Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2018-09-25T18:06:32Z No. of bitstreams: 1 2013 - Nath?lia Virg?nia da Silva Ribeiro.pdf: 1961349 bytes, checksum: 43e989102153b88ad17a4eefb1e37f9e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-25T18:06:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013 - Nath?lia Virg?nia da Silva Ribeiro.pdf: 1961349 bytes, checksum: 43e989102153b88ad17a4eefb1e37f9e (MD5) Previous issue date: 2013-07-24 / CAPES / The species Jatropha curcas, popularly known as physic nut, belonging to the family Euphorbiaceae, is currently regarded as one of the greatest potential of oil seeds for biodiesel production in the world. However, the knowledge of available genetic variability and productive behavior of the species are still scarce. This work is part of the Breeding Program of Jatropha curcas developed in UFRRJ, and its objective was know some morphological and productive aspects of 10 progenies of physic nut (Jatropha curcas), grown in greenhouse and camp up to 17 months old, selected from female parents belonging to the Germplasm Collection of physic nut (Jatropha curcas) of the Department of Plant Science at the Institute of Agronomy of UFRRJ. It is expected this study provide important information for the continued Breeding Program of the species in UFRRJ. The experiment was installed in October 2011 in greenhouse, and consisted of 10 progenies of physic nut arranged in experimental design randomized blocks with 3 repetitions, and 15 plants by experimental parcel. After 4 evaluation in greenhouse, the plants were transferred to the camp, here were done 6 evaluation, the last being in April 2013. In the greenhouse it was evaluated aspects related to the germination of the progeny and the behavior of young plants. In the first case, it was estimated germination itself progenies and the index of germination speed (IGS), and at the second, the size of the petiole (SMP), number, width and length of fully developed leaves, respectively, discriminated as NDL, WDL and LDL, insertion angle of the leaf (IALs), length relationship and width of leaf (LWL), height of young plants (HYP), stem diameter (SDI) and branches number (BNU). The obtained data were submitted to analysis of variance, mean test via DMS-t and correlation analysis. The coefficient of genotypic determination (H2), of genotypic variation (CVg) and experimental variation (CVe) were also estimated, and variation index (VIg). The mean germination percentage for Jatropha curcas species was 68,23%, and the mean index germination speed was of 8,60 seeds germinated per day. The progeny that reached higher percentage of gemination and higher germination speed were UFRRJ/PM05 (83,33 and 3,12) and UFRRJ/PM01 (83,33 and 3,38). Whereas the progenies UFRRJ/PM10 and UFRRJ/PM04 were the ones with the lowest percentage of germination and germinated more slowly. In the greenhouse was no statistically significant difference between treatments for the variables SMP, NDL, SDI, HYP, BNU, LDL, WDL. Only for LWL and IALs not statistical difference was detected signficativa. In the camp, it was evaluated variables related to morphological and productive. The morphological variables were: insertion angle of the leaf (IALs), height of young plants (HYP), stem diameter (SDI), of branches number (BNU) and the size of the petiole (SMP). Variables related to aspects of production were: fruit number (FNU), average fruit weight (AFW), fruit length (FRL), fruit width (FRW), weight of fruit of the crop (WFC), weight of dries seeds (WDS), seeds number per fruit (SNF=SNU/FNU), seeds number (SNU), seed length (SEL), seed width (SEW), average seed weight (ASW=GPR/SNU) and grain production (GPR= SNUxASW). All data obtained for each stage of treatment in this study were submitted to analysis of variance, mean test way DMS-t and correlation analyzes. Only for the variables related to morphological aspects considered the effect of season in the ANOVA. Were also estimated the coefficient of genotypic determination (H2), genotypic variation (CVg) and experimental variation (CVe), and the variation index (IVg). All variables (morphological and production) were subjected to regression analysis over the 6 collection periods. Was also estimated genetic the following parameters: genetic variance (?2g), additive variance (?2a), heritability of family means, within family, stratified mass and mass in the experiment. The estimation of genetic parameters was based on the last review performed in the experiment, not considering, therefore, the season effect. From previously mentioned analysis it was observed that all the variables related to morphological aspects showed statistically significant differences between treatments. As for variables related to production only FRW, AFW, SEL and ASW no statistically significant difference. Characters related to leaf morphology showed low coefficients of determination and variation index, while the latter parameters were higher for the variables HYP (83,24 e 0,64) e BNU (80,92 e 0,59), respectively, evaluated in plants in a greenhouse. Progenies with the highest mean branches number were UFRRJ/PM07 (0,49) and UFRRJ/PM08 (0,47). In the camp, the BNU variable had the highest coefficient of genotypic determination (84,16) and variation index (0,54) again. Variables SDI, HYP, IALs and BNU showed a linear behavior over the following months, only exception to IALs variable studied in the progeny UFRRJ/PM 10. Variable SMP proved oscillating in all progenies during the months evaluated. Regarding the variables related to production, the progeny had a different behavior between them. Therefore, the selection of these variables are not indicated when you want to increase grain production in physic nut. Only when considering the quantitative variables is that selection for increased production becomes more effective, for example, the selection of the seeds number. The variable branches number (BNU) was positively correlated with almost all variables in the greenhouse and all related to the production characteristics analyzed in the camp, therefore, this variable can be used in precocious selection for increased production in physic nut. The progenies UFRRJ/PM08 and UFRRJ/PM01 were the most promising in respect of seed production, but, evaluation over the years are still needed, as the plants of the experiment were evaluated in still too early to age, and then, physiological and experimental aspects may be being even more important than genetic factors. / A esp?cie Jatropha curcas, popularmente conhecida como pinh?o manso, pertencente ? fam?lia Euphorbiaceae, ? considerada atualmente como uma das oleaginosas de maior potencial para a produ??o de biodiesel no mundo. No entanto, o conhecimento da variabilidade gen?tica dispon?vel e o comportamento produtivo da esp?cie ainda s?o escassos. O presente trabalho ? parte do Programa de Melhoramento Gen?tico de Jatropha curcas desenvolvido na UFRRJ, e teve como objetivo conhecer alguns aspectos morfol?gicos e produtivos de 10 prog?nies de pinh?o-manso (Jatropha curcas), cultivadas em casa de vegeta??o e campo at? aos 17 meses de idade, selecionadas a partir de genitores femininos pertencentes ? Cole??o de Germoplasma de pinh?o-manso (Jatropha curcas) do Departamento de Fitotecnia do Instituto de Agronomia da UFRRJ. Espera-se com este trabalho fornecer informa??es importantes para a continuidade do Programa de Melhoramento da esp?cie na UFRRJ. O experimento foi instalado em outubro de 2011 em casa de vegeta??o, e foi composto por 10 prog?nies de pinh?o-manso dispostas em delineamento em blocos ao acaso com 3 repeti??es, e 15 plantas por parcela experimental. Ap?s 4 avalia??es em casa de vegeta??o, as plantas foram transferidas para o campo, onde foram realizadas 6 avalia??es, sendo a ultima no m?s de abril de 2013. Em casa de vegeta??o avaliou-se aspectos relacionados ? germina??o das prog?nies e o comportamento das plantas jovens. No primeiro caso, estimou-se a germina??o propriamente dito das prog?nies e o ?ndice de velocidade de germina??o (IVG), e no segundo, o tamanho do pec?olo (TMP), n?mero, largura e comprimento de folhas completamente desenvolvidas, respectivamente, discriminados como NFD, LAF e COF, ?ngulo de inser??o da folha (AIFc), rela??o comprimento e largura de folha (CLF), altura de plantas (APJ), di?metro de caule (DIC) e n?mero de ramos (NDR). Os dados obtidos foram submetidos a an?lises de vari?ncia, teste de m?dia via DMS-t e an?lise de correla??o. Tamb?m foram estimados os coeficientes de determina??o genot?pico (H2), de varia??o genot?pico (CVg) e de varia??o experimental (CVe), e o ?ndice de varia??o (IVg). A porcentagem m?dia de germina??o para a esp?cie Jatropha curcas foi de 68,23%, e o ?ndice m?dio de velocidade de germina??o foi de 8,60 sementes germinadas por dia. As prog?nies que atingiram maiores percentuais de gemina??o e maior velocidade de germina??o foram a UFRRJ/PM05 (83,33 e 3,12) e UFRRJ/PM01 (83,33 e 3,38). Enquanto que as prog?nies UFRRJ/PM10 e UFRRJ/PM04 foram as que apresentaram os percentuais de germina??o mais baixos e germinaram mais lentamente. Em casa de vegeta??o houve diferen?a estat?stica significativa entre os tratamentos para as vari?veis TMP, NFD, DIC, APJ, NDR, COF, LAF. Apenas para CLF e AIFc n?o se detectou diferen?a estat?stica signficativa. No campo, avaliou-se vari?veis ligadas aos aspectos morfol?gicos e produtivos. As vari?veis morfol?gicas analisadas foram: ?ngulo de inser??o da folha (AIFc), altura de plantas (APJ), di?metro de caule (DIC), n?mero de ramos (NDR), tamanho m?dio de entren? (MECc). As vari?veis relacionadas aos aspectos de produ??o foram: n?mero de frutos (NFR), peso m?dio do fruto (PFR), comprimento do fruto (CFR), largura do fruto (LFR), peso de frutos da colheita (PFC), peso de sementes secas (PMSs), n?mero de sementes por fruto (NSF = NSE/NFR), n?mero de sementes (NSE), comprimento da semente (CMS), largura da semente (LSE), peso m?dio de sementes (PMS=PSP/NSE) e produ??o de gr?os (PGP=NSExPMS). Todos os dados obtidos para cada tratamento nesta etapa do trabalho foram submetidos ?s an?lises de vari?ncia, teste de m?dia via DMS-t e an?lises de correla??o. Apenas para as vari?veis ligadas aos aspectos morfol?gicos considerou-se o efeito de ?poca na anova. Foram estimados tamb?m os coeficientes de determina??o genot?pico (H2), de varia??o genot?pico (CVg) e de varia??o experimental (CVe), e o ?ndice de varia??o (IVg). Todas as vari?veis (morfol?gicas e de produ??o) foram submetidas a an?lises de regress?o ao longo das 6 ?pocas de coleta. Estimou-se tamb?m os seguintes par?metros gen?ticos: vari?ncia gen?tica (?2g), vari?ncia aditiva (?2a), herdabilidades entre m?dias de fam?lias, dentro de fam?lia, massal estratificada e massal no experimento. A estimativa dos par?metros gen?ticos foi com base na ?ltima avalia??o realizada no experimento, n?o considerando, portanto, o efeito de ?poca. A partir das an?lises anteriormente citadas observou-se que todas as vari?veis ligadas aos aspectos morfol?gicos apresentaram diferen?a estat?stica significativa entre os tratamentos. Quanto as vari?veis relacionadas ? produ??o apenas LFR, PFR, CMS, e PMS n?o apresentaram diferen?a estat?stica significativa. Caracteres relacionados ? morfologia da folha apresentaram baixos coeficientes de determina??o e ?ndice de varia??o, enquanto que estes mesmos par?metros foram altos para as vari?veis APJ (83,24 e 0,64) e NDR (80,92 e 0,59), respectivamente, avaliados em plantas em casa de vegeta??o. As prog?nies que apresentaram as maiores m?dias do n?mero de ramos foram as UFRRJ/PM07 (0,49) e UFRRJ/PM08 (0,47). No campo, a vari?vel NDR apresentou novamente o maior coeficiente de determina??o genot?pico (84,16) e ?ndice de varia??o (0,54). As vari?veis DIC, APJ, AIFc e NDR apresentaram um comportamento linear ao passar dos meses, exce??o apenas para a vari?vel AIFc estudada na prog?nie UFRRJ/PM 10. A vari?vel MECc mostrou-se oscilante em todas as prog?nies durante os meses avaliados. Em rela??o ?s vari?veis ligadas ? produ??o, as prog?nies tiveram um comportamento diferenciado entre si. Todas as vari?veis ligadas aos aspectos morfol?gicos da semente (largura, comprimento e peso m?dio) apresentaram baix?ssima ou nenhuma variabilidade gen?tica entre as prog?nies estudadas. Portanto, a sele??o sobre estas vari?veis n?o s?o indicadas quando se deseja o aumento da produ??o de gr?os em pinh?o-manso. Apenas quando se considera vari?veis de natureza quantitativa ? que a sele??o para o aumento de produ??o torna-se mais efetiva, como por exemplo, a sele??o sobre o n?mero de sementes. A vari?vel n?mero de ramos (NDR) se correlacionou positivamente com quase todas as vari?veis analisadas em casa de vegeta??o e com todos os caracteres relacionados ? produ??o analisados no campo, assim sendo, essa vari?vel pode ser utilizada em sele??o precoce visando o aumento da produ??o em pinh?o-manso. As prog?nies UFRRJ/PM08 e UFRRJ/PM01 foram as mais promissoras no que se refere a produ??o de sementes, por?m, avalia??es ao longo dos anos ainda s?o necess?rias, visto que as plantas do experimento foram avaliadas em idade ainda muito precoce, e portanto, aspectos fisiol?gicos e experimentais podem estar sendo at? mais importantes do que aspectos gen?ticos.

Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-09-28T19:28:43Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) mariane_rodrigues_ferreira.pdf: 1446137 bytes, checksum: b0c55b008bb6208223dfeaa66f8b1e31 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2017-10-09T14:21:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) mariane_rodrigues_ferreira.pdf: 1446137 bytes, checksum: b0c55b008bb6208223dfeaa66f8b1e31 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-09T14:21:58Z (GMT). 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Os coeficientes de repetibilidade para produ??o de massa seca total (MST), massa seca foliar (MSF), massa seca do colmo (MSC), porcentagem de folhas (%F), porcentagem de colmo (%C), foram estimados por meio de quatro m?todos: an?lise de vari?ncia (ANOVA), an?lise estrutural com base na m?dia dos coeficientes de correla??o (AECOR), an?lise de componentes principais com base na matriz de covari?ncia (CPCOV) e na matriz de correla??es (CPCOR). Para o estudo da estabiliza??o genot?pica, utilizaram-se os coeficientes estimados pela ANOVA e CPCOR. Para a avalia??o das caracter?sticas morfog?nicas foram estimadas: taxa de aparecimento foliar (TAPF), filocrono (FIL), taxa de alongamento foliar (TALF), taxa de senesc?ncia foliar (TSF), comprimento final da l?mina (CFL), n?mero de folhas vivas (NFV), dura??o de vida das folhas (DVF), taxa de alongamento de pseudocolmo (TALC), n?mero m?dio de perfilhos (NMP), rela??o l?mina:colmo (RLC). Para MST, foram observados coeficientes de repetibilidade variando entre 0,3500 e 0,4300 pelos m?todos da ANOVA e CPCOR, respectivamente. Altos coeficientes de repetibilidade tamb?m foram encontrados para a caracter?stica MSF. Baixos coeficientes de repetibilidade foram observados para %F e %Ce rela??o l?mina:colmo. Para estabiliza??o genot?pica da MST, os melhores coeficientes foram observados para a combina??o entre os cortes 6 a 7 e entre os cortes 5 a 8, enquanto os menores coeficientes foram observados quando se utilizaram apenas os cortes 3 a 4 e de 1 a 2, em ambos os m?todos. Para a rela??o l?mina:colmo, os melhores coeficientes foram registrados para os cortes 6 a 7 pelo m?todo da ANOVA, e 1 a 2 pelo m?todo CPCOR. De maneira geral, a combina??o entre os cortes de 6 a 7, tamb?m proporcionou maior repetibilidade e determina??o, otimizando a estabiliza??o dos gen?tipos para as massas e porcentagens de folha e de colmo. No estudo dos par?metros gen?ticos e agrupamento, foi observado que somente as caracter?sticas TALF, CFL e RLC tiveram o componente vari?ncia gen?tica significativo. Apesar disto, as caracter?sticas TALC, NFV, apresentaram coeficientes de varia??o genot?picos (CVg) superiores aos coeficientes de varia??o residual ou ambiental (CVe). As caracter?sticas TAPF, FIL, DVF e TSF apresentaram valores abaixo da unidade para a raz?o CVg/CVe. Alta raz?o CVg/CVe foi observada para as caracter?sticas RLC, NFV, TALC, TALF, CFL, sendo os maiores coeficientes foram registrados para RLC. Ap?s o agrupamento, constatou-se a forma??o de cinco grupos morfofuncionais. Os grupos que apresentaram maiores valores de TALF foram os grupos 3, 5 e 1 com valores superiores ? m?dia geral de todos os gen?tipos avaliados. Enquanto o grupo 4 obteve menor desempenho para esta caracter?stica. Para a TALC o grupo 2 se destacou, seguido pelo grupo 5. Dentre todos os grupos a maior RLC constada foi para o grupo 4 e para CFL o grupo 3. Conclui-se que os m?todos que proporcionaram os melhores coeficientes de repetibilidade de determina??o foram os dos componentes principais com base na matriz de correla??o e de covari?ncia. Para a estabiliza??o genot?pica, os melhores coeficientes de repetibilidade e determina??o s?o observados para os cortes realizados no segundo per?odo das ?guas. As caracter?sticas TALF, CFL e RLC apresentam variabilidade gen?tica significativa, e as caracter?sticas TAPF, FIL, DVF e TSF apresentam baixa raz?o CVg/CVe e necessitam de maior controle ambiental. Os grupos 3, 5 e 1, apresentam altas taxas de alongamento de folha como mecanismo de ac?mulo de forragem. J? o grupo 4 se destaca pela capacidade de perfilhamento. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2017. / The objective was to evaluate the coefficient of repeatability of the agronomic traits and to estimate the breeding value of morphogenic characteristics to stablish morphofunctional groups in the clustering analysis of Tocher in Panicum maximum genotypes. The repeatability coefficients were estimated by four methods: analysis of variance (ANOVA), structural analysis based on the correlation matrix (EACOR), principal component analysis based on the variance and covariance?s matrix (PCCOV) and principal component analysis based on the correlation matrix (PCCOR). To the genotypic stabilization study, the ANOVA and PCCOR were used. To the morphogenic evaluation, the characteristics were estimated: leaf appearance rate (LAR), phillochron (PHC), leaf elongation rate (LER), leaf senescence rate (LSR), number of live leaves (NLL), leaf life spam (LLS), leaf final length (LFL), stem elongation rate (SER), average number of tillers (ANT) and leaf:stem ratio (LSR). To total dry matter were observed repeatability coefficients ranging from 0.3500 to 0.4300 by the ANOVA and PCCOR methods, respectively. High coefficients of repeatability were estimated to leaf dry mass too. Low coefficients of repeatability were observed to percentage of leaves, stems and leaf:stem ratio. In the genotypic stabilization of total dry mass the higher coefficients were observed between the 6 and 7th harvest and between the 5 and 8th harvest, while the lowest coefficients were observed when the harvests 3 to 4 and 1 to 2 were considered in both methods. To leaf:stem ratio the higher coefficients were observed to harvests between 6 and 7 in the ANOVA method and 1 to 2 in the PCCOR method. In general, the combination between the 6 and 7th harvests also improves the repeatability and determination coefficients, optimizing the stabilization of the genotypes to dry mass and percentage of leaf and stems. In the study of genetic parameters and clustering, were observed significant effect to genetic variance component only to LER, LFL and LSR. In spite of this the characteristic SER and NLL had CVg higher than CVr. The characteristics LAR. PHC, LLS and LSR had CVg/CVr above the unity. High CVg/CVr ratio were observed to LSR, NLL, SER, LER and LFL, so that the highest coefficient observed to LSR. After the clustering analysis was found five morphofunctional groups. The groups with higher LER were 3, 5 and 1 with breeding values above the general mean. The group 4 had lowest LER. The groups 2 and 5 had the highest SER and the highest LSR was observed to the group 4. The group 3 showed high LFL. It was possible to conclude that the total and leaf dry mass have higher coefficient of repeatability, indicating better accuracy in the identification of the superior genotypes of P. maximum. In the genotypic stabilization, the higher coefficient and determination were observed to the harvests realized in the rainy period. The morphogenic characteristics that have the highest genetic variance have more possibility of gains with the selection and the traits with low CVg/CVr ratio need more environmental control. The groups 3, 5 and 1 have high potential to forage production duly its high leaf elongation rate.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2016-10-19T11:04:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alex Leonardo Tosta - 2014.pdf: 2466765 bytes, checksum: 244fe49c8fdc9852a7fbf54d5cee5710 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2016-10-19T16:10:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alex Leonardo Tosta - 2014.pdf: 2466765 bytes, checksum: 244fe49c8fdc9852a7fbf54d5cee5710 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-19T16:10:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alex Leonardo Tosta - 2014.pdf: 2466765 bytes, checksum: 244fe49c8fdc9852a7fbf54d5cee5710 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-06-06 / The development of more adapted genotypes to water stress conditions and/ or more efficient water use is a priority that begins to be sought in different programs of genetic improvement of plants. Thus, knowledge of methodologies to be used in breeding programs to produce genotypes more tolerant to water stress conditions and more efficient water use is of paramount importance to this alternative to be viable. Based on the above, the objective was to study the response of onion genotypes to different levels of soil water that help the selection of plants with tolerance to drought and/ or which are more efficient in water use. We evaluated the effect of five levels of water deficit (100, 80, 60, 40 and 20% of ETc ) in eight genotypes of onion (“TX 08” , “Vale Ouro IPA – 11”, “BRS 367” , “Primavera”, “Optima F1”, “Franciscana IPA – 10” , “CNPH 6179org” and “Alfa Tropical”). The irrigations were performed whenever the strain of the soil water in treatments with 100% of ETc reached the critical soil water tension of 10 kPa. The design was used in a randomized block design (RBD) with five replications in a factorial 5 x 8 (blades x genotypes ) . Each experimental unit corresponded to a 10-liter vessel with 6 onion plants. The TX08 and IPA-10 genotype showed potential for use in breeding programs to drought tolerance, because their moderate sensitivity to drought, high water use efficiency and high productivity / O desenvolvimento de genótipos mais adaptadas às condições de estresse hídrico e/ou mais eficientes no uso de água é uma prioridade que começa a ser buscada em diferentes programas de melhoramento genético de plantas. Sendo assim, o conhecimento de metodologias para serem utilizadas em programas de melhoramento destinados a produção de genótipos mais tolerantes a condições de estresse hídrico e mais eficientes no uso de água é de suma importância para que esta alternativa se viabilize. Com base no exposto, objetivou-se estudar a resposta de genótipos de cebola a diferentes níveis de estresse hídrico que auxilie a seleção de genótipos com maior tolerância ao déficit hídrico e/ou que sejam mais eficientes no uso de água. Avaliou-se o efeito de cinco níveis de déficit hídrico (100, 80, 60, 40 e 20% da ETc) em oito genótipos de cebola (“TX 08”, “Vale Ouro IPA-11”, “BRS 367”, “Primavera”, “Optima F1”, “Franciscana IPA-10”, CNPH 6179org e “Alfa Tropical”). Foi empregado o delineamento em blocos casualizados (DBC), com cinco repetições em esquema fatorial 5 x 8 (lâminas x genótipos). Cada unidade experimental correspondeu a um vaso de 10 litros com 6 plantas de cebola. As irrigações eram realizadas sempre que a tensão de água no solo, avaliada por tensiômetros, atingia de 10 kPa nos tratamentos com 100% da ETc. O genótipo TX08 e IPA-10 demonstraram potencial para serem utilizados em programas de melhoramento visando tolerância a seca, pois apresentam moderada sensibilidade ao déficit hídrico, alta eficiência no uso de água e alta produtividade.

Os marcadores microssatélites por serem de natureza codominante e multialélica tornam-se ideais para a caracterização, mapeamento e seleção assistida. Os locos microssatélites disponíveis têm sido utilizados efetivamente na caracterização de acessos de bananeira (Musa), porém muitos deles têm se mostrado com baixa eficiência de amplificação. Neste sentido, os objetivos deste trabalho foram: desenvolver novos locos de microssatélites, caracterizar 224 acessos de bananeira do banco de germoplasma da Embrapa em relação à ploidia e constituição genômica empregando abordagens moleculares e estabelecer relações genéticas entre eles. Foram desenvolvidos 50 novos locos de microssatélites dos quais 44 foram polimórficos entre os acessos analisados. Para a caracterização da ploidia dos acessos foi utilizado a citometria de fluxo, e para a definição da composição genômica foram empregados polimorfismo nos genes ribossomiais nucleares (rDNA) e 16 locos microssatélites, que também serviram para estabelecer as relações genéticas entre os acessos. Além disso, foram sequenciados regiões do rDNA de 17 acessos de bananeira para identificação de polimorfismo de base única (SNP) associados ao genoma A e B. A constituição genômica e/ou ploidia determinada por abordagens moleculares confirmou a classificação previamente estabelecida por descritores morfológicos, com exceção dos acessos Marmelo, Pitogo e Pisang Nangka. As regiões do rDNA sequenciadas permitiram identificar 17 SNPs específicos para M. balbisiana, que poderão ser utilizados para classificar acessos quanto a constituição genômica. A análise de agrupamento derivada da genotipagem dos acessos com 16 locos de microssatélites subdividiu os genótipos de acordo com a ploidia, constituição genômica e subgrupos de bananeira, enquanto que a abordagem empregando o modelo bayesiano corroborou de forma geral com essa categorização. Foi detectada uma ampla heterogeneidade nos acessos diplóides, onde poucos acessos triplóides tiveram sua ancestralidade definida nos grupos dos acessos diplóides. / Microsatellite markers are co-dominant and multiallelic, and the method of choice for genetic characterization, mapping, and assisted selection breeeding. Microsatellite loci have been effectively used to characterize banana (Musa) accessions, but in some cases they have shown low amplification efficiency. Thus, the objectives of this work were to develop new microsatellite loci; to characterize 224 accessions from the Embrapa germplasm collection of banana for ploidy and genomic constitution, as well as to establish genetic relationships among the accessions. Fifty new microsatellite loci were developed, from which 44 were polimorphic. Flow citometry was employed to characterize ploidy, while genomic constitution was determined by polymorphism at the nuclear ribosomal gene (rDNA) and 16 microsatellite loci, also used to establish the genetic relationship among the accessions. Additionally, rDNA regions were sequenced from 17 banana accessions to identify specific single nucleotide polymorphism (SNP) associated with the A or B genome. The genomic constitution and/or ploidy determined by various molecular approaches confirmed the previous classification established by morphological descriptors, except for Marmelo, Pitogo and Pisang Nangka. The sequenced rDNA regions allowed to identify 17 SNPs specific for M. balbisiana, which could be used to classify accessions according to genomic composition. Clustering analysis derived from accession genotyping using 16 microsatellite loci subdivided genotypes according to ploidy, genomic composition and banana subgroups, while the approach using a Bayesian model corroborated in general terms this categorization. A large heterogeneity of the diploid accessions was detected, which restrict the definition of ancestrality of triploid accessions in the diploid accession groups.

Os cloroplastos encontrados nas folhas de plantas e algas pertencem a uma classe de organelas subcelulares denominadas de plastídios. Os plastídios possuem seu próprio genoma (plastoma), o qual contêm genes que participam de funções essenciais no metabolismo vegetal, como fotossíntese, síntese de aminoácidos e outras rotas biossintéticas. O plastoma da maioria das plantas superiores tem tamanho entre 120 a 180 kb. Em angiospermas é caracterizado pela presença de duas regiões repetidas invertidas (IRs) separadas por duas regiões de cópia única; uma longa (LSC) e outra curta (SSC). Para o sequenciamento completo da molécula do DNA (cpDNA) de Eucalyptus grandis, foram preparadas bibliotecas que geraram 9.033 seqüências de DNA. A seqüência completa foi determinada e possui o tamanho de 160.292 pb. As regiões IRs apresentam ter 26.400 pb; a SSC, 18.501 pb e; a LSC, 88.991 pb. As regiões codificadoras foram anotadas por análise de similaridade ao plastoma de Eucalyptus globulus. Todas as categorias gênicas presentes neste plastoma foram encontradas no plastoma de E. grandis. Estas duas espécies possuem 99,57% de similaridade na seqüência de nucleotídeos e apresentam total similaridade na organização dos seus genes. A disponibilidade de plastomas completos de diferentes espécies de Eucalyptus, torna possível realizar estudos comparativos para a identificação de polimorfismos espécie-específicos, importantes para serem utilizados como marcadores moleculares no melhoramento genético de Eucalyptus. / The chloroplasts found in plant leaves and algae belong to a class of subcellular organelle called plastids. The plastids has its own genome (plastome) which contain genes that participate in mainly functions on plant metabolism like photosynthesis, amino acids synthesis and other biosynthetic pathways. The plastome of most of higher plants are between 120-180 kb in size. It is characterized in angiosperms by two inverted repeat regions (IRs) separated by two regions of unique single copies; one large (LSC) and another small (SSC). For the complete sequencing of the DNA (cpDNA) molecule of chloroplast from Eucalyptus grandis, libraries were prepareted and generated 9,033 DNA sequences. The complete sequence was determined and it is 160,292 bp in size. The IRs showed to have 26,400 bp; the SSC, 18,502 bp and; the LSC, 88.991 bp in size. The gene coding regions were annotated by similarity analysis against the Eucalyptus globulus plastome. All types of gene categories present in E. globulus were found in E. grandis plastome. These two species show 99.57% of similarity on nucleotide sequence and they both present total similarity in their gene organization. The availability of complete plastomes from different Eucalyptus species make possible to perform comparative studies to identify species-specific polymorphisms, wich are important to be used as molecular markers in Eucalyptus breeding programs.

Diversos estudos afirmam ser bastante restrita a base genética da soja cultivada, o que gera problemas como falta de variabilidade, fragilidade das cultivares e alcance de um limite de produtividade. O desafio é selecionar dentre o germoplasma quais acessos utilizar em um programa de melhoramento. Este trabalho objetivou analisar a diversidade genética de 79 acessos de soja de diferentes regiões do mundo. Para tanto, foram utilizados marcadores microssatélites genômicos, funcionais e caracteres agromorfológicos. Vinte caracteres agromorfológicos foram avaliados em campo e submetidos a análises multivariadas para a estimação da diversidade genética. A dissimilaridade genética entre os acessos foi calculada pela distância generalizada de Mahalanobis, utilizando-se, a seguir, o algoritmo de otimização de Tocher para o agrupamento dos acessos. A análise de agrupamento resultou em 16 grupos, com cinco deles contendo um só acesso. PIs de mesma origem geográfica foram alocadas no mesmo grupo, com exceções. A primeira variável canônica absorveu 76,99% da variação observada, sendo as características com maior contribuição número de dias para a maturidade e início da granação. A segunda variável canônica absorveu 13,66% e os caracteres de maior peso foram massa de cem sementes e altura de inserção da primeira vagem. A terceira variável canônica absorveu 2,80% da variação, e as características de maior peso foram produtividade de grãos e número de vagens por planta. Isto demonstra que os caracteres ciclo, início da granação e massa de cem sementes são indicados para a análise da diversidade genética em acessos de soja. Todos os 30 locos analisados na genotipagem dos acessos foram polimórficos, sendo encontrados 259 alelos. O número de alelos por loco variou de 2 a 21, com uma média de 8,63. Os acessos analisados possuem uma quantidade bastante significativa de alelos raros, sendo os genótipos 19, 35, 63 e 65 os que apresentaram maior número de alelos exclusivos. A heterozigosidade esperada teve seu maior valor no loco Sat_001 (0,935) e seu menor valor no loco PHYA1 (0,182). A heterozigozidade observada variou de zero a 0,130 (loco Satt308 e loco Satt102, respectivamente). Os acessos 75 e 79, PI 281911 e PI 281907, respectivamente, são os mais similares (0,189) e os acessos 31 (PI 212606 ) e 35 (PI 229358), assim como o 40 (PI 265497) e 78 (438503A) são os mais distintos (0,965). Os dendrogramas oriundos de dados de SSRs, EST-SSRs e caracteres agromorfológicos resultaram em diferenças nos agrupamentos, sendo encontrada baixa correlação por testes de Mantel, mostrando que cada tipo de abordagem acessa diferentemente a variabilidade existente em germoplasma de soja. / Many studies have shown that cultivated soybean has a very narrow genetic basis, which generates some problems such as lack of genetic variability, cultivars vulnerability and achievement of a productivity plateau. The challenge is to select within the germplasm which accessions to use in a breeding program. This study aimed to analyze the genetic diversity of 79 soybean accessions from different regions of the world. For this purpose, genomic and functional microsatellites markers, as well as agromorphological traits, were used. Twenty agromorphological traits were evaluated in field and submitted to the multivariate analyses. The genetic dissimilarity between the accessions was calculated by the generalized distance of Mahalanobis, followed by Tochers algorithm optimization for the grouping of the accessions. The grouping analysis resulted in 16 groups, with five of them containing only one accession. PIs of same geographic origin were placed in the same group, with exceptions. The first canonic variable absorbed 76.99% of the observed variation, being the characteristics with greater contribution number of days to maturity and beginning of grain filling. The second canonic variable absorbed 13.66% and the characters of heavier weight had been mass of one hundred seeds and height of insertion of the first string bean. The third canonic variable absorbed 2.80% of the variation, and the characteristics of heavier weight had been grain productivity and number of string beans per plant. This demonstrates that the characters cycle, beginning of the grain filling and mass of one hundred seeds are indicated for the analysis of the genetic diversity in soybean accessions. All the 30 locus analyzed in the genotyping of the accessions were polymorphic, containing 259 alleles. The number of alleles per locus varied from 2 to 21, with a average of 8,63. The analyzed accessions possess a significant amount of rare alleles, being genotypes 19, 35, 63 and 65 the ones that had presented greater numbers of exclusive alleles. The expected heterozygosity had its highest value in Sat_001 (0,935) and its lowest value in PHYA1 (0,182). The observed heterozygosity varied from zero to 0,130 (Satt308 and Satt102, respectively). Accessions 75 and 79, PI 281911 and PI 281907, respectively, are the most similar (0,189) and accessions 31 (PI 212606) and 35 (PI 229358), as well as accessions 40 (PI 265497) and 78 (438503A) are the most distinct ones (0,9921). The deriving dendrograms from SSRs data, EST-SSRs and agromorphological traits resulted in differences in the groupings, being found low correlation for Mantel tests, showing that each type of approach accesses differently the existing variability in soybean germplasm.

A seleção de genitores para cruzamentos constitui-se em uma das etapas mais importantes em programas de melhoramento genético, pois com isso evita-se o desenvolvimento de populações pouco promissoras. Com o advento dos marcadores moleculares surgiu a possibilidade de predizer o desempenho das populações com base nas distâncias genéticas entre os genitores, mas os resultados disponíveis são contraditórios. O objetivo deste trabalho foi avaliar a possibilidade de predizer a variabilidade de cruzamentos de soja a partir de medidas de distâncias genéticas obtidas com marcadores moleculares AFLP. Foram realizados seis cruzamentos biparentais, entre cultivares recomendados para o Estado de São Paulo, com diferentes graus de distâncias genéticas (DG): baixo (DG£ 0,20), médio (DG@ 0,44) e alto (DG@ 0,65). Para cada cruzamento foram obtidas 100 progênies F2:3, que foram avaliadas em delineamentos em látice simples e parcelas lineares de 2 m espaçadas de 0,5 m, contendo 30 plantas após o desbaste, no ano agrícola de 2007/08. Foram avaliados os caracteres: número de dias para florescimento (DF), altura das plantas no florescimento (AF), número de dias para maturação (DM), altura das plantas na maturação (AM), acamamento (AC) e produção de grãos (PG). Para cada cruzamento foi estimada a variância genética entre progênies ( 2 p ), o coeficiente de herdabilidade entre médias de progênies ( 2 X h ), e a amplitude das médias individuais das progênies ( 3 : 2 F ) para todos os caracteres. Para a produção de grãos (PG) foi estimada ainda a proporção esperada de linhagens superiores (PS) e a heterose (h). Observou-se um aumento na magnitude da variância genética ( 2 p ), do coeficiente de herdabilidade ( 2 X h ) e da amplitude das médias das progênies ( 3 : 2 F ) com o aumento da distância genética (DG), principalmente para PG, DM e AF, evidenciado pelas correlações entre estas estimativas e DG ( = r 0,60 a 1,00). Para os demais caracteres as correlações foram ligeiramente inferiores. Além disso, para PG observou-se também uma correlação alta com a proporção esperada de linhagens superiores ( = r 0,77) e com a heterose ( = r 0,83). Estes resultados indicam claramente um aumento da variabilidade genética com o aumento da distância genética entre os genitores, sendo possível uma seleção prévia de genitores, da ordem de 50%, com base nas distâncias genéticas obtidas com marcadores moleculares AFLP, com o intuito de reduzir o número de populações a ser avaliado. / The selection of parents for crossings is one of the most important steps in plant breeding programs, in order to avoid the development of unfavorable populations. The population performance can be predicted by using genetics distances based on molecular markers, but the reported results are not consistent. Thus, the objective of this work was to investigate the possibility of predicting genetic variability of soybean crosses, based on genetic distances between parents derived from AFLP molecular markers. Six two-way crosses of soybean were performed between cultivars adapted to the state of São Paulo, Brazil, with different levels of molecular genetic distances (DG): low (DG£ 0,20); intermediate (DG@ 0.44) and high (DG@ 0.65). For each cross 100 F2:3 progenies were evaluated in a simple lattice design and plots 2 meter long spaced by 0.5 meter, containing 30 plants after thinning, in the 2007/08 growing season. The following traits were evaluated: days to flowering (DF), plant height at flowering (AF), days to maturity (DM), plant height at maturity (AM), lodging (AC) and grain yield (PG). For each cross the following parameters were estimated: genetic variance among progenies ( 2 p ), heritability among progeny means ( 2 X h ) and amplitude of the individual progeny means ( 3 : 2 F ) for all traits. For grain yield the expected proportion of superior inbred lines (PS) and heterosis (h) were also estimated. It was observed an increasing of genetic variance ( 2 p ), heritability ( 2 X h ) and amplitude of the progeny means ( 3 : 2 F ), with the genetic distance (DG) increasing, mainly for PG, DM and AF, as can be seen by the correlation coefficients between those estimates and DG ( = r 0.60 to 1.00). For the other traits, the correlation coefficients were smaller. Besides, a correlation of DG with the proportion of superior inbred lines ( = r 0.77) and with heterosis ( = r 0.83) were also observed for PG. General results indicate clearly an increasing of genetic variability following the increasing of genetic distances between the parents, and thus, a previous selection of parents of around 50%, based on AFLP genetic distances, is possible, in order to reduce the number of populations to be evaluated.

Este trabalho teve como objetivo estimar a natureza e a magnitude dos parâmetros genéticos, principalmente a heterose dos híbridos F1 e as capacidades geral e específica de combinação em cruzamentos dialélicos parciais de pimentão (Capsicum annuum). Os genitores incluíram dois diferentes grupos de linhagens. O primeiro tem quatro linhagens resistentes ao PVY (AF3267, AF3269, AF3270 e AF3278) e o segundo grupo seis linhagens suscetíveis a esta virose (AF3248, AF3249, AF3252, AF3254, AF3255 e AF3256). Os 24 híbridos obtidos, os dez genitores e o híbrido-padrão Magali-R foram testados em um delineamento de blocos ao acaso, com quatro repetições, em campo aberto, na Estação Experimental da Sakata Seed Sudamérica Ltda, localizada em Bragança Paulista-SP, no período de 18/10/99 a 17/03/00. Cada parcela experimental teve dez plantas totais e cinco plantas úteis. O espaçamento utilizado foi o de 0,50m entre plantas dentro das parcelas e de 1,40m entre as parcelas. Foram avaliados os seguintes caracteres: altura de planta na maturidade (APM), número de dias para o florescimento (NDF), número de dias para a maturidade (NDM), produção de frutos por planta (PFP), número de frutos por planta (NFP), peso médio de fruto (PMF), comprimento de fruto (CF), diâmetro de fruto (DF), espessura de pericarpo de fruto (EP) e número de lóculos por fruto (NL). As análises estatístico-genéticas foram feitas utilizando-se a metodologia de análise dialélica de Gardner & Eberhart (1966) adaptada por Miranda Filho & Geraldi (1984). Os principais resultados foram: 1)Valores significativos de heterose em relação à média dos genitores foram encontrados para os caracteres: altura de planta na maturidade (-13,61 a 7,15%), produção de frutos por planta (até 18,11%), número de frutos por planta (14,22%), peso médio de fruto (até 18,06%), comprimento de fruto (-12,52 a 19,53%), diâmetro de fruto (5,79%), espessura de pericarpo de fruto (até 9,38%) e número de lóculos por fruto (6,11%); 2) Foram obtidos valores significativos de heterose em relação ao genitor resistente ao PVY para os caracteres altura de planta na maturidade (-16,03 a 35,84%), produção de frutos por planta (até 60,21%), número de frutos por planta (até 47,39%) e espessura de pericarpo de fruto (até 18,38%); 3) Ocorreram valores significativos de heterobeltiose para os caracteres peso médio de fruto (até 10,37%), comprimento de fruto (até 15,74%) e diâmetro de fruto (5,60%); 4) Houveram valores significativos de heterose em relação ao híbrido-padrão Magali-R para os caracteres produção de frutos por planta (29,27%), peso médio de fruto (até 25,73%), comprimento de fruto (até -25,28%), diâmetro de fruto (até 23,58%), espessura de pericarpo de fruto (até 32,97%) e número de lóculos por fruto (13,35%); 5) Houve maior predominância dos efeitos gênicos aditivos para os caracteres altura de planta na maturidade, número de dias para o florescimento, produção de frutos por planta, número de frutos por planta, espessura de pericarpo de fruto e número de lóculos por fruto. Os efeitos gênicos não-aditivos foram mais importantes para os caracteres : número de dias para a maturidade; peso médio, comprimento e diâmetro de fruto; 6) Valores significativos das heteroses média, do grupo 2 e específica foram observados para os caracteres : altura de planta na maturidade, peso médio e comprimento de fruto, indicando a contribuição de ambas capacidade geral e específica de combinação. / This research aimed to estimate the nature and magnitude of genetic parameters, mainly the heterosis of F1 hybrids and both general and specific combining ability in a partial diallel crossing system of pepper (Capsicum annuum). The parents included two different groups of lines : the first one has four PVY resistant lines (AF3267, AF3269, AF3270 and AF3278), and the second group of parents has six susceptible lines for this virosis (AF3248, AF3249, AF3252, AF3254, AF3255 and AF3256). The 24 obtained hybrids, the ten parental lines and the check cultivar Magali-R were tested in a randomized block design, with four replications, under field conditions, at Sakata Seed Sudamérica Ltda Research Station, located in Bragança Paulista, state of São Paulo, during the 10/18/99 to 03/17/00 period. Each experimental plot had ten total plants and five useful plants. The spacing used was 0.50m between plants inside the plot and 1.40m between plots. The following characters were evaluated : plant height at maturity (APM), number of days to flowering (NDF), number of days to maturity (NDM), fruit yield per plant (PFP), number of fruits per plant (NFP), average fruit weight (PMF), fruit length (CF), fruit diameter (DF), fruit pericarp thickness (EP) and number of locules per fruit (NL). The statistic-genetical analysis were done by using the methodology of diallel system of Gardner & Eberhart (1966) adapted by Miranda Filho & Geraldi (1984). The main result were: 1) Significant values of heterosis in relation to mid parent values were found out to the characters: plant height at maturity (-13.61 to 7.15%), fruit yield production (up to 18.11%), number of fruits per plant (14.22%), average fruit weight (up to 18.06%), fruit length (-12.52 to 19.53%), fruit diameter (5.79%), fruit pericarp thickness (up to 9.38%) and number of locules per fruit (6.11%); 2) They were obtained significant values of heterosis in relation to PVY resistant parent to the characters plant height at maturity (-16.03 to 35.84%), fruit yield per plant (up to 60.21%), number of fruit per plant (up to 47.39%) and fruit pericarp thickness (up to 18.38%); 3) Significant values of heterobeltiosis occurred to the characters fruit length (up to 15.74%), average fruit weight (up to 10.37%) and fruit diameter (5.60%); 4) There were significant values of heterosis in relation to the standard Magali-R to the characters fruit yield per plant (29.27%), average fruit weight (up to 25.73%), fruit length (up to -25.28%), fruit diameter (up to 23.58%), fruit pericarp thickness (up to 32.97%) and number of locules per fruit (13.35%); 5) There was higher predominance of additive genetic effects to the characters plant height, number of days to flowering, fruit yield per plant, number of fruits per plant, fruit pericarp thickness and number of locules per fruit. The non-additive genetic effects were more important to the characters: number of days to maturity, average weight, length and diameter of fruit; Significant values of medium, from group 2 and specific heterosis were observed to the characters: plant height at maturity, average weight and length of fruit, indicating the contribution of both general and specific combining ability.

Orientadores: Anete Pereira de Souza, Ronan Xavier Corrêa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T14:19:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CerqueiraSilva_CarlosBernardMoreno_D.pdf: 123175108 bytes, checksum: 668158b424ffa91922546922a5837ce2 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O gênero Passiflora, cujas espécies são popularmente conhecidas como maracujazeiros, destaca-se na família Passifloraceae tanto pelo número de espécies (aproximadamente 520) quanto pela importância econômica associada à parte destas espécies. Os maracujazeiros ocorrem em diferentes países, sendo sua diversidade amplamente representada nas Américas, onde a Colômbia e o Brasil se destacam com aproximadamente 170 e 150 espécies de Passiflora, respectivamente. Economicamente os maracujazeiros despertam interesse pela beleza de suas flores, presença de princípios ativos medicinais, extração de óleos essenciais para indústria de cosméticos, produção de frutos para consumo in natura ou produção de derivados. O Brasil se destaca como maior produtor de maracujá, embora a produtividade nacional seja baixa (média de 14 T/ha-1 ano-1), quando comparada ao potencial da passicultura (± 50 T/ha -1 ano-1). Em parte essa baixa produtividade é ocasionada pela ausência de cultivares adaptadas às diferentes regiões produtoras e pela suscetibilidade das cultivares às principais enfermidades que acometem a cultura. Embora crescente, os programas de melhoramento genético do maracujazeiro apresentam resultados modestos frente às demandas existentes. Entre os obstáculos enfrentados pelos melhoristas, está a reduzida representatividade do gênero Passiflora em bancos de germoplasma, bem como a escassez de informações biológicas e agronômicas para maioria dos acessos. Assim, foi objetivo desta tese gerar informações genéticas e moleculares que contribuam para o melhoramento do maracujazeiro. Inicialmente foram construídas revisões críticas relacionadas aos avanços obtidos no melhoramento e na conservação das Passiflora com o uso de marcadores moleculares, bem como a cerca da principal doença que acomete a passicultura (virose do endurecimento dos frutos). Posteriormente foram obtidos, a partir de bibliotecas genômicas enriquecidas de microssatélites, 25, 17 e 52 novos pares de primers para P. cincinnata, P. edulis e P. setacea respectivamente, sendo observado um percentual de locos polimórficos inferior a 30% e um número médio de cinco alelos por loco. Testes de amplificação cruzada foram realizados para 14 espécies de maracujazeiros, sendo observada uma média de 70% de amplificação cruzada. De posse destes marcadores, foi estimada a distância e quantificada a estrutura genética entre 116 acessos (representados por 364 plantas distribuídas em três espécies). A partir dos dados de genotipagem e das análises estatísticas (descritivas, frequentistas e Bayesianas) foi observado baixa diversidade entre os acessos, e níveis moderado a alto de estruturação (com 0,08 ? Gst ? 0,38) e percentuais de alelos privados variando entre 20 e 40% entre os grupos sugeridos pelas estimativas Bayesianas (K=2 para P. cincinnata; K=3 ou 5, para P. edulis, e; K=2 ou 3 para P. setacea). Coleções nucleares representativas para até 100% da diversidade alélica amostrada foram sugeridas. Com base na caracterização de locos microssatélites e na avaliação de sintomas associadas à virose do endurecimento, verrugose e antracnose, observados em 36 acessos de P. edulis (amarelo e roxo), foi possível identificar grupos de acessos a serem priorizados em programas de (pré) melhoramento dedicados ao incremento de resistência em variedades cultivadas. Os resultados obtidos contribuem para o desenvolvimento dos programas de pré-melhoramento e melhoramento genético do maracujazeiro, além de auxiliarem no manejo e na conservação da variabilidade genética do gênero / Abstract: The genus Passiflora, whose species are popularly known as passion fruits, stands out in the family Passifloraceae both by the number of species (about 520) as well as the associated economic importance of some of these species. Passion fruits occur in different countries, with their diversity widely represented in the Americas, where Colombia and Brazil stand out with approximately 170 and 150 species of Passiflora, respectively. Economic interest in passion fruit emerged from the beauty of their flowers, presence of active medicinal principles, extraction of essential oils for cosmetics industry, fruits production for fresh consumption or derivatives production. Brazil is considered the largest producer of passion fruit, although national productivity is low (average 14 T/ha-1 year-1) when compared to passion fruit culture potential (± 50 T/ha -1 year-1). This low productivity is caused in part by the lack of adapted cultivars to the different production regions and due cultivars susceptibility to passion fruit major diseases. Despite an increasing rate, passion fruit breeding programs shows modest results versus existing demands. Among the obstacles faced by breeders, stand out the genus Passiflora reduced representation in germplasm banks, as well as the scarcity of biological and agronomic information for most accessions. Thus, the aim of this thesis was to generate information genetics and molecular that contributes to the passion fruit genetic breeding. Initially, critical reviews related to advances in Passiflora breeding and conservation using molecular markers, as along with information about the main disease affecting the passiculture (passion fruit woodiness disease) were presented. Novel primer pairs for P. cincinnata, P. edulis and P. setacea, in number of 25, 17 and 52 respectively, were subsequently obtained from microsatellite enriched genomic libraries, being observed a less than 30% polymorphic loci and an average number of five alleles per locus. Cross-amplification tests were performed for 14 species of passion fruit and an average of 70% cross-amplification was observed. Using these markers, genetic distance and structure were estimated among 116 accessions (represented by 364 plants distributed among three species). From genotyping and statistical analyzes data (descriptive, frequentist and Bayesian), low genetic diversity among accessions was observed. Also, Bayesian estimated suggested groups (K=2 for P. cincinnata, K=3 or 5 for P. edulis, and, K=2 or 3 for P. setacea) showed moderate to high levels of structuring (0.08 ? Gst ? 0.38) along with private alleles percentage ranging from 20 to 40%. Representative core collections ensuring up to 100% of the sampled allelic diversity were suggested. Based on microsatellite loci characterization and symptoms evaluation of associated woodiness virus, scab and anthracnose, observed in 36 accessions of P. edulis (yellow and purple), it was possible to identify groups of accessions to be prioritized in (pre) breeding programs dedicated to resistance improving in cultivars. These results contribute to the passion fruit pre-breeding and breeding programs development, and assist the genus genetic variability management and conservation / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

A cultura da cana-de-açúcar (Saccharum spp.) possui uma importância histórica e econômica para o Brasil. O agronegócio sucroalcooleiro vem experimentando forte expansão na última década não só no Brasil como também em todo o mundo em função, principalmente, da demanda por fontes de energia menos agressivas ao ambiente. Para atender a uma maior demanda por seus subprodutos, principalmente de etanol, a área cultivada com cana-de-açúcar vem aumentando a cada ano no Brasil, ocupando áreas novas de cultivo nas regiões centrais do país. Nesse contexto, o melhoramento genético tem um papel fundamental no desenvolvimento de novas cultivares adaptadas a essas condições de cultivo. A maioria dos caracteres de importância econômica possui uma natureza genética complexa fazendo com que o desenvolvimento de uma nova cultivar de cana-de-açúcar leve mais de 10 anos. Desta forma, o uso de abordagens que permitam a identificação de genes ou de QTLs associados a caracteres quantitativos de forma precisa e rápida tem grande utilidade no melhoramento dessa espécie. O mapeamento por associação baseado no fenômeno do desequilíbrio de ligação é uma metodologia que visa detectar associações entre genes e caracteres agronômicos, podendo contribuir desta forma para o melhoramento da cana-de-açúcar. Assim, este trabalho teve como principal objetivo avaliar o uso da abordagem de mapeamento por associação na detecção de associações importantes entre marcadores moleculares do tipo SSR e AFLP e os caracteres Altura, Diâmetro e Número de Colmos; Percentual de Fibra na Cana (Fibra % Cana); Porcentagem em massa de sacarose (Pol % cana) e Tonelada de Cana por Hectare (TCH) em cana-de-açúcar. Os dados fenotípicos dos genótipos avaliados são oriundos de experimentos conduzidos em quatro regiões: Ribeirão Preto, Jaú e Piracicaba em São Paulo e Goianésia em Goiás no período entre 1990 e 2009. Associações entre os marcadores e os caracteres fenotípicos foram avaliadas em cada região e em todas simultaneamente. A análise de associação realizada através de modelos mistos sugeriu a existência de doze associações envolvendo os caracteres Número de Colmos, Porcentagem em massa de sacarose (Pol % cana) e Tonelada de Cana por Hectare (TCH). Quatro associações envolveram a característica Número de Colmos sendo três (CIR56, ACG_CGT e AGG_CAG) de caráter geral, ou seja, relacionada à média das quatro regiões e uma associação na região de Goiás (ACG_CAT). Sete associações entre a característica Pol % Cana e as marcas CV60, CV106, AAG_CAC, AAG_CAG e ACG_CTT foram específicas para a região de cultivo de Ribeirão Preto. Uma associação entre Tonelada de Cana por Hectare (TCH) e a marca ACG_CGC foi detectada na região de Piracicaba. / Sugarcane (Saccharum spp.) has an historical and economic relevance in Brazil. We are the largest producer and exporter of sugar and ethanol in the world. Sugar agribusiness has experienced a xx in the last decade not only in Brazil but also around the world as a consequence of increasing demand on renewable and clean sources of energy. As a consequence, the growing area with sugarcane in Brazil is expanding, reaching the central regions of the country. Sugarcane breeding has an important role in developing new cultivars adapted to these new conditions. However, most traits of economic importance in sugarcane have complex genetic architecture making the improvement of new sugarcane cultivars a challenging process. Thus, adoption of strategies that allow for rapid and precise detection of genes associated with quantitative traits is of great interest, representing a valuable tool for sugarcane breeding. Association mapping based on linkage disequilibrium represents a strategy useful for detection of marker-trait associations and may contribute for identifying genes useful for sugarcane breeding. In the present study, association mapping approach was applied to sugarcane in order to evaluate its potential contribution in detecting important associations between SSR and AFLP molecular markers and the characters Height, Diameter and Number of Stalks; % Fiber; % Pol and TCH. Phenotypic data for genotypes were collected from field trials in four locations: Ribeirão Preto, Jaú and Piracicaba in São Paulo and Goianésia in Goiás between 1993 and 2009. Marker-trait associations were tested for each location individually and for all locations simultaneously. A mixed model approach was adopted to test for marker-trait associations. The results suggested the existence of twelve associations involving the characters Stalk Number, % Pol and TCH. Four associations involved stalk number from which three (markers CIR56, ACG_CGT e AGG_CAG) were for all locations and one specific to Goiás (ACG_CAT). Seven associations between % Pol and markers CV60, CV106, AAG_CAC, AAG_CAG e ACG_CTT were detected in Ribeirão Preto. One association between TCH and ACG_CGC was detected in Piracicaba