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Master thesis deals with designing of air-conditioning system into newly reconstructed high-rise building of Faculty of Mechanical Engineering Brno University of Technology. Reconstruction of a building results in change of thermo-technical parameters which impacts dimensioning of air condition system. Designing air-conditioning system depends on heat loss and heat gain calculation and also on consequential psychometrical calculations. The size of air conditioning equipment which provides required internal microclimate will be determined from the calculation results. Currently there is Detail design elaborated including technical report and material specification.

There is currently a large increase in the speed of production of DNA sequence data as next generation sequencing technologies become more widespread. As such there is a need for rapid computational techniques to functionally annotate data as it is generated. One computational method for the functional annotation of protein-coding genes is via detection of interaction partners. If the putative partner has a functional annotation then this annotation can be extended to the initial protein via the established principle of “guilt by association”. This work presents a method for rapid detection of functional interaction partners for proteins through the use of the comparative method. Functional links are sought between proteins through analysis of their patterns of presence and absence amongst a set of 54 eukaryotic organisms. These links can be either direct or indirect protein interactions. These patterns are analysed in the context of a phylogenetic tree. The method used is a heuristic combination of an established accurate methodology involving comparison of models of evolution the parameters of which are estimated using maximum likelihood, with a novel technique involving the reconstruction of ancestral states using Dollo parsimony and analysis of these reconstructions through the use of logistic regression. The methodology achieves comparable specificity to the use of gene coexpression as a means to predict functional linkage between proteins. The application of this method permitted a genome-wide analysis of the human genome, which would have otherwise demanded a potentially prohibitive amount of computational resource. Proteins within the human genome were clustered into orthologous groups. 10 of these proteins, which were ubiquitous across all 54 eukaryotes, were used to reconstruct a phylogeny. An application of the heuristic predicted a set of functional protein interactions in human cells. 1,142 functional interactions were predicted. Of these predictions 1,131 were not present in current protein-protein interaction databases.

Chromatin remodeler proteins exert an important function in promoting dynamic modifications in the chromatin architecture, rendering the transcriptional machinery available to the condensed genomic DNA. Due to this central role in regulating gene transcription, deregulation of these molecular machines may lead to severe perturbations in the normal cell functions. Loss-of-function mutations in the CHD7 gene, a member of the chromodomain helicase DNA-binding (CHD) family, are the major cause of the CHARGE syndrome in humans. The disease is characterized by a variety of congenital anomalies, including malformations of the craniofacial structures, peripheral nervous system, ears, eyes and heart. In this context, several studies have already shown the importance of CHD7 for proper function of the neural stem cells (NSCs). Interestingly, we found that CHD7 mRNA levels are upregulated in gliomas, when compared to normal brain tissue, therefore, we hypothesized that CHD7 might have a role in the pathogenesis of these tumors. To investigate the possible oncogenic role of CHD7 in glioblastoma (GBM), we adopted gain- and loss-of-function approaches in adherent GBM cell lines. Using CRISPR_Cas9 genome editing, we found that CHD7 deletion suppresses anchorage-independent growth and reduces spheroid invasion in human LN-229 cells. Moreover, deletion of CHD7 delayed tumor growth and improved overall survival in an orthotopic xenograft glioma mouse model. Conversely, ectopic overexpression of CHD7 in LN-428 and A172 cells was found to increase cell motility and invasiveness in vitro and LN-428 tumor growth in vivo. RNAseq analysis showed that alterations of CHD7 expression levels promote changes in several molecular pathways and modulate critical genes associated with cell adhesion and locomotion. However, the mechanisms underlying the effects of CHD7 overexpression in glioma tissue are still not understood. Here, we also generated recombinant plasmid with functional CHD7 promoter activity reported by luciferase assay. This powerful tool should enable future studies to determine the direct targeting relationship between different signal transduction pathways and CHD7 geneexpression. In summary, our findings indicate that GBM cells expressing a high level of CHD7 may exist and contribute to tumor infiltration and recurrence. Further studies should warrant important clinical-translational implications of our findings for GBM treatment. / As proteínas remodeladoras de cromatina exercem importante papel, promovendo modificações dinâmicas na arquitetura da cromatina e dando acesso à maquinaria transcricional ao DNA genômico condensado. Devido à esta função central na regulação da transcrição gênica, a desregulação dessas máquinas moleculares pode levar a perturbações graves na função normal das células. Assim, por exemplo, mutações do tipo perda de função no gene CHD7, um membro da família \"chromodomain helicase DNA-binding\" (CHD), são a principal causa da síndrome de CHARGE em humanos. A doença é caracterizada por uma variedade de anomalias congênitas, incluindo malformações das estruturas craniofaciais, sistema nervoso periférico, orelhas, olhos e coração. Neste contexto, vários estudos já mostraram a importância da proteína CHD7 para o funcionamento normal de células-tronco neurais (NSCs). Curiosamente, descobrimos que os níveis de mRNA de CHD7 estão mais fortemente expressos em gliomas, quando comparados ao tecido cerebral normal, portanto, nós hipotetizamos que CHD7 poderia ter um papel na patogênese desses tumores. Para investigar o possível papel oncogênico de CHD7 em glioblastoma (GBM), utilizamos enfoques de ganho e perda de função em linhagens celulares aderentes de GBM. Utilizando a técnica de CRISPR_Cas9 para edição do genoma, demonstramos que a deleção do gene CHD7 suprime o crescimento independente de ancoragem e reduz a invasão de esferóides em células LN-229 humanas de GBM. Além disso, a deleção de CHD7 reduziu o crescimento do tumor e melhorou a sobrevida em modelo de injeção ortotópica xenográfica em camundongo. Por outro lado, verificou-se que a super-expressão ectópica de CHD7 nas células LN-428 e A172 aumenta não só a motilidade celular e a capacidade de invasão in vitro, mas, também, o crescimento do tumor de LN-428 in vivo. A análise de RNA-seq mostrou que o nocauteamento da sequência codificadora de CHD7 e sua super-expressão promovem alterações em diversas vias moleculares, modulando genes críticosassociados à adesão e locomoção celular. No entanto, os mecanismos subjacentes aos efeitos da super-expressão de CHD7 em tecidos de glioma ainda não são compreendidos. Neste trabalho, geramos um plasmídeo recombinante contendo um fragmento da região promotora de CHD7, o qual se mostrou funcional em ensaios de luciferase. Esta ferramenta permitirá que estudos futuros possam identificar a relação direta entre as diferentes vias de transdução de sinal e a expressão do gene CHD7. Em resumo, nossos achados indicam que células de GBM expressando um alto nível de CHD7 podem existir e contribuir para a infiltração e recorrência do tumor. Estudos posteriores deverão avaliar as possíveis implicações dos resultados apresentados neste trabalho para a translação clínica no tratamento de pacientes com GBM.

Chromatin remodeler proteins exert an important function in promoting dynamic modifications in the chromatin architecture, rendering the transcriptional machinery available to the condensed genomic DNA. Due to this central role in regulating gene transcription, deregulation of these molecular machines may lead to severe perturbations in the normal cell functions. Loss-of-function mutations in the CHD7 gene, a member of the chromodomain helicase DNA-binding (CHD) family, are the major cause of the CHARGE syndrome in humans. The disease is characterized by a variety of congenital anomalies, including malformations of the craniofacial structures, peripheral nervous system, ears, eyes and heart. In this context, several studies have already shown the importance of CHD7 for proper function of the neural stem cells (NSCs). Interestingly, we found that CHD7 mRNA levels are upregulated in gliomas, when compared to normal brain tissue, therefore, we hypothesized that CHD7 might have a role in the pathogenesis of these tumors. To investigate the possible oncogenic role of CHD7 in glioblastoma (GBM), we adopted gain- and loss-of-function approaches in adherent GBM cell lines. Using CRISPR_Cas9 genome editing, we found that CHD7 deletion suppresses anchorage-independent growth and reduces spheroid invasion in human LN-229 cells. Moreover, deletion of CHD7 delayed tumor growth and improved overall survival in an orthotopic xenograft glioma mouse model. Conversely, ectopic overexpression of CHD7 in LN-428 and A172 cells was found to increase cell motility and invasiveness in vitro and LN-428 tumor growth in vivo. RNAseq analysis showed that alterations of CHD7 expression levels promote changes in several molecular pathways and modulate critical genes associated with cell adhesion and locomotion. However, the mechanisms underlying the effects of CHD7 overexpression in glioma tissue are still not understood. Here, we also generated recombinant plasmid with functional CHD7 promoter activity reported by luciferase assay. This powerful tool should enable future studies to determine the direct targeting relationship between different signal transduction pathways and CHD7 geneexpression. In summary, our findings indicate that GBM cells expressing a high level of CHD7 may exist and contribute to tumor infiltration and recurrence. Further studies should warrant important clinical-translational implications of our findings for GBM treatment. / As proteínas remodeladoras de cromatina exercem importante papel, promovendo modificações dinâmicas na arquitetura da cromatina e dando acesso à maquinaria transcricional ao DNA genômico condensado. Devido à esta função central na regulação da transcrição gênica, a desregulação dessas máquinas moleculares pode levar a perturbações graves na função normal das células. Assim, por exemplo, mutações do tipo perda de função no gene CHD7, um membro da família \"chromodomain helicase DNA-binding\" (CHD), são a principal causa da síndrome de CHARGE em humanos. A doença é caracterizada por uma variedade de anomalias congênitas, incluindo malformações das estruturas craniofaciais, sistema nervoso periférico, orelhas, olhos e coração. Neste contexto, vários estudos já mostraram a importância da proteína CHD7 para o funcionamento normal de células-tronco neurais (NSCs). Curiosamente, descobrimos que os níveis de mRNA de CHD7 estão mais fortemente expressos em gliomas, quando comparados ao tecido cerebral normal, portanto, nós hipotetizamos que CHD7 poderia ter um papel na patogênese desses tumores. Para investigar o possível papel oncogênico de CHD7 em glioblastoma (GBM), utilizamos enfoques de ganho e perda de função em linhagens celulares aderentes de GBM. Utilizando a técnica de CRISPR_Cas9 para edição do genoma, demonstramos que a deleção do gene CHD7 suprime o crescimento independente de ancoragem e reduz a invasão de esferóides em células LN-229 humanas de GBM. Além disso, a deleção de CHD7 reduziu o crescimento do tumor e melhorou a sobrevida em modelo de injeção ortotópica xenográfica em camundongo. Por outro lado, verificou-se que a super-expressão ectópica de CHD7 nas células LN-428 e A172 aumenta não só a motilidade celular e a capacidade de invasão in vitro, mas, também, o crescimento do tumor de LN-428 in vivo. A análise de RNA-seq mostrou que o nocauteamento da sequência codificadora de CHD7 e sua super-expressão promovem alterações em diversas vias moleculares, modulando genes críticosassociados à adesão e locomoção celular. No entanto, os mecanismos subjacentes aos efeitos da super-expressão de CHD7 em tecidos de glioma ainda não são compreendidos. Neste trabalho, geramos um plasmídeo recombinante contendo um fragmento da região promotora de CHD7, o qual se mostrou funcional em ensaios de luciferase. Esta ferramenta permitirá que estudos futuros possam identificar a relação direta entre as diferentes vias de transdução de sinal e a expressão do gene CHD7. Em resumo, nossos achados indicam que células de GBM expressando um alto nível de CHD7 podem existir e contribuir para a infiltração e recorrência do tumor. Estudos posteriores deverão avaliar as possíveis implicações dos resultados apresentados neste trabalho para a translação clínica no tratamento de pacientes com GBM.

本文探討我國銀行業執行盈餘管理的動機、工具及經濟後果。其中本研究以增額稅負的角度去探討銀行從事盈餘管理的經濟後果，本文就經濟後果的部分主要是以稅負的角度出發，是否銀行會因為盈餘管理而產生稅負成本為主要探討方向。　　 就資本市場動機部分，本文發現上市櫃銀行確實較公開發行銀行偏好小額正盈餘變動，也就是上市櫃公司由於資本市場的壓力而有盈餘管理的行為存在。接著本文設計兩個銀行業盈餘管理工具之估計式：將壞帳提列及出售票券損益之非權衡性因素，各自建立一迴歸模型，做為本研究捕捉銀行業盈餘管理的工具與金額，本文結果未能發現我國上市櫃銀行在從事盈餘管理行為時，有所謂增額稅負效果的證據。 / This study investigates the motivation, tools and economic consequences of earnings management of bankings. In particular, the main issue of this study is to investigate whether incremental tax is the economic consequences of bankings conducting earnings management. My results show that the listed bankings that issue the stocks in securities exchange markets have stronger earnings management. In other words, listed bankings will conduct earnings management to alleviate the pressure from the capital markets. Furthermore, this study also find two estimated equations of the tools of earnings management of the bankings: (1) discretionary loans provision and (2)discretionary gain and loss on sale of securities. I find no evidence to claim there are tax costs for the bankings engaging in earnings management.

Submitted by Daniele Amaral (daniee_ni@hotmail.com) on 2016-09-13T17:55:09Z No. of bitstreams: 1 DissFSS.pdf: 1360494 bytes, checksum: 5c89e0de122abd4765ba50babcca44a7 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-15T13:31:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissFSS.pdf: 1360494 bytes, checksum: 5c89e0de122abd4765ba50babcca44a7 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-09-15T13:31:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissFSS.pdf: 1360494 bytes, checksum: 5c89e0de122abd4765ba50babcca44a7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T13:32:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissFSS.pdf: 1360494 bytes, checksum: 5c89e0de122abd4765ba50babcca44a7 (MD5) Previous issue date: 2015-08-07 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The Sharing Game, an economic game, studies behavior involved in resource allocation. The participant faces several trials in which he must choose between two options, both with an amount of resources for him and for other passive participant. In the optimal option the distributor receives more and the receiver even more, and in the non optimal option the distributor receives less and the other even less. From their choice, participants may be classified as optimizers, egalitarians or competitives. This work intends to assess whether and to what extent, distributions of strategies in the Sharing Game are affected by the variables gender distributor and allocation frame (gains or losses). There were the Experimental Conditions Gain-Loss and Loss-Gain, both involving hypothetical money. Data were collected online through the website Survey Monkey (n=427). In an intragroup analysis, there was no difference in the strategies adopted by participants distributing gains and losses. However, a between group analysis showed a significant order exposure effect of the allocation type, that is, if the game started with gains or losses. When comparing the two experimental conditions, the Gain-Loss condition presented an optimized strategy in a higher percentage of participants, and the Loss-Gain condition showed a higher percentage of participants both in the egalitarian and competitive strategies. Significant gender differences were found in the two experimental conditions, since in both of them the optimal strategy showed a higher percentage of men. This study has social and scientific importance by presenting an experimental model to study cooperation and competition. It also contributes for the economic games being more known and used in Psychology and Behavior Analysis. Finally, it provides greater generality to the data which may still be inconclusive regarding gender and the use of gains or losses in economic games. / O Jogo da Partilha é um jogo econômico que estuda os comportamentos envolvidos na distribuição de recursos. O participante deve escolher, em uma série de tentativas, entre duas opções com uma quantidade de recursos para ele e para outro participante passivo. Na opção ótima, o distribuidor recebe mais e o outro participante mais ainda e na opção não ótima, o distribuidor recebe menos e o outro menos ainda. A partir das escolhas dos participantes, verificam-se quantos foram otimizadores, igualitários e competitivos. Este trabalho pretendeu avaliar se, e em que extensão, as distribuições de estratégias no Jogo da Partilha são afetadas pelas variáveis gênero do distribuidor e tipo de alocação (ganho ou perda). Houve a Condição Experimental Ganho-Perda e a Condição Experimental Perda-Ganho, ambas envolvendo distribuição de dinheiro hipotético. Os dados foram coletados on-line através do site Survey Monkey (n=427). Em uma análise intragrupo, não houve diferença nas estratégias adotadas pelos participantes, entre distribuir ganho e perda. Porém, uma análise entre grupos mostrou efeitos significativos da ordem do tipo de alocação e do gênero do distribuidor. Na condição Ganho-Perda, houve uma maior porcentagem de participantes na estratégia otimizada, e na condição Perda-Ganho houve uma maior porcentagem na igualitária e na competitiva. E, nas duas condições experimentais, houve uma maior porcentagem de homens na estratégia otimizada. Este trabalho possui importância social e científica ao apresentar um modelo experimental para estudar competição e cooperação, ao contribuir para os jogos econômicos serem mais conhecidos e utilizados na Psicologia e na Análise do Comportamento, e ao fornecer maior generalidade aos dados inconclusivos em relação ao gênero e à utilização de ganho e perda em alocações de recursos. / 2012/23951-8