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Valor da captura híbrida para o papilomavírus humano (HPV) no seguimento de pacientes submetidos à conização do colo uterino devido a lesão intraepitelial de alto grau por cirurgia de alta frequência (CAF) / The value of the HPV DNA test on the follow-up of the patients treated for high grade cervical intraepithelial lesions by conization with large loop excision of the transformation zone (LLETZ)

Roncaglia, Maria Teresa 22 May 2012 (has links)
INTRODUÇÃO: A lesão intraepitelial cervical de alto grau causada pelo HPV, precursora do câncer cervical, é facilmente diagnosticada e seu tratamento pode ser realizado de maneira ambulatorial, sem muitas complicações. Mesmo assim, o seguimento das pacientes tratadas deve ser feito de maneira criteriosa e sistemática para que a recorrência ou persistência da doença não passe despercebida. Conseguir identificar o grupo de pacientes com maior probabilidade de recorrência ou persistência da doença facilitaria sobremaneira esse seguimento, diminuindo o ônus econômico e psicológico que o seguimento generalizado produz. O objetivo deste trabalho é identificar marcadores que possam indicar o grupo de pacientes com maior possibilidade de recorrência da lesão intraepitelial cervical de alto grau. MÉTODOS: Neste estudo 114 mulheres com diagnóstico de lesão intraepitelial cervical de alto grau foram submetidas à conização cervical por cirurgia de alta frequência (CAF) no Setor de Patologia do Trato Genital Inferior (PTGI) da Divisão da Clínica Ginecológica do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HC-FMUSP) no período entre março de 2006 e maio de 2009. O seguimento foi realizado a cada seis meses durante o período de 24 meses. No seguimento foi coletada a citologia cervical, captura híbrida para HPV e realizada a colposcopia. Foram avaliados os testes de captura híbrida para HPV coletadas durante o seguimento, imuno-histoquímicos para oncoproteína viral E6 e proteína p16 na peça cirúrgica como possíveis marcadores de recorrência. RESULTADOS: A avaliação anatomopatológica da peça cirúrgica diagnosticou 85 (74,6%) casos de lesão intraepitelial cervical de alto grau e 29 (25,4%) casos de lesão intraepitelial de baixo grau. Nessas peças, 45 (39,5%) apresentaram expressão positiva para oncoproteína E6 e 69 (60,5%) apresentaram expressão negativa para E6; 74 (64,9%) apresentaram expressão positiva para p16 e 40 (35,1%) apresentaram expressão negativa para p16. A oncoproteína E6 não se associou com a apresentação mais grave da doença. Já a proteína p16 esteve positiva em 68 (80%) casos diagnosticados como lesão intraepitelial de alto grau e negativa em 23 (79,3%) casos com diagnóstico anatomopatológico de lesão intraepitelial de baixo grau ou cervicite crônica. A CH coletada no primeiro retorno apresentou sensibilidade de 83,3%, especificidade de 87,8%, VPP de 50% e VPN de 97,3%. Comparando a CH coletada no primeiro retorno com a citologia coletada após os 24 meses de seguimento, a CH apresentou sensibilidade de 75%, especificidade de 83,1%, VPP de 20% e VPN de 98,3%. CONCLUSÕES: A expressão das oncoproteína E6 e proteína p16 na peça cirúrgica não demonstraram ter valor para predizer recorrência no seguimento de pacientes tratadas por lesão intraepitelial cervical de alto grau, mesmo a p16 estando associada à presença de lesões mais graves. A CH pode ser usada como um teste preditivo de recorrência durante o seguimento de pacientes tratadas por lesão intraepitelial de alto grau. O VPN do teste é bastante alto e seu resultado negativo, seis meses após o tratamento indica uma taxa baixíssima de recorrência da doença / INTRODUCTION: The high grade cervical intraepithelial lesion caused by HPV, a pre-malignant condition, is easily diagnosed and its treatment can be done in outpatients without many complications. Nevertheless the patients follow-up must be done in a very systematic way to avoid any recurrence or persistence of the disease. To be able to identify the group of patients with higher rate of recurrence or persistence of the disease would make this follow-up much easier and decrease the economic and psychological burden of stressed outcome. The goal of our study is to identify markers that could indicate the group of patients more likely to recur. METHODS: In this study, 114 women diagnosed with high grade cervical intraepithelial lesion were treated with LLETZ at the Discipline of Gynecology, Faculty of Medicine, São Paulo University from March 2006 and May 2009. The follow-up visits after the treatment included Pap smear, HPV DNA test and colposcopy and occurred every 6 months for 24 months. The markers evaluated were the HPV DNA test collected during the follow-up and immunohistochemical tests performed on the surgical specimen: E6 oncoprotein and protein p16. RESULTS: We found 85 cases (74,6%) of HSIL and 29 cases (25,4%) of LSIL in the surgical specimen obtained with the LLETZ. The E6 oncoprotein was expressed in 45 (39,5%) and not expressed in 69 (60,5%) of the specimen; 74 (64,9%) expressed p16 and 40 (35,1%) didnt express p16. The E6 oncoprotein was not associated with severe presentation of the disease. The protein p16 was positive in 68 (80%) cases of diagnosed HSIL and negative in 23 (79,3%) cases with diagnosed LSIL or chronic cervicitis. The HPV DNA test collected at the first follow-up consult at 6 months presented a sensitivity of 83,3% specificity of 87,8%, positive predictive value (PPV) of 50% and negative predictive value (NPV) of 97,3%. Comparing the HPV DNA test collected at the first follow-up visit and the cervical cytology collected at the fourth and last follow-up visit at 24 months, the HPV DNA test presented a sensitivity of 75%, specificity of 83,1%, PPV of 20% and NPV of 98,3%. CONCLUSIONS: The E6 oncoprotein and protein p16 expression on the surgical specimen were not able to predict recurrence of the disease during the follow-up of the patients. The HPV DNA test can be used as a marker of the recurrence on the follow-up of patients treated for HSIL with LLETZ. The HPV DNA test negative result at the 6 month follow-up visit represents an extremely low recurrence rate
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Eficácia da escovação associada à irrigação oral na manutenção dos tecidos peri-implantares e overdentures estudo clínico randomizado / Effectiveness of brushing associated with oral irrigation in maintenance of peri-implant tissues and overdentures randomized clinical trial

Marcela Moreira Salles 27 January 2017 (has links)
A manutenção das próteses implantossuportadas e da saúde dos tecidos peri-implantares está diretamente relacionada ao sucesso do tratamento reabilitador. O objetivo deste trabalho foi avaliar, por meio de estudo clínico randomizado, a eficácia de um método experimental (escovação associada à irrigação oral), na manutenção dos tecidos peri-implantares e overdentures. Foram analisadas capacidade de remoção de biofilme e manutenção da saúde dos tecidos orais, ação antimicrobiana e satisfação do paciente. Foram selecionados 38 pacientes usuários de prótese total superior convencional e overdenture inferior, retida por implantes ou mini-implantes e sistema de encaixe tipo o\'ring. Os pacientes utilizaram os seguintes métodos: ES (Controle): método mecânico da escovação - escova específica para próteses totais, escova dental de cerdas macias e dentifrício e WP (Experimental): associação da escovação com a irrigação oral (Waterpik). Os pacientes foram orientados a higienizar suas próteses e tecidos peri-implantares, por meio do método da escovação, por 2 minutos, 3 vezes ao dia, sendo que no método experimental, os pacientes utilizaram a irrigação oral, uma vez ao dia, após a escovação, direcionando o jato de água à margem gengival e região dos componentes protéticos das overdentures. Todos os pacientes utilizaram os dois métodos de higiene, em uma sequência aleatória, por um período de 14 dias, com um período intercalado de 7 dias de wash out. As avaliações foram realizadas antes (baseline) e após a utilização de cada método. A capacidade de remoção de biofilme e a manutenção da saúde oral dos tecidos foram avaliadas por meio do Índice de Placa Modificado (IP), Índice Gengival (IG), Profundidade de Sondagem (PS) e Índice de Sangramento à Sondagem (SS). Para a análise da ação antimicrobiana, o biofilme subgengival foi coletado por meio de cones de papel e biofilme presente nos componentes das overdentures por meio de microbrush, e as amostras coletadas foram processadas pela técnica de hibridização DNA Checkerboard (39 espécies microbianas avaliadas). Os pacientes responderam a um questionário específico por meio de Escala Visual Analógica (EVA) de 100,0 mm, após o uso de cada método. Os dados relacionados aos parâmetros clínicos e à ação antimicrobiana foram analisados por meio do teste de Friedman (&alpha;=0,05), seguido de comparações realizadas por meio do teste de Wilcoxon; as comparações entre implantes convencionais e mini-implantes foram realizadas por meio do teste de Mann-Whitney (&alpha;=0,05). A análise das respostas ao questionário de satisfação foi realizada por meio do teste de Wilcoxon (&alpha;=0,05). Os resultados mostraram que, quanto aos parâmetros clínicos, houve diferença estatisticamente significante entre os valores obtidos no baseline e os valores após os métodos avaliados (p<0,001); entre os métodos ES e WP, não houve diferença significante (IP, IG e PS: p=1,000; SS: p=0,828); houve diferença estatisticamente significante entre os diferentes tipos de implantes apenas do IP após ES (p<0,05). Houve diferença estatisticamente significante entre os métodos (p<0,05), quando comparados os valores da quantidade total de células microbianas presentes no biofilme subgengival, sendo WP mais efetivo que ES (p<0,05), porém não houve diferença entre baseline e WP (p>0,05); considerando os micro-organismos avaliados, WP promoveu redução mais efetiva que ES apenas da espécie C. rectus (p=0,001). A quantidade total de células microbianas presentes nos componentes das overdentures nas avaliações foi semelhante (p=0,607) e a microbiota identificada apresentou-se qualitativamente semelhante após cada um dos métodos. Não houve diferença estatisticamente significante entre os diferentes tipos de implantes quanto ao total de células microbianas presentes no sulco peri-implantar e nos componentes das overdentures, identificadas em cada uma das avaliações (p>0,05). As médias das respostas ao questionário de satisfação após ambos os métodos foram altas (acima de 80,0 mm) para todas as questões, porém não houve diferença estatisticamente significante entre as respostas dadas após o uso de ES e WP (p>0,05). Concluiu-se que o método experimental foi eficaz na redução dos parâmetros clínicos avaliados; apresentou ação antimicrobiana mais efetiva na redução da quantidade total de micro-organismos presentes no biofilme subgengival; porém, não apresentou ação antimicrobiana frente aos micro-organismos presentes nos componentes protéticos das overdentures; e proporcionou alto nível de satisfação do paciente. / The maintenance of implant-supported prostheses and peri-implant health is directly related to the success of rehabilitation treatment. The aim of this study was to evaluate, through randomized clinical trial, the efficacy of an experimental method (brushing associated with oral irrigation) in the maintenance of the peri-implant tissues and overdentures. Biofilm removal capacity and oral tissues health maintenance, antimicrobial action and patient satisfaction were analyzed. Thirty-eight patients, users of conventional maxillary complete denture and mandibular overdenture retained by implants or mini-implants and o\'ring-retained system, were selected. The patients utilized the following methods: MB (Control): mechanical brushing method specific brush for dentures, soft bristle toothbrush and dentifrice, and WP (Experimental): association of mechanical brushing with oral irrigation (Waterpik). Patients were instructed to clean their dentures and peri-implant tissues, by means of brushing method for 2 minutes, 3 times a day, and in the experimental group, patients used the oral irrigation, once a day, after brushing, directing the water jet to the gingival margin and the region of the prosthetic components of the overdentures. All patients used both hygiene methods in a random sequence for a period of 14 days, with a 7-day wash-out interposed period. The evaluations were performed before (baseline) and after using each method. Biofilm removal capacity and oral tissues health maintenance were evaluated through Modified Plaque Index (PI), Gingival Index (GI), Probing Depth (PD), and Bleeding on Probing Index (BP). For the antimicrobial action analysis, the subgingival biofilm was collected by means of sterile paper cones and the biofilm present on the overdentures components by microbrush, and the collected samples were processed by the Checkerboard DNA hybridization technique (39 microbial species evaluated). Patients answered to a specific questionnaire using the Visual Analogue Scale (VAS) of 100.0 mm, after application of each method. The data related to clinical parameters and antimicrobial activity were analyzed using the Friedman test (&alpha;=0.05), followed by comparisons using the Wilcoxon test; comparisons between conventional implants and mini-implants were performed using the Mann-Whitney test (&alpha;=0.05). The analysis of the satisfaction questionnaire responses was performed using the Wilcoxon test (&alpha;=0.05). The results showed that, regarding clinical parameters, there was a statistically significant difference between the values obtained at baseline and the values after the evaluated methods (p<0.001); between the MB and WP methods there was no significant difference (PI, GI and PD: p=1.000; BP: p=0.828); there was a statistically significant difference between the different types of implants only of PI after MB (p<0.05). There was a statistically significant difference between the methods (p<0.05) when comparing the values of the total amount of microbial cells in the subgingival biofilm, WP being more effective than MB (p<0.05), but there was no difference between baseline and WP (p>0.05); considering the evaluated microorganisms, WP promoted a more effective reduction than MB only of the C. rectus species (p=0.001). The total amount of microbial cells present in the components of overdentures in the evaluations was similar (p=0.607) and the identified microbiota appeared qualitatively similar after each method. There was no statistically significant difference between the different types of implants for the total microbial cells in the peri-implant sulcus and in the overdentures components identified in each of the evaluations (p>0.05). The means of the satisfaction questionnaire responses after both methods were high (above 80.0 mm) for all the questions, but there was no statistically significant difference between the answers given after the use of ES and WP (p>0.05). It was concluded that the experimental method was effective in reducing the clinical parameters evaluated; presented more effective antimicrobial action in reducing the total amount of microorganisms present in the subgingival biofilm; however, showed no antimicrobial action against microorganisms present in the prosthetic components of the overdentures; and provided high level of patient satisfaction.
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Adesão ao método de auto coleta para rastreio de lesões precursoras do câncer do colo do útero

Oliveira, Rebecca Guimarães January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2011-11-09T14:45:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1648 bytes, checksum: e095249ac7cacefbfe39684dfe45e706 (MD5) 000238.pdf: 759139 bytes, checksum: d93f97e93a35ffbd923409758cca2b7b (MD5) Previous issue date: 2008 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Fernandes Figueira. Departamento de Ensino. Programa de Pós-Graduação em Saúde da Criança e da Mulher. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A citologia convencional apresenta importantes limitações em relação a sua sensibilidade e cobertura populacional, o que limita a maior redução das taxas de mortalidade por câncer de colo do útero. Por estas razões, métodos diagnósticos moleculares como a Captura Híbrida têm sido apontados como possíveis substitutos ou complementos do rastreio primário do câncer cervical. O objetivo desse estudo foi investigar a adesão de uma população feminina, residente da comunidade do Morro dos Macacos, Vila Isabel, Rio de Janeiro, ao método da autocoleta da Captura Híbrida em comparação ao método da citologia oncótica cervical. Realizamos um ensaio clínico controlado randomizado no qual mulheres recrutadas através de visitas domiciliares foram aleatoriamente alocadas para autocoleta da CH (51%) ou para realização da citologia (49%). Nossa amostra foi constituída por 100 mulheres e verificamos que a adesão entre as pacientes que receberam o kit da autocoleta da CH foi significativamente maior do que a adesão entre as pacientes convidadas para realizar a citologia (68,6% e 32,7% respectivamente; p < 0,001). Os dados aqui apresentados apontam a autocoleta da CH como uma possibilidade de atingir mulheres resistentes ou que têm dificuldade de acesso aos programas de rastreio do câncer do colo do útero baseados na citologia. / The Pap smears has major limitations on its sensitivity and coverage, which limits the greatest reduction in mortality rates of cervical cancer. For these reasons, molecular diagnostic methods such as Hybrid Capture have been mentioned as possible substitutes or additions of primary screening of cervical cancer. The aim of the present investigation was to examine the adhesion of a female population, living in the community of the Morro dos Macacos, Vila Isabel, Rio de Janeiro, for self-collection of specimens for Hybrid Capture compared to the Pap smear. We performed a randomized controlled clinical trial in which women were recruited through home visits and randomly allocated to self-collection samples (51%) or for the Pap smear (49%). A hundred women participated and the adhesion between the patients who were allocated to self-collection was significantly higher than among patients invited to be submitted Pap smear (68.8% and 32.7% respectively; p < 0.001). Our findings suggest the self-collection of specimens for Hybrid Capture can be an opportunity to reach women who are resistant or have difficulty of access to cervical cancer prevention programs based on cytology.
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Avaliação clínica e microbiológica periodontal de crianças e adolescentes sob terapia ortodôntica com aparelhos fixos ou removíveis /

Rêgo, Rodrigo Otávio Citó César. January 2004 (has links)
Orientador: Joni Augusto Cirelli / Banca: José Eduardo Cezar Sampaio / Banca: Ary dos Santos Pinto / Banca: Maria Mônica Studart Gurgel Mendes Moreira / Banca: Márcia Pinto Alves Mayer / Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar os parâmetros clínicos e microbiológicos periodontais de crianças e adolescentes sob terapia ortodôntica com aparelho fixo ou removíveis. Trinta indivíduos (14,5l1,7 anos - Grupo FIX) que utilizavam aparelhos fixos e 18 que utilizavam aparelho extra bucal removível ou placa de Hawley há pelo menos 6 meses (9,6 l 1,5 anos - Grupo REM) foram comparados a dois grupos controle, constituídos por indivíduos da mesma idade (14,2 l 1,7 anos - Grupo C-FIX e 9,3 l 1,9 anos - Grupo C-REM) que não utlizavam esses dispositivos. Foi analisada a presença de placa bacteriana visível (IP), sangramento gengival (IG), profundidade de sondagem (PS) e perda de inserção clínica (PIC). Amostras de placa bacteriana subgengival foram coletadas e analisadas por meio de sondas de oligonucleotídeos para A. actinomycetemcomitans (Aa), C. rectus, Capnocytophaga sp. E. corrodens, F. nucleatum, F. vincentii, M. micros, Neisseriaceae., P. gingivalis, P. intermedia, espiroquetas, T. forsythensis e Treponema sp. Diferenças significantes (p<0,05) foram observadas entre os grupos FIX e C-FIX quanto aos parâmetros IP (66,8% e 47,7%), IG (43% e 15,6%), e para as prevalências de todas as bactérias avaliadas, exceto as da familia Neisseriaceae. Entre dentes bandados e seus análogos no grupo controle foram encontradas diferenças significantes para os parâmetros PV (80,3% e 58,8%), SM (64,3% e 20,6%) e PS (2,9 mm e 2,5 mm), respectivamente. Entre os grupos REM e C-REM, essas diferenças também foram observadas para IP (58,7% e 14,3%) e IG (19,8% e 8,8%) e para as prevalências de Aa, C. rectus, E. corrodens, Neisseriaceae e espiroquetas. Entre os dentes retentores de grampo e seus análogos no grupo controle verificou-se diferenças significantes para IP (77,8% e 31,3%). Não foi verificado aumento da PS associado a PIC. Também foi avaliada a... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: The purpose of this study was to compare clinical and microbiological parameters in children and adolescents with and without fixed or removable orthodontic appliances. Thirty subjects (mean age 14.5l1.7 years) treated with fixed appliances and 18 treated with removable appliances for at least 6 months were selected as test groups, FIX and REM, respectively. The control groups were comprised of 30 subjects (mean age 14.2l1.7 years - Group C-FIX) and 18 subjects (mean age 9.3l1.9 years - Group C-REM) that did not receive orthodontic treatment. Clinical evaluations were made for plaque index (PI), gingival index (GI), probing depth (PD) and clinical attachment loss (CAL). Subgingival plaque samples were collected from the patients and analyzed by oligonucleotide probes for the presence of A. actinomycetemcomitans (Aa), C. rectus, Capnocytophaga sp. E. corrodens, F. nucleatum, F. vincentii, M. micros, Neisseriaceae., P. gingivalis, P. intermedia, spirochetes, T. forsythensis and Treponema sp. Additionally, two subgingival dental plaque samples from one subject of each test group were further analyzed by cloning and sequencing the amplified 16S rDNA. Significant differences were noted between FIX and C-FIX for PI (66.8% versus 47.7%), GI (43.8% versus 15.6%) and between the banded teeth in the FIX group and the analogous teeth in the C-FIX group for PI (80.3% versus 58.8%), GI (64.3% versus 20.6%) and PD (2.9 mm versus 2.5 mm). Significant differences were noted between FIX and C-FIX for all targeted bacteria but Neisseriaceae. Results: Significant differences were also noted between REM and C-REM for PI (58.7% versus 14.3%) and GI (19.8% versus 8.8%) and between the clasped teeth in the test group and the analogous teeth in the control group for PI (77.8% versus 31.3%). Significant differences were noted between the REM and C-REM for Aa... (Complete abstract, click electronic address below). / Doutor
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Detecção e distribuição genotípica do Papilomavírus humano (HPV) nos carcinomas anais / Detection and genotypic distribution of human Papillomavirus (HPV) in anal carcinomas

Libera, Larisse Silva Dalla 29 March 2016 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-09-15T13:30:32Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Larisse Silva Dalla Libera - 2016.pdf: 2593854 bytes, checksum: 6b47c9f7567c45f8cd463c53b5b7b129 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-09-15T13:31:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Larisse Silva Dalla Libera - 2016.pdf: 2593854 bytes, checksum: 6b47c9f7567c45f8cd463c53b5b7b129 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T13:31:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Larisse Silva Dalla Libera - 2016.pdf: 2593854 bytes, checksum: 6b47c9f7567c45f8cd463c53b5b7b129 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-03-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Anal cancer incidence is increasing significantly, especially when associated with the Human papillomavirus (HPV). The objective of this study was to evaluate the clinicopathological aspects of anal cancers and their association with HPV detection and genotypic distribution. It was a retrospective epidemiological study, with the use of the clinicopathological secondary data and molecular analyses of specimens of anal cancers embedded in paraffin blocks, diagnosed in a reference institution in the treatment of cancer at the Centro-Oeste region in a period of ten years (2000-2010). It was initially consulted a list of 140 cases of anal cancers but only 81 were included in the study. Molecular analysis included the amplification and detection of a viral genome fragment, by using PCR (polymerase chain reaction), and genotyping by reverse hybridization, using the commercial kit INNO LiPA. Data analysis was performed by descriptive statistics, univariate analysis and survival. According to the cases evaluated (n 81), 53.1% were more than 61 years of age, and the majority (63%) were females; 51.9% (n 42) presented squamous cells carcinoma (SCC). Lymph node metastases were described in 25.9%, distant metastases in 8.6% being the liver and the lung the most affected organs, the death was recorded in 45 cases (55.6%). HPV DNA was positive in 69% of cases. In the analysis by histologic type, 88.1% of squamous cell carcinomas (SCC), and 43.8% of adenocarcinomas was positive for viral DNA. The ECC was associated with HPV (p 0.0001) as well as females (p 0.01). Multiple infections were detected in 14.3% of the cases. The most prevalent genotypes were HPV16, HPV33 and HPV18. HPV 16 was found in 100% of multiple infections. After five years, overall survival was 44.3% for the group, the prognostic factors worse were female sex (p 0.008), squamous cell carcinoma (p 0.01) and the presence of distant metastasis (p 0. 01). Survival was not influenced by the presence of HPV (p 0.54). The aggressiveness of anal cancer described in this study reinforces the need of prevention strategies for this type of disease, including the HPV vaccine. / A incidência do câncer anal vem aumentando significativamente, principalmente quando associado ao Papilomavírus humano (HPV). O objetivo deste estudo foi avaliar os aspectos clínicopatológicos dos cânceres anais e suas associações com a detecção e distribuição genotípica do HPV. Trata-se de um estudo epidemiológico transversal retrospectivo, com a utilização dos dados clínicopatológicos secundários e análises moleculares de espécimes de cânceres anais contidos em blocos de parafina, diagnosticados em uma instituição de referência no tratamento de câncer na região Centro-Oeste em um período de dez anos (2000-2010). Inicialmente foi consultada uma lista com 140 casos de cânceres anais mas apenas 81 cumpriram os critérios de inclusão e exclusão e foram incluídos no estudo. A análise molecular incluiu a amplificação de um fragmento do genoma viral por PCR (reação em cadeia da polimerase) e hibridização reversa, com o uso do kit comercial INNO LiPA. A análise dos dados foi feita por estatística descritiva, análise univariada e de sobrevida. Do número de casos avaliados (n 81), 53,1% tinham mais que 61 anos de idade e a maior parte (63%) foram mulheres; 51,9%(n 42) apresentavam câncer anal de células escamosas (CCE). Metástases linfonodais foram descritas em 25,9%, metástases a distância em 8,6% sendo o fígado e o pulmão os órgãos mais acometidos e o óbito foi registrado em 45 casos (55,6%). A detecção de DNA do HPV foi positiva em 69% dos casos. Na ánalise por tipo histológico, 88,1% dos carcinomas de células escamosas (CCE) e 43,8% dos adenocarcinomas foram positivos para o DNA viral. O CCE foi associado ao HPV (p 0,0001) assim como o sexo feminino (p 0,01). Infecções múltiplas foram detectadas em 14,3% dos casos. Os genótipos mais prevalentes foram o HPV16, 33 e 18. O HPV 16 esteve presente em 100% das infecções múltiplas. A sobrevida global em 60 meses foi de 44,3%, os fatores de pior prognósticos foram o sexo feminino (p 0,008), o carcinoma de células escamosas (p 0,01) e a presença de metástase à distância (p 0,01). A sobrevida não foi influenciada pela presença do HPV (p 0,54). A agressividade dos cânceres anais descritos neste trabalho reforça a necessidade de estratégias de prevenção para esses cânceres, incluindo a vacina contra HPV.
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Valor da captura híbrida para o papilomavírus humano (HPV) no seguimento de pacientes submetidos à conização do colo uterino devido a lesão intraepitelial de alto grau por cirurgia de alta frequência (CAF) / The value of the HPV DNA test on the follow-up of the patients treated for high grade cervical intraepithelial lesions by conization with large loop excision of the transformation zone (LLETZ)

Maria Teresa Roncaglia 22 May 2012 (has links)
INTRODUÇÃO: A lesão intraepitelial cervical de alto grau causada pelo HPV, precursora do câncer cervical, é facilmente diagnosticada e seu tratamento pode ser realizado de maneira ambulatorial, sem muitas complicações. Mesmo assim, o seguimento das pacientes tratadas deve ser feito de maneira criteriosa e sistemática para que a recorrência ou persistência da doença não passe despercebida. Conseguir identificar o grupo de pacientes com maior probabilidade de recorrência ou persistência da doença facilitaria sobremaneira esse seguimento, diminuindo o ônus econômico e psicológico que o seguimento generalizado produz. O objetivo deste trabalho é identificar marcadores que possam indicar o grupo de pacientes com maior possibilidade de recorrência da lesão intraepitelial cervical de alto grau. MÉTODOS: Neste estudo 114 mulheres com diagnóstico de lesão intraepitelial cervical de alto grau foram submetidas à conização cervical por cirurgia de alta frequência (CAF) no Setor de Patologia do Trato Genital Inferior (PTGI) da Divisão da Clínica Ginecológica do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HC-FMUSP) no período entre março de 2006 e maio de 2009. O seguimento foi realizado a cada seis meses durante o período de 24 meses. No seguimento foi coletada a citologia cervical, captura híbrida para HPV e realizada a colposcopia. Foram avaliados os testes de captura híbrida para HPV coletadas durante o seguimento, imuno-histoquímicos para oncoproteína viral E6 e proteína p16 na peça cirúrgica como possíveis marcadores de recorrência. RESULTADOS: A avaliação anatomopatológica da peça cirúrgica diagnosticou 85 (74,6%) casos de lesão intraepitelial cervical de alto grau e 29 (25,4%) casos de lesão intraepitelial de baixo grau. Nessas peças, 45 (39,5%) apresentaram expressão positiva para oncoproteína E6 e 69 (60,5%) apresentaram expressão negativa para E6; 74 (64,9%) apresentaram expressão positiva para p16 e 40 (35,1%) apresentaram expressão negativa para p16. A oncoproteína E6 não se associou com a apresentação mais grave da doença. Já a proteína p16 esteve positiva em 68 (80%) casos diagnosticados como lesão intraepitelial de alto grau e negativa em 23 (79,3%) casos com diagnóstico anatomopatológico de lesão intraepitelial de baixo grau ou cervicite crônica. A CH coletada no primeiro retorno apresentou sensibilidade de 83,3%, especificidade de 87,8%, VPP de 50% e VPN de 97,3%. Comparando a CH coletada no primeiro retorno com a citologia coletada após os 24 meses de seguimento, a CH apresentou sensibilidade de 75%, especificidade de 83,1%, VPP de 20% e VPN de 98,3%. CONCLUSÕES: A expressão das oncoproteína E6 e proteína p16 na peça cirúrgica não demonstraram ter valor para predizer recorrência no seguimento de pacientes tratadas por lesão intraepitelial cervical de alto grau, mesmo a p16 estando associada à presença de lesões mais graves. A CH pode ser usada como um teste preditivo de recorrência durante o seguimento de pacientes tratadas por lesão intraepitelial de alto grau. O VPN do teste é bastante alto e seu resultado negativo, seis meses após o tratamento indica uma taxa baixíssima de recorrência da doença / INTRODUCTION: The high grade cervical intraepithelial lesion caused by HPV, a pre-malignant condition, is easily diagnosed and its treatment can be done in outpatients without many complications. Nevertheless the patients follow-up must be done in a very systematic way to avoid any recurrence or persistence of the disease. To be able to identify the group of patients with higher rate of recurrence or persistence of the disease would make this follow-up much easier and decrease the economic and psychological burden of stressed outcome. The goal of our study is to identify markers that could indicate the group of patients more likely to recur. METHODS: In this study, 114 women diagnosed with high grade cervical intraepithelial lesion were treated with LLETZ at the Discipline of Gynecology, Faculty of Medicine, São Paulo University from March 2006 and May 2009. The follow-up visits after the treatment included Pap smear, HPV DNA test and colposcopy and occurred every 6 months for 24 months. The markers evaluated were the HPV DNA test collected during the follow-up and immunohistochemical tests performed on the surgical specimen: E6 oncoprotein and protein p16. RESULTS: We found 85 cases (74,6%) of HSIL and 29 cases (25,4%) of LSIL in the surgical specimen obtained with the LLETZ. The E6 oncoprotein was expressed in 45 (39,5%) and not expressed in 69 (60,5%) of the specimen; 74 (64,9%) expressed p16 and 40 (35,1%) didnt express p16. The E6 oncoprotein was not associated with severe presentation of the disease. The protein p16 was positive in 68 (80%) cases of diagnosed HSIL and negative in 23 (79,3%) cases with diagnosed LSIL or chronic cervicitis. The HPV DNA test collected at the first follow-up consult at 6 months presented a sensitivity of 83,3% specificity of 87,8%, positive predictive value (PPV) of 50% and negative predictive value (NPV) of 97,3%. Comparing the HPV DNA test collected at the first follow-up visit and the cervical cytology collected at the fourth and last follow-up visit at 24 months, the HPV DNA test presented a sensitivity of 75%, specificity of 83,1%, PPV of 20% and NPV of 98,3%. CONCLUSIONS: The E6 oncoprotein and protein p16 expression on the surgical specimen were not able to predict recurrence of the disease during the follow-up of the patients. The HPV DNA test can be used as a marker of the recurrence on the follow-up of patients treated for HSIL with LLETZ. The HPV DNA test negative result at the 6 month follow-up visit represents an extremely low recurrence rate
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Smart plasmonic Lab-On-a-Chip System for DNA-based biosensing / Bio-détection plasmonique à ADN sur laboratoire sur puce

Wu, Tzu-Heng 20 March 2017 (has links)
Dans cette thèse, nous nous intéressons à la problématique de l’intégration de capteurs plasmoniques performants et bas coût sur des dispositifs de type smartphone, en vue d’applications de diagnostic biomédical. A cette fin, nous proposons deux biocapteurs « smart ». Premièrement, un système de détection colorimétrique à base de nanoparticules d’or est mis en œuvre pour détecter de l’ADN. Le système intègre une détection synchrone logicielle mise en œuvre au sein du smartphone, où les signaux physiques transitent par la voie audio. Le processus de diagnostic prend moins de 15 minutes pour une limite de détection de 0.77 nM, approximativement 6 fois meilleure que la sensibilité usuelle d’un spectromètre UV-Vis conventionnel, à temps de mesure identique. Dans une seconde partie, un capteur à résonance plasmon de surface en configuration de Kretschmann, se distinguant par une sensibilité à la phase optique, est développé. Le design monolithique et compact repose sur un interféromètre à dédoublement latéral et une modulation de phase. Le contrôle et la lecture du prototype s’effectue également par smartphone. La modulation de phase est de type sinusoïdale et une sensibilité importante est obtenue, autour de 2,3 10-6 RIU avec une dynamique de 7 10-3 RIU, chiffres obtenus pour une puce optique standard et un temps d’intégration de 100 ms. Ce second dispositif est ensuite testé pour la détection de protéines (Troponine I cardiaque), en fonctionnalisant la surface par ADN Tro4 / In this thesis, we investigate the possibility and potential for integration of portable optical biosensor for diagnostic purposes. To this end, we propose two “smart” biosensor systems. In the first part of this thesis, a DNA biosensor combining single-wavelength colorimetry and digital Lock-in Amplifier within a smartphone is proposed. Utilizing full advantage of audio channel and digital signal processing capacity of a smartphone, we have built a handheld DNA AuNp colorimetry biosensor. Based on the results, the diagnostic process takes only 15 minutes of reaction time while offering a limit of detection around 0.77 nM which is 6 times better than a desktop UV-Vis spectrometer.In second part of the thesis, a Shearing interferometer based Surface Plasmon Resonance (SiSPR) biosensor is proposed. SiSPR allows for phase sensitive detection on conventional Kretschmann configuration. Its monolithic design reduces optical parts, costs and allows portable application. The essence of SiSPR is a reflective layer in addition to plasmonic layer. To extract phase information from SiSPR, a sinusoidal phase modulation is achieved by modulation of the laser injection current. For a 100 ms measurement and a standard optical chip, the sensitivity of the SiSPR is around 2.3x10-6 RIU with a dynamic range of 7.0x10-3 RIU, which is better than amplitude SPR devices. Finally, Tro4 DNA surface modification on the SiSPR chip is demonstrated for future cardiac Troponin I diagnostic
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Identification of H. Pylori in Saliva by a Nested PCR Assay Derived From a Newly Cloned DNA Probe

Jiang, C, Li, C, Ha, T, Ferguson, D. A., Chi, D. S., Laffan, J. J., Thomas, E. 01 June 1998 (has links)
A novel probe was developed from genomic DNA of Helicobacter pylori ATCC type strain 43629. It hybridized with all 73 H. pylori clinical isolates tested but not with any of 183 non-H. pylori DNAs in dot blot hybridization. Typing tests revealed 41 different HaeIII-digestion patterns from 57 H. pylori strains tested. Based on the sequence of the probe, a nested PCR was developed that detected as little as 2 fg of H. pylori DNA or approximately equivalent to one cell. No PCR products were amplified from any of 21 non-H. pylori strains tested. Using this nested PCR, H. pylori DNA was detected in 33 of 45 (73%) saliva samples collected from patients with gastric H. pylori infection. These data suggest that the probe is useful for typing H. pylori and that the nested PCR is a valuable tool for detecting H. pylori DNA in saliva.
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DNA vazebné vlastnosti proteinů rodiny CSL ve Schizosaccharomyces pombe / DNA-binding properties of the CSL proteins of Schizosaccharomyces pombe

Ptáčková, Martina January 2010 (has links)
As the effector component of the Notch signaling pathway the transcription factors of the CSL family (CBF1/RBP-Jκ/Suppressor of Hairless/Lag-1) are essential for many developmental processes in metazoan organisms, but they can function also independently of Notch. Recently, their presence was proved in fungal organisms lacking the Notch pathway as well as most of the known metazoan interacting partners. Cbf11 and Cbf12, the CSL proteins of the unicellular yeast Schizosaccharomyces pombe, were determined experimentally as non-essential nuclear transcription factors, which regulate cell adhesion, extracellular material production, colony morphology, septation and daughter cell separation, coordination of nuclear and cell division, and ploidy maintenance in an antagonistic way. The responsive genes of these factors are not known yet. In this study, genes of S. pombe, whose promoter regions represent potential direct targets for the Cbf proteins binding, were predicted. The binding of the Cbf11 and Cbf12 proteins, and of a truncated version Cbf12∆N to CSL response elements contained in the regulatory regions of selected S. pombe genes was tested in vitro by EMSA, and consequently, in the case of the Cbf11 protein, also in vivo by ChIP. Cbf11 and Cbf12∆N recognize specifically the response elements in...

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