Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-05-09T18:09:49Z No. of bitstreams: 1 DELANO HÉLIO OLIVEIRA - DISSERTAÇÃO PPGCC 2015..pdf: 994388 bytes, checksum: 3aafc37c8cabe33b27414e66db934ccb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-09T18:09:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DELANO HÉLIO OLIVEIRA - DISSERTAÇÃO PPGCC 2015..pdf: 994388 bytes, checksum: 3aafc37c8cabe33b27414e66db934ccb (MD5) Previous issue date: 2015 / O desenvolvimento de aplicações corporativas modernas para web baseia-se na utilização de padrões e ferramentas para viabilizar a rápida prototipagem, garantindo a separação entre modelo de negócio e interface gráfica de usuário (GUI, do inglês Graphical User Interface). As plataformas de Scaffold, por exemplo, permitem um aumento da produtividade dos desenvolvedores ao gerarem código a partir dos elementos do modelo conceitual. Porém,o código fonte de GUI gerado apresenta muita replicação, devido ao acoplamento ainda existente entre os componentes das telas de interface gráfica e as propriedades inerentes ao modelo conceitual da aplicação, dificultando a manutenção do software. Os padrões de renderização propostos por Welick et al. se apresentam como uma solução conceitual para este problema, através do mapeamento de metadados do modelo conceitual em componentes gráficos, organizando o código de GUI e reduzindo a replicação de código. Neste trabalho, tem-se como objetivo a criação de um arcabouço para o desenvolvimento de aplicações corporativas com arquitetura web moderna, com foco em GUI, baseado em padrões de renderização. O arcabouço permite que o desenvolvedor construa componentes de GUI sem acoplá-los aos elementos do modelo conceitual. A associação da GUI com o modelo conceitual é feita através de regras de renderização, que podem ser alteradas facilmente. O arcabouço proposto foi validado através de um estudo de caso, no qual foi demonstrada uma redução significativa na duplicação do código quando comparada às plataformas de Scaffold. / The modern enterprise web application development is based on the use of patterns and tools to enable rapid prototyping, ensuring separation between the business model and graphical user interface (GUI). The Scaffold frameworks, for example, allows an increase in productivity of developers to generate code from the elements of domain model. However, the GUI source code generated presents a lot of replications due to coupling still extant between GUI components and properties inherent to the domain model of the application, making it difficult to maintain the software. The rendering patters proposed by Welick et al. are presented as a conceptual solution to this problem by mapping domain model metadata to graphical components, organizing the GUI code and reducing code duplication. In this Work, we have aimed to create a framework for enterprise applications development with web modern architecture, focusing on GUI, based on rendering patterns. This framework allows the developer to build GUI components without engage to elements of domain model. The GUI link with domain model is made by rendering rules, which can be changed easily. The proposed framework was validated by a case study in which it was demonstrated a significant reduction in code duplication when compared to Scaffold frameworks.

O principal objetivo desta tese é a investigação do foco narrativo nos romances Nenhum olhar e Cemitério de pianos, de José Luís Peixoto, com vistas a defender a hipótese de que o narrador em primeira pessoa promove a assunção de duplos. Ambas as obras trazem personagens que contam a sua história e, no processo da narração, entram em contato consigo mesmas, sob uma perspectiva pautada nas deformações intrínsecas à passagem do tempo. Nesse sentido, a faculdade da memória assume um papel fundamental na relativização do passado. Trata-se, em primeiro lugar, de uma análise do plano da expressão. Concomitante à questão do narrador e seus duplos, observamos que o conteúdo de ambos os romances evoca o tema da busca da salvação. Compreendemos que a concepção de mundo que permeia as referidas obras está pautada na jornada de Cristo na Terra e, em especial, ao drama da Paixão. Concluímos, pois, que, ao desejo do narrador em primeira pessoa de contar a sua história, estão intimamente relacionados o fenômeno do duplo e a negação da morte. Desse modo, por meio da duplicação, as personagens entram em contato com uma realidade supratemporal, fundada no mito. / The main objective of this thesis is the investigation of narrative focus on novels Nenhum olhar and Cemitério de pianos, by José Luís Peixoto, in order to defend the hypothesis that the first-person narrator promotes the assumption of doubles. Both works bring characters to tell their story and in the process of narration, get in touch with themselves, a perspective based on the deformations intrinsic to the passage of time. In this sense, the faculty of memory plays a key role in the relativization of the past. It is, firstly, an analysis of the level of expression. Concomitant with the question of the narrator and his double, we observed that the contents of both novels evoke the theme of the quest for salvation. We understand that the world view that permeates these works is based on the journey of Christ on Earth and in particular the drama of the Passion. Therefore we conclude that the desire of the first-person narrator to tell his story, are closely related to the phenomenon of the double and the denial of death. Thus, by duplicating the characters come into contact with supratemporal reality, founded on myth.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-04-24T14:03:12Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) dissertacao-mestrado.pdf: 2772669 bytes, checksum: 25b575026c012270168ca5a4c397d063 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T14:03:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) dissertacao-mestrado.pdf: 2772669 bytes, checksum: 25b575026c012270168ca5a4c397d063 (MD5) Previous issue date: 2015-07-29 / CNPQ / N-Graphs is a multiple conclusion natural deduction with proofs as directed graphs, motivated by the idea of proofs as geometric objects and aimed towards the study of the geometry of Natural Deduction systems. Following that line of research, this work revisits the system under a purely combinatorial perspective, determining geometrical conditions on the graphs of proofs to explain its soundness criterion and proof growth during normalization. Applying recent developments in the fields of proof graphs, proof-nets and N-Graphs itself, we propose a linear time algorithm for proof verification of the full system, a result that can be related to proof-nets solutions from Murawski (2000) and Guerrini (2011), and a normalization procedure based on the notion of sub-N-Graphs, introduced by Carvalho, in 2014. We first present a new soundness criterion for meta-edges, along with the extension of Carvalho’s sequentization proof for the full system. For this criterion we define an algorithm for proof verification that uses a DFS-like search to find invalid cycles in a proof-graph. Since the soundness criterion in proof graphs is analogous to the proof-nets procedure, the algorithm can also be extended to check proofs in the multiplicative linear logic without units (MLL−) with linear time complexity. The new normalization proposed here combines a modified version of Alves’ (2009) original beta and permutative reductions with an adaptation of Carbone’s duplication operation on sub-N-Graphs. The procedure is simpler than the original one and works as an extension of both the normalization defined by Prawitz and the combinatorial study developed by Carbone, i.e. normal proofs enjoy the separation and subformula properties and have a structure that can represent how patterns lying in normal proofs can be recovered from the graph of the original proof with cuts. / N-Grafos é uma dedução natural de múltiplas conclusões onde provas são representadas como grafos direcionados, motivado pela idéia de provas como objetos geométricos e com o objetivo de estudar a geometria de sistemas de Dedução Natural. Seguindo esta linha de pesquisa, este trabalho revisita o sistema sob uma perpectiva puramente combinatorial, determinando condições geométricas nos grafos de prova para explicar seu critério de corretude e crescimento da prova durante a normalização. Aplicando desenvolvimentos recentes nos campos de grafos de prova, proof-nets e dos próprios N-Grafos, propomos um algoritmo linear para verificação de provas para o sistema completo, um resultado que pode ser comparado com soluções para roof-nets desenvolvidas por Murawski (2000) e Guerrini (2011), e um procedimento de normalização baseado na noção de sub-N-Grafos, introduzidas por Carvalho, em 2014. Apresentamos primeiramente um novo critério de corretude para meta-arestas, juntamente com a extensão para todo o sistema da prova da sequentização desenvolvida por Carvalho. Para este critério definimos um algoritmo para verificação de provas que utiliza uma busca parecida com a DFS (Busca em Profundidade) para encontrar ciclos inválidos em um grafo de prova. Como o critério de corretude para grafos de provas é análogo ao procedimento para proof-nets, o algoritmo pode também ser estendido para validar provas em Lógica Linear multiplicativa sem units (MLL−) com complexidade de tempo linear. A nova normalização proposta aqui combina uma versão modificada das reduções beta e permutativas originais de Alves com uma adaptação da operação de duplicação proposta por Carbone para ser aplicada a sub-N-Grafos. O procedimento é mais simples do que o original e funciona como uma extensão da normalização definida por Prawitz e do estudo combinatorial desenvolvido por Carbone, i.e. provas em forma normal desfrutam das propriedades da separação e subformula e possuem uma estrutura que pode representar como padrões existentes em provas na forma normal poderiam ser recuperados a partir do grafo da prova original com cortes.

Submitted by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2016-09-08T19:58:04Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriel Eliseu Silva - 2014.pdf: 1496066 bytes, checksum: 022a464ffaf53a95f5e7c2aba78aeff4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2016-09-08T19:58:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriel Eliseu Silva - 2014.pdf: 1496066 bytes, checksum: 022a464ffaf53a95f5e7c2aba78aeff4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-08T19:58:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Gabriel Eliseu Silva - 2014.pdf: 1496066 bytes, checksum: 022a464ffaf53a95f5e7c2aba78aeff4 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-08-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / (Dynamics of the shrub-tree community in three areas of cerrado sensu stricto in the municipality of Jataí, southwest of Goiás). The aim of the study was to assess the changes in shrub-tree community in a range of approximately three years, involving changes in the structure and vegetation composition with soil factors and the fire. The study was conducted in three areas of “cerrado sentido restrito”, using a ten plots of 20 × 50m in each area. All shrub-tree individuals with DAS (diameter at the heigh of the ground) ≥ 5 cm in the first survey (T1) were plaquetados, estimated their heights and identified their species (2009 in BAT and LAJ, and 2010 in FRP). The second survey (T2) was carried out in 2012 in the area of LAJ and in 2013 in the other two areas (BAT and FRP). T2 survivors were re-measured and those who have to enter the inclusion criteria (recruits) were measured and plaquetados. T1 in BAT, it was found 70 species, 853 individuals and basal area of 8.75 m2. T2 is sampled-63 species, 601 individuals and basal area of 9.12 m2. In the interval between the two surveys (4.16 years) nine species disappeared and two joined the community. The diversity index of Shannon and Pielou evenness were 3.26 and 0.77, respectively, for T1. For T2, only the diversity changed, dropping to 3.16. The average annual mortality rate was 11.55% and the recruitment 2.4%. In LAJ met 83 species, 1391 individuals and basal area of 16.82 m2 in T1 and T2 is already sampled-87 species, 1503 individuals and basal area of 18.65 m2. In the period of 3.58 years, eight species entered four disappeared in the community. The diversity index was 3.62 at T1 and T2 3.65. The average annual mortality rate was 2.27% and 4.13% of recruitment. In FARP met 77 species, 1863 individuals and basal area of 10.87 m2 in T1, T2 and already sampled to 75 species, 1395 individuals and basal area of 10.1 m2. In the period of three years, seven species have disappeared and five joined the community. The diversity index was 3,62 at T1 and T2 3,65. For the evenness values were 0,8 for both surveys. The average annual mortality rate was 10,37% and 1,73% of recruitment. The three cerrado narrow sense fragments altered the species richness, the number of individuals and basal area, but no significant changes in the diversity index between the first and the second survey. This may be related to variations in wealth, depending on the species with few individuals. The highest mortality found for BAT and FRP may be related to the presence of fire, while for the LAJ the largest recruitment is associated with absence of disturbance. The change in density and growth of individuals can still be conditioned to the soil characteristics. In LAJ and BAT the clay soil, while allowing the establishment and growth of forest species and individuals susceptible to fire, in BAT, it is believed that the fire has acted as limiting changes in the structure, preventing the density of vegetation; and LAJ, the increased density and increased basal area possibly occurred in the absence of fire. In the FRP, it is suggested that any fire and the sandy soil can contribute to the limitation on structural changes and the wealth of the community. Thus, in the LAJ greater rate of recruitment in relation to the recorded mortality, may possibly be related to the absence of fire and soil characteristics, providing tree compaction stage and a possible succession of the community, indicating the formation of a cerradão. Regarding the areas of BAT and FARP the highest mortality rates in relation to recruitment may ester associated with the presence of fire, preventing the thickening in the community and keeping the cerrado vegetation type narrow sense. / (Dinâmica da comunidade arbustivo-arbórea de três áreas de cerrado sentido restrito no município de Jataí, sudoeste de Goiás). O objetivo do trabalho foi verificar as mudanças ocorridas na comunidade lenhosa em um intervalo aproximado de três anos, associando as alterações na estrutura e na composição vegetacionais com os fatores edáficos e o fogo. O estudo foi realizado em três áreas de cerrado sentido restrito, utilizando dez parcelas de 20 × 50m em cada área, onde foram amostrados todos os indivíduos lenhosos com DAS (diâmetro a altura do solo) ≥ 5 cm no primeiro levantamento (T1), plaquetados, estimados suas alturas e identificados suas espécies (2009 no BAT e na LAJ, e 2010 na FRP). O segundo levantamento (T2) foi realizado em 2012 na área da LAJ e em 2013 nas outras duas áreas (BAT e FRP). Em T2 os sobreviventes foram remedidos e aqueles que passaram a entrar no critério de inclusão (recrutas) foram mensurados e plaquetados. Em T1 no BAT, encontrou-se 70 espécies, 853 indivíduos e área basal de 8,75 m2. Em T2 amostrou-se 63 espécies, 601 indivíduos e área basal de 9,12 m2. No intervalo entre os dois levantamentos (4,16 anos) nove espécies desapareceram e duas ingressaram na comunidade. O índice de diversidade de Shannon e a equabilidade de Pielou foram 3,26 e 0,77, respectivamente, para T1. Para T2, apenas a diversidade alterou, caindo para 3,16. A taxa média anual de mortalidade foi 11,55% e a de recrutamento 2,4%. Na LAJ encontrou-se 83 espécies, 1391 indivíduos e área basal de 16,82 m2 em T1, e já em T2 amostrou-se 87 espécies, 1503 indivíduos e área basal de 18,65 m2. No período de 3,58 anos, oito espécies ingressaram e quatro desapareceram na comunidade. O índice de diversidade em T1 foi de 3,62 e em T2 3,65. A taxa média anual de mortalidade foi de 2,27% e a de recrutamento 4,13%. Na FARP encontrou-se 77 espécies, 1863 indivíduos e área basal de 10,87 m2 em T1, e já em T2 amostrou-se 75 espécies, 1395 indivíduos e área basal de 10,1 m2. No período de 3,0 anos, sete espécies desapareceram e cinco ingressaram na comunidade. O índice de diversidade em T1 foi de 3,62 e em T2 3,65. Para a equabilidade os valores foram 0,8 para ambos os levantamentos. A taxa média anual de mortalidade foi de 10,37% e a de recrutamento 1,73%. Os três fragmentos de cerrado sentido restrito alteraram a riqueza de espécies, o número de indivíduos e área basal, porém não houve mudanças consideráveis nos índices de diversidade entre o primeiro e o segundo levantamento. Isso pode estar relacionado à variação da riqueza, em função das espécies que apresentaram poucos indivíduos. As maiores mortalidades encontradas para a BAT e FRP podem estar relacionadas à presença do fogo, enquanto para a LAJ o maior recrutamento esteja associado à ausência da perturbação. A alteração na densidade e o crescimento dos indivíduos podem estar condicionados ainda às características do solo. Na LAJ e no BAT o solo argiloso, apesar de possibilitar o estabelecimento e crescimento dos indivíduos de espécies florestais e sensíveis ao fogo, no BAT, acredita-se que o fogo tem atuado como limitante nas alterações da estrutura, impedindo o adensamento da vegetação; e na LAJ, o aumento da densidade e incremento em área basal, possivelmente ocorreu devido à ausência de queimadas. Já na FRP, sugere-se que o fogo eventual e o solo arenoso possam contribuir com a limitação nas alterações estruturais e na riqueza da comunidade. Assim, na LAJ a maior taxa de recrutamento registrada em relação à de mortalidade, possivelmente pode estar relacionada à ausência do fogo e às características do solo, proporcionando o adensamento arbóreo e um possível estágio sucessional da comunidade, indicando a formação de um cerradão. Em relação às áreas do BAT e da FARP as maiores taxas de mortalidade em relação às de recrutamento podem estar associadas à presença de queimadas, impedindo o adensamento na comunidade e mantendo a fitofisionomia de cerrado sentido restrito.

Introdução: Polineuropatias são doenças do sistema nervoso periférico com etiologias variadas. Dentre elas são freqüentes as inflamatórias e as hereditárias, com prevalência de 0,67-7,7/100000 e 7,9-82,3/100000 para polineuropatia inflamatória desmielinizante crônica (PIDC) e Doença de Charcot-Marie-Tooth (CMT), respectivamente. Existem poucas evidências de sobreposição entre estas duas doenças e também algumas dificuldades diagnósticas em situações específicas. Objetivos: Estudar a freqüência de mutações (duplicações e deleções) do gene PMP22 em uma coorte de pacientes inicialmente diagnosticados como PIDC ou suspeitos de apresentarem as duas condições, os sinais e sintomas sugestivos da sobreposição e os fatores implicados em erro de classificação da neuropatia. Métodos: 111 pacientes com diagnóstico de PIDC foram estudados. DNA foi isolado a partir de leucócitos de sangue periférico segundo protocolo padrão. Duplicações e deleções do gene PMP22 foram avaliadas através de marcadores polimórficos do DNA localizados dentro do cromossomo 17p11.2-12, o qual contém o gene PMP22. Achados clínicos e laboratoriais também foram estudados e comparados entre os grupos. Resultados: Dentre os 111 pacientes estudados, mutações no PMP22 foram encontradas em 10 (9%), sendo duplicações em 9 pacientes e deleção em 1 paciente. Concomitância entre PIDC e CMT foi verificada em 4 pacientes (3,6%), todos com duplicação do PMP22. Os outros 6 pacientes foram diagnosticados como CMT puro (5) ou Neuropatia Hereditária Susceptível à Compressão (1), visto que não apresentaram melhora com o uso de tratamento imunomodulador e/ou imunossupressor (5 casos) ou foi estabelecido diagnóstico alternativo associado (1). Os outros 101 pacientes não tiveram duplicação nem deleção deste gene e, portanto, tinham PIDC apenas. Idade média dos pacientes com PIDC/CMT foi de 23,8±18,0 anos e 43,6±19,3 anos para pacientes sem mutações (p=0,04). Houve diferença estatísticamente significativa na resposta ao tratamento entre os grupos PIDC/CMT X CMT (p=0,008) e PIDC X CMT (p=0,00). Ausência de história familiar e presença de doenças e hábitos ligados ao desenvolvimento de neuropatias periféricas, como diabetes mellitus e ingesta de bebidas alcoólicas, por exemplo, bem como achados atípicos na eletroneuromiografia e na biópsia de nervo podem ter contribuído para a confusão diagnóstica nos casos de CMT puro. Conclusões: Alguns pacientes podem desenvolver PIDC em associação com CMT e se beneficiam do tratamento. A neuropatia hereditária poderia predispor à neuropatia inflamatória, uma vez que estes pacientes tendem a apresentar essa condição em idades mais precoces. Cautela deve ser dispensada àqueles pacientes com suspeita diagnóstica de PIDC que não têm os achados clássicos ou não melhoram com o tratamento, uma vez que podem apresentar outras etiologias para a neuropatia, dentre elas uma neuropatia hereditária, como a CMT. / Introduction: Polyneuropathies are peripheral nervous system disorders with a wide range of etiologies. Among them, inflammatory and hereditary are frequent with prevalence of 0.67-7.7/100000 and 7.9-82.3/100000, for chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy (CIDP) and Charcot-Marie-Tooth disease (CMT), respectively. There are a few evidence of ovelapping between these two conditions and also some diagnostic difficulties in specific situations. Objectives: To study the frequency of mutations in PMP22 gene (duplications and delections) among a cohort of patients initially diagnosed as CIDP or suspected to have both conditions, the signs and symptoms related to this ovelapping and factors implicated in misdiagnose. Methods: 111 patients with an initially CIDP suspected diagnosis were studied. DNA was isolated from peripheral blood leucocytes following a standard salting-out protocol. Duplications and delections in the PMP22 gene were analysed by polymorphic DNA markers located within the chromosome 17p11.2-12, wich contains the PMP22 gene. Clinical and laboratory findings were also studied and compared within groups. Results: Among 111 patients studied, 10 (9%) were found to harbor mutations in PMP22 gene, specifically duplications in nine and delection in one. We therefore diagnosed CIDP plus CMT in four patients (3.6%), all of them with a duplicated PMP22 gene. The other six patients were diagnosed as pure CMT (5) or Hereditary Neuropathy with liability to Pressure Palsy (1), as they did not improved with the use of immunomodulatory and/or immunosupressive treatment (five cases) or were found to have alternative associated diagnosis (one patient). The other 101 patients did not show duplication nor delection in this gene, so they had CIDP. Mean age of patients with CIDP/CMT were 23.8±18.0 years and 43.6±19.3 years for patients without mutations (p=0.04). There were statistically significant difference in treatmet response between groups CIDP/CMT X CMT (p=0.008) and CIDP X CMT (p=0.00). The lack of family history and presence of other diseases and habits linked to the development of peripheral neuropathies, as diabetes mellitus and alcohol intake, for instance, as well as atypical findings in electrodiagnostic studies and nerve biopsy may have contributed to misdiagnose in the pure CMT cases. Conclusions: Some patients may develop CIDP in association with CMT and have benefit from treatment. The hereditary neuropathy may predispose to the inflammatory neuropathy as these patients tend to show this condition at younger ages. Caution should be dispensed to those patients with a suspected diagnose of CIDP who do not have the classical disease findings or do not improve with treatment, as they can have alternative etiologies for the neuropathy, among them a hereditary neuropathy as CMT disease.

A pesquisa de variações no número de cópias (CNVs; copy number variants) cromossômicas tem revelado o importante papel destas alterações genômicas na diversidade populacional e na etiologia de doenças humanas. O modelo de associação de CNVs a doenças envolve deleções e/ou duplicações individualmente raras, mas com segmentos cromossômicos de tamanhos relevantes. Os pacientes com baixa estatura de início pré-natal constituem um grupo heterogêneo com quadros clínicos complexos frequentemente resultantes de alterações genéticas, que, desde o período intrauterino, perturbam os mecanismos e vias de desenvolvimento e crescimento fetais. Assim sendo, aventamos a hipótese de que CNVs raras possam estar entre as causas genéticas de baixa estatura de início prénatal. Para tanto, nosso estudo visou avaliar a presença de deleções ou duplicações submicroscópicas em um grupo selecionado de pacientes nascidos pequenos para idade gestacional (PIG) com baixa estatura persistente sem causa definida. Foram avaliados 51 pacientes nascidos PIG com baixa estatura persistente após o 4º ano de vida que apresentavam dismorfismos, atraso de desenvolvimento neuropsicomotor (DNPM) ou deficiência intelectual, porém sem caracterizar síndromes conhecidas e com cariótipo normal. Amostras de DNA dos pacientes foram submetidas à hibridização genômica comparativa por microarray (aCGH; array comparative genomic hybridization) baseada em oligonucleotídeos na plataforma 60K. Os achados foram comparados com CNVs descritas em bancos de dados de controles normais. Foram identificadas 18 CNVs, ausentes em controles saudáveis, em 17 dos 51 pacientes (33%). As alterações foram avaliadas para classificação de sua patogenicidade de acordo com os seguintes critérios: 1) padrão de herança e segregação familiar; 2) sobreposição a coordenadas genômicas de síndromes conhecidas; 3) sobreposição a CNVs patogênicas descritas em banco de dados; 4) e conteúdo gênico. Quatro CNVs, encontradas em 3 pacientes, foram classificadas como patogênicas: 1) del 22q11.21; 2) dup 10q26.2-26.3 e del 10q26.3; e 3) del 4q28.2-q31.21. Cinco CNVs, encontradas em 5 pacientes, foram classificadas como provavelmente patogênicas: 4) del 3q27.1-q27.3; 5) del 20p13; 6) dup 14q11.2-q12; 7) dup 16q24.1-q24; e 8) dup Xq31.1-q13.2. Somando os grupos, encontramos CNVs patogênicas ou provavelmente patogênicas em 16% do total de pacientes. De acordo com a segregação familiar, 4 variações foram consideradas de significado clínico incerto, enquanto 5 foram benignas. Para estabelecer uma relação causal genótipo-fenótipo e identificar genes associados a baixa estatura de início pré-natal, foi realizada uma análise ampla do conteúdo gênico das variações classificadas como patogênicas, provavelmente patogênicas ou de significado clínico incerto, através do uso de efetivas ferramentas de bioinformática. Nossos resultados nos levam às seguintes conclusões: 1) a frequência de CNVs patogênicas e provavelmente patogênicas no estudo foi de 16%, evidenciando que CNVs raras provavelmente estão entre as causas genéticas de baixa estatura de início pré-natal; 2) o aCGH permitiu a elucidação do diagnóstico e das bases genéticas envolvidas no fenótipo em 8 pacientes selecionados; e 3) foram encontradas CNVs em diferentes regiões cromossômicas, com diferentes genes candidatos, que podem estar envolvidos nos mecanismos de regulação do crescimento e/ou nas vias regulatórias de desenvolvimento intrauterino / Analysis of chromosomic copy number variants (CNVs) have demonstrated the important role of these genomic imbalances in population diversity and human disease. The model of CNV disease association involves deletions and/or duplications that are individually rare but encompass chromosomal segments of relevant size. Prenatal onset short stature patients constitute a complex group characterized by clinical heterogeneity. The causes of prenatal growth impairment frequently involve genetic changes that disturb the mechanisms and the pathways of fetal growth and development. Thus, we hipothesized that rare CNVs might contribute to the genetic etiology of prenatal onset short stature. In order to evaluate this assumption, our study analyzed the presence of submicroscopic deletions and/or duplications in a selected group of patients born small for gestational age with persistent short stature but without a recognized cause. A total of 51 patients with prenatal and postnatal growth retardation associated with dysmorphic features, developmental delay and/or intellectual disability, but without criteria for known syndromes, were selected. All patients had normal G-banded karyotyping. Array-based comparative genomic hybridization (aCGH) in a whole-genome 60K platform was performed using DNA obtained from all patients. Detected CNVs were compared with CNV data from healthy controls individuals, excluding common copy number polymorphisms. In 17 of the 51 patients screened (33%), 18 rare CNVs were identified. The pathogenicity of CNVs was assessed by considering the following criteria: inheritance and familial segregation; overlap with genomic coordinates for a known genomic imbalance syndrome; overlap with CNVs previously identified in other patients with prenatal onset short stature; and gene content. Four distinct CNVs, found in three patients, were classified as pathogenic: 1) del 22q11.21; 2) dup 10q26.2-26.3 and del 10q26.3; and 3) del 4q28.2-q31.21. Five CNVs, found in five patients, were classified as probably pathogenic: 4) del 3q27.1-q27.3; 5) del 20p13; 6) dup 14q11.2-q12; 7) dup 16q24.1-q24; and 8) dup Xq31.1-q13.2. Taken both groups together, we found pathogenic or probably pathogenic CNVs in 16% of patients. According to familial segregation, four variants were considered as variants of uncertain clinical significance, while five variants were considered as benign. In an attempt to establish a causal genotype-phenotype correlation and to identify genes involved in growth impairment of prenatal onset, the gene content of the variants was analyzed using bioinformatics tools for gene prioritization. Based on our results, it is possible to make the following conclusions: 1) the frequency of pathogenic or probably pathogenic CNVs was at least 16%, indicating that rare CNVs are probably among the genetic causes of prenatal onset short stature; 2) aCGH clarified the diagnosis and the genetic etiology involved in the phenotype of 8 selected patients; and 3) we found CNVs in distinct chromosomal regions with several candidate genes that may be involved in the mechanisms of growth regulation and/or in the regulatory pathways of intrauterine development

Esta pesquisa tem por objetivo verificar se os alunos-informantes, aprendizes brasileiros de espanhol como língua estrangeira, e futuros professores, utilizam a duplicação, assim como investigar se a hipótese de que a experiência em sala de aula focada no fornecimento de input abundante e centrada na comunicação pode levar a melhores resultados no uso de pronomes clíticos e das duplicações em comparação aos obtidos por meio de trabalho centrado na gramática. Para tanto, propusemos um experimento com três diferentes situações pedagógicas de expor os alunos-informantes às duplicações em estruturas com o pronome clítico em espanhol, a fim de comprovar se há diferença no resultado final da aprendizagem a partir de diferentes processos de manipulação do input (PMI). Como o fenômeno que analisamos está estritamente relacionado à organização da estrutura informacional visando à melhor veiculação da informação em benefício da comunicação, adotamos a Gramática Funcional da corrente holandesa (DIK, 1981, 1989, 1997) para o entendimento do referido fenômeno. Pela mesma razão, buscamos uma teoria de aquisição e aprendizagem que pudesse corroborar o experimento que realizamos com os alunos-informantes, com o intuito de verificar a validade de nossa proposta de diferença no output destes aprendizes em função de processos, também diferenciados, de manipulação do input. Deste modo, a Teoria do Monitor proposta por Krashen (1976 e 1982), mais especificamente, a Hipótese do Input, pareceu-nos pertinente para testar nossa hipótese sobre o uso da duplicação. Assim, pudemos concluir que os informantes, usaram a duplicação em suas produções a partir de uma situação comunicativa apresentada pela história em quadrinhos selecionada e que há diferença no output em função da metodologia de exposição dos aprendizes aos conteúdos estabelecidos. A proposta metodológica que apresentou input centrado na comunicação e contextualizado obteve resultados mais significativos em termos de output. Esta proposta de PMI atende à concepção funcionalista da linguagem, logo o input que deve ser dado aos aprendizes é aquele que mais se aproxima da situação real de comunicação, pois a estrutura informacional será compreendida, o input será compreensível e possibilitará o processo de aprendizagem/aquisição proposto por Krashen (1982) em sua hipótese do input. / This research aims at verifying if the students-informants, Brazilian learners of Spanish as a foreign language, and future teachers, use the duplicate phenomena, as well as investigate if the hypothesis that the experience in classroom focused on providing abundant input and focused on communication can lead to better results in the use of clitic pronouns and duplicate in comparison to the ones which are focused on grammar. Therefore we proposed an experiment which contemplates three different pedagogical situations that expose the students-informants to the duplicate occurrence of clitic structures in Spanish in order to prove if there is difference in the final result of the learning process starting from different process of manipulation of input (PMI). As the phenomena we analyzed is closely related to the organization of the informational structure aiming at the best way of spreading the information for the benefit of communication, we chose the Functional Grammar based on the Dutch doctrine (Dik, 1981, 1989, 1997) for the understanding of that very phenomenon. For the same reason, we seek a theory of acquisition and learning that could corroborate the experiment we conducted with the students-informants in order to check the validity of our proposal for a difference in the output of these learners in terms of processes, also differentiated, in handling the input. Thus, the Monitor Theory proposed by Krashen (1976 and 1982), more specifically, the Input Hypothesis seemed appropriate to test our hypothesis about the use of duplication. So, we concluded that the informants used the duplicate phenomena in their production from a communicative situation presented by the chosen comic book and that there is some difference in the output depending on the methodology of exposure of learners to the table of contents established. The methodological proposal which presented the input centered on communication and contextualized obtained more significant results in terms of output. This PMI proposal meets the functionalist conception of language, therefore the input that should be given to learners is the one that most closely matches the real situation of communication, because the informational structure is understood, the input is comprehensible and enables the learning process / acquisition proposed by Krashen (1982) in his hypothesis of the input.

Esta pesquisa tem por objetivo verificar se os alunos-informantes, aprendizes brasileiros de espanhol como língua estrangeira, e futuros professores, utilizam a duplicação, assim como investigar se a hipótese de que a experiência em sala de aula focada no fornecimento de input abundante e centrada na comunicação pode levar a melhores resultados no uso de pronomes clíticos e das duplicações em comparação aos obtidos por meio de trabalho centrado na gramática. Para tanto, propusemos um experimento com três diferentes situações pedagógicas de expor os alunos-informantes às duplicações em estruturas com o pronome clítico em espanhol, a fim de comprovar se há diferença no resultado final da aprendizagem a partir de diferentes processos de manipulação do input (PMI). Como o fenômeno que analisamos está estritamente relacionado à organização da estrutura informacional visando à melhor veiculação da informação em benefício da comunicação, adotamos a Gramática Funcional da corrente holandesa (DIK, 1981, 1989, 1997) para o entendimento do referido fenômeno. Pela mesma razão, buscamos uma teoria de aquisição e aprendizagem que pudesse corroborar o experimento que realizamos com os alunos-informantes, com o intuito de verificar a validade de nossa proposta de diferença no output destes aprendizes em função de processos, também diferenciados, de manipulação do input. Deste modo, a Teoria do Monitor proposta por Krashen (1976 e 1982), mais especificamente, a Hipótese do Input, pareceu-nos pertinente para testar nossa hipótese sobre o uso da duplicação. Assim, pudemos concluir que os informantes, usaram a duplicação em suas produções a partir de uma situação comunicativa apresentada pela história em quadrinhos selecionada e que há diferença no output em função da metodologia de exposição dos aprendizes aos conteúdos estabelecidos. A proposta metodológica que apresentou input centrado na comunicação e contextualizado obteve resultados mais significativos em termos de output. Esta proposta de PMI atende à concepção funcionalista da linguagem, logo o input que deve ser dado aos aprendizes é aquele que mais se aproxima da situação real de comunicação, pois a estrutura informacional será compreendida, o input será compreensível e possibilitará o processo de aprendizagem/aquisição proposto por Krashen (1982) em sua hipótese do input. / This research aims at verifying if the students-informants, Brazilian learners of Spanish as a foreign language, and future teachers, use the duplicate phenomena, as well as investigate if the hypothesis that the experience in classroom focused on providing abundant input and focused on communication can lead to better results in the use of clitic pronouns and duplicate in comparison to the ones which are focused on grammar. Therefore we proposed an experiment which contemplates three different pedagogical situations that expose the students-informants to the duplicate occurrence of clitic structures in Spanish in order to prove if there is difference in the final result of the learning process starting from different process of manipulation of input (PMI). As the phenomena we analyzed is closely related to the organization of the informational structure aiming at the best way of spreading the information for the benefit of communication, we chose the Functional Grammar based on the Dutch doctrine (Dik, 1981, 1989, 1997) for the understanding of that very phenomenon. For the same reason, we seek a theory of acquisition and learning that could corroborate the experiment we conducted with the students-informants in order to check the validity of our proposal for a difference in the output of these learners in terms of processes, also differentiated, in handling the input. Thus, the Monitor Theory proposed by Krashen (1976 and 1982), more specifically, the Input Hypothesis seemed appropriate to test our hypothesis about the use of duplication. So, we concluded that the informants used the duplicate phenomena in their production from a communicative situation presented by the chosen comic book and that there is some difference in the output depending on the methodology of exposure of learners to the table of contents established. The methodological proposal which presented the input centered on communication and contextualized obtained more significant results in terms of output. This PMI proposal meets the functionalist conception of language, therefore the input that should be given to learners is the one that most closely matches the real situation of communication, because the informational structure is understood, the input is comprehensible and enables the learning process / acquisition proposed by Krashen (1982) in his hypothesis of the input.

A pesquisa de variações no número de cópias (CNVs; copy number variants) cromossômicas tem revelado o importante papel destas alterações genômicas na diversidade populacional e na etiologia de doenças humanas. O modelo de associação de CNVs a doenças envolve deleções e/ou duplicações individualmente raras, mas com segmentos cromossômicos de tamanhos relevantes. Os pacientes com baixa estatura de início pré-natal constituem um grupo heterogêneo com quadros clínicos complexos frequentemente resultantes de alterações genéticas, que, desde o período intrauterino, perturbam os mecanismos e vias de desenvolvimento e crescimento fetais. Assim sendo, aventamos a hipótese de que CNVs raras possam estar entre as causas genéticas de baixa estatura de início prénatal. Para tanto, nosso estudo visou avaliar a presença de deleções ou duplicações submicroscópicas em um grupo selecionado de pacientes nascidos pequenos para idade gestacional (PIG) com baixa estatura persistente sem causa definida. Foram avaliados 51 pacientes nascidos PIG com baixa estatura persistente após o 4º ano de vida que apresentavam dismorfismos, atraso de desenvolvimento neuropsicomotor (DNPM) ou deficiência intelectual, porém sem caracterizar síndromes conhecidas e com cariótipo normal. Amostras de DNA dos pacientes foram submetidas à hibridização genômica comparativa por microarray (aCGH; array comparative genomic hybridization) baseada em oligonucleotídeos na plataforma 60K. Os achados foram comparados com CNVs descritas em bancos de dados de controles normais. Foram identificadas 18 CNVs, ausentes em controles saudáveis, em 17 dos 51 pacientes (33%). As alterações foram avaliadas para classificação de sua patogenicidade de acordo com os seguintes critérios: 1) padrão de herança e segregação familiar; 2) sobreposição a coordenadas genômicas de síndromes conhecidas; 3) sobreposição a CNVs patogênicas descritas em banco de dados; 4) e conteúdo gênico. Quatro CNVs, encontradas em 3 pacientes, foram classificadas como patogênicas: 1) del 22q11.21; 2) dup 10q26.2-26.3 e del 10q26.3; e 3) del 4q28.2-q31.21. Cinco CNVs, encontradas em 5 pacientes, foram classificadas como provavelmente patogênicas: 4) del 3q27.1-q27.3; 5) del 20p13; 6) dup 14q11.2-q12; 7) dup 16q24.1-q24; e 8) dup Xq31.1-q13.2. Somando os grupos, encontramos CNVs patogênicas ou provavelmente patogênicas em 16% do total de pacientes. De acordo com a segregação familiar, 4 variações foram consideradas de significado clínico incerto, enquanto 5 foram benignas. Para estabelecer uma relação causal genótipo-fenótipo e identificar genes associados a baixa estatura de início pré-natal, foi realizada uma análise ampla do conteúdo gênico das variações classificadas como patogênicas, provavelmente patogênicas ou de significado clínico incerto, através do uso de efetivas ferramentas de bioinformática. Nossos resultados nos levam às seguintes conclusões: 1) a frequência de CNVs patogênicas e provavelmente patogênicas no estudo foi de 16%, evidenciando que CNVs raras provavelmente estão entre as causas genéticas de baixa estatura de início pré-natal; 2) o aCGH permitiu a elucidação do diagnóstico e das bases genéticas envolvidas no fenótipo em 8 pacientes selecionados; e 3) foram encontradas CNVs em diferentes regiões cromossômicas, com diferentes genes candidatos, que podem estar envolvidos nos mecanismos de regulação do crescimento e/ou nas vias regulatórias de desenvolvimento intrauterino / Analysis of chromosomic copy number variants (CNVs) have demonstrated the important role of these genomic imbalances in population diversity and human disease. The model of CNV disease association involves deletions and/or duplications that are individually rare but encompass chromosomal segments of relevant size. Prenatal onset short stature patients constitute a complex group characterized by clinical heterogeneity. The causes of prenatal growth impairment frequently involve genetic changes that disturb the mechanisms and the pathways of fetal growth and development. Thus, we hipothesized that rare CNVs might contribute to the genetic etiology of prenatal onset short stature. In order to evaluate this assumption, our study analyzed the presence of submicroscopic deletions and/or duplications in a selected group of patients born small for gestational age with persistent short stature but without a recognized cause. A total of 51 patients with prenatal and postnatal growth retardation associated with dysmorphic features, developmental delay and/or intellectual disability, but without criteria for known syndromes, were selected. All patients had normal G-banded karyotyping. Array-based comparative genomic hybridization (aCGH) in a whole-genome 60K platform was performed using DNA obtained from all patients. Detected CNVs were compared with CNV data from healthy controls individuals, excluding common copy number polymorphisms. In 17 of the 51 patients screened (33%), 18 rare CNVs were identified. The pathogenicity of CNVs was assessed by considering the following criteria: inheritance and familial segregation; overlap with genomic coordinates for a known genomic imbalance syndrome; overlap with CNVs previously identified in other patients with prenatal onset short stature; and gene content. Four distinct CNVs, found in three patients, were classified as pathogenic: 1) del 22q11.21; 2) dup 10q26.2-26.3 and del 10q26.3; and 3) del 4q28.2-q31.21. Five CNVs, found in five patients, were classified as probably pathogenic: 4) del 3q27.1-q27.3; 5) del 20p13; 6) dup 14q11.2-q12; 7) dup 16q24.1-q24; and 8) dup Xq31.1-q13.2. Taken both groups together, we found pathogenic or probably pathogenic CNVs in 16% of patients. According to familial segregation, four variants were considered as variants of uncertain clinical significance, while five variants were considered as benign. In an attempt to establish a causal genotype-phenotype correlation and to identify genes involved in growth impairment of prenatal onset, the gene content of the variants was analyzed using bioinformatics tools for gene prioritization. Based on our results, it is possible to make the following conclusions: 1) the frequency of pathogenic or probably pathogenic CNVs was at least 16%, indicating that rare CNVs are probably among the genetic causes of prenatal onset short stature; 2) aCGH clarified the diagnosis and the genetic etiology involved in the phenotype of 8 selected patients; and 3) we found CNVs in distinct chromosomal regions with several candidate genes that may be involved in the mechanisms of growth regulation and/or in the regulatory pathways of intrauterine development

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Sistemas descritos por Hamiltonianos do tipo Dirac são ubíquos. Surgindo em materiais como grafeno, isolantes topológicos ou recentemente nos semimetais de Weyl. Devido ao interesse tecnológico e acadêmico desses materiais, caracterizar suas propriedades é essencial. Uma abordagem matemática para efetuar o estudo de tais sistemas consiste em discretizar o Hamiltoniano no espaço das posições, mas tal abordagem esbarra no problema da duplicação de férmions. De forma breve, esse problema atesta pela impossibilidade de simulação de férmions livres não massivos em uma rede discreta sem que alguma simetria ou propriedade da Hamiltoniana seja quebrada. No presente trabalho demonstramos que tal problemática não deveria ser causa de preocupação para o estudo de sistemas na matéria condensada, pois podemos utilizar a simetria quebrada para confinar os portadores de carga no sistema para remover os estados duplicados. Tal remoção é conseguida com a inserção de um termo quadrático em relação ao momento, conhecido como massa de Wilson. Nesse sentido podemos inserir um termo de Wilson com quebra de simetria necessária para o confinamento, tornando o problema de duplicação de férmions irrelevante, essa relação não tinha sido notada até o presente trabalho, e recentes resultados na literatura erroneamente atribuem a massa de Wilson com a quebra de uma simetria de reversão temporal, o que não necessariamente é verdade. Nesse contexto além de abordar essa relação a presente dissertação objetiva também elucidar alguns mal entendimentos a respeitos das massas de Wilson, quiralidade e outras simetrias. Para validar nosso argumento central estudamos diversos sistemas de interesse e comparamos com os resultados na literatura. / Hamiltonians of Dirac type are ubiquitous. Appearing in materials such as graphene, topological insulators or recently in the Weyl semimetals. Due to the technological and academic interest of these materials, characterizing their properties is essential. A mathematical approach to study these systems consists of discretizing the Hamiltonian in the space of positions, but such an approach causes the problem of doubling fermions (FDP). We demonstrate the FDP should not be a cause of concern for the study of confined systems because we can use the broken symmetry to confine in the system to remove the duplicate states. Such removal is achieved by inserting a quadratic term with respect to the moment, known as the Wilson mass. In this sense we can insert a Wilson term with symmetry breaking required for confinement, rendering the fermion duplication problem irrelevant, this relationship had not been noticed until the present work, and recent literature results erroneously attribute Wilson’s mass to break of a symmetry of time reversal, which is not necessarily true. In this context, in addition to addressing this relationship, the present dissertation also aims to elucidate some misconceptions regarding the Wilson masses, chirality and other symmetries. In order to validate our central argument we study several systems of interest and compare it with the results in the literature. / Dissertação (Mestrado)