Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5451.pdf: 3223679 bytes, checksum: 330bb99725d861546288b6adcca1e31b (MD5) Previous issue date: 2013-03-22 / Universidade Federal de Sao Carlos / The cattle egret (Bubulcus ibis), native from Africa, invaded the American continent by the end of the XIX century, initiating the process of colonization through the north of South America and spreading throughout the continent. Haemoparasites are found in all continents in the world, with the exception of Antarctica, and in preliminary tests it was verified they are present in the cattle egret population. The objectives of this work were to estimate the prevalence of the haemoparasites Plasmodium and Haemoproteus on African and Brazilian populations of B. ibis and to identify the repertoire of the lineages in these populations. Blood samples and blood slides were acquired from B. ibis nestlings in six brazilian populations and in 15 african populations, located at the west coast, totalling around 859 individuals. For the molecular diagnosis, fragments of the cytochrome B gene of the Plasmodium spp. and the Haemoproteus spp. were amplified. The DNA of the parasite in the infected individuals was sequenced and the identification of the genus and the lineages present was performed through phylogenetic analysis via the bayesian method using the Mr. Bayes software. These results were partially confirmed by the morphological diagnosis. The prevalences in Africa for the Plasmodium genus decreased from Senegal and Guinea-Bissau to South Africa, while Brazilian prevalences increased from Pará to Rio Grande do Sul. The diversities of African lineages of Plasmodium spp. were higher in regions close to and above the Equator line; the highest Brazilian diversity was also found near the Equator. The G pair to pair statistical test did not reveal difference between the prevalences of African and Brazilian cattle egret populations, both for the Plasmodium and for the Haemoproteus genera. Significant difference was detected relative to the richness of the lineages of the Plasmodium genus found in Africa and Brazil, partially confirming the predictions of the Enemy Release Hypothesis. Some evidence points to African countries near and above the Equator line as African source-founder populations of the cattle egret that colonized Brazil. / A garça-vaqueira (Bubulcus ibis), nativa da África, invadiu o continente americano no final do século XIX, iniciando o processo de colonização pelo norte da América do Sul e se espalhando por toda a área do continente. Os hemoparasitas são encontrados em todos os continentes do mundo, com exceção da Antártida e em testes preliminares verificamos que estão presentes na população de garça vaqueira. Os objetivos desse trabalho foram estimar a prevalência dos hemoparasitas, Plasmodium e Haemoproteus, nas populações de B. ibis africanas e brasileiras e identificar o repertório das linhagens nessas populações. Amostras de sangue e lâminas foram obtidas de ninhegos de B. ibis em seis populações brasileiras e em 14 populações africanas, localizadas na costa oeste, totalizando cerca 859 indivíduos. Para o diagnóstico molecular, foram amplificados fragmentos do gene do citocromo B do Plasmodium spp e do Hemoproteus spp . O DNA do parasita dos indivíduos infectados foi sequenciado e a identificação do gênero e das linhagens presentes foi feita por análise filogenética pelo método bayesiano no programa Mr. Bayes. Esses resultados foram parcialmente confirmados com o diagnóstico morfológico. As prevalências da África para o gênero Plasmodium decresceram de Senegal e Guiné Bissau para a África do Sul, ao passo que as brasileiras aumentaram do Pará para o Rio Grande do Sul. As diversidades das linhagens africanas de Plasmodium spp. foram maiores nas regiões próximas e acima à linha do Equador; a maior diversidade brasileira foi encontrada próximo ao Equador também. O teste estatístico G par a par não revelou diferença entre as prevalências das populações de garças vaqueiras africanas e brasileiras, tanto para o gênero Plasmodium quanto para o Haemoproteus. Foi detectada diferença significativa com relação à riqueza das linhagens do gênero Plasmodium encontradas na África e no Brasil, confirmando parcialmente as previsões da Hipótese da Liberação do Inimigo. Algumas evidências apontaram para os países africanos próximos e acima da linha do Equador como populações fonte-fundadora africana de garças vaqueiras que colonizaram o Brasil.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5210.pdf: 2118261 bytes, checksum: 34186074c7b33cbccbdeb2e52494a041 (MD5) Previous issue date: 2013-03-26 / Universidade Federal de Sao Carlos / The cattle egret (Bubulcus ibis [Ardeidae]) was first reported in the New World in the late nineteenth century and has been found scattered throughout the Americas since the 1950s. The aim of the present study was to analyze the distribution of genetic diversity in African and Brazilian populations of the cattle egret to understand the process of colonization of the non-native area in the Brazil. Genetic variation in the mitochondrial DNA (mtDNA) Control Region (CR) (n = 412 African and 177 Brazilian individuals), in ATPase 6 and 8 genes (n = 108 African and 49 Brazilian individuals) and in the intron 5 of the nuclear transforming growth factor beta-2 gene (n = 96 African and 50 Brazilian individuals) were evaluated. Genetic diversity across regions of Africa was similar, except for the lesser diversity found in South Africa. Neutrality tests, mismatch distributions and Bayesian skyline plots revealed demographic expansion in the overall African population, dated by the latter method as 15000 years before the present, occurred after the last glacial maximum. The findings were discussed hypothesizing that past climatic events have shaped the current distribution of genetic diversity. AMOVA and pairwise Fst tests revealed a lack of differentiation among nearly all African populations. The few cases of differentiation involved the South African and/or Nigerian populations. Brazilian populations exhibited no genetic structure or effective size deviations over time. Mitochondrial and nuclear DNA genetic variability demonstrated similar levels of genetic variation between the Brazilian and African populations, suggesting multiple introduction events. Based on historical and genetic data (differentiation levels and shared haplotypes), we propose a likely migration route between both continents departing from West Africa, passing through oceanic islands and archipelagos, such as Cape Verde, and finally arriving in the Americas on the northern and/or southern coast of Brazil. / Bubulcus ibis (garça-vaqueira) é um ardeídeo cuja presença na América do Sul foi reportada pela primeira vez no final do século XIX e já na década de 1950 encontravase espalhada por todo o continente. O presente estudo teve por objetivo analisar a distribuição da diversidade genética nas populações africanas e brasileiras de B. ibis visando compreender os processos que modelaram os padrões de colonização da área não-nativa no Brasil. Foi estudada a variação genética da região controladora (RC) do DNA mitocondrial (DNAmit) (N = 412 africanas e 177 brasileiras) e dos genes ATPases 6 e 8 do DNA mitocondrial (N = 108 africanas e 49 brasileiras) e do íntron 5 do gene nuclear Transforming growth factor beta-2 (TGFB2) (N = 96 africanas e 50 brasileiras). Níveis de diversidade genética encontrados foram semelhantes entre as regiões africanas, exceto pela menor diversidade encontrada na África do Sul. Os testes de neutralidade, as curvas de mismatch distribution e o Bayesian Skyline Plot evidenciaram uma expansão demográfica na população total africana, datada por essa última metodologia em 15 mil anos atrás, ocorrida após o último máximo glacial. Esses resultados foram discutidos supondo que eventos climáticos dessa época produziram os padrões encontrados no presente da distribuição da diversidade genética. Os testes de AMOVA e os FST par a par mostraram ausência de diferenciação entre quase todas as populações africanas e quando achada, envolveram as populações da África do Sul e/ou da Nigéria. As populações brasileiras não se diferenciaram geneticamente, nem apresentaram desvios do tamanho efetivo ao longo do tempo. A variabilidade genética avaliada pelos genes do DNAmit e do DNA nuclear foram semelhantes nas populações brasileiras e africanas, sugerindo a ocorrência de múltiplos eventos de introdução. Uma provável rota de migração entre os dois continentes foi suposta nesse estudo baseando-se nos registros históricos e nos dados genéticos (graus de diferenciação e compartilhamento de haplótipos): aves partiriam da costa oeste da África, passando por ilhas oceânicas e/ou arquipélagos como Cabo Verde e chegariam ao continente sul americano pelo norte e/ou sul do litoral brasileiro.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:20:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4932.pdf: 1990172 bytes, checksum: 7025c9dd589a8c2a6771bc24539895b5 (MD5) Previous issue date: 2013-03-05 / Universidade Federal de Sao Carlos / The genetic diversity of the cattle egret (Bubulcus ibis) was analyzed to investigate reproductive behavior and characterize Brazilian populations of the species. Genotypes at seven microsatellite loci were used to investigate the occurrence of more than one female laying eggs in the same nest, characterizing the occurrence of multiple maternity. DNA was extracted from swabs collected from the outer surface of eggs and sexed; males were excluded. Forty-eight clutches from two breeding seasons (2010 and 2011) were genetically analyzed. Thirty-nine eggs laid by a second or third female were recorded. In five nests, the first egg of the clutch was from a different female, the laying happening prior to that of the incubating female. Suggesting nest takeover by another pair of egrets that kept the pre-existing eggs together with its own clutch. In the other 43 nests, the hypothesis of brood parasitism was posed to explain why one or two additional females were found laying eggs in a nest. A 463-bp fragment of the mitochondrial DNA control region Domain I was amplified for 148 individuals from seven Brazilian populations to investigate genetic-population and demographic parameters. Genetic diversity indices, the population structure tests Fst and AMOVA, a haplotype network, mismatch distribution and neutrality tests (Tajima s D, Fu s Fs, Fu and Li s D* and F*, Ramos-Onsins and Rozas R2) revealed the following: i) a high level of diversity was recorded for the cattle egret in Brazil in comparison to other closely related species studied in the country; ii) genetic diversity levels determined for the Brazilian regions are similar; iii) genetic structuring was not observed between the seven studied populations; and iv) the different tests performed to determine demographic expansion revealed no significant results. This is the first genetic characterization study for Bubulcus ibis to date and the findings indicate a high degree of plasticity in reproductive behavior and confirm a marked dispersion behavior of the species, leading to the homogenization of Brazilian populations. / A diversidade genética da garça-vaqueira (Bubulcus ibis) foi utilizada para se investigar o comportamento reprodutivo e para se caracterizar populações brasileiras da espécie. Genótipos em locos de microssatélites foram utilizados na detecção da presença de mais de uma fêmea ovipositando em um mesmo ninho, o que pode caracterizar a ocorrência de maternidade múltipla. O DNA extraído dos swabs coletados na superfície externa dos ovos foi sexado e eventuais amostras de machos foram excluídas. Quarenta e oito ninhadas, de duas temporadas reprodutivas (2010 e 2011) foram analisadas geneticamente. Foram registrados 39 ovos ovipositados por uma segunda ou terceira fêmea. Em 33 ninhos foram encontrados genótipos distintos de duas fêmeas e em seis ninhos genótipos de três fêmeas. Em cinco ninhos o primeiro ovo na sequência de oviposição mostrou-se ser de uma fêmea diferente, tendo a oviposição acontecido previamente àquela da fêmea incubante. Esse achado foi explicado supondo a tomada de ninho por um segundo casal de garças, com a manutenção do ovo pré-existente juntamente com os da própria ninhada. Nos outros 43 ninhos, a presença das fêmeas extras foi explicada hipotetizando a ocorrência de parasitismo de ninho intraespecífico. Um fragmento de 463 pb do Domínio I da região controladora do DNA mitocondrial foi amplificado para 148 indivíduos para a investigação de parâmetros genéticopopulacionais e processos demográficos nas sete populações estudadas. A estimativa de índices de diversidade genética, testes de estruturação populacional Fst e AMOVA, a construção de uma rede de relação entre haplótipos, a análise de mudanças no tamanho populacional pela mismatch distribution e a realização de testes de neutralidade (D de Tajima, Fs de Fu, D* e F* de Fu e Li, R2 de Ramos-Onsins e Rozas) permitiram identificar: i) um nível alto de diversidade genética para B. ibis no Brasil, quando comparado a espécies proximamente relacionadas estudadas no país; ii) níveis semelhantes de diversidade genética determinados para as regiões brasileiras; iii) ausência de estruturação genética entre as sete populações estudadas; e iv) ausência de sinais de expansão demográfica pelos testes realizados. Os resultados aqui apresentados são os primeiros resultados genéticos na espécie até o momento e apontam para uma alta plasticidade no comportamento reprodutivo e confirmam a dispersão bastante acentuada da espécie, levando a homogeneização das populações brasileiras.