Orientador: Fábio Porto-Foresti. / Banca: Orlando Moreira Filho / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Banca: Luiz Antonio Carlos Bertollo / Banca: José Carlos Pansonato Alves / Resumo: A família Prochilodontidae apresenta uma extraordinária estabilidade dos caracteres morfológicos e merísticos, o qual pode estar relacionado ao fato de efetuarem grandes migrações com propósito reprodutivo, dispersando-se em grandes áreas. Sob o ponto de vista citogenético, apresenta uma constituição cariotípica bastante conservada com 2n=54 cromossomos dos tipos metacêntrico e submetacêntrico com número fundamental igual a 108. Além disso, a presença de microcromossomos supranumerários em algumas espécies do gênero Prochilodus tornou-se a base para diversos estudos citogenéticos. Diante disso, este trabalho objetivou realizar um estudo pormenorizado sobre a origem, herança e estrutura dos cromossomos supranumerários em Prochilodus. Para isto, foram realizados estudos citogenéticos envolvendo alguns exemplares deste gênero, portadores (Prochilodus lineatus e Prochilodus nigricans) e não-portadores de supranumerários (Prochilodus argenteus, Prochilodus brevis e Prochilodus costatus). Em todos os indivíduos analisados citogeneticamente foi constatado um número diploide de 54 cromossomos dos tipos metacêntrico e submetacêntrico, além da presença cromossomos B em P. lineatus e em P. nigricans. A utilização de marcadores citogenéticos convencionais (Giemsa, NOR e Banda C) e citogenéticos- moleculares (FISH) com sondas de genes ribossômicos 5S e 18S confirmaram uma constituição cariotípica conservada apenas para o número e morfologia cromossômica nestas cinco espécies. A localização das Regiões Organizadoras de Nucléolo (NOR) foi evidenciada no braço longo do segundo par de cromossomo submetacêntrico em P. brevis, P. costatus, P. lineatus e P. nigricans. Em P. argenteus somente um cromossomo deste mesmo par foi marcado pela Prata, seu homólogo não exibiu marcações demonstrando inatividade ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The family Prochilodontidae shows morphological and meristic characters with an extraordinary degree of stability, which may be related to the great migrations accomplished for reproductive purposes, spreading over large areas. From the cytogenetic viewpoint, it presents a much conserved karyotypic constitution with 2n = 54 metacentric and submetacentric chromosomes with fundamental number equal to 108. Moreover, the presence of supernumerary microchromosomes in some species of the genus Prochilodus provided the basis for a range of cytogenetic studies. In light of the aforementioned, this study aimed to conduct a detailed investigation of the origin, inheritance, and structure of supernumerary chromosomes in Prochilodus. In this connection, we conducted cytogenetic studies involving a few specimens of this genus, bearers (Prochilodus lineatus and Prochilodus nigricans) and non-bearers of supernumerary (Prochilodus argenteus, Prochilodus brevis, and Prochilodus costatus). All subjects cytogenetically studied exhibited a diploid number of 54 metacentric and submetacentric chromosomes, besides revealing the presence B chromosomes in P. lineatus and P. nigricans. The use of conventional cytogenetic (Giemsa, NOR and C-Band) and molecular cytogenetic markers (FISH) with 5S and 18S ribosomal gene probes confirmed a conserved karyotypic constitution restricted only to the chromosome number and morphology in these five species. The location of Nucleolar Organizer Regions (NOR) was detected on the long arm of the second pair of a submetacentric chromosome in P. brevis, P. costatus, P. lineatus, and P. nigricans. In P. Argenteus, only one chromosome of that same pair was marked by silver staining, whereas its homologous did not show any markings, demonstrating inactivity in this region... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Rogério Abdallah Curi / Banca: Guilherme Costa Venturini / Banca: Simone Cristina Méo Niciura / Resumo: Ao longo de várias décadas a raça Quarto de Milha foi selecionada para diferentes objetivos, formando grupos com aptidões ou habilidades distintas, como a linhagem de corrida, que apresenta melhor desempenho que qualquer outra linhagem ou raça em corridas de curta distância e a linhagem de trabalho, utilizada no manejo de bovinos a campo e em provas de caráter funcional. Considerando as diferenças nas medidas corporais e na musculatura que ocorrem entre as linhagens de corrida e de trabalho da raça Quarto de Milha, o objetivo deste trabalho foi analisar a ocorrência de relações entre alelos de polimorfismos da região cromossômica do gene da miostatina MSTN (ECA18), um regulador negativo do desenvolvimento muscular, e as duas linhagens da raça. Outro objetivo foi realizar análises de associação de polimorfismos dessa região cromossômica com valor genético estimado (EBV) do desempenho em corridas, dado pelo índice de velocidade máximo (IV max), e EBVs da altura à cernelha (AC), perímetro torácico (PT) e comprimento corporal (CC) na linhagem de corrida, e com EBVs da AC, PT e CC na linhagem de trabalho. Foram utilizadas informações genômicas, fenotípicas e de pedigree de 420 equinos, de ambos os sexos, registrados na associação Brasileira de criadores (ABQM), sendo 352 da linhagem de corrida e 68 da de trabalho. Na região genômica estudada (gene MSTN ± 2Mb), foram identificados 46 SNPs e 1 SINE - ERE1 comuns às linhagens de trabalho e de corrida, dos quais 32 SNPs e 1 SINE apres... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: For several decades the Quarter Horse breed was selected for different purposes, forming groups with different abilities, such as the racing line, which performs better than any other lineage or breed in short distance races and the lineage of work, used in the management of field cattle and in functional tests. Considering the differences in body measurements and musculature that occur between racing and working strains of the Quarter-Mile breed, the objective of this study was to analyse the occurrence of relations between polymorphic alleles of the chromosomal region of the myostatin (MSTN) gene (ECA18), a negative regulator of muscle development, and the two lineages of the breed. Other objective was to perform association analyses of these polymorphisms with estimated genetic value (EBV) of the performance in lineages, given by the maximum velocity index (IV max), and EBVs of height at withers (HW), heart girth (HG) and body length (BL) in the racing line, and with EBVs of AC, PT and CC in the working line. We used genomic, phenotypic and pedigree information from 420 horses of both sexes, recorded in the Brazilian breeders' association (ABQM), 352 and 68 of the racing and working line, respectively. In the studied genomic region (MSTN gene ± 2Mb), 46 SNPs and 1 SINE - ERE1 were identified, common to the working and running strains, of which 32 SNPs and one SINE presented alleles with significantly different frequencies between them. It has also been found that the portion of this region closest to the MSTN gene (± 1Mb) is less polymorphic in the racing versus the working strain, which may be a consequence of higher selection pressure on that region in the racing line and / or due to the use of purebred English animals in it. In relation to the polymorphisms associated with the phenotypes (p not adjusted <0.05)... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-10T17:16:53Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 761778 bytes, checksum: ecca750c172b279fb9ce213dddba2559 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T17:16:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 761778 bytes, checksum: ecca750c172b279fb9ce213dddba2559 (MD5) Previous issue date: 2016-05-24 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Sondas cromossomo-específicas referem-se a um conjunto de sequências de DNA marcadas com fluorescência, específicas de um par cromossômico, visualizadas através da hibridização em preparações citogenéticas. Tais sondas possibilitam a visualização altamente sensível e exclusiva de cromossomos individuais, ampliando a resolução diferencial de cariótipos. Elas podem ser empregadas em análises de organização do genoma, genômica comparativa, estudos evolutivos e filogenéticos, auxiliar na identificação de pares de homólogos, comparação cariotípica e obtenção de mapas físicos com marcas que auxiliem em programas de melhoramento genético. Técnicas de microdissecção de cromossomos, juntamente com métodos de isolamento e amplificação do DNA microdissectado, representam ferramentas úteis para serem aplicadas na construção dessas sondas cromossomo-específicas. Um fator considerado limitante no uso da microdissecção é a necessidade de coletar em torno de 20 cópias de um determinado cromossomo. Isso implica na necessidade de reconhecimento prévio do alvo e a certeza na identificação. A utilização de um único cromossomo resolve essa questão e possibilita a construção de sondas sem necessidade de identificação prévia, além de reduzir os esforços relativos à microdissecção. Considerando o potencial informativo dessas sondas e o desafio de construí-las a partir de um único cromossomo, o presente trabalho foi realizado com objetivo de padronizar metodologias para construção de sondas cromossomo-específicas a partir de um cromossomo isolado por microdissecção. Para tanto, foram realizadas adaptações das técnicas para obtenção de cromossomos mitóticos e meióticos adequados para caracterização cariotípica e aplicação das técnicas de microdissecção e hibridização in situ fluorescente. Foram utilizadas metáfases provenientes de cultura de linfócitos humanos para padronização de (i) métodos de microdissecção; (ii) enzimas adequadas e condições de amplificação de um cromossomo por DOP-PCR; (iii) enzimas para a marcação fluorescente das sondas por random primer e (iv) condições de estringência para a hibridização in situ fluorescente (FISH). Após essas padronizações iniciais, as metodologias foram empregadas em milho (Zea mays) e pimentão (Capsicum annuum) para primeiros testes envolvendo espécies vegetais. Foram obtidas sondas cromossomo-específicas para o par 2 do cariótipo humano, para o par cromossômico 1 de milho e para pimentão (provavelmente o par 7 ou 8). Esses resultados demonstraram que, apesar da construção de sondas cromossomo-específicas ser uma metodologia extensa e desafiadora, a padronização de cada etapa possibilitou a marcação de um par específico a partir da coleta de um único cromossomo para humano, milho e pimentão. A microdissecção, a transferência do material para o microtubo e a comparação de diferentes parâmetros na amplificação por DOP-PCR foram consideradas como as etapas mais críticas do processo. A qualidade das preparações cromossômicas foi um fator crucial para aplicação das metodologias de microdissecção e FISH. Esse trabalho revela estratégias baseadas na microdissecção de um único cromossomo que possibilitaram a produção de sondas cromossomo-específicas para diferentes organismos, como humano, milho e pimentão. As etapas padronizadas poderão direcionar os procedimentos de construção de sondas cromossomo-específicas para todos os cromossomos dos cariótipos das espécies utilizadas nesse trabalho, bem como poderão ser aplicadas em outras plantas. / Chromosome-specific probes are DNA sequences, fluorescently labelled specifically for a chromosome pair. Such probes can be applied for analysis in evolutionary and phylogenetic studies, for karyotype comparison and to obtain physical maps that help in plant breeding programs. Techniques of chromosome microdissection, along with methods of isolation and amplification of microdissected DNA, represent useful tools to be employed in the construction of chromosome-specific probes. A considered limiting factor in the use of microdissection is the necessity to collect around 20 copies of a particular chromosome. This implies the need of prior recognition of the target and the conviction in identification. The use of a single chromosome solves this issue and allows the construction of probes without prior identification, besides reducing the efforts on microdissection. Considering the potential of these informative probes, this study aimed to compare and standardize methods of classical and molecular cytogenetics to build probes. Therefore, technical adjustments were made to obtain mitotic and meiotic chromosomes suitable for karyotype characterization and application in microdissection techniques and in situ hybridization. Metaphases from human lymphocytes were used to standardization of (i) microdissection methods; (ii) chromosomes amplification; (iii) DNA fluorescent labelling and (iv) stringency conditions for fluorescence in situ hybridization (FISH). After the initial protocol standardization, the methodologies were used in maize (Zea mays) and sweat peppers (Capsicum annuum). A chromosome-specific probe for pair 2 of human chromosomes, a probe to chromosome 1 of corn and a probe for sweat pepper (probably the pair 7 or 8) were obtained. Although chromosome-specific probes construction involves many steps, the standardization of each process stages allowed, in our conditions, to obtain a specific probe from a single chromosome for humans, corn and sweat pepper. The microdissection and the comparison of different DOP-PCR parameters were considered as the most critical steps of the process. Human and plant chromosomes showing preserved morphology and structure provided a suitable template DNA for probes construction. The quality of chromosome preparation was a key factor for the microdissection and application of FISH methodologies. This work reveals strategies based on microdissection of a single chromosome that made possible the production of chromosome-specific probes for different organisms, such as human, corn and pepper. Standardized steps may guide the procedures of chromosome-specific probes construction for all chromosomes of karyotypes of the species used in this work, and it may be applied to other plant.

Tese (doutorado) - Universidade de São Paulo. Instituto de Biociências / Made available in DSpace on 2013-12-05T19:30:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1982

Orientadora : Profª Drª Iris Hass / Coorientadora : Profª Drª Roberto Ferreira Artoni / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba,20/03/2017 / Inclui referências : f. 44-48 / Resumo: Cromossomos B, ou cromossomos extranumerários, são elementos extras ao complemento padrão de uma espécie. Eles apresentam comportamento distinto ao complemento A e não obedecem às frequências Mendelianas, resultado de uma gametogênese desbalanceada. Em mamíferos, aproximadamente 70% dos cromossomos B descritos ocorrem na ordem Rodentia. Akodon montensis é a única espécie do gênero a apresentar cromossomos B, cuja origem ainda é desconhecida. Este trabalho teve como objetivo analisar variações morfológicas, numéricas e possíveis homologias entre os cromossomos extranumerários e o complemento A, encontrados em uma população de Akodon montensis na ilha de São Francisco do Sul, Santa Catarina. Sondas de cromossomos B inteiros para pintura cromossômica foram desenvolvidas utilizando microdissecção cromossômica, sondas de DNA repetitivo 18S, 5S e sequencia telomérica também foram utilizadas. Análises morfológicas dos cromossomos permitiram a identificação de quatro tipos de cromossomos B na população: na população. As hibridações com as sondas de cromossomos inteiros revelaram homologia entre todos os cromossomos B, mas não mostraram sinal cromossomos A. Os resultados indicam que os cromossomos B dessa população podem ter uma origem comum antiga, que resultou na variação de tamanho e morfologia observados. Palavras-chave: Rodentia, Akodon montensis, cromossomo B, DOP-PCR, FISH, pintura cromossômica. / Abstract: B chromosomes are extra chromosomes to the standard complement that occur in about 15% of eukaryotes. They present parasite behavior and do not follow Mendelain heritage patterns, resulting in an unbalanced gametogenesis. In mammals, about 70% of reported B chromosomes occur in Rodentia. Akodon montensis is a South American rodent known to host B chromosomes. The purpose of this work was to analyze morphology, frequency, and possible homologies amongst various B chromosomes found in an isolated population in São Francisco do Sul Island, Brazil. Morphological analysis identified four different B euchromatic chromosomes types. Whole chromosome probes were manufactured through microdissection of all B types singly. The rDNA 18S, 5S and telomeric probes were also employed in addition of the nucleolar organizing regions by Ag-NORs. The larger rDNA had polymorphic labeling, except for B chromosomes, whereas the 5S rDNA was located exclusively in the interstitial position of the long arm of the chromosomes 5. Whole chromosome painting with B probes by fluorescent in situ hybridization revealed homologous composition for all four types of B chromosomes in this population, but no occurrence of homologous regions in autosomal chromosomes or the sex chromosomes. These results indicate that B chromosomes in this population may have a common origin, with posterior size and morphology diversification. Key words: Rodentia, Akodon montensis, B chromosome, DOP-PCR, FISH, chromosome painting

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-02Bitstream added on 2014-06-13T19:05:53Z : No. of bitstreams: 1 voltolin_ta_dr_botib.pdf: 2147115 bytes, checksum: 09f04075f90553f16abaa9ae38b53084 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A família Prochilodontidae apresenta uma extraordinária estabilidade dos caracteres morfológicos e merísticos, o qual pode estar relacionado ao fato de efetuarem grandes migrações com propósito reprodutivo, dispersando-se em grandes áreas. Sob o ponto de vista citogenético, apresenta uma constituição cariotípica bastante conservada com 2n=54 cromossomos dos tipos metacêntrico e submetacêntrico com número fundamental igual a 108. Além disso, a presença de microcromossomos supranumerários em algumas espécies do gênero Prochilodus tornou-se a base para diversos estudos citogenéticos. Diante disso, este trabalho objetivou realizar um estudo pormenorizado sobre a origem, herança e estrutura dos cromossomos supranumerários em Prochilodus. Para isto, foram realizados estudos citogenéticos envolvendo alguns exemplares deste gênero, portadores (Prochilodus lineatus e Prochilodus nigricans) e não-portadores de supranumerários (Prochilodus argenteus, Prochilodus brevis e Prochilodus costatus). Em todos os indivíduos analisados citogeneticamente foi constatado um número diploide de 54 cromossomos dos tipos metacêntrico e submetacêntrico, além da presença cromossomos B em P. lineatus e em P. nigricans. A utilização de marcadores citogenéticos convencionais (Giemsa, NOR e Banda C) e citogenéticos- moleculares (FISH) com sondas de genes ribossômicos 5S e 18S confirmaram uma constituição cariotípica conservada apenas para o número e morfologia cromossômica nestas cinco espécies. A localização das Regiões Organizadoras de Nucléolo (NOR) foi evidenciada no braço longo do segundo par de cromossomo submetacêntrico em P. brevis, P. costatus, P. lineatus e P. nigricans. Em P. argenteus somente um cromossomo deste mesmo par foi marcado pela Prata, seu homólogo não exibiu marcações demonstrando inatividade... / The family Prochilodontidae shows morphological and meristic characters with an extraordinary degree of stability, which may be related to the great migrations accomplished for reproductive purposes, spreading over large areas. From the cytogenetic viewpoint, it presents a much conserved karyotypic constitution with 2n = 54 metacentric and submetacentric chromosomes with fundamental number equal to 108. Moreover, the presence of supernumerary microchromosomes in some species of the genus Prochilodus provided the basis for a range of cytogenetic studies. In light of the aforementioned, this study aimed to conduct a detailed investigation of the origin, inheritance, and structure of supernumerary chromosomes in Prochilodus. In this connection, we conducted cytogenetic studies involving a few specimens of this genus, bearers (Prochilodus lineatus and Prochilodus nigricans) and non-bearers of supernumerary (Prochilodus argenteus, Prochilodus brevis, and Prochilodus costatus). All subjects cytogenetically studied exhibited a diploid number of 54 metacentric and submetacentric chromosomes, besides revealing the presence B chromosomes in P. lineatus and P. nigricans. The use of conventional cytogenetic (Giemsa, NOR and C-Band) and molecular cytogenetic markers (FISH) with 5S and 18S ribosomal gene probes confirmed a conserved karyotypic constitution restricted only to the chromosome number and morphology in these five species. The location of Nucleolar Organizer Regions (NOR) was detected on the long arm of the second pair of a submetacentric chromosome in P. brevis, P. costatus, P. lineatus, and P. nigricans. In P. Argenteus, only one chromosome of that same pair was marked by silver staining, whereas its homologous did not show any markings, demonstrating inactivity in this region... (Complete abstract click electronic access below)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-12-05T12:10:51Z No. of bitstreams: 1 2016_ElizaFabriciodeMeloBellarddoNascimento.pdf: 1510859 bytes, checksum: f46e5594f50b95ae5eda3cd325437b0e (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-01-13T17:15:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_ElizaFabriciodeMeloBellarddoNascimento.pdf: 1510859 bytes, checksum: f46e5594f50b95ae5eda3cd325437b0e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-13T17:15:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_ElizaFabriciodeMeloBellarddoNascimento.pdf: 1510859 bytes, checksum: f46e5594f50b95ae5eda3cd325437b0e (MD5) / O amendoim (Arachis hypogaea L.) é uma espécie alotetraplóide recente com dois subgenomas oriundos da hibridação entre as espécies silvestres diplóides, A. duranensis (genoma A) e A. ipaënsis (genoma B), seguida por uma duplicação cromossômica espontânea (3.500 a 9.400 anos atrás). O genoma de A. hypogaea é estimado em 2,8 Gb e composto em sua maioria por sequências repetitivas. Com o objetivo de compreender alterações no genoma que se seguiram após a poliploidização dos cromossomos de A. hypogaea, um híbrido alotetraploide sintético (A. ipaënsis x A. duranensis)4x, e as espécies genitoras diploides foram citogeneticamente comparados. Os cariótipos dos alotetraploides partilham muitas semelhanças derivadas de seus genitores diploides: o número e a morfologia geral dos cromossomos; a intensidade e posição de bandas heterocromáticas DAPI+ em regiões centroméricas; número de sítios de DNAr 5S; e a distribuição geral de DNA repetitivo. No entanto, um dos sítios de DNAr 5S no alotetraploide sintético mudou de posição em relação aos seus genitores. Embora para A. hypogaea, os sítios de DNAr 45S foram equivalentes à soma do encontrado nas espécies diploides, no alotetraploide sintético dois sítios foram perdidos. De maneira geral, após GISH, os cromossomos de ambos os alotetraploides mostraram hibridização preferencial com seus genomas diploides correspondentes. No entanto, pelo menos um par de cromossomos do alotetraploide sintético apresentou padrões de hibridização em mosaico, como indicativos de recombinação entre os subgenomas. Este estudo fornece provas claras de que o genoma do alotetraploide sintético é mais instável do que o genoma de A. hypogaea. Fato considerado inesperado, já que derivam das mesmas espécies genitoras. Por alguma razão, a estrutura dos cromossomos de A. hypogaea é inerentemente mais estável, ou tem sido, pelo menos parcialmente estabilizado através de alterações genéticas e seleção. ________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Peanut (Arachis hypogaea L.) is a recent allotetraploid with two subgenomes derived from hybridization between the diploid wild species, A. duranensis (A genome) and A. ipaënsis (B genome), followed by spontaneous chromosomal duplication (3,500 to 9,400 years ago). The genome of A. hypogaea has a high repetitive content and estimated size of 2.8 Gb. With the aim of understanding genome changes that followed polyploidy, the chromosomes of A. hypogaea, an induced allotetraploid hybrid (A. ipaënsis x A. duranensis)4x, and the diploid progenitor species were cytogenetically compared. The karyotypes of the allotetraploids share many similarities derived from the progenitor diploids: the number and general morphology of chromosomes; the intensity and position of DAPI+ heterochromatic bands in centromeric regions; 5S rDNA loci number; and overall distribution of repetitive DNA. However, one of the 5S rDNA loci in the induced allotetraploid had changed position relative to its progenitors. Whilst for A. hypogaea, the 45S rDNA loci were equivalent to the sum of those present in the diploid species, in the induced allotetraploid, two loci have been lost. Generally, the chromosomes of both tetraploids showed preferential hybridization to their corresponding diploid genomes. However, at least one pair of chromosomes of the induced allotetraploid had mosaic hybridization patterns, indicative of recombination between subgenomes. This study provides clear evidence that the genome of the induced allotetraploid is more unstable than the genome of A. hypogaea. This could be considered unexpected because they derive from the same progenitor species. For some reason the chromosome structure of A. hypogaea is inherently more stable, or, it has been at least partially stabilized through genetic changes and selection. Key words: peanut; genome content; heterochromatic banding; rDNA; LTR-retrotransposons, GISH; FISH; chromosomes.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-02-07T16:08:01Z No. of bitstreams: 1 2016_EricaCarineCamposCaldasRosa_Parcial.pdf: 932018 bytes, checksum: 625ec7bdb4a4df4de8dbb895609240b0 (MD5) / Rejected by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br), reason: Boa noite, O corte do arquivo parcial não condiz com o especificado pelo autor. Atenciosamente. on 2017-03-20T21:53:27Z (GMT) / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-03-29T18:15:25Z No. of bitstreams: 1 2016_EricaCarineCamposCaldasRosa_Parcial.pdf: 1777588 bytes, checksum: 34f34df3e8651978bf884f3933e99911 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2017-04-12T19:56:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_EricaCarineCamposCaldasRosa_Parcial.pdf: 1777588 bytes, checksum: 34f34df3e8651978bf884f3933e99911 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-12T19:56:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_EricaCarineCamposCaldasRosa_Parcial.pdf: 1777588 bytes, checksum: 34f34df3e8651978bf884f3933e99911 (MD5) / Introdução: Os telômeros constituem seqüências repetitivas de DNA que protegem as extremidades dos cromossomos lineares mantêm a estabilidade genômica. Com o envelhecimento, observa-se seu encurtamento progressivo. Fatores adicionais podem acelerar o encurtamento dos telômeros, sobretudo aqueles relacionados a estresse oxidativo (EO) e resposta inflamatória. É possível, assim, que o comprimento dos telômeros represente potencial indicador de dano oxidativo e inflamatório e de senescência celular. O diabetes mellitus tipo 2 (DM2) associa-se a EO e resposta inflamatória e é possível que associe-se também a encurtamento dos telômeros. Este estudo investigou o comprimento de telômeros e marcadores de EO em diabéticos tipo 2, em Brasília, DF. Métodos: Foram determinados, no soro de diabéticos tipo 2 e de sujeitos com tolerância normal à glicose (controles), a concentração de TBARS (substâncias reativas ao ácido tiobarbitúrico) e a capacidade antioxidante total (FRAP). O comprimento relativo dos telômeros foi determinado por PCR quantitativa em tempo real, utilizando como normalizador o gene de cópia única 36B4. Resultados: Foram incluídos 165 sujeitos com DM2, com mediana de idade de 49 anos, predomínio do sexo feminino (75,8%), mediana do tempo de diagnóstico do DM2 de 2 anos, predominância de baixo nível de escolaridade e mediana do índice de massa corporal (IMC) de 30 kg/m2. Para avaliação de marcadores de EO, os diabéticos foram comparados a um grupo de 130 controles com mediana de idade de 46 anos, predominância do sexo masculino, maior nível de escolaridade e IMC mediano de 27 kg/m2. Os diabéticos tipo 2 apresentaram concentração sérica de TBARS significativamente maior que a dos controles e capacidade antioxidante total significativamente menor que a dos controles, independentemente do sexo ou IMC. Nos diabéticos tipo 2, a concentração sérica de TBARS foi correlacionada negativamente com a de colesterol LDL e a capacidade antioxidante total foi positivamente correlacionada como tempo de diagnóstico, hemoglobina glicada e concentração sérica de triglicerídeo. Para análise do comprimento relativo dos telômeros, os diabéticos foram comparados a 158 controles, com idade semelhante (mediana de 49 anos), predominância do sexo masculino, maior nível de escolaridade e mediana do IMC de 27 kg/m2. O comprimento relativo dos telômeros foi superior no grupo de diabéticos tipo 2 em relação ao controle, porém a diferença não mais foi observada após exclusão dos valores discrepantes (outliers). Não foi observada associação entre o comprimento relativo dos telômeros e o sexo ou estado nutricional, nos dois grupos, nem com retinopatia, entre os diabéticos. Nos diabéticos tipo 2, foi observada correlação negativa do comprimento relativo dos telômeros com o tempo de diagnóstico do DM2, glicemia de jejum, hemoglobina glicada e capacidade antioxidante total, e positiva com a concentração sérica de TBARS. Nos controles, foi observada correlação negativa do comprimento relativo dos telômeros com a idade. Conclusão: Os resultados do presente estudo sugerem que o DM2 está associado a aumento de marcador sérico de peroxidação lipídica e redução da capacidade antioxidante total no soro, porém não a encurtamento dos telômeros. O comprimento dos telômeros, no entanto, parece estar relacionado a indicadores metabólicos desfavoráveis no diabético tipo 2, incluindo glicemia de jejum e hemoglobina glicada. / Introduction: Telomeres are repetitive sequences of DNA that protect the ends of linear chromosomes and maintain genomic stability. They gradually shorten with aging, but additional factors may accelerate telomere shortening, especially those related to oxidative stress (OS) and the inflammatory response. It is possible, therefore, that telomere length may represent a potential indicator of oxidative and inflammatory damage. Type 2 diabetes (T2D) is associated with OS and inflammatory response and can also lead to telomere shortening. This study investigated the telomere length and OS markers in type 2 diabetics, in Brasilia, DF. Methods: Serum concentration of TBARS (thiobarbituric acid reactive substances) and total antioxidant capacity (FRAP) were measured in patients with T2D and control subjects with normal glucose tolerance. Relative telomere length was determined by quantitative real-time PCR using as the normalizer the single copy gene 36B4. Results: 165 subjects with T2D were included, with a median age of 49 years, female predominance (75.8%), median time of diagnosis of DM2 of 2 years, a high frequency of low educational attainment and median index body mass index (BMI) of 30 kg/m2. Serum levels of OS markers in T2D patients were compared to those of 130 controls with a median age of 46 years, who were predominantly male, had a higher level of education and a median BMI of 27 kg/m2. Serum levels of TBARS were significantly higher and total antioxidant capacity was significantly lower in T2D patients compared with controls, regardless of gender or BMI. In T2D patients, serum levels of TBARS were negatively correlated with serum LDL cholesterol levels; total antioxidant capacity was positively correlated to time since T2D diagnosis, glycated hemoglobin and serum triglyceride levels. Relative telomere length in T2D patients was compared to that of 158 age-matched controls (median age of 49 years), but who were predominantly male, had higher education level and a median BMI of 27 kg/m2. Relative telomere length was higher in T2D patients compared with controls, but this difference was not observed after exclusion of outliers. No association was found between relative telomere length and gender or nutritional status defined by BMI, either in T2D patients or controls. In T2D patients, relative telomere length was no associated with the presence of retinopathy. In these patients, relative telomere length was negatively correlated with time since diagnosis of T2D, fasting blood glucose, glycated hemoglobin and total antioxidant capacity. On the other hand, it was positively correlated with serum levels of TBARS. Among controls, relative telomere length was negatively correlated with age. Conclusion: The results suggest that T2D is associated with increased OS but not with telomere shortening. Reduced retive telomere length, however, seemed to be related to an unfavorable metabolic profile in T2D patients, including increased fasting blood glucose and glycated hemoglobin.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2015. / Submitted by Guimaraes Jacqueline (jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2015-11-10T13:11:44Z No. of bitstreams: 1 2015_DianaLuizaMarinhoBrandao.pdf: 1818626 bytes, checksum: 34f2db9e79fbe1b4b2ec42060d0e3cc5 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2015-11-13T11:57:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_DianaLuizaMarinhoBrandao.pdf: 1818626 bytes, checksum: 34f2db9e79fbe1b4b2ec42060d0e3cc5 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-13T11:57:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_DianaLuizaMarinhoBrandao.pdf: 1818626 bytes, checksum: 34f2db9e79fbe1b4b2ec42060d0e3cc5 (MD5) / A inativação do cromossomo X é um fenômeno biológico que ocorre exclusivamente em fêmeas durante os primeiros estágios embrionários de células de mamíferos. Esse fenômeno é consequência da compensação de dosagem dos produtos gênicos entre os sexos: masculino e feminino. Mulheres portadoras de mutações patogênicas presentes no cromossomo X podem apresentar o padrão desviado de inativação do cromossomo X, que ocorre quando preferencialmente o cromossomo de mesma origem parental é inativado em ao menos 95% das células, favorecendo assim o alelo normal. Exemplo de mutações que podem alterar o padrão de inativação são genes situados no cromossomo X que estão correlacionados com a deficiência intelectual (DI). Neste projeto propôs-se determinar o perfil de inativação do cromossomo X em amostra de população brasileira que não apresentava histórico familiar para deficiência intelectual ligada ao X. A amostra foi constituída por 102 mulheres brasileiras, alfabetizadas. A maioria das mulheres participantes era nascida na Região Nordeste e Centro-Oeste e apresentou idade média de 46 anos. Os critérios de inclusão utilizados para a participação de todas as mulheres foram: idade mínima de 35 anos, ter tido pelo menos um filho biológico e não apresentar histórico familiar para deficiência intelectual ligada X. A análise do padrão diferencial de metilação do cromossomo X, utilizada para identificar a razão de inativação, revelou que quatro mulheres tinham desvio total de inativação do cromossomo X. As quatro amostras com padrão desviado passaram pela análise de cariótipo, que se revelou normal para todos os casos, e pela técnica de análise cromossômica por microarranjos, que não identificou nenhum microrrearanjo patológico nas quatro amostras. Contudo, ao buscar associação entre informações obtidas durante as entrevistas com as participantes e o padrão desviado de inativação do X, observou-se que três das quatro mulheres apresentavam também histórico familiar para câncer. Esse tipo de achado, previamente observado em tumores, pode servir de subsídios para que novas pesquisas busquem identificar quais os tipos de associação entre o fenômeno aqui estudado e a incidência de casos de câncer. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The chromosome X inactivation is a biological phenomenon, which occurs solely in cells of female mammals during their first embrionary stages. This phenomenon is consequence of the gene expression balancing of male and female gene. Women who have pathogenic mutations in the chromosome X can exhibit a skewed pattern of inactivation, which take place mainly when the chromosomes of the same parental origin is silenced in at least 95% of the body cells. Pathogenic mutations in genes located in the chromosome X has proved to play a pivotal role on the creating intellectual disabilities(ID), which are more frequently found in men rather than women. In this thesis we aim to establish the profile of inactivation of the chromosome X from a sample of the Brazilian population with no reported family background of X-linked mental impairment. The sample was compound by 102 Brazilian women. They were all literate and had severous occupations. Most of participants were born in Northeastern and Central-Western parts of Brazil, and showed average age of 46 years old. The criteria used for the selection of the sample was: woman, above 35 years old, having had at least one biological health male child; and who had any family record of X-linked mental impairment. The study of the differential partner of methylation in the chromosome X, intended to identify the inactivation ratio, unveiled that four women had skewed X-inactivation. All four divergent samples undergone karyotype analysis (normal for all cases) and microarray. No pathological micro-rearrangement was found. However, looking for association between information accessed by interview and skewed X-chromossome it was observed that three of the four women had family background of cancer. Findings such as this, previously reported in tumors, provides a basis for further researches to establish correlations between the phenomenon described herein and the incidence of certain types of cancer.

Orientador: Diogo Cavalcanti Cabral de Mello / Banca: Ana Paula de Moraes / Banca: Clarisse Palma da Silva / Resumo: DNAs satélites (DNAsat) são sequências usualmente repetidas centenas a milhares de vezes arranjadas consecutivamente uma à outra, enriquecidas geralmente na heterocromatina em regiões específicas ou cromossomos, tais como os cromossomos B. Neste trabalho, isolamos o primeiro DNAsat no gafanhoto Abracris flavolineata, nomeado AflaSAT-1. A sequência foi caracterizada integrando abordagem molecular, genômica e citogenética objetivando compreender a organização estrutural, evolução nos cromossomos A e B e possível atividade transcricional. O AflaSAT-1 é compartilhado entre espécies de gafanhotos, mas revelou uma evidente amplificação em A. flavolineata formando arranjos detectáveis. A sequência apresentou baixa variabilidade em nível interpopulacional; no entanto monômeros do cromossomo B (µB-DNA) da população de Rio Claro/SP exibiram maior variabilidade e quatro mutações exclusivas, refletindo a comum taxa mutacional mais elevada dos cromossomos B. A análise genômica estrutural revelou organizações distintas para o DNAsat, apresentando uma associação alternativa com outro DNAsat, nomeado AflaSAT-2. A análise cromossômica revelou que ambos os DNAsat estão interligados um ao outro formando grandes blocos nos centrômeros de quase todos os cromossomos (exceto para o menor par), e para o cromossomo B apenas um pequeno sinal centromérico foi notado em indivíduos da população de Rio Claro/SP. Nas distintas populações a distribuição cromossômica do AflaSAT-1 revelou variabilidade, como ausência de algumas marcas, blocos adicionais e também heteromorfismo, a qual se correlacionou com a estimativa de número de cópias, sugerindo uma dinâmica de expansão ou eliminação de repetições. Finalmente, a constitutiva atividade transcricional de AflaSAT-1 foi observada nos distintos tecidos de adultos, e em distintas fases de desenvolvimento, tanto em indivíduos portadores e não portadores de cromossomo B / Abstract: Satellite DNAs (satDNA) are sequences usually repeated hundred to thousand times tandemly arrayed, enriched in heterochromatin from specific region or chromosomes, including B chromosomes. Here, we isolated the first satDNA in the grasshopper Abracris flavolineata, named AflaSAT-1. The sequence was characterized by integration of cytogenetic, molecular and genomics approaches, aiming to understand the structural organization, evolution in A and B chromosomes and possible transcriptional activity. The AflaSAT-1 is shared with other grasshopper species, but it was evidently amplified in A. flavolineata forming detectable clustered arrays. AflaSAT-1 presented low variability at interpopulational level; but monomers from B chromosome observed in individuals from Rio Claro/SP were more variable presenting four exclusive mutations, reflecting the common higher mutational rate in this chromosome. Genomic structural analysis revealed distinct organization for the satDNA, with its alternative association with other satDNA, named AflaSAT-2. The chromosomal analysis showed that both satDNAs were also interglimed to each other, forming large blocks in centromeres of almost all chromosomes (except the smallest pair), but in the B chromosome only a small centromeric signal was noticed in individuals from Rio Claro/SP. Chromosomal distribution for AflaSAT-1 revealed variability, at populational level, with absence of marks, additional clusters and heteromorphism. This variation was coincidentally followed by variability in copy number, suggesting dynamic expansion or elimination of repeats. Finally, AflaSAT-1 was constitutively transcriptionally active in five tissues of adults, in distinct life cycle phases, and both in carrier and non-B chromosome carriers / Mestre