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Microdissecção e sequenciamento completo de cromossomos B em peixes aplicados em estudos evolutivos e funcionais

Utsunomia, Ricardo. January 2016 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Resumo: No presente estudo, duas populações da espécie de peixe Moenkhausia sanctaefilomenae, uma coletada no rio Batalha, Bauru-SP (bacia do rio Tietê) e outra coletada no rio Novo, Ocauçu-SP (bacia do rio Paranapanema), foram analisadas através de técnicas citogenéticas básicas e moleculares. Além disso, o sequenciamento na plataforma Illumina HiSeq2000 de ambos os genomas e de uma variante do cromossomo B microdissecado também foram realizados. Os resultados obtidos revelaram que todos os indivíduos da população do rio Batalha apresentam de 0 a 6 cromossomos B por célula, enquanto os indivíduos da população do rio Novo não mostram elementos supranumerários. Deve-se destacar que os cromossomos B encontrados nos indivíduos do rio Batalha podem ser divididos em 2 variantes, sendo uma eucromática (B1) e altamente frequente na população, e outra heterocromática (B2) e com uma baixa prevalência. A hibridação in situ fluorescente (FISH) de DNAs repetitivos evidenciou que ambas as variantes apresentam clusters de DNAr 18S, histona H3 e satDNAs MS3 e MS7, com diferenças apenas na abundância do DNAr 18S. A análise das sequências presentes nos cromossomos B revelam que a variante B1 é mais antiga que a variante B2, embora ambas pareçam ter derivado de um mesmo cromossomo. Além disso, a seleção parece estar relaxada em ambas as variantes para o gene de histona H3. Para um melhor conhecimento do conteúdo genômico do cromossomo B, uma biblioteca microdissecada da variante B1 foi sequenciada e o... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor
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Dinâmica evolutiva de DNAs repetitivos com ênfase em espécies da tribo Phanaeini /

Oliveira, Sárah Gomes de. January 2013 (has links)
Orientador: Cesar Martins / Coorientador: Rita de Cássia de Moura / Banca: Marie-Anne Van Sluys / Banca: Vera Lúcia da Silva Valente Gaiesky / Banca: Gustavo Campos e Silva Kuhn / Banca: Mara Cristina de Alemida Matiello / Resumo: O estudo de DNAs repetitivos tem se mostrado uma ferramenta esclarecedora para diversas questões, que incluem desde a organização molecular e o entendimento da estrutura cromossômica, à análises relacionadas à diversificação e evolução cariotípica. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi analisar a organização cromossômica e genômica dos DNAs repetitivos com ênfase em representantes da tribo Phanaeini (Coleoptera: Scarabaeidae: Scarabaeinae), visando a compreensão dos mecanismos evolutivos envolvidos na dinâmica dos DNAs repetitivos no genoma e suas implicações. Em representantes da tribo Phaneini, especialmente membros do gênero Coprophanaeus, foi observado que a expansão de DNA repetitivo ocorreu no início da diversificação do grupo; estando estas sequências envolvidas com a diversificação dos mecanismos sexuais de Coprophanaeus, e com a origem e evolução do cromossomo B observado em C. cyanescens. O isolamento e mapeamento de transposons Mariner revelou que estas sequências sofreram uma elevada diversificação durante a história evolutiva de Phanaeini, podendo também exercer alguma função na região pericentromérica dos cromossomos. Comparações entre sequências de famílias relacionadas do transposon Mariner mostrou que estas sequências podem estar envolvidas em um processo de transferência horizontal (HT) em diversos grupos animais não-relacionados, especialmente entre insetos e mamíferos; o que contribuiu para a ampla distribuição destes elementos transponíveis. Em relação às famílias multigênicas analisadas, observou-se uma grande variação para o DNAr 18S em contraste com o padrão conservado de DNAr 5S, sugerindo que as regiões genômicas que abrigam as classes de genes ribossomais são governadas por distintas forças evolutivas. Adicionado à isso, as análises das ...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The study of repetitive DNAs has been explored as an important tool to answer various biological questions, including the molecular organization and understanding of chromosome structure, and the analysis of karyotype diversification and evolution. Thus, this study focused in the chromosomal and genomic organization of repetitive DNA with emphasis on representatives of the Phanaeini tribe (Coleoptera: Scarabaeidae: Scarabaeinae), with the aim in understanding the mechanisms involved in the evolutionary dynamics of repetitive DNAs in the genome and their implications. In Phaneini, especially members of Coprophanaeus genus, it was observed that the expansion of repetitive DNAs occurred early in the diversification of the group. Also, these sequences have being involved in the diversification of sex chromosomes of Coprophanaeus, and the origin and evolution of the B chromosome observed in C. cyanescens. Isolation and mapping of Mariner transposons revealed that these sequences had a high diversification during the evolutionary history of Phanaeini, and therefore may also play a role in the pericentromeric region of the chromosomes. Comparative analysis between sequences of related families of Mariner transposons showed that these sequences may have been involved in a process of horizontal transfer (HT) in several unrelated groups of animals, especially between insects and mammals, which contributed to the widespread distribution of transposable elements (TEs). Regarding to the chromosomal mapping of multigene families, there was a large variation for 18S rDNA in contrast to the conserved pattern of 5S rDNA, suggesting that distinct evolutionary forces govern the genomic regions that harbor both ribosomal. Furthermore, the chromosomal mapping of repetitive sequences is a useful tool in understanding the processes that govern ...(Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Estudos citogenéticos no genêro Characidium (Teleostei, Characiformes, Chrenuchidae), com análise estrutural e molecular do sistema ZZ-ZW de cromossomos sexuais /

Alves, Jose Carlos Pansonato. January 2010 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Banca: Cláudio de Oliveira / Banca: Luis Antonio Carlos Bertollo / Banca: Artur Antonio Andreata / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Resumo: Foram analisadas onze espécies de peixes do gênero Characidium, Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2 e Characidium sp3 de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e moleculares (marcação por fluorocromos base-específicos, hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 18S e 5S, com sondas teloméricas (TTAGGG)n e com sondas para histona H1 e também microdissecção, amplificação e hibridação in situ fluorescente com sondas produzidas a partir do cromossomo sexual W e dos cromossomos B). Todas as espécies apresentaram número diplóide de 2n=50 cromossomos, com predominância dos cromossomos dos tipos meta e submetacêntricos, além da ocorrência de cromossomos supranumerários em C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi e Characidium sp3. Foi observada também a ocorrência de um sistema ZZ-ZW de cromossomos sexuais representado pelo par heteromórfico número 2 em todas as espécies, com exceção apenas de Characidium cf. zebra, que não apresentou cromossomos sexuais diferenciados. O DNAr 5S foi localizado em diferentes cromossomos entre estas espécies, mas sempre em posição intersticial dos cromossomos, reforçando a idéia de que esta localização cromossômica poderia representar alguma vantagem relacionada à organização destes genes no genoma. As RONs, identificadas pela prata, pela CMA3 e pela sonda de DNAr 18S, foram sempre localizadas em compartimentos cromossômicos distintos do DNAr 5S e estão diretamente relacionadas ao processo de diferenciação dos cromossomos Z e W,... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Eleven species of fish of the genus Characidium comprised by Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2, and Characidium sp3 from different Brazilian hydrographic basins were analyzed using basic cytogenetic (coloration with Giemsa, localization of NORs for silver nitrate marking and C-banding) and molecular techniques (for base-specific fluorochrome markings, fluorescent in situ hybridization with 18S and 5S rDNA probes, telomere probes (TTAGGG)n, and H1 histone, as well as microdissection, amplification and in situ fluorescent hybridization using probes prepared from both sex W and B chromosome). All the species presented a diploid number of 2n=50 chromosomes, with a predominance of the meta- and submetacentric types, besides the occurrence of supranumerary chromosomes in C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi, and Characidium sp3. The occurrence of a ZZ-ZW sex chromosome system represented by the heteromorphic pair number 2 in all species was observed, with the exception of Characidium cf. zebra, which did not presented differentiated sex chromosomes. The 5S rDNA marks were observed in different chromosomes among these species, but always located in an interstitial position, strengthening the idea that this chromosome location might represent some advantage related to the organization of these genes in the genome. NORs identified using Silver and CMA3, staining and 18S rDNA probe have always been located in distinct chromosome compartments when compared to 5S rDNA, showed to be directly related to the Z and W chromosome differentiation process, and is considered to play an important role in their evolution, considering that they could... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Herança, manutenção e origem dos diferentes tipos de cromossomos B em Prochilodus lineatus (Characiformes, Prochilodontidae) do rio Mogi-Guaçu /

Penitente, Manolo. January 2014 (has links)
Orientador: Fábio Porto-Foresti / Banca: Roberto Ferreira Artroni / Banca: Luis Antonio Carlos Bertollo / Resumo: Prochilodus lineatus constitui-se em uma espécie de grande ocorrência na bacia superior do rio Paraná, envolvendo, sobretudo, os rios Grande, Pardo e Mogi-Guaçu. Citogeneticamente, essa espécie apresenta número diploide de 54 cromossomos dos tipos meta/submetacêntricos e apresenta um interessante sistema de microcromossomos B, que pode ocorrer variação interindividual de zero a nove supranumerários, além de apresentar polimorfismo, sendo encontrados diferentes morfotipos. P. lineatus pode ser considerada uma espécie modelo de peixe neotropical, sendo muito utilizada para estudos concernentes à origem, comportamento meiótico e evolução dos cromossomos B, devido à facilidade de captura, manejo, alta frequência de supranumerários e polimorfismo. Atualmente existem muitas especulações a respeito de sua função, origem e herança, o que torna a análise da estrutura do DNA deste tipo cromossômico, assim como o estudo do seu padrão de herança de extrema importância. Diante disto, o presente trabalho teve como objetivo estudar a origem, manutenção e herança das variantes de cromossomos B encontradas em P. lineatus do rio Mogi-Guaçu, a partir da análise da composição do DNA, frequência na população natural e padrão de transmissão destes elementos genômicos. Os resultados obtidos a partir da análise da herança destes supranumerários mostrou dinamismo entre as variantes de supranumerários para prevalecerem nos genomas hospedeiros, por meio do padrão de transmissão (kB), onde o morfotipo B-metacêntrico apresentou kB acima da taxa Mendeliana, indicando um possível mecanismo de acúmulo (drive), enquanto que os morfotipos B-acro e B-submetacêntrico apresentaram kB abaixo da taxa Mendeliana, indicando estarem em estágio de extinção. Ao realizar a técnica de pintura cromossômica, utilizando as sondas B-específicas obtidas a partir da microdissecção de cada morfotipo, observou-se ... / Abstract: Prochilodus lineatus is a species of high incidence in the upper Paraná River basin, involving mainly the Grande, Pardo and Mogi-Guaçu Rivers. Cytogenetically, this species has a diploid number of 54 meta/submetacentric chromosomes and presents an interesting system of B microchromosomes, which can occur interindividual variation from zero up to nine supernumeraries, also it presents polymorphism and can be found in different morphotypes. P. lineatus can be considered a model species of neotropical fish, commonly used for studies concerning the origin, behavior and evolution of B chromosomes, due to ease of capture, handling, high frequency of supernumerary and polymorphism. Currently, there are only speculations about its function, origin and inheritance, which make the analysis of the DNA structure of this chromosomal type, as well as the study of the inheritance pattern, of the utmost importance. Faced with this, the present work aimed to study the origin, maintenance and inheritance of the B chromosomes variants found in P. lineatus from Mogi-Guaçu River, from DNA composition analysis, frequency in natural population and transmission pattern of these genomic elements. The results obtained from the inheritance analysis of these supernumerary showed a dynamism between supernumerary variants to prevail in the host genome through the transmission pattern (kB), in which the B-metacentric morphotype presented kB above Mendelian ratio, indicating a possible accumulation mechanism (drive), while the B-acro and B-submetacentric variants presented kB below Mendelian ratio, indicating that they were in extinction stage. When performing the chromosome painting technique, using B-specific probes obtained from each microdissected morphotypes, it was observed a homology between the B chromosome variants, indicating a common ancient variant origin. However, only the B-submetacentric chromosome probe (Bsm) showed ... / Mestre
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Constituição cariotípica em leptodactilídeos do gênero Leptodactylus e em espécies de famílias relacionadas à Leptodactylidae (Amphibia: Anura) /

Campos, João Reinaldo da Cruz de. January 2010 (has links)
Orientador: Sanae Kasahara / Banca: Cleusa Yoshiko Nagamachi / Banca: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Ana Paula Zampieri Silva / Banca: Luciana Bolsoni Lourenco / Resumo: Até recentemente, a família Leptodactylidae era considerada polifilética, mas nenhum dos trabalhos realizados antes de 2006 resolveu essa polifilia. Nesse ano, quase que simultaneamente, duas grandes revisões foram publicadas, com base principalmente em sequenciamento gênico e sem considerar dados citogenéticos, resultando em filogenias que mudaram radicalmente a taxonomia e a sistemática de muitos grupos de anuros. Leptodactylidae foi uma das famílias que passou por grandes transformações, sendo os gêneros reduzidos de 57 para apenas quatro. Na presente Tese, foram analisados os cariótipos de nove espécies do gênero Leptodactylus e 19 representantes de famílias relacionadas à Leptodactylidae, cujos dados são apresentados em três partes. No primeiro capítulo são apresentados cariótipos com 2n=20, nos exemplares de Vitreorana eurygnatha e V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22, em Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho e I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus e L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri e P. moreirae (Leiuperidae); e 2n=26 para Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris e Zachaenus parvulus (Cycloramphidae), Flectonotus sp. e Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). São também descritos o padrão de Ag-RON e bandamento C para a grande maioria das espécies. Os dados cromossômicos aqui obtidos, juntamente com os disponíveis na literatura, foram avaliados à luz das árvores filogenéticas atuais, tendo sido observada grande concordância com as alterações propostas. O segundo capítulo trata dos cariótipos de três espécies de Leptodactylus que pertenciam ao gênero Adenomera, com 2n=24 em L. cf. marmoratus, 2n=23... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Until recently, the family Leptodactylidae was considered polyphyletic, but no paper published before 2006 clarify this question. In that year two extensive revisions were published, almost simultaneously, based mainly on gene sequencing with no contribution of cytogenetic data. These studies resulted in phylogenetic trees which have radically changed the taxonomy and systematic of several groups of frogs. Leptodactylidae was one of the families that suffered great modifications, and the number of genus was reduced from 57 to only 4. In this work, the karyotypes of 9 species of Leptodactylus and representatives of 19 families related to Leptodactylidae were analyzed, and the data are presented in three parts. The first chapter describes the karyotypes with 2n=20, in species of Vitreorana eurygnatha and V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22 in Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho and I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus and L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri and P. moreirae (Leiuperidae); and 2n=26 in Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris and Zachaenus parvulus (Cycloramphidae) Flectonotus sp. and Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). The C band and Ag- RON patterns are described for the majority of the species. The chromosomal data obtained here, along with those available in the literature, were analyzed in the light of the current phylogenetic trees, and are in accordance to the proposed modifications. The second chapter reports the karyotypes of three Leptodactylus species belonging to the former genus Adenomera, with 2n=24 in L. cf. marmoratus, 2n=23 in Leptodactylus sp. (aff bokermanni), and 2n=26 in L. hylaedactylus, bearing different... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Mapeamento físico de genes ribosomais 18S e 5S nos cromossomos de espécies simpáticas do gênero Gymnotus (Teleostei, Gymnotiformes, Gymnotidae)

Scacchetti, Priscilla Cardim [UNESP] 25 February 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-25Bitstream added on 2014-06-13T20:20:30Z : No. of bitstreams: 1 scacchetti_pc_me_botib.pdf: 611456 bytes, checksum: 9da86fc13407eb38ca4617dc47ac3e9d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Foram analisadas citogeneticamente quatro espécies de peixes do gênero Gymnotus, G. sylvius, G. pantherinus, G. inaequilabiatus e G. cf. carapo de componentes de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e citomoleculares (coloração com os fluorocromos base-específicos CMA3 e DAPI, hibridação in fluorescente situ (FISH) com sondas de DNAr 18S e 5S, sonda teloméricas (TTAGGG)n e sonda obtida do cromossomo portador das RONs de G. carapo da bacia Amazônica por Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS) e caracterização e organização genômica do DNAr 5S). G. sylvius apresentou número diplóide de 40 cromossomos (22m+12sm+6st); G. pantherinus apresentou número diplóide de 52 cromossomos (32m+18sm+2st) e G. inaequilabiatus (42m+10sm+2a) e G. cf. carapo (38m+12sm+4st) apresentaram 54 cromossomos. O bandamento C evidenciou a marcação de pequenos blocos centroméricos em todos os cromossomos de todas as espécies, sendo, porém, detectadas algumas marcações intersticiais em G. sylvius e grandes blocos intersticiais nos cromossomos de G. inaequilabiatus, G. cf. carapo e G. pantherinus. As RONs foram identificadas em apenas um par cromossômico nas quatro espécies e foram coincidentes com a hibridação fluorescente in situ realizada com a sonda para DNAr 18S e a coloração com o fluorocromo CMA3. A hibridação com a sonda para DNAr 5S revelou marcações em até dezessete pares de cromossomos em G. inaequilabiatus e em até quinze pares em G. cf. carapo; dois pares cromossômicos em G. pantherinus e um par em G. sylvius. A hibridação com a sonda para a sequência telomérica (TTAGGG)n revelou marcações nos telômeros de todos os cromossomos dos representantes destas quatro espécies, além de blocos intersticiais no primeiro... / Four fish species of the genus Gymnotus comprised by G. sylvius, G. pantherinus, G. inaequilabiatus and G. cf. carapo from different Brazilian hydrographic basins were analyzed using classic cytogenetic (coloration with Giemsa, localization of NORs for silver nitrate marking and C-banding) and molecular cytogenetic techniques with base-specific fluorochrome DAPI and CMA3, fluorescence in situ hybridization (FISH) with probes consisting of 18S and 5S rDNA, telomeric sequences (TTAGGG)n and whole chromosome prepared by Fluorescence Activated Cell Sorting (FACS) of the NOR chromosome, obtained of G. carapo from Amazon basin, as well as a characterization and genomic organization of 5S rDNA. G. sylvius presented a diploid number of 40 chromosomes (22m+12sm+6st); G. pantherinus presented a karyotype with 52 chromosomes (32m+18sm+2st) and G. inaequilabiatus (42m+10sm+2a) and G. cf. carapo (38m+12sm+4st) presented 54 chromosomes. All the species presented the constitutive heterochromatin located in the centromeric region of all chromosomes. Besides that, some interstitial marks were detected in G. sylvius and large interstitial blocks were identified at the chromosomes of G. inaequilabiatus, G. cf. carapo and G. pantherinus. NORs were identified in only one chromosome pair in all species and were coincident with the in situ hybridization using probes of 18S rDNA and the fluorochrome CMA3. FISH using the probes of 5S rDNA revealed marks up to seventeen chromosome pairs in G. inaequilabiatus and up to fifteen pairs in G. cf. carapo, two chromosome pairs in G. pantherinus and one pair in G. sylvius. The telomeric probes were localized at the telomeres of all chromosomes in the four species, as well as interstitial telomeric sequence in the first metacentric pair in G. sylvius and along the NORs in G. inaequilabiatus and G. cf. carapo. The amplification, cloning, sequencing and in situ hybridization... (Complete abstract click electronic access below)
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Evolução do DNA satélite na subfamília aurantioideae (Rutaceae)

Emília Barros e Silva, Ana January 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:55:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5293_1.pdf: 1975066 bytes, checksum: ad92cf6b4cc6656b99745a7ba874fe4e (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / A subfamília Aurantoideae (Rutaceae) está representada por cerca de 200 espécies, destacando-se àquelas pertencentes ao gênero Citrus, pela sua importância econômica. Do ponto de vista citogenético, o padrão de bandas heterocromáticas de Citrus e gêneros relacionados é o parâmetro mais importante para comparação entre espécies, por ser bastante variável. Embora essas bandas sejam ricas em GC, o que é demonstrado pela coloração com cromomicina A3 (CMA), a natureza dessas bandas ainda é desconhecida. Neste trabalho foi realizada uma análise comparada da distribuição das bandas CMA, dos sítios de DNAr 5S e 45S e de uma seqüência satélite isolada de Citrus sinensis nos cromossomos de representantes de alguns gêneros, através da hibridização in situ fluorescente (FISH), visando compreender a evolução da heterocromatina dentro da subfamília. Os resultados mostraram que os sítios de DNAr 5S ocorrem quase sempre muito proximamente ligados aos sítios de DNAr 45S, sugerindo que a conservação dessa ligação foi mantida por pressão de seleção. Um aspecto importante dessa associação é que a posição cromossômica dos sítios de DNAr 5S e 45S variou entre as espécies sem alterar a orientação cromossômica destes, indicando a ocorrência de diversos rearranjos cromossômicos. Por outro lado, o DNA satélite rico em GC isolado de C. sinensis, hibridizou na maioria dos blocos heterocromáticos das três espécies investigadas de Citrus, em Fortunella obovata e em Poncirus trifoliata, sugerindo que essa seqüência seja um dos principais componentes das bandas CMA observadas em Citrus e gêneros próximos. Contudo, essa seqüência não hibridizou em Murraya paniculata, uma espécie mais afastada de Citrus, mas com padrão de bandas heterocromáticas similar a este. Portanto, seqüências satélites diferentes podem ter sido amplificadas em grupos distintos de espécies de Aurantioideae, gerando padrões de bandas similares. Esses dados indicam que padrões de bandas similares não indicam necessariamente homeologia cromossômica
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Meiose invertida quiasmática e aquiasmática em plantas com cromossomos holocinéticos

Corina Carneiro de Cabral, Gabriela 31 January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:02:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2080_1.pdf: 693319 bytes, checksum: 06ba5e0a91cf68ac0aaa48e656e42501 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / De acordo com a extensão do cinetócoro, os cromossomos podem ser divididos em monocêntricos, com cinetócoro localizado, e holocinéticos, com cinetócoro difuso. Diversos organismos com cromossomos holocinéticos, incluindo todas as plantas com este tipo cromossômico, apresentam uma meiose bastante peculiar, na qual são observadas 2n cromátides individualizadas na prófase II. Este tipo de meiose é denominado meiose invertida ou pós-reducional, baseado na hipótese de que a segregação das cromátides irmãs na anáfase I seria a causa das cromátides individualizadas na prófase II. Neste trabalho, foi analisado o curso meiótico de duas espécies de Cyperaceae, Rhynchospora pubera (2n = 10) e R. tenuis (2n = 4), que apresentam meiose quiasmática e aquiasmática, respectivamente. Foram encontrados fortes indícios de meiose invertida nas duas espécies, uma vez que os cinetócoros das cromátides irmãs apresentaram ligação anfitélica com o fuso na metáfase I tanto nos univalentes de R. tenuis como nos bivalentes de R. pubera. A ligação anfitélica dos cinetócoros irmãos é um pré-requisito para a segregação das cromátides irmãs na anáfase I. Adicionalmente, foram investigados neste trabalho dois aspectos da prófase I que poderiam interferir na formação de quiasmas na meiose de R. tenuis. Neste caso, foi avaliada a presença de Rad51, uma enzima que atua no reparo de quebras na dupla fita de DNA, necessária para a formação do quiasma, e de ASY1, uma das proteínas que compõe o elemento axial dos cromossomos meióticos e é necessária para a sinapse. A formação de quebras na dupla fita de DNA na prófase I parece ocorrer normalmente, com base na distribuição dos sinais da recombinase Rad51. No entanto, a imunolocalização da ASY1 revelou a formação de filamentos anormais, com aspecto borrado, em R. tenuis, contrastando com os filamentos nítidos observados em R. pubera. A análise da distribuição dos sítios de DNAr 5S e das bandas CMA+ confirmou que a meiose de R. tenuis é assináptica. Baseado nos defeitos sinápticos observados em R. tenuis, é possível que a ausência de quiasmas deva-se a uma falha na formação do complexo sinaptonêmico, uma vez que as etapadas inicias de recombinação estão presentes na espécie
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Caracterização citogenética de cultivares de Lycopersicon esculentum Mill. e espécies afins

OLIVEIRA, Maria Betânia Melo de January 2002 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4495_1.pdf: 728619 bytes, checksum: 9b2bd7eb066091b213cc0e54058b34f5 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2002 / Com o intuito de avaliar as características citológicas das espécies pertencentes ao gênero Lycopersicon foram realizadas análises citogenéticas com coloração convencional e hibridização in situ em algumas espécies desse gênero. Todos os materiais apresentaram 2n=24 cromossomos, exceto os tetraplóides, com 2n=48. Os cariótipos foram simétricos constituídos de um par de cromossomos satelitados nas espécies diplóides. O número e a posição dos sítios ribossomais (DNAr 5S e 45S) observados com a hibridização in situ foi igualmente semelhante nas cinco espécies analisadas, não havendo, aparentemente, nenhuma diferença no tamanho. São discutidas a estabilidade cariotípica quanto ao número cromossômico e aos sítios de DNAr 5S e 45S entre as espécies
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Estudos cromossomicos em populações de Simulium (Chirostilbia) pertinax (Diptera, Simuliidae)

Gaona, Jairo Campos 26 August 1997 (has links)
Orientadores: Carlos Fernando S. Andrade, Shirlei M. Recco-Pimentel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-22T19:18:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gaona_JairoCampos_M.pdf: 5770054 bytes, checksum: 49c05506226eee9c132cbb49f851eeec (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: Foram realizados estudos cromossômicos em seis populações de Simulium (Chirostilbia) pertinax do Brasil. Pela análise dos gânglios cerebrais larvais da população de Morungaba, SP verificou-se que a espécie apresenta um cariótipo com 2n=6 cromossomos, sendo dois pares metacêntricos e um par submetacêntrico. Com base em metodologia padronizada para a família Simuliidae, foram elaborados os mapas dos cromossomos politênicos de glândulas salivares larvais. Os cromos somos politênicos apresentaram constância morfológica no seu padrão de bandas. Não foi registrada qualquer constrição importante e regiões assinápticas foram raras. Também, não foram observados cromossomos B nem segmento diferencial do sexo. A comparação do padrão de bandas dos cromossomos politênicos com aquele "standard" do subgênero Simulium mostrou uma semelhança de cerca de 63% para várias regiões nos seis braços cromossômicos. Além da população de Morungaba (n=1O2), foram analisadas mais cinco populações de S. pertinax coletadas nos estados do Paraná (Tibaji, n=13), Rio Grande do Sul (Nova Petrópolis, n=14), Rio de Janeiro (Muriqui, n=40) e São Paulo (Barra do Una, n=38; e llhabela, n=48). Foram feitas comparações dos cromos somos politênicos dentro e entre seis populações. Os cromossomos politênicos apresentaram pareamento dos homólogos e conspícuas regiões centroméricas. As características morfológicas dos cromossomos politênicos, como centrômeros, marcadores universais, região organizadora nucleolar (NOR) e padrão de bandas, não apresentaram variação apreciável dentro e entre as populações, exceto um polimorfismo de expressão, uma região organizadora nucleolar secundária (NOR 2°) em um indivíduo. Apesar de quatro das populações apresentarem características bioecológicas diferentes e terem sofrido diferentes tipos de pressão de seleção por inseticidas, não foi observada diferenciação cromossômica. Pela homosseqüencialidade cromossômica verificada entre as seis populações sugere-se que a espécie seja monomórfica e os fatores genéticos de resistência aos inseticidas estejam espalhados no genoma sem uma expressão aparente em nível cromossômico / Abstract: Chromosornic studies were carries out for six populations of Simulium (Chirostilbia) pertinax of BraziI. The analysis of the larval cerebral ganglia from the population found in Morungaba, SP showed that the species presents a karyotype with 2n=6 chromosomes, two pairs being metacentric and one pair submetacentric. Based on standard methodology for the Simuliidae family, the polytene chromosome maps were made using the larval salivary glands. Polytene chromosomes banding pattems presented high morphological homology. No important constrictions were recorded and assinaptic regions were rare. AIso, neither B chromosomes nor a sex differential segment were observed. Comparison of polytene chromosome band pattems with that considered standard for the subgenus Simulium showed a similarity of about 63% for many regions in all the six chromosome arms. Besides the population obtained from Morungaba (n=1O2) a study was also made of five S. pertinax populations collected respectively in the states of Paraná (Tibaji, n=13), Rio Grande do Sul (Nova Petrópolis, n=14), Rio de Janeiro (Muriqui, n=40) and São Paulo (Barra do Una, n=38; and llhabela, n=48). Comparisons for the polytene chromosomes within and among the six populations were carried out. Polytene chromosomes showed band pairing among homologous chromosomes and conspicuous centromeric regions. No difference was observed for any morphological chromosome characteristics such as centromeres, universal markers, nuclear organizer region (NOR) and banding pattem within and among populations, except by one individual expression of polymorphism, a secondary NOR. No chromosomal differentiation associated to insecticide resistance was observed a1though four of the populations presented different bioecological features and suffered different selection pressures by insecticides. Due to the chromosomal homosequentiality found among the six populations it was suggested that S. pertinax is a monomorphic species and that the genetic factors for organophosphorous resistance are spread in the genome with no visually detectable morphologic expressions at the chromosome level / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Ciências Biológicas

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