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Identification of proteins from the marine red macroalga Hypnea musciformis by proteomic analysis / Identificação de proteínas da macroalga marinha vermelha Hypnea musciformis por análise proteômica

Nascimento, Fernando Edson Pessoa do January 2014 (has links)
NASCIMENTO, Fernando Edson Pessoa do. Identificação de proteínas da macroalga marinha vermelha Hypnea musciformis por análise proteômica. 2014. 62 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Engenharia de Pesca, Fortaleza-CE, 2014 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-14T13:19:27Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_fepnascimento.pdf: 1476110 bytes, checksum: a37b0bfbc43de7460d0259fd1a190bb2 (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-14T13:19:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_fepnascimento.pdf: 1476110 bytes, checksum: a37b0bfbc43de7460d0259fd1a190bb2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-14T13:19:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_fepnascimento.pdf: 1476110 bytes, checksum: a37b0bfbc43de7460d0259fd1a190bb2 (MD5) Previous issue date: 2014 / Atualmente vivemos em uma acirrada competição na pesquisa de desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos, o ambiente marinho pode ser visto como uma fonte de materiais biotecnológicos funcionais. Recentemente, estudos demostram que dentro do ambiente marinho as algas se destacam como organismos com grande potencial biotecnológico por possuirem em sua composição várias moléculas bioativas que apresentam diversas e intensas atividades biológicas. Dentre todos os grupos algais, neste trabalho enfatizamos o das algas vermelhas, a qual a espécie de estudo é a alga marinha vermelha Hypnea musciformis (Wulfen). J. V. Lamouroux pertence à ordem Gigartinales e a família Hypneaceae, abundante no litoral do Ceará. Trabalhos biotecnológicos e científicos são realizados com esta espécie, neste sentido o objetivo principal deste trabalho e identificar e caracterizar proteínas existente neste organismo através de uma abordagem proteômica, que é uma área recente na ciência, que permite bioprospectar um conjunto de proteínas presentes num organismo através do uso de ferramentas analíticas, pois, em condições fisiológicas específicas, o funcionamento do sistema biológico pode ser refletido por análise do proteoma do mesmo, e assim a sua expressão gênica funcional. Considerando a carência de estudos sobre proteômica em algas marinhas e em especial da carragenófita Hypnea musciformis, o presente trabalho tem como objetivo principal desenvolver metodologias de separação de proteínas de extrato protéico de Hypnea musciformis e identificar as proteínas expressas pelo organismo. Neste trabalho conseguimos estabelecer uma metodologia de separação de proteínas deste organismo a partir de um extrato fracionado com sulfato de amônio e através de espectrometria de massas, identificar algumas proteínas da alga marinha. Desta forma, sendo de fundamental importância para o enriquecimento na literatura de proteomica de macroalgas marinhas. Os resultados deste trabalho que estão de acordo com o nosso objetivo foi a identificação de 3 proteínas por técnica de espectrometria de massas utilizando ionização do tipo eletrospray da fração protéica 20-40% e a identificação de algumas proteínas através do Mascot / We currently live in a fierce competition in the research development of new biotechnology products, the marine environment can be seen as a source of functional biotechnological materials. Recent studies show that within the marine environment algae stand out as organisms with great biotechnological potential by having in its composition various bioactive molecules that have diverse and intense biological activities, among all algal groups in this study emphasize the of red algae, which the kind of study is red seaweed Hypnea musciformis (Wulfen). JV Lamouroux belongs to the order Gigartinales and Hypneaceae family, abundant on the coast of Ceará. Biotechnological and scientific works are carried out with this species, in this sense, the main objective of this work is to identify and characterize proteins existing in this organism through a proteomics approach, is a new area in science that allows bioprospect a set of proteins in an organism by using analytical tools because under specific physiological conditions the biological functioning of the system can be reflected by the proteome analysis of the same, and thus the functional gene expression. Considering the lack of studies on proteomics in seaweed and in particular the carragenófita Hypnea musciformis, this paper aims to develop methods for separating proteins from protein extract of Hypnea musciformis and identify the proteins expressed by the organism. In this work we have established a methodology for separating proteins of this organism from a fractionated extract with ammonium sulfate and by mass spectrometry to identify proteins of some kelp, thus being of fundamental importance for the enrichment of macroalgae in the proteomics literature marine. The results of this work are consistent with our objective was the identification of three proteins by mass spectrometry using electrospray ionization type protein fraction of 20-40% and the identification of some proteins by Mascot
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Fontes de fósforo na produção e composição bromatológica de cultivares de milheto forrageiro / Phosphorus sources in production and chemical composition of the peral millet forage

PAUSE, Alzira Gabriela da Silva 12 April 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:13:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE GABRIELA CIENCIA ANIMAL.pdf: 1463173 bytes, checksum: 395aac03a18f82f95770c0584036defe (MD5) Previous issue date: 2010-04-12 / The dry matter yield and quality aspects of forage millet are still poorly understood, as well as specific information handled by this grass and nitrogen fertilization. Experiment was conducted to evaluate the productive potential and chemical composition of the dry mass of three cultivars of pearl millet (Pennisetum glaucum (L.) R. Brown) (ADR-7010, ADR- 500 and BRS-1501), submitted to sources of phosphorus (superphosphate and fused), nitrogen (0, 40, 80 and 160 kg ha-¹) in the form of urea in three cuts in the UFG / Goiânia-GO . The experimental design was completely factorial arrangement 2 x 3 x 4 with four replications. The parameters evaluated were dry matter production (DMP) of the whole plant, while the dry matter (DM), crude protein (CP), acid detergent fiber (ADF) and neutral detergent fiber (NDF) were determined for the whole plant and its fractions (leaf and stem). Only the whole plant was given the apparent conversion efficiency of nitrogen (NACS), apparent nitrogen recovery (NAR) and nitrogen accumulated in the plant (NA) and protein fractions (A, B1, B2, B3 and C). All tests were accomplished using the SAS program (2007). Statistical analysis revealed no significant interactions between the variables studied in this way, these were discussed in isolation. Among the evaluated cultivars the highest yield (P <0.05) was the cultivar ADR-7010 (1175 kg ha-1 DM). The increment of N increases in production. NA increased with the increase of N rates with maximum value of 42.70 kg. The NACS and RAN decreased with the addition of the nutrient, with a peak of 10.77 kg ha-1 and 33.44%. The DM content of whole plant and leaf differed (P <0.05) and stem fraction only differed among genotypes. The CP content of whole plant did not differ (P> 0.05), but increased with the succession of cuts. The leaf blade was no difference (P <0.05) reduction of CP in terms of cuts. The CP concentration of stem ranged from 8.90% to 14.04%. ADF whole plant increased due to the succession of cuts and leaf blade varied between the cultivars, the highest contents of ADF were found in the stem. The NDF in the whole plant did not differ between the N levels, however all values were below 60%. The greatest amount recorded in the leaf was 63.81%. The higher NDF were identified in the stem fraction (55.54% to 68.03%). The contents of HEM differ between courts and for all plant cultivars and their fractions. There was no significant difference (P> 0.05) for the nitrogen fractions among all treatments. The contents determined for fraction C were all lower than 10%. Cultivar ADR-7010 showed the best results as well as the source superphosphate. The sources of phosphorus and nitrogen fertilization influenced the parameters. / A produção de massa seca e aspectos qualitativos de milheto forrageiro ainda são pouco conhecidos, assim como informações específicas dessa gramínea manejada com fertilização fosfatada e nitrogenada. Foi conduzido experimento para avaliar o potencial produtivo e composição bromatológica da massa seca de três cultivares de milheto (Pennisetum glaucum (L.) R. Brown) (ADR-7010; ADR- 500 e BRS-1501), submetidos à fontes de fósforo (superfosfato simples e termofosfato), doses de nitrogênio (0; 40; 80 e 160 kg.ha-¹) sob a forma de uréia em três cortes na UFG/Goiânia-GO. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com arranjo fatorial 2 x 3 x 4, com quatro repetições. Os parâmetros avaliados foram produção de massa seca (PMS) da planta inteira, enquanto que os teores de matéria seca (MS), proteína bruta (PB), fibra em detergente ácido (FDA) e fibra em detergente neutro (FDN) foram determinados para a planta inteira e suas frações (lâmina foliar e colmo). Somente para a planta inteira foi determinada a eficiência de conversão aparente de nitrogênio (ECAN), recuperação aparente do nitrogênio (RAN) e nitrogênio acumulado na planta (NA), assim como as frações de proteínas (A, B1, B2, B3 e C). Todas as análises foram realizadas com auxílio do programa computacional SAS (2007). A análise estatística não revelou interações significativas entre as variáveis pesquisadas, dessa forma, as mesmas foram discutidas isoladas. Entre os cultivares avaliados a maior produção (P<0,05) foi do cultivar ADR-7010 (1.175 kg.ha-1 de MS). O incremento de N promoveu aumentos na produção. O NA aumentou em função da elevação das doses de N com valor máximo de 42,70 kg. A ECAN e RAN diminuíram com o acréscimo do nutriente, com valores máximos de 10,77 kg.ha-1 e 33,44%. Os teores de MS da planta inteira e lâmina foliar diferiram (P<0,05) e a fração colmo somente diferiu entre os cultivares. Os teores de PB da planta inteira não diferiram (P>0,05), porém, aumentaram com a sucessão dos cortes. Na lâmina foliar houve diferença (P<0,05) com redução do teor de PB em função dos cortes. Os teores de PB do colmo variaram de 8,90% a 14,04%. Os teores de FDA da planta inteira aumentaram devido à sucessão dos cortes e na lâmina foliar variaram entre os cultivares, os maiores conteúdos de FDA foram verificados no colmo. Os teores de FDN na planta inteira não diferiram entre as doses de N, entretanto todos os valores foram inferiores a 60%. O maior teor registrado na lâmina foliar foi de 63,81%. Os maiores valores de FDN foram identificados na fração colmo (55,54% a 68,03%). Os teores de HEM diferiram entre cortes e cultivares para planta inteira e suas frações. Não verificou-se diferença significativa (P>0,05) para as frações nitrogenadas entre todos os tratamentos. Os conteúdos determinados para a fração C, foram todos inferiores a 10%. O cultivar ADR-7010 apresentou os melhores resultados, assim como a fonte superfosfato simples. As fontes de fósforo e fertilização nitrogenada influenciaram os parâmetros avaliados.

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