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Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteína

Oliveira, Ronaldo Junio de [UNESP] 01 August 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-01Bitstream added on 2014-06-13T20:01:01Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_rj_dr_sjrp.pdf: 3645510 bytes, checksum: 181949bcc7d9fbd2c0929fdd73a9cf0a (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A difusão desempenha um papel importante na cinética de eno-velamento de proteínas. Nessa tese, desenvolvemos métodos analíticos e computacionais para o estudo do coeficiente de difusão dependente da posi-ção e do tempo. Para estes estudos, utilizou-se sobretudo o modelo baseado na estrutura (modelo G¯o) via simulação computacional da representação em carbonos alfa. Investigou-se o efeito da difusão no enovelamento da proteína cold-shock (TmCSP). Encontrou-se que o efeito temporal da difusão leva a cinéticas não-exponenciais e a estatística não-poissônica da distribuição de tempos de enovelamento. Com relação a dependência com a posição, o coeficiente de difusão revelou ter um comportamento não-monotônico que foi compreendido pela análise dos valores- e da entropia residual no estado nativo. Para uma versão frustrada do modelo, encontrou-se que um baixo nível de frustração energética aumenta a difusão no estado nativo e torna o estado de transição mais homogêneo. Esses resultados corroboram com experimentos recentes de fluorescência de uma única molécula. Esse trabalho também propõe um método para a determinação da superfície de energia de enovelamento de proteína. A partir da caracterização da superfície de energia, definimos a quantidade (LD – Landscape Descriptor) que mostrou uma forte correlação entre a cinética e a termodinâmica de uma dezena de proteínas globulares, tornando-se um método útil para classificar proteínas / Diffusion plays an important role in protein folding kinetics. In this thesis we developed analytical and computational methods in order to study the diffusion coefficient dependent on position and time. For these studies we used mainly the structure-based model (G¯o model) via computer simulation of the alpha-carbon representation. We investigated the effect of diffusion in the folding of the cold-shock protein (TmCSP). We found that the time dependence on diffusion leads to non-exponential kinetics and non-Poisson statistics of folding time distribution. With respect to the position dependence, the diffusion coefficient reveled a non-monotonic behavior that was understood by analyzing the -values and the residual entropy in the native state. For a frustrated version of the model, we found that a low level of frustration energy stabilizes and increases the diffusion in the native state and the transition state becomes more homogeneous. These results are supported by recent single-molecule fluorescence experiments. This work also proposes a method to determine the protein folding energy landscape. With the energy landscape characterized, we defined the quantity (LD – Landscape Descriptor) which showed a strong correlation between kinetics and thermodynamics of a dozen globular proteins making it a useful method to classify proteins
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Peptídeos cíclicos em espécies do semiárido brasileiro e uma cultivada: caracterização e atividade biológica

Pinto, Meri Emili Ferreira [UNESP] 24 September 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-09-24Bitstream added on 2014-08-13T18:01:03Z : No. of bitstreams: 1 000747389.pdf: 4914750 bytes, checksum: f03c9a011f9843bf09e773fa2716e773 (MD5) / O Brasil tem uma das maiores biodiversidades do mundo, no entanto poucos peptídeos derivados de plantas tem sido estudados desse bioma, constituindo uma rica fonte para buscar peptídeos com características estruturais e funções ecológicas interessantes. Neste estudo são descritos a investigação de orbitídeos e ciclotídeos em 24 espécies vegetais. Os orbitídeos referem-se a todos os peptídeos cíclicos ciclizados N-C que não apresentam ligação dissulfeto. Os ciclotídeos, grupo de mini- proteínas caracterizam-se por apresentar uma estrutura (CCK ) conferindo –lhes uma notável estabilidade. Após a análise específica para estes compostos, foi possível selecionar três espécies para prosseguir com os estudos de isolamento: J. ribifolina , H. calceolaria e B. vulgaris . J. ribifolia ( Pohl ) Baill ( syn. Adenoropium ribifolium Pohl, J. gossypifolia var. ribifolia ( Pohl ) Müll. ), conhecida como pinhão -manso e pinhão rasteiro, é um arbusto da família Euphorbiaceae, que geralmente cresce na região semi-árida do nordeste brasileiro. Plantas do gênero Jatropha, compreendem cerca de 175 espécies, ricas em compostos bioativos, como alcalóides, terpenos, lignanas, flavonóides e orbitídeos. A partir dos extratos etanólico de J. ribifolia, coletada no Estado da Paraíba, um novo octapeptídeo cíclico foi isolado por métodos cromatográficos, incluindo HPLC. A análise conformacional foi estabelecida por dados de RMN e dinâmica molecular. A síntese desse orbitídeo foi realizada por síntese em fase sólida (SPPS)-Fmoc/tBu. As atividades antimicrobiana, citotóxica e antimalárica foram avaliadas, para ambas as formas: circular e seu análogo linear sintéticos. Ribifolina (IC50 41,92 mM) foi moderadamente eficaz contra a o Plasmodium falciparum 3D7, mas seu análogo linear (IC50 519μmol / L) mostrou-se fraco em inibir a sobrevivência do parasita. Estes compostos não apresentam qualquer citotoxicidade contra... / Brazil has one of the largest biodiversity in the world, however only a few plant-derived peptides have been studied from our biomes, constituting a rich source of peptides with interesting structural features and ecological functions, and so far, with potential pharmacological properties. In this study are described the investigation of orbitides and cyclotides in 24 species from plants. The orbitides refer to all N-to-C cyclized peptides from plants that do not contain disulfides and cyclotides, mini-proteins group characterized by a cyclic topology, collectively known as cyclic cystine motif (CCK) conferring them with remarkable stability. After the specific analysis for these compounds, was possible to select three species for to isolated your peptides: J. ribifolina, H. calceolaria e B. vulgaris. J. ribifolia (Pohl) Baill (syn. Adenoropium ribifolium Pohl, J. gossypifolia var. ribifolia (Pohl) Müll.), known as “pinhão-manso” and “pinhão rasteiro”, is a shrub of the Euphorbiaceae family that commonly grows in the semiarid region of northeastern Brazil. Plants of the genus Jatropha, which comprises approximately 175 species, have been established as a rich source of bioactive compounds such as alkaloids, terpens, lignans, flavonoids and cyclic peptides, so called orbitides. From the EtOH extracts of the J. ribifolia, collected in the states of Paraíba, an octapeptide cyclic, was isolated by a multi-step chromatography procedures, including HPLC. Conformational analysis of these peptides has been evaluated by using of NMR experiments and simulated annealing molecular dynamics. The synthesis of the new cyclic peptides were accomplished by solid-phase peptide synthesis (SPPS)-Fmoc/tBu. The antimicrobial, citotoxity and antimalarial activities are being evaluated for both the circular and linear synthetic form of the novel orbitide from J. ribifolia. Ribifolin (IC50 41.92 μM) was moderately effective against the Plasmodium...
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Verificação automática da malha viária georreferenciada em imagens digitais

Silva, Marco Aurélio Oliveira da [UNESP] January 2005 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005Bitstream added on 2014-06-13T19:50:21Z : No. of bitstreams: 1 silva_mao_me_prud_prot.pdf: 2133151 bytes, checksum: a54be88723cd614f467fb0f56a173b46 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este trabalho propõe uma solução para o problema de verificação automática da malha viária georreferenciada em imagens aéreas digitais. O método proposto baseia-se em duas etapas básicas, isto é: 1- Extração automática de rodovias georreferenciadas; e 2- Análise de consistência das rodovias extraidas. Na primeira etapa, a metodologia para a extração de rodovias baseada no algoritmo de programação dinâmica é utilizada para a extração automática das rodovias georreferenciadas. O método é inicializado a partir da projeção de pontos salientes extraidos automaticamente ao longo destas rodovias para o espaço Imagem. Estes pontos descrevem grosseiramente a forma, a posição, e a topologia das rodovias georreferenciadas. Além disso, a precisão dos pontos transformados para o espaço imagem é também estimada, o que possibilita a definição automática das janelas debusca utilizadas pelo algoritmo de programação dinâmica. A análise de consistência das rodovias extraidas baseia-se num modelo de erro que permite concluir estatisticamente se as rodovias extraidas não discrepam significativamente das correspondentes projetadas na imagem. Os resultados obtidos mostram...
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Controle das propriedades dinâmicas de sistemas mecânicos através da utilização de molas inteligentes

Castilho Filho, Edson Luiz Valverde [UNESP] 31 August 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-05-17T16:51:30Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-31. Added 1 bitstream(s) on 2016-05-17T16:55:10Z : No. of bitstreams: 1 000864230.pdf: 1866850 bytes, checksum: 9ad28107377e11f0b8e5361f14581a46 (MD5) / Os sistemas produtivos modernos requerem, cada vez mais, confiabilidade e bom desempenho de seus equipamentos que, ao apresentarem níveis de vibração elevados, tendem a se deteriorar precocemente e produzir variações no processo produtivo, comprometendo assim sua utilização. Dado o interesse em mitigar os efeitos da vibração, nos últimos anos o estudo de sistemas que sejam capazes de controlar os deslocamentos e as forças dinâmicas geradas por equipamentos vem ganhando espaço considerável na engenharia. Este trabalho apresenta o estudo de uma técnica de controle semiativo que emprega a alteração das propriedades dinâmicas através da modificação da rigidez do sistema, para produzir o efeito de atenuação de vibrações. Foi desenvolvida uma metodologia para avaliação do efeito de alteração da rigidez do sistema através de análise adimensional dinâmica do sistema e, além disso, foram também equacionados analiticamente todos os parâmetros envolvidos no controle das propriedades do sistema. Foi desenvolvido o projeto teórico de um dispositivo capaz de realizar a modificação da rigidez de um sistema mecânico, sendo este simulado em condições de aplicação na atenuação de vibrações de um equipamento que atravessa sua frequência natural. Os resultados demonstram que o dispositivo tem aplicação bastante efetiva para pequenas estruturas e que o conceito pode ser estendido para experimentos com sistemas reais / Modern production systems increasingly require good reliability and performance of their machines and equipment. Those which have high vibration levels tend to deteriorate sooner and to produce poor production processes, which means that the maximum availability cannot be exploited. In recent years, due to the desire to mitigate the effects of vibration, systems which are capable of controlling the dynamic displacements and forces generated by equipment, have been studied. The work in this dissertation presents a study of a semi-active control technique which changes the dynamic properties of a machine, through the modification of the system stiffness, to produce the effect of vibration reduction. A methodology is developed to evaluate the effect of the system stiffness alteration through dynamic analysis. A potential implementation of a design capable of modifying the stiffness of a mechanical system is presented, and simulations are carried out into its performance as a machine passes through its natural frequency. The results show that the design works in principle and has the potential to work in a real experimental system
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Peptídeos cíclicos em espécies do semiárido brasileiro e uma cultivada: caracterização e atividade biológica /

Pinto, Meri Emili Ferreira. January 2013 (has links)
Orientador: Vanderlan da Silva Bolzani / Co-orientador: Eduardo Maffud Cilli / Banca: Angela Regina Araujo / Banca: Humberto Márcio Santos Milagre / Banca: Mario Sérgio Palma / Banca: Josean Fechine Tavares / Resumo: O Brasil tem uma das maiores biodiversidades do mundo, no entanto poucos peptídeos derivados de plantas tem sido estudados desse bioma, constituindo uma rica fonte para buscar peptídeos com características estruturais e funções ecológicas interessantes. Neste estudo são descritos a investigação de orbitídeos e ciclotídeos em 24 espécies vegetais. Os orbitídeos referem-se a todos os peptídeos cíclicos ciclizados N-C que não apresentam ligação dissulfeto. Os ciclotídeos, grupo de mini- proteínas caracterizam-se por apresentar uma estrutura (CCK ) conferindo -lhes uma notável estabilidade. Após a análise específica para estes compostos, foi possível selecionar três espécies para prosseguir com os estudos de isolamento: J. ribifolina , H. calceolaria e B. vulgaris . J. ribifolia ( Pohl ) Baill ( syn. Adenoropium ribifolium Pohl, J. gossypifolia var. ribifolia ( Pohl ) Müll. ), conhecida como "pinhão -manso" e "pinhão rasteiro", é um arbusto da família Euphorbiaceae, que geralmente cresce na região semi-árida do nordeste brasileiro. Plantas do gênero Jatropha, compreendem cerca de 175 espécies, ricas em compostos bioativos, como alcalóides, terpenos, lignanas, flavonóides e orbitídeos. A partir dos extratos etanólico de J. ribifolia, coletada no Estado da Paraíba, um novo octapeptídeo cíclico foi isolado por métodos cromatográficos, incluindo HPLC. A análise conformacional foi estabelecida por dados de RMN e dinâmica molecular. A síntese desse orbitídeo foi realizada por síntese em fase sólida (SPPS)-Fmoc/tBu. As atividades antimicrobiana, citotóxica e antimalárica foram avaliadas, para ambas as formas: circular e seu análogo linear sintéticos. Ribifolina (IC50 41,92 mM) foi moderadamente eficaz contra a o Plasmodium falciparum 3D7, mas seu análogo linear (IC50 519μmol / L) mostrou-se fraco em inibir a sobrevivência do parasita. Estes compostos não apresentam qualquer citotoxicidade contra... / Abstract: Brazil has one of the largest biodiversity in the world, however only a few plant-derived peptides have been studied from our biomes, constituting a rich source of peptides with interesting structural features and ecological functions, and so far, with potential pharmacological properties. In this study are described the investigation of orbitides and cyclotides in 24 species from plants. The orbitides refer to all N-to-C cyclized peptides from plants that do not contain disulfides and cyclotides, mini-proteins group characterized by a cyclic topology, collectively known as cyclic cystine motif (CCK) conferring them with remarkable stability. After the specific analysis for these compounds, was possible to select three species for to isolated your peptides: J. ribifolina, H. calceolaria e B. vulgaris. J. ribifolia (Pohl) Baill (syn. Adenoropium ribifolium Pohl, J. gossypifolia var. ribifolia (Pohl) Müll.), known as "pinhão-manso" and "pinhão rasteiro", is a shrub of the Euphorbiaceae family that commonly grows in the semiarid region of northeastern Brazil. Plants of the genus Jatropha, which comprises approximately 175 species, have been established as a rich source of bioactive compounds such as alkaloids, terpens, lignans, flavonoids and cyclic peptides, so called orbitides. From the EtOH extracts of the J. ribifolia, collected in the states of Paraíba, an octapeptide cyclic, was isolated by a multi-step chromatography procedures, including HPLC. Conformational analysis of these peptides has been evaluated by using of NMR experiments and simulated annealing molecular dynamics. The synthesis of the new cyclic peptides were accomplished by solid-phase peptide synthesis (SPPS)-Fmoc/tBu. The antimicrobial, citotoxity and antimalarial activities are being evaluated for both the circular and linear synthetic form of the novel orbitide from J. ribifolia. Ribifolin (IC50 41.92 μM) was moderately effective against the Plasmodium... / Doutor
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Desenvolvimento de modelos de gás em rede para escoamentos monofásicos e bifásicos

Santos, Luis Orlando Emerich dos January 2000 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. / Made available in DSpace on 2012-10-18T01:27:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2014-09-25T16:08:25Z : No. of bitstreams: 1 174057.pdf: 23518672 bytes, checksum: a5679dd878959c29a1cab6ea212d8e45 (MD5) / Este trabalho divide-se em duas partes, na primeira parte é apresentado um método para determinação de permeabilidade intrínseca baseado em modelos de gás em rede. Mostra-se que estes modelos possuem um comportamento que pode ser descrito pelas equações de Navier-Stokes para baixo número de Mach. O método foi utilizado para determinação de permeabilidade de rochas de reservatório petrolíferos e os resultados comparados com dados experimentais. Também na primeira parte é apresentado o modelo de rede BGK (Lattice Boltzmann). Baseado na equação de Boltzmann este método permite a integração numérica da equação de Navier-Stokes. São apresentados resultados para escoamentos em uma cavidade quadrada e também a formação das esteiras de vórtices de von-Karman. Na segunda parte, é proposto um novo modelo para a simulação de fluidos imiscíveis baseado na idéia de um campo de mediadores que simulam interações a longa distância utilizando regras locais. Este modelo permite, além disso, o controle da tensão interfacial e da espessura da interface. A dinâmica do modelo é descrita e são apresentados resultados de simulações de diversos casos, incluindo a verificação da lei de Laplace, o fenômeno de coalescência, interações de pares de fluidos molhante/não-molhante com superfícies sólidas e a formação de uma gota sob a ação da gravidade. Estes resultados são comparados com os dados disponíveis.
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Análise da fluidodinâmica do prato perfurado de uma unidade piloto de destilação

Teleken, Joel Gustavo 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Química, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T21:17:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 269302.pdf: 7568708 bytes, checksum: 5cb88cac4ce2c685e3c05e515e00af6e (MD5) / O processo de destilação é amplamente utilizado em refinarias de petróleo porém, a maioria dos estudos que envolvem colunas de destilação estão fundamentados por modelos macroscópicos de conservação de massa e de energia, como por exemplo, os modelos de estágios de equilíbrio e não equilíbrio, nos quais os aspectos fluidodinâmicos do escoamento são restritos e orientados a medição de parâmetros macroscópicos. Neste trabalho é estudada a habilidade da fluidodinâmica computacional em modelar a complexa hidrodinâmica de pratos perfurados em colunas de destilação, afim de analisar o processo com uma abordagem microscópica. Para tanto objetiva-se a proposição de um modelo microscópico de conservação de quantidade de movimento, em condições de escoamento turbulento sob a influência da fase vapor, para representar a fluidodinâmica do escoamento líquido-vapor em prato perfurado de uma unidade piloto de destilação, com validação através da correlação experimental de Bennett et. al., (1983), e então analisar qual a influência, que as resistências utilizadas para controle com aquecimento distribuído da unidade piloto de destilação que estão sobre as superfícies dos pratos, tem sobre a fluidodinâmica do escoamento, além de um estudo sobre os fenômenos de transferência de calor e massa para uma mistura binária de etanol e água. A metodologia numérica consistiu em iniciar com o estudo de escoamento monofásico, passado para o multifásico em um prato perfurado, utilizando-se um modelo homogêneo e tridimensional. Após a validação deste modelo a partir da correlação experimental de Bennett et. al., (1983), estudou-se a influência que as resistências tem na sua hidrodinâmica, além de estudar os fenômenos de transferência de calor e massa para a mistura binária. Na análise dos resultados obtidos concluiu-se primeiramente que o modelo homogêneo, tridimensional, multifásico apresenta uma boa concordância com a correlação experimental de Bennett et. al., (1983), além de observar-se a ocorrência de diferentes padrões de escoamento na superfície do prato no interior de uma coluna de destilação de acordo com a vazão de vapor e a presença das resistências sobre a superfície dos pratos, sendo o escoamento não uniforme. Além disto, o fluxo de líquido próximo a parede tem uma tendência de retroceder, o que resulta no fenômeno de circulação que ocorre devido ao componente radial de velocidade sofrer um maior impacto do campo de pressão em comparação ao componente axial. Os efeitos de borbulhamento provocados pela fase vapor aumentam a energia cinética turbulenta do líquido fluindo horizontalmente. Também observou-se que a presença das resistências sobre a superfície do prato influenciam nos padrões de fluxo sobre o mesmo.
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Simulação da nanoestruturação de nanofolhas de óxido de grafeno reduzido através de dinâmica molecular /

Maria, Marco Aurélio Euflauzino. January 2015 (has links)
Orientador: Antonio Riul Junior / Co-orientador: Douglas Soares Galvão / Banca: Alexys Bruno Alfonso / Banca: Paulo Noronha Lisboa Filho / Banca: Augusto Batagin Neto / Banca: Cristiano Woellner / O Programa de Pós Graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais, PosMat, tem caráter institucional e integra as atividades de pesquisa em materiais de diversos campi / Resumo: Estudamos a nanoestruturação de uma nanofolha de óxido de grafeno reduzido "envelopada" com o polímero poliesetireno sulfonado de sódio (GPSS) através de simulação computacional. Demos um primeiro passo no estudo sobre a formação das nanfolhas de GPSS, poi futuramente pretendemos estudar filmes automontados de GPSS depositados sobre uma membrana de Nafion". A motivação é melhor compreensão do mecanismo de redução da passagem de metanol e aumento da condução de íons H+ observada experimentalmente em uma célula combustível de metanol direto realizado pela Dra. Celina Miyazaki (POSMAT/UNESP). Neste trabalho, realizamos a simulação de uma nanofolha de óxido de grafeno reduzido (rGO) que se aproximasse o máximo possível daquela obtida experimentalmente, contendo defeitos (vacâncias) e os grupos químicos hidroxila, epóxido, carboxila e carbonila, resultantes da síntese química. Adicionalmente, verificamos como o rGO fica "envelopado" pelo polímero PSS, mesmo na presença de água, ocorrendo isso principalmente devido à atração eletrostática entre os oxigêncios presentes no PSS com os hidrogênios pertencentes aos grupos hidroxila e carboxila da nanofolhas de rGO. Observou-se que esse "envelopamento" é favorecido pela presença de água. Essas observações corroboram com os resultados experimentais / Abstract: We studied the nanostructuration of reduced graphene oxide nanoplatelets wapped by the polymer poly (sodium4 styrenesulfonate) (GPSS), using compational simulation. A first step was taken for the study about formation of GPSS nanoplatelets, using coputational simulation, as we intend to study in a near future a self-assembled film of GPSS deposited onto Nafion® membranes. The motivation is a better comprehension of the blocking barrier mechanism to the passage of methanol and increasing the H+ ions conductivity observed experimentally in a direct methanol fuel cell setup made by Dra Celina M. Miyazaki (POSMAT, UNESP). We have made here the simulation of a reduced graphene oxide (rGO) nanoplatelet closer to that obtained experimentally, having defects (vacancies) and hydroxyl, epoxy, carboxyl and carbonyl chemical groups, resultant from the chemical synthesis. In addition, it was verified how rGO is surrounded by the PSS polymer, even in the presence of water, putting the system as close as possible to the experimental condition. The "enveloping" of rGO by PSS happened mainly by elestrostatic attraction between oxygen atoms present in PSS with hydrogen atoms present at hydroxyl and carbonyl groups in rGO, and it was favored by the presence of water. These observations are corroborated by the experimental results / Doutor
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Correntes críticas e comportamento dinâmico dos vórtices em fitas supercondutoras do tipo II com arranjos conformes de centros de aprisionamento /

Filenga, Daví. January 2016 (has links)
Orientador: Pablo Antonio Venegas Urenda / Banca: Dayse Iara dos Santos / Banca: Durval Rodrigues Júnior / O Programa de Pós Graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais, PosMat, tem caráter institucional e integra a as atividades de pesquisa em materiais de diversos campi / Resumo: Na presente dissertação realizou-se o estudo das forças críticas e do comportamento dinâmico dos vórtices magnéticos de fitas supercondutoras do tipo II com arranjos conformes de centros de aprisionamento (pinning), bem como de diversos outros tipos de arranjos e também de diferentes trechos de arranjos. Além dos efeitos da geometria finita e aprisionamento, foi analisado o comportamento do sistema ao variar parâmetros externos como força de transporte e campo magnético. Os sistemas simulados correspondem a supercondutores bidimensionais, finitos na direção transversal e infinitos na direção longitudinal. A descrição das interações existentes no sistema pôde ser feita através de um conjunto de equações de Langevin, as quais foram resolvidas utilizando a técnica de Dinâmica Molecular. As soluções destas equações permitiram, dentre outros resultados, a obtenção das trajetórias e velocidades dos vórtices. Através das trajetórias, foi possível determinar o comportamento dinâmico das linhas de fluxo, e através das velocidades, os valores de força crítica. Para obter as posições iniciais dos vórtices, foi utilizado um algoritmo de Recozimento Simulado Generalizado (Generalized Simulated Annealing), o qual permitiu obter as configurações de menor energia do sistema. Os cálculos realizados foram feitos para 154 diferentes sistemas, que consistiram na análise do comportamento das interações neles existentes ao variar o campo magnético externo (H) aplicado nas amostras, bem como na a... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In this work we study the critical forces and dynamic behavior of magnetic vortices in type II superconducting tapes with conformal pinning arrays, as well several other types of arrays and also parts of arrays. In addition to the effects of finite geometry and pinning, we analyze system behavior by varying external parameters such as transport force and magnetic field. The simulated systems corresponds a two-dimensional superconductor, finite in the transverse direction and infinite in the longitudinal direction. The description of the interactions existing in the system can be made via a set of Langevin equations which were solved using Molecular Dynamics techniques. The solutions of these equations allowed, among other results, to obtain the trajectories and velocities of the vortices. Through the trajectories, it was possible to determine the dynamic behavior of the vortex lines, and through the velocities, the values of critical force. To obtain the initial positions of the vortices, we use a Generalized Simulated Annealing algorithm, which sought the settings of the lower energy system. Our calculations were made for 154 different systems, consisting in analyzing the interaction behavior contained in the systems by varying the external magnetic field (H) applied in the samples and the analysis of size effects of superconducting tapes using different arrays and parts of arrays of pinning centers. To study the influence of the applied magnetic field, a scan was taken with... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Efeitos da força de três corpos nos cristais de gases inertes

Gay Ducati, Maria Beatriz January 1978 (has links)
Neste trabalho a dinâmica de rede dos cristais de gases inertes é descrita pela aproximação não-harmônica. São obtidas as matrizes de força e respectivas matrizes dinâmicas pa ra o primeiro e segundo vizinho da rede FCC. São determinados os tensores de força de terceira ordem para interações de dois e de três corpos, bem como os respectivos tensores dinâmicos. A freqüência renormalizada dofononé obtida considerando-se nos cálculos a primeira contribuição não-harmônica. Os resultados teôricos são comparados com os resultados experimentais para o 36Ar. / In this work the lattice dynamics of inert gas crystals is described by anharmonic approximaticn. Force matrices and their respective dynamic matrices for the first and second FCC lattice neighboor are obtained. Th third order force tensors for interaction of two and three bodies are determined, as his dynamics tensors. The renormalized frequency of the phonon is obtained by considering in the calculation the first anharmonic contribution. Theoretical results are compared with experimental results to 36Ar.

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