Orientador: Carlos Roberto Padovani / Resumo: Em muitas situações, existe a necessidade de estudar o comportamento de alguma característica em uma mesma unidade amostral ao longo do tempo, dose acumulada de algum nutriente ou medicamento. Na prática, a estrutura dos dados dessa natureza geralmente estabelece comportamentos não lineares nos parâmetros de interesse, já que estes caracterizam melhor a realidade biológica pesquisada. Essa conjuntura é propícia ao estudo de remodelação cardíaca (RC) por sobrecarga pressórica em ratos submetidos a diferentes manobras sequenciais de cálcio. Como o comportamento da RC não está claramente estabelecido, o objetivo deste trabalho consiste em fazer um estudo comparativo sobre a performance de quatro modelos de curvas de crescimento em quatro grupos experimentais, considerando erros normais $\theta$ generalizado multivariado. Além disso, a modelagem dos dados envolve duas estruturas de covariância: a homocedástica com a presença de autocorrelação lag 1 e a heterocedástica multiplicativa. No contexto metodológico, utiliza-se o procedimento de estimação por máxima verossimilhança com a aplicação da técnica de reamostragem bootstrap. Além disso, técnicas de simulações são implementadas para comprovação das propriedades metodológicas aplicadas. Para comparação entre os modelos, utilizam-se alguns avaliadores de qualidade de ajuste. Conclui-se, no presente estudo, que a estrutura homocedástica com autocorrelação lag 1 para os modelos Brody e de Von Bertalanffy, destacam-se por apresentar ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Many situations, there is a need to study the behavior of some characteristic in the same sample unit over time, accumulated dose of some nutrient or medication. In practice, the structure of data of this nature generally establishes non-linear behaviors in the parameters of interest, since these characterize better the biological reality researched. This situation is favorable to the study of cardiac remodeling (CR) by pressure overload in rats submitted to different sequential calcium maneuvers. As the behavior of CR is not clearly established, the objective of this work is to perform a comparative study on the performance of four models of growth curves in four experimental groups, considering normalized multivariate θ standard errors. In addition, the data modeling involves two covariance structures: the homocedastic with the presence of autocorrelation lag 1 and the multiplicative heterocedastic. In the methodological context, the procedure of estimation by maximum likelihood is used with the technique of bootstrap resampling. In addition, simulation techniques are implemented to prove the methodological properties applied. For the comparison between the models, some adjustment quality evaluators are used. It is concluded in the present study that the homocedastic structure with lag 1 autocorrelation for the Brody and Von Bertalanffy models stands out for presenting excellent estimates and good quality of adjustment of the maximum developed stress (TD) as a function of t... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-13T12:35:18Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 282077 bytes, checksum: 07f64cbb3c928a371466373200ba572e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-13T12:35:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 282077 bytes, checksum: 07f64cbb3c928a371466373200ba572e (MD5) Previous issue date: 2003-01-31 / Secretaria de Educação do Distrito Federal / Avaliou-se o crescimento de Klebsiella pneumoniae estirpe P15 em caldo nutriente adicionado de diferentes fontes de carbono, em dieta enteral comercial nas condições geralmente adotadas durante a estocagem e administração e em dietas com o pH modificado ou adicionadas de prebióticos e nisina + EDTA. Verificou-se que, a adição de adonitol, amido, dulcitol e xilitol ao caldo nutriente, reduziu o crescimento bacteriano em relação ao controle após 11 horas de incubação a 37 0 C. Fontes de carbono como glicose, maltodextrina, maltodextrina mais triglicerídeos de cadeia media e sacarose estimularam o crescimento de K. pneumoniae. A 25 oC foi verificado o crescimento da bactéria nas dietas enterais com pH variando de 4,9 a 7,9 resultando em uma população de 10 7 a 10 9 UFC mL -1 , em 26 horas de incubação o que correspondeu a um aumento de três a cinco ciclos logaritmos na base 10 no número de células. O tempo de geração de K. pneumoniae em dieta enteral a 25 oC, variou de 44,2 a 95,9 minutos com velocidades específicas de crescimento de 0,433 h -1 a 0,941 h -1 . A 15 e 20 oC o crescimento de K. pneumoniae em valores de pH 5,9 a 7,9 também resultou em um aumento de três a cinco ciclos logaritmos na população. O ajuste do pH da dieta para 4,9 resultou em um crescimento menor do que um ciclo logaritmo. Não foi observado o crescimento de K. pneumoniae em dietas com pH 3,9. A 15 e 20 oC constatou-se a redução substancial dos parâmetros cinéticos de crescimento bacteriano avaliados com valores de tempo de geração entre 98,83 e 419,24 minutos e velocidade específica de crescimento entre 0,099 h -1 e 0,420 h -1 . O efeito estimulador do frutooligossacarídeo e de inulina no crescimento de K. pneumoniae, observado em caldo nutriente, não foi constatado quando estes prebióticos foram adicionados em dietas enterais com o pH ajustado para 5,0 e 5,5. A adição de 3,0 mg L -1 do antimicrobiano nisina juntamente com o agente quelante EDTA não promoveu a inibição do crescimento de K. pneumoniae. A baixa concentração de nisina adicionada e provavelmente, a abundância de minerais encontrada na composição de dietas enterais, pode ter contribuído para a ineficácia da nisina sobre a K. pneumoniae. A presença de cápsula foi verificada em células de K. pneumoniae cultivadas em caldo nutriente adicionado de glicose, maltodextrina, maltodextrina + TCM e sacarose e em dietas enterais com pH ajustado entre 3,9 e 6,9. A presença de cápsula não foi observada nas células de K. pneumoniae cultivadas em caldo nutriente adicionado de fontes de carbono como adonitol, amido, dulcitol, xilitol e em dietas incorporadas de frutooligossacarídeo, inulina ou nisina + EDTA em pH 5,0. A acidez titulável expressa em ácido lático da dieta comercial variou, inicialmente, entre 0,94 a 1,22% e após o crescimento de K. pneumoniae foram encontrados valores de 0,80 % após a incubação por 48 horas a 15 oC, 0,76 % a 20 oC e 0,66 % a 25 oC. / Growth of Klebsiella pneumoniae strain P15 in nutrient broth supplemented with different carbon sources, in commercial enteral formula under typical storage and administration conditions and in formula with modified pH or supplemented with prebiotics or nisin A + EDTA was evaluated. Addition of adonitol, starch, dulcitol and xylitol to nutrient broth reduced bacterial growth in relation to the control after 11 hours incubation at 37 o C. Carbon sources such as glucose, maltodextrin, maltodextrin + medium chain triglycerides and sucrose stimulated growth of K. pneumoniae and resulted in populations of greater cellular mass. At 25 o C, bacterial growth was found in formula at pH of 4.9 to 7.9, and reached 10 7 to 10 9 CFU mL -1 after 26 hours incubation, corresponding to an increase of three to five log cycles. Generation time of K. pneumoniae in enteral formula at 25 o C varied from 44.2 to 95.9 minutes, resulting in specific growth rates of 0.433 to 0.941 h -1 . At 15 and 20 o C and pH 5.9 to 7.9, growth of K. pneumoniae also increased three to five log cycles. Adjusting the formula pH to 4.9 resulted in less than one log cycle of growth. No K. pneumoniae growth was observed in formula at pH 3.9. At 15 and 20 o C, a substantial reduction in the bacterial kinetic growth parameters evaluated was observed, with generation times varying from 98.83 to 419.24 minutes and specific growth rates from 0.099 to 0.420 h -1 . The stimulating effect of fructo-oligosaccharides and inulin on K. xipneumoniae growth that was observed in nutrient broth was not found when these prebiotics were added to the enteral formula at pH 5.0-5.5. Addition of 3.0 mg L -1 of the antimicrobial agent nisin together with the chelant EDTA did not inhibit growth of K. pneumoniae. The low nisin concentration and, probably, the abundance of minerals in the enteral formula may have affected EDTA’s chelating action, and thus interfered with nisin’s action. Capsules were present when K. pneumoniae cells were cultivated at pH 3.9 to 6.9 in nutrient broth supplemented with glucose, maltodextrin, maltodextrin + medium chain triglycerides and sucrose. Capsules were not observed when K. pneumoniae cells were cultivated at pH 5.0 in nutrient broth supplemented with adonitol, starch, dulcitol and xylitol or in enteral formula supplemented with fructo-oligosaccharide, inulin or nisin + EDTA. Titratable acidity in commercial enteral formula initially varied between 0.94 and 1.22 %, expressed as equivalent lactic acid. Upon growth of K. pneumoniae, 0.80 % acidity was found at 15 o C, 0.76 % at 20 o C and 0.66 % at 25 o C, after 48 hours of incubation.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:22Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-07-18Bitstream added on 2014-06-13T20:57:57Z : No. of bitstreams: 1 perez_hl_me_jabo.pdf: 253936 bytes, checksum: b4207e189c180a854872829f47586958 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A demanda por produtos de origem animal, tem aumentado, paralelamente a este crescimento, observam-se esforços para promover melhorias na produtividade de carne dos rebanhos ovinos. Com o objetivo de estudar o desempenho produtivo e reprodutivo de cruzas de ovinos lanados, foram utilizados os dados da escrituração zootécnica do rebanho, pertencente ao Setor de Ovinocultura do Departamento de Zootecnia da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV/Unesp), Jaboticabal, SP. Os dados da escrituração foram oriundos de 312 ovelhas, sendo 129 da raça Ideal, 44 1/2 Ile de France 1/2 Ideal, 98 3/4 Ile de France 1/4 Ideal e 41 7/8 Ile de France 1/8 Ideal, submetidas ao cruzamento absorvente para a raça Ile de France. As ovelhas foram mantidas em sistema de criação semi-extensivo, levadas ao pasto pela manhã e recolhidas ao aprisco no final da tarde. A estação de monta aconteceu nos meses de novembro a janeiro. Após o nascimento, as crias eram pesadas e marcadas com número de identificação e as informações registradas em fichas individuais, que posteriormente foram transcritas para planilhas do Microsoft ExcelÒ. As análises das características produtivas: peso ao nascer (PN), peso ao desmame (PD), peso aos 180 dias (P180), ganho médio diário (GMD) e tempo para o animal atingir 32 kg de peso corporal (D32), foram realizadas no SAS, (1996) baseadas no método dos quadrados mínimos, utlizando o procedimento GLM e o teste Tukey para comparação das médias. Para as curvas de crescimento foi utilizado o modelo não-linear Von Bertalanffy, sendo o ajuste realizado pelo procedimento NLIN, utilizandose o método de DUD. Para as características reprodutivas foram utilizados o procedimento GLM e o teste Tukey, basedo no método dos quadrados mínimos para idade ao primeiro parto (IPP) e o teste de qui-quadrado para fertilidade, taxa de desmame, e prolificidade... / The demand for products originated from animals, mainly meat, has been increasing and it is clear that efforts are being made to improve the productivity in ovine cattle. Aiming to study productive and reproductive performance of crossbred sheep, data from the sheep recording of the ovine cattle from Paulista State University, FCAV/Unesp, Jaboticabal, SP, Brazil were used. The record data came from 312 sheep (129 of Polwarth breed, 44 1/2 Ile de France 1/2 Polwarth, 98 3/4 Ile de France 1/4 Polwarth e 41 7/8 Ile de France 1/8 Polwarth) submitted to absorber crossbreeding for Ile de France. The sheep were kept in semi-extensive raising system; they were taken to the field in the morning and returned to the shelter late in the afternoon. The breeding season happened from November until January. After birth, the sheep were weighted and marked with the identification number and the information registered in individual forms that were later transcripted to Microsoft ExcelÒ. Productive characteristic analysis: body weight at birth (BWB), body weight at weaning (BWW), body weight with 180 days (BW180), daily weight gain average (DWGA) and necessary period for animals to get 32 kg of body weight (BW32) were carried out at SAS statistical analysis (1996), based on the Chi-square method, using the GLM procedure and the Tukey test for average comparisons. The non linear model of Van Bertalanffy was used to analyse growth pattern and the adjustment was accomplished by the NLIN procedure using the DUD method. It was used the GLM procedure for the reproductive characteristics, the Tukey test to analyse age at the first birth (AFB) and the Chi-square test to analyse fertility, weaning rate and prolificacy. None significant alterations were observed for the following productive characteristics, BWB, BWW, and BW32 (p>0.05), with composition genetic averages... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseJMOC.pdf: 835254 bytes, checksum: 1012374c638f55703b16fb6586e89202 (MD5) Previous issue date: 2000-02-28 / Financiadora de Estudos e Projetos / Experiments with snook cultivation, Centropomus parallelus, aiming at increasing the continental pisciculture, mainly in northeast Brazil, were carried out in two stages. The first one was carried out at the laboratory of the Federal University of Paraíba, aiming to determine the optimum diet for increasing snook weight, in a 3 X 3 factorial treatment using feeds containing 35, 40, and 45% of crude protein and 3000, 3100, and 3200 kcal energy. The nine diets used here were prepared from ingredients obtained in the localities of the present study. They were added to 45 aquaria (50 L capacity each) with alevins obtained from spawning performed at a laboratory of the federal University of Santa Catarina, southern region of Brazil, presenting an initial average weight of 1.70g and stocked in a density ca 20 fish/m2, during a period of nine weeks. The best performance concerning the snook protein requirement was obtained by using 45% crude protein diet and with intermediary energy levels of 3100 kcal. On the second stage, fieldworks were performed in the municipalities of São Bento and Bananeiras, located in the mesoregion of sertão (microregion of Catolé do Rocha ) and mesoregion of agreste (microregion of Brejo ) in Paraíba State, respectively, where development of snooks obtained from spawning and fed with the best feed determined on the first stage, was estimated. The same management procedures were utilized in both localities. In São Bento, two aquaria (270m2 each) belonging to the fish farming Fazenda PROSAL Aquacultura S/A were utilized, from 26th May/1998 to 26th May/1999. In Bananeiras, two tanks (100m2 each) belonging to the Pisciculture Station of IBAMA (Insitute for the Environment and Natural Resources) were utilized, from 11th June/1998 to 11th June/1999. Both places were selected because they have the greatest number of pisicultures in Paraíba State. High fluctuations of limnological variables, mainly nutrients (ammonium, nitrite, and nitrate) occurred during the experiments acting upon snook, which showed to be a rough species. A positive and significant correlation (p (< ou =) 0.05) was obtained between zooplancton belonging to Other Organisms group (ostracods, chironomids, oligochaetes, insects larvae, etc) and the Weight Increase Rate. However, among the natural food occurring in the cultivation ponds (in São Bento) cladocerans were the snook favourite food, whereas in the tanks (in Bananeiras) Other Organisms group was its favourite food. Through the best adjusted values index (r2) obtained from several growth mathematical equations used here, the polynomial model showed to be noteworthy, despite significant differences between the snook groups development from the aquaria and from the tanks was not obtained. / Com objetivo de incrementar a piscicultura continental e principalmente a da Região Nordeste do Brasil, foram conduzidos experimentos com o cultivo do camurim Centropomus parallelus em duas etapas. A primeira, realizada em laboratório, nas instalações da Universidade Federal da Paraíba, teve como objetivo identificar uma dieta que apresentasse melhor performance no ganho de peso, utilizando um esquema fatorial 3 x 3, entre rações com níveis de 35, 40 e 45% de proteína bruta (PB) e 3000, 3100 e 3200 kcal de energia. As nove dietas foram compostas por ingredientes normalmente adquiridos na região e ofertadas em um sistema de 45 aquários (50 L cada) com alevinos provenientes de desova efetuada em laboratório da Universidade Federal de Santa Catarina, apresentando peso médio inicial de 1,70g e estocados numa densidade de aproximadamente de 20 peixes/m2 , por um período de nove semanas. A melhor performance quanto à exigência dos camurins foi com teor protéico de 45% PB, e com níveis intermediários de energia de 3100 kcal. A segunda etapa realizada em campo, nas localidades de São Bento e Bananeiras, municípios situados respectivamente nas mesorregiões do sertão (microrregião de Catolé do Rocha) e do agreste (microrregião do brejo) paraibanos, onde se avaliou o desenvolvimento do camurim obtido através de desova e alimentado com a ração que apresentou melhor performance na primeira etapa. Os procedimentos empregados no manejo foram os mesmos em ambas as localidades. Em São Bento, durante o período de 26 de maio de 1998 a 26 de maio de 1999utilizaram-se dois viveiros, cada um com área de 270 m2, localizados na Fazenda PROSAL Aquacultura S/A. Em Bananeiras, durante o período de 11 de junho de 1998 a 11 de junho de 1999 utilizaram-se dois tanques, cada um com área de 100m2 , pertencentes á Estação de Piscicultura do IBAMA ( Instituto Brasileiro do Meio ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis). Ambas as áreas foram selecionadas por serem aquelas com maior numero de piscicultura no Estado. Durante a experimentação, as variáveis limnológicas avaliadas impuseram altas flutuações, principalmente quanto aos nutrientes (amônio, nitrito e nitrato), oportunidade em que o camurim demonstrou sua grande rusticidade. Obteve-se correlação significativa (p (< ou =) 0,05) entre o zooplâncton pertencente ao grupo dos Outros organismos (Ostracoda, Chironomidae, Oligochaeta, Larvas de insetos, etc.) e a Taxa de Incremento de Peso. Entretanto, dentre os alimentos na turais presentes nos ambientes de cultivo, houve preferência nos viveiros (em São Bento) pelo grupo dos Cladocera, e nos tanques (em Bananeiras) pelo grupo dos Outros organismos . Através do melhor índice de ajuste (r2) obtido entre as diversas equações matemáticas de crescimento, destacou-se o modelo polinomial, que, no entanto, não configurou diferenças significativas no desenvolvimento do camurim entre os grupos viveiros e tanques.

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós-Graduação em Engenharia e Ciência de Alimentos, Escola de Química e Alimentos, 2008. / Submitted by Caroline Silva (krol_bilhar@hotmail.com) on 2012-09-17T00:08:20Z No. of bitstreams: 1 tese mestrado liane.pdf: 1042970 bytes, checksum: bb0c0bb945531f1ebe8e3aca39dd22de (MD5) / Approved for entry into archive by Bruna Vieira(bruninha_vieira@ibest.com.br) on 2012-09-20T18:27:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 tese mestrado liane.pdf: 1042970 bytes, checksum: bb0c0bb945531f1ebe8e3aca39dd22de (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-20T18:27:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese mestrado liane.pdf: 1042970 bytes, checksum: bb0c0bb945531f1ebe8e3aca39dd22de (MD5) Previous issue date: 2008 / Durante a produção, armazenamento, transporte e embalagem de produtos alimentícios, a presença de microrganismos é inevitável. A carne de frango, especialmente, é um alimento altamente perecível e, juntamente com outros tipos de carnes provenientes de ave, apresenta grande variedade de bactérias patogênicas e deteriorantes quando comparada com outros alimentos. Assim, a avaliação do crescimento microbiano e o controle da temperatura de armazenamento são importantes para garantir a segurança e vida útil dos alimentos. O trabalho objetivou caracterizar microbianamente três peitos de frango (cru, temperado com NaCl e cozido), produzidos no Brasil e exportados para a Europa, bem como, estimar a vida útil de tais produtos após o descongelamento, quando armazenados em diferentes condições de temperatura. Foi simulada a cadeia de abastecimento dos peitos de frango congelados, durante 20 dias a -18 ± 0,5 C para simulação do transporte destes produtos por navio até a Europa, desde sua expedição no Brasil e, após descongelamento, durante 21 dias a 4 ± 0,5 C para simulação da vida útil em gôndola de supermercado. Os produtos foram analisados quanto a Pseudomonas spp., Salmonella spp., Listeria monocytogenes, Staphylococcus spp. e microrganismos viáveis totais (mesófilos e psicrotróficos). Em termos de contagens de número de colônias viáveis totais, durante os primeiros 20 dias (a -18°C), a presença de microrganismos se manteve estável em baixos níveis de detecção. Após o descongelamento foram observadas as curvas de crescimento dos microrganismos, onde as fases lag ocorreram durante os primeiros 6 dias. A máxima concentração microbiana foi atingida após 15-18 dias, dependendo do produto. Em nenhuma das amostras foi detectada a presença de Salmonella spp. e Listeria monocytogenes. Após este estudo inicial foi avaliado o tempo de vida útil dos três produtos em diferentes condições de temperatura de armazenamento (2, 4, 7, 10, 15 e 20ºC). O estudo foi baseado na determinação de microrganismos aeróbios psicrotróficos, Pseudomonas spp., aeróbios mesófilos e Staphylococcus spp. O aumento da temperatura fez reduzir a vida útil dos três produtos estudados, em relação a todos os microrganismos. De modo geral, os produtos apresentaram faixas de vida útil de 10 até mais de 26 dias, a 2ºC; de 9 até mais de 21 dias, a 4ºC; de 6 até 12 dias, a 7ºC; de 4 até 8 dias, a 10ºC; de 2 até 4 dias, a 15ºC; e de 1 a 2 dias, a 20ºC. Quando armazenadas em temperaturas de refrigeração (2, 4 e 7°C), as amostras apresentaram pouca variação no tempo de vida útil, especialmente a 2 e 4°C. Já quando armazenadas à temperatura ambiente (temperaturas iguais ou superiores a 10ºC), a cada 5ºC de elevação na temperatura de armazenamento, a vida útil reduziu-se à metade do tempo. / During production, storage, transport and packaging of food products, the presence of microorganisms is unavoidable. The chicken meat, especially, is a highly perishable food and, together with other types from poultry meat presents great variety of pathogenic bacteria and spoilage when compared with other foods. Like this, the evaluation of the microbial growth and the control of the storage temperature are important to guarantee the safety and shelf life of the foods. The work aimed to characterize microbially, three chicken breast (raw, tempered with NaCl and cooked), produced in Brazil and exported to Europe, as well as, to estimate the shelf life of such products after thawing, when stored in different temperature conditions. The supply chain of frozen chicken breast was simulated for 20 days at -18±0,5oC for simulation of the transport of these products by ship to Europe, from its expedition in Brazil and, after thawed, during 21 days at 4 ± 0,5oC for simulation of the supermarket shelf life. Pseudomonas spp., Salmonella spp., Listeria monocytogenes, Staphylococcus spp. and total viable microorganisms (mesophilic and psicrotrophic) were analyzed in the products. In terms of accountings of total viable colonies number, during the first 20 days (-18°C), the presence of microorganisms was stable at low levels of detection. After thawing the microorganism growth curves showed that the lag phases happened during the first 6 days. The highest microbial concentration was reached after 15-18 days, according to the product. In none of the samples the presence of Salmonella spp. and Listeria monocytogenes were detected. After this initial study it was evaluated the shelf life time of the three products in different conditions of storage temperature (2, 4, 7, 10, 15 and 20ºC). The study was based on the determination of aerobic psicrotrophic, Pseudomonas spp., aerobics mesophilic and Staphylococcus spp. The increase of temperature reduce the shelf life of the three studied products, in relation to all of the microorganisms. In general, the products presented shelf life ranges from 10 to more than 26 days, at 2ºC; from 9 to more than 21 days, at 4ºC; from 6 to 12 days, at 7ºC; from 4 to 8 days, at 10ºC; of 2 to 4 days, at 15ºC; and, from 1 to 2 days at 20ºC. When stored in refrigerating temperature (2, 4 and 7°C), the samples presented a few variation in the shelf life time, especially at 2 and 4°C. But when stored to room temperature (at 10ºC or higher temperature), to each 5ºC of elevation in the storage temperature, the shelf life was reduced to half time.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-05-16T14:49:47Z No. of bitstreams: 1 Rafael Marques do Nascimento.pdf: 1808210 bytes, checksum: da5eea3b80f893488b3bc6a6b6d6cff1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T14:49:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rafael Marques do Nascimento.pdf: 1808210 bytes, checksum: da5eea3b80f893488b3bc6a6b6d6cff1 (MD5) Previous issue date: 2015-07-30 / In experimental research usually it is need to extract derivatives from the obtained data for the study and characterization of the phenomenon in question. Such data contains random noise and / or statistical errors and usual techniques of numerical di erentiation, such as nite di erences, can amplify the noise. Keep the noise inherent to the data under control is essential to avoid misinterpretation of the phenomenon. In the present study we applied an alternative methodology to analyze sh growth curves. In this methodology the growth curve is approximated by a smooth function that is not associated with a growth model and therefore is independent of parameter estimation. The method is based on Tikhonov regularization process and consists in a simple and reliable procedure for calculating derivative from experimental data. The process is independent of the nature of the data and can handle points which are not evenly distributed. The method can be extended to derivatives of higher order and can also be used to smooth experimental data. We apply the method to the adjustment for growth curves of the three species of sh: curema Mugil, Thunnus obesus and Pseudupeneus maculatus, whose data were previously analyzed through growth models. We conclude that the methodology here employed approximates accurately the curves of the rst and second derivative and provides information on the instantaneous rate animal growth. / Em ensaios experimentais usualmente se faz necessário a extração de derivadas dos dados obtidos, para o estudo e caracterização do fenômeno em questão. Tais dados contém ruídos aleatórios e/ou erros estatísticos e técnicas usuais de diferenciação numérica, como diferenças nitas, podem amplificar o ruído. Manter o ruído inerente aos dados sob controle é imprescindível para não introduzir comportamentos espúrios nos dados. No presente estudo, aplicamos uma metodologia alternativa na análise das curvas de crescimento de peixes. Nesta metodologia, a curva de crescimento é aproximada por uma função suave que não está associada a um modelo de crescimento e, portanto, é independente de estimação de parâmetros. O método baseia-se no processo de regularização de Tikhonov e consiste em um procedimento simples e cofiável para se calcular derivadas de dados experimentais. O processo é independente da natureza dos dados e pode lidar com pontos de dados não uniformemente distribuídos. O método pode ser estendido para derivadas de ordem mais altas e também pode ser usado para suavizar dados experimentais. Aplicamos o método ao ajuste da curva de crescimento de três espécies de peixes: Mugil curema, Thunnus obesus e Pseudupeneus maculatus, cujos dados foram previamente analisados via modelos de crescimento. Concluímos que a metodologia empregada aproxima com precisão as curvas da primeira e segunda derivada e fornece informações sobre as taxas instantâneas de crescimento animal.

Essa pesquisa teve como objetivos avaliar o desempenho, perfil do crescimento, qualidade do ovo, composição corporal e características ósseas e reprodutivas de poedeiras alimentadas com diferentes programas nutricionais, no período de 1 dia até 72 semanas de idade. Foram utilizadas 1656 aves distribuídas em um delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial 3x2 com os fatores: Programas nutricionais (P1 - 95% das exigências nutricionais, P2 - 100% das exigências nutricionais e P3 - 105% das exigências nutricionais preconizadas pelo Manual Hy-Line) e variedades da linhagem Hy-Line (W36 e Brown), totalizando seis tratamentos com seis repetições de 46 aves cada. Para obter as curvas de crescimento utilizou-se a equação de Gompertz e modelo matemático multifásico. O programa P3 proporcionou melhor ganho de peso na fase de cria (0 - 6 semanas) e, similarmente os programas P2 e P3 na fase de recria (7 - 17 semanas). Em ambas as fases (cria e recria), o consumo de ração não foi influenciado pelos programas nutricionais. No entanto, as aves da variedade Brown apresentaram maior consumo de ração e maior ganho de peso em relação às aves da variedade W36. Verificou-se que durante a fase de produção, os programas nutricionais não afetaram a produção de ovos, peso dos ovos e conversão alimentar. Como esperado, as poedeiras Brown apresentaram maiores valores para as características consumo de ração e produção, peso e massa de ovos em relação às poedeiras W36. As características de qualidade interna dos ovos (porcentagens de gema e albúmen, unidade Haugh e índice gema), de qualidade externa dos ovos (porcentagem de casca, espessura de casca e densidade aparente do ovo), ósseas (resistência à quebra, concentrações de cálcio e fósforo e densitometria) e reprodutivas (peso e diâmetro dos folículos ovarianos e peso e comprimento dos segmentos do oviduto) não foram influenciadas pelos programas nutricionais, no período de 18 a 72 semanas de idade. As poedeiras W36 apresentaram maiores valores para o percentual de gema, resistência óssea à quebra e densitometria óssea. Por outro lado, as poedeiras Brown apresentaram maiores valores para o percentual de albúmen, espessura da casca, densidade aparente dos ovos, peso e comprimento do magno, útero e vagina. A taxa máxima de crescimento do peso vivo e dos nutrientes na carcaça (proteína, gordura, cinzas e água) ocorre em idades diferentes. No geral, a equação de Gompertz proporcionou melhor ajuste dos dados em relação ao modelo matemático multifásico. Conclui-se que o programa P3 é o mais indicado para a fase de cria e que o programa P2 atende as exigências nutricionais para as fases de recria e produção. As variedades W36 e Brown apresentam diferentes perfis de desempenho, crescimento, resistência óssea, reprodutivo e de qualidade dos ovos. / This study was carried out to evaluate the performance, growth profile, egg quality, body composition, and bone and reproductive characteristics of hens fed different nutritional programs from day-one to 72 weeks of age. 1656 birds were randomly assigned in a factorial scheme 3x2: nutritional programs (P1 - 95% of the requirements, P2 - 100% of the requirements, and P3 - 105% of the requirements according to Hy-Line Manual) and Hy-Line strains (W36 and Brown), resulting six treatments with six replicates of 46 birds each. To obtain the growth curves was used the equation of Gompertz and multiphase mathematical model. P3 program provided better weight gain in the starter phase (0 - 6 weeks) and, similarly, P2 and P3 programs for the grower phase (7 - 17 weeks). In both phases (starter and grower), feed intake was not influenced by the nutritional programs. However, the Brown pullets showed higher feed intake and weight gain than W36 pullets. It was verified, during the production phase, that egg production, egg weight, and feed conversion were not affected by the nutritional programs. As expected, the Brown hens showed higher values for feed intake, egg production, egg weight, and egg mass than W36 hens. Egg internal (yolk and albumen percentages, Haugh unit, and yolk index), egg external (shell percent, shell thickness, and egg specific gravity), bone (breaking force resistance, calcium and phosphorus concentrations, and bone densitometry), and reproductive characteristics (weight and length of follicles ovarian and of the oviduct segments) were not influenced by the nutritional programs, from 18 to 72 weeks of age. W36 hens showed higher values for yolk percent, bone breaking force resistance, and bone densitometry. On the other hand, Brown hens showed higher values for albumen percent, shell thickness, egg specific gravity, weight and length of magnum, uterus, and vagina. The maximum rates of body growth and nutrients of carcass (protein, fat, ash and water) occurs in different ages. In general, the equation of Gompertz provided better adjust of the data than multiphase mathematical model. It was concluded that the P3 program is indicated for starter phase and P2 program is able to support the nutritional requirements for grower and production phases. The varieties W36 and Brown show different performance, growth, bone strength, reproductive and egg quality profiles.

Nos últimos anos, em áreas de produção de culturas transgênicas resistentes ao glyphosate, falhas no controle do capim-pé-de-galinha (Eleusine indica) são cada vez mais frequentes, estando provavelmente relacionadas ao uso indiscriminado do glyphosate e ao consequente aumento da pressão de seleção de biótipos de plantas daninhas resistentes a esse herbicida. Este trabalho teve como objetivo comparar a suscetibilidade de quatro populações de capim-pé-de-galinha ao herbicida glyphosate em diferentes estádios de desenvolvimento, bem como estudar a eficácia de herbicidas alternativos ao glyphosate no controle de plantas desta espécie na pré e pós-emergência das mesmas. Também foi objetivo deste trabalho estudar aspectos da biologia, tais como: crescimento, número de sementes produzidas por uma planta e influência da escarificação mecânica sobre a germinação do capim-pé-de- galinha. Foi verificado que existem diferenças na suscetibilidade das populações ao glyphosate, no qual a população denominada EIR2 proveniente de Primavera do Leste - MT foi a que necessitou de maiores doses para ser controlada, sendo caracterizada como um caso de resistência de nível baixo, pois a dose máxima de bula recomendada para a espécie é capaz de controlar todas as populações do estudo. Os herbicidas mais indicados para o controle de capim-pé-de-galinha na pré-emergência foram o flumioxazin, sulfentrazone, clomazone e trifluralina, apresentando maiores níveis de controle e efeito residual mais prolongado. O controle do capim-pé-de-galinha na pós-emergência inicial (2 a 3 perfilhos) e no estádio intermediário (6 a 8 perfilhos) foi eficiente com todos os herbicidas testados. No estádio mais avançado (10 a 12 perfilhos) o herbicida sethoxydim não controlou nenhuma das populações, não sendo indicado para plantas com mais de 6 perfilhos. Foram identificadas diferenças significativas entre o controle das populações com os inibidores da ACCase, sendo necessários outros estudos para confirmação da resistência a esses herbicidas. O capim-pé-de-galinha apresentou de maneira geral elevado acúmulo de matéria seca total, sendo considerado altamente competitivo. Foram encontradas diferenças entre o crescimento das populações, não havendo relação com a suscetibilidade diferencial ao glyphosate existente entre as mesmas. O perfilhamento iniciou-se aos 28 dias após a emergência (DAE), com um pico de crescimento dos 42 aos 63 DAE quando as plantas atingiram o ápice do acúmulo foliar e matéria seca, entrando posteriormente na senescência. O florescimento iniciou-se entre 42 e 49 DAE e perdurou até os 63 DAE. Uma planta da espécie Eleusine indica produziu em média 45000 sementes e não foram encontradas diferenças significativas na produção de sementes entre as populações. A escarificação mecânica das sementes acelerou o processo de germinação e aumentou a germinação final das populações de capim-pé-de-galinha. O mecanismo que confere a dormência física das sementes de capim-pé-de-galinha está relacionado com a impermeabilidade do tegumento. / Lately, in the areas of production of transgenic crops resistant to glyphosate failures in control of goosegrass has been reported frequently, probably by an intense using of glyphosate and consequent increasing in selection pressure of weeds resistant to glyphosate. For this reason this work was carried out in order to compare the susceptibility of four goosegrass populations to glyphosate in different stages of development, as well as studying the effectiveness of alternative herbicides to glyphosate in the control of such species in pre and post-emergence. It was also a goal of this work study biological aspects, such as growth, weed number produced by a plant and influence of mechanical scarification on the germination of the goosegrass. It was found that there are differences in the susceptibility of populations to glyphosate, in which EIR2 population from Primavera do Leste - MT was the one that required higher doses to be controlled, being characterized as a case of low-level resistance because of the maximum recommended dose is able to control all the populations studied. Herbicides the most suitable to control pre-emergence were flumioxazin, sulfentrazone, clomazone and trifluralin, with high levels of control were used a longer residual effect. The control of goosegrass in the early post-emergence (2-3 tillers) and the intermediate stage (6-8 tillers) was efficient with all the tested herbicides. In the most advanced stage (10 to 12 tillers) the herbicide sethoxydim did not control any of populations, was not were used suitable for plants with more than 6 tillers. Remarkable differences were identified between the control of populations with ACCase inhibitors. Other studies are necessary to confirm the resistance to these herbicides. The goosegrass showed high accumulation of total dry matter, being considered highly competitive. Some differences were found among the growth of the populations, with no relation to the differential susceptibility to glyphosate existing between them. The tillering began at 28 days after emergence (DAE), with a growth between of 42 to 63 DAE when the plants reached the apex of the leaf and dry matter accumulation, later entering senescence. The flowering started between 42 and 49 DAE and lasted until 63 DAE. A plant of Eleusine indica produced on average 45 000 seeds and there were no important differences between seed production among populations. Mechanical scarification of seeds accelerated the germination and increased the final germination populations of goosegrass. The mechanism that confers the physical dormancy of goosegrass seeds is related to the impermeability of the integument.

Mycoplasma (M.) genitalium é um importante agente de doença sexualmente transmissível sendo, responsável por uma série de desordens do trato urogenital humano. A aderência do micoplasma é um dos principais fatores de virulência na sua patogenicidade e conseqüente colonização nas células hospedeiras. Neste estudo, obte-se a curva de crescimento de duas cepas de M. genitalium (G37 e 1019V) utilizando-se da dosagem proteíca (BCA), densidade óptica (OD600) e PCR em tempo real. A cepa referencial G37 é de alta passagem e foi isolada de homens e a 1019V é de baixa passagem, sendo recentemente isolada de amostra clínica de cérvix humana. Utilizando-se da fase logarítimica obtida pela curva, comparou-se a dinâmica de interação destas cepas na célula epitelial de carcinoma de cérvix humana (HeLa) e na célula endometrial humana (EM42), em diferentes intervalos de tempo com auxílio de microscopia confocal. Apesar destas cepas divergirem na seqüência dos genes relacionados a aderência houve poucas variações entre as curvas de crescimento. A aderência e a invasão de M. genitalium nas células não fagocíticas confirmou os dados de literatura. Entretanto, após 30 minutos de contato com as células, detectou-se o antígeno de aderência de ambas as cepas na região intranuclear Este achado, indica uma nova característica desta espécie ainda não conhecida entre os molicutes. / Mycoplasma genitalium (Mg) is an important cause of sexual transmitted disease and has been implicated in a range of genital tract disorders.The adherence of mycoplasmas is a key virulence attribute, pathogenic features and consequences of host-cell colonization. Herein, we characterize growth properties of two Mg strains (G37 and 1019V) using BCA assay, OD600, CCU assay, real-time PCR. Based upon these strategies, we compared the behavior of similarly grown Mg variants coincubated with HeLa cervical epithelioid cells and EM42 endometrial cells over a dynamic time course.using laser scanning confocal microscopy. Mg G37 is a multiply passaged type strain isolated from a male while 1019V was recently isolated from human cervical samples and only minimally passaged. Both strains further diverge by sequence heterogeneities within adherence-related MG191 and MG192 genes. Despite these differences, our results identified only subtle variations in axenic growth for the two strains. Further and consistent with previous studies, a subset of adherent Mg organisms invaded host cells. However, intranuclear localization was observed, which occurred as early as 30 minutes after infection.

O ferro é essencial para a sobrevivência das bactérias, estando envolvido em vários processos metabólicos. Apesar de sua baixa solubilidade, as bactérias dispõem de sistemas eficientes e específicos para captação, utilização e armazenamento desse metal, ao mesmo tempo controlando adequadamente a concentração de ferro livre no meio, para evitar seus potenciais efeitos tóxicos. Xylella fastidiosa é uma bactéria gram-negativa que coloniza o xilema de uma diversidade de plantas cultivadas e silvestres em várias partes do mundo, sendo o agente causador de uma série de doenças em plantas economicamente importantes como citros, videiras e café. Alguns mecanismos de virulência de X. fastidiosa já foram elencados, entre esses a formação de biofilme, que promoveria a oclusão do xilema e consequente estresse hídrico para a planta. Postula-se que a captação de ferro por X. fastidiosa, causando redução da concentração desse metal no xilema das plantas infectadas, seja uma das estratégias utilizadas pela bactéria em seu processo de infecção. Nosso objetivo neste trabalho foi de investigar o processo de captação de ferro por X. fastidiosa e avaliar em maior detalhe o efeito da concentração de ferro no crescimento e na expressão de fatores de virulência dessa bactéria, expandindo os estudos anteriormente realizados em nosso grupo. Para tal propusemos: (i) avaliar a capacidade de X. fastidiosa produzir sideróforos, pequenas moléculas quelantes de ferro; (ii) investigar, em condições de cultivo com diferentes concentrações de ferro, o perfil de expressão de alguns genes de X. fastidiosa que possam ser integrantes do stimulon do ferro; (iii) analisar o efeito da concentração de ferro no crescimento e formação de biofilme por X. fastidiosa. Observamos que X. fastidiosa parece produzir um composto quelante de ferro que pode ser um sideróforo e elencamos alguns genes que poderiam estar envolvidos na síntese desse composto. Confirmamos que ferro é necessário para o crescimento de X. fastidiosa, sendo que em alta concentração de ferro foi observada maior deposição de biofilme pela cultura bacteriana. Interessantemente também foi observado que as células crescidas em meio com pouco ferro secretaram mais exopolissacarídeos totais na fração do biofilme, o que estabelece uma relação entre as concentrações de ferro no meio com a expressão de um fator de virulência essencial para o desenvolvimento da infecção por X. fastidiosa. / Iron is an essential nutrient for bacteria, being involved in many metabolic processes. Despite its low solubility, bacteria present efficient and specific systems for uptake, utilization and storage of iron, meanwhile controlling metal concentration adequately to prevent potential toxic effects of free iron. Xylella fastidiosa is a Gram-negative bacterium which colonizes the xylem of a wide range of crops and wild species of plants worldwide. This bacterium is the agent of several diseases affecting economically important crops, such as citrus, grapevine and coffee. Among the proposed X. fastidiosa virulence mechanisms is the formation of biofilm which may occlude xylem vessels causing hydric stress. It is postulated that iron uptake might cause reduction of its concentration within the xylem of infected plants therefore constituting a virulence strategy during bacterial infection process. Our aims in this work were to investigate the process of iron uptake in X. fastidiosa and to evaluate the effect of iron concentration in the growth and morphology of this bacterium, expanding previous studies. For this we set to: (i) investigate the capacity of X. fastidiosa in producing siderophores, small biomolecules utilized for iron quelation; (ii) evaluate, under culture conditions at different iron concentrations, the expression profile of candidate genes that might be part of the iron stimulon; (iii) analyse the effect of iron concentration in growth and biofilm formation of X. fastidiosa. We observed that X. fastidiosa seems to produce a compound with iron quelating ability, such as a siderophore, and we point to a group of genes that might be involved in the synthesis of this compound. We confirmed that iron is necessary for growth of X. fastidiosa. At high concentrations of iron we observed higher biofilm production. Interestingly, we also observed that when grown in low iron concentration, X. fastidiosa secretes more exopolysaccharides (EPS) associated with the biofilm, suggesting a link between iron concentration and expression of an essential virulence factor to the infection process of X. fastidiosa.