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Modulation of the conformaiton [sic] and function of membrane-bound anti-apoptotic Bcl-2 by potential anti-cancer drugs

Tian, Xuefei. January 2008 (has links) (PDF)
Thesis--University of Oklahoma. / Bibliography: leaves 71-78.
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Avaliacao do efeito biologico da radiacao beta do sup[90]Sr em celulas sanguineas humanas e elaboracao de curva dose resposta

OLIVEIRA, ELAINE M. de 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:44:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:56:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 06865.pdf: 2088769 bytes, checksum: 011acb7fa0ff799f54b79805918ddfb3 (MD5) / Dissertacao (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP
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Examining Dose-Response Effects in Randomized Experiments with Partial Adherence

January 2018 (has links)
abstract: Understanding how adherence affects outcomes is crucial when developing and assigning interventions. However, interventions are often evaluated by conducting randomized experiments and estimating intent-to-treat effects, which ignore actual treatment received. Dose-response effects can supplement intent-to-treat effects when participants are offered the full dose but many only receive a partial dose due to nonadherence. Using these data, we can estimate the magnitude of the treatment effect at different levels of adherence, which serve as a proxy for different levels of treatment. In this dissertation, I conducted Monte Carlo simulations to evaluate when linear dose-response effects can be accurately and precisely estimated in randomized experiments comparing a no-treatment control condition to a treatment condition with partial adherence. Specifically, I evaluated the performance of confounder adjustment and instrumental variable methods when their assumptions were met (Study 1) and when their assumptions were violated (Study 2). In Study 1, the confounder adjustment and instrumental variable methods provided unbiased estimates of the dose-response effect across sample sizes (200, 500, 2,000) and adherence distributions (uniform, right skewed, left skewed). The adherence distribution affected power for the instrumental variable method. In Study 2, the confounder adjustment method provided unbiased or minimally biased estimates of the dose-response effect under no or weak (but not moderate or strong) unobserved confounding. The instrumental variable method provided extremely biased estimates of the dose-response effect under violations of the exclusion restriction (no direct effect of treatment assignment on the outcome), though less severe violations of the exclusion restriction should be investigated. / Dissertation/Thesis / Doctoral Dissertation Psychology 2018
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Escolha dos níveis nutricionais na determinação do nível-ótimo e no ajuste de modelos estatísticos utilizados em ensaios dose-resposta

Souza, Fernando Augusto de [UNESP] 24 February 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-24Bitstream added on 2014-06-13T18:57:29Z : No. of bitstreams: 1 souza_fa_me_jabo.pdf: 1931388 bytes, checksum: 4c66f4cd56386572eb7ad4b52f5d1472 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este trabalho avaliou a influência da heterocedasticidade e dos níveis nutricionais (número e posição) utilizados em ensaios dose-resposta, na estimativa do nível-ótimo e no ajuste dos modelos, além de verificar o quão informativas são as estatísticas utilizadas para avaliar a precisão do ajuste (R², R² ajustado, CV e SQD). Utilizaram-se dados dos experimentos realizados por Nascimento et al. (2007) e Siqueira (2009) e dados simulados. Constatou-se que, quando os níveis estiveram distribuídos próximos do verdadeiro requerimento, os modelos com platô proporcionaram resultados mais confiáveis. Já os modelos quadrático e exponencial se mostraram mais adequados para situações no qual os níveis estão mais dispersos em relação ao verdadeiro requerimento. A heterocedasticidade não interferiu na estimativa do nível-ótimo, porém influenciou no ajuste dos modelos e proporcionou pequenas mudanças nos parâmetros das equações obtidas. O coeficiente de determinação (ajustado e não ajustado) foi diretamente influenciado pela definição do nível mais próximo do ótimo e dos níveis extremos, enquanto que, o coeficiente de variação e a soma dos quadrados dos desvios, pelos níveis iniciais e pelo nível próximo do ótimo. A soma dos quadrados dos desvios demonstrou ser mais sensível, pois seu valor apresentou pequenas variações entre os modelos nas diferentes situações, que as outras estatísticas não detectaram. Ressalta-se a importância de se estabelecer corretamente o intervalo dos níveis estudados para que a dispersão dos valores do nível-ótimo estimado seja minimizada e que o ajuste seja satisfatório, independente do modelo utilizado / This work evaluated the influence of heteroskedasticity and the nutritional levels (number and position) used in dose-response trials to estimating the optimal-level and the adjustment of the models, also check how informative are the statistics used to evaluate the accuracy of fit (R ², R ² adjusted, CV and SQD). The data used in this experiment are from Nascimento et al. (2007) and’ Siqueira (2009) trials and simulated data. It was found that when levels were distributed close to the real requirement, the models with plateau have provided more reliable results. Since the quadratic and exponential models were more suitable for situations in which the levels are more dispersed about the real requirement. The heteroskedasticity did not affect the estimate of the level-optimal, but influenced the adjustment of the models and provided small changes in the parameters of the equations obtained. The coefficient of determination (adjusted and unadjusted) was directly influenced by the definition of the level closest to the optimum and extreme levels, while the coefficient of variation and the sum of squares of deviations were influenced by the initial levels and the level close to the optimum. The sum of squares of deviations was more sensitive, because its value showed small variations between models in different situations that the other statistics did not detect. Emphasized the importance to precisely define the range of levels studied to the dispersion of the obtained optimal-level is minimized and the fit is satisfactory regardless of the model
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Validation of endpoints as biomarkers of low-dose radiation damage

Rossouw, Maria Susanna January 2004 (has links)
Thesis (MTech (Biomedical Technology))--Cape Technikon, Cape Town, 2004 / The need for radiobiological research was bom from the discovery that high doses of radiation could cause cancer and other health effects. However, recent developments in molecular biology uncovered the effects of low doses of radiation on different biological systems and as a result new techniques have been developed to measure these effects. The aim of this study was thus to validate biomarkers of initial DNA strand breaks, micronucleus formation, and the different pt ;ases of apoptosis as biological indicators of low-dose radiation damage. Furthermore, the difference in response of blood cells to different qualities and doses of radiation was investigated by irradiating cells with low- and high-LET radiation simultaneously. Blood from one donor was irradiated with doses between 0 and 4 Gy gamma- and neutron radiation. The alkaline single-cell gel electrophoresis (comet) assay was performed on different cell preparations directly after irradiation for the detection of initial DNA strand breaks. Radiation-induced cytogenetic damage was investigated using the cytokinesis-blocked micronucleus assay while different features of apoptosis were investigated by measuring caspase activation, enzymatic DNA fragmentation, and cellular morphology. The comet assay was sensitive enough to detect DNA strand breaks above 0.25 Gy and showed that the Iymphocyte isolation process induced some endogenous damage in cells, detected by the formation of highly damaged cells and hedgehogs in isolated cell preparations only.
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Avaliacao do efeito biologico da radiacao beta do sup[90]Sr em celulas sanguineas humanas e elaboracao de curva dose resposta

OLIVEIRA, ELAINE M. de 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:44:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:56:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 06865.pdf: 2088769 bytes, checksum: 011acb7fa0ff799f54b79805918ddfb3 (MD5) / Dissertacao (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP
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Avaliação dos níveis de radiação ambiental no laboratório de tomografia por emissão de pósitrons acoplada a tomografia computadorizada, microPET/CT / Evaluation of ambient radiation levels in positron emission tomography/computed tomography in microPET/CT laboratory

SARMENTO, DANIELE M. 26 August 2016 (has links)
Submitted by Marco Antonio Oliveira da Silva (maosilva@ipen.br) on 2016-08-26T11:07:48Z No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2016-08-26T11:07:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O sistema microPET/CT é um importante equipamento utilizado nas pesquisas de imagem diagnóstica em pequenos animais. O radiofármaco mais usado nesta tecnologia é o fluordeoxiglicose marcado com flúor-18. Este estudo tem como objetivo efetuar o controle radiológico no laboratório de pesquisa microPET/CT do Centro de Radiofarmácia do IPEN-CNEN/SP, de forma a satisfazer tanto as normas nacionais como as recomendações internacionais. O laboratório está classificado pela equipe de radioproteção da instalação como área supervisionada, nas quais embora não seja obrigatória a adoção de medidas específicas de proteção e segurança, devem ser submetidas reavaliações regulares das condições do ambiente de trabalho. Visando assegurar a proteção radiológica dos trabalhadores diretamente envolvidos no manuseio do equipamento, realizou-se o monitoramento do local de trabalho e a avaliação do controle de dose individual. Inicialmente foi feito o monitoramento pré-operacional, isto é, o levantamento radiométrico no laboratório. Além disso, mediu-se nível de radiação externa nas instalações do laboratório e suas adjacências, por meio da colocação de nove dosímetros termoluminescentes (TL) de CaSO4:Dy, em locais previamente selecionados. Os indivíduos ocupacionalmente expostos foram avaliados mensalmente por meio do uso de dosímetros TL posicionados no tórax e por medidas de corpo inteiro, tomadas a cada seis meses. O período do estudo foi de dois anos, com início em abril de 2014. Para o controle do microPET/CT realizou-se testes de desempenho de acordo com o protocolo padrão do equipamento e em conformidade com a norma desenvolvida pela força tarefa para estudos com PET em animais Animal PET Standard Task Force. O presente estudo permitiu demonstrar que os níveis de radiação das áreas (estimativas de dose ambiente e dose efetiva), assim como a blindagem do equipamento estão adequados de acordo com os limites da exposição ocupacional. Ressalta-se a importância de se seguir rigorosamente os princípios de radioproteção, já que se trata de pesquisas com fontes radioativas não seladas. / Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energéticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Requerimento de treonina para jundiá (Rhamdia quelen) na fase inicial / Threonine jundiá for requirement (Rhamdia quelen) in initial phase

Flores, Daniel Prois 26 February 2015 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / In this trial the requirement of threonine for the jundiá (Rhamdia quelen) was studied during the initial growth phase. Therefore a dose response experiment with five threonine inclusion levels (1.6, 2.2, 2.8, 3.4, 4.0% crude protein (CP)) and four replications was performed. The mixed diets were isonitrogenous (37% CP) and isocaloric (3400 kcal / kg estimated digestible energy). Juvenile jundiás (initial weight 4.47 ± 0.39 g and 8.16 ± 0,49cm length) were subjected to 70 experimental days, fed three times a day until apparent satiation, and their consumption calculated on a daily basis. Water quality parameters levels were kept optimal for the specie. Every twenty one days biometry was performed to evaluate the parameters of weight, weight gain, specific growth rate and feed conversion ratio. Body composition, nutrients deposition, metabolic, and enzymatic parameters were evaluated at the beginning and end of the trial. The data were submitted to normality test, analysis of variance, polynomial regression, and segmented regression. Then was chosen the analysis that best fits the data by comparing the residual error. The parameters of hepatossomatic index, mineral matter, and CAA, were higher in treatment with 1.6% of threonine in the diet. Based on the biomass parameters, relative weight gain, specific growth rate, and total weight gain, the appropriate level of threonine for catfish in that weight stage is 2.45% of threonine of the gross protein in the diet. / Neste trabalho foi estudado o requerimento em treonina para o jundiá (Rhamdia quelen) na fase inicial de crescimento. Para tal foi realizado um experimento de dose-resposta com cinco níveis de inclusão de treonina (1,6; 2,2; 2,8; 3,4; 4,0% da proteína bruta (PB)) com quatro repetições. As dietas mistas eram isoprotéicas (37% PB) e isocalóricas (3400 kcal/kg de energia digestível estimada). Os juvenis de jundiá (peso inicial 4,47±0,39 g e comprimento 8,16±0,49cm) foram submetidos a 70 dias experimentais, alimentados três vezes ao dia até a saciedade aparente, e o consumo calculado diariamente. Os parâmetros de qualidade da água mantiveram-se dentro do ideal para a espécie. A cada vinte e um dias foi realizada biometria para avaliação dos parâmetros de peso, ganho de peso, taxa de crescimento específico e conversão alimentar aparente (CAA). A composição corporal, deposição de nutrientes, parâmetros metabólicos e enzimáticos foram avaliados ao início e ao final do período experimental. Os dados foram submetidos ao teste de normalidade, posteriormente a análise de variância, análise de regressão polinomial e regressão segmentada sendo escolhida a análise que melhor se ajusta aos dados através da comparação do erro residual. Os parâmetros de índice hepatossomático, matéria mineral e CAA, foram superiores no tratamento 1,6% de treonina na dieta. Baseando-se nos parâmetros de biomassa, ganho de peso relativo, taxa de crescimento específico e ganho de peso total o nível adequado de treonina para o jundiá nesta fase de peso é de 2,45% de treonina da proteína bruta da dieta.
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Elephantopus mollis Kunth (ASTERACEAE): FLUXO DE EMERGÊNCIA E CURVA DE DOSE-RESPOSTA A HERBICIDAS / Elephantopus mollis Kunth (ASTERACEAE): EMERGENCY FLOW AND HERBICIDES DOSE-RESPONSE CURVES

Balbinot, Andrisa 10 March 2016 (has links)
Fundação de Amparo a Pesquisa no Estado do Rio Grande do Sul / Elephantopus mollis is a Asteraceae family species recently found in soybean crops / winter pastures in the central-western region of Rio Grande do Sul, Brazil. Its presence has reduced yields and increased the cost of production of these crops. In order to get the emergency pattern of the species throughout the year and its sensitivity to the main herbicide used in these crops it is that took place this work. To determine the emergency flow and the seed bank in the area two experiments were conducted in a rural area of the municipality of Tupanciretã, and for the response to herbicides were conducted five trials of dose-response curves to the herbicide glyphosate, 2, 4-D, metsulfuron-methyl, flumioxazin and saflufenacil. In the emergency experiments it have been demarcated two areas side by side. One kept uncroped and another subjected to the usual crop of the total area. In both areas, treatments were represented by twelve months of the year to carry out the count of emerged plants for each month. The samples to estimate the seed bank were collected in the month of August in each of the twelve portions of the area kept uncroped in the depths of 0 to 5 cm and 5 to 10 cm. In trays kept in a greenhouse (UFSM), counts were made of emerged plants, every 15 days for 150 days. For dose-response curves were established doses and represents the division multiple of the recommended dose of herbicide for similar species as 0; x / 8; x / 4; x / 2; x; 2x; 4x; 8x. For glyphosate x = 1440 g ha-1, 2,4-D x = 670 g ha-1, metsulfuron x = 2.4 g ai ha-1, flumioxazin x = 50 g ai ha-1 and saflufenacil x = 35 g ai ha-1. Herbicide treatments were applied to plants with 8 to 10 leaves. The variables were visual assessment of control (%) (range 0-100) at 3, 7, 14, 21 and 28 days after treatments and the mass of green and dry matter of roots and shoots, producing the total mass and relative, by its expression as a percentage of treatment without herbicide to 28 days. The results show that E. mollis emerges during all months of the year, with major emergencies in the months of November, February and May. But the seed bank pointed to the presence in the average of all samples of 400 seeds m2 of E. mollis in the 0 to 5 cm and inexpressive 5 to 10 cm. There was a weak correlation between the emerged plants and seed bank, proving to be the most intense emergency probably due to soil temperature for the months of November, February and May. It can be suggested that emergency peaks coincide with the time of implantation of cultures and thus represent the best opportunities to make up the control. The results found with the curves show that glyphosate and 2,4-D are not efficient in the control and can not conclude on the efficiency metsulfuron, flumioxazin and saflufenacil. / Elephantopus mollis é uma espécie da família Asteraceae recentemente encontrada em cultivos de soja/pastagens de inverno na região centro-oeste do Rio Grande do Sul, Brasil. Sua presença tem reduzido o rendimento e aumentado o custo de produção dessas culturas. Com o objetivo de conhecer o padrão de emergência da espécie ao longo do ano e sua sensibilidade aos principais herbicidas empregados nesses cultivos é que realizou-se o presente trabalho. Para determinar o fluxo de emergência e a estimativa do banco de sementes na área foram conduzidos dois experimentos em área rural do município de Tupanciretã, e para a resposta aos herbicidas foram conduzidos cinco ensaios de curvas de dose-resposta com os herbicidas glifosato, 2,4-D, metsulfuron-metil, flumioxazin e saflufenacil. Nos experimentos para a emergência foram demarcadas duas áreas próximas. Uma mantida sem cultivo e outra submetida ao cultivo usual da área total. Em ambas, os tratamentos foram representados pelos doze meses do ano para realizar a contagem das plantas emergidas para cada mês, com quatro repetições. As amostras para estimar o banco de sementes foram coletadas no mês de agosto, em cada uma das doze parcelas da área mantida sem cultivo, nas profundidades de 0 a 5 cm e de 5 a 10 cm. Em bandejas mantidas em casa de vegetação, foram efetuadas as contagens das plantas emergidas, a cada 15 dias, durante 150 dias. Para as curvas de dose-resposta foram estabelecidas doses representando a divisão e múltiplo da dose recomendada dos herbicidas para espécies similares, na forma: 0; x/8; x/4; x/2; x; 2x; 4x; 8x. Para glifosato x = 1440 g ea ha-1, 2,4-D x = 670 g ea ha-1, metsulfuron x = 2,4 g ia ha-1, flumioxazin x = 50 g ia ha-1 e saflufenacil x = 35 g ia ha-1. Os tratamentos herbicidas foram aplicados sobre plantas com 8 a 10 folhas. As variáveis foram a avaliação visual de controle (%) (escala 0-100) aos 3, 7, 14, 21 e 28 dias após os tratamentos e a massa de matéria verde e seca das raízes e parte aérea, produzindo a massa total e relativa, por sua expressão em percentagem do tratamento sem herbicida aos 28 dias. Os resultados demonstram que E. mollis emerge durante todos meses do ano, com maiores emergências nos meses de novembro, fevereiro e maio. Já a estimativa do banco de sementes apontou para a presença, na média de todas amostras, de 400 sementes m2 de E. mollis na profundidade de 0 a 5 cm e inespressiva entre 5 a 10 cm. Houve uma fraca correlação entre as plantas emergidas e o banco de sementes, demonstrando ser a emergência mais intensa provavelmente devido à temperatura do solo dos meses de novembro, fevereiro e maio. Pode-se sugerir que os picos de emergência coincidem com os momentos de implantação das culturas e representam assim as melhores oportunidades para realizar-se o controle. Os resultados das curvas demonstram que glifosato e 2,4-D não são eficientes no controle e não se pode concluir sobre a eficiência de metsulfuron, flumioxazin e saflufenacil.
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Modelos matemáticos para predição das exigências nutricionais da colina para frangos de corte / Mathematical models for prediction of nutritional requirement of the choline for chicks

Michele Bernardino de Lima 26 July 2012 (has links)
A colina é um nutriente essencial nas dietas de frangos de corte. Os valores de exigências nutricionais são variáveis e foram estabelecidos há muitos anos. Assim, o objetivou-se com este trabalho reavaliar as respostas de frangos de corte de alto potencial genético de 1 a 7, 1 a 14 e 1 a 21 dias de idade como também modelar as respostas por diferentes funções matemáticas. Foram conduzidos dois experimentos sob dois níveis de metionina na dieta, tendo como base o método dose-resposta. Para os ensaios, foram utilizados 2.160 pintos de corte machos da linhagem Cobb 500 (1.080 em cada experimento), distribuídos em um delineamento inteiramente casualizado, com seis tratamentos, seis repetições e 30 aves por unidade experimental. Os tratamentos consistiram em rações com níveis de 390, 715, 1.040, 1.365, 1.690 e 2.015 mg/kg de colina. As rações experimentais foram formuladas utilizando-se a técnica da suplementação. Foi formulada uma ração basal à base de milho, farelo de soja, concentrado proteico de soja, açúcar e amido contendo 390 mg/kg de colina total e 0,596% de metionina digestível. O cloreto de colina (62,5%) comercial foi suplementado para obter os demais níveis. O segundo experimento consistiu nos mesmos tratamentos do primeiro, porém com atendimento de 0,440% da metionina digestível. As variáveis mensuradas em ambos os ensaios foram: consumo de ração, consumo de colina, conversão alimentar e ganho de peso. Para modelar as respostas considerou-se o consumo de colina como variável independente e ganho de peso como variável dependente. As respostas foram modeladas por cinco modelos matemáticos: broken line, broken line com ascendência quadrática, cinética de saturação, logístico e monomolecular e o melhor modelo foi selecionado pelo critério de Akaike. As análises estatísticas foram realizadas com auxílio do programa computacional SAS® utilizando o procedimento PROC GLM para análise das pressuposições e análise de variância e PROC NLIN para o ajuste dos modelos. Os modelos que melhor se ajustaram foram: Broken line com ascendência quadrática (1,26 mg/g de GP ensaio 1) e Logístico (1,26 mg/g de GP ensaio 2) para o período de 1 a 7 dias. No período de 1 a 14 dias os modelos selecionados para o experimento com metionina normal e reduzida foram Logístico (1,16 mg/g de GP) e Broken line com ascendência quadrática (1,28 mg/g de GP), respectivamente. Já para o período de 1 a 21 foram o cinética de saturação, estimando uma exigência de 1,35 mg/g de GP para o experimento com metionina normal, e Broken line com ascendência quadrática estimando uma exigência de 1,21 mg de colina/g de GP para o experimento com metionina reduzida. / Choline is an essential nutrient in the diets of chicks. Supplementation levels in feeds is variable and requirements have been established many years ago. Thus, the objective of this study was to reassess the responses of high genetic potential chicks from 1-7, 1-14 and 1 to 21 days as well as modeling the responses of different mathematical functions. Two trials were conducted using two dietary levels of methionine, based on the dose-response method. For the trials were used 2,160 Cobb 500 male broiler chicks (1,080 birds in each experiment), distributed in a completely randomized design with six treatments and six replicates and 30 birds per experimental unit. The treatments consisted of diets with levels of 390, 715, 1,040, 1,365, 1,690 and 2,015 mg/kg of choline. The diets were formulated using the supplementation method. The basal diet was formulated based on corn, soybean meal, soy protein concentrate, sugar and starch, and contained 390 mg/kg of choline and 0.596% of digestible methionine. Commercial choline chloride (62.5%) was supplemented to obtain the other levels. The second trial consisted of the same treatments of the first, but with 0.440% of digestible methionine. The variables measured in both trials were: feed intake (FI), intake of choline (IC), feed conversion (FC) and weight gain (WG). To model the responses, the variables used were the intake of choline as an independent variable and weight gain as the dependent variable. The responses were modeled by five mathematical models: broken line (ascending linear and quadratic segments), saturation kinetic, 4-parameter logistics and monomolecular models and the best model was selected by Akaike information criterion. Statistical analyzes were performed using the computer program SAS® using PROC GLM for analysis of the assumptions and analysis of variance and PROC NLIN to fit the models. The models that best fit were: broken line quadratic segments (1.26 mg/g of WG - trial 1) and Logistics (1.26 mg/g of WG - trial 2) for the period 1-7 days. In the period 1-14 days, the models selected for the experiment with normal and deficient methionine were Logistic (1.16 mg/g WG) and broken line quadratic segments (1.28 mg/g WG), respectively. For the period 1-21days, the models were the saturation kinetics, estimating a requirement of 1.35 mg/g of WG for the experiment with normal methionine, and broken line quadratic segments estimating a requirement of 1.21 mg choline/g of WG for the experiment with deficient methionine.

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