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Comparação entre métodos de elaboração e validação de escala diagramática de bacteriose foliar em diferentes clones de Eucalyptus urophylla X Eucalyptus grandis / Comparison of elaboration and validation methods for diagrammatic scale of bacterial leaf blight on different Eucalyptus urophylla X Eucalyptus grandis clonesDamasceno, Vítor Flávio Furtado [UNESP] 08 September 2016 (has links)
Submitted by VÍTOR FLÁVIO FURTADO DAMASCENO null (vitor_ffd@yahoo.com.br) on 2016-11-03T19:59:15Z
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Previous issue date: 2016-09-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A avaliação da severidade - porcentagem da área lesionada em relação à área total - pode ser feita com auxílio de escalas diagramáticas, que são elaboradas com base na Lei WeberFechner e utilizam regressão linear simples em seu processo de validação, porém apresentam erros na metodologia estatística. O objetivo desta pesquisa foi propor um método de elaboração e validação de escalas de bacteriose em um híbrido Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis, avaliar a da influência de concentrações de diferentes espécies de bactérias na validação de escalas, verificar a possibilidade de avaliações utilizando tons de cinza, e a influência da dispersão de lesões nas estimativas dos avaliadores no uso desta ferramenta. Foram conduzidos quatro experimentos com amostras das cidades de Bofete-SP e Botucatu-SP. No primeiro experimento, foram utilizadas 100 folhas de três clones (H13, I144 e AEC 1528) de Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis infectadas naturalmente com bacteriose, que tiveram sua severidade medida para elaboração, por quartis e Weber-Fechner, e validação das seis escalas diagramáticas. No segundo, mudas de eucalipto com três concentrações diferentes (105, 107 e 109 indivíduos/mL) de inóculo de três bactérias (Pseudomonas sp., Xanthomonas sp. e mix) tiveram folhas coletadas para construção de três escalas diagramáticas. No terceiro, imagens digitais das amostras de folhas dos três clones de eucalipto infectados com bacteriose foram analisadas em tons de cinza. Houve estudo de correlação entre as variáveis considerando os três clones como um único grupo e separadamente. No quarto, a escala diagramática construída para o clone AEC 1528 foi repetida em diferentes níveis de dispersão, com a mesma severidade das folhas representativas dos níveis da escala, seguidas de avaliação. No primeiro experimento, o método de quartis apresentou melhoras nas leituras quando comparado ao método Weber-Fechner, houve diferença entre os clones segundo as avaliações e o uso de escalas foi favorável. No segundo, houve melhoras nas estimativas com o uso das escalas. No terceiro, os tons de cinza podem diferenciar a severidade dos clones como um único grupo e há separação de clones por severidade. No quarto, foi detectada influência direta da dispersão das lesões da doença nas estimativas dos avaliadores. Conclui-se que o método de quartis obteve melhores resultados que o método Weber-Fechner; escalas levando em consideração a concentração de inóculo podem resultar em diferenças nas avaliações; tons de cinza podem avaliar severidade e diferenciar clones; variações na dispersão de uma mesma severidade influenciam diretamente as estimativas de um avaliador. / The severity evaluation – percentage of the injured leaf area relative to its total – could be done with the assistance of diagrammatic scales, which are elaborated based on the WeberFechner law and uses simple linear regression for its validation process. However, errors can be found in statistical methodology. The objective of this research was to propose methods of elaboration and validation for diagrammatic scales of bacterial leaf blight on the hybrid Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis, evaluate the influence of concentrations and different species of bacteria on scales validation, verify the possibilities of evaluations using gray scale, and the influence of leaf injuries dispersion on the estimates done by evaluators using this tool. Four experiments were conducted with samples from Bofete-SP and Botucatu-SP. In the first experiment, 100 leaves were used from three different clones (H13, I144 e AEC 1528) of Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis naturally infected with bacterial leaf blight, which had the severity measured for the elaboration, by quartiles and Weber-Fechner law, and the validation of the six resultant diagrammatic scales. In the second one, eucalypt leaves with three different concentrations (105, 107 e 109 individuals/mL) of three bacterial inoculums (Pseudomonas sp., Xanthomonas sp. and mix), had their leaves collected for the construction of three diagrammatic scales. In the third, the digital images of the sampled leaves of the three eucalypt clones were analyzed using gray scale values. There was made a correlation among the variables considering the three clones as one single group and separately. In the fourth, the diagrammatic scale built for the clone AEC 1528 was replicated into different levels of dispersion with the same severity of the levels present in the scale, followed by evaluation. In the first experiment, the quartiles method presented reading improvements in comparison with the Weber-Fechner method. There was difference among the clones and the use of the scale was favorable. In the second, there were estimates improvements using the scales. In the third, the gray scale can detect the difference of severity of the clones as a single group and there is clone differentiation by severity. In the fourth, it was detected direct influence of the injuries dispersion in the evaluations. It concludes that the quartiles method had better results than the Weber-Fechner method; scales considering the concentration of the inoculum could result into evaluation differences; gray scale can be used for severity evaluation and clone differentiation; variations of the same dispersion of severity can influence directly the estimates of and evaluator.
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Caracterização da concentração industrial no Rio Grande do Norte entre os anos 2000 e 2010.Azevedo, Sylvester Stallone Pereira de 28 September 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-09-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This study aims to characterize the levels and patterns of concentration of industrial activity in the state of Rio Grande do Norte in the period between 2000 and 2010. For this there will be the calculation of the indices of spatial correlation Global Moran's I and local (LISA) defined by Anselin (1995) between the territorial subdivisions of the state - microregions. It was
identified that the state only has clusters of positive spatial correlation in the manufacturing industry and the sectors of capital, labor and natural resource intensive. It was also observed that the resource sector is less concentrated in both years considered polar and that all sectors have experienced decentralization of industrial activities except for the labor-intensive sector, which takes the place of more concentrated industry in 2010, this place occupied by the capital-intensive sector in 2000. In the estimation of the model say that the influence of the variables defined in the theory of growth was observed that the small amount of micro state not allowed to obtain a model very consistent. This suggested the estimation of models considering the variables individually, allowing better understand the influence that the wages paid to the worker, the average size of establishments, the distances of the micro and the
capital share in manufacturing employment that each state has in the micro affect growth of such participation, indicating the agglomeration tendencies. The results are consistent with the arguments presented in the New Economic Geography and the empirical studies that have
been done to test them. / O presente trabalho busca caracterizar os níveis e padrões de concentração da atividade industrial no estado do Rio Grande do Norte no período compreendido entre os anos 2000 e o
ano 2010. Para isso será realizado o cálculo dos índices de correlação espacial I de Moran Global e local (LISA) definidos por Anselin (1995) entre as subdivisões territoriais do estado
microrregiões. Foi identificado que o estado só apresenta aglomerados de correlação espacial positiva na indústria de transformação e nos setores de capital, trabalho e recursos
naturais intensivos. Também foi observado que o setor de recursos naturais é o menos concentrado em ambos os anos polares considerados e que todos os setores sofreram
desconcentração das atividades industriais com exceção do setor de trabalho intensivo, que ocupa o lugar de setor mais concentrado em 2010, lugar esse ocupado pelo setor de capital intensivo no ano 2000. Na estimação do modelo que descreve a influência das variáveis definidas na teoria sobre o crescimento foi observado que a quantidade pequena de
microrregiões do estado não permitiu a obtenção de um modelo muito consistente. Isso sugeriu a estimação de modelos considerando as variáveis individualmente, o que permitiu entender melhor a influência que o salário pago ao trabalhador, o tamanho médio dos estabelecimentos, a distâncias das microrregiões à capital e a participação no emprego industrial que cada microrregião tem no estado afetam o crescimento dessa participação, indicando tendências à aglomeração. Os resultados são coerentes com os argumentos apresentados na Nova Geografia Econômica e com os trabalhos empíricos que vêm sendo feitos para testá-los.
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Avaliação do efeito antimicrobiano e anti-inflamatório de derivados furoxânicos e benzofuroxânicos como alternativa para o tratamento da acne vulgar / Evaluation of antimicrobial and anti-inflammatory effects of furoxan and benzofuroxan derivatives as an alternative for acne vulgaris treatmentDelgado, Ivone Leila Lima [UNESP] 23 May 2017 (has links)
Submitted by Ivone Leila Lima Delgado null (leilavone@gmail.com) on 2017-06-23T19:11:39Z
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Previous issue date: 2017-05-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A acne é uma doença autolimitada de componente multifatorial, caracterizada pela presença de inflamação e colonização bacteriana pelo microrganismo Propionibacterium acnes. Atualmente, o tratamento tópico e/ou oral, inclui fármacos com propriedades anti-inflamatórias, antimicrobianas e queratolíticas. Apesar dos efeitos benéficos no tratamento da acne, a terapia atual apresenta limitações que justificam a busca de novos fármacos. Furoxanos e benzofuroxanos são compostos heterocíclicos contendo a função N-óxido e que apresentam uma grande diversidade de propriedades farmacológicas, incluindo antimicrobiana. Neste trabalho investigouse o efeito antimicrobiano de compostos furoxanos e benzofuroxanos pertencentes à biblioteca de moléculas do laboratório de Química Farmacêutica e Medicinal da Faculdade de Ciências Farmacêuticas. Para fins de caracterização do espectro de ação, além do P. acnes foi realizado screening do perfil de atividade antimicrobiana frente às cepas fúngicas, bactérias Gram positivas e Gram negativas usando as técnicas de microdiluição. Os furoxanos e benzofuroxanos foram testados em concentrações que variaram de 0.03 a 100 μg/mL. Foram usados controles como a cefazolina (0.39 μg/mL) para P. acnes, o imipenen (<0.39 μg/mL) para as bactérias Gram positivas, aztreonan (<0.39 μg/mL) para as Gram-negativas, anfotericinaB (0.25 μg/mL) e o fluconazol (65 μg/mL) para as espécies de Candida e Cryptococcus, respectivamente. Após incubação, foram realizadas leituras visuais sem e com revelador resazurina (0.01%) para determinação da Concentração Inibitória Mínima (CIM). Dos 20 compostos avaliados, 14 foram capazes de inibir o crescimento de, pelo menos, um microrganismo. O composto (E)-4-(3-((2-(3- hidroxibenzoil) hidrazona) metil) fenoxi)-3-(fenilsulfonil)-1, 2,5-oxadiazol-2-óxido (composto 15) se mostrou o mais ativo contra P. acnes apresentando CIM de 0.19 μg/mL. Estudos in vitro demonstraram para este composto capacidade de liberação de óxido nítrico, sendo este aumento de estresse oxidativo um dos possíveis mecanismos de ação. Esta molécula também foi capaz de inibir a produção do NO em macrófagos na concentração de 0.78 ug/mL. A avaliação in vitro da citotoxicidade em macrófagos e atividade anti-inflamatória por determinação quantitativa de IL1-β e a TNF-α foram realizadas. Determinou-se para o composto mais ativo contra P. acnes que a viabilidade em macrófagos é de 100% em concentrações inferiores a 0.09 μg/mL; entretanto, não foi possível observar capacidade de inibição destas citocinas nas concentrações usadas. Ensaio in vivo para o composto 15 não permitiram identificar redução da inflamação em modelo animal induzido por P. acnes. Em resumo, esses resultados permitem concluir que o composto (E)-4-(3-((2-(3-hidroxibenzoil) hidrazona) metil) fenoxi)-3-(fenilsulfonil)-1, 2,5-oxadiazol-2-óxido apresenta potente atividade antimicrobiana contra Propionibacterium acnes e pode se tornar uma alternativa terapêutica ao tratamento dessa doença. / Acne is a self-limiting disease of multifactorial component characterized by the presence of inflammation and bacterial colonization by Propionibacterium acnes. Currently, topical and oral treatments include drugs presenting anti-inflammatory, antimicrobial, exfoliating and keratolytics properties. The current treatment has shown adverse effects that justify the search for new anti-acne drugs.Furoxan and benzofuroxan are heterocyclic compounds containing the N-oxide function that exhibit a wide range of pharmacological properties, including antimicrobial. Here, we investigated the antimicrobial effect of furoxans and benzofuroxans derivatives from a library of compounds belonging to the Medicinal Chemistry Laboratory on the School of Pharmaceutical Sciences - UNESP. In order to characterize the spectrum of action not only P. acnes, but also fungal, Gram positive and Gram negative strains of bacteria were used. Minimum Inhibitory Concentration (MIC) was determinate by microdilution technique. Benzofuroxan and furoxans were tested at concentrations ranging from 0.03 to 100 μg/mL. It was used as controls:cefazolin (0.39 μg/mL) for P. acnes; imipenem (<0.39 μg/mL) for Gram positive bacteria; aztreonan (<0.39 μg/mL) to Gram-negative; amphotericin B (0.25 μg/ml) and fluconazole (>65 μg/mL) for species of Candida and Cryptococcus, respectively. After incubation, visual readings were performed with and without revealing reassuring (0.01%) to determine the MIC value. Over 20 compounds evaluated, 14 were able to inhibit the growth of at least one microorganism.The compound (E) -4- (3 - ((2- (3-hydroxybenzoyl) hydrazone) methyl) phenoxy) -3- (phenylsulfonyl) -1,2,5-oxadiazole-2-oxidewas the most active molecule against Propionobacterium acnes, presenting MIC value of 0.19 μg/mL. In vitro studies showed that this compound was able to release nitric oxide, which should be one of the modes of action for this compound. There was also inhibition of NO production in macrophage at the concentration of 0.78 ug/mL.The cellular viability against macrophage cells and the anti-inflammatory effect characterized by the inhibition of IL1-β e a TNF-α were performed. It was characterized in murine macrophages that the limit of 100% of viability is found at concentrations inferior to 0.09 μg/mL; however, it was not observed inhibition ability of these cytokines in the concentration used. The in vivo assay did not show anti-inflammatory activity of the tested compound. As conclusion, we identified the compound (E) -4- (3 - ((2- (3- hydroxybenzoyl) hydrazone) methyl) phenoxy) -3- (phenylsulfonyl) -1,2,5-oxadiazole- 2-oxideas a new drug antimicrobial active against Propionobacterium acnes. This compound could be used as a new alternative to treat acne.
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Compósitos poliméricos reforçados por tecidos multiaxiais acoplados: anisotropia, configuração e concentração da deformaçãoFontes, Raphael Siqueira 14 December 2017 (has links)
Submitted by Automação e Estatística (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-04-11T20:54:52Z
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Previous issue date: 2017-12-14 / A proposta desta Tese de Doutorado é determinar a influência na resposta mecânica de laminados compósitos à base de tecidos multiaxiais acoplados de fibras de vidro-E e matriz epóxi éster vinílica, quando em presença de descontinuidade geométrica, aqui caracterizada por um furo circular. Nesse estudo do fenômeno da concentração de tensão é dado ênfase ao comportamento da deformação na vizinhança do furo, tendo em vista a característica do tecido de reforço ter suas camadas básicas acopladas através de fios de costura, tornando-os mais compactos em sua capacidade de suporte de carga. Esse estudo é desenvolvido a partir da medição das deformações na vizinhança do furo, utilizando a técnica de medição por Extensometria, frente aos ensaios de tração uniaxial. Por fim, serão apresentados os resultados em termos quantitativos sobre o efeito da presença da descontinuidade geométrica, mediante os cálculos da Resistência Residual (RS), do Módulo Residual (RM) e dos Fatores de Concentração de Tensão (K, calculados a partir de variados métodos analíticos), além da determinação das distribuições das deformações (obtidas das leituras dos extensômetros) na vizinhança do furo nos laminados em estudo, nas orientações 0°, 90° e 45° dos CPs. Essas distribuições são validadas utilizando a solução analítica proposta por Lekhnitskii (1968) e Konish e Whitney (1975), amplamente utilizada para materiais compósitos ortotrópicos. Ao ser efetuada a comparação entre os valores medidos experimentalmente e as distribuições analíticas das deformações, observou-se pouca interferência dos valores de K adotados para a obtenção das curvas analíticas, resultando numa concordância entre os valores obtidos pelos extensômetros e o modelo analítico. / The proposal of this Doctoral Thesis is to determine the influence on the mechanical response of composite laminates based on E-glass multiaxial Non-Crimp Fabrics and epoxy vinyl ester matrix, with the presence of geometric discontinuity, here characterized by a circular hole. In this study of the stress concentration phenomenon, emphasis is given to the strain behavior in the vicinity of the hole, since the reinforcing fabric characteristic, whose basic layers are coupled by stitching, making them more compact in their load support capacity. This study is developed from the strain measurement in the vicinity of the hole, using the technique of measurement by strain gages, during uniaxial tensile tests. Finally, the effect of the presence of the geometric discontinuity will be presented in quantitative terms, by means of the Residual Strength (RS), Residual Modulus (RM) and the Stress Concentration Factors (K, obtained by different analytical methods), in addition to the determination of strain distributions (obtained from strain gage measurements) in the vicinity of the hole in the laminates under study, in 0°, 90° and 45° orientations of the specimens. These distributions are validated using the analytical solution proposed by Lekhnitskii (1968) and Konish and Whitney (1975), widely used for orthotropic composite materials. When comparing the experimentally measured values with the analytical distributions of the strains, was observed little interference of the K values adopted to obtain the analytical curves, resulting in an agreement between the values obtained by the strain gages and the analytical model.
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Funcionalização do PVC para aplicação em procedimentos de extração em fase sólida de espécies metálicas / Functionalization of pvc for application in processes of solid phase extraction of metallic speciesSilva, Adrielli Cristina Peres da 21 February 2018 (has links)
Submitted by Adrielli Cristina Peres da Silva (adriellicristina@hotmail.com) on 2018-04-20T19:17:40Z
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DISSERTAÇÃO ADRIELLI CRISTINA PERES DA SILVA - BIOTECNOLOGIA.pdf: 1253086 bytes, checksum: 7537e0e126ba2d997c618f87745823e5 (MD5) / Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2018-04-23T12:53:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2018-02-21 / Pró-Reitoria de Pós-Graduação (PROPG UNESP) / O desenvolvimento de materiais adsorventes e posterior utilização em procedimentos de extração em fase sólida (remoção/ pré-concentração) de espécies metálicas é uma área da Química/ Engenharia Química, que sempre se manteve em destaque devido à necessidade, seja de monitorar, realizar a remoção da matriz antes da análise ou de remover o contaminante da amostra. A determinação direta de metais presentes em baixas concentrações em amostras de águas naturais é geralmente dificultada devido à presença de espécies interferentes e à necessidade do uso de técnicas sofisticadas para quantificá-los. Os metais determinados: Cu(II), Cd(II), e Pb(II); são de interesse ambiental em razão de seu uso intensivo, distribuição e por serem não-degradáveis, podendo acumular-se em matrizes ambientais manifestando toxicidade. Desta forma, o projeto teve como objetivo a utilização do PVC como suporte sólido para o ancoramento da molécula 4-amino-3-hidrazino-5-mercapto-1,2,4-triazol (AHMT) e aplicação em sistema de pré-concentração e remoção de espécies metálicas em amostras aquosas. O material foi caracterizado por Análise Elementar, a qual determinou a concentração do ligante por meio da porcentagem de nitrogênio, que foi de 3,88%. Espectroscopia de infravermelho por transformada de Fourier (FTIR) que constou a presença de bandas em 3200 cm-1 e entre 3300 e 3500 cm-1 que podem ser atribuídas ao grupamento amina, presente na molécula do ligante, cujos resultados podem ser indicativos de que a funcionalização ocorreu com sucesso. Espectroscopia de Fotoelétrons Excitados por Raios-X que corroborou as análises anteriores indicando a presença de grupos referentes ao ligante. Medidas da área superficial específica pelo método BET a qual caracterizou o material segundo a Isoterma de adsorção/ dessorção do Tipo II, Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV) e Determinação de Ponto de Carga Zero (pHpzc), para a verificar a ocorrência da reação de modificação e possibilitar a construção de um modelo. O material foi aplicado em estudos de adsorção para se determinar o tempo mínimo de contato, o pH ótimo de adsorção e a sua Capacidade Máxima de adsorção, no qual constatou 0,46; 0,14 e 0,32 mmol g -1 para Cu(II), Cd(II) e Pb(II), respectivamente. Na sequência, o material foi aplicado em sistema de fluxo contínuo para otimização de parâmetros, tais como: 18 Massa da amostra e vazão de percolação da solução, concentração do eluente e volume do eluato. / The development of adsorbent materials and subsequent use in the phase extraction processes (preconcentration) of metallic species is an area of Chemistry / Chemical Engineering that has always attracted great attention in virtue of the need to monitor contamination and to perform matrice-analyte separation prior to analysis. The direct determination of metals present at low concentrations in samples of natural waters is difficult due to the presence of interfering species and to the need of sophisticated techniques to quantify them. The metals, Cu(II), Cd(II) and Pb(II) have environmental interest because of their intensive use, distribution and because they are non-degradable, thus accumulating in the environment and manifesting toxicity. Thus, the objective of the project was to use PVC as a solid support for the anchoring of the molecule 4-amino-3-hydrazino-5-mercapto-1,2,4-triazole (AHMT) and its application in a system for the preconcentration and removal of metal species from aqueous samples. The material was characterized by Elemental Analysis, Fourier-transform Infrared Spectroscopy (FTIR), X-ray Photoelectron Spectroscopy, specific surface measurements according to BET method, Scanning Electron Microscopy (SEM) and Point of Zero Charge (pHpzc) to verify the occurrence of the modification reaction and to enable the construction of a model.The material was applied in adsorption studies to determine the minimum contact time, the optimum adsorption pH and its maximum adsorption capacity, in which it found 0.46; 0.14 and 0.32 mmol g-1 for Cu (II), Cd (II) and Pb (II), respectively. Then, the material was applied in a continuous flow system, to optimize parameters such as: sample mass, sample percolation flow, eluent concentration and eluate volume; in order to apply, posteriorly, in natural water samples. / 33004064087P8
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Desenvolvimento de sistema computacional para simulações de dinâmica molecular a pH constante /Martins, Ingrid Bernardes Santana. January 2016 (has links)
Orientador: Alexandre Suman de Araujo / Banca: Pedro Geraldo Pascutti / Banca: Gabriel Gouvea Slade / Resumo: Diversos processos biológicos envolvendo proteínas são mediados por alterações de pH. Infecção de células por vírus, catálise enzimática, associação de ligantes e a solubilidade de compostos são exemplos de tais processos. Assim, investigar o comportamento das cargas dos grupos ionizáveis de proteínas em função de mudanças no pH é de grande interesse. Simulações de DinÂmica Molecular são amplamente utilizadas para estudo dos mais diversos sistemas biológicos devido à confiabilidade de seus resultados. No entanto, elas não se mostram eficientes para a descrição de sistemas sensíveis a variações de pH pois os graus de ionização precisariam variar ao longo da simulação. Esse estado é definido na modelagem do sistema com base no pKa desses grupos isolados e no pH da solução. Isso representa uma limitação severa, pois processos que são modulados pela mudança na protonação não podem ser observados, de modo que uma abordagem mais realista é executar simulações em que o estado de protonaçao dos componentes do sistema possam variar com o tempo. Neste trabalho é desenvolvido um sistema computacional que acopla Dinâmica Molecular comum, executada com o pacote GROMACS, a um algoritmo que modifica o estado de protonação dos resíduos ionizáveis do sistema em intervalos de tempo regulares utilizando o método Monte Carlo com o critério de Metrópolis. Objetivando-se testar o método desenvolvido, foram realizadas Simulações de Dinâmica Molecular a pH Constante de um pepídeo composto majoritariamente de alaninas e cujo único grupo ionizável é um ácido glutâmico em diferentes pHs, com a finalidade de obter a curva de titulação desse peptídeo e então compará-la com a curva de titulação do ácido glutâmico isolado / Abstract: Several biological processes involving proteins are mediated by pH changes. Virus infection of cells, enzymatic catalysis, association of ligands and compounds solubility are examples of such processes. Therefore, invetigation of the titration residues charges in proteins in function of pH changes is very concernment. Molecular Dynamics simulations are widely used to study the most diverse biological systems due to the reliability of its results. However, they are not efficient to describe systems that are sensitive to pH changes because the protonation state needs to vary throughout the simulation. This state is defined in the system modeling based on the pKa of these isolated groups and solution pH. This is a severe limitation as processes that are modulated by the change in the protonation can not be observed, so that a more realistic approach is to run simulations where the protonation state of the system components may vary with time. In this work a computer system that couples common Molecular Dynamics, performed with GROMACS, and an algorithm that changes the protonation state of titratable residues of the system at regular time intervals by using Monte Carlo - Metropolis is developed. In order to test the developed method, Molecular Dynamics Simulations by Constant pH of a peptide consisting of mostly alanines whose only titratable group is a glutamic acid was made in different pHs in order to obtain the titration curve of this peptide and then compare it with the titration curve of isolated glutamic acid / Mestre
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Comparação entre métodos de elaboração e validação de escala diagramática de bacteriose foliar em diferentes clones de Eucalyptus urophylla X Eucalyptus grandis /Damasceno, Vítor Flávio Furtado, 1986. January 2016 (has links)
Orientador: José Raimundo de Souza Passos / Coorientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Magali Ribeiro da Silva / Banca: Lidia Raque de Carvalho / Resumo: A avaliação da severidade - porcentagem da área lesionada em relação à área total - pode ser feita com auxílio de escalas diagramáticas, que são elaboradas com base na Lei WeberFechner e utilizam regressão linear simples em seu processo de validação, porém apresentam erros na metodologia estatística. O objetivo desta pesquisa foi propor um método de elaboração e validação de escalas de bacteriose em um híbrido Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis, avaliar a da influência de concentrações de diferentes espécies de bactérias na validação de escalas, verificar a possibilidade de avaliações utilizando tons de cinza, e a influência da dispersão de lesões nas estimativas dos avaliadores no uso desta ferramenta. Foram conduzidos quatro experimentos com amostras das cidades de Bofete-SP e Botucatu-SP. No primeiro experimento, foram utilizadas 100 folhas de três clones (H13, I144 e AEC 1528) de Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis infectadas naturalmente com bacteriose, que tiveram sua severidade medida para elaboração, por quartis e Weber-Fechner, e validação das seis escalas diagramáticas. No segundo, mudas de eucalipto com três concentrações diferentes (105, 107 e 109 indivíduos/mL) de inóculo de três bactérias (Pseudomonas sp., Xanthomonas sp. e mix) tiveram folhas coletadas para construção de três escalas diagramáticas. No terceiro, imagens digitais das amostras de folhas dos três clones de eucalipto infectados com bacteriose foram analisadas em tons de cinza. Houve ... / Abstract: The severity evaluation - percentage of the injured leaf area relative to its total - could be done with the assistance of diagrammatic scales, which are elaborated based on the WeberFechner law and uses simple linear regression for its validation process. However, errors can be found in statistical methodology. The objective of this research was to propose methods of elaboration and validation for diagrammatic scales of bacterial leaf blight on the hybrid Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis, evaluate the influence of concentrations and different species of bacteria on scales validation, verify the possibilities of evaluations using gray scale, and the influence of leaf injuries dispersion on the estimates done by evaluators using this tool. Four experiments were conducted with samples from Bofete-SP and Botucatu-SP. In the first experiment, 100 leaves were used from three different clones (H13, I144 e AEC 1528) of Eucalyptus urophylla x Eucalyptus grandis naturally infected with bacterial leaf blight, which had the severity measured for the elaboration, by quartiles and Weber-Fechner law, and the validation of the six resultant diagrammatic scales. In the second one, eucalypt leaves with three different concentrations (105, 107 e 109 individuals/mL) of three bacterial inoculums (Pseudomonas sp., Xanthomonas sp. and mix), had their leaves collected for the construction of three diagrammatic scales. In the third, the digital images of the sampled leaves of the three eucalypt clones were analyzed using gray scale values. There was made a correlation among the variables considering the three clones as one single group and separately. In the fourth, the diagrammatic scale built for the clone AEC 1528 was replicated into different levels of dispersion with the same severity of the levels present in the scale, followed by evaluation. In the first experiment, the quartiles method presented reading ... / Mestre
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Gestão, território e desenvolvimento : dificuldades e perspectivas do município de Tabatinga - SP /Brumatti, Lívia Martinez. January 2015 (has links)
Orientadora: Ana Claudia Giannini Borges / Banca: José Gilberto Souza / Banca: Perla Calil Pongeluppe Wadhy Rebehy / Resumo: O Brasil vivenciou, a partir da década de 1990, mudanças na organização do seu território. A lógica de produção capitalista, com caráter financeiro e internacional se estabeleceu, neste período, no país, provocando, dentre outros aspectos, processos de concentração/aglomeração de atividades produtivas similares ou complementares em um mesmo município ou região. Houve, a partir desse período, grande surgimento dessas formas de organização produtiva (concentradas em aglomerado) no país. Em razão disso, as instituições públicas brasileiras passaram a demonstrar grande interesse nas mesmas, como formas de promoção de desenvolvimento nos territórios. Neste sentido, buscou-se, neste trabalho, compreender as dificuldades e perspectivas das empresas do aglomerado industrial do município de Tabatinga - SP, com ênfase na gestão financeira das mesmas, de modo a verificar as condições dessas empresas frente a um ambiente de grande competição de mercado. Além disso, procurou-se identificar e analisar as relações existentes entre as empresas na busca de desenvolvimento próprio e para o território em que estão inseridas. Para tal, foram realizados: estudos teóricos a respeito das temáticas; levantamento de dados secundários para conhecimento dos ramos de bicho de pelúcia e de enxoval de bebê; e, pesquisa de campo com nove empresas do aglomerado. Foi possível identificar que, inicialmente, as empresas apresentavam dificuldades relacionadas à sua informalidade. Para superação dessa condição, atuaram na formalização dos empreendimentos, na contratação de novos empregados (já com relações formais) e na mudança de local doméstico para imóvel comercial, para que, dessa forma, pudessem promover crescimento nas suas vendas e participação de mercado. As empresas entrevistadas apresentam ações individualizadas (compra, venda e inovação), que poderiam ser coletivas se o aglomerado industrial apresentasse... / Abstract: Brazil has been experienced from the 1990s, changes in the organization of its territory. The capitalist production logic, with a financial and international character has been established during this period in the country, causing, among other things, processes of concentration / agglomeration of similar or complementary productive activities in the same municipality or region. It has been occurred, from that period, a large emergence of these productive organization forms (concentrated in agglomeration) in the country. As a result, Brazilian public institutions began to show great interest in them, as ways of promoting development in the territories. In this sense, this work aimed to understand the problems and prospects of the companies in the industrial agglomeration of the municipality of Tabatinga-SP, with an emphasis on financial management of the same, in order to check the conditions of these companies to face an environment of great competition of market. In addition, it sought to identify and analyze the relationships among the companies in the search for their own development and for the development of the territory in which they operate. To this end, it has been performed: theoretical studies on the topics; collection of secondary data to knowledge the branches of stuffed toys and of baby outfits; and field research with nine companies of the agglomeration. It has been identified that, initially, the companies had difficulties related to their informality. To overcome this condition, they worked in the formalization of the companies, the hiring of new employees (already with formal relations) and the changing of domestic location for commercial property, for which, therefore, could promote growth in sales and market share. Interviewed companies have individualized actions (buying, selling and innovation), which could be collective if the industrial agglomeration presented a dynamic cooperation. In addition, there are numerous... / Mestre
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A luta da terra nas literaturas portuguesa e brasileira: a linha marcada no chão que une José Saramago e Euclides da Cunha / The struggle for land in the Portuguese and in the Brazilian literatures: the ground line that connects José Saramago and Euclides da CunhaLuciana de Oliveira Mangueira 28 March 2014 (has links)
Dois romances escritos em países e em contextos históricos distintos aparecem como um retrato da situação do campo através do tempo em Brasil e Portugal. O processo de união dos homens em torno de um motivo comum, a oportunidade de sobrevivência na terra através da garantia do trabalho, se transforma na luta desses contra a alienação e, posteriormente, contra a força armada que protege o Estado e o grande proprietário. As questões que envolvem a terra transcendem o caráter comumente telúrico uma vez que essa é também personagem efetivamente ativo na vida dos homens do campo. Também personagem múltiplo é esse homem, representado pelas figuras do sertanejo baiano e o camponês alentejano: guardam em si a ambiguidade da fragilidade do corpo que, justamente, se torna em sua maior força. O movimento para a luta transforma homens e terra, muda a História. Esse processo é visto e traduzido por Euclides da Cunha em Os sertões e por José Saramago em Levantado do chão. A campanha de Canudos e as lutas pelo direito ao trabalho no campo português são próximas, desse modo, por representarem ambos, sob a perspectiva dos narradores desses dois romancistas, uma análise das injustiças cometidas pelo poder do Estado contra os que nada possuem e o levantar desses por seus direitos, pela transformação do estado de coisas / Two novels written in different countries and in different historical contexts depict the situation in the countryside throughout time in Brazil and Portugal. The process of the gathering of men around a common trait the opportunity of survival on land through the job guarantee also becomes the struggle against alienation and, afterwards, against the armed force that protect both the State and the landowner. The issues that spin around the land transcend the commonly telluric characteristic once this is also a character effectively active in the life of countrymen. Moreover, such man is also a multiple character, which is represented by the backland man from Bahia and the countryman from Alentejo: they keep in themselves the frailty of the body that, fairly enough, turns into their greatest strength. Te movement towards the struggle changes men and land, it changes History. This is the process observed and depicted by Euclides da Cunha in Os sertões (Rebellion in the Backlands) and by José Saramago in Levantado do Chão (Raised from the Ground). The Canudos campaign and the struggles towards the right to work in Portuguese country lands are side by side for both represent, under the perspective of these novels (and novelists) narrators, an analysis on the injustices promoted by the power of the State against those who do not own anything, and their standing for their rights, for the change of the state-of-things
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Traçadores isotópicos (Pb) e concentrações de metais em sedimentos superficiais: ferramentas na caracterização da poluição no setor oeste da baía de Sepetiba-RJ (SE do Brasil) / Isotopic tracers (Pb) and metal concentrations in surface sediments: tools for characterizing pollution in the west bay of Sepetiba-RJ (SE Brazil)Shéron Joyce Díaz Morales 30 May 2012 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este estudo teve como objetivo principal utilizar os teores de elementos-traço e análise isotópica de Pb (204Pb,206Pb,207Pb,208Pb) como ferramentas na caracterização da poluição da Baía de Sepetiba-RJ. As coletas de sedimento superficiais de fundo foram realizadas em três campanhas, em novembro de 2010, no setor oeste da Baía de Sepetiba RJ. A malha amostral é composta por 66 amostras (BSEP 001 a BSEP 066) coletadas com busca-fundo Van Veen. O pré-processamento das amostras ocorreu no Laboratório Geológico de Preparação de Amostras do Departamento de Geologia da Universidade do Estado do Rio de Janeiro. A digestão parcial das amostras de sedimento (< 0.072 mm) para obtenção do teor parcial dos elementos-traço (Ag, As, Cd, Co, Cr, Cu, Li, Mn, Ni, Pb, Sr, U, Zn) e de isótopo de Pb (lixiviação) foi executada no Laboratório de Geoquímica Analítica do Instituto de Geociências da UNICAMP e a leitura foi executada através do ICP-MS. Já as análises das concentrações totais dos elementos-traço (inclusive, Hg) e de isótopos de Pb (dissolução total) foram realizadas no laboratório ACTLABS (Ontário-Canadá) através do ICP Varian Vista. As leituras isotópicas foram feitas somente nas amostras que apresentaram concentrações parciais de Pb, acima de 0,5 g/g, totalizando 21 estações. Pôde-se constatar a existência de um enriquecimento de elementos-traço no setor oeste da Baía de Sepetiba. As médias dos teores totais de Ag (0,4 g/g), Cd (0,76 g/g), Cu (62,59 g/g), Li (43,29 g/g), Ni (16,65 g/g), Pb (20,08 g/g), Sr (389,64 g/g) e Zn (184,82 g/g) excederam os limites recomendados ou valores naturais. Isto pode ser reflexo da influência antrópica na região, principalmente relacionada à atividade de dragagem e à permanência dos resíduos de minério da desativada companhia de minério Ingá, na Ilha da Madeira. Os mapas de distribuição da concentração dos metais-traço destacaram a presença de vários sítios de deposição ao longo do setor oeste da baía de Sepetiba, com destaque para a região entre a porção centro oeste da Ilha de Itacuruça e o continente; Saco da Marambaia e Ponta da Pombeba; e porção oeste da Ponta da Marambaia. As razões isotópicas 206Pb/207Pb da área estudada variaram entre 1,163 a 1,259 para dissolução total e 1,1749-1,1877 para técnica de lixiviação, valores considerados como assinaturas de sedimentos pós-industriais ou comparados à assinatura de gasolina. Ainda sobre a técnica de lixiviação, destaca-se que os sedimentos superficiais do setor oeste (206Pb/207Pb: 1,1789) da baía de Sepetiba apresentaram uma assinatura uniforme e menos radiogênica do que setor leste (206Pb/207Pb: 1,2373 e 1,2110) desta baía. Através da assinatura isotópica de Pb encontrada nesta região é possível destacar a pouca contribuição das águas oceânicas para esse sistema, entretanto, a circulação interna intensa das águas da baía permite a homogeneização destas. O emprego destes tipos de ferramentas no monitoramento ambiental da área mostrou-se bastante eficiente, sendo importante a continuidade desta abordagem de pesquisa a fim de auxiliar na implementação de um plano de manejo local. / This study aimed to use of trace elements contents and isotopic analysis of Pb (204Pb, 206Pb, 207Pb, 208Pb) as tools to characterize the pollution of the Sepetiba Bay, Rio de Janeiro. Sampling of surface bottom sediments were carried out in three campaigns in November 2010, in the west sector of the Sepetiba Bay - RJ. The sampling grid is composed of 66 samples (BSEP 001 to BSEP 066) collected with Van Veen - bottom grab. The pre-processing of the samples occurred in the Geological Laboratory Sample Preparation, Department of Geology of the Rio de Janeiro State University. The partial digestion of sediments samples (< 0072 mm) to obtain the trace elements partial content (Ag, Cd, Co, Cr, Cu, Li, Mn, Ni, Pb, Sr, U, Zn) and Pb isotope (leaching) was performed at the Laboratory of Analytical Geochemistry of the Geosciences Institute at UNICAMP and the reading was performed by ICP-MS. The analysis of the total concentrations of trace elements (including, Hg) and Pb isotopes (total dissolution) were performed in the laboratory Actlabs (Ontario, Canada) by ICP Varian Vista. The isotopic readings were taken only in samples with partial Pb concentrations above 0,5 g/g, a total of 21 stations. It was found that the existence of an enrichment of trace elements in the west sector of the Sepetiba Bay. The mean total content of Ag (0,4 g/g), Cd (0,76 g/g), Cu (62,59 g/g), Li (43,29 g/g), Ni (16,65 g/g), Pb (20,08 g/g), Sr (389,64 g/g) and Zn (184,82 g/g) exceeded the recommended limits or natural values. This may reflect the anthropogenic influence in the region, mainly related to the activity of dredging and the permanence of waste ore off the mining company Inga, on the Madeira island. The distribution maps of the concentration of trace metals highlighted the presence of multiple sites of deposition along the west sector of Sepetiba Bay, with emphasis on the region between the central west of the Itacuruça Island and the mainland; Marambaia Bay and Pombeba Tip, and the west portion of Marambaia Bay. 206Pb/207Pb isotope ratios in the study area ranged from 1,163 to 1,259 for total dissolution and 1,1749 to 1,1877 for leaching technique values considered as a signature of postindustrial or sediments compared to the signature of gasoline. Still on the leaching technique, it is emphasized that the surface sediments of the west sector (206Pb/207Pb: 1,1789) from Sepetiba Bay presented a signature uniform and less radiogenic than the east sector (206Pb/207Pb: 1,2373 and 1,211) of this bay. Through the Pb isotopic signature found in this region is possible to highlight that there is minimal contribution of ocean water for this system, however, the intense internal circulation of the waters of the bay allows the homogenization of these. The use of these types of tools in environmental monitoring of the area proved to be very efficient, it is important to continue this research to assist in implementing a management plan for the site.
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