Recentemente, tem sido constatadas falhas no controle da planta daninha capim-branco (Chloris polydactyla) pelo herbicida glyphosate em áreas de culturas anuais e perenes no Brasil. Suspeita-se que estas falhas sejam decorrentes da seleção de populações resistentes desta planta daninha ao glyphosate. No entanto, até o momento, poucos relatos estão disponíveis na literatura caracterizando estas falhas. Esta pesquisa teve como objetivo a caracterização dos níveis de suscetibilidade de populações que apresentaram falha de controle, assim como estudar seus mecanismos de resistência. Também foi objetivo do trabalho analisar comparativamente o crescimento das populações suscetíveis e as supostamente resistentes ao glyphosate e avaliar a eficácia de herbicidas considerados alternativos ao glyphosate. Na primeira etapa, foram estudadas 87 populações do capim-branco vinda de diferentes regiões do Brasil, das quais duas sobreviveram ao experimento designado \"screening\". Esses dois biótipos, 59 e 69, juntamente com outras 15 populações suscetíveis, foram submetidos a experimentos de dose-resposta para a caracterização de suas suscetibilidades e determinação da dose eficiente de controle, da qual foi calculada em 705,41 g e.a. ha-1 de glyphosate. Em seguida, os biótipos supostamente resistentes foram comparados a um biótipo suscetível (34) para o cálculo do fator de resistência, que variou entre 3,92 e 7,95, confirmando a resistência dos biótipos. Não foi possível inferir claramente que existem diferenças de crescimento entre os biótipos resistente e suscetível que implicaria em custo adaptativo do biótipo resistente. No entanto, fica evidente que nas fases iniciais de crescimento, o biótipo 34S foi ou superior ou estatisticamente igual ao biótipo 69R. Não foi possível estabelecer uma relação entre diferenças de suscetibilidade entre os biótipos, portanto, a resistência do biótipo 69R ao glyphosate não alterou sua suscetibilidade aos herbicidas alternativos ao glyphosate aqui estudados. Na pós-emergência, clethodim e fenoxaprop-P-ethyl foram eficientes para controlar os biótipos 34S e 69R, enquanto que em pré-emergência, todos os herbicidas testados foram eficientes. O biótipo 69R absorveu menor quantidade de 14glyphosate em relação ao biótipo 34S em todos os tratamentos, do qual foi estatisticamente inferior àqueles contendo 14glyphosate + surfactante não-iônico (0,25%), 14glyphosate + sulfato de amônio (3kg ha-1) e 14glyphosate isolado. O tratamento que proporcionou maior absorção para ambos os biótipos foi o 14glyphosate + surfactante não-iônico. O biótipo 69R teve absorção máxima (Amax) 17% inferior ao biótipo 34S e maior retenção de 14glyphosate na folha tratada. O acúmulo de ácido chiquímico no biótipo 34S foi 2,56 vezes maior que no biótipo 69R. Mutações no gene que codificam a EPSPs dos biótipos 34S e 69R não foram observadas. Por fim, baseando-se nos dados aqui obtidos, é possível afirmar que a absorção reduzida, bem como a maior retenção do 14glyphosate nas folhas do biótipo 69R, possuem papel importante na resistência desse biótipo ao glyphosate. / It has been recently observed failures in controlling Tall windmill grass (Chloris polydactyla) by glyphosate in agricultural areas in Brazil. It is suspected that these failures are due to selection of resistant biotypes to glyphosate. However, to date, few reports are available in the literature characterizing these failures. Therefore, this study aimed to characterize the levels of susceptibility of differents populations of Chloris polydactyla, and to study the possible mechanisms of resistance to glyphosate. It was also an objective of this study to build a comparative growth analysis between populations, as well as evaluating the effectiveness of alternatives herbicides to glyphosate. In the first step, 87 populations from different regions of Brazil were studied, of which two survived the experiment called \"screening\". These two biotypes, 59 and 69, along with 15 other susceptible populations were subjected to a dose- response experiment for the characterization and determination of their susceptibility to glyphosate and a baseline herbicide sensitivity was obteined, which was calculated in 705.41 g ae ha-1 of glyphosate. Then the supposedly resistant biotypes (59R and 69R) were compared to a susceptible population (34S) for calculate the resistance factor, which ranged from 3.92 to 7.95, confirming the resistance of the biotypes. It was impossible to infer accurately that there are differences in growth between the resistant and susceptible biotypes of Tall windmill grass, which would imply in fitness penalty for the resistant biotype. However, it is evident that in the early growth stages, in most of the variables analyzed, the 34S was biotype or higher or statistically equal to biotype 69R. It was not possible to establish a statistical difference in susceptibility among biotypes, therefore the resistance of 69R biotype to glyphosate did not alter its susceptibility to alternative herbicides. At post-emergence, clethodin and fenoxaprop-P-ethyl were efficient to control biotypes 34S and 69R. On the other hand, at pre-emergence, all herbicides were efficient to control both biotypes. The biotype 69R absorbed smaller amount of 14glyphosate relative to 34S biotype in all treatments, which was statistically inferior to those containing 14glyphosate + non-ionic surfactant (0.25%), 14glyphosate + ammonium sulfate (3 kg ha-1) and 14glyphosate alone. The treatment providing greater absorption for both biotypes was 14glyphosate + non-ionic surfactant. Biotype 69R absorbed 17% less than the biotype 34S and had higher treated leaf retention. The shikimic acid accumulation assay in the biotype 34S was 2.56 times higher than in biotype 69R. Mutations in the gene encoding EPSPs were not observed. Finally, based on data obtained here, it is clear that the reduced absorption and treated leaf retention of 14glyphosate in biotype 69R, have an important role in the resistance of this biotype to glyphosate.

Recentemente, tem sido constatadas falhas no controle da planta daninha capim-branco (Chloris polydactyla) pelo herbicida glyphosate em áreas de culturas anuais e perenes no Brasil. Suspeita-se que estas falhas sejam decorrentes da seleção de populações resistentes desta planta daninha ao glyphosate. No entanto, até o momento, poucos relatos estão disponíveis na literatura caracterizando estas falhas. Esta pesquisa teve como objetivo a caracterização dos níveis de suscetibilidade de populações que apresentaram falha de controle, assim como estudar seus mecanismos de resistência. Também foi objetivo do trabalho analisar comparativamente o crescimento das populações suscetíveis e as supostamente resistentes ao glyphosate e avaliar a eficácia de herbicidas considerados alternativos ao glyphosate. Na primeira etapa, foram estudadas 87 populações do capim-branco vinda de diferentes regiões do Brasil, das quais duas sobreviveram ao experimento designado \"screening\". Esses dois biótipos, 59 e 69, juntamente com outras 15 populações suscetíveis, foram submetidos a experimentos de dose-resposta para a caracterização de suas suscetibilidades e determinação da dose eficiente de controle, da qual foi calculada em 705,41 g e.a. ha-1 de glyphosate. Em seguida, os biótipos supostamente resistentes foram comparados a um biótipo suscetível (34) para o cálculo do fator de resistência, que variou entre 3,92 e 7,95, confirmando a resistência dos biótipos. Não foi possível inferir claramente que existem diferenças de crescimento entre os biótipos resistente e suscetível que implicaria em custo adaptativo do biótipo resistente. No entanto, fica evidente que nas fases iniciais de crescimento, o biótipo 34S foi ou superior ou estatisticamente igual ao biótipo 69R. Não foi possível estabelecer uma relação entre diferenças de suscetibilidade entre os biótipos, portanto, a resistência do biótipo 69R ao glyphosate não alterou sua suscetibilidade aos herbicidas alternativos ao glyphosate aqui estudados. Na pós-emergência, clethodim e fenoxaprop-P-ethyl foram eficientes para controlar os biótipos 34S e 69R, enquanto que em pré-emergência, todos os herbicidas testados foram eficientes. O biótipo 69R absorveu menor quantidade de 14glyphosate em relação ao biótipo 34S em todos os tratamentos, do qual foi estatisticamente inferior àqueles contendo 14glyphosate + surfactante não-iônico (0,25%), 14glyphosate + sulfato de amônio (3kg ha-1) e 14glyphosate isolado. O tratamento que proporcionou maior absorção para ambos os biótipos foi o 14glyphosate + surfactante não-iônico. O biótipo 69R teve absorção máxima (Amax) 17% inferior ao biótipo 34S e maior retenção de 14glyphosate na folha tratada. O acúmulo de ácido chiquímico no biótipo 34S foi 2,56 vezes maior que no biótipo 69R. Mutações no gene que codificam a EPSPs dos biótipos 34S e 69R não foram observadas. Por fim, baseando-se nos dados aqui obtidos, é possível afirmar que a absorção reduzida, bem como a maior retenção do 14glyphosate nas folhas do biótipo 69R, possuem papel importante na resistência desse biótipo ao glyphosate. / It has been recently observed failures in controlling Tall windmill grass (Chloris polydactyla) by glyphosate in agricultural areas in Brazil. It is suspected that these failures are due to selection of resistant biotypes to glyphosate. However, to date, few reports are available in the literature characterizing these failures. Therefore, this study aimed to characterize the levels of susceptibility of differents populations of Chloris polydactyla, and to study the possible mechanisms of resistance to glyphosate. It was also an objective of this study to build a comparative growth analysis between populations, as well as evaluating the effectiveness of alternatives herbicides to glyphosate. In the first step, 87 populations from different regions of Brazil were studied, of which two survived the experiment called \"screening\". These two biotypes, 59 and 69, along with 15 other susceptible populations were subjected to a dose- response experiment for the characterization and determination of their susceptibility to glyphosate and a baseline herbicide sensitivity was obteined, which was calculated in 705.41 g ae ha-1 of glyphosate. Then the supposedly resistant biotypes (59R and 69R) were compared to a susceptible population (34S) for calculate the resistance factor, which ranged from 3.92 to 7.95, confirming the resistance of the biotypes. It was impossible to infer accurately that there are differences in growth between the resistant and susceptible biotypes of Tall windmill grass, which would imply in fitness penalty for the resistant biotype. However, it is evident that in the early growth stages, in most of the variables analyzed, the 34S was biotype or higher or statistically equal to biotype 69R. It was not possible to establish a statistical difference in susceptibility among biotypes, therefore the resistance of 69R biotype to glyphosate did not alter its susceptibility to alternative herbicides. At post-emergence, clethodin and fenoxaprop-P-ethyl were efficient to control biotypes 34S and 69R. On the other hand, at pre-emergence, all herbicides were efficient to control both biotypes. The biotype 69R absorbed smaller amount of 14glyphosate relative to 34S biotype in all treatments, which was statistically inferior to those containing 14glyphosate + non-ionic surfactant (0.25%), 14glyphosate + ammonium sulfate (3 kg ha-1) and 14glyphosate alone. The treatment providing greater absorption for both biotypes was 14glyphosate + non-ionic surfactant. Biotype 69R absorbed 17% less than the biotype 34S and had higher treated leaf retention. The shikimic acid accumulation assay in the biotype 34S was 2.56 times higher than in biotype 69R. Mutations in the gene encoding EPSPs were not observed. Finally, based on data obtained here, it is clear that the reduced absorption and treated leaf retention of 14glyphosate in biotype 69R, have an important role in the resistance of this biotype to glyphosate.

Submitted by Priscila Nascimento (pnascimento@icict.fiocruz.br) on 2012-11-30T12:31:09Z No. of bitstreams: 1 beatriz-cyranka.pdf: 1720638 bytes, checksum: c436adb348584d5a5a8213fccdef6ea6 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-11-30T12:31:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 beatriz-cyranka.pdf: 1720638 bytes, checksum: c436adb348584d5a5a8213fccdef6ea6 (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Novas tecnologias, como o sistema isolador para ensaios de esterilidade vieram a contribuir com a incorporação de um melhor desempenho destes ensaios no controle de qualidade das indústrias farmacêuticas.Este trabalho teve como objetivo a verificação do processo de biodescontaminação dentro do sistema isolador de Bio-Manguinhos, utilizado como agente esterilizante o gás de peróxido de hidrogênio. Foram utilizadas como biocarga para redução de contaminação microbiológica três concentrações dos microrganismos, Candida albicansATCC 10231, Clostridium sporogenesATCC 11437 eMicrococcus luteusATCC 9341, impregnadas em discos de filtro de celulose. Os estudos de cinética de crescimento dos microrganismos foram realizados para um melhor entendimento do seumetabolismo, bem como aspectos gerais de crescimento que contribuíram para ressaltar que a Candida albicans inicia sua fase exponencial de crescimento na segunda hora do cultivo e finaliza esta etapa na sexta hora do cultivo, com produção máxima de células viáveis, fato observado também no microrganismo Micrococccus luteus. Para o cultivo doClostridium sporogenes o crescimento foi mais lento com uma curva de crescimento com 60 horas de cultivo total. A produção de maior número de células para o Clostridiumfoi alcançada na vigésima quarta hora de cultivo, assim como a maior produção de esporos. Foi estabelecida, ao longo da curva de crescimento, a relação entre densidade ótica e número de células viáveis, relação essa importante para o estabelecimento das condições do estudo em relação à biocarga empregada de cada microrganismo no momento do desafio no sistema isolador. A capacidade de descontaminação avaliada dentro do sistema isolador com o biocida peróxido de hidrogênio revelou o tempo de exposição ao gás de 10 minutos, como resultado final satisfatório apresentando redução total da carga microbiana com destruição total das células viáveis, assim como as formas esporuladas do Clostridium sporogenes. Desta forma conclui-se que o peróxido de hidrogênioé um biocida de eficácia comprovada, nas variáveis deste estudo e o processode descontaminação no sistema isolador de Bio-Manguinhos é compatível comsua atividade finalística na produção de insumos para a saúde. / New technologies such as isolator system for sterility tests came to help with the incorporation of a better performance of these kinds of tests in quality control of pharmaceutical companies. This study aimed to verify the decontamination process within the system isolator of Bio-Manguinhos, usinghydrogen peroxide gas as a sterilizing agent. Three concentrations of microorganisms were used as bioburden for the microbiological contamination reduction, Candida albicansATCC 10231, Clostridium sporogenesATCC 11437 and Micrococcus luteusATCC 9341, impregnated in cellulose filter discs. Studies of growth kinetics of microorganisms were carried out to a better understanding of theirmetabolism, as well as general aspects of growth that contributed to emphasize that the Candida albicansbegins its exponential growth phase in the second hour of cultivation and this step ends at the sixth hour cultivation, with maximum yield of viable cells, this was also observed in the Micrococcus luteusmicroorganism. For the Clostridium sporogenescultivation, growth was slower with a 60 hours growth curve of total culture. The production of more cells for Clostridiumwas achieved in the twenty-fourth hour of cultivation, as well as the maximum spores production. It was established along the growth curve the relationship between optical density and numberof viable cells, this relationship was important to establish the conditions of the study related to the bioburden of each microorganism used to challenge the isolator system. The decontamination capacity evaluated within the isolator system with the hydrogen peroxide biocide showed that the gas exposure time of 10 minutes wassatisfactory demonstrating total reduction of the microbial load with total destruction of viable cells, as well as the sporulated forms of Clostridium sporogenes. Thus it is concluded that hydrogen peroxide is a proved effective biocide, in the variables of this study and decontamination process in the Bio-Manguinhos insulator system is compatible with its main activity in the production of health supplies.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-03-30Bitstream added on 2014-06-13T20:25:13Z : No. of bitstreams: 1 marcato_sm_dr_jabo.pdf: 1013964 bytes, checksum: d793681174ebe0af179b43c6de3b4b20 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com objetivo determinar os parâmetros de crescimento do peso vivo e da ave depenada, das penas e componentes químicos corporais, das partes, dos órgãos e tecidos de frangos de corte, machos e fêmeas das linhagens Ross e Cobb, foram utilizados 1920 pintos criados em galpão alojados em boxes. O delineamento foi inteiramente casualizado em esquema fatorial 2x2 (linhagens e sexo), 4 repetições de 120 aves cada. Foi avaliado o crescimento das aves depenadas e das penas, das partes e dos órgãos, dos músculos, ossos e peles. Foram realizados abates semanais até 56 dias de idade, após jejum de 24 horas. As aves foram pesadas para obtenção do peso de jejum, um grupo de aves foram depenados para obter o peso de penas, e as demais aves foram evisceradas e realizadas os cortes para avaliação do desenvolvimento das partes e órgãos. Após, foram pesadas, identificadas e congeladas. Posteriormente, as amostras foram moídas, liofilizadas e encaminhadas para análises de matéria seca, nitrogênio, extrato etéreo e cinzas. Foram elaboradas curvas e taxas de crescimento através da equação de Gompertz. As aves Cobb foram mais precoces no crescimento e deposição de proteína e cinzas corporais, na deposição de proteína, gordura e água das penas, na taxa de crescimento e deposição de nutrientes da coxa, dorso, cabeça, proventrículo e no crescimento do intestino. As aves Ross apresentaram maior potencial de crescimento de asa, pescoço, sobrecoxa e pés, e foram mais precoces no crescimento das penas, do fígado e deposição de água e cinzas no fígado. Houve semelhança entre as linhagens para peso do músculo, crescimento e deposição de nutrientes para o peito e coração e no peso e proteína dos ossos. / The objective of this study was determine the growth parameters of the live weight, of feathers, of parts, organs and tissues and body chemical components strains chickens, males and females Cobb and Ross broilers. Were used 1920 chicks raised in boxes from 1 to 56 days of age, distributed randomly in a factorial model (2 strains x 2 sex), with 4 replicate pens of 120 birds. The birds were fed ad libitum with diets formulated according to requirements for each age phase. The birds were weight and four birds of each group were slaughtered weekly. Afther 24 hours of fasting, the birds were slaughtered to determined body, parts, organs, tissues weight and nutrients deposition. Thereafther, samples were freeze-fried to be analized for dry matter, protein, ash and fat. The parameters of weight and in nutrient depositions obtained weekly were adjusted by the Gompertz equation in order to estimate the growth parameters Wt= Wm exp(-exp(-B(t-t))). The growth and body nutrients deposition rates were determined by derived of the equations. Cobb broilers were more precocious in growth and of body protein and ash deposition than Ross. The deposition of protein, fat and water feather, in growth rate and depositions of nutrients in the thigh, dorsum, head and proventriculum and intestine were higher compared to Ross. The of Ross boilers was bigger than Cobb wing, neck, drumstick and feet growth potential. The Ross strains were more precocious in the growth of leg, liver and depositions of water and ash in the liver. The strains had similarity growth potencial of muscle and nutrients deposition in the breast, heart and bones.

Made available in DSpace on 2015-03-26T14:02:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 627381 bytes, checksum: b98c2d603d0b5930a8386f8bc84fc09a (MD5) Previous issue date: 2013-07-24 / This study aimed to evaluate the growth curve of Holstein heifers. For this purpose, 839 weight and height measurements of heifers raised in Animal Science Department of Federal University of Viçosa was collected. Data collection was performed every 30 days in confined animals fed with sugarcane and corn silage, receiving on average 1 kg / head / day of concentrate. The correlation between body weight and age of heifers was describe by four nonlinear models: Brody: Weight (W) = A x (1 be-kt)3; Gompertz: W = A x exp(- be-kt); Logistics: W = A x (1 + be-kt)-1; Von Bertalanffy: W = A x (1 be-kt), where A = represents the adult weight; k = maturity rate; b = mathematical constant, no biological definition; t = age in days. The estimation model of body weight from the wither heightwas tested using the general dataset, i.e., using 839 measurements, and separately analyzed different weight categories: 0-500 kg; 0 -400 kg and 0-300 kg, which contained, respectively, 770, 647 and 530 observations.The weight / height ratio was evaluated as function of age, adjusted a simple linear regression in function of age. Was adjusted Heinrichs and exponential models to describe the weight of heifers in function of wither height. All models were fitted using SAS®software using MODEL, NLIN and GLM procedures. Regarding the setting of nonlinear models, the Logistic model showed better results, resulting in the estimates for the parameters: mature weight of 615 kg, maturity rate of 0.0056 and sexual maturity at about 307 kg. The wither height stabilization occurred at the age of 632 days (21 months at a height of 138 cm). Exponential model showed better results compared to Heinrichs model, therefore was chosen to describe the correlation between wither height and body weight. An estimated equation for this model was given by: Weight = 4.3577 x EXP (0.0343 x ALT), where ALT = wither height. The use of body measurements as wither height to estimate body weight of Holstein heifers can be performed until the age of 21 months, allowing small farmers,who do not have scales to monitor the development of the heifers. / O presente trabalho foi conduzido para avaliar a curva de crescimento de novilhas Holandesas. Foram obtidas 839 medidas de peso e altura de novilhas criadas no Setor de Gado de Leite do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa, MG. A coleta de dados foi realizada a cada 30 dias. Os animais foram criados em sistema confinado, com alimentação de cana de açúcar e silagem de milho, recebendo diariamente 1 kg de concentrado. A relação entre peso vivo e idade de novilhas foi descritapor meio de quatro diferentes modelos não lineares: Brody: Peso = A x (1 be-kt)3; Gompertz: Peso = A x exp(-be-kt); Logístico: Peso = A x (1 + be-kt)-1; Von Bertalanffy: Peso = A x (1 be-kt), onde: A = representa o peso adulto; k = taxa de maturidade, ou velocidade de crescimento; b = constante matemática, sem definição biológica; t = idade em dias.O modelo de estimação do peso corporal a partir da altura de cernelha foi testado com o conjunto geral de dados, i.e., utilizando as 839 medidas, e também analisou-se separadamente as categorias de peso: 0-500 kg; 0-400 kg; e 0-300 kg, as quais continham, respectivamente, 770, 647 e 530 observações. Foi realizada uma avaliação da relação peso/altura em função da idade utilizando-se uma regressão linear simples. Foram ajustadosos modelos Heinrichs e exponencial para descrever o peso das novilhas em função da altura da cernelha. Todos os modelos foram ajustados por meio do software SAS® usando os procedimentos MODEL, NLIN e GLM. Em relação ao ajuste dos modelos não lineares, o modelo Logístico apresentou melhor resultado, resultando nas seguintes estimativas para os parâmetros: peso à maturidade de 615 kg, taxa de maturidade de 0,0056 e maturidade sexual com cerca de 307 kg. A estabilização da altura de cernelha ocorreu na idade de 632 dias (21 meses a uma altura de 138 cm). O modelo exponencial apresentou melhor resultados em relação ao modelo Heinrichs, portanto foi escolhido para descrever a relação entre altura de cernelha e peso corporal. A equação estimada para este modelo foi dada por: Peso = 4,3577 x EXP(0,0343 x ALT), onde ALT é altura de cernelha. O uso de medidas corporais, como altura de cernelha, para estimar o peso corporal de novilhas Holandesas pode ser realizado até a idade de 21 meses, possibilitando aos pequenos produtores rurais, que não possuem balança, a acompanhar o desenvolvimento ponderal de suas novilhas.

O ferro é essencial para a sobrevivência das bactérias, estando envolvido em vários processos metabólicos. Apesar de sua baixa solubilidade, as bactérias dispõem de sistemas eficientes e específicos para captação, utilização e armazenamento desse metal, ao mesmo tempo controlando adequadamente a concentração de ferro livre no meio, para evitar seus potenciais efeitos tóxicos. Xylella fastidiosa é uma bactéria gram-negativa que coloniza o xilema de uma diversidade de plantas cultivadas e silvestres em várias partes do mundo, sendo o agente causador de uma série de doenças em plantas economicamente importantes como citros, videiras e café. Alguns mecanismos de virulência de X. fastidiosa já foram elencados, entre esses a formação de biofilme, que promoveria a oclusão do xilema e consequente estresse hídrico para a planta. Postula-se que a captação de ferro por X. fastidiosa, causando redução da concentração desse metal no xilema das plantas infectadas, seja uma das estratégias utilizadas pela bactéria em seu processo de infecção. Nosso objetivo neste trabalho foi de investigar o processo de captação de ferro por X. fastidiosa e avaliar em maior detalhe o efeito da concentração de ferro no crescimento e na expressão de fatores de virulência dessa bactéria, expandindo os estudos anteriormente realizados em nosso grupo. Para tal propusemos: (i) avaliar a capacidade de X. fastidiosa produzir sideróforos, pequenas moléculas quelantes de ferro; (ii) investigar, em condições de cultivo com diferentes concentrações de ferro, o perfil de expressão de alguns genes de X. fastidiosa que possam ser integrantes do stimulon do ferro; (iii) analisar o efeito da concentração de ferro no crescimento e formação de biofilme por X. fastidiosa. Observamos que X. fastidiosa parece produzir um composto quelante de ferro que pode ser um sideróforo e elencamos alguns genes que poderiam estar envolvidos na síntese desse composto. Confirmamos que ferro é necessário para o crescimento de X. fastidiosa, sendo que em alta concentração de ferro foi observada maior deposição de biofilme pela cultura bacteriana. Interessantemente também foi observado que as células crescidas em meio com pouco ferro secretaram mais exopolissacarídeos totais na fração do biofilme, o que estabelece uma relação entre as concentrações de ferro no meio com a expressão de um fator de virulência essencial para o desenvolvimento da infecção por X. fastidiosa. / Iron is an essential nutrient for bacteria, being involved in many metabolic processes. Despite its low solubility, bacteria present efficient and specific systems for uptake, utilization and storage of iron, meanwhile controlling metal concentration adequately to prevent potential toxic effects of free iron. Xylella fastidiosa is a Gram-negative bacterium which colonizes the xylem of a wide range of crops and wild species of plants worldwide. This bacterium is the agent of several diseases affecting economically important crops, such as citrus, grapevine and coffee. Among the proposed X. fastidiosa virulence mechanisms is the formation of biofilm which may occlude xylem vessels causing hydric stress. It is postulated that iron uptake might cause reduction of its concentration within the xylem of infected plants therefore constituting a virulence strategy during bacterial infection process. Our aims in this work were to investigate the process of iron uptake in X. fastidiosa and to evaluate the effect of iron concentration in the growth and morphology of this bacterium, expanding previous studies. For this we set to: (i) investigate the capacity of X. fastidiosa in producing siderophores, small biomolecules utilized for iron quelation; (ii) evaluate, under culture conditions at different iron concentrations, the expression profile of candidate genes that might be part of the iron stimulon; (iii) analyse the effect of iron concentration in growth and biofilm formation of X. fastidiosa. We observed that X. fastidiosa seems to produce a compound with iron quelating ability, such as a siderophore, and we point to a group of genes that might be involved in the synthesis of this compound. We confirmed that iron is necessary for growth of X. fastidiosa. At high concentrations of iron we observed higher biofilm production. Interestingly, we also observed that when grown in low iron concentration, X. fastidiosa secretes more exopolysaccharides (EPS) associated with the biofilm, suggesting a link between iron concentration and expression of an essential virulence factor to the infection process of X. fastidiosa.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-05-15T17:26:44Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Jose Ferreira Batista da Silva.pdf: 851564 bytes, checksum: 1a7e403b124792a436c6595938142885 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-15T17:26:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Jose Ferreira Batista da Silva.pdf: 851564 bytes, checksum: 1a7e403b124792a436c6595938142885 (MD5) Previous issue date: 2015-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of this study was to evaluate the growth, carcass yield and meat quality of animals Nellore and with Rubia Gallega. For the study of performance were applied the properties of four nonlinear models, considering the set of growth curves: Von Bertalanffy, Brody, Gompertz and Logistic. The models were adjusted by the method of Gauss Newton through the function "nls", free Software R version 3.1., the data weight-for-age in times 0; 270; 365; 550; and 660 days of age, male and female in Nellore breed and its intersection with the race Rubia Gallega, considering the criteria: Akaike’s Information Criterion (AIC), Bayesian Information Criterion (BIC), mean squared residue (QMR), coefficient of determination (R2) and mean deviation of absolute waste (DMA). It was also applied the likelihood-ratio test for equality of parameters of nonlinear models to determine if a single curve would be adequate to describe the growth of these animals. For the female cross-Nellore and males crossed, the model that best adjusted growth curves was the Brody, while that for males the Nellore breed was the Logistic model. For the test of equality, comparing the curves between females and males Nellore and between males Nellore and crossover, it was found that the hypothesis k1 = k2 = k was rejected by the maximum likelihood ratio test, indicating different growth rate (K). Already for the hypothesis a1 = a2 = a for female and male Nellore, it was found that the female Nellore and the male crossover showed same weight to maturity (A) in relation to the male Nellore. Even with the test of equality of parameters (Â and K), when comparing the data of animals between female and male crusaders and between females Nellore and the crusaders, it was checked that is not rejected by the maximum likelihood ratio test, which indicates that it can be represented by a single equation and that the curves are parallel and identical. This way, neither the sex and the genetic group influenced the estimated parameters. For the evaluation of the income of carcase and meat quality were used 27 male animals whole, being 12 crusaders (Nellore x Rubia Gallega) and 15 pure (Nellore), created and fed grazing Brachiaria brizantha, until the average age of 32 months, and then slaughtered in fridge commercial in the city of Parnamirim - RN. The parameters evaluated were: body weight at slaughter; weights of carcasses hot and cold; income of hot carcasses (WHR) and cold (RCF); body length (CC); index of compactness of the carcasse (ICC); losses by cooling; pH and temperature (T) of the housing in the times 0h, 3h and 24h; weights and yields of front, and hindquarter; area of rib eye); thickness of subcutaneous fat (EGS); color (L*, a* and b*); losses by cooking; and softness. There was no difference (P< 0.05) for WHR; T 0h and 3h; NE; AOL; and color a* and b*. The difference found for these variables, in favor of the animals crossed, proved to be promising for the production of a product potentially superior, by presenting characteristics in order to care for attributes that give meat quality. / Objetivou-se avaliar o crescimento, rendimento de carcaça e qualidade da carne de animais Nelore e cruzados com Rubia Gallega. Para o estudo de desempenho foram aplicadas as propriedades de quatro modelos não lineares, considerando-se o ajuste de curvas de crescimento: Von Bertalanffy, Brody, Gompertz e Logístico. Os modelos foram ajustados pelo método de Gauss Newton por meio da função “nls”, do Software livre R versão 3.1., aos dados peso-idade nos tempos 0; 270; 365; 550; e 660 dias de idade, de machos e fêmeas da raça Nelore e de seu cruzamento com a raça Rubia Gallega, considerando-se os critérios: Akaike's Information Criterion (AIC), Bayesian Information Criterion (BIC), quadrado médio do resíduo (QMR), coeficiente de determinação (R2) e desvio médio absoluto dos resíduos (DMA). Aplicou-se também o teste da razão de verossimilhança para igualdade de parâmetros de modelos não lineares para determinar se uma única curva seria adequada para descrever o crescimento desses animais. Para as fêmeas Nelore cruzadas e machos cruzados, o modelo que melhor ajustou as curvas de crescimento foi o de Brody, enquanto que para os machos da raça Nelore foi o Logístico. Para o teste de igualdade, comparando-se as curvas entre fêmeas e machos Nelore e entre machos Nelore e cruzado, verificou-se que a hipótese k1 = k2 = k foi rejeitada pelo teste da razão de máxima verossimilhança, indicando diferente taxa de crescimento (K). Já para a hipótese a1 = a2 = a para fêmeas e machos Nelore, verificou-se que a fêmea Nelore e o macho cruzado apresentaram mesmo peso à maturidade (A) em relação ao macho Nelore. Ainda com o teste de igualdade de parâmetros (Â e K), no comparativo dos dados de animais entre fêmea e macho cruzados e entre fêmeas Nelore e cruzada foi verificada não rejeição pelo teste da razão de máxima verossimilhança, o que indica que pode ser representada por uma única equação e que as curvas são paralelas e idênticas. Dessa maneira, nem o sexo e o grupo genético influenciaram os parâmetros estimados. Para avaliação dos rendimentos de carcaça e qualidade de carne foram utilizados 27 animais machos inteiros, sendo 12 cruzados (Nelore x Rubia Gallega) e 15 puros (Nelore), criados e alimentados em pastagem de Brachiaria brizantha, até a média de idade de 32 meses, sendo, em seguida, abatidos em frigorífico comercial no município de Parnamirim – RN. Os parâmetros avaliados foram: peso corporal ao abate; pesos de carcaças quente e fria; rendimentos de carcaças quente (RCQ) e fria (RCF); comprimento de carcaça (CC); índice de compacidade da carcaça (ICC); perdas por resfriamento; pH e temperatura (T) da carcaça nos tempos 0h, 3h e 24h; pesos e rendimentos do dianteiro, costilhar e traseiro; área de olho de lombo (AOL); espessura de gordura subcutânea (EGS); cor (L*, a* e b*); perdas por cocção; e maciez. Houve diferença (P<0,05) para RCQ; T 0h e 3h; EGS; AOL; e cor a* e b*. A diferença encontrada para essas variáveis, a favor dos animais cruzados, mostrou-se promissora para produção de um produto potencialmente superior, por apresentar características visando ao atendimento de atributos que conferem qualidade da carne.

Mycoplasma (M.) genitalium é um importante agente de doença sexualmente transmissível sendo, responsável por uma série de desordens do trato urogenital humano. A aderência do micoplasma é um dos principais fatores de virulência na sua patogenicidade e conseqüente colonização nas células hospedeiras. Neste estudo, obte-se a curva de crescimento de duas cepas de M. genitalium (G37 e 1019V) utilizando-se da dosagem proteíca (BCA), densidade óptica (OD600) e PCR em tempo real. A cepa referencial G37 é de alta passagem e foi isolada de homens e a 1019V é de baixa passagem, sendo recentemente isolada de amostra clínica de cérvix humana. Utilizando-se da fase logarítimica obtida pela curva, comparou-se a dinâmica de interação destas cepas na célula epitelial de carcinoma de cérvix humana (HeLa) e na célula endometrial humana (EM42), em diferentes intervalos de tempo com auxílio de microscopia confocal. Apesar destas cepas divergirem na seqüência dos genes relacionados a aderência houve poucas variações entre as curvas de crescimento. A aderência e a invasão de M. genitalium nas células não fagocíticas confirmou os dados de literatura. Entretanto, após 30 minutos de contato com as células, detectou-se o antígeno de aderência de ambas as cepas na região intranuclear Este achado, indica uma nova característica desta espécie ainda não conhecida entre os molicutes. / Mycoplasma genitalium (Mg) is an important cause of sexual transmitted disease and has been implicated in a range of genital tract disorders.The adherence of mycoplasmas is a key virulence attribute, pathogenic features and consequences of host-cell colonization. Herein, we characterize growth properties of two Mg strains (G37 and 1019V) using BCA assay, OD600, CCU assay, real-time PCR. Based upon these strategies, we compared the behavior of similarly grown Mg variants coincubated with HeLa cervical epithelioid cells and EM42 endometrial cells over a dynamic time course.using laser scanning confocal microscopy. Mg G37 is a multiply passaged type strain isolated from a male while 1019V was recently isolated from human cervical samples and only minimally passaged. Both strains further diverge by sequence heterogeneities within adherence-related MG191 and MG192 genes. Despite these differences, our results identified only subtle variations in axenic growth for the two strains. Further and consistent with previous studies, a subset of adherent Mg organisms invaded host cells. However, intranuclear localization was observed, which occurred as early as 30 minutes after infection.

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Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 434501 bytes, checksum: 0ab5e3021a0cbd11c8c868f09b269488 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The analysis of growth curves of animals has been widely used to increase the efficiency of beef cattle ranching. Related to growth curves with nonlinear mixed models strategic, studies have strategic applications in genetic improving programs in defining selection criteria for earliness and weight gain, aimed at, that for each individual is estimated a random coefficient, facilitating identification and selection of more efficient animals based on the coefficients. This methodology considers the variability between and within individuals. The objective of this study was to evaluate the efficiency of the adjustment of growth curves by nonlinear mixed models. Nonlinear models, Michaelis-Menten Modified, Logistic, von Bertalanffy, Gompertz, Richards and Brody, were fitted, with and without the incorporation of random effects for analysis of growth in beef cattle Tabapuã race. For comparison between fixed and mixed models were used the following adjustment quality evaluators: Akaike s information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), mean absolute deviation (DMA), mean square error (MSE) and coefficient of determination (R2). The use of nonlinear mixed model was efficient to describe bovine growth curves. / A análise de curvas de crescimento de animais tem sido muito utilizada para aumentar a eficiência da pecuária de corte. Estudos relacionados a curvas de crescimento com modelos não lineares mistos podem ter aplicações estratégicas em programas de melhoramento genético na definição de critérios de seleção para precocidade e ganho de peso, tendo em vista, que para cada indivíduo é estimado um coeficiente aleatório, facilitando a identificação e seleção de animais mais eficientes com base nos coeficientes. Essa metodologia considera a variabilidade entre e dentro de indivíduos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do ajuste de curvas de crescimento através de modelos não lineares mistos. Foram ajustados os modelos não lineares Michaelis-Menten Modificado, Logístico, von Bertalanffy, Gompertz, Richards e Brody, com e sem a incorporação de efeitos aleatórios para análise de curva de crescimento de bovinos de corte da raça Tabapuã. Para comparação entre modelos fixos e mistos foram utilizados os seguintes avaliadores de qualidade de ajuste: critério de informação de Akaike (AIC), critério de informação bayesiano (BIC), desvio médio absoluto (DMA), erro quadrático médio (EQM) e coeficiente de determinação (R2). A utilização de modelos não lineares mistos foi eficiente para descrever curvas de crescimento de bovinos.