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Métodos multivariados para agrupamento de bovinos de raça Hereford em função dos parâmetros de curvas de crescimento / Multivariate methods for grouping Hereford cattle breed against the parameters of growth curves

Luiz Ricardo Nakamura 23 January 2012 (has links)
Após o ajuste individual das 55 vacas estudadas pelo modelo Gompertz difá- sico com estrutura de erros autorregressiva de ordem 1 (totalizando 7 parâmetros), notou-se que apenas 6 vacas tinham problemas nas estimativas de seus parâmetros (não convergentes ou não signicativos), dessa forma continuou-se o trabalho proposto com 49 animais. Com as estimativas de cada um dos parâmetros (variáveis nessa etapa) foi realizada a análise de componentes principais e observação do gráco biplot, sendo possível a constatação de que 2 dos parâmetros do modelo continham informações ambíguas com pelo menos um dos demais parâmetros e estes foram retirados da análise, restando 5 parâmetros para o estudo. A análise de componentes principais foi realizada novamente apenas com os 5 parâmetros restantes e os três primeiros componentes principais (escolhidos pelo critério da percentagem de variância original explicada) foram utilizados como variáveis em um processo de agrupamento hierárquico. Após a realização da análise de agrupamentos, observou-se que 5 grupos homogêneos de animais foram formados, cada um com caraterísticas distintas. Desta forma, foi possível identicar animais que se destacavam, positiva ou negativamente, no que tange ao seu peso assintótico e taxa de crescimento. / After individual adjustment of the 55 cows studied using the diphasic Gompertz model with autoregressive structure of errors (totalizing 7 parameters), it was noted that only 6 cows had problems on estimates of the parameters (not converged or not signicant), then the proposed work continued with 49 animals. With each of the parameters estimates (variables at this stage) was performed a principal component analysis and observation of the biplot, and it was possible to nd that two of the model parameters contained ambiguous information with at least one of the other parameters, then these 2 parameters were removed from the analysis, leaving 5 parameters for the study. The principal component analysis was performed again with only ve remaining parameters and the rst three principal components (chosen by the criterion of percentage of original explained variance) were used as variables in a process of hierarchical clustering. After performing the cluster analysis, we found that ve homogeneous groups of animals were formed, each with distinct characteristics. Thus, it was possible to identify animals that stood out, positively or negatively, in terms of their asymptotic weight and growth rate.
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Curvas padrão pôndero-estatural de portadores de Síndrome de Down procedentes da região urbana da cidade de São Paulo / Growth charts (standard grown curves) of children with down Syndrome deriving from São Paulo\'s Urban area

Zan Mustacchi 29 November 2002 (has links)
De fato, por não existir um levantamento antropométrico de crianças com síndrome de Down no Brasil, foi realizado em São Paulo um estudo biométrico prospectivo que permitiu a elaboração de curvas antropométricas avaliando taxas de peso, estatura e perímetro cefálico elaboradas por tabelas e gráficos com valores lapidados de 4 percentis de dois grupos etários de ambos os sexos divididos de 0-24 meses e de 2-8 anos respectivamente.o estudo considerou e excluiu, quando pertinente, fatores ambientais ou genéticos paralelos que eventualmente pudessem interferir nas variáveis avaliadas. A ampla revisão bibliográfica e a comparação dos dados antropométricos permitiram enfatizar a importância de curvas padrões nacionais para estatura, peso e perímetro cefálico de crianças com síndrome de Down, facilitando o diagnóstico diferencial entre outros comprometimentos clínicos, auxiliando na intervenção clínico-Iaboratorial, na prevenção e acompanhamento médico. / Considerint that there is any anthropometrical evaluation in children with Down\'s syndrome in Brazil, the objective of this prospective biometric investigation was to construct anthropometrical curves for weight, stature and cephalic perimeter in children with Down\' s syndrome living in São Paulo urban area. Ali measurements were obtained from January 1980 to December 1999. Ali height or cephalic perimeter values 10% below or above and weight values 16% below or above of the 1st and 3rd quartile were excluded. Tables for each sex during 0-24 months and 2-8 years were presented in mean, standard deviations, percentiles and quartiles and graphics were presented in percitiles. Environmental and genetic factors associated that could interfere in development were identified and the proband excluded from the sample. The employing of a national pattem curve of stature, weight and cephalic perimeter for individuaIs with Down\' s syndrome would be useful in differential diagnosis among other clinical disorders associated to this genetic malformation providing better clinical intervention and prevention of comorbidity.
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Curvas de crescimento e produtividade de vacas Nelore e cruzadas, de diferentes tipos biológicos, em sistema de produção intensiva / Curves of growth and productivity of Nellore and cross from different biological types in intensive production system

Fabiane de Lima Silva 11 February 2010 (has links)
Inicialmente, foram analisados dados peso-idade do nascimento até 100 meses de idade, de vacas de quatro grupos genéticos (G): Nelore (NEL), ½Canchim + ½Nelore (CN), ½Angus + ½Nelore (AN) e ½Simental + ½Nelore (SN), pertencentes a Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos. Os animais considerados neste estudo nasceram de 1998 a 2001 (Ano), na primavera e outono (EP), e foram criados em sistema de produção intensiva, recebendo três níveis de suplementação pós-desmama (M): 0, 1,5; 3,0 kg/animal/dia de concentrado. O objetivo neste estudo foi comparar diferentes modelos não-lineares para estimar o crescimento, e avaliar a influência de efeitos de ambiente e grupo genético sobre os parâmetros estimados. Os modelos não-lineares: Brody, Gompertz, Logístico, Von Bertalanffy e Richards foram ajustados por mínimos quadrados ordinários e ponderados, considerando a variância normal e ponderada pelo inverso dos pesos em diferentes períodos. Foi usado o procedimento NLIN do SAS. Os modelos Brody e Von Bertalanffy convergiram para todos os G, havendo, entretanto, leve superioridade do Brody ponderado. Na comparação do ajuste dos modelos considerando o uso do inverso da variância os modelos mostraram-se mais adequado. As estimativas dos parâmetros peso assintótico (A) e taxa de maturidade (k) do modelo de Brody ponderado foram analisadas por meio de modelo que, além do efeito médio global, incluiu os efeitos de G, M, EP e as interações entre estes efeitos. Houve diferenças significativas das curvas de crescimento médias para os G. Na análise individual dos parâmetros A e k estimados através do modelo Brody ponderado, verificou-se que A foi influenciado (P<0,05) por G e EP e k foi influenciado (P<0,05) por M, fornecidos aos animais durante quatro meses após desmama. Melhorias no manejo alimentar resultaram em menor variação na forma das curvas de crescimentos e em altas taxas de maturidade. Na segunda parte, verificou-se a qualidade do modelo Brody, ponderado pelo inverso das variâncias dos pesos, quanto ao ajuste peso-idade como também a influência das estimativas do peso à maturidade (A) e da taxa de maturidade (k) sobre características produtivas das vacas NEL, CN, AN e SN. Foram organizados 10 grupos contemporâneos (GC), com concatenação dos efeitos Ano-EP-M para cada G. Utilizando-se um modelo misto com efeitos de G e GC, foi incluído, alternadamente covariáveis linear e quadrática de A e k, na análise das características produtivas: peso à desmama dos bezerros (PD); número (ND8) e kg (KD8) de bezerros desmamados em até 8 anos de permanência da vaca no rebanho; relação PD/peso da vaca ao parto (PD_PVP); relação PD/peso da vaca à desmama do bezerro (PD_PVD); relação PD/unidade metabólica da vaca (PV0,75) à desmama do bezerro (PDW). Houve diferença significativa (P<0,05) da curva de crescimento entre os grupos genéticos (G) e também entre os grupos de contemporâneos (GC) dentro de G. Verificou-se que estas características foram, em geral, influenciadas (P<0,01) tanto pelos efeitos linear e quadrático de A quanto pelos efeitos linear e quadrático de k. / Initially, were analyzed weight-age data from birth to 100 months of age from cows of four genetic groups (G): Nellore (NEL), ½Nellore + ½Canchim (CN), ½Angus +½Nellore (AN) and ½Simmental + ½Nellore (SN), of a experiment carried out at Embrapa Southeast Cattle Research Center, State of São Paulo, Brazil. The animals considered in this study were born from 1998 to 2001 (Year) in spring and fall (EP), and were managed in intensive production system and submitted to three of levels of supplementation post-weaning (M): 0, 1.5 and 3.0 kg/animal/day of concentrate. The objective of this study was to compare different nonlinear models to fitted growth curves, of beef cattle females, and to evaluate of environmental and genetic group effects on the estimated parameters. The nonlinear models: Brody, Gompertz, Logistic, Von Bertalanffy and Richards were fitted by ordinary least squares and weighted by the inverse of the variances of the weights in different periods. It was used the NLIN procedure of SAS. The parameters asymptotic weight (A) and maturing rate (k) obtained from model of Brody were analyzed by a mixed linear model that, besides the overall mean effect, included the effects of G, M, EP, and the interactions among these effects. The Brody and Von Bertalanffy models converged for all genetic groups, although slight superiority of the weighted Brody. Comparing the goodness of fit of these models, the use of the inverse of variances showed more efficient than the adjust of the models considering normal variances. Individual analysis of A and k estimated the model weighted Brody, the A parameter was influenced (P <0.05) by genetic group and season of birth and k was influenced (P <0 05) for levels of supplementation to the animals. Improvements in feeding supplementation resulted in less variation in the shape of growth curves and rates of maturity. In the second part of the work, it was evaluated the goodness of the Brody model, weighted by the inverse variance weights, in the adjust of weight-age data, and also analyzed the influence of the maturity weight (A) and maturing rate (k) estimates for traits cows productivity. Were organized 10 contemporary groups (CG) with concatenation of effects Year- EP-M for each G. Considering a mixed model with effects of G and CG (10 contemporaneous groups organized by concatenation Year-EP-M effects), linear and quadratic covariate effects of A and k, were added, alternately, for the analysis of the following traits: weaning weight of calve (WW), number (NW8) and kg (KW8) of calves weaned over 8 years of the cow in the herd; WW/weight of the cow at calving (WW_WC); WW/cow weight at weaning of calf (WW_WWC); and WW/metabolic unit of the cow (PV0,75) at weaning of the calf (MW). There was significant difference (P<0.05) of the growth curve among the genetic groups and also among contemporary groups within G. It was found that the production traits were, in general, influenced (P<0.01) by both linear and quadratic effects of A and k.
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Role of Ectodermal-neural cortex 1 protein in human glioma progression, identification of a peptide internalized by human glioblastoma cells and development of an alternative method to generate growth curves of adherent cultures / Papel da proteína Ectodermal-neural cortex 1 (ENC1) na progressão de glioma humano, identificação de um peptídeo internalizado por células de glioblastoma humano e desenvolvimento de um método alternativo para gerar curvas de crescimento celular

Pereira, Túlio Felipe 14 November 2018 (has links)
Gliomas are the most common form of primary intracranial malignancy, among which astrocytomas are the most frequent. Ectodermal-cortex protein 1 (ENC 1), also known as Nuclear Restricted Protein/Brain (NRP/B), was first characterized as a protein which interacts with the cytoskeleton by binding to actin through Kelch-like domains, being related to neural fate specification during development of the nervous system. The first chapter of this thesis confirms ENC1 as a tumor suppression properties by a genomic edition approach, analyses ENC1 expression in a set of patient glioma samples and describes the correlation these data with patients survival and progression-free survival, concluding that ENC1 expression may constitute a biomarker for glioma aggressiveness. The second chapter refers to the identification and in vitro characterization of the LHTNELQ peptide, which was selected by the Phage Display method using human glioblastoma cells. This new peptide is able to be internalized by these cells and features as a new tool for the development of glioma therapeutics. The third chapter report an alternative method to generate growth curves of adherent cell cultures, which is based on the CFSE fluorescence decay over time. It is an alternative method to determine growth curves of cultured cells, with smaller variation among technical replicates than that of counting-based methods. / Gliomas são a forma mais comum de malignidades primárias intracranianas, dentre os quais os astrocitomas são os mais frequentes. A proteína Ectodermal-neural cortex 1 (ENC1), também conhecida como Nuclear Restricted Protein/Brain (NRP/B), foi primeiramente caracterizada como uma proteína que interage com o citoesqueleto por meio de ligação à actina através de domínios Kelch-like, sendo relacionada com diferenciação neuronal durante o desenvolvimento do sistema nervoso. O primeiro capítulo desta tese descreve confirmação da capacidade supressora tumoral de ENC1 por abordagem de edição genômica, analisa a expressão de ENC1 em um conjunto de amostras de pacientes com gliomas e correlaciona esses dados com tempo de sobrevida geral e sobrevida livre de progressão tumoral nos pacientes, concluindo que a expressão de ENC1 pode ser utilizada como um biomarcador da agressividade do glioma. O segundo capítulo apresenta a identificação e caracterização in vitro do peptídeo LHTNELQ, que foi selecionado pela metodologia de Phage display utilizandose de células de glioblastoma humano. Este novo peptídeo é capaz de internalizar-se nestas células e figura como uma nova ferramenta para o desenvolvimento de estratégias terapêuticas para glioblastomas. No terceiro capítulo propõe-se um método alternativo para gerar curvas de crescimento celular de cultura aderente, o qual é baseado no decaimento da fluorescência do reagente CFSE ao longo do tempo. Tratase de um método alternativo para a determinação de curvas de crescimento de culturas aderentes, com menor variação entre as réplicas técnicas do que os métodos baseados em contagem das células.

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