical significance was declared at the 5% level. Average plasma ascorbic acid concentration (mg/L) for Group 1 to 5 were 2.67; 2.60; 2.46; 2.63 and 2.60, respectively, and 2.63 and 2.52 for primiparous and multiparous cows. A negative correlation was observed between ascorbic acid and both glucose and NEFAs and a positive correlation between ascorbic acid and milk yield. No correlation was found between ascorbic acid and other parameters. Results of this study demonstrated that plasma ascorbic acid concentration did not change in response to stage of lactation and number of lactations and eventhough plasma ascorbic acid was correlated to glucose, NEFAs and milk yield, it was not possible to identify the factor that determine ascorbic acid variability in dairy cows.
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Fatores de virulência de Staphylococcus spp. e viabilidade celular na mastite subclínica de cabras / Virulence factors of Staphylococcus spp. and cell viability in subclinical mastitis of goatsSalaberry, Sandra Renata Sampaio 13 August 2014 (has links)
A mastite subclínica em caprinos é causada principalmente pelo Staphylococcus spp., sendo os estafilococos coagulase negativa (SCN) os patógenos de maior ocorrência e o S. aureus, a espécie de estafilococos mais pesquisada. Dessa forma, pouco se conhece sobre a patogenicidade de SCN e outros estafilococos coagulase positiva (SCP), além do S. aureus. Também há poucos estudos sobre a variação da viabilidade celular na mastite subclínica de cabras. Assim, o objetivo do presente estudo foi determinar os fatores de virulência de adesão e produção de biofilme de estirpes de Staphylococcus spp. isoladas de amostras de leite de cabras, verificando possíveis associações com a viabilidade celular. Para realizar a colheita das amostras, primeiramente, foi efetuada um exame físico da glândula mamária, com posterior realização dos testes da caneca de fundo preto e California mastitis test (CMT). A colheita do leite foi efetuada em três alíquotas: análises microbiológicas, contagem de células somáticas (CCS) e viabilidade celular. Realizou-se a identificação, teste de antibiograma e PCR (Reação em cadeia polimerase) dos Staphylococcus spp. isolados nas amostras de leite. Os genes de virulência pesquisados no PCR foram: cna, eno, ebpS, fnbA, fnbB, fib e bap. Avaliou-se a quantidade de CCS, em equipamento de citometria de fluxo, e a viabilidade celular, após centrifugações das amostras de leite e visualização das células em microscópio, utilizando o corante azul de Trypan. Os resultados foram: 122 amostras com crescimento bacteriano e dessas, 110 (90,2%) foram identificadas como Staphylococcus spp., sendo 90 (73,8%) de SCN e 12 (16,4%) de SCP. As espécies mais isoladas de estafilococos foram: S. epidermidis (24,55%), S. lugdunensis (15,40%) e S. intermedius (13,64%). As amostras apresentaram maior resistência aos antimicrobianos: penicilina (81,8%), oxacilina (60,0%) e ampicilina (55,5%). Observou-se maior sensibilidade para: enrofloxacina (99,1%), eritromicina (98,2%), gentamicina (98,2%) e vancomicina (98,2%). Com relação aos fatores de virulência pesquisados, foram encontradas amostras positivas para todos os genes, com exceção do gene fnbB: eno (53,6%), bap (43,7%), ebpS (19,1%), fnbA (18,2%) e fib (16,4%). Mais de um gene foi detectado em algumas estirpes, sendo que as associações de maior ocorrência foram: bap/eno em SCN e ebpS/eno/fib/fnbA em SCP. Os valores da CCS das amostras de leite com isolamento de Staphylococcus spp., SCN e SCP foram maiores do que nas amostras sem isolamento bacteriano e as estirpes com presença da associação de genes ebpS/eno/fib/fnbA apresentaram maior CCS do que bap/eno. Com relação à viabilidade celular, as amostras com isolamento de Staphylococcus spp. apresentaram maior viabilidade celular do que as amostras sem isolamento bacteriano e não houve associação dos genes identificados nas estirpes com a viabilidade celular. Concluiu-se que os genes eno e bap apresentaram maior ocorrência nas estirpes de Staphylococcus spp., sendo os mais encontrados nos isolados de SCN e os genes ebpS, fib e fnbA foram os mais detectados nos SCP. A viabilidade celular foi maior nas amostras com isolamento de Staphylococcus spp. em relação as sem isolamento bacteriano e não houve associação entre os fatores de virulência das estirpes de Staphylococcus spp. e a viabilidade celular. / Subclinical mastitis in goats is mainly caused by Staphylococcus spp., coagulase-negative staphylococci (CNS) is the most frequent pathogens and S. aureus, the most researched specie of staphylococci. Thus, little is known about the pathogenicity of SCN and other coagulase-positive staphylococci (CPS), beyond the S. aureus. There are few studies on the variation of cell viability in subclinical mastitis of goats. The aim of the present study was to determine the virulence factors of adhesion and biofilm production of Staphylococcus spp. strains isolated from milk samples of goats, verifying for possible associations with cell viability. To collect samples, firstly, was performed a physical examination of the mammary gland, with subsequent tests for mug of black background and California mastitis test (CMT). Three aliquots of milk were collected: microbiological analysis, somatic cell count (SCC) and cell viability. Identification, antibiotic susceptibility testing and PCR (polymerase chain reaction) were performed of Staphylococcus spp. isolated from milk samples. Virulence genes researched in PCR were: cna, eno, ebpS, fnbA, fnbB, fib and bap. Evaluation of CCS, using flow cytometry equipment, and cell viability, after centrifugation of milk samples and visualization the cells in the microscope using Trypan blue dye, were performed. The results were: from 122 samples with bacterial growth, 110 (90.2%) were identified as Staphylococcus spp., 90 (73.8%) of CNP and 12 (16.4%) of the CNP. The most isolated staphylococci species were: S. epidermidis (24.55%), S. lugdunensis (15.40%) and S. intermedius (13.64%). Samples showed higher resistance to antimicrobials: penicillin (81.8%), oxacillin (60.0%) and ampicillin (55.5%). We observed higher sensitivity to: enrofloxacin (99.1%), erythromycin (98.2%), gentamicin (98.2%) and vancomycin (98.2%). Regarding virulence factors researched, positive samples were found for all genes, except fnbB gene: eno (53.6%), bap (43.7%), ebpS (19.1%), fnbA (18.2%) and fib (16.4%). More than one gene were detected in some strains, with the most frequent associations were bap/eno in CNS and ebpS/eno/fib/fnbA in CNP. The values of SCC of milk samples with isolation of Staphylococcus spp., CNS and CNP were higher than samples without bacterial isolation and the isolation of strains with combination of ebpS/eno/fib/fnbA genes showed higher SCC than bap/eno. Regarding cell viability, samples with isolation of Staphylococcus spp. showed higher cell viability than samples without bacterial isolation and there was no association of the genes identified in strains with cell viability. In conclusion, eno and bap genes were more frequent in Staphylococcus spp. strains, eno and bap genes were mostly found in isolated CNS and ebpS, fib and fnbA genes were more detected in CNP. Cell viability was higher in samples with isolation of Staphylococcus spp. compared those without bacterial isolation and there was no association between the virulence factors of Staphylococcus spp. strains and cell viability.
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Estudo da reprodutibilidade do exame de microscopia especular de córnea em amostras com diferentes números de células / Reproducibility study of the corneal specular microscope in samples with different number of cellsHolzchuh, Ricardo 19 August 2011 (has links)
INTRODUÇÃO: O endotélio corneal exerce papel primordial para a fisiologia da córnea. Seus dados morfológicos gerados pelo microscópio especular (MEC) como densidade endotelial (DE), área celular média (ACM), coeficiente de variação (CV) e porcentagem de células hexagonais (HEX) são importantes para avaliar sua vitalidade. Para interpretar estes dados de forma padronizada e reprodutível, foi utilizado um programa estatístico de análise amostral, Cells Analyzer PAT. REQ.(CA). OBJETIVO: Demonstrar valores de referência para DE, ACM, CV e HEX. Demonstrar o percentual de células endoteliais marcadas e desconsideradas no exame ao marcar-se 40, 100 e 150 células em uma única imagem do mosaico endotelial e o perfil do intervalo de confiança (IC) das variáveis estudadas ao se considerar 40, 100, 150 e tantas células quantas indicadas pelo CA. Demonstrar o erro amostral de cada grupo estudado. MÉTODOS: Estudo transversal. Os exames de MEC foram realizados com o aparelho Konan NONCON ROBO® SP-8000, nos 122 olhos de 61 portadores de catarata (63,97 ± 8,15 anos de idade). As imagens endoteliais caracterizaram se pelo número de células marcadas e consideradas para cálculo dos seguintes dados: DE, ACM, CV e HEX. Os grupos foram formados de 40, 100, 150 células marcadas numa única imagem endotelial e Grupo CA em que foram marcadas tantas células quanto necessárias em diferentes imagens, para obter o erro relativo calculado inferior ao planejado (0,05), conforme orientação do programa CA. Estudou-se o efeito do número de células sobre IC para as variáveis endoteliais utilizadas. RESULTADOS: A média dos valores de referência encontrados para DE foi 2395,37 ± 294,34 cel/mm2; ACM 423,64 ± 51,09 m2; CV 0,40 ± 0,04 e HEX 54,77 ± 4,19%. O percentual de células endoteliais desconsideradas no Grupo 40 foi 51,20%; no Grupo 100, 35,07% e no Grupo 150, 29,83%. O número médio de células calculado inicialmente pelo CA foi 247,48 ± 51,61 e o número médio de células efetivamente incluídas no final do processo amostral foi 425,25 ± 102,24. O erro amostral dos exames no Grupo 40 foi 0,157 ± 0,031; Grupo 100, 0,093 ± 0,024; Grupo 150, 0,075 ± 0,010 e Grupo CA, 0,037 ± 0,005. O aumento do número de células diminuiu a amplitude do IC nos olhos direito e esquerdo para a DE em 75,79% e 77,39%; ACM em 75,95% e 77,37%; CV em 72,72% e 76,92%; HEX em 75,93% e 76,71%. CONCLUSÃO: Os valores de referência da DE foi 2395,37 ± 294,34 cel/mm2; ACM foi 423,64 ± 51,09 m2; CV foi 0,40 ± 0,04 e HEX foi 54,77 ± 4,19%. O percentual de células endoteliais desconsideradas no Grupo 40 foi 51,20%; no Grupo 100 foi 35,07% e no Grupo 150 foi 29,83%. O programa CA considerou correto os exames nos quais 425,25 ± 102,24 células foram marcadas entre duas e cinco imagens (erro relativo calculado de 0,037 ± 0,005). O aumento do número de células diminuiu a amplitude do IC para todas as variáveis endoteliais avaliadas pela MEC / INTRODUCTION: Corneal endothelium plays an important role in physiology of the cornea. Morphological data generated from specular microscope such as endothelial cell density (CD), average cell area (ACA), coefficient of variance (CV) and percentage of hexagonal cells (HEX) are important to analyze corneal status. For a standard and reproducible analysis of the morphological data, a sampling statistical software called Cells Analyzer PAT. REC (CA) was used. PURPOSE: To determine normal reference values of CD, ACA, CV and HEX. To analyze the percentage of marked and excluded cells when the examiner counted 40, 100, 150 cells in one endothelial image. To analyze the percentage of marked and excluded cells according to the statistical software. To determine the confidence interval of these morphological data. METHODS: Transversal study of 122 endothelial specular microscope image (Konan, non-contact NONCON ROBO® SP- 8000 Specular Microscope) of 61 human individuals with cataract (63.97 ± 8.15 years old) was analyzed statistically using CA. Each image was submitted to standard cell counting. 40 cells were counted in study Group 40; 100 cells were counted in study Group 100; and 150 cells were counted in study Group 150. In study group CA, the number of counted cells was determined by the statistical analysis software in order to achieve the most reliable clinical information (relative error < 0,05). Relative error of the morphological data generated by the specular microscope were then analyzed by statistical analysis using CA software. For Group CA, relative planned error was set as 0.05. RESULTS: The average normal reference value of CD was 2395.37 ± 294.34 cells/mm2, ACA was 423.64 ± 51.09 m2, CV was 0.40 ± 0.04 and HEX was 54.77 ± 4.19%. The percentage of cells excluded for analysis was 51.20% in Group 40; 35.07% in Group 100; and 29.83% in Group 150. The average number of cells calculated initially by the statistical software was 247.48 ± 51.61 cells and the average number of cells included in the final sampling process was 425.25 ± 102.24 cells. The average relative error was 0.157 ± 0.031 for Group 40; 0.093 ± 0.024 for Group 100; 0.075 ± 0.010 for Group 150 and 0.037 ± 0.005 for Group CA. The increase of the marked cells decreases the amplitude of confidence interval (right and left eyes respectively) in 75.79% and 77.39% for CD; 75.95% and 77.37% for ACA; 72.72% and 76.92% for CV; 75.93% and 76.71% for HEX. CONCLUSION: The average normal reference value of CD was 2395.37 ± 294.34 cells/mm2, ACA was 423.64 ± 51.09 m2, CV was 0.40 ± 0.04 and HEX was 54.77 ± 4.19%. The percentage of excluded cells for analysis was 51.20% in Group 40; 35.07% in Group 100 and 29.83% in Group 150. CA software has considered reliable data when 425.25 ± 102.24 cells were marked by the examiner in two to five specular images (calculated relative error of 0.037 ± 0.005). The increase of the marked cells decreases the amplitude of confidence interval for all morphological data generated by the specular microscope
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Sensibilidade da microalga marinha Dunaliella tertiolecta BUTCHER a diferentes substâncias químicas utilizadas como referência em ensaios ecotoxicológicos / Sensitivity of the marine microalgae Dunaliella tertiolecta BUTCHER to the different chemical substances utilized as toxicity test referenceClaudia Camila Minei 31 October 2011 (has links)
Os ensaios ecotoxicológicos com o fitoplâncton marinho têm sido uma importante ferramenta para o monitoramento da qualidade de águas devido à sua relevância ecológica. A variabilidade dos resultados dos ensaios ecotoxicológicos também pode ser atribuída à sensibilidade do lote de organismos-teste. O presente trabalho traz informações da sensibilidade de Dunaliella tertiolecta para as substâncias de referências, dicromato de potássio, dodecil sulfato de sódio, cromato de potássio, sulfato de zinco e sulfato de cobre, e dois métodos de determinação da biomassa. As concentrações inibitórias com a densidade celular foram CI50-48h= 177,1, CI50-72h= 129,8 e CI50-96h= 108,5 mg/L de K2Cr2O7; CI50-48h= 0,97, CI50-72h= 1,25 e CI50-96h= 1,18mg/L de DSS e CI50-96h= 273,3mg/L de K2CrO4. Para o conteúdo de clorofila-a (96h), foram CI50-Cl-a= 113,0mg/L de K2Cr2O7; CI50-Cl-a= 1,26mg/L de DSS e CI50-Cl-a= 150,6mg/L de K2CrO4. A sensibilidade da microalga foi maior ao DSS, altamente degradável, em relação aos compostos metálicos, com potencial carcinogênico. As 96h de exposição resultaram em melhor repetibilidade, não havendo diferença significativa entre os métodos utilizados. Na seleção da substância de referência e do método também devem ser considerados os resíduos gerados e a periculosidade dos reagentes, visando à qualidade dos resultados e um menor impacto ao ambiente / The toxicity tests with marine phytoplankton have been an important tool for the water quality monitoring due to its ecological relevance. The variability of the toxicity tests results can also be attributed to the test-organisms batch sensitivity. This study provides information about the sensitivity of Dunaliella tertiolecta to the reference substances potassium dichromate, sodium dodecyl sulfate, potassium chromate, zinc sulfate and copper sulfate, and two methods of biomass determination. The inhibitory concentrations were IC50-48h= 177.1, IC50-72h= 129.8 and IC50-96h= 108.5mg/L of K2Cr2O7; IC50-48h= 0.97, IC50-72h= 1.25 and IC50-96h= 1.18mg/L of DSS and IC50-96h= 273,3mg/L of K2CrO4. For the chlorophyll-a content (96h) were IC50-Cl-a= 113.0mg/L of K2Cr2O7, IC50-Cl-a= 1.26mg/L of SDS and IC50-Cl-a= 150,6mg/L of K2CrO4. The microalgae sensibility was higher to DSS, highly degradable related to metallic compounds, with carcinogenic potential. The 96h of exposure resulted in better repeatability, with no significant difference between the tested methods. In the reference substance and method selection the generated residues and the hazard reagent must be considered, due to the results quality and a lower impact on the ambient.
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Análise do hemograma e dos marcadores inflamatórios séricos na cárie da primeira infância / Hemogram and serum inflammatory markers analysis in early childhood cariesLima, Gisele Quariguasi Tobias 01 February 2017 (has links)
Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-05-15T17:37:00Z
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Previous issue date: 2017-02-01 / Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Maranhão (FAPEMA) / Objective: Early Childhood Caries (ECC) has been associated with systemic conditions such
as obesity and other nutritional deficiencies. These associations have not been adequately
studied yet. The present study aimed at evaluating systemic conditions that may be underlying
the severity of caries in early childhood. The aim of this study was to evaluate the serum
levels of interleukin- 1β (IL-1β), interleukin (IL-6), tumor necrosis factor-α (TNF-α) and
lipocalin associated with human neutrophil gelatinase (NGAL) associated with higher caries
severity in early childhood (number of cavities), in a theoretical model adjusted for social
variables, BMI Z score and consumption of beverages with added sugar; and Chapter II aimed
at comparing the mean hemoglobin, neutrophils and eosinophils in children with Severe Early
Childhood Cavities (S-ECC) and carie-free children and also to analyze the association
between these components of the hemogram with the presence of S-ECC, in models adjusted
for socioeconomic variables and for the consumption of sugar rich beverages. Methods: A
case-control study was carried out in São Luis, Maranhão, Brazil, from June 2015 to
September 2016. The sample was obtained from the randomization of the original sample
from a historical cohort; with 152 children aged between 4 and 5 years old, 72 cases (children
with ECC) and 80 controls (caries free). The data were obtained through a structured and
validated questionnaire containing socioeconomic, demographic and maternal schooling
questions applied to mothers or caregivers; a Food Frequency Questionnaire (FFQ) and
anthropometric examination, to evaluate the nutritional status; oral clinical examination of
children for assessment of decayed teeth (ceo-d index); blood tests and reading of serum
inflammatory markers and blood count. For Article 1, a Poisson regression model was
suggested to evaluate the association between social factors, the BMI Z score (Body Mass
Index), sugar consumption and severity of ECC; and for the analysis of the association
between serum levels of IL-1β, IL-6, TNF-α and NGAL and severity of ECC with adjusted
model for social variables, BMI Z score and consumption of added sugar beverages. The
average ratio (AR) and the respective confidence intervals (95% CI) were estimated at a
significance level of 5%. For Article 2, a comparison test of the hemogram (hemoglobin,
neutrophils and eosinophils) of children with and without S-ECC was performed, and Logistic
Regression models were applied to test the association between Levels of hemoglobin,
neutrophils, and eosinophils and presence of S-ECC and adjusted for family income, mother's
schooling, sex and consumption of sugar-rich beverages, with estimated coefficients in OR,
95% confidence intervals, Significance level of 5%. Results: In chapter 1, the highest tertiles
of the serum levels of IL-6 (2nd tercil- AR = 1,55, CI = 1,14-2,10, p = 0.005, 3rd tercil- AR =
1,54, CI = 13-2.09, p = 0.006), TNF-α (3rd tercil- RM = 1.33, CI = 1.00-1.78, p = 0.040) and
NGAL (2nd tercil- AR = 1.79, CI = 1.10-2.90, p ≤ 0.001, 3rd tercil- AR = 2.04, CI = 1.26-
3.30, p = 0.003) were associated with the highest severity of caries in early infancy, even after
adjusting for BMI, however after adjusting the model for the consumption of beverages with
added sugar, the associations were maintained for IL-6 the strength of association of NGAL
was reduced, and for TNF-α there was no association. In Chapter 2, lower mean hemoglobin
levels (p = 0.036), higher mean neutrophils (p = 0.040) and eosinophils (p = 0.034) were
found in children with S-ECC compared to caries-free ; in the regression models adjusted for
economic and socioeconomic variables, higher levels of hemoglobin were protective for SECC
(OR 0.64; IC=0,41-0,97; p=0,040) while higher levels of neutrophils were indicators of
risk of S-ECC (OR 1.03; IC=1,02-1,06; p=0,040), and after adjustment for frequency of
consumption of sugar-rich beverages, the strength of association of these components with the
S-ECC was reduced, suggesting that the higher frequency of consumption of these sugars are
a common factor that bind blood-to-blood changes to S-ECC. Conclusion: Higher serum
levels of IL-6, TNF-α and NGAL are associated with higher caries severity in children,
suggesting the presence of underlying systemic inflammation and excessive consumption of
added sugars seem to be implicated in the relationship between higher serum levels of TNF-α
and NGAL with Severity of caries in children. Higher levels of neutrophils and eosinophils
and lower levels of hemoglobin have been shown in children with S-ECC suggesting that
systemic alterations such as iron deficiency and inflammation should be investigated in the
presence of S-ECC by multidisciplinary health teams. / Objetivo: A Cárie na Primeira Infância (CPI) tem sido associada a condições sistêmicas
como a obesidade e outras carências nutricionais; no entanto, as evidências ainda são frágeis.
O presente estudo propôs-se a avaliar condições sistêmicas que possam estar subjacentes à
gravidade de cárie na primeira infância. Assim sendo, esta tese foi dividida em dois capítulos:
O capítulo I teve como objetivo avaliar os níveis séricos de interleucina- 1β (IL-1β),
interleucina (IL- 6), fator de necrose tumoral- α (TNF-α) e lipocalina associada à gelatinase
dos neutrófilos humanos (NGAL) associados a maior gravidade da cárie na primeira infância
(número de cavidades), em modelo teórico ajustado para as variáveis socioeconômicas e
demográficas, escore Z do IMC e consumo de bebidas com açúcar de adição; e o capítulo II
teve como objetivo comparar as médias de hemoglobina, neutrófilos e eosinófilos em crianças
com Cárie Grave na Primeira Infância (CPI-G) e livres de cárie e analisar a associação entre
esses componentes do hemograma com a presença da CPI-G, em modelos ajustados para
variáveis socioeconômicas e demográficas e para o consumo de bebidas ricas em açúcar.
Métodos: Estudo caso-controle foi realizado em São Luis, Maranhão, Brasil, no período de
junho de 2015 à setembro de 2016. A amostra foi obtida a partir da aleatorização da amostra
original de uma coorte histórica; sendo selecionadas 152 crianças, entre 4 e 5 anos de idade,
72 casos (crianças com CPI) e 80 controles (crianças livres de cárie). Os dados foram obtidos
por meio de um questionário estruturado e validado contendo questões socioeconômicas,
demográfica aplicado às mães ou responsáveis; de um Questionário de Frequência Alimentar
(QFA) e de exame antropométrico, para avaliação do estado nutricional; exame clínico bucal
das crianças para aferição de dentes cariados (índice ceo-d); exames de sangue e leitura de
marcadores inflamatórios séricos e do hemograma. Para o Artigo 1, foi sugerido modelo de
regressão de Poisson para avaliar: a associação entre os fatores sociais, o escore Z do IMC
(Índice de Massa Corpórea), consumo de açúcar e gravidade de CPI; e para análise da
associação entre os níveis séricos de IL-1β, IL-6, TNF-α e NGAL e gravidade de CPI com
modelo ajustado para variáveis socioeconômicas e demográfica, escore Z do IMC e consumo
de bebidas com açúcar de adição. Estimou-se a razão das médias (RM) e os respectivos
intervalos de confiança (IC 95%), a um nível de significância de 5%. Para o Artigo 2 foi feito
um teste de comparação de médias (Teste T não pareado) das variáveis do hemograma
(hemoglobina, neutrófilos e eosinófilos) em crianças com CPI-G e livres de cárie, e aplicados
modelos de Regressão Logística para testar a associação entre os níveis de hemoglobina, de
neutrófilos, e eosinófilos e presença de CPI-G e ajustados para renda familiar, escolaridade da
mãe, sexo e consumo de bebidas ricas em açúcar, com os coeficientes estimados em OR,
intervalos de confiança de 95%, a um nível de significância de 5%. Resultados: No capítulo
1, maiores tercis dos níveis séricos de IL-6 (2º tercil- RM= 1,55, IC= 1,14-2,10, p = 0,005; 3º
tercil- RM=1,54, IC=1,13-2,09, p = 0,006), de TNF-α (3º tercil- RM=1,33, IC=1,00-1,78,
p=0,040) e de NGAL (2º tercil- RM=1,79, IC= 1,10-2,90, p ≤ 0,001; 3º tercil- RM=2,04,
IC=1,26-3,30, p = 0,003) se associaram com a maior gravidade da cárie na primeira infância,
e se mantiveram associados mesmo após ajuste para IMC, entretanto após ajuste do modelo
para o consumo de bebidas com açúcar de adição, as associações foram mantidas para IL-6, a
força de associação do NGAL foi reduzida, e para TNF-α não houve associação. No capítulo
2, menores médias de hemoglobina (p=0,036), maiores médias de neutrófilos (p=0,040) e de
eosinófilos (p=0,034) foram encontradas em crianças com CPI-G comparadas às livres de
cárie; nos modelos de regressão ajustados para variáveis socioeconômicas, maiores níveis de
hemoglobina foram protetores à CPI-G (OR 0,64; IC=0,41-0,97; p=0,040) enquanto maiores
níveis de neutrófilos foram indicadores de risco da CPI-G (OR 1,03; IC=1,02-1,06; p=0,040),
e após ajuste para a frequência de consumo de bebidas ricas em açúcares, a força de
associação desses componentes do hemograma com a CPI-G foi reduzida, sugerindo que a
maior frequência de consumo desses açúcares seja fator comum às alterações do hemograma
em relação à CPI-G. Conclusão: maiores níveis séricos de IL-6, TNF-α e NGAL estão
associados à maior gravidade de cárie em crianças, sugerindo presença de inflamação
sistêmica subjacente e o excessivo consumo de açúcares de adição parece estar implicado na
relação entre maiores níveis séricos TNF-α e NGAL com gravidade da cárie em crianças.
Maiores níveis de neutrófilos e de eosinófilos e menores de hemoglobina foram mostrados em
crianças com a CPI-G sugerindo que alterações sistêmicas como deficiência de ferro e
inflamação devam ser pesquisadas na presença de CPI-G por equipes multidisciplinares de
saúde.
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Diagnostic and prognostic value of current phenotyping methods and novel molecular markers in idiopathic pulmonary fibrosisNicol, Lisa Margaret January 2018 (has links)
Background Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a devastating form of chronic lung injury of unknown aetiology characterised by progressive lung scarring. A diagnosis of definite IPF requires High Resolution Computed Tomography (HRCT) appearances indicative of usual interstitial pneumonia (UIP), or in patients with 'possible UIP' CT appearances, histological confirmation of UIP. However the proportion of such patients that undergo SLB varies, perhaps due to a perception of risk of biopsy and additive diagnostic value of biopsy in individual patients. We hypothesised that an underlying UIP pathological pattern may result in increased risk of death and aimed to explore this by comparing the risk of SLB in suspected idiopathic interstitial pneumonia, stratified according to HRCT appearance. Additionally we sought to determine the positive-predictive value of biopsy to diagnose IPF in patients with 'possible UIP HRCT' in our population. In patients with possible UIP who are not biopsied, the clinical value of bronchoalveolar lavage (BAL) is uncertain. We aimed to prospectively study the diagnostic and prognostic value of BAL differential cell count (DCC) in suspected IPF and determine the feasibility of repeat BAL and the relationship between DCC and disease progression in two successive BALs. We hypothesised that BAL DCC between definite and possible IPF was different and that baseline DCC and change in BAL DCC predicted disease progression. Alveolar macrophages (AMs) are an integral part of the lung's reparative mechanism following injury, however in IPF they contribute to pathogenesis by releasing pro-fibrotic mediators promoting fibroblast proliferation and collagen deposition. Expansion of novel subpopulations of pulmonary monocyte-like cells (PMLCs) has been reported in inflammatory lung disease. We hypothesised that a distinct AM polarisation phenotype would be associated with disease progression. We aimed to perform detailed phenotyping of AM and PMLCs in BAL in IPF patients. Several prognostic scoring systems and biomarkers have been described to predict disease progression in IPF but most were derived from clinical trial patients or tertiary referral centres and none have been validated in separate cohorts. We aimed to identify a predictive tool for disease progression utilising physiological, HRCT and serum biomarkers in a unique population of incident treatment naïve IPF patients. Methods Between 01/01/07 and 31/12/13, 611 consecutive incident patients with suspected idiopathic interstitial pneumonia (IIP) presented to the Edinburgh lung fibrosis clinic. Of these patients 222 underwent video-assisted thoracoscopic lung biopsy and histological pattern was determined according to ATS/ERS criteria. Post-operative mortality and complication rates were examined. Fewer than 2% received IPF-directed therapy and less than 1% of the cohort were lost to follow-up. Disease progression was defined as death or ≥10% decline in VC within 12 months of BAL. Cells were obtained by BAL and a panel of monoclonal antibodies; CD14, CD16, CD206, CD71, CD163, CD3, CD4, CD8 and HLA-DR were used to quantify and selectively characterise AMs, resident PMLCs, inducible PMLCs, neutrophils and CD4+/CD8+ T-cells using flow cytometry. Classical, intermediate and non-classical monocyte subsets were also quantified in peripheral blood. Potential biomarkers (n=16) were pre-selected from either previously published studies of IPF biomarkers or our hypothesis-driven profiling. Linear logistic regression was used on each predictor separately to assess its importance in terms of p-value of the associated weight, and the top two variables were used to learn a decision tree. Results Based on the 2011 ATS/ERS criteria, 87 patients were categorised as 'definite UIP', of whom 3 underwent SLB for clinical indications. IPF was confirmed in all 3 patients based on 2013 ATS/ERS/JRS/ALAT diagnostic criteria. 222 patients were diagnosed with 'possible UIP'; 55 underwent SLB, IPF was subsequently diagnosed in 37 patients, 4 were diagnosed with 'probable IPF' and 14 were considered 'not IPF'. In this group, 30 patients were aged 65 years or over and 25/30 (83%) had UIP on biopsy. 306 patients had HRCTs deemed 'inconsistent with UIP', SLB was performed in 168 patients. Post6 operative 30-day mortality was 2.2% overall, and 7.3% in the 'possible UIP' HRCT group. Patients with 'definite IPF' based on HRCT and SLB appearances had significantly better outcomes than patients with 'definite UIP' on HRCT alone (P=0.008, HR 0.44 (95% CI 0.240 to 0.812)). BAL DCC was not different between definite and possible UIP groups, but there were significant differences with the inconsistent with UIP group. In the 12 months following BAL, 33.3% (n=7/21) of patients in the definite UIP group and 29.5% (n=18/61) in the possible UIP group had progressed. There were no significant differences in BAL DCC between progressor and non-progressor groups. Mortality in patients with suspected IPF and a BAL DCC consistent with IPF was no different to those with a DCC inconsistent with IPF (P=0.425, HR 1.590 (95% CI 0.502 to 4.967)). There was no difference in disease progression in either group (P=0.885, HR 1.081 (95% CI 0.376 to 3.106)). There was no statistically significant difference in BAL DCC at 0 and 12 months in either group. There was no significant change in DCC between 0 and 12 month BALs between progressors and non-progressors. Repeat BAL was well tolerated in almost all patients. There was 1 death within 1 month of a first BAL and 1 death within 1 month of a second BAL; both were considered 'probably procedure-related'. AM CD163 and CD71 (transferrin receptor) expression were significantly different between groups (P < 0.0001), with significant increases in the IPF group vs non fibrotic ILD (P < 0.0001) and controls (P < 0.0001 and P < 0.001 respectively). CD71 expression was also significantly increased in the IPF progressor vs non-progressor group (P < 0.0001) and patients with high CD71 expression had significantly poorer survival than the CD71low group (P=0.040, median survival 40.5 and 75.6 months respectively). CD206 (mannose receptor) expression was also significantly higher in the IPF progressor vs non-progressor group (P=0.034). There were no differences in baseline BAL neutrophil, eosinophil or lymphocyte percentages between IPF progressor or non-progressor groups. The percentage of rPMLCs was significantly increased in BAL fluid cells of IPF patients compared to those with non-fibrotic ILD (P < 0.0001) and healthy controls (P < 0.05). Baseline rPMLC percentage was significantly higher in IPF progressors vs IPF non-progressors (P=0.011). Baseline BAL iPMLC:rPMLC ratio was also significantly different between IPF progressor and non-progressor groups (P=0.011). Disease progression was confidently predicted by a combination of clinical and serological variables. In our cohort we identified a predictive tool based on two key parameters, one a measure of lung function and one a single serum biomarker. Both parameters were entered into a decision tree, and when applied to our cohort yielded a sensitivity of 86.4%, specificity of 92.3%, positive predictive value of 90.5% and negative predictive value of 88.9%. We also applied previously reported predictive tools such as the GAP Index, du Bois score and CPI Index to the Edinburgh IPF cohort. Conclusions SLB can be of value in the diagnosis of ILD, however perhaps due to the perceived risks associated with the procedure, only a small percentage of patients undergo SLB despite recommendations that patients have histological confirmation of the diagnosis. Advanced age is a strong predictor for IPF, and in our cohort 83% of patients aged over 65 years with 'possible UIP' HRCT appearances, had UIP on biopsy. BAL and repeat BAL in IPF is feasible and safe (< 1.5% mortality). Of those that underwent repeat BAL, disease progression was not associated with a change in DCC. However, 22% of lavaged patients died or were deemed too frail to undergo a second procedure at 12 months. These data emphasise the importance of BAL in identifying a novel human AM polarisation phenotype in IPF. Our data suggests there is a distinct relationship between AM subtypes, cell-surface expression markers, PMLC subpopulations and disease progression in IPF. This may be utilised to investigate new targets for future therapeutic strategies. / Disease progression in IPF can be predicted by a combination of clinical variables and serum biomarker profiling. We have identified a unique prediction model, when applied to our locally referred, incident, treatment naïve cohort can confidently predict disease progression in IPF. IPF is a heterogeneous disease and there is a definite clinical need to identify 'personalised' prognostic biomarkers which may in turn lead to novel targets and the advent of personalised medicines.
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Avaliação da contagem de células somáticas do leite como indicador da ocorrência de mastite em vacas Gir / Evaluation of milk somatic cell count as an indicator of mastitis occurrence in Gyr cowsReis, Carolina Barbosa Malek dos 31 March 2010 (has links)
Os objetivos deste trabalho foram determinar a sensibilidade e especificidade do limiar de contagem de células somáticas (CCS) de vacas Gir para o diagnóstico de mastite subclínica causada por patógenos primários e secundários e avaliar os efeitos de rebanho, vaca, mês de coleta, quarto mamário, presença de infecção intramamária, tipo de microrganismo e suas interações sobre o logCCS e composição do leite. Avaliou-se a hipótese que o limiar da CCS para detecção de mastite subclínica é igual entre vacas Gir e Holandesas. Foram utilizadas 221 vacas Gir em lactação, provenientes de três fazendas comerciais. Foram coletadas amostras de leite individuais por quarto mamário e compostas uma vez por mês, durante um ano. Foram realizadas análises de CCS, composição do leite e cultura microbiológica. O quarto mamário e a vaca foram considerados unidades experimentais. Para determinar a sensibilidade, especificidade e odds ratio (OR) dos limiares da CCS para identificação de quartos infectados, foram utilizados quatro valores de CCS: 100, 200, 300 e 400 (x 103 células/mL), assim como a correlação entre a CCS e composição do leite. Não houve efeito do rebanho sobre o logCCS para amostras individuais de quartos mamários e compostas, mas vaca dentro de rebanho foi o principal fator responsável pela variação do logCCS. Houve efeito do rebanho sobre a composição do leite, assim como o mês de coleta apresentou efeito tanto sobre o logCCS quanto para a composição do leite, considerando as duas unidades experimentais. A presença de infecção intramamária afetou negativamente a composição do leite, exceto sobre o teor de gordura; sendo que os maiores teores de lactose, proteína e ESD foram encontrados em amostras sem isolamento bacteriano. Os maiores logCCS foram obtidos em amostras infectadas. O limiar da CCS de 100 x 103 células/mL apresentou, em ambas as unidades experimentais, maiores valores de sensibilidade e valor preditivo negativo. O limiar de 200 x 103 células/mL apresentou maior chance da ocorrência de mastite do que o limiar de 100 x 103 células/mL. Foi observada correlação negativa entre CCS com lactose e extrato seco desengordurado (ESD), mas a correlação foi positiva entre CCS com gordura e proteína, tanto em nível de quarto mamário quanto de vaca. Portanto, a composição do leite foi influenciada pela CCS, os teores de lactose e ESD diminuíram em altas CCS, enquanto que as concentrações de gordura e proteína aumentaram. / The aim of this study was to determine the sensibility and specificity of somatic cell count (SCC) threshold in Gyr cows to diagnosis the subclinical mastitis caused by primary and secondary pathogens, and to evaluate the effect of herd, cows, month, mammary quarter, intramammary infection, type of microorganism and their interactions on logSCC and milk composition. The hypothesis to be tested was that the SCC threshold to detection of subclinical mastitis is the same for Holstein and Gir cows. A total of 221 lactation Gir cows from three commercial dairy farms was selected. Composed and quarter individual milk samples were collected once a month, during one year for SCC, milk composition and bacteriological analysis. The mammary quarter and the cow were considered experimental units. To determine the sensibility, specificity and odds ratio (OR) from SCC threshold to identify the infected quarters four values of SCC: 100, 200, 300 and 400 (x 103 cells/mL) were used. It was also evaluated the correlation between SCC and milk composition. There was no effect of herd on logSCC in individuals and composed samples, but cow nested within herd was major factor responsible for the logSCC variation. The month of sampling presented significant effect on logSCC and milk composition in both experimental units. The intramammary infection presence affected negatively the milk composition, except of fat concentration. Higher lactose, protein and non-fat solids (NFS) percentages were found in negative samples and higher logSCC were observed in infected samples. The SCC threshold of 100 x 103 cells/mL presented the major sensibility and negative predictive value for subclinical mastitis detection. The threshold of 200 x 103 cells/mL had higher chance to have mastitis than the threshold of 100 x 103 cells/mL. It was observed a negative correlation between SCC with lactose and NFS; but the correlation was positive between SCC with fat and protein in mammary quarters and cow level. Milk composition was influenced by SCC, once the lactose and NFS percentages decreased in samples with high SCC and the protein and fat concentration increased.
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