O conhecimento da herança dos caracteres de interesse é essencial para programas de melhoramento genético. Entretanto, a herança é altamente influenciada pelo ambiente e pela constituição genotípica da população e, assim, o acúmulo de informações é de grande importância para um melhor conhecimento das heranças dos caracteres. A maior parte dos estudos de herança de caracteres quantitativos é baseada em genótipos que não são mais usados em programas de melhoramento. Este trabalho teve como objetivo o estudo da herança da produção de grãos (PG) e dos componentes de produção em soja, isto é, número de vagens por planta (VP), número de sementes por planta (SP) e número de sementes por vagem (SV), em uma população derivada do cruzamento entre os cultivares Embrapa 60 e MG/BR 46, de alta divergência genética. Os genitores e as gerações F1, F2 e os dois retrocruzamentos foram avaliados experimentalmente no ano agrícola de 2007/8 para os quatro caracteres no Departamento de Genética da ESALQ, em Piracicaba, SP. Os dados experimentais foram submetidos às análises genéticas segundo o modelo aditivodominante, proposto por Mather e Jinks. As estimativas da heterose foram positivas para três dos caracteres (PG, VP e SP), e em torno de 50%, em relação à média dos genitores, enquanto que para SV a heterose foi nula. A herdabilidade entre plantas foi mediana para os componentes da produção (entre 33% e 42%) e baixa para PG (16%). As estimativas das variâncias aditivas foram sempre superiores às da variância dominante, de forma que os graus médios de dominância para todos os caracteres foram em torno de 1,0 (0,96 a 1,21), indicando a ocorrência de dominância completa para os caracteres avaliados. / The knowledge of inheritance of traits is very important for breeding purposes. However, the inheritance is highly influenced by the environment and the genotypic composition of the population and thus, the accumulative information of estimates is very important for a better knowledge of the inheritance of quantitative traits. Most of the studies of inheritance of quantitative traits in soybeans are based on populations which nowadays have no more interest in soybean breeding programs. The objective of this study was to investigate the inheritance of grain yield (PG) and yield components in soybeans, i.e., number of pods per plant (VP), number of seeds per plant (SP), and number of seeds per pod (SV), in a population derived from two genetically divergent soybean cultivars: Embrapa 60 and MG/BR 46. The parents, F1, F2 and two backcross generations were evaluated in the 2007/8 growing season for the four traits, at the Department of Genetics (ESALQ), in Piracicaba, SP. Experimental data were submitted to genetic analyses according to the additive-dominant model proposed by Mather and Jinks. Heterosis estimates were positive for three out of four traits (PG, VP, SP), with magnitudes around 50%, based on the parent means, while for SV heterosis was null. The heritability estimates on a plant basis were medium for yield components (between 33% and 42%) and low for PG (16%). Additive variance estimates were always higher than the dominance estimates, and the degree of dominance (gmd) for all the traits were around 1.0 (0.96 to 1.21), indicating the occurrence of complete dominance for the traits assessed.

O objetivo do presente trabalho foi definir os objetivos de seleção e estimar os valores econômicos para característica de importância econômica em um sistema de bovinos de corte criados em regime de ciclo completo, além de estimar os parâmetros genéticos para características produtivas, reprodutivas e de qualidade de carcaça avaliadas no programa de seleção Nelore Brasil. O desenvolvimento do modelo bioeconômico foi realizado considerando as informações do sistema de produção e dos parâmetros biológicos com objetivo de estabilizar o rebanho e calcular o número de animais em cada categoria, obter as informações de desempenho produtivo e econômico (receita e despesas) do sistema pecuário, e por fim a obtenção dos valores econômicos das características contidas no objetivo de seleção em sistema de ciclo completo, que para tal, foram utilizadas planilhas interligadas do programa Microsoft Excel®. Os valores econômicos foram estimados simulando o aumento de 1% no valor da característica do objetivo de seleção, mantendo as demais constantes. A estimação dos parâmetros genéticos foi pelo método de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) usando o modelo animal, utilizando o software WOMBAT e o ganho genético anual para as características de reprodução, carcaça e desenvolvimento ponderal foi estimado pela regressão linear do valor genético (VG) em função do ano de nascimento. O modelo bioeconômico foi eficaz na estimação das fontes de receitas e despesas do sistema de produção e os valores econômicos estimados seguindo a ordem de importância para o ciclo completo foram R$ 3,69 para peso ao abate de macho (PAM), R$ 3,63 para peso a desmama de macho (PDM), R$ 3,58 para taxa de desmama (TD), R$ 3,40 para peso ao abate de fêmea (PAF), R$ 2,30 para peso a desmama de fêmea (PDF) e R$ 0,13 para peso ao adulto de vaca (PAV). Portanto, o PAM foi à característica de maior impacto no sistema de produção, porém, todas promoveram retorno econômico positivo com exceção do PAV que foi praticamente nulo. As estimativas de herdabilidade para as características de produção, reprodução e qualidade de carcaça foram favoráveis ao progresso genético por seleção direta. As correlações estimadas demonstram que machos com maior perímetro escrotal tendem a ser mais pesados e esses apresentarem maior rendimento e acabamento da carcaça. O processo de Resumo 13 seleção empírica utilizado pelo programa Nelore Brasil está sendo eficiente, de acordo com os resultados positivos dos progressos genéticos nas estimativas de tendência. Portanto todas as características avaliadas no sistema de ciclo completo tiveram importância econômica positivas, indicando que o processo de seleção trariam aumentos de lucratividade e as avaliadas geneticamente poderiam ser incluídas como critério de seleção contribuindo com a maximização da resposta esperadas para as características do objetivo de seleção. / The objective of this study was to define the objectives of selecting and estimating economic values for characteristics of economic importance in a system of beef cattle raised in fullcycle scheme. We also aimed to estimate the parameters for genetic reproductive and productive characteristics of carcass quality evaluated in the breeding program Nellore Brazil. The bio-economic model was developed considering the information and production system of biological parameters to stabilize the herd and calculate the number of animals in each category, obtain information on economic performance (revenue and expenses) of the livestock system, and finally to obtain economic values of the characteristics contained in the objective of selection in full-cycle system. We used interlinked spreadsheets in the Microsoft Excel®. The economic values were estimated by simulating the increase of 1% for the value of the characteristic of objective selection, keeping the others constant. The estimation of genetic parameters was obtained by the method of Restricted Maximum Likelihood (REML) using the animal model in the WOMBAT software and genetic gain for annual breeding characteristics; weighted carcass and development were estimated by linear regression of genetic value (GV) depending on the year of birth. The bio-economic model was effective in estimating revenue and expenditure sources of the production system and the estimated economic values, following the order of importance for the complete cycle, were R$ 3.69 for slaughter weight of male (SWM), R$ 3.63 for weaning weight of male (WWM), R$ 3.58 for weaning rate (WR), R$ 3.40 for the slaughter weight of female (SWF), R$ 2.30 for weaning weight of female (WWF) and R$ 0.13 for adult cow weight (ACW). Therefore, SWM had the greatest impact on the production system, however, all aspects promoted positive economic return with the exception of ACW, which was practically null. Heritability estimates for production, reproduction and carcass characteristics and quality were favorable to genetic progress for direct selection. The estimated correlations demonstrate that males with larger scrotal perimeter tend to be heavier and have higher carcass yield and finishing. The empirical selection process used by the program Brazil Nellore is efficient, according to the positive results of the genetic progress in trend estimates. Therefore, all features evaluated in the fullAbstract 16 cycle system had positive economic importance, indicating that the selection process could bring gains in profitability and the genetically evaluated characteristics could be included as a breeding criterion, contributing to the maximization of the expected response for the traits of interest in breeding programs.

Submitted by Simone Souza (simonecgsouza@hotmail.com) on 2017-08-28T12:39:38Z No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Rebeca Marcos.pdf: 1055560 bytes, checksum: aac5593cf7f7cea41e814e5a2f33b911 (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2017-08-30T12:12:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Rebeca Marcos.pdf: 1055560 bytes, checksum: aac5593cf7f7cea41e814e5a2f33b911 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-30T12:12:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Rebeca Marcos.pdf: 1055560 bytes, checksum: aac5593cf7f7cea41e814e5a2f33b911 (MD5) Previous issue date: 2014-02-19 / CAPES / Objetivou-se acompanhar o desempenho zootécnico, as características morfométricas e analisar o padrão de crescimento dos tambaquis da primeira geração de seleção genética para ganho de peso. O trabalho foi realizado no período de setembro de 2012 a maio de 2013 no município de Santo Antônio de Leverger – Mato Grosso, Brasil. Foram estudadas sete famílias oriundas do programa de melhoramento genético e um grupo controle (sem melhoramento). Todos os animais foram individualizados com microchips. Foram avaliadas e mensuradas as seguintes características: ganho de peso, comprimento total, comprimento padrão, tamanho de cabeça, altura, largura e perímetro do corpo. O experimento seguiu um delineamento inteiramente casualizado e foram avaliados dados coletados durante nove biometrias mensais dos grupos de tambaqui melhorados geneticamente e o controle (sem melhoramento). Para descrever o desempenho zootécnico dos tambaquis, as comparações entre os tratamentos (famílias e controle) usou-se o teste de Dunnett com 5% de significância e para o comportamento do crescimento dos tambaquis utilizou-se o modelo matemático de regressão não linear de Gompertz. Cinco das sete famílias avaliadas (A, B, D, E e G) apresentaram maior peso final, ganho de peso diário e crescimento morfométrico quando comparada ao controle (sem melhoramento). Apenas a família C do programa de melhoramento genético apresentou peso final, ganho de peso diário e as características morfométricas inferiores em relação ao controle (sem melhoramento) e a família F apresentou resultados semelhantes ao controle (sem melhoramento). Os animais melhorados geneticamente apresentaram padrão de crescimento diferente e superior em relação aos animais não melhorados (grupo controle), em se tratando, principalmente do peso assintótico. / Aimed to monitor the production performance, morphometric characteristics and analyze the growth pattern of tambaquis the first generation of genetic selection for weight gain. The study was conducted from September 2012 to May 2013, in Santo Antônio de Leverger - Mato Grosso, Brazil. Seven families from the breeding program and a control group (no improvement) were studied. All animals were individually microchipped. Were evaluated and measured the following characteristics: weight gain, total length, standard length, head size, height, width and perimeter of the body. The experiment followed a completely randomized design and data collected for nine monthly biometrics groups of genetically improved tambaqui and control (no improvement) were evaluated. To describe the production performance of tambaquis, comparisons between treatments (families and control) we used the Dunnett test with 5% significance and the growth behavior of tambaquis used the nonlinear mathematical model of Gompertz regression. Five out of seven families (A, B, D, E and G) had higher final weight, average daily gain and morphometric growth compared to the control (no improvement). Only the C family breeding program presented final weight, average daily gain and lower morphometric characteristics compared to the control (no improvement) and F family presented similar to the control (no improvement) results. Genetically improved animals showed different pattern of growth and higher compared to unimproved animals (control group), in the case, especially the asymptotic weight.

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2015-10-14T22:00:35Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Poliana Regina Carloni Di Prado - 2013.pdf: 1121268 bytes, checksum: de6b8400cf11e9a39e0a3bb61045e84e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-10-16T10:53:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Poliana Regina Carloni Di Prado - 2013.pdf: 1121268 bytes, checksum: de6b8400cf11e9a39e0a3bb61045e84e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-16T10:53:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Poliana Regina Carloni Di Prado - 2013.pdf: 1121268 bytes, checksum: de6b8400cf11e9a39e0a3bb61045e84e (MD5) Previous issue date: 2013-03-13 / The consumption of pepper genus Capsicum is in increasing demand worldwide. However few works have been conducted aiming their utilization in plant breeding research as well as in preserving their genetic patrimonium. The objectives of this work were to estimate the genetic parameters of a pimenta de bode (Capsicum chinense Jacq) population from the Southwest of Goiás as well as to assess gains from selection carried out in that population based on six selection criteria. Twenty seven genotypes and three commercial controls were used and the experiment arranged in a completely randomized bloc design with three replicates and four plants per plot spaced by 1.2 X 0.8 m. The estimated parameters were: genetic variance σ²g, environmental variance σ²e, phenotypic variance σ²g; genetic variance coefficient CVg%, the ratio between the genetic coefficient of variance and the environmental ratio CVg/CVe, and the heritability in broad sense term h2. The criteria used from gains selection were: selection I – shortening the flowering period; II - increase harvested fruit weight in the first harvest; III – increase fruit production; IV – increase 10 fruit weight; V – reduce 10 fruit weight; VI –shorten ripening period The CVg% was above 10% for the majority of the traits tested as well as the CVg/CVe , above 1, indicating the predominance of the genetic traits in relation to the environmental factors; being these traits considered ideal for use in genetic breeding programs. Heritability in broad sense (h2) varied from 54.27 to 99.66%. The selection criteria used presenting gains from selection were I, III, IV and VI, with 10.30, 69.59, 181 and 1.31 % respectively of gains obtained for the selected trait. / O consumo de pimentas, do gênero Capsicum, possui uma crescente demanda em nível mundial. Por outro lado, poucos trabalhos têm sido realizados com a finalidade de preservar o patrimônio genético dessas espécies e também utilização deste em programas de melhoramento genético. Os objetivos deste trabalho foram estimar os parâmetros genéticos de uma população de pimenta de bode (Capsicum chinense Jacq) do sudoeste goiano e os ganhos de seleção realizados nessa população baseados em seis critérios de seleção. Foram utilzados 27 genótipos e 3 testemunhas comerciais, o experimento foi conduzido em blocos casualizados, com três repetições, quatro plantas por parcela e espaçamento de 1.2x0.8m. Os parâmetros estimados foram variâncias genética σ²g, ambiental σ²e, fenotípica σ²f, o coeficiente de variação genético CVg%, a razão entre o coeficiente de variação genético e o ambiental CVg/CVe e a herdabilidade em sentido amplo h2. Os critérios utilizados foram; seleção I: reduzir os dias para florescimento, II: aumentar o peso na primeira colheita, III: aumentar a produção de frutos, IV: aumentar o peso de 10 frutos, V: reduzir o peso de 10 frutos e VI: reduzir os dias para maturação. O CVg% foi acima de 10% para a maioria das características, o CVg/CVe foi acima de 1 para a maioria das características indicando que os fatores genéticos são predominantes em relação aos ambientais. A h2 variou de 54.27 à 99.66%. Os critérios de seleção utilizados que apresentaram ganhos de seleção foram I, III, IV, VI com 10.30, 69.59, 181, 1.31% respectivamente de ganho realizado para característica selecionada.

O objetivo do presente trabalho foi definir os objetivos de seleção e estimar os valores econômicos para característica de importância econômica em um sistema de bovinos de corte criados em regime de ciclo completo, além de estimar os parâmetros genéticos para características produtivas, reprodutivas e de qualidade de carcaça avaliadas no programa de seleção Nelore Brasil. O desenvolvimento do modelo bioeconômico foi realizado considerando as informações do sistema de produção e dos parâmetros biológicos com objetivo de estabilizar o rebanho e calcular o número de animais em cada categoria, obter as informações de desempenho produtivo e econômico (receita e despesas) do sistema pecuário, e por fim a obtenção dos valores econômicos das características contidas no objetivo de seleção em sistema de ciclo completo, que para tal, foram utilizadas planilhas interligadas do programa Microsoft Excel®. Os valores econômicos foram estimados simulando o aumento de 1% no valor da característica do objetivo de seleção, mantendo as demais constantes. A estimação dos parâmetros genéticos foi pelo método de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) usando o modelo animal, utilizando o software WOMBAT e o ganho genético anual para as características de reprodução, carcaça e desenvolvimento ponderal foi estimado pela regressão linear do valor genético (VG) em função do ano de nascimento. O modelo bioeconômico foi eficaz na estimação das fontes de receitas e despesas do sistema de produção e os valores econômicos estimados seguindo a ordem de importância para o ciclo completo foram R$ 3,69 para peso ao abate de macho (PAM), R$ 3,63 para peso a desmama de macho (PDM), R$ 3,58 para taxa de desmama (TD), R$ 3,40 para peso ao abate de fêmea (PAF), R$ 2,30 para peso a desmama de fêmea (PDF) e R$ 0,13 para peso ao adulto de vaca (PAV). Portanto, o PAM foi à característica de maior impacto no sistema de produção, porém, todas promoveram retorno econômico positivo com exceção do PAV que foi praticamente nulo. As estimativas de herdabilidade para as características de produção, reprodução e qualidade de carcaça foram favoráveis ao progresso genético por seleção direta. As correlações estimadas demonstram que machos com maior perímetro escrotal tendem a ser mais pesados e esses apresentarem maior rendimento e acabamento da carcaça. O processo de Resumo 13 seleção empírica utilizado pelo programa Nelore Brasil está sendo eficiente, de acordo com os resultados positivos dos progressos genéticos nas estimativas de tendência. Portanto todas as características avaliadas no sistema de ciclo completo tiveram importância econômica positivas, indicando que o processo de seleção trariam aumentos de lucratividade e as avaliadas geneticamente poderiam ser incluídas como critério de seleção contribuindo com a maximização da resposta esperadas para as características do objetivo de seleção. / The objective of this study was to define the objectives of selecting and estimating economic values for characteristics of economic importance in a system of beef cattle raised in fullcycle scheme. We also aimed to estimate the parameters for genetic reproductive and productive characteristics of carcass quality evaluated in the breeding program Nellore Brazil. The bio-economic model was developed considering the information and production system of biological parameters to stabilize the herd and calculate the number of animals in each category, obtain information on economic performance (revenue and expenses) of the livestock system, and finally to obtain economic values of the characteristics contained in the objective of selection in full-cycle system. We used interlinked spreadsheets in the Microsoft Excel®. The economic values were estimated by simulating the increase of 1% for the value of the characteristic of objective selection, keeping the others constant. The estimation of genetic parameters was obtained by the method of Restricted Maximum Likelihood (REML) using the animal model in the WOMBAT software and genetic gain for annual breeding characteristics; weighted carcass and development were estimated by linear regression of genetic value (GV) depending on the year of birth. The bio-economic model was effective in estimating revenue and expenditure sources of the production system and the estimated economic values, following the order of importance for the complete cycle, were R$ 3.69 for slaughter weight of male (SWM), R$ 3.63 for weaning weight of male (WWM), R$ 3.58 for weaning rate (WR), R$ 3.40 for the slaughter weight of female (SWF), R$ 2.30 for weaning weight of female (WWF) and R$ 0.13 for adult cow weight (ACW). Therefore, SWM had the greatest impact on the production system, however, all aspects promoted positive economic return with the exception of ACW, which was practically null. Heritability estimates for production, reproduction and carcass characteristics and quality were favorable to genetic progress for direct selection. The estimated correlations demonstrate that males with larger scrotal perimeter tend to be heavier and have higher carcass yield and finishing. The empirical selection process used by the program Brazil Nellore is efficient, according to the positive results of the genetic progress in trend estimates. Therefore, all features evaluated in the fullAbstract 16 cycle system had positive economic importance, indicating that the selection process could bring gains in profitability and the genetically evaluated characteristics could be included as a breeding criterion, contributing to the maximization of the expected response for the traits of interest in breeding programs.

O conhecimento da herança dos caracteres de interesse é essencial para programas de melhoramento genético. Entretanto, a herança é altamente influenciada pelo ambiente e pela constituição genotípica da população e, assim, o acúmulo de informações é de grande importância para um melhor conhecimento das heranças dos caracteres. A maior parte dos estudos de herança de caracteres quantitativos é baseada em genótipos que não são mais usados em programas de melhoramento. Este trabalho teve como objetivo o estudo da herança da produção de grãos (PG) e dos componentes de produção em soja, isto é, número de vagens por planta (VP), número de sementes por planta (SP) e número de sementes por vagem (SV), em uma população derivada do cruzamento entre os cultivares Embrapa 60 e MG/BR 46, de alta divergência genética. Os genitores e as gerações F1, F2 e os dois retrocruzamentos foram avaliados experimentalmente no ano agrícola de 2007/8 para os quatro caracteres no Departamento de Genética da ESALQ, em Piracicaba, SP. Os dados experimentais foram submetidos às análises genéticas segundo o modelo aditivodominante, proposto por Mather e Jinks. As estimativas da heterose foram positivas para três dos caracteres (PG, VP e SP), e em torno de 50%, em relação à média dos genitores, enquanto que para SV a heterose foi nula. A herdabilidade entre plantas foi mediana para os componentes da produção (entre 33% e 42%) e baixa para PG (16%). As estimativas das variâncias aditivas foram sempre superiores às da variância dominante, de forma que os graus médios de dominância para todos os caracteres foram em torno de 1,0 (0,96 a 1,21), indicando a ocorrência de dominância completa para os caracteres avaliados. / The knowledge of inheritance of traits is very important for breeding purposes. However, the inheritance is highly influenced by the environment and the genotypic composition of the population and thus, the accumulative information of estimates is very important for a better knowledge of the inheritance of quantitative traits. Most of the studies of inheritance of quantitative traits in soybeans are based on populations which nowadays have no more interest in soybean breeding programs. The objective of this study was to investigate the inheritance of grain yield (PG) and yield components in soybeans, i.e., number of pods per plant (VP), number of seeds per plant (SP), and number of seeds per pod (SV), in a population derived from two genetically divergent soybean cultivars: Embrapa 60 and MG/BR 46. The parents, F1, F2 and two backcross generations were evaluated in the 2007/8 growing season for the four traits, at the Department of Genetics (ESALQ), in Piracicaba, SP. Experimental data were submitted to genetic analyses according to the additive-dominant model proposed by Mather and Jinks. Heterosis estimates were positive for three out of four traits (PG, VP, SP), with magnitudes around 50%, based on the parent means, while for SV heterosis was null. The heritability estimates on a plant basis were medium for yield components (between 33% and 42%) and low for PG (16%). Additive variance estimates were always higher than the dominance estimates, and the degree of dominance (gmd) for all the traits were around 1.0 (0.96 to 1.21), indicating the occurrence of complete dominance for the traits assessed.

A cultura da cana-de-açúcar (Saccharum spp.) possui uma importância histórica e econômica para o Brasil. O agronegócio sucroalcooleiro vem experimentando forte expansão na última década não só no Brasil como também em todo o mundo em função, principalmente, da demanda por fontes de energia menos agressivas ao ambiente. Para atender a uma maior demanda por seus subprodutos, principalmente de etanol, a área cultivada com cana-de-açúcar vem aumentando a cada ano no Brasil, ocupando áreas novas de cultivo nas regiões centrais do país. Nesse contexto, o melhoramento genético tem um papel fundamental no desenvolvimento de novas cultivares adaptadas a essas condições de cultivo. A maioria dos caracteres de importância econômica possui uma natureza genética complexa fazendo com que o desenvolvimento de uma nova cultivar de cana-de-açúcar leve mais de 10 anos. Desta forma, o uso de abordagens que permitam a identificação de genes ou de QTLs associados a caracteres quantitativos de forma precisa e rápida tem grande utilidade no melhoramento dessa espécie. O mapeamento por associação baseado no fenômeno do desequilíbrio de ligação é uma metodologia que visa detectar associações entre genes e caracteres agronômicos, podendo contribuir desta forma para o melhoramento da cana-de-açúcar. Assim, este trabalho teve como principal objetivo avaliar o uso da abordagem de mapeamento por associação na detecção de associações importantes entre marcadores moleculares do tipo SSR e AFLP e os caracteres Altura, Diâmetro e Número de Colmos; Percentual de Fibra na Cana (Fibra % Cana); Porcentagem em massa de sacarose (Pol % cana) e Tonelada de Cana por Hectare (TCH) em cana-de-açúcar. Os dados fenotípicos dos genótipos avaliados são oriundos de experimentos conduzidos em quatro regiões: Ribeirão Preto, Jaú e Piracicaba em São Paulo e Goianésia em Goiás no período entre 1990 e 2009. Associações entre os marcadores e os caracteres fenotípicos foram avaliadas em cada região e em todas simultaneamente. A análise de associação realizada através de modelos mistos sugeriu a existência de doze associações envolvendo os caracteres Número de Colmos, Porcentagem em massa de sacarose (Pol % cana) e Tonelada de Cana por Hectare (TCH). Quatro associações envolveram a característica Número de Colmos sendo três (CIR56, ACG_CGT e AGG_CAG) de caráter geral, ou seja, relacionada à média das quatro regiões e uma associação na região de Goiás (ACG_CAT). Sete associações entre a característica Pol % Cana e as marcas CV60, CV106, AAG_CAC, AAG_CAG e ACG_CTT foram específicas para a região de cultivo de Ribeirão Preto. Uma associação entre Tonelada de Cana por Hectare (TCH) e a marca ACG_CGC foi detectada na região de Piracicaba. / Sugarcane (Saccharum spp.) has an historical and economic relevance in Brazil. We are the largest producer and exporter of sugar and ethanol in the world. Sugar agribusiness has experienced a xx in the last decade not only in Brazil but also around the world as a consequence of increasing demand on renewable and clean sources of energy. As a consequence, the growing area with sugarcane in Brazil is expanding, reaching the central regions of the country. Sugarcane breeding has an important role in developing new cultivars adapted to these new conditions. However, most traits of economic importance in sugarcane have complex genetic architecture making the improvement of new sugarcane cultivars a challenging process. Thus, adoption of strategies that allow for rapid and precise detection of genes associated with quantitative traits is of great interest, representing a valuable tool for sugarcane breeding. Association mapping based on linkage disequilibrium represents a strategy useful for detection of marker-trait associations and may contribute for identifying genes useful for sugarcane breeding. In the present study, association mapping approach was applied to sugarcane in order to evaluate its potential contribution in detecting important associations between SSR and AFLP molecular markers and the characters Height, Diameter and Number of Stalks; % Fiber; % Pol and TCH. Phenotypic data for genotypes were collected from field trials in four locations: Ribeirão Preto, Jaú and Piracicaba in São Paulo and Goianésia in Goiás between 1993 and 2009. Marker-trait associations were tested for each location individually and for all locations simultaneously. A mixed model approach was adopted to test for marker-trait associations. The results suggested the existence of twelve associations involving the characters Stalk Number, % Pol and TCH. Four associations involved stalk number from which three (markers CIR56, ACG_CGT e AGG_CAG) were for all locations and one specific to Goiás (ACG_CAT). Seven associations between % Pol and markers CV60, CV106, AAG_CAC, AAG_CAG e ACG_CTT were detected in Ribeirão Preto. One association between TCH and ACG_CGC was detected in Piracicaba

Dando continuidade aos trabalhos realizados no Departamento de Genética da ESALQ/USP, referentes aos estudos de mapeamento de genes de resistência à bacteriose em maracujá-amarelo, foram realizados dois novos experimentos de inoculação envolvendo uma população obtida a partir do cruzamento entre ‘IAPAR-06’ e ‘IAPAR- 123’, ambos acessos pertencentes ao Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR). Essa população F1, composta de 160 indivíduos, foi utilizada para a construção dos mapas de ligação com base em marcadores AFLP, utilizando tanto marcas com segregação 1:1 quanto marcas bi-parentais 3:1, as quais serviram de ponte para a integração dos mapas construídos para cada genitor. Para a avaliação fenotípica, 104 indivíduos, além dos genitores, foram inoculados por dois isolados de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae, em dois experimentos distintos. Foi constatado que a resistência à bacteriose é poligênica e há, pelo menos, três locos quantitativos (QRL) envolvidos. Testes quanto à metodologia de mensuração das lesões foliares também foram realizados. Foi verificado que, independente da metodologia de avaliação fenotípica, os resultados foram equivalentes quanto ao mapeamento de QRL. De acordo com as diferentes datas de avaliação e/ou idades das folhas, QRL com diferentes efeitos foram detectados ou, até mesmo, QRL foram alocados em diferentes grupos de ligação. Os dados oriundos do presente estudo corroboram resultados obtidos em trabalho anterior envolvendo a mesma população de mapeamento. A utilização de um segundo isolado bacteriano possibilitou a detecção de um novo QRL. As limitações do uso de marcadores dominantes para fins de mapeamento de locos quantitativos são discutidas. / Continuing the studies carried out in the Genetics Department at ESALQ/USP concerning the mapping of resistance genes for the bacterial disease in yellow passion fruit, two new assays were conducted involving a population derived from a cross between ‘IAPAR-06’ and ‘IAPAR-123’, both accessions belonging to Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR). This F1 population, composed of 160 individuals, was used for constructing genetic maps based on AFLP markers, using both markers with segregation 1:1 and with biparental 3:1, which act as a bridge to integrate the maps constructed for each of the parents. For phenotypic evaluation, 104 individuals plus the parents were inoculated with two isolates of Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae in two different assays. It was seen that the resistance to bacterial disease is polygenic, and there are at least three quantitative loci (QRL) involved. Tests regarding methods for measuring leaf lesions were also carried out. It was seen that, irrespective of the methodology used for phenotypic evaluation, the results were identical for QRL mapping. Different evaluation times and/or leaf ages resulted in detection of QRL with different effects, and even QRL allocated on different linkage groups. Data derived from the present study corroborate results obtained previously involving the same mapping population. The use of a second bacterial isolate did allow a new QRL to be detected. The limitations of using of dominant markers for mapping quantitative loci are discussed.

Os objetivos do presente trabalho compreenderam a obtenção de estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos, como variâncias, correlações, herdabilidades e respostas à seleção, em uma população derivada do cruzamento entre as linhagens 14 e 56 de soja, contrastantes para produção de grãos. Os tratamentos consistiram de uma amostra de 89 progênies F2:4 e 11 testemunhas comerciais, que foram avaliadas em experimentos em látice triplo 10 x 10 no ano agrícola 2007/08 na Estação Experimental Anhembi do Departamento de Genética da ESALQ/USP, localizada em Piracicaba, SP. A parcela experimental foi constituída de uma linha de 2 m de comprimento, espaçada de 0,5 m, contendo 35 plantas no estande ideal, após o desbaste. Foram avaliados os seguintes caracteres: dias até a maturação (DM), altura das plantas na maturação (AM), acamamento (AC) e produção de grãos (PG). As estimativas dos coeficientes de herdabilidade entre médias de progênies foram: elevada para AM (77,4%), mediana para DM (32,3%) e baixas para AC e PG (18,1% e 19,0%, respectivamente). Entretanto, os coeficientes de variação genética foram muito baixos para DM e AC (0,37% e 1,61%, respectivamente), e mais altos para AM e PG (6,80% e 6,83%, respectivamente), indicando a ocorrência de pouca variabilidade genética para DM e AC e, conseqüentemente, poucas perspectivas de resposta à seleção. O coeficiente de correlação genética entre AM e PG foi alto (rg = 0,67), indicando que a seleção para PG deve resultar em plantas mais altas. A estimativa da resposta com seleção das 20% progênies mais produtivas foi de 4,5%, e a resposta correlacionada em AM foi de 3,8%. Devido à baixa variabilidade genética, as respostas correlacionadas esperadas em DM e AC foram muito pequenas. Os resultados indicam que a população pode ser melhorada somente para os caracteres PG e AM. / This paper was carried out in order to estimate genetic and phenotypic parameters, such as variances, heritabilities, correlations and expected response to selection in a population derived from the cross between inbred lines 14 and 56 of soybeans, divergent for grain yield. Entries consisted of a sample of 89 F2:4 progenies and 11 commercial checks, evaluated in a triple 10 x 10 lattice design in the 2007/08 growing season at Anhembi Experimental Station of the Genetics Department (ESALQ/USP), near Piracicaba, SP. Plots were single 2-meter-long rows spaced 0.5 m apart, with 35 plants after thinning. The following traits were evaluated: days to maturity (DM), plant height at maturity (AM), lodging (AC) and grain yield (PG). Heritability estimates on a progeny mean basis were high for AM (77.4%), medium for DM (32.3%) and low for AC and PG (18.1% and 19.0%, respectively). However, genetic coefficients of variation were very low for DM and AC (0.37% and 1.61%, respectively) and higher for AM and PG (6.80% and 6.83%, respectively), which indicates low genetic variability for DM and AC and, consequently, small perspectives of response to selection. Genetic correlation coefficient between AM and PG was high (rg = 0.67), indicating that selection for higher PG will result in taller plants. Expected response based on selection of the 20% high yielding progenies was 4.5%, and the correlated response in AM was 3.8%. The correlated response in DM and AC were very low, due to the low genetic variability. General results have shown that the population can be improved only for the traits PG and AM.

A hibridação somática é uma nova opção em programas de melhoramento de espécies cítricas, obtendo-se híbridos somáticos que podem manter integralmente a combinação genética de ambos os progenitores envolvidos na hibridação. Assim, o objetivo desse trabalho foi estudar a propagação e crescimento de combinações parentais de híbridos somáticos com potencial para serem utilizados como porta-enxertos e verificar possíveis resistências/tolerâncias à infecção de tronco e raízes por Phytophthora nicotianae e ao vírus da tristeza dos citros (CTV). Os híbridos somáticos utilizados nos trabalhos foram: limão 'Cravo' + laranja azeda, laranja 'Caipira' + limão 'Cravo', laranja 'Caipira' + tangerina 'Cleópatra', laranja 'Caipira' + limão 'Volkameriano', laranja 'Caipira' + limão 'Rugoso', tangerina 'Cleópatra' + limão 'Volkameriano', tangerina 'Cleópatra' + laranja azeda, limão 'Cravo' + tangerina 'Sunki', laranja 'Ruby Blood' + limão 'Volkameriano', laranja 'Rohde Red' + limão 'Volkameriano' e laranja 'Valência' + Fortunella obovata. Na propagação dos híbridos, estacas de 15 cm de comprimento foram retiradas de plantas matrizes dos respectivos híbridos somáticos e submetidas ao enraizamento em câmara de nebulização intermitente por 100 dias. Posteriormente, foram analisadas o sistema radicular das estacas e parte aérea. Em seguida, foram transplantadas para sacos plásticos, conduzidas em haste única e mantidas em casa-de-vegetação por 210 dias, realizando-se avaliações mensais em relação à parte aérea e ao final avaliações do sistema radicular. Para os ensaios de infecção por Phytophthora nicotianae e CTV, foram utilizadas mudas dos respectivos híbridos somáticos oriundos de estacas e ainda a inclusão de plantas testemunhas. Para os testes de resistência/tolerância a P. nicotianae, utilizou-se o método da agulha para o teste de infecção de tronco, sendo as lesões quantificadas após 25 dias da inoculação. Para o teste de podridão das raízes e radicelas, o substrato foi infectado com estruturas do patógeno, sendo analisados a parte aérea das plantas quinzenalmente e o sistema radicular após 60 dias da instalação do ensaio. Para o teste de tolerância dos híbridos somáticos ao CTV, adotou-se o método de união dos tecidos (enxertia), analisando-se a parte aérea das plantas mensalmente em três avaliações. No enraizamento das estacas, os híbridos laranja 'Caipira' + tangerina 'Cleópatra', laranja 'Caipira' + limão 'Volkameriano', limão 'Cravo' + tangerina 'Sunki' e laranja 'Rohde Red' + limão 'Volkameriano' apresentaram melhores resultados, sendo que os híbridos laranja 'Caipira' + limão 'Volkameriano' e laranja 'Rohde Red' + limão 'Volkameriano' se destacaram em relação ao desenvolvimento das estacas após o tranplantio. Os híbridos somáticos tangerina 'Cleópatra' + laranja azeda, limão 'Cravo' + tangerina 'Sunki', tangerina 'Cleópatra' + limão 'Volkameriano', laranja 'Ruby Blood' + limão 'Volkameriano', laranja 'Rohde Red' + limão 'Volkameriano' e laranja 'Caipira' + limão 'Volkameriano' apresentaram bons resultados em relação à redução da podridão do tronco e os híbridos somáticos tangerina 'Cleópatra' + limão 'Volkameriano', tangerina 'Cleópatra' + laranja azeda, laranja 'Caipira' + limão 'Volkameriano' e laranja 'Caipira' + limão 'Cravo' apresentaram tolerância a podridão das raízes e radicelas ocasionado por P. nicotianae. Os híbridos tangerina 'Cleópatra' + laranja azeda e laranja 'Valência' + Fortunella obovata apresentaram intolerância ao vírus da tristeza dos citros. / Somatic hybridization is a new alternative in citric species breeding, yielding somatic hybrids which may integrally keep the genetic combination of both progenitors involved in the hybridization. Thus, the objective of this work was to study the propagation and growth of somatic hybrids parental combinations with potential to be used as rootstock and to verify possible resistance/tolerance to trunk and roots infection by Phytophthora nicotianae and citrus tristeza virus (CTV). This work applied the following somatic hybrids: 'Cravo' lemon + sour orange, 'Caipira' orange + 'Cravo' lemon, 'Caipira' orange + 'Cleopatra' tangerine, 'Caipira' orange + 'Volkamerian' lemon, 'Caipira' orange + 'Rough' lemon, 'Cleopatra' tangerine + 'Volkamerian' lemon, 'Cleopatra' tangerine + sour orange, 'Cravo' lemon + 'Sunki' tangerine, 'Ruby Blood' orange + 'Volkamerian' lemon, 'Rohde Red' orange + 'Volkamerian' lemon and 'Valência' orange + Fortunella obovata. In hybrids propagation, stem cuttings of approximately 15 cm length were excised from matrix plants of respective somatic hybrids and submmited to rooting in intermitent nebulization chamber for 100 days. Later, the stem cuttings root system and air part were analyzed. In sequence, they were transplanted to plastic bags, conduced in only one hast and kept in greenhouse during 210 days, when monthly evaluations were performed concerning the air part and, in the end, root system evaluations. For the Phytophthora nicotianae and CTV infection essays, plants derived from the respective somatic hybrids originated from stem cuttings were used, as well as control plants. For the resistance/tolerance to P. nicotianae analysis, the needle method for the trunk infection test was applied, being the lesions quantified after 25 days post-inoculation. For the roots and radicels flashening test, substrate was infected with pathogen structures and the air part of the plants was analyzed at every 15 days; roots were analyzed 60 days after the essay implementation. To evaluate the somatic hybrids tolerance to CTV, it was adopted the method of tissues union (grafting), where the air part of the plants was analyzed once a month in three evaluations. On the stem cuttings rooting, the hybrids of 'Caipira' orange + 'Cleopatra' tangerine, 'Caipira' orange + 'Volkamerian' lemon, 'Cravo' lemon + 'Sunki' tangerine and 'Rohde Red' orange + 'Volkamerian' lemon presented the best results, with the hybrids of 'Caipira' orange + 'Volkamerian' lemon and 'Rohde Red' orange + 'Volkamerian' lemon being the top concerning the stem cuttings development after transplanting. The somatic hybrids of 'Cleopatra' tangerine + sour orange, 'Cravo' lemon + 'Sunki' tangerine, 'Cleopatra' tangerine + 'Volkamerian' lemon, 'Ruby Blood' orange + 'Volkamerian' lemon, 'Rohde Red' orange + 'Volkamerian' lemon and 'Caipira' orange + 'Volkamerian' lemon showed good results related to reducing the trunk flashening, and the somatic hybrids of 'Cleopatra' tangerine + 'Volkamerian' lemon, 'Cleopatra' tangerine + sour orange, 'Caipira' orange + 'Volkamerian' lemon and 'Caipira' orange + 'Cravo' lemon presented tolerance to roots and radicels flashening caused by P. nicotianae. The hybrids of 'Cleopatra' tangerine + sour orange and 'Valência' orange + Fortunella obovata showed to be intolerant to citrus tristeza virus.