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Fenologia reprodutiva, distribuição espacial e frugivoria em Rhipsalis (Cactaceae) /

Guaraldo, André de Camargo. January 2009 (has links)
Orientador: Marco Aurélio Pizo / Banca: Wesley Rodrigues Silva / Banca: Leonor Patricia Cerdeira Morellato / Resumo: As epífitas são responsáveis por grande parte da diversidade vegetal das florestas neotropicais. São também importantes para a diversidade faunística dessas regiões, pois fornecem recursos alimentares (e.g., flores, frutos e sementes) e micro-ambientes propícios à sobrevivência de vários animais. Rhipsalis (Cactaceae) é um gênero de plantas holoepífitas cujos frutos são consumidos principalmente por um único gênero de aves, as Euphonia. Para verificar a hipótese de especialização na dispersão de sementes de Rhipsalis pelas Euphonia, inicialmente foi estudada a fenologia reprodutiva dessa epífita. Uma vez conhecido o período de disponibilidade de frutos maduros aos frugívoros, foram realizados registros eventuais de frugivoria e observações focais em indivíduos de Rhipsalis para definir a assembléia de frugívoros consumidores de seus frutos. Posteriormente, frutos de cinco espécies de Rhipsalis foram fornecidos a aves frugívoras mantidas em cativeiro. Testes de germinação foram realizados com as sementes que passaram pelo trato digestório dessas aves com o objetivo de verificar seu potencial como dispersoras efetivas das sementes de Rhipsalis. Os resultados obtidos demonstraram que o gênero Rhipsalis apresenta sincronia na produção das fenofases reprodutivas entre os indivíduos e atividade reprodutiva ao longo de todo o ano. A produção de frutos maduros teve duração longa entre os meses de junho e fevereiro. Todas as espécies apresentaram fenofases reprodutivas sazonais. As observações de frugivoria e os testes de germinação realizados confirmaram que as sementes de Rhipsalis podem ser dispersas por endozoocoria. O processamento dos frutos pelas aves frugívoras, especificamente a remoção da polpa que recobre as sementes, não apenas incrementou as taxas de germinação e germinabilidade das sementes, mas também se mostrou importante para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Epiphytes are responsible for a great part of the plant diversity in Neotropical Forests. They are also important for animal diversity due to the production of food resources (e.g. flowers, fruits and leaves) and microhabitats used by a myriad of animal species. Rhipsalis (Cactaceae) is a holoepiphytic plant genus whose fruits are eaten mostly by a single bird genus, the Euphonia. To test the hypothesis that Rhipsalis presents a specialized seed dispersal system, firstly it was studied the reproductive phenology of this epiphyte. Once the availability of ripe fruits to birds was known, occasional frugivory records and focal observation on fruiting individuals of Rhipsalis were made to record the assemblage of animals that eat its fruits. Fruits of five species of Rhipsalis were offered to captive frugivorous birds to access their role as effective dispersers of Rhipsalis seeds. For this, germination tests were made with the seeds after they had passed through the birds' digestive system. Results showed that Rhipsalis individuals have synchronized reproductive phenophases and the genus has reproductive activity along the year. Ripe fruit production lasted for a long period, between June and February. All species showed significant seasonality in the reproductive phenophases. Frugivory records and germination tests confirmed that the seeds of Rhipsalis may be dispersed by endozoochory. Additionally, the manipulation of the fruits by birds - specifically the removal of the pulp that recovers the seeds - provided higher germination rates and germinability to the seeds, suggesting that the passage though a bird' gut is important to reactivate the metabolism of the seeds' embryo. Although 31 animal species were recorded eating Rhipsalis fruits, Euphonia birds may be considered as the main consumer, being responsible for around 60% of feeding visits. Seed dispersal systems involving... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Frugivoria e efetividade de dispersão de sementes dos últimos grandes frugívoros da Mata Atlântica : a anta (Tapirus terrestris) e o muriqui (Brachyteles arachnoides) /

Bueno, Rafael da Silveira. January 2010 (has links)
Orientador: Mauro Galetti Rodrigues / Banca: Laurence Cullot / Banca: Patrícia Izar / Resumo: Grandes mamíferos exercem um considerável impacto no recrutamento de plantas nas florestas tropicais. A anta (Tapirus terrestris) e o muriqui (Brachyteles arachnoides), ambos ameaçados de extinção, são os maiores frugívoros terrestre e arborícola da Floresta Atlântica Brasileira e pouco estudados em termos de efetividade na dispersão de sementes. Nós comparamos aspectos quantitativos e qualitativos da dispersão de sementes por estas espécies uma Floresta Atlântica contínua no sudeste do Brasil. Muriquis dispersaram pelo menos 28 espécies de plantas, com média de 23,3 sementes por defecação, enquanto as antas dispersaram somente 6 espécies, porém com média de 72,5 sementes por defecação. Apenas uma espécie (Euterpe edulis) dispersa pela anta não foi encontrada nas defecações dos muriquis. Muriquis podem dispersar sementes de 2,2 a 23,4 mm de largura, enquanto as antas podem dispersar de 2,9 a 30 mm. Antas depositam as sementes de forma agregada em cada defecação ou latrinas, enquanto os muriquis as espalham pela sua área de vida. Um único muriqui dispersa no mínimo 918 sementes ≥ 2 mm por mês enquanto uma única anta na mesma área dispersa no mínimo 140 sementes ≥ 2 mm por mês. Em cerca de 1000 ha, um indivíduo de muriqui podem dispersar mais de 11.000 sementes ≥ 2mm/ano e um indivíduo de anta cerca de 1.680 sementes ≥ 2mm/ano. Ambos animais são fundamentais e complementares para a dispersão de sementes da Mata Atlântica. Se por um lado o muriqui dispersa mais espécies, a anta dispersa sementes muito grandes. Apesar dos muriquis dispersarem pelos menos 13 vezes mais sementes e produzirem uma chuva de sementes mais intensa que as antas, essas são capazes de dispersar sementes em locais que os muriquis não visitam, como áreas abertas e florestas degradadas, além de dispersam as semente a maiores distâncias. A extinção desses megafrugívoros... (resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Large bodied mammals may pose a great impact on plant recruitment in tropical forests. The tapir (Tapirus terrestris) and the muriqui (Brachyteles arachnoides), both threatened by extinction, are the largest frugivores in the Brazilian Atlantic forests and are poorly studied in terms of seed dispersal effectiveness. We compared quantitative and qualitative aspects of seed dispersal by these species in a continuous Atlantic forest in southeastern Brazil. Muriquis was observed to disperse at least 28 fruit species, with mean of 23,3 seeds per feces while tapirs dispersed only six species but with mean of 72,5 seeds per feces. Only one species (Euterpe edulis) dispersed by tapirs was not found in muriqui's feces. Muriquis can disperse seeds from 2.2 to 23.4 mm wide, while tapirs from 2.9 to 29.4 mm. Tapirs deposit the dispersed seeds aggregated in single feces or in latrines, while muriquis scatter them around their home range. A single muriqui can disperse at least 918 seeds >2mm/month while a single tapirs in the same area occupied by muriquis can disperse 140 seeds >2mm/month. Therefore, in 1000ha about 11.000 seeds >2mm/year are dispersed by the muriquis and tapirs dispersed about 1.680 seeds >2mm/year. Both animals are complementary to the seed dispersal cycle in the Atlantic Forest. If in one hand muriquis disperse more species, tapirs disperse very large seeds. Despite muriquis disperse at least 13 times more seeds and produce a more intense seed rain, tapirs are able to disperse seeds in places not visited by the muriquis, as open areas, degraded forests, and disperse seeds farther than muriquis. The extinction of these megafrugivores can negatively affect the recruitment of several species of plants, specially those with large seeds occurring in the Atlantic Forest (like Sapotaceae and Chrysobalanaceae) that have muriquis and tapirs as the last seed dispersers / Mestre
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Disseminação de dados estatísticos georeferenciados através de WEB services e software livre. / Dissemination of statistical data GIS through WEB services and free software.

Paulo Cesar Rangel da Rocha 02 October 2009 (has links)
Diferentes organizações públicas e privadas coletam e disponibilizam uma massa de dados sobre a realidade sócio-econômica das diferentes nações. Há hoje, da parte do governo brasileiro, um interesse manifesto de divulgar uma gama diferenciada de informações para os mais diversos perfis de usuários. Persiste, contudo, uma série de limitações para uma divulgação mais massiva e democrática, entre elas, a heterogeneidade das fontes de dados, sua dispersão e formato de apresentação pouco amigável. Devido à complexidade inerente à informação geográfica envolvida, que produz incompatibilidade em vários níveis, o intercâmbio de dados em sistemas de informação geográfica não é problema trivial. Para aplicações desenvolvidas para a Web, uma solução são os Web Services que permitem que novas aplicações possam interagir com aquelas que já existem e que sistemas desenvolvidos em plataformas diferentes sejam compatíveis. Neste sentido, o objetivo do trabalho é mostrar as possibilidades de construção de portais usando software livre, a tecnologia dos Web Services e os padrões do Open Geospatial Consortium (OGC) para a disseminação de dados espaciais. Visando avaliar e testar as tecnologias selecionadas e comprovar sua efetividade foi desenvolvido um exemplo de portal de dados sócio-econômicos, compreendendo informações de um servidor local e de servidores remotos. As contribuições do trabalho são a disponibilização de mapas dinâmicos, a geração de mapas através da composição de mapas disponibilizados em servidores remotos e local e o uso do padrão OGC WMC. Analisando o protótipo de portal construído, verifica-se, contudo, que a localização e requisição de Web Services não são tarefas fáceis para um usuário típico da Internet. Nesta direção, os trabalhos futuros no domínio dos portais de informação geográfica poderiam adotar a tecnologia Representational State Transfer (REST). / Several public and private organizations collect and provide a large amount of data on the socio-economic realities of different countries. Governmental Brazilian agencies are showing today clear interest to disseminate a range of different information to several user profiles. However, many limitations to a more massive and democratic dissemination persist, including heterogeneity of data sources, data dispersion and not friendly format of presentation. Due to the inherent complexity involved in the spatial information, which produces conflict on many levels, the exchange of data in geographic information systems is not a trivial problem. For Web-based applications, Web services can be a useful solution, since they enable new applications to interact with those that already exist and also enable compatibility among systems developed in different platforms. This study aims to show the possibilities of developing thematic portals using free software, Web services technology and the Open Geospatial Consortium standards for the dissemination of spatial data. To evaluate and test the proposal, a portal that integrates data from statistical information servers was built. As example, a thematic portal of socio-economic data was developed, integrating data from a local server and data from remote servers. The main contributions of work is the availability of dynamic maps, the generation of maps by the composition of maps available at local and remote servers and use the standard OGC WMC. The portal shows however that the location and application of Web services are not an easy task for typical Internet users. In this direction, future work could adopt the technology REST (Representational State Transfer).
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Informações informais na monitoração do ambiente organizacional : um estudo exploratório no setor de TI

Andriotti, Fernando Kuhn January 2008 (has links)
Dentre todas as atividades que uma organização realiza, a monitoração do ambiente certamente deveria ser uma delas. Nesta atividade, que tem como principal entrada e também saída a informação, em poucos casos são desenvolvidas todas as etapas recomendadas. Muitos são os fatores que provocam, ou que ensejam este comportamento por parte das empresas, um deles é o excesso de informação disponível no mercado, o que dificulta a monitoração. Neste processo, sobretudo devido a esta dificuldade, muitos acabam recorrendo a informações não estruturadas, informais, provenientes das mais diversas fontes. Assim sendo, o objetivo deste trabalho é buscar compreender, através da identificação de algumas dimensões da atividade de monitoração do ambiente, o uso da informação informal por executivos e especialistas da área de Tecnologia da Informação (TI). Foram considerados fornecedores indivíduos especialistas que tenham como principal função distribuir informação, ou seja, jornalistas – como busca-se compreender o setor de TI, filtrou-se profissionais que estivessem ligados à área. Já os usuários são executivos, os quais foram selecionados de acordo com o ramo de suas empresas, ou seja, que comercializassem soluções na área. Por se tratar de um estudo de natureza exploratória e qualitativa, a coleta de dados foi realizada por meio de entrevistas em profundidade com estes indivíduos. Os resultados, analisados à luz das dimensões identificadas, permitiram que se obtivesse um panorama do uso da informação informal tanto por fornecedores quanto por usuários, para fins de monitoração do ambiente. / Among all organizational activities, environmental scanning should be one of them. This activity, which has the information as main output and input, just in a few cases is developed with all recommended stages. There are lots of reasons that incentives/contributes to this behavior, one of them is the flood of information that comes from the market, which difficults the environmental scanning activity. In this process, especially due to this, some go after non-structured informal information, from all kinds of sources. Based on this, the aim of this study is to comprehend, through the identification of some dimensions of environmental scanning, the use of informal information by executives and specialists from IT (Information Technology). It was considered individual specialists that have as main occupation to provide/distribute information, in this case, professionals that have an involvement with the IT area. The users are executives that were selected according to the core business of their organizations – that is oriented to the IT area as well. As an exploratory and qualitative study, the data collection was made through interviews with the participants. The results were analyzed according to the dimensions identified, and this allowed to have a broad scenario of the use of informal information – by whom provides and by who uses information to scan their environments.
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Sistemas de recuperação de informação (SRI) / subsistema de entrada: uma sistematização das alternativas de construção

Silva, Claudio Ribeiro da 16 August 1996 (has links)
Made available in DSpace on 2015-10-19T11:50:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ClaudioRibeirodaSilva.pdf: 521734 bytes, checksum: 1204a0b6a3e4aee8fcc2fefd510e6aca (MD5) Previous issue date: 1996-08-16 / The alternatives of each phase on input's subsystem for an Information Retrieval System Project are described. The literature's behaviour to support this objective is evalueted / Relaciona as etapas do subsitema de entrada necessarias para a construcao de um SRI, sistematizando algumas alternativas existentes em cada uma delas. Avalia o comportamento da literatura em fornecer os conhecimentos necessarios para esta construcao.
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Fatores associados à informação e à prescrição da pílula anticoncepcional de emergência (PAE) por ginecologistas e obstetras brasileiros / Associated factors to information and prescription of emergency contraception pill by Brazilian gynecologists an obstetricians

Oliveira, William Alexandre de 16 August 2018 (has links)
Orientadores: Aníbal Faúndes, Maria José Duarte Osis / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-16T20:48:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_WilliamAlexandrede_M.pdf: 659096 bytes, checksum: 56cf5a8130f44d6cf8388f074a6bdd43 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Introdução: A pílula anticoncepcional de emergência (PAE) é uma forma de contracepção hormonal que permite evitar uma gravidez não planejada após uma relação sexual desprotegida. O acesso à PAE pode ser dificultado por atitudes negativas dos médicos, derivadas de sua opinião sobre o mecanismo de ação deste método. Objetivo: Avaliar a proporção de ginecologistas e obstetras brasileiros que prescrevem a PAE e a sua associação com algumas características dos médicos e suas percepções sobre o mecanismo de ação desse método. Sujeitos e Método: Estudo de corte transversal, baseado na análise secundária de estudo anterior com 3.337 ginecologistas e obstetras brasileiros que autorresponderam um questionário enviado. Outro banco de dados foi criado com as variáveis de interesse para este estudo: as variáveis independentes foram: opinião dos médicos em relação ao mecanismo de ação da pílula de contracepção de emergência (evitar a fecundação, impedir a implantação do óvulo fertilizado e provoca um ?microaborto"), experiência pessoal com o uso da PAE (precisou usar e usou; precisou usar, mas não usou e nunca precisou usar). A experiência de informar as potenciais usuárias sobre a disponibilidade da PAE e de prescrevê-la foram as variáveis dependentes. As variáveis de controle utilizadas foram os dados sociodemográficos dos médicos. Análise dos dados: A análise bivariada foi feita para testar as associações entre independentes e de controle com as duas variáveis dependentes e quantificar a razão de prevalência e o intervalo de confiança 95%. Finalmente, a análise de regressão múltipla de Poisson foi realizada para identificar as variáveis independentes associadas às duas variáveis dependentes. Resultados: 91,4% dos médicos afirmaram que informam seus pacientes sobre a PAE, 89,3% já prescreveram o método pelo menos uma vez durante o tempo de exercício da profissão; 20,8% afirmaram que a ação da PAE ocorria antes da fecundação e 56,9% acreditavam que interferia com a implantação e 22,3% dos médicos referiram que a PAE provocava um ?microaborto?. Com relação ao uso, 24,7% dos médicos já tiveram a necessidade de usar a PAE e usaram, 1,6% tiveram a necessidade de usar mas não usaram e 73,6% nunca tiveram a necessidade de utilizar a PAE. O percentual dos médicos que nunca tinham informado sobre a pílula anticoncepcional de emergência ou prescrito o método foi mais que duas vezes maior entre aqueles que acreditavam que a PAE provocava um ?microaborto? do que entre aqueles que tinham outra percepção sobre o mecanismo de ação da PAE. A proporção de médicos que nunca tinham informado ou prescrito a PAE foi maior entre os médicos que tiveram a necessidade usar o método e não o usaram, do que entre os médicos que nunca tiveram a necessidade de usá-lo. Conclusões: O conceito errôneo de que a PAE pode provocar um ?microaborto? é uma importante barreira para as potenciais usuárias, enquanto que a experiência de uso pessoal pelos médicos que necessitaram usá-la favorece a informação e a prescrição do método. / Abstract: Introduction: The emergency contraceptive pills (ECPs) is a form of hormonal contraception that can prevent an unintended pregnancy after unprotected sex. Access to the EAP may be hampered by negative attitudes of doctors, derived from his view on the mechanism of action of this method. Objective: To evaluate the proportion of Brazilian gynecologists and obstetricians to prescribe the ECP and its association with some characteristics of doctors and their perceptions of the mechanism of action of these methods. Subjects and Methods: Cross-sectional study, based on secondary analysis of a previous study with 3337 Brazilian gynecologists and obstetricians who autorresponderam a questionnaire. Another database was created with the variables of interest to this study: the independent variables were physicians' beliefs regarding the mechanism of action of emergency contraception pill (to prevent fertilization, prevent implantation of the fertilized egg and causes "microaborto"), personal experience with the use of PAE (needed to use and used, had to use but not used and never needed to use). The experience of informing potential users about the availability of SAP and prescribe it were the dependent variables. The control variables used were sociodemographic data for doctors. Data analysis: A new database was prepared separately from the database of original research, dividing the variables of interest described above. Bivariate analysis was done to test the associations between independent and control with the two dependent variables and quantify the prevalence ratio and confidence interval 95%. Finally, Poisson analysis was performed to identify variables independently associated with dependent variables. Results: 91.4% of doctors said they inform their patients about ECP, 89.3% had prescribed the method at least once. 20.8% said that ECP acts before fertilization and 56.9% believed that acts by interfering with implantation and only 22.3% of physicians believed that ECP causes a micro abortion. The percentage of physicians who had the necessity to use ECP and used was 24,7%, 1.6% had the necessity to use but did not use it and 73.6% had never had the necessity to use the ECP. The percentage of doctors who had never informed about the emergency contraceptive pill or prescribe the method was more than twice higher among those who believed that the ECP causes a micro abortion than among those who believed in a different mechanism of action of ECP. The proportion of doctors who had never informed or prescribed emergency contraception was greater among physicians who had the necessity to use the method and did not use it than among physicians who had never had the necessity to use it. Conclusions: The misconception that the ECP can cause a micro abortion is an important barrier to potential users, while the personal experience of doctors contribute in a positive way for the information and prescription of the method. / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Tocoginecologia
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Prevalência e caracterização molecular de bastonetes Gram negativos isolados do sistema de transporte público coletivo do município de Goiânia-Go / Molecular epidemiology of Gram negative rods from collective public Transport system in the central region of Brazil

Lamaro, Luana 09 June 2017 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-11-07T17:03:10Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luana Lamaro - 2017.pdf: 3263118 bytes, checksum: d0e16b39616bfde882a20ec1ff2e5c54 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-11-08T10:02:25Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luana Lamaro - 2017.pdf: 3263118 bytes, checksum: d0e16b39616bfde882a20ec1ff2e5c54 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-08T10:02:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Luana Lamaro - 2017.pdf: 3263118 bytes, checksum: d0e16b39616bfde882a20ec1ff2e5c54 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-06-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Objects contaminated with microorganisms are denominated fomites. A number of studies have reported fomites as sources of microorganism dissemination. This study aimed to isolate and identify Gram Negative Bacilli (GNB) from a collective public transport line in the city of Goiânia, GO, to characterize by phenotypic and genotypic methods in the antimicrobial susceptibility profile and to analyze the macrorrestricity profile of the isolated. As samples of the fixed bars surfaces of the buses and ratchets of the platforms and terminals of “Leste-Oeste” line were collected with swab and sent to the Laboratory of Applied Bacteriology of the IPTSP-UFG. After the GNB culture, as species were identified by PCR and submitted to the Antimicrobial Susceptibility Test (AST). The plasmid DNA of the strains resistant to beta-lactams was extracted for the search of genes encoding beta-lactamases by PCR. The macrorrestriction profile of P. mirabilis strains was performed by PFGE using the XbaI enzyme. A total of 852 swabs were collected representing a prevalence of 46.0% of GNB in the evaluated surfaces. The species identified were A. baumannii (40.8%), H. alvei (30.9%), P. mirabilis (26.1%) and E. coli (2.2%). The AST revealed 31 (7.9%) multidrug resistant isolates. The blaTEM and blaCTX genes were detected. We observed a presence of eight clusters and three clones among the species P. mirabilis. This study proves that the surfaces present in the collective public transport system can be sources of resistant multi-drug GNB and these bacteria have the potential of dispersion and permanence in different community environments. / Objetos contaminados por micro-organismos são denominados fômites. Vários estudos relacionam fômites como fontes de disseminação de micro-organismos. Este estudo objetivou isolar e identificar Bastonetes Gram Negativos (BGN) de uma linha de transporte público coletivo da cidade de Goiânia – GO, caracterizar por métodos fenotípicos e genotípicos o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos e analisar o perfil de macrorrestrição dos isolados. As amostras das superfícies das barras fixas dos ônibus e as catracas das plataformas e terminais da linha Leste-Oeste foram coletadas com swab e enviadas para o Laboratório de Bacteriologia Aplicada do IPTSP-UFG. Após o cultivo dos BGN, as espécies foram identificadas por PCR e submetidas ao Teste de Suscetibilidade aos Antimicrobianos (TSA). O DNA plasmidial das cepas resistentes aos betalactâmicos foi extraído para a pesquisa dos genes codificadores de betalactamases por PCR. O perfil de macrorrestrição das cepas de P. mirabilis foi realizado por PFGE utilizando a enzima XbaI. Foram coletados 852 swabs representando uma prevalência de 46,0% de BGN nas superfícies avaliadas. As espécies identificadas foram: A. baumannii (40,8 %), H. alvei (30,9 %), P. mirabilis (26,1 %) e E. coli (2,2 %). O TSA revelou 31 (7,9 %) isolados multidroga resistentes. Foram detectados os genes blaTEM e o gene blaCTX. Observamos a presença de oito clusters e três clones entre as espécies P. mirabilis. Este estudo comprova que as superfícies presentes no sistema de transporte público coletivo podem ser fontes de BGN multidroga resistentes e que essas bactérias possuem potencial de dispersar e permanecer em diferentes ambientes comunitários.
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Caracterização molecular e fenotípica da disseminação de diferentes sorotipos de Escherichia coli enteroinvasora em células epiteliais intestinais da linhagem Caco-2 / Phenotypic and molecular characterization of dissemination from different serotypes of Enteroinvasive Escherichia coli in intestinal epitelial cells lineage Caco-2

Hadassa Cristhina de Azevedo Soares dos Santos 13 March 2012 (has links)
Escherichia coli enteroinvasora (EIEC) e Shigella spp. causam disenteria bacilar, caracterizada pela destruição das células epiteliais da mucosa do cólon do hospedeiro. Ambos os microrganismos apresentam características bioquímicas, genéticas e patogênicas semelhantes, porém a doença causada por EIEC se apresenta numa forma mais branda e auto limitante. Dois genes plasmidiais, icsA e icsB estão envolvidos na disseminação intra e intercelular da bactéria, fator importante na produção e resolução da doença. Trabalhos anteriores mostraram que S. flexneri M90T possui uma capacidade maior de disseminação do que o sorotipo de EIEC O124:H-. Devido a esses resultados surgiu a seguinte pergunta: Será que essas diferenças moleculares e fenotípicas estariam restritas ao sorotipo O124:H- ou é comum ao patotipo EIEC? Assim, neste trabalho avaliamos as características fenotípicas e moleculares de onze diferentes sorotipos de EIEC e as comparamos com as amostras de S. flexneri. Pelo ensaio de placas de lise em células Caco-2 mostramos que a capacidade de disseminação de todos os sorotipos de EIEC é menor quando comparada à Shigella M90T. Ao avaliar as sequências gênicas vimos polimorfismos dos genes icsA e icsB dentro do grupo EIEC, assim como em relação aos sorotipos S. flexneri 2a e S. flexneri 5a. A menor disseminação, apresentado pelo patotipo de E. coli, pode estar associada com o processo de ligação e/ou recrutamento de N-WASP, como também na interação com outras proteínas do hospedeiro. / Enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) and Shigella spp cause bacillary dysentery in humans by invading and multiplying within epithelial cells of the colonic mucosa. Although EIEC and Shigella spp share many genetic and biochemical similarities, the illness caused by EIEC is less severe. The effector proteins IcsA and IcsB are important in the physiopathology of the disease triggered by EIEC and Shigella spp. IcsA is required for intracellular actin-based motility, and the role of IcsB is to camouflage IcsA from the autophagic host defense system. Previous studies showed that EIEC O124:H- showed a significantly less efficient cell-to-cell Caco-2 dissemination when compared with S. flexneri. Due to these results the following question arose: Are molecular and phenotypic differences restricted to serotype O124:H- or is it common to EIEC pathotype? Thus, this study evaluated the phenotypic and molecular characteristics of eleven different serotypes of EIEC and compares them to samples of S. flexneri. All EIEC serotypes presented lower cell-to-cell Caco-2 dissemination compared to Shigella M90T, and the differences between this two species expanded to the icsA and icsB gene sequences, in which it was possible to observe a polymorphism of the genes. The smallest spread presented by EIEC E. coli pathotype could be associated with the connection process and/or recruitment of N-WASP, as well as to other important host proteins.
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Processo autofágico no reconhecimento de Escherichia coli enteroinvasora: um possível mecanismo da degradação bacteriana por células epiteliais / Autophagy in recognition of Enteroinvasive Escherichia coli: a possible bacterial degradation mechanism by epithelial cells.

Hadassa Cristhina de Azevedo Soares dos Santos 13 May 2016 (has links)
O reconhecimento de bactérias invasoras pelas células hospedeiras através do processo autofágico é um fator chave na determinação da infecção bacteriana. Escherichia coli enteroinvasora (EIEC) possui uma proteína, denominada IcsB, que em estudos em Shigella, é responsável pela inativação deste processo de degradação bacteriana. Uma vez que EIEC expressa menos IcsB do que S. flexneri, nos propusemos a investigar o processo autofágico na infecção por EIEC, utilizando as técnicas de mutação gênica por inserção, western-blot, microscopia de fluorescência e eletrônica de transmissão e microarray. Verificamos que a proteína IcsB é um fator de virulência importante na camuflagem de EIEC, pois quando pouco ou nada expresso, há um maior reconhecimento da bactéria pelas células hospedeiras, favorecendo sua menor disseminação. Isto corrobora não somente com a transcrição gênica, mas com a importância da sequência de nucleotídeos deste gene, uma vez que a cepa de E. coli SM124/13 complementada com o icsB de Shigella se mostrou mais eficiente na disseminação dentro da célula hospedeira. De forma interessante, IcsB apresentou um papel inédito na regulação da resposta inflamatória das células HeLa, onde a ausência de IcsB em EIEC promoveu uma intensa perturbação na homeostase da célula hospedeira, com aumento da secreção de IL-6, IL-8 e morte celular. Adicionalmente, ficou evidente que a célula eucariótica responde de maneira distinta frente a infecção por EIEC e Shigella flexneri. EIEC provavelmente ativou o processo autofágico em células humanas de forma não canônica. Nossa hipótese seria de que EIEC é reconhecida pelo processo autofágico, podendo ser este um importante fenômeno de reconhecimento bacteriano que colabore para a menor disseminação intracelular de EIEC, e assim tornar sua doença mais branda, quando comparada com a infecção por Shigella. / The invasive bacteria recognition by host cells through autophagy is a key factor for determining bacterial infection. Enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) express a protein IcsB, which in Shigella, is known for inactivating the bacterial degradation process. Once EIEC showed less expression of icsB when compared to S. flexneri, we proposed to investigate the autophagy caused by EIEC infection, using techniques such as gene mutation by insertion, western blot, fluorescence microscopy, transmission electron microscopy and microarray. Our results showed that IcsB protein is an important virulence factor in EIEC because it causes a camouflage of the bacteria in the eukaryotic cell. When there is a low expression of the protein, the cell recognition of the invasive bacteria is high, decreasing the bacteria dissemination. This found confirms the importance of the gene transcription and the gene sequence, since the strain E. coli SM124/13, complemented with icsB from Shigella, showed higher dissemination efficiency inside of the host cell. Interestingly, IcsB showed a new role on regulating the inflammatory response in Hela cells. The absence of IcsB in EIEC generated an intense disturbance of the cell homeostasis, increased the secretion of IL-6 and IL-8, and caused cell death. Additionally, our results revealed that eukaryotic cell infected by EIEC or Shigella flexneri showed distinguish responses. In EIEC infection, the autophagy was activated in human cells, but not in a conventional mode. Our hypothesis is that EIEC is recognized by autophagy, being an important cell process for bacterial recognition. This process can cause a decrease in the intracellular spread of EIEC making the infection less severe when compared to the infection caused by Shigella.
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Listeria monocytogenes em camarão (Penaeus brasiliensis): marcadores sorológicos e genéticos no monitoramento de sua disseminação em uma unidade processadora de pescado / Listeria monocytogenes in shrimp (Penaeus brasiliensis): serologic and genetic markers to trace the dissemination in a sea food processing plant

Maria Teresa Destro 25 July 1995 (has links)
A ocorrência de Listeria monocytogenes em alimentos vem sendo estudada desde o início dos anos 80, após seu envolvimento em vários surtos de doença de origem alimentar. Os frutos do mar são o grupo de alimentos que despertou menor atenção por parte dos pesquisadores, apesar de terem sido envolvidos em casos esporádicos de listeriose e mesmo em surtos da doença. A amostragem ambiental e de produto, ao longo de uma linha de processamento é uma forma de localizar áreas relacionadas à contaminação do alimento permitindo que sejam feitas correções para evitar a produção de bens que exponham o consumidor a doenças. Com a finalidade de avaliar a contribuição da matéria prima e fatores ambientais na ocorrência e distribuição de L. monocytogenes em uma indústria processadora de pescados, e mais especificamente, numa linha processadora de camarão rosa (penoeus brasiliensis), é que desenvolveu-se a presente pesquisa. Também buscou-se determinar as diversidades antigênica e genética das cepas de L. monocytogenes isoladas, e correlacionar esta diversidade à sua distribuição na indústria. Assim, um total de 363 amostras coletadas em diferentes pontos de uma linha de processamento de camarão rosa foram examinadas para a presença de L. monocytogenes, empregando-se a metodologia recomendada pelo Health Protection Branch, do Canadá. A seguir, 115 cepas de L. monocytogenes representativas das amostras positivas para o microrganismo foram sorotipadas e o polimorfismo do seu DNA cromossomico avaliado com o auxílio dos métodos RAPD (\"randon amplified polimorphic DNA\") e PFGE (\"pulsed-field MTDestro - Doutorado - Listeria monocytogeneses em camarao... 140 gel electrophoresis\"). Um grupo de 25 cepas foi também submetido a sorotipagem completa, fagotipagem e ribotipagem pelo sistema RiboPrint da DuPont. Do total de amostras examinadas, 64 (17,6%) apresentaram-se contaminadas por L. monocyfogenes. As amostras ambientais apresentaram 25,0% de positividade (14 positivas/56 examinadas). As amostras de utensílios 24,2% (8/33) e as de água 23,8% (5/21). As amostras de camarão apresentaram 18,0% de contaminação (32/178) e as de manipuladores 7,6% (5/66). Nenhuma das amostras de gelo foi positiva para L. monocyfogenes. Durante o processamento observou-se um aumento na percentagem de amostras positivas para L. monocytogenes, chegando esta percentagem a 35,0% em algumas etapas, mas reduzindo-se a 16,0% no produto final. O perfil composto gerado pela combinação dos resultados obtidos com a tipagem molecular das 115 cepas de L. monocyfogenes selecionadas, permitiu a sua divisão em 24 grupos, de acordo com seus perfis de DNA. A sorotipagem das 25 cepas selecionadas mostrou que 11 pertenciam ao sorovar 4b, 7 ao sorovar 1/2b, 2 ao sorovar 1/2c e 5 ao sorovar 1/2a. A fagotipagem permitiu que elas fossem divididas em 7 fagovares, sendo que a maior parte das cepas do sorovar 4b (81,8%) não foi fagotipável. A ribotipagem destas 25 cepas originou 6 RiboGroupsTM. Os resultados indicaram que cepas de L. monocytogenes de origem ambiental pertenciam a perfis compostos exclusivos para o ambiente, enquanto que cepas provenientes da água e de utensílios possuiam um perfil composto em comum. Amostras de camarão coletadas nas diversas etapas doprocessamento apresentaram L. monocytogenes com pelo menos um perfil composto em comum, perfil este também presente nas cepas isoladas das mãos dos manipuladores. / The importance of seafood in the spread of foodborne pathogens is well known, however, until the last few years, little attention has been paid to the role of seafood in disseminating L. monocytogenes. Two foodborne listeriosis outbreaks have been linked to the consumption of seafood. L. monocytogenes and other Listeria species have been isolated from different types of raw or processed seafood, but the main source of contamination is unknown. For this reason, it is important to monitor the potential sources of this pathogen in food processing plants, in order to minimize product contamination. The aim of this study was to evaluate the contribution of raw material and environment in the occurrence and distribution of L. monocytogenesin shrimp (Penaeus brasiliensis) processing plant. The antigenic and genetic diversities of L. monocytogenes strains were also determined. A total of 363 samples, collected in different areas of a shrimp processing plant in Santos, SP, were examined using the methodology recomended by the Health Protection Branch, Canada. One hundred and fifteen strains of L. monocytogenes representing the L. monocytogenes positive samples were first serotyped and then sub-typed by molecular typing (RAPD and PFGE). A group of 25 strains were also ribotyped and phage-typed. L. monocytogeneswas isolated from 64 (17.6%) of the total samples analysed. Environmental samples showed the highest positivity rate (25%) followed by utensils (24,2%) and water (23.8%) samples. Shrimp samples presented 18% of positivity for L. monocytogenes while food handlers samples presented 7.6%. None of the ice samples was positive for the microorganism. When the composite profile from \"both (RAPD-PFGE) methods was generated, the 115 strains could be separated in 24 groups, according to their DNA pattern. The results indicated that environmental strains of L. monocytogenes ali feel into composite profile groupings unique to the environment, while strains from both water and utensils shared another composite profile group. L. monocytogenes fresh shrimp iso/ates belonging to one profile group, were found in the different areas of the processing line. This same latter group was also present in food handlers from the processing and packaging areas of the plant.

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