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Presente e futuro da análise de dados de fatores associados à soroprevalência da diarreia viral bovina / Present and future of data analysis of associated factors to seroprevalence of bovine viral diarrhea

Machado, Gustavo January 2016 (has links)
O vírus da diarreia viral bovina (BVDV) causa uma das doenças mais importantes de bovinos em termos de custos econômicos e sociais, uma vez que é largamente disseminado na população de gado leiteiro. Os objetivos do trabalho foram estimar a prevalência em nível de rebanho e investigar fatores associados aos níveis de anticorpos em leite de tanque através de um estudo transversal, bem como discutir e comparar diferentes técnicas de modelagem, as tradicionais como regressão e as menos usuais para este fim, como as de Machine learning (ML) como Random Forest. O estudo transversal foi realizado no estado do Rio Grande do Sul para a estimação da prevalência de doenças reprodutivas baseados em amostras de tanque de leite, partindo de uma população total de 81.307 rebanhos. Foram coletadas 388 amostras de tanque de leite, e nas propriedades selecionadas foi aplicado um questionário epidemiológico. Como resultados se identificou uma prevalência de 23,9% (IC95% = 19,8 - 28,1) de propriedades positivas. Através de análise de regressão de Poisson se identificou como fatores associados o BVDV: o exame retal como rotina para o diagnóstico de prenhes, Razão de Prevalência [PR] = 2,73 (IC 95%: 1.87-3.98), contato direto entre animais (contato via cerca de propriedades lindeiras) (PR=1,63, IC 95%: 1.13-2.95) e propriedades que não utilizavam inseminação artificial (PR=2.07, IC 95%: 1.38-3.09) Na técnica de Random Forest pôde-se identificar uma dependência na ocorrência de BVDV devido a: inseminação artificial quando realizada pelo proprietário da propriedade ou capataz, o número de vizinhos que também possuem criação de bovinos, e em concordância com os resultados da regressão quanto a dependência da ocorrência de BVDV devido a palpação retal. Como resultado, pôde-se perceber que o BVDV está distribuído no estado do RS e caso seja de interesse do poder público, o desenvolvimento de um programa de controle da doença pode ser baseado nos resultados encontrados. Por outro lado, a contribuição deste estudo vai além das tradicionais análises realizadas em epidemiologia veterinária, principalmente devido os bons resultados obtidos com a abordagem por ML neste estudo transversal. Por fim, a utilização de técnicas estatísticas mais avançadas contribuiu para elucidar melhor os fatores possivelmente envolvidos com a ocorrência de BVDV no rebanho leiteiro gaúcho. / The bovine viral diarrhea virus (BVDV) causes one of the most important disease of cattle in terms of economic and social costs, since it is widely disseminated in dairy cattle population. The objectives were to estimate the herd level prevalence at and investigate factors associated with antibody levels in bulk tank milk through a cross sectional study, discuss and compare different modeling techniques such as the traditional regression with the ones less used for this approach machine learning (ML). The cross sectional study was conducted in Rio Grande do Sul state to estimate the prevalence of reproductive diseases based on bulk tank milk samples, from a total population of 81,307 herds. Milk samples from 388 bulk tank were sampled, and an epidemiological questionnaire was applied in each farm. The prevalence was 23.9% (95% CI 19.8 - 28.1). Through the Poisson regression analysis, the following factors associated with BVDV were found: routine use of rectal examination for pregnancy (Prevalence Ratio [PR] = 2.73 (IC 95%: 1.87-3.98), direct contact between/among animals (contact over the fence of neighboring farms) (PR = 1.63, IC 95%: 1.13-2.95) and properties that did not use artificial insemination (PR = 2.07, IC 95%: 1.38-3.09). On the other hand, using ML techniques, it was identify a dependency upon the occurrence of BVDV due to: artificial insemination when carried out by the owner of the property or foreman; the number of neighbors who also have cattle, and in accordance with the regression results as the dependence of the occurrence of BVDV due to routine use of rectal examination for pregnancy. BVDV is spread across the State and if the government's interest to launch a disease control program measures should be focusing mainly on better conditions and care in reproduction. On the other hand, the contribution of this study goes beyond traditional analyzes in veterinary epidemiology, mainly due to the good results obtained with the approach by ML in this cross-sectional study. Finally, the use of advances statistics techniques it has been made progress to better elucidate the factors possibly involved in the occurrence of BVDV in state dairy herds.
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Desempenho produtivo e comportamento de vacas holandesas com a utilização de duas fontes protéicas na alimentação

Krolow, Rodrigo Holz January 2006 (has links)
O trabalho experimental foi desenvolvido em uma propriedade de produção leiteira no município de Camargo, na região fisiográfica denominada de Planalto Médio do RS, com o objetivo de estudar e quantificar o efeito da substituição do componente protéico (farelo de soja) da ração, comumente fornecida aos animais, por pastejo controlado de trevo branco (Trifolium repens L.) em animais mantidos em pastagens de azevém (Lolium multiflorum L.), na performance produtiva, comportamento e qualidade do leite de vacas holandesas. Para tal, foram utilizados dois grupos de animais agrupados de forma homogênea após estratificação por produção, período de lactação e peso corporal, em um delineamento experimental completamente casualizado em blocos. Os dois grupos eram mantidos em pastagens de azevém, por um determinado período de tempo durante o dia (aproximadamente 5 horas). Um grupo recebia diariamente 3 kg de suplemento energético constituído de farelo de milho, farelo de trigo, casca de soja e sal mineral (subtraída de farelo de soja) e tinha acesso controlado à pastagem de trevo branco (aproximadamente 2,5 horas), denominado tratamento TB; outro recebia a mesma quantidade de suplemento, adicionada de quantidade de proteína equivalente ao consumo diário no tratamento anterior via trevo, na forma de farelo de soja, denominado tratamento FS. As medições eram realizadas em avaliações quinzenais, procedendo-se controles leiteiros individuais, medidas de perímetro torácico, coletas de amostras de sangue e leite dos animais e registro de atividades dos animais em pastejo. Os resultados demonstraram semelhanças significativas entre os dois tratamentos, para a maioria das variáveis estudadas, com exceção do teor de proteína do leite que foi maior para o tratamento TB, e os valores de teor de lactose, tempo de pastejo e freqüência de bocados maiores para o tratamento FS. Estes resultados indicam que a utilização do trevo branco, como fonte protéica para os animais, foi tecnicamente viável e eficiente.
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Produção leiteira e comportamento ingestivo de vacas Jersey em pastagem cultivada de inverno com e sem suplementação / Milk production and ingestive behavior of ‘jersey’ cows on cool season annual pasture with or without soybean supplement

Velho, Ione Maria Pereira Haygert January 2008 (has links)
O trabalho foi desenvolvido em uma propriedade rural, no município de Pelotas, RS. Com o objetivo de avaliar o comportamento ingestivo diurno e a produção de leite de vacas e a relação dos componentes da pastagem com o comportamento ingestivo e a produção de leite. A fase experimental foi de 117 dias, entre 02 de agosto e 26 de novembro de 2006, divididos em nove períodos. Com temperaturas médias que variaram de 7,3 ºC à 21,6 ºC e umidade relativa de 43,1% à 77,4%. Os tratamentos foram pastagem cultivada de inverno, constituída de uma mistura de aveia-preta (Avena strigosa Schreb), azevémperene (Lolium multiflorum Lam.) e ervilhaca (Vicia sativa) com suplementação (farelo de soja e casca de soja) e sem suplementação. Os animais foram distribuídos aleatóriamente aos tratamentos segundo um delineamento completamente casualizado. O método de pastejo foi lotação rotacionada em faixas. Foram utilizadas oito vacas da raça Jersey. A produção de leite foi mensurada através do controle individual, 48 horas após o pastejo dos animais. O conhecimento do comportamento de vacas leiteiras em pastejo é de suma importância para o melhor aproveitamento das pastagens bem como para o estabelecimento de estratégias adequadas de manejo. Para o registro das atividades de pastejo, ruminação e ócio, adotou-se a observação visual, feita a cada 10 minutos, no tempo de permanência das vacas na pastagem que foi de 7 horas e 30minutos. Foram registrados a taxa de bocados, que compreende o tempo necessário para o animal realizar 20 bocados de apreensão. O estágio de desenvolvimento da planta afeta a digestibilidade. A fibra em detergente neutro afetou no tempo de ruminação. A diminuição de lâmina foliar dificulta a oportunidade dos animais de apreenderem a forragem, influenciando na taxa de bocado. A eficácia da mastigação e da ruminação esta relacionada e depende tanto do animal como da composição da forragem. / The objective of this work was to evaluate the diurnal ingestive behavior and milk production of lactating ‘Jersey’ cows grazing a cool season annual pasture of black oats (Avena strigosa), annual ryegrass (Lolium multiflorum) and common vetch (Vicia sativa), from August 02 to November 26, 2006 (117 grazing days), in Pelotas, RS, southern Brazil. The rotational stocking grazing method was used. Eight mature cows were used and to each one of four was fed 8 kg/cow/day of a soybean meal + soybean hull supplement. Treatments were assigned at random to cows, using a complete randomized experimental design. Data on behavioral activities were taken at every 10 minutes, by visual observation, during 450 minutes, time that cows spent on the pasture daily. Behavioral parameters studied were: grazing time, rumination time, idleness, bite rate and bite size. Milk production/cow/day was determined by milk weighting, 48 hours after grazing, during two consecutive days. Statistical analysis of data was performed using mainly the SAS PROC MEANS procedure, and for stepwise regression studies the PROC REG program was used to determine total R² and partial R² for each variable included in the model. Average grazing time was 297 and 275 minutes/day for cows on pasture alone and on pasture plus soybean supplement, respectively. It was also affected (R²=0,53) by the crude protein content of diet. The forage NDF content influenced (R²=0,82) on rumination time and the bite rate was affected (R²=0,95) by the proportion of leaf blades of forage plants present in the pasture. Feeding cows with soybean supplement increased milk production. Average milk production (corrected to 4% fat) was 17.6 and 20.6 kg/cow/day for cows on pasture alone and on pasture plus soybean supplement, respectively. In general, no relevant changes on the diurnal ingestive behavior of lactating ‘Jersey’ cows kept on a cool season annual pasture were found in this study, as a result of using the soybean supplement.
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Efeito da suplementação com selênio no perfil bioquímico sangüíneo e características físico-químicas do leite normal e do leite instável não ácido / Effect of the suplementation with selenium on profile sanguineous biochemist and physical-chemical characteristics of normal milk and not acid unstable milk

Viero, Vitório January 2008 (has links)
O experimento foi conduzido no Sistema de Pecuária de Leite (SISPEL), na Embrapa, em Pelotas, Rio Grande do Sul, com 32 vacas em lactação da raça Jersey em lactação, divididas em quatro grupos, de acordo com a produção de leite, peso vivo, escore corporal e tempo de lactação. O estudo teve o objetivo de avaliar o efeito da suplementação de diferentes fontes e níveis de selênio (Se) em vacas em lactação, sobre as características físicoquímicas do leite, produção de leite e concentração desse no sangue e leite, assim como verificar a ocorrência do leite instável não ácido (LINA) e as alterações na composição do leite e sangue decorrentes da instabilidade. Os tratamentos foram determinados como: grupo controle (dieta padrão), Selênio Inorgânico 0,3 (dieta padrão + 0,3mg Selenito de sódio/kg de concentrado), Selênio Orgânico 0,3 (dieta padrão + 0,3 mg Selêniometionina/kg de concentrado) e Selênio Orgânico 0,6 (dieta padrão + 0,6 mg selêniometionina/kg de concentrado). No leite, foram analisadas composição química, características físicas, contagem de células somáticas (CCS) e teores de Se, cálcio iônico e uréia e, no sangue, albumina, uréia, triglicerídeos, colesterol, glicose, proteína total, Ca, Mg, P e Se. A suplementação de selênio aumentou linearmente a concentração do mineral no leite e no sangue, independente da fonte. Porém, não ocorreram alterações expressivas nas características físico-químicas, CCS e produção de leite relacionada com a suplementação. Das 124 amostras de leite analisadas durante o experimento, 101 (81,45%) foram estáveis e 23 (18,55%) precipitaram em concentrações de etanol até 72%. O leite classificado como leite instável não ácido (LINA) apresentou maior concentração de cálcio iônico e menor concentração de lactose que o leite normal. O sangue de animais que produziram LINA apresentou maior concentração de uréia e triglicerídeos. / The trial was lead in the intensive system of milk production - SISPEL, at the Embrapa, in Pelotas, Rio Grande do Sul State, with 32 lactating Jersey cows, distributed in four groups, according to milk production, body weight, body condition score and days in milking. The study had the objective to evaluate the effect of the supplementation with different sources and levels of selenium (Se) for dairy cows, on the physical-chemical characteristics of milk, milk yield and selenium concentration in the blood and milk, as well as, to verify the occurrence of not acid unstable milk (LINA) and the alterations in the composition of milk and blood. The treatments were denominated as follows: control (diet without added selenium), Inorganic Selenium (standard diet + 0,3 mg sodium Selenite /kg concentrate), Organic Selenium 0,3 (standard diet + 0,3 mg Selenomethionine/kg concentrate) and Organic Selenium 0,6 (diet standard diet + 0,6 mg selenomethionine/ kg concentrate). Physical-chemical characteristics, somatic cells count (SCC), concentration of Se, ionic calcium and urea in milk and albumen, urea, triglycerides, cholesterol, glucose, total protein, Ca, Mg, P in blood had been analyzed. Supplementation of selenium increased linearly the concentration of the Se in milk and blood, independently of the source. There were not expressive alterations for physical and chemical characteristics, SCC and milk yield related to supplementation. Of the 124 analyzed milk samples during the experiment, 101 (81,45%) were stable and 23(18,55%) precipitated in alcoholic solutions wirth ethanol concentrations to 72%. Milk samples classified as not acid unstable milk (LINA) presented greater concentration of ionic calcium and lower concentration of lactose that stable milk. The blood of animals that had produced LINA presented greater concentration of lactosis and triglycerides.
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Leite instável não ácido e propriedades físico-químicas do leite de vacas Jersey / Unstable not acid milk and physical-chemical characteristics of milk from jersey cows

Abreu, Alexandre Susenbach de January 2008 (has links)
O experimento foi realizado em Itapiranga/SC, de 14 de maio a 17 de junho de 2007. Objetivou-se avaliar o efeito do aumento do aporte de nutrientes sobre a estabilidade do leite na prova do álcool e as propriedades físico-químicas do leite além do perfil bioquímico sanguíneo. Dezesseis vacas da raça Jersey em lactação foram divididas aleatoriamente em dois grupos homogêneos, com oito animais em cada grupo de forma a padronizar a condição corporal, peso, estádio e ordem de lactação e produção de leite. Os animais do grupo controle continuaram recebendo a dieta a base de silagem de sorgo, pastagem de capim elefante pioneiro (Pennisetum purpureum) e concentrado comercial, enquanto o outro grupo recebeu dieta, usando os mesmos ingredientes, mas formulada para atender a 100% das necessidades nutricionais (NRC, 2001). Os animais foram avaliados quanto ao peso e condição corporal no início, meio e final do ensaio. A produção de leite, estabilidade ao álcool, acidez titulável foram avaliados duas vezes por semana durante o experimento. A densidade, índice crioscópico, composição química do leite, pH, fervura, redutase, contagem bacteriana total (CBT) e contagem de células somáticas (CCS) foram avaliados no início, meio e final do experimento, enquanto a análise sanguínea dos animais foi realizada no início e no final do experimento. O ajuste da dieta aumentou a estabilidade do leite na prova do álcool, porém não modificou a produção de leite nem suas características físico-químicas e microbiológicas. / The trial was performed in Itapiranga / SC, from May 14to June 17, 2007. The objective was to evaluate the effect of increased nutrient supplyon the stability of milk at alcohol test and the physicochemical properties of milk, as well blood profile. Sixteen lactating Jersey cows were used , randomly distributed into two homogenous groups, with eight animals in each group in order to standardize the body condition, weight, stage of lactation, number of offspring, milk production. Control group received the same diet they had been fed with sorghum silage, elefant grass pasture (Pennisetum purpureum), and commercial concentrate, while the other group received diet with the same feeds but formulated to meet the 100% of nutritional requirements (NRC, 2001). The animals were assessed for weight, stage and number of lactation, and body condition at the beginning, middle and end of the trial. Milk yield, stability at the alcohol test, titrable acidity were evaluated twice a week,density, crioscopyc index, milk chemical composition , pH, boiling, reductase, somatic cell count (SCC), total bacterial count (CBT), urea were evaluated at the beginning, middle and end of the experiment while animal’s blood were evaluated at the beginning and end of the experiment. Diet adequacy increased milk stability at the alcohol test, but did not change milk yield, nor physical-chemical and microbiological properties of milk.
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Uso da termografia infravermelha para avaliar a tolerância ao calor em bovinos de leite submetidos ao estresse térmico / Use of infrared thermography to assess heat tolerance in dairy cattle subjected to heat stress

Daltro, Darlene dos Santos January 2014 (has links)
É necessário compreendermos como os animais domésticos respondem aos fatores estressores climáticos na tentativa de amenizar a ação prejudicial das variáveis climáticas responsáveis pelo estresse térmico pelo calor. Assim, o objetivo do presente trabalho foi verificar se a termografia infravermelha poderia ser utilizada no reconhecimento dos animais sob estresse térmico pelo calor, bem como identificar qual a melhor região do animal utilizada para esse reconhecimento. Foram utilizadas 38 vacas em lactação das raças Holandês e Girolando submetidas ao estresse térmico pelo calor. A pesquisa foi conduzida na Embrapa Gado de Leite em Coronel Pacheco-MG. A coleta de dados foi feita separadamente para cada raça. Os parâmetros fisiológicos coletados foram: temperatura retal, frequência respiratória, frequência cardíaca e escore de ofegação. Para avaliação dos parâmetros ambientais utilizou-se um termômetro de globo digital modelo TGD-200. Para obtenção das imagens termográficas de diferentes regiões do corpo dos animais, utilizou-se uma câmera infravermelha (FLIR® System T300). As temperaturas ambientais variaram de 20,7°C a 37,9°C com umidade relativa chegando a 95%. Verificou-se através da termografia infravermelha a maior sensibilidade ao estresse por calor para a raça Holandês. As temperaturas obtidas pelo termógrafo mostraram-se indicadores das condições de conforto térmico. A melhor região para identificar a situação de estresse pelo calor no animal foi à região do úbere. / It is necessary to understand how domestic animals respond to climate stressors in attempt mitigate the harmful effects of climate variables responsible for heat stress. The aim of this study was to determine whether infrared thermography could be used in the recognition of animals in a state of heat stress, as well as identifying how best region of the animal used for this recognition. Was used 38 cows in lactating Holstein Friesian and Girolando breeds, under heat stress. The research was conducted at Embrapa Gado de Leite in the municipality of Coronel Pacheco in the state of Minas Gerais. Data collection was done separately for each breed. The physiological parameters collected were: rectal temperature, respiratory rate, heart rate and panting score. For assessment of environmental parameters we used a globe thermometer digital model (TGD-200). To obtain the thermograph photographs of different regions of the body of animals, we used an infrared camera (FLIR® System T300). The environmental temperature ranged from 20.7°C to 37.9°C with a relative humidity reaching 95%. It was found by infrared thermography increased sensitivity to heat stress for Holstein Friesian. The thermograph temperatures proved indicators of thermal comfort. The best region to identify heat stress in cows was udder region.
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Uso da termografia infravermelha para avaliar a tolerância ao calor em bovinos de leite submetidos ao estresse térmico / Use of infrared thermography to assess heat tolerance in dairy cattle subjected to heat stress

Daltro, Darlene dos Santos January 2014 (has links)
É necessário compreendermos como os animais domésticos respondem aos fatores estressores climáticos na tentativa de amenizar a ação prejudicial das variáveis climáticas responsáveis pelo estresse térmico pelo calor. Assim, o objetivo do presente trabalho foi verificar se a termografia infravermelha poderia ser utilizada no reconhecimento dos animais sob estresse térmico pelo calor, bem como identificar qual a melhor região do animal utilizada para esse reconhecimento. Foram utilizadas 38 vacas em lactação das raças Holandês e Girolando submetidas ao estresse térmico pelo calor. A pesquisa foi conduzida na Embrapa Gado de Leite em Coronel Pacheco-MG. A coleta de dados foi feita separadamente para cada raça. Os parâmetros fisiológicos coletados foram: temperatura retal, frequência respiratória, frequência cardíaca e escore de ofegação. Para avaliação dos parâmetros ambientais utilizou-se um termômetro de globo digital modelo TGD-200. Para obtenção das imagens termográficas de diferentes regiões do corpo dos animais, utilizou-se uma câmera infravermelha (FLIR® System T300). As temperaturas ambientais variaram de 20,7°C a 37,9°C com umidade relativa chegando a 95%. Verificou-se através da termografia infravermelha a maior sensibilidade ao estresse por calor para a raça Holandês. As temperaturas obtidas pelo termógrafo mostraram-se indicadores das condições de conforto térmico. A melhor região para identificar a situação de estresse pelo calor no animal foi à região do úbere. / It is necessary to understand how domestic animals respond to climate stressors in attempt mitigate the harmful effects of climate variables responsible for heat stress. The aim of this study was to determine whether infrared thermography could be used in the recognition of animals in a state of heat stress, as well as identifying how best region of the animal used for this recognition. Was used 38 cows in lactating Holstein Friesian and Girolando breeds, under heat stress. The research was conducted at Embrapa Gado de Leite in the municipality of Coronel Pacheco in the state of Minas Gerais. Data collection was done separately for each breed. The physiological parameters collected were: rectal temperature, respiratory rate, heart rate and panting score. For assessment of environmental parameters we used a globe thermometer digital model (TGD-200). To obtain the thermograph photographs of different regions of the body of animals, we used an infrared camera (FLIR® System T300). The environmental temperature ranged from 20.7°C to 37.9°C with a relative humidity reaching 95%. It was found by infrared thermography increased sensitivity to heat stress for Holstein Friesian. The thermograph temperatures proved indicators of thermal comfort. The best region to identify heat stress in cows was udder region.
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Tendências genéticas das características de produção, conformação e manejo de bovinos Gir leiteiro / Genetic trends of production, conformation and management characteristics of bovine dairy Gir

Carvalho, Nathã Silva de January 2018 (has links)
Em diferentes programas de melhoramento genético, o acompanhamento do progresso genético é essencial para possibilitar ajustes necessários à sua utilização. No Brasil, além de ser considerada uma das raças mais utilizadas para a produção de fêmeas mestiças leiteiras, a raça Gir Leiteiro lidera a lista das raças exportadoras de sêmen. Por conta disso, este estudo objetivou estimar os parâmetros e as tendências genéticas para vinte características de produção, conformação e manejo de animais puros da raça, integrantes do Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro, além das tendências fenotípicas e das tendências genéticas para quatro trajetórias de seleção para produção de leite e de gordura. A metodologia utilizada foi a da Máxima Verossimilhança Restrita em um modelo animal. As tendências genéticas para todas as características foram obtidas via regressão linear das médias dos valores genéticos em função do ano de nascimento dos animais, que em geral, variou de 1935 a 2013. As herdabilidades foram de 0,23 (leite), 0,10 (gordura) e variaram de 0,01 a 0,53 para as características lineares de conformação e manejo. Para produção de leite em 305 dias, houve favorável progresso genético ao longo do tempo, para fêmeas mensuradas (14,04 kg/ano), fêmeas (8,27 kg/ano) e machos (6,12 kg/ano), quanto para as quatro trajetórias de seleção (pais de touros, pais de vacas, mães de touros e mães de vacas). As tendências genéticas para produção de gordura em 305 dias, embora positivas, foram de baixa magnitude. As mudanças genéticas nas características lineares foram em geral, variáveis e inexpressivas, sugerindo que a seleção no Gir Leiteiro tenha sido direcionada essencialmente para maior produção de leite. A provável maior adesão pelos criadores ao uso de reprodutores comprovadamente geneticamente superiores e as melhorias ambientais (nutrição e manejo), possibilitaram incrementos fenotípicos nas produções de leite (55,38 kg/ano) e de gordura (0,91 kg/ano) em bovinos puros da raça Gir Leiteiro no Brasil. / In different breeding programs for genetic improvement, the monitoring of genetic progress is essential to allow for the necessary adjustments to its use. In Brazil, besides being considered one of the most used breeds for the production of crossbred dairy females, the Dairy Gir breed leads the list of semen export breeds. The objective of this study was to estimate parameters and genetic trends for nineteen traits of production, conformation and management of purebred animals of the National Breeding Program for Dairy Gir, in addition to the phenotypic trends and genetic trends for four selection trajectories for the milk yield and fat yield productions. The methodology used was that of Restricted Maximum Likelihood in an animal model. The genetic trends for all traits were obtained through linear regression of the means of genetic values according to the year of birth of the animals, which generally varied from 1935 to 2013. The heritabilities were 0.23 (milk), 0.10 (fat) and ranged from 0.01 to 0.53 for the linear conformation and management traits. The milk yield in 305 days presented favorable genetic progression over time for both mensured females (14.04 kg/year), females (8.27 kg/year) and males (6.12 kg/year), and for the four selection trajectories. The genetic trends for fat yield production in 305 days, although positive, were of low magnitude. The genetic changes in the linear characteristics were in general, variable and inexpressive, suggesting that the selection in Dairy Gir has been directed essentially to a greater milk yield. The probable higher adhesion by breeders to the use of genetically superior breeding herds and environmental improvements (nutrition and management), allowed for phenotypic increases in the milk yield (55.38 kg/year) and fat yield (0.91 kg/year) in the Dairy Gir cattle in Brazil.
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Fatores que afetam a estabilidade do leite bovino / Factors affecting the stability of bovine milk

Machado, Sandro Charopen January 2010 (has links)
Entre os anos de 2007 e 2009, no nordeste do Rio Grande do Sul, foi conduzido um estudo para avaliar a ocorrência de leite instável não ácido, fatores que afetam a estabilidade do leite bovino e a relação entre o teste do álcool e o teste de tempo de coagulação do leite. Fez-se um questionário para a tipificação das propriedades, um levantamento mensal do leite de 50 propriedades, e se analisou a acidez, coagulação na fervura e no álcool e tempo de coagulação no tanque, além da composição química, células somáticas e contagem bacteriana. Posteriormente, foi realizado um experimento avaliando dietas com três proporções de concentrado (35, 45 e 55%), por 56 dias, avaliando o número de dias em lactação, produção leiteira, peso, condição corporal, características físico-química do leite, pH ruminal e da urina e composição química do sangue. Complementarmente foram realizados quatro protocolos experimentais para avaliar o efeito da temperatura sobre o teste do álcool, o efeito do citrato sobre a estabilidade do leite, o efeito do uso de capilares de diferentes tamanhos sobre o resultado de tempo de coagulação e o uso de diferentes metodologias analíticas para determinação de lactose no leite. A análise estatística dos dados foi efetuada com o programa SAS (2001), avaliando a frequência de ocorrência de fatores (Proc FREQ), correlação (Proc CORR), variância (Proc GLM) e regressão (Proc REG), sendo que no experimento com animais as médias foram ajustadas utilizando dias em lactação, e os valores iniciais de cada atributo como co-variáveis. Foram observados elevada incidência de LINA, CCS e CBT, pouca interferência da dieta na ocorrência de LINA e na alteração da composição do leite e baixa correlação entre o teste do álcool e o tempo de coagulação no tanque. Não houve relação entre o teste da fervura e os testes do álcool e do tempo de coagulação. O citrato melhorou a estabilidade do leite medida no teste do álcool e no tempo de coagulação. A temperatura do leite (4 x 20°C) não interferiu no resultado do teste do álcool. As dimensões dos capilares de teste do tempo de coagulação modificam os valores obtidos, podendo prejudicar a comparação entre diferentes laboratórios. Entre os fatores testados, os que atuaram sobre a estabilidade do leite no teste do álcool foram: a concentração inicial de álcool capaz de induzir a coagulação, a concentração de cátions divalentes em relação aos monovalentes e o teor de sódio do leite. Em relação ao teste do tempo de coagulação, apenas o seu valor inicial foi significativo. Conclui-se que a ocorrência da instabilidade do leite é elevada, a composição mineral do leite foi a que exerceu maior influência sobre os resultados no teste do álcool, não foram detectados fatores que influenciaram o teste do tempo de coagulação nem o da fervura. Não se pode ainda recomendar outro teste para substituir o teste do álcool. / Between 2007 and 2009 in the Northeastern Rio Grande do Sul, a study was conducted aiming to evaluate the occurrence of unstable non-acid milk, the factors affecting the stability of bovine milk and the degree of relationship between test results and alcohol test coagulation time of milk. Was carried out initially, a questionnaire for the characterization of the properties, then a monthly survey of milk from 50 properties, and examined the acidity (acidity and pH), coagulation test and the boiling alcohol and clotting time in tank, and chemical composition, somatic cell and bacterial count. Later we performed an experiment on animals, which were fed with three different proportions of concentrate (35, 45 and 55%) for 56 days and were evaluated the number of days in milk, milk production, weight, body condition, features physical chemistry of milk, pH and composition of urine and blood chemistry. In addition were performed four experimental protocols to evaluate the effect of temperature on the alcohol test, the effect of citrate on the stability of milk, the effect of using capillaries of different sizes on the results of clotting time and the use of different analytical methodologies for determination of lactose in milk. The statistical analysis was performed with SAS software (2001), evaluating the occurrence of factors (Proc FREQ), correlation (CORR), variance (Proc GLM) and regression (Proc REG), and the experiment animals the means were adjusted using days in milk, and the initial values of each attribute as covariates. We observed high levels of incidence of LINA, CCS and CBT, little interference from the diet in the occurrence of LINA and change the composition of milk and low correlation between the alcohol and the clotting time in the tank. There was no relationship between the boiling test and tests for alcohol and clotting time. Citrate exerted positive action on the stability of milk as the test of alcohol and the clotting time. The temperature of milk during the test (4 x 20 ° C) had no effect on the test result of alcohol. The dimensions of the capillary test of clotting time modify the values and may undermine the comparison between different laboratories. Among the factors tested, acted on the stability of milk alcohol test were: the initial concentration of alcohol to induce coagulation, the concentration of divalent cations compared to monovalent and sodium content of milk. For the test of clotting time, only the initial value was significant. It is concluded that the occurrence of instability of the milk is high, the factors measured, the mineral composition of milk that was the greatest influence on the results in the alcohol, but not detected factors influencing the test of clotting time or to the boil. You can not even recommend another test to replace the alcohol test.
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Estudo de polimorfismos do gene JY-1 e sua associação à produção de embriões in vivo e in vitro em doadoras da raça holandesa (Bos taurus taurus) / Study of JY-1 gene polymorphisms and their association with in vivo and in vitro embryo production in holstein donors (Bos taurus taurus)

Silveira, Cecília Rodrigues Alves [UNESP] 17 June 2016 (has links)
Submitted by CECÍLIA RODRIGUES ALVES SILVEIRA null (c_ras@hotmail.com) on 2017-03-16T23:38:33Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Cecilia_Rodrigues_Alves_Silveira.pdf: 1335776 bytes, checksum: 2c41b17b49dd121d78806d292d582d58 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2017-03-21T18:39:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silveira_cra_me_jabo.pdf: 1335776 bytes, checksum: 2c41b17b49dd121d78806d292d582d58 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T18:39:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silveira_cra_me_jabo.pdf: 1335776 bytes, checksum: 2c41b17b49dd121d78806d292d582d58 (MD5) Previous issue date: 2016-06-17 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo do presente estudo foi avaliar o desempenho na produção embrionária in vivo e in vitro de doadoras da raça Holandesa não lactantes, verificar a ocorrência de polimorfismos no gene JY-1 e sua associação com a produção in vivo e in vitro de embriões. Primeiramente, foi verificada a similaridade na produção de embrião da mesma doadora entre as biotécnicas (produção in vivo e in vitro), sendo utilizadas 44 vacas e comparados os desempenhos nas produções de embrião. Na produção in vivo de embriões não foram observados efeitos de ano (P=0,13), estação dentro de ano (P=0,46) e touro dentro de estação e ano (P=0,20). Na produção in vitro, também não foram observados efeitos de ano (P=0,64) e estação dentro de ano (P=0,72), entretanto, o efeito do touro dentro da estação e ano foi significativo (P<0,01). Não há correlação entre as produções in vivo e in vitro dentro de doadora (r=- 0,04; P=0,56). Nenhuma probabilidade de semelhança entre as biotécnicas de produção de embriões, ou seja, se a mesma doadora tem o mesmo desempenho nas duas técnicas (acima ou abaixo da média), foi encontrada (P=0,12). Para verificar a ocorrência de polimorfismos no gene JY-1 e sua associação com a produção embrionária, dados retrospectivos de produções in vivo e in vitro de embriões foram obtidos de 144 vacas não lactantes da raça Holandesa. Para a identificação dos polimorfismos do gene JY-1, as regiões do éxon 2 e íntron 2 foram amplificadas e sequenciadas pelo método de PCR-sequenciamento. Foram detectados quatro SNPs [dois no éxon 2 (rs381676360; rs384600927) e dois no íntron 2 (rs378994837; rs211595914)]. O SNP rs381676360 provocou uma substituição não sinônima de aminoácido (leucina/isoleucina) e o rs384600927, uma substituição sinônima do aminoácido valina. Em relação ao equilíbrio de Hardy-Weinberg, uma das quatro frequências genotípicas não se encontrava em equilíbrio (rs211595914; P<0,01). Considerando o teste de desequilíbrio de ligação (DL), maiores valores de r2 (>0,33) foram observados entre os SNPs rs381676360, rs384600927 e rs378994837 (r2=0,767-0,973) e um SNP (rs211595914) apresentou baixos valores de r2 (r2=0,016-0,025). A associação dos SNPs com as características [número de embriões transferíveis produzidos in vivo (NET); taxa de embriões transferíveis in vivo; (%ET); número de embriões produzidos in vitro (NEV); taxa de clivagem (%CLIV) e taxa de embriões in vitro (%EV)] foi verificada. Nenhum dos SNPs isoladamente foi associado às características estudadas. Porém, quando todos os SNPs foram considerados em conjunto quanto à associação às características, valores significativos foram encontrados para o NET (P<0,01), NEV (P<0,01) e %EV (P<0,01). Desta forma, é possível concluir que o desempenho de produção de doadores de embriões depende da biotécnica utilizada. Ainda, que o gene JY-1 possui polimorfismos do tipo SNP em vacas não lactantes da raça Holandesa e que estes estão associados à produção embrionária. / The aim of this study was to evaluate the performance in in vivo and in vitro embryo production in non-lactating Holstein donors, verify the occurrence of JY-1 gene polymorphisms and their association with the in vivo and in vitro embryo production. First, the similarity in embryo production from the same donor between biotechnologies (in vivo and in vitro production) was verified, being used 44 cows and the embryo production performance was compared. In in vivo embryo production no effects of year (P=0.13), season within year (P=0.46) and sire within the season and year (P=0.20) were found. Regarding in vitro embryo production, no effects of year (P=0.64) and season within year (P=0.72) were found, however, the effect of sire within season and year was significant (P<0.01). There was no correlation concerning embryo production between techniques within donors (r=- 0.04, P=0.56). No probability of similarity between the embryo production techniques, i.e., if the same donor has the same performance in two techniques (above or below of the average), was found (P=0.12). To check the occurrence of JY-1 gene polymorphisms and their association with embryo production, retrospective data from in vivo and in vitro embryo production were obtained from 144 non-lactating Holstein cows. For the identification off JY-1 gene polymorphisms, the region of exon 2 and intron 2 was amplified and sequenced by PCR-sequencing method. Four SNPs were found [two in exon 2 (rs381676360; rs384600927) and two in intron 2 (rs378994837; rs211595914)]. SNP rs381676360 caused a non-synonymous amino acid substitution (leucine/isoleucine) and rs384600927 a synonymous substitution of the valine amino acid. Regarding the Hardy-Weinberg equilibrium, one of the four genotypic frequencies was not in equilibrium (rs211595914; P<0.01). For linkage disequilibrium test (LD) higher r2 values (>0.33) were observed between the SNPs rs381676360, rs384600927 and rs378994837 (r2=0.767 to 0.973) and one SNP (rs211595914) showed lower r2 values (r2=0.016 to 0.025). The association of SNPs with the characteristics [number of in vivo transferable embryos (NET); in vivo transferable embryo rate; (%ET); number of in vitro embryos (NEV); cleavage rate (% CLIV) and in vitro embryo rate (%EV)] was observed. None of the SNPs alone was associated with traits. However, when all SNPs were considered together for the association, significant values were found for NET (P<0.01), NEV (P<0.01) and %EV (P<0.01). Thus, it is possible to conclude that the donor embryo production performance depends on the implemented technique. Still, the JY-1 gene has SNP polymorphisms and they are associated with embryo production in non-lactating Holstein cows. / CNPq: 447172/2014-0 / FAPESP: 2014/13162-1

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