As populações de milho ESALQ-PB 2 (grãos dentados) e ESALQ-PB 3 (grãos duros ou “flint”) após um ciclo de seleção massal estratificada foram submetidas a um processo cíclico de seleção recorrente com endogamia, objetivando conhecer o comportamento destas populações como tais e dos seus potenciais como fonte de linhagens endogâmicas vigorosas para utilização em esquema de produção de híbridos. Para cada uma das populações, foram avaliados os caracteres de peso de campo, peso de três espigas e peso de grãos, além de três caracteres de planta e dois caracteres de espiga, sendo que somente o caráter peso de campo foi avaliado nos três ciclos de seleção, tendo sido os demais avaliados em um ciclo. Os dados que fundamentaram esta pesquisa foram coletados a partir de três ciclos de seleção para a produção de grãos. No primeiro ciclo foram avaliadas 1000 progênies S1 em dez látices simples 10 x 10 duplicados. No ciclo seguinte avaliaram-se 400 progênies S1 em quatro látices simples 10 x 10 triplicados. E, no último ciclo foram avaliados 490 progênies S2 das referidas populações em dez látices simples 7 x 7 duplicados. Durante os ciclos de seleção, empregou-se como testemunhas a variedade"Piranão"(1º ciclo); as populações parentais, E8ALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3 (2º ciclo); e os híbridos duplos comerciais, Cargill 511 e Contimax 322 (3º ciclo). Adicionalmente, foram estudados os efeitos de irradiação no primeiro ciclo e da depressão por endogamia no segundo ciclo. Além da estimação de médias, a realização de análises de variância permitiu a obtenção de estimativas de outros parâmetros populacionais, tais como: variância genética aditiva (&#2442A); coeficientes de herdabilidade ao nível de plantas (h2) e de médias de progênies (h2x̄); coeficientes de variação experimental (CVe) genético (CVg); índice de variação (θ = CVg/CVe); e erro padrão da media (sm). Também foram elaborados histogramas de distribuição de médias para todos os caracteres estudados nas duas populações. Dentre as estimativas de interesse destacaram- se as da variância genética aditiva em (g/planta)2 para o peso de campo, que foram entre os limites (tomados sob duas hipóteses) de 114,0 a 142,5 e 125,9 a 157,4 no primeiro ciclo, 119,9 a 149,9 e 111,0 a 138,7 no segundo ciclo, e 219,2 a 246,6 e 234,4 a 263,7 no terceiro ciclo, para as populações ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3, respectivamente. Além disso, no primeiro ciclo também foram incluídas amostras irradiadas, cujas estimativas foram de 182,8 a 228,6 e 89,9 a 112,3 para ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3, respectivamente. Também foi determinada no segundo ciclo a depressão por endogamia para os caracteres peso de campo e peso de grãos cujos valores foram de 43,82% e 43,72% para ESALQ-PB 2; e 42,49% e 49,44% para ESALQ-PB 3, respectivamente. Uma análise global dos resultados mostrou evidências de progresso no comportamento das linhagens endogâmicas durante os ciclos de seleção. Além disso, uma análise da estrutura genética das duas populações nos ciclos de seleção leva a inferir que ambas apresentam um bom potencial para a obtenção de linhagens endogâmicas vigorosas, muito embora tenha sido detectada após dois ciclos de seleção com endogamia, a presença de uma acentuada carga genética potencial devida à presença de genes deletérios. / The maize populations ESALQ-PB 2 (yellow dent) and ESALQ-PB 3 (orange flint) after one cycle of stratifioted mass selection were submitted to recurrent selection under inbreeding, aiming to know the properties of these populations"per se"and their potential as source of vigorous inbred lines in hybrid programs. For each population the following traits were evaluated: field weight, weight of three ears and Kernel yield; three plant characters and two ear characters; field weight was evaluated in the three selection and the others evaluated in one cycle. The experimental data were obtained during three selection cycles for yield. At the first cycle 1000 S1 progenies were evaluated in ten double 10 x 10 lattices. In the second cycle 400 S1 progenies were evaluated in four triple 10 x 10 lattices. Finally, in the last cycle 490 S2 progenies were evaluated in ten double 7 x 7 lattices. During the selection cycles the variety 'Piranão' (1st cycle), the parental populations, ESALQ-PB 2 and ESALQ-PB 3 (2nd cycle) and the double-cross Cargill 511 and Contimax 322 (3nd cycle) were used as checks. It was also studied the irradiation effects in the first cycle and inbreeding depression in the second cycle. Besides the means, the analyses of variance allowed the estimation of population parameters, such as: additive genetic variance (&#2442A, heretability coefficient at individual (h2) and progenies mean basis (h2x̄); experimental and genetic coefficients of variation (CVe and CVg); variation index (θ=CVg/CVe) and mean standard erros (sm). Also the distributions of progeny means were presented in histograms for alI characters studied. The estimates of additive genetic variance, in (g/plant)2, for field weight, were pointed out, that were between the limits (taken under two hypothesis): 114.0 to 142.5 and 125.9 to 157.4 in the first cyc1e; 119,9 to 149,9 and 111.0 to 138.7 in the second cycle and 219.2 to 246.6 and 234.4 to 263.7 in the third cycle, for the populations ESALQ-PB 2 and ESALQ-PB 3, respectively. In the first cycle, it was a1so included irradiated samp1es, and the respectives estimates were 182,8 to 228.6 and 89.9 to 122.3 for ESALQ-PB 2 e ESALQ-PB 3. At the second cycle it was also detemined the inbreeding depression effects for the characters field weight and grain yield, which were 43.82% and 43.72% for ESALQ-PB 2; and respectively. 42.49% and 49.44% for ESALQ-PB 3, respectively. An overall analysis of the results showed evidence of progress in the performance of the inbred lines during the selection cycles. An analysis of the genetic structure of the two populations in the selection cycles, showed that both populations present a good potential as source of vigorous inbred lines, though an expressive part of the potential genetic load still remained after two cycles of selection under inbreeding.

O presente trabalho teve por objetivo estudar os efeitos do gene Lg3, o qual controla a ausência de formação de lígula nas folhas de milho, em características agronômicas através da análise de dois experimentos, instalados na Estação Experimental de Anhumas (Piracicaba. SP), no ano agrícola de 1990/91. No primeiro experimento, oito populações segregando 1:1 para o gene foram avaliadas através do delineamento de blocos ao acaso com parcelas sub-sub-divididas, com quatro repetições, onde os fatores eram: espaçamento entre linhas (O,5 e 1.0 metro), genótipos (oito populações RC1) e presença de lígula. Neste ensaio foram coletados dados referentes à: peso de grãos (gramas por planta), peso de 100 grãos (gramas) e prolificidade (número de espigas por planta); com base em média por sub-sub-parcela e com base na competição entre as plantas na linha (competição completa ou meia competição). No segundo experimento, uma amostra de vinte e sete populações segregantes foi avaliada de acordo com o delineamento de blocos ao acaso, com seis repetições. Neste ensaio foram consideradas as características: altura da planta (metros), representada pela distância entre o solo e a inserção da folha bandeira; altura da inserção da espiga superior (metros); diâmetro do colmo (centímetros), medido no internódio imediatamente acima da inserção da espiga superior; número de folhas acima da inserção da espiga superior, comprimento de espiga (centímetros); número de fileiras; peso de grãos (gramas por planta) e peso de 100 grãos (gramas). Os resultados obtidos para peso de grãos foram contrastantes. No primeiro experimento, foi observado superioridade dos genótipos com lígula ao nível de 1% de probabilidade, ao passo que no segundo não foi detectado diferença significativa. A diferença foi atribuída à maior exigência dos genótipos sem lígula por água, que também contribuiu para menor prolificidade e maior peso de 100 grãos no período em que houve déficit hídrico (Experimento 1). No segundo experimento, não foi observada diferença significativa para as características avaliadas. A partir dos dados obtidos notou-se que a introdução do gene Lg3 em plantas de milho é promissora, no sentido de alterar a arquitetura da planta, produzindo materiais com aspectos semelhantes aos dos híbridos mais recentes. Entretanto, o gene apresenta efeitos distintos no genoma de acordo com as características intrínsecas deste e das condições ambientais da avaliação. A maior susceptibilidade dos genótipos Lg3 por estresse hídrico, implica que, um programa de seleção nas populações receptoras para tolerância a estas condições pode resultar em genótipos –Lg3 mais estáveis / not available

A determinação do número de progênies utilizadas em programas de melhoramento de milho é de grande importância, pois estas devem ser representativas da população. Porém, pouca atenção tem sido dada para o problema da amostragem. Geralmente são amostrados certo número de progênies, sem a certeza de que esta amostra seja representativa da população que está sendo estudada. O presente trabalho teve por objetivo, determinar o tamanho adequado da amostra em duas populações de milho, para ser utilizada em programas de seleção recorrente com progênies S1. Os experimentos foram conduzidos em dois locais (fazendas Areão e Caterpillar, em Piracicaba) no ano agrícola de 93/94. Foram avaliadas 400 progênies S1, sendo 200 da população BR-105 e 200 da população BR-106. As progênies foram avaliadas em quatro experimentos em látice 1 Ox1 O, contendo 100 destas por experimento. As 200 progênies de cada população foram divididas em grupos de 25 progênies. Os tamanhos amostrais foram: 25, 50, 75, 100, 125, 150, 175 e 200 progênies. Para cada tamanho de amostra, foram estimados parâmetros genéticos para os caracteres peso de espigas (PE), altura da planta (AP), altura da espiga (AE), posição relativa da espiga (EP) e índice de espigas (IE). Baseando-se na estabilidade dos componentes da variância, no coeficiente de herdabilidade e no intervalo de confiança destas estimativas, foram determinados os tamanhos ideais da amostra. Verifica-se que o tamanho ideal da amostra para os caracteres PE, AP, AE, IE e EP foram, respectivamente: 175, 125, 125, 175 e 200 progênies S1, na população BR-105; e para a população BR-106 foram: 175, 125, 125, 175 e 175 progênies S1, respectivamente. Observou-se que o tamanho ideal da amostra, não diferiu entre as duas populações, sendo que apenas para o caráter EP o tamanho adequado da amostra na população BR-106 foi um pouco menor. Baseando-se nestes resultados e nas condições experimentais utilizadas, conclui-se que em programas de melhoramento, seriam necessárias 200 progênies S1 para representar as populações / Sample size of progenies has great importance in maize breeding programs, because progenies would represent its base population. Hence, progenies sampling must be carefully considered. In general, researchers sample a certain number of plants without assuring that they represent the population that is being evaluated. This research was aimed to evaluate the suitable size for sampling, allowing that the sample can represent the populations of maize studied. S1 progenies of BR-105 and BR-106 populations were used. The experiments were carried out in two locations (Areão and Caterpillar farms, in Piracicaba) during 93/94 growing season. Four hundred S1 progenies were evaluated, where 200 S1 progenies were from BR-105 and 200 from BR-106 populations. The progenies were evaluated in four lattice 10x10 experiments, with 100 progenies per experiment. Two hundred progenies of each population were divided in groups of 25 progenies. The sampling sizes used were: 25, 50, 75, 100, 125, 150, 175 and 200 progenies. Genetic parameters of the following traits were estimated: ear weight (EW), plant height (PH), ear height (EH), ear placement (EP) and prolificacy (P). Suitable sampling sizes were determined based on genetic variance, heritability and confidence intervals of those estimates. It was observed that the suitable sampling sizes for EW, PH, EH, P and EP were: 175, 125, 125, 175 and 200 S1 progenies for BR- 105 population; and 175, 125, 125, 175 and 175 S1 progenies for BR- 106 population, respectively. The suitable sampling size did not differ for both populations, being the suitable sampling size for EP in BR- 106 population a little lower. Thus, in the experimental conditions used, two hundred S1 progenies would be used as adequate sample size for maize breeding programs

Orientadores : Antonio Sergio Ramalho, Luis Alberto Magna / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-02T20:18:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mazzi_MichelleMarcondes_M.pdf: 1626952 bytes, checksum: 0516ce31127d2e13361d29345221f38a (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Os mecanismos homeostáticos de manutenção do polimorfismo da hemoglobina S e da talassemia beta ainda não estão totalmente esclarecidos, admitindo-se a existência de mecanismos complementares ou alternativos, em relação à hipótese de seleção favorável dos heterozigotos pela malária. O aumento de fertilidade das heterozigotas é um dos processos sugeridos, embora só tenha sido testado até o momento em estudos indiretos e/ou realizados em áreas malarígenas, onde é difícil afastar a influência dessa parasitemia sobre o comportamento reprodutivo das heterozigotas. No presente trabalho, a fertilidade de portadoras do traço falciforme (heterozigotas AS) e do traço talassêmico beta (heterozigotas AT) foi comparada de forma direta à de suas irmãs com hemoglobina normal (homozigotas AA), em região não malarígena (Araras, SP). Foram estudadas 53 heterozigotas AS e 43 irmãs AA, casadas ou com parceria estável com maridos AA, bem como 68 heterozigotas AT e 45 irmãs AA, igualmente casadas com indivíduos com hemoglobina normal. As heterozigotas e as suas irmãs-controle foram comparadas quanto à idade, pelo teste de Mann-Whitney, sem diferença significativa. O número médio de filhos das heterozigotas AS e AT (3,0755 e 2,7647, respectivamente) não diferiu significativamente do observado nas amostras-controle (3,0000 e 2,3778, respectivamente). Além disso, não foi observada diferença significativa entre heterozigotas e controles, no que diz respeito à proporção de mulheres casadas sem filhos, quando comparadas pelo teste exato de Fisher. Tais resultados não favoreceram, portanto, a hipótese de o aumento de fertilidade das heterozigotas ser um mecanismo homeostático de manutenção do polimorfismo da hemoglobina S e da talassemia beta / Abstract: Homeostatic mechanisms that maintain hemoglobin S and beta thalasemia are not completely clear so far, being considered the presence of mechanisms either complimentary or alternative concerning the hypothesis of favorable selection of heterozygous by malaria. Increased fertility of heterozygous women is one of the suggested processes, though it has only been tested so far in indirect surveys and/or ones that have been carried out in areas with endemic malaria, which makes it difficult to split apart the influence of this disease over the reproductive behavior of heterozygous women. In the present work, the fertility of sickle-cell trait women (heterozygous AS) and thalasemic trait (heterozygous AT) was directly compared to the fertility of their sisters carrying normal hemoglobin (homozygous AA). The samples were obtained in a non-endemic malaria area (Araras, SP). It has been studied 53 AS women and their 43 AA sisters, both either married or sharing a stable relationship with their husband AA, as well as 68 AT women and their 45 AA sisters, also married with normal hemoglobin husbands. The average number of children per heterozygous AS and AT women (3.0755 and 2.7647 respectively) did not differ significantly from those observed among their control sisters (3.0000 and 2.3778 respectively). In addition, it was not observed a significant difference between the proportion of married women without children between the heterozygous women and their control sisters. The results herein presented hence does not support the hypothesis of increased fertility of heterozygous women as being a homeostatic mechanism able to maintain the polymorphism of either hemoglobin S and beta thalasemia / Mestrado / Ciencias Biomedicas / Mestre em Ciências Médicas

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T17:26:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Abreu_AluanaGoncalvesde_M.pdf: 3013481 bytes, checksum: 1e80077fc9d6f66ee4da3aa8b8903472 (MD5) Previous issue date: 2003 / Mestrado

Orientadores: Luiz Francisco Lembo Duarte, Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T20:54:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dias_GustavoMuniz_M.pdf: 55978490 bytes, checksum: ce5edb29ed334ed2e7fcc280a376a9f4 (MD5) Previous issue date: 2004 / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Ana Maria Lima de Azevedo Espin / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-24T06:25:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Geurgas_SilviaRodrigues_M.pdf: 3311301 bytes, checksum: de822dddb6c7d65ed9e0653e0c4ffece (MD5) Previous issue date: 1998 / Mestrado

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-11-09T15:45:39Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1077793 bytes, checksum: 8d3920841482aad705663696300bbf65 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-09T15:45:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1077793 bytes, checksum: 8d3920841482aad705663696300bbf65 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cedrela (Meliaceae) é um gênero monofilético que inclui 17 espécies florestais no Neotropico. A sua diversificação se intensificou no Mioceno tardio e Plioceno cedo. Muitas espécies de Cedrela possuem distribuição restrita, entretanto Cedrela fissilis Vell. e amplamente distribuída. No Brasil C. fissilis Vell. acontece geralmente associada a florestas úmidas e estacionais. Esta espécie esta considerada “em perigo” pela lista vermelha da IUCN. É formada por duas linhagens filogenéticas que não são um clado monofilético, Cedrela fissilis Vell. e Cedrela odorata L., contendo além, sequências de C. balansae, chamando-se de complexo C. fissilis. O rio Paraná se espalha pelo Cerrado, um importante hotspot de biodiversidade; provavelmente manteve-se estável e formaram um único grande refúgio durante o final do Pleistoceno, onde ocorreram mudanças climáticas importantes. Ferramentas moleculares irão contribuir para a compreensão do processo histórico de dispersão de genes. Florestas estacionais são fortes ecossistemas ameaçados, a pesar de ser consideradas áreas de endemismo. O objetivo deste estudo foi caracterizar a diversidade genética dentro e entre populações de Cedrela ao longo do alto do Rio Paraná. Dez microssatélites foram utilizados para a genotipagem de 192 indivíduos; obtiveram-se valores de HO=0,65 e HE=0,78 e valores positivos da FIS (FIS=0,18). Para AMOVA, 84,93 % da variação estavam dentro das populações e 15,07% estavam entre as populações, com valores de divergência genética (FST=0,151). O grupo da Cedrela fissilis linhagem 1 mostrou-se mais diverso, com 22 dos 54 alelos privados encontrados. Ele apresentou valor FST (FST = 0,111) menor do que as populações do grupo Cedrela sp. (FST=0,188). Verificou-se forte estrutura das populações, com cinco linhagens de Cedrela e com espécimes com menos admixtured nunca antes amostradas, sendo maior do que o número de linhagens conhecidas com base em sequências de ADN e do que os resultados do estudo do complexo C. fissilis usando SSR. Três destes cinco grupos são novas linhagens. Isto sugere, de acordo com nossos resultados, a presença de refúgios na bacia do alto rio Paraná, além de uma nova unidade geneticamente distinta e mais dois para análise botânica. Além disso, algumas populações mostraram relevância na conservação do habitat devido à presença de material genético estranho e processo histórico. / Cedrela (Meliaceae) is a monophyletic genus and includes 17 tree species in the Neotropics. Its diversification intensified in the Late Miocene and Early Pliocene. Most Cedrela species have restricted distribution ranges, however Cedrela fissilis Vell. is widespread. In Brazil C. fissilis Vell. occurs associated with Seasonal and Moist Forest. This species is "endangered" on the red list of the IUCN. Cedrela fissilis is formed by Cedrela fissilis Vell. and Cedrela odorata L., two phylogenetic lineages that are not a monophyletic clade, comprising moreover sequences of C. balansae, called C. fissilis complex. The upper Paraná River spreads into the Cerrado, an important biodiversity hotspot; it is probably remained stable and formed a single large Cerrado refugium during the late Pleistocene, where occurred important climatic changes that could influence in the spread of species. Molecular tools will contribute for understanding the historical process of gene dispersal since the Pleistocene. Seasonal forests are strong threatened ecosystems. The knowledge about seasonal forest has been increased since they are considered as areas of endemism. The aim of this study was to characterize the genetic diversity within and among populations of Cedrela along upper Parana River. Ten microsatellites were used to genotype 192 individuals, then it was obtained high values of heterozygosis (HO=0.65, HE=0.78), with positive values of FIS (FIS=0.18). For AMOVA, 84.93% of the variation were within populations and 15.07% were among populations which also reflected into the values of genetic divergence (FST=0.151). The Cedrela fissilis lineage 1 group showed more diverse, with 22 of 54 private alleles found. It presented FST value (FST=0.111) lower than the populations of Cedrela sp. group (FST=0.188). It has been found strong population structure showing a number of groups equal to five and being greater than the number of known phylogenetic lineages based on DNA sequences and also greater than the results of study of the C. fissilis complex using SSR markers. Three of these five groups are new lineages that no was found in previously works. This suggests, according our evidence, the presence of refugia in the upper Paraná River basin, moreover of a new genetically distinct unit and two more for botanical review. Furthermore, some populations showed conservation relevance of habitat due to the presence of peculiar genetic material and historical process.

Zoobotryon verticillatum (delle Chiaje, 1822) é um briozoário cosmopolita amplamente distribuído em regiões tropicais e temperadas em todos os oceanos. Por possuir meios de distribuição natural restritos, é possível supor que o táxon se trate de um complexo de espécies crípticas ou de uma espécie vastamente introduzida por ação antrópica. Para elucidar essa questão, foram realizadas análises populacionais e filogenéticas utilizando-se dois genes mitocôndrias, citocromo c oxidase subunidade 1 região 3\' (COI-3P) e subunidade ribossomal RNA 16S (16S). As análises filogenéticas suportaram o monofiletismo de Z. verticillatum e, juntamente com as análises populacionais, indicam que é uma única espécie distribuída mundialmente. A falta de uma estrutura geográfica evidente nas redes haplotípicas, a ausência majoritária de relacionamentos dicotômicos e clados altamente suportados (pp >= 5%) nas árvores filogenéticas, a falta de resultados significativos na maioria dos teste D e Fs realizados, a baixa diversidade genética em nível populacional e a falta de diferenciação genética entre a maioria das populações comparadas são compatíveis com um processo distribuição antrópico para Z. verticillatum. No entanto, com base nos resultados obtidos durante esta pesquisa, não é possível inferir um possível centro de dispersão ou local de origem para a espécie. / Zoobotryon verticillatum (delle Chiaje, 1822) is a cosmopolitan bryozoan largely distributed in tropical and temperate waters of all oceans. With limited natural dispersal capabilities, it is reasonable to suppose that the taxon is a complex of cryptic species or a widespread species due to anthropogenic activity. In order to elucidate this question, analyses of two mitochondrial genes, cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) and ribosomal RNA subunit (16S) were conducted. Phylogenetic data supported the monophyletism of Z. verticillatum and, together with the population analysis, indicated that it is one species with worldwide distribution. The absence of geographical structure in the haplotype networks, the majority absence of dichotomous relationships, and highly supported clades (pp >= 5%) in phylogenetic trees, the lack of significance in the D test and Fs statistics, the low genetic diversity at the population level and the lack of genetic differentiation between most of the population comparison are consistent with anthropogenic introduction process for Z. verticillatum. However, based on the results obtained during this study, it is not yet possible to infer the center of dispersion for the species.

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-02-15T17:53:16Z No. of bitstreams: 2 Adam Souza de Alencar Leão.pdf: 2611223 bytes, checksum: cd2daf2bf8565d02d484dba67f31b189 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-15T17:53:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Adam Souza de Alencar Leão.pdf: 2611223 bytes, checksum: cd2daf2bf8565d02d484dba67f31b189 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2009-08-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The pirarucu (Arapaima gigas) is one of the largest freshwater fishes of the world; it can grow to up to 3 meters, and weight up to 200 kg. It is an economically important fish used as a traditional food source in the Amazon basin. It has suffered a long history of commercial exploitation, which has resulted in various populations with critically low levels of genetic variability. The current work is a population genetic study of this specie with the goal of estimating levels of genetic variability for the principal tributaries of the Amazon River, comparing them to those observed in the main channel of the Amazon River, analyzing if there has been a reduction of genetic diversity in the analyzed localities, and if Arapaima gigas is a genetically structured species. With this goal in mind, 11 microsatellite markers were used due to their high levels of polymorphism and those are sufficiently informative for this type of a study. Average heterozygosity calculated across all loci for each sampling locality varied from 0.32 in Araguaia River to 0.70 in Mamirauá. Considering only localities from the main channel of the Amazon River, observed heterozygosity was 0.45 in Iquitos and 0.70 in Mamirauá. Observed heterozygosities in the tributaries of the Amazon River ranged from 0.32 in the Araguaia River to 0.62 in the Tapajós River. The ANOVA results showed a heterogeneous pattern in the distribution of genetic diversity in Arapaima gigas among all sampled localities, and between localities from the main stream of the Amazon River and its tributaries. On average, however, higher average heterozygosities were observed in the main stream Amazon River compared with tributaries. This pattern could be explained by the main stream Amazon River may be a zone of contact for Arapaima from different regions which could be facilitated by the ebb and flow of várzea waters. AMOVA demonstrated that 76.46% of genetic variance is explained by within individual contrasts, while 20.28% is explained by among locality contrasts. The among locality contrast is consistent with low migration rates of this species. A Bayesian analysis shows that there is population structuring in the form of a gradient along the length of the Amazon basin; this analysis also shows that tributaries do not contain genetically differentiated populations with respect to the main stream of the Amazon River. The observed genetic structuring of Arapaima gigas allows us to divide the Amazon basin in three macro-regions that should be differentially managed due to their genetic particularities; these regions are western Amazon comprising the localities of Iquitos, Letícia, Eirunepé, Mamirauá, Tapauá, Lábrea, Manuel Urbano e Borba; central Amazon comprising the localities of Carauarí, Coarí, RDS Piagaçu-Purus, Manacapuru, Careiro da Várzea, Nhamundá, Santarém (São Miguel Island) and Jacaréacanga; and eastern Amazon and the Araguaia/Tocanins basin comprising the localities of Macapá, Mexiana, Marabá and Bananal Island (Araguaia River). However, the spatial autocorrelation analysis shows that across the length of its distribution, this species is connected by gene flow. We observed a signature of recent population reduction using the M value test in 11 localities of the 20 localities sampled for this study. The most drastic reductions were observed for samples collected in Mexiana Island and in the Araguaia River (Bananal Island). These results should be viewed as an important signal of genetic fragility of Arapaima gigas individuals from these localities. Based on the presented data, it is strongly recommended that one implements a differentiated management and conservation strategy for this species for the three macro-geographic regions of the Amazon basin identified through the genetic particularities of Arapaima gigas in each of these three regions. / O pirarucu (Arapaima gigas) é um dos maiores peixes de água doce do mundo, podendo crescer até 3 metros de comprimento e pesar até 200 quilos. É um peixe de grande importância econômica usado como fonte de alimento pela população tradicional na bacia Amazônica. É marcado por uma longa história de exploração comercial, o que reduziu a variabilidade genética de muitos grupos de indivíduos desta espécie. O presente trabalho reporta um estudo de genética de populações para o Arapaima gigas objetivando estimar níveis de variabilidade genética de espécimes coletados em 20 localidades ao longo da bacia Amazônica e Tocantins/Araguaia, investigar se há existência de estrutura genética e verificar se houve redução populacional. Para isso foram utilizados 11 marcadores microssatélites que devido ao seu elevado polimorfismo atendem às necessidades deste estudo. A heterozigosidade média observada sobre todos os locos para cada localidade amostrada variou de 0,32 para os espécimes coletados no rio Araguaia a 0,70 para para os espécimes coletados em Mamirauá. Considerando apenas localidades da calha principal do rio Amazonas, a heterozigosidade observada foi de 0,45 em Iquitos a 0,70 em Mamirauá. Enquanto que para os tributários da bacia Amazônica amostrados foi verificado 0,32 no rio Araguaia a 0,62, no rio Tapajós. Os resultados da análise de ANOVA, utilizada para testar se há diferenças significativas na distribuição da heterozigosidade observada em relação às localidades amostradas e em relação às amostras coletadas na calha e nos principais tributários da bacia Amazônica, mostraram um padrão heterogêneo na distribuição da variabilidade genética para a referida espécie, sendo que altos e baixos valores são distribuídos de maneira não uniforme entre as localidades amostradas para o presente estudo e foi encontrado um maior valor de variabilidade genética para as amostras coletadas na calha do que nos tributários amostrados. O fato de haver maior variabilidade genética nos indivíduos coletados na calha pode ser devido ao fato de a calha funcionar como um ponto de encontro de Arapaimas de várias localidades, com deslocamento favorecido pelas transgressões e introgressões das águas de várzea. Os resultados de AMOVA demonstram que os grupos analisados no presente estudo encontram-se moderadamente estruturados. Resultado condizente com os hábitos de baixa migração da referida espécie. Os resultados da análise Bayesiana mostram que há estrutura populacional na forma de gradiente ao longo da bacia amazônica, esses resultados também mostram que os rios tributários não comportam populações geneticamente diferenciadas em relação à calha principal. A estruturação genética encontrada para a espécie Arapaima gigas nos permite dividir a bacia Amazônica em três macroregiões que devem ser manejadas de maneira diferenciada devido às suas particularidades genéticas, essas regiões são Amazônia ocidental compreendendo as localidades Iquitos, Letícia, Eirunepé, Mamirauá, Tapauá, Lábrea, Manuel Urbano e Borba; Amazônia central compreendendo as localidades Carauarí, Coarí, RDS Piagaçu- Purus, Manacapuru, Careiro da Várzea, Nhamundá, Santarém (Ilha de São Miguel) e Jacaréacanga; e Amazônia oriental e bacia do Araguaia / Tocantins compreendendo as localidades de Macapá, Mexiana, Marabá e Ilha do Bananal (rio Araguaia). O teste de auto- correlação espacial mostrou que entre toda a amostragem deste estudo há fluxo gênico para a espécie Arapaima gigas. Foi observada redução populacional recente significativa através do teste de Mvalue para 11 das 20 localidades amostradas, sendo que reduções mais drásticas foram observadas para as amostras da Ilha de Mexiana na foz do rio Amazonas e Ilha do Bananal, no rio Araguaia. Esses resultados devem ser vistos como um aviso importante sobre a fragilidade genética dos grupos de Arapaima gigas dessas localidades. Desta forma, com base nos dados apresentados, é fortemente aconselhável que sejam implementados programas de manejo e conservação desta espécie de maneira diferenciada nas três macroregiões da bacia Amazônica, levando em conta as particularidades genéticas da espécie em cada região.