Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-12-03Bitstream added on 2014-08-13T18:00:58Z : No. of bitstreams: 1 000749631_20161221.pdf: 86605 bytes, checksum: b97d8625314d0c98a614cadf0aa2d4ed (MD5) Bitstreams deleted on 2016-12-22T10:58:29Z: 000749631_20161221.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-12-22T10:59:15Z : No. of bitstreams: 1 000749631.pdf: 3715933 bytes, checksum: d94a5dfacea6e822a22d762ae3dc1858 (MD5) / A tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) é uma das espécies de peixe mais cultivadas no Brasil, além de ser altamente consumida em nível mundial. No entanto, a intensificação do cultivo e o destino inadequado de dejetos propiciam a infecção parasitária de tilápias de rio e de aquicultura. Dentre os parasitos de peixes, os protozoários são os mais frequentes, podendo causar queda na produção e mortalidade dos animais, causando prejuízo econômico. O presente estudo teve como objetivo detectar e caracterizar novos protozoários em tilápia do Nilo (O. niloticus) de aquicultura (Mira Estrela, São Paulo) e pesca extrativa (Botucatu, São Paulo). Foram coletadas 56 amostras de tilápia do Nilo de cultivo e 60 de pesca extrativa e submetidas à necropsia, esfregaço sanguíneo, imprint, exame de fezes, histopatologia, microscopia eletrônica de transmissão, PCR, sequenciamento e análise filogenética para detecção e caracterização dos protozoários. Foi encontrada ocorrência de 100% de parasitose em todos os peixes (aquicultura e pesca) e tecidos analisados por todas as técnicas de diagnóstico realizadas. Os principais achados histopatológicos foram presença de granulomas com cápsula fibrosa contendo melanomacrófagos, cistos parasitários e eosinófilos. Pela presença do cisto globular, macronúcleo e micronúcleo, observados na microscopia eletrônica de transmissão, sugere-se que os protozoários pertençam ao filo Ciliophora. Após amplificação do DNA do protozoário pela PCR, análise da sequência e da árvore filogenética foi possível identificar que o protozoário é semelhante e possui ancestral comum com o ciliado Telotrochidium matiense, podendo ser o primeiro relato desse grupo de ciliados em peixes / Nile tilapia (Oreochromis niloticus) is highly consumed worldwide and it is the most popular fish in aquaculture in Brazil. However, the intensification and the inappropriate waste destination provide parasitary infection of tilapia from river and aquaculture. Among fish parasites, protozoan are the most common, which can cause decrease of the production and mortality of the animals that leads to economic loss. This study was aimed to detect and characterize novel protozoans in Nile tilapia (O. niloticus) from aquaculture (Mira Estrela, São Paulo) and catch (Botucatu, São Paulo). It was sampled 116 Nile tilapias, which 56 were from aquaculture and 60 from river. They were submitted to necropsy, blood smear, imprint, faeces analysis, histopathology, transmission electron microscopy, PCR, sequencing, and phylogeny for detection and characterization of protozoan found. Parasitism was detected in 100% of fishes analyzed by all diagnostic techniques performed in tissues. The main findings were granuloma with fibrous capsule containing macrophages, parasites cysts, and eosinophils. Considering globular cyst with thin wall, macronucleus and micronucleus presence in transmission electron microscopy, it could be inferred that the protozoan found can belong to Ciliophora phylum. After amplification of protozoan DNA by PCR, sequencing, and phylogenetic analysis, it was possible to identify that the protozoan that was found infecting tilapias were similar and had common ancestor with Telotrochidium matiense. This is the first report of this group of ciliate in fish

Orientador: Germano Francisco Biondi / Coorientador: João Pessoa Araújo Júnior / Banca: Cesar Martins / Banca: Sérgio Carmona de São Clemente / Banca: Jean Guilherme Fernandes Joaquim / Banca: Agar Costa Alexandrino de Pérez / Resumo: A tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) é uma das espécies de peixe mais cultivadas no Brasil, além de ser altamente consumida em nível mundial. No entanto, a intensificação do cultivo e o destino inadequado de dejetos propiciam a infecção parasitária de tilápias de rio e de aquicultura. Dentre os parasitos de peixes, os protozoários são os mais frequentes, podendo causar queda na produção e mortalidade dos animais, causando prejuízo econômico. O presente estudo teve como objetivo detectar e caracterizar novos protozoários em tilápia do Nilo (O. niloticus) de aquicultura (Mira Estrela, São Paulo) e pesca extrativa (Botucatu, São Paulo). Foram coletadas 56 amostras de tilápia do Nilo de cultivo e 60 de pesca extrativa e submetidas à necropsia, esfregaço sanguíneo, imprint, exame de fezes, histopatologia, microscopia eletrônica de transmissão, PCR, sequenciamento e análise filogenética para detecção e caracterização dos protozoários. Foi encontrada ocorrência de 100% de parasitose em todos os peixes (aquicultura e pesca) e tecidos analisados por todas as técnicas de diagnóstico realizadas. Os principais achados histopatológicos foram presença de granulomas com cápsula fibrosa contendo melanomacrófagos, cistos parasitários e eosinófilos. Pela presença do cisto globular, macronúcleo e micronúcleo, observados na microscopia eletrônica de transmissão, sugere-se que os protozoários pertençam ao filo Ciliophora. Após amplificação do DNA do protozoário pela PCR, análise da sequência e da árvore filogenética foi possível identificar que o protozoário é semelhante e possui ancestral comum com o ciliado Telotrochidium matiense, podendo ser o primeiro relato desse grupo de ciliados em peixes / Abstract: Nile tilapia (Oreochromis niloticus) is highly consumed worldwide and it is the most popular fish in aquaculture in Brazil. However, the intensification and the inappropriate waste destination provide parasitary infection of tilapia from river and aquaculture. Among fish parasites, protozoan are the most common, which can cause decrease of the production and mortality of the animals that leads to economic loss. This study was aimed to detect and characterize novel protozoans in Nile tilapia (O. niloticus) from aquaculture (Mira Estrela, São Paulo) and catch (Botucatu, São Paulo). It was sampled 116 Nile tilapias, which 56 were from aquaculture and 60 from river. They were submitted to necropsy, blood smear, imprint, faeces analysis, histopathology, transmission electron microscopy, PCR, sequencing, and phylogeny for detection and characterization of protozoan found. Parasitism was detected in 100% of fishes analyzed by all diagnostic techniques performed in tissues. The main findings were granuloma with fibrous capsule containing macrophages, parasites cysts, and eosinophils. Considering globular cyst with thin wall, macronucleus and micronucleus presence in transmission electron microscopy, it could be inferred that the protozoan found can belong to Ciliophora phylum. After amplification of protozoan DNA by PCR, sequencing, and phylogenetic analysis, it was possible to identify that the protozoan that was found infecting tilapias were similar and had common ancestor with Telotrochidium matiense. This is the first report of this group of ciliate in fish / Doutor

Orientador: Pedro Duarte Novaes / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T21:32:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barbosa_SimonedeCassiaPortela_D.pdf: 19084475 bytes, checksum: 48a5c7f93d08c78c28a6f73b298043e7 (MD5) Previous issue date: 2004 / Doutorado

Orientador: Pedro Duarte Novaes / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-07-25T05:38:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barbosa_SimonedeCassiaPortela_M.pdf: 1067591 bytes, checksum: ed07c3496d667e7d824c82f661bfea72 (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: A freqüência de fibroblastos ciliados foi estudada em tecidos conjuntivos, que diferem entre si pela origem e pela atividade metabólica. Utilizou-se 7 camundongos machos, pesando em média 36g, e colhidas amostras dos seguintes tecidos: gengiva, ligamento periodontal de incisivo e de molar, todos de origem ectomesenquimal e derme de origem mesodérmica. Foram contados 600 fibroblastos por tecido de cada animal, no aumento de 16.000x ao microscópio eletrônico de transmissão. Todas as células com cHios foram fotografadas e não foi encontrada nenhuma particularidade em relação a sua localização, porém os cilios examinados apresentaram um padrão 9+0 de microtúbulos o que sugere que sua função não esteja relacionada com a motilidade. Os resultados estatísticos não indicaram diferença entre a frequência de fibroblastos ciliados quando se comparou ligamento periodontal de incisivos e de molares ( p.< 0,05 ) contudo esta frequência no ligamento se apresentou maior quando comparada com a gengiva e a derme. A diferença estatística foi detectada na comparação entre gengiva e derme, sendo significativamente maior na gengiva. (p. <0,05 ). Embora a função desses cHios permaneça desconhecida, nosso estudo indicou que a freqüência de fibroblastos ciliados poderia estar relacionada à atividade metabólica do tecido que é maior no ligamento periodontal de incisivos e de molares e menor na derme, ficando a gengiva em posição intermediária / Abstract: The frequency of ciliated fibroblasts was determined in connective tissues of different embryological origin and metabolic activity. Seven male mice, weighting 36g, were used. Samples of gingiva, molar and incisor periodontal ligament and skin were fixed in glutaraldehyde, and embedded in araldite. Six hundred fibroblasts per tissue from each animal were counted at a magnification of 16.000x of the transt;nission electron microscope and every ciliated cell was photographed. The cilia showed a 9+0 microtubule pattem which indicates that they are not related to cell motility. There was no statistical difference in the freguency of ciliated fibroblasts of periodontal ligament when incisors and molars, were compared. However this frequency was higher (p.<0,05) in comparison with the one of dermis and gingiva. Statistical difference I 'was detected when gingiva and dermis were compared, being significantly higher in the gingiva (p.<0,05). Although a sensorial function has been suggested the role of this organelle in fibroblasts is unknown. Their frequency, however, could be related to the metabolic activity of the tissues, which is higher in periodontal ligament fibroblasts, lower in dermal ones, and with the gingival fibroblasts at an intermediate position / Mestrado / Histologia / Mestre em Biologia e Patologia Buco-Dental

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4173.pdf: 1140916 bytes, checksum: 20dfe79f655af716f14bb7ff0f256252 (MD5) Previous issue date: 2012-02-13 / Universidade Federal de Minas Gerais / Planktonic bacteria play important role in the organic matter decomposition, nutrient cycling and as food for organisms of higher trophic levels such as flagellates and ciliates, thus representing fundamental components in planktonic food webs. This study analyzed the microbial community structure and evaluated the importance of heterotrophic nanoflagellates (HNF) and ciliates bacterivory in a subtropical environment predominantly mesotrophic (Lobo-Broa reservoir, Brazil) by the quantification of their ingestion rates during one year period. The in situ experiments using fluorescently labelled bacteria (FLB) were conducted on the surface of two sampling points that have different trophic degrees. In parallel, physical, chemical and biological water variables were also evaluated. The ciliates showed a higher specific ingestion rate of bacteria (3,3 x 103 bact ind-1 h-1) than HNF (79,7 bact ind-1 h-1) due to differences in size and food acquisition among the two protozoans. The ingestion rates for both ciliates and HNF were always higher in the point 2 (P2) probably due to the higher water temperatures, which accelerate the protozoans metabolism, and higher bacterial densities. Concerning total protozoan bacterivory, the HNF populations had the greatest grazing impact (60%) on the reservoir bacterial community, especially the HNF smaller than 5 &#956;m. The data showed that HNF grazing, in addition to regulation the bacteria abundance, probably also induced changes in the bacterial community structure, such as increasing bacterial filaments numbers and size. The ciliates contributed significantly to the bacterivory, especially in P2, where high densities and ingestion rates were verified. The main ciliate consumers of bacteria were from Spirotrichea, Peritrichia, Haptoria and Scuticociliatia groups. The bottom-up control was more important in the dry season and the top-down control was more important in the rainy one. Thus, in an annual basis, the resource availability and protozoan predation are equally important to the bacterial abundance regulation in the Lobo reservoir. / Bactérias planctônicas desempenham importante papel na decomposição da matéria orgânica, na reciclagem de nutrientes e como alimento para organismos de níveis tróficos superiores tais como flagelados e ciliados, representando, assim, componentes fundamentais nas teias alimentares. Este estudo analisou a estrutura da comunidade microbiana e avaliou a importância da bacterivoria por nanoflagelados heterotróficos (NFH) e ciliados em um ambiente subtropical predominantemente mesotrófico (reservatório do Lobo-Broa, Brasil) pela quantificação de suas taxas de ingestão durante o período de um ano. Os experimentos in situ utilizando bactérias marcadas fluorescentemente (FLB) foram realizados na superfície de dois pontos de coleta que apresentam graus de trofia diferentes. Em paralelo foram avaliadas variáveis físicas, químicas e biológicas da água. Os ciliados apresentaram taxa de ingestão individual de bactérias maior (3,3 x 103 bact ind-1 h-1) do que a dos NFH (79,7 bact ind-1 h-1) devido às diferenças de tamanho e forma de obtenção de alimento entre os dois protozoários. As taxas de ingestão, tanto para os ciliados quanto para os NHF, foram sempre maiores no ponto 2 (P2) devido provavelmente as maiores temperaturas da água, que aceleram o metabolismo dos protozoários, e as maiores densidades de bactérias. Em relação à bacterivoria total por protozoários, as populações de NFH causaram maior impacto de predação (60%) sobre a comunidade bacteriana do reservatório, principalmente os NFH menores que 5&#956;m. Os dados indicaram que a predação por NFH, além de regular a abundância de bactérias, provavelmente também induziu modificações na estrutura da comunidade bacteriana, como o aumento do tamanho e da quantidade de filamentos bacterianos. Os ciliados contribuíram significativamente para a bacterivoria, principalmente no P2, onde apresentaram altas densidades e taxas de ingestão. Os principais grupos de ciliados consumidores de bactérias foram os Spirotrichea, Haptoria, Peritrichia e Scuticociliatia. O controle bottom-up teve maior importância no período seco e o controle top-down maior importância no período chuvoso. Assim, em uma base anual, a disponibilidade de recursos e a predação são igualmente importantes na regulação da abundância bacteriana no reservatório do Lobo.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4171.pdf: 1651530 bytes, checksum: 8003a7d4f21e79f409398cd7ec50f25d (MD5) Previous issue date: 2012-02-13 / Universidade Federal de Minas Gerais / Bacteria, found in terrestrial and aquatic environments, besides their important role in organic matter decomposition and nutrient cycling, are a food source for organisms of the higher trophic levels in the food chain, such as protozooplanktonic and metazooplanktonic organisms. This study aimed to evaluate the relative importance of protozooplanktonic (ciliates and heterotrophic nanoflagellates) and metazooplanktonic organisms (rotifers, cladocerans and copepods) as bacterial consumers throughout a year, which included a rainy and a dry season, in a eutrophic environment (Monjolinho reservoir-SP) by quantifying their ingestion rates. For this purpose, grazing experiments were carried out bimonthly during one year at the sub-surface of a central station of the reservoir using fluorescently labeled bacteria (FLB) dyed with DTAF. In each survey, besides the experiments, limnological (pH, dissolved oxygen, temperature, conductivity, water transparency and nutrients) and biological (chlorophyll-a and phaeophytin concentrations, bacterioplankton, protozooplankton and metazooplankton density) water parameters were also sampled. The heterotrophic nanoflagellates (HNF) showed higher population ingestion rates than the ciliates in dry and rainy seasons, and the HNF smaller than 5&#956;m were the main consumers of bacteria. Among the metazooplanktonic organisms, the rotifers dominated the bacterial ingestion, and the organisms belonging to the genus Filinia and Keratella and to the families Testudinellidae and Brachionidae were the main bacterial consumers. Besides ingesting bacteria, however, protozoa and rotifers population also seemed to be controlled by cladocerans and copepods predation, which, in turn, seemed to be regulated by predation of larger organisms, such as small vertebrates. Thus, the predation control (top-down) occured both on bacterial communities and protozooplanktonic and metazooplanktnic communities and bacteria were regulated both by direct and indirect predation of zooplanktonic population. The resources control (bottom-up) semmed to be higher during the dry season, while in the rainy season bacterial communities were more controlled by predation. The greatest impact on bacterial communities was caused by HNF and ciliates during the rainy season and by HNF and rotifers during the dry one. / As bacterias, encontradas em ambientes terrestres e aquaticos, alem de possuirem importante papel na decomposicao da materia organica e na ciclagem de nutrientes, sao fonte de alimento para organismos de niveis troficos superiores, tais como protozoarios e organismos do metazooplancton. O presente trabalho avaliou a importancia relativa de organismos protozooplanctonicos e metazooplanctonicos (rotiferos, cladoceros e copepodes) como consumidores de bacterias em um ambiente eutrofico (Reservatorio do Monjolinho-SP) pela quantificacao das taxas de consumo durante o periodo de um ano, que englobou uma estacao seca e uma chuvosa. Para isso, na superficie de um ponto central no reservatorio, foram realizados experimentos de bacterivoria (grazing) bimestralmente durante um ano, utilizando bacterias marcadas fluorescentemente (FLB) com o corante DTAF. Nos dias dos experimentos foram tambem analisados parametros limnologicos (pH, oxigenio dissolvido, temperatura, condutividade, transparencia da agua, e nutrientes) e biologicos (concentracoes de clorofila-a e feofitina, densidade do bacterioplancton, protozooplancton e metazooplancton). Os nanoflagleados heterotroficos (NFH), quando comparados aos ciliados, apresentaram maiores taxas populacionais de ingestao de bacterias tanto no periodo seco quanto no chuvoso, sendo os NFH menores que 5 &#956;m os maiores consumidores de bacterias. Dentre os organismos metazooplanctonicos, os rotiferos dominaram o consumo de bacterias, sendo os representantes dos generos Filinia e Keratella e das familias Testudinellidae e Brachionidae os maiores consumidores de bacteria. Os dados obtidos indicaram que, alem de predadores de bacterias, as populacoes de protozoarios e rotiferos pareceram ser reguladas pela predacao de cladoceros e copepodes, os quais, por sua vez, parecem sofrer pressao de predacao por organismos maiores, como provavelmente pequenos vertebrados. Assim, o controle por predacao (top-down) ocorreu tanto sobre as comunidades bacterianas quanto sobre as protozooplanctonicas e metazooplanctonicas, sendo as comunidades bacterianas reguladas tanto pela predacao direta quanto indireta das populacoes zooplanctonicas. O controle por disponibilidade de recursos (bottom-up) pareceu ter maior influencia no reservatorio no periodo seco, enquanto no periodo chuvoso, as comunidades bacterianas pareceram mais controladas por predacao, sendo que maiores impactos sobre as comunidades bacterianas foram causados pelos NFH e ciliados no periodo chuvoso, e pelos NFH e rotiferos no periodo seco.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-10-05T12:22:47Z No. of bitstreams: 1 adalgisafernandacabral.pdf: 2311730 bytes, checksum: 74c9543db3aba7fbe66c74cdf1dab5e2 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-10-05T13:57:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 adalgisafernandacabral.pdf: 2311730 bytes, checksum: 74c9543db3aba7fbe66c74cdf1dab5e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-05T13:57:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 adalgisafernandacabral.pdf: 2311730 bytes, checksum: 74c9543db3aba7fbe66c74cdf1dab5e2 (MD5) Previous issue date: 2009-02-16 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No presente estudo, foram analisados aspectos da taxonomia e morfologia do protista ciliado epibionte Rhabdostyla chironomi encontrado no córrego São Pedro (Juiz de Fora, MG), bem como alguns aspectos ecológicos da relação epibiótica entre o ciliado peritríqueo de larvas de quironomídeos do gênero Chironomus gr. decorus. A presente dissertação está dividida em quatro partes. Na primeira, uma população de ciliados do gênero Rhabdostyla foi isolada e investigada in vivo, com o auxílio de técnicas de impregnação pela prata e de microscopia eletrônica e identificada como uma população do ciliado peritríqueo pouco conhecido R. chironomi. Na segunda parte, foi analisado o padrão de ocorrência espacial e temporal do ciliado epibionte R. chironomi sobre larvas de Chironomus gr. decorus em coletas ao longo de um ano em cinco estações amostrais do córrego São Pedro. As análises estatísticas demonstraram correlação entre prevalência de infestação e parâmetros como pluviosidade, disponibilidade de alimento e abundância de hospedeiros, além da heterogeneidade temporal e espacial da distribuição do ciliado. Na terceira, foi avaliada a influência da poluição orgânica na distribuição de R. chironomi sobre larvas de quironomídeos, por meio de dois experimentos, no primeiro, foram realizadas coletas em cinco estações ao longo de um ano de estudo e no segundo uma única coleta longitudinal em oito estações do mesmo córrego. A prevalência de infestação apresentou heterogeneidade espacial ocorrendo nas estações com maior grau de enriquecimento orgânico. Na quarta parte, foram investigados os sítios de fixação de R. chironomi sobre larvas de quironomídeos e quantificada a intensidade de colonização desta relação epibiótica. Todos os 26104 ciliados epibiontes encontrados colonizaram exclusivamente os túbulos ventrais das larvas de quironomídeos. A intensidade de colonização variou de um a 67 indivíduos por hospedeiro, com intensidade média de 4.86 (±1,5348) sendo que 91,03% apresentaram entre um e dez ciliados. / In the present study, both taxonomy and morphology aspects of the epibiont ciliate Rhabdostyla chironomi found in São Pedro stream (Juiz de Fora-MG), as well some ecological aspects of this epibiotic relationship between the peritrich and chironomid larvae from genus Chironomus gr. decorus. The present dissertation is divided into four parts. In the first one, a population ciliates from genus Rhabdostyla was isolated and investigated in vivo and using techniques of silver impregnation and scanning electron microscopy, being identify as a population of the the poorly know peritrich ciliate R. chironomi. In the second, was analyzed the spatial and temporal pattern of occurrence of R. chironomi as epibiont on Chironomus gr. decorus trough collections in the period of one year at five sampling stations at São Pedro Stream. Statistical analyses showed correlation between the prevalence of infestation and as rainfall, food availability and host abundance, besides the temporal and spatial heterogeneity of the ciliate. In the third one, was evaluated the influence of organic pollution in the distribution of R. chironomi on chironomid larvae, trough two experiments, the first one, made in five sampling stations, over a year of study and the second, was one collection in eight sampling stations in the same stream. The prevalence of infestation showed spatial heterogeneity occurring at stations with a higher degree of organic enrichment. In the fourth part, was investigated the colonization sites of R. chironomi as epibiont on chironomid larvae and also, quantified the colonization intensity of this relationship. All 26.104% of epibionts ciliates exclusively colonized the ventral tubules of the chironomid larvae. The colonization intensity ranged from one to 67 individuals per host, with mean intensity of 4.86 (± 1.5348) of which 91.03% had between one to ten ciliates.