Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-03-07T17:37:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) lorena_tavares_oliveira.pdf: 1039032 bytes, checksum: 99b6c1aac4a55a13ac7523067c7e14af (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2017-03-30T14:58:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) lorena_tavares_oliveira.pdf: 1039032 bytes, checksum: 99b6c1aac4a55a13ac7523067c7e14af (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-30T14:58:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) lorena_tavares_oliveira.pdf: 1039032 bytes, checksum: 99b6c1aac4a55a13ac7523067c7e14af (MD5) Previous issue date: 2016 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Objetivou-se com este estudo estimar par?metros gen?ticos e fenot?picos para probabilidade de prenhez nas idades 15, 19, 23, 27, 31, 35, 39 e 43 meses (PP_15, PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 e PP_43), em novilhas da ra?a Sindi, via modelo de limiar em regress?o aleat?ria utilizando os polin?mios ortogonais de Legendre de segunda, terceira e quarta ordem, considerando a homogeneidade e heterogeneidade de vari?ncia residual. Os componentes de covari?ncia foram estimados por abordagem Bayesiana, utilizando o programa THRGIBBS3F90. Foram inclu?dos os efeitos fixos de criador, fazenda do criador, ano de nascimento, esta??o de nascimento e como covari?vel (de efeito linear) foi considerado o peso da vaca na idade em que ela concebeu. Al?m desses efeitos para todas as idades estudadas, foram considerados os efeitos aleat?rios gen?ticos aditivos, de ambiente permanente e residual. O melhor modelo para a an?lise RRTM foi o LEG_4441 que obteve as seguintes estimativas de herdabilidade 0,34; 0,41; 0,45; 0,41; 0,37; 0,32; 0,32; 0,33 para PP_15, PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39, PP_43, respectivamente. As estimativas das correla??es gen?ticas obtidas entre PP_15 com PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 e PP_43 foram 0,1; -0,39; -0,65; -0,83; -0,93; -0,81; -0,71, respectivamente. As estimativas das correla??es fenot?picas para PP_15 com PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 e PP_43 foram respectivamente 0,12; -0,09; -0,17; -0,22; -0,26; -0,25; 0,40. A an?lise que utilizou modelo LEG_4441 foi a mais indicada para estimar os par?metros gen?ticos para a probabilidade de prenhez em diferentes idades em novilhas da ra?a Sindi, indicando que a prenhez precoce possui variabilidade gen?tica para ser inclu?da como caracter?stica alvo de sele??o em programas de melhoramento, com potencial para se obter ganhos gen?ticos satisfat?rios. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2016. / Our aim with this study was estimating genetic and phenotypic parameters for pregnancy probability at 15, 19, 23, 27, 31, 35, 39 and 43 month old (PP_15, PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 and PP_43) in Sindhi heifers, by using threshold model in a random regression framework, adopting Legendre orthogonal polynomials of second, third and fourth order, considering homogeneity and heterogeneity of residual variance. Covariance components were estimated by Bayesian approach using THRGIBBS3F90 program. The model included the fixed effects of herd, herd of the farm, year of birth, birth season and as a covariate (with linear effect) was considered the weight of the cow at the age when she calved. In addition to these effects for all ages studied, additive genetic, permanent environmental and residual random effects were considered. The best model for the analysis was the RRTM LEG_4441 which obtained the following heritability estimates: 0.34; 0.41; 0.45; 0.41; 0.37; 0.32; 0.32; 0.33 to PP_15, PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 and PP_43, respectively. Genetic correlation estimates between PP_15 with PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 and PP_43 were 0.1; -0.39; -0.65; -0.83; -0.93; -0.81; -0.71, respectively. Phenotypic correlation estimates for PP_15 with PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 and PP_43 were respectively 0.12; -0.09; -0.17; -0.22; -0.26; -0.25; 0.40. The analysis by using LEG_4441 model was the most appropriate to estimate genetic parameters for pregnancy probability at different ages in Sindhi heifers, indicating that early pregnancy has genetic variability to be included as a goal trait selection in breeding programs, with the potential to achieve satisfactory genetic gains.

Le processus de sélection intersexuelle peut impliquer plusieurs mécanismes différents dans le choix du partenaire. Chez la pyrale Achroia grisella, les femelles choisissent les mâles en se basant sur des caractères de leur chant d'avertissement ultrasonique, et de précédentes études ont montré que ce choix peut procurer, à une femelle discriminante, certains bénéfices génétiques indirects. Dans cette thèse, j'ai continué à explorer le mécanisme de bénéfices indirects chez cette espèce en 1) déterminant avec plus de précision un paramètre acoustique, l‟amplitude du chant, qui influence le choix des femelles et en 2) examinant la covariance génétique entre les traits du chant mâle et ceux de la préférence femelle. J'ai constaté qu'en plus de préférer des chants mâles émis avec une plus grande amplitude et une plus grande puissance acoustique, les femelles font également une discrimination en faveur des chants comprenant des forts « pics d'amplitude ». Cependant, mes analyses génétiques moléculaires de la relation entre les traits du signal mâle et ceux de la préférence femelle, n'ont révélé aucune covariance significative, comme prédit par la théorie de la sélection sexuelle. Ces derniers résultats fournissent un aperçu important concernant l‟existence d‟un tempo réduit de la sélection sexuelle, dans les populations naturelles. / The process of inter-sexual selection may involve several different mechanisms of mate choice. In the pyralid moth Achroia grisella, females choose males based on characters of their ultrasonic advertisement song, and previous work has indicated that such choice may afford a discriminating female certain indirect genetic benefits. In this thesis I continued to probe the indirect benefits mechanism in this species by 1) determining with more precision one acoustic character, song amplitude, that influences female choice and by 2) examining the genetic covariance between the male song trait and the female preference trait. I found that in addition to preferring male songs delivered at greater amplitude and with greater acoustic power, females also discriminate in favor of songs including higher 'amplitude peaks'. However, my molecular genetic analyses of the relationships between the male signal and female preference traits did not reveal any significant covariance, as predicted by sexual selection theory. These latter findings provide important insight on the reduced tempo of sexual selection that may exist in natural populations.

SANTOS, Tyssia Nogueira Maciel dos. Avaliação genética da curva de lactação de cabras saanen utilizando modelos de regressão aleatória. 2014. 51 f. : Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Departamento de Zootecnia, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Fortaleza-CE, 2014. / Submitted by Eric Santiago (erichhcl@gmail.com) on 2016-08-09T13:21:33Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_tnmsantos.pdf: 879224 bytes, checksum: 96fe44313df6f0e17fee9e748d618407 (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-09T13:31:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_tnmsantos.pdf: 879224 bytes, checksum: 96fe44313df6f0e17fee9e748d618407 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-09T13:31:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_tnmsantos.pdf: 879224 bytes, checksum: 96fe44313df6f0e17fee9e748d618407 (MD5) Previous issue date: 2014 / The aim of this study was to perform a genetic-quantitative evaluation of the lactation curve up to 305 days of Saanen goats, fitting different random regression models to the best fit on the fixed and random trajectories of this curve and thus estimate the (co) variances and genetic parameters associated to this period. 11,018test-day milk yieldof 950 goats belonging to herds supported by the Dairy Goats Breeding Program (Capragene®) were used. The fixed effects used in the analysis were contemporary group, sex of offspring, type of milking and management. 18 models with different orderswere evaluated, to verify the simultaneous best fit of the regressions for the fixed and random trajectories (direct additive genetic, permanent environmental and residual effects). Ordinary orthogonal polynomials and Legendre polynomials, of second order were used to fit the fixed regression. Ordinary polynomials, orthogonal Legendre polynomials and B-spline functions, ranging from second to fourth order, were used for fit the random regressions. The model with orthogonal Legendre polynomials of second order to the fixed part and the b-spline function of fourth order for the random part was the most suitable for the fitting of the data analyzed. In fixed path, this model estimated peak lactation between 52-61 days, with an average of 2.378 kg of milk / day. The curve began with an average yield of 2.298 kg / day, ending 305 days with an average yield of 0.758 kg / day. Heritability estimates ranged from 0.294 ± 0.135 to 0.794 ± 0.075. Greater genetic variability was estimated for the intermediate test-day yields in the trajectory of the lactation curve, between 79 and 180 days, with higher heritability estimates. Genetic correlations among the test-day yields ranged from 0.551 ± 0.125 and 0.998 ± 0.001, with higher values between milk yield in the next and subsequent days, and becoming smaller as the distanceamong the test-day yield increase. The estimated genetic variability indicates that it is possible to modify the lactation curve of Saanen goats of the study population. The selection should be performed between 79 and 180 days of lactation, after the peak of lactation, however where the greatest heritabilities were observed period. The selection on this point will change the curve as a whole on the basis of correlated genetic responses. / O objetivo deste estudo foi realizar uma avaliação genético-quantitativa da curva de lactação até 305 dias de cabras da raça Saanen, avaliando distintos modelos de regressão aleatória para o melhor ajuste das trajetórias fixa e aleatórias desta curva, e assim estimar as covariâncias e parâmetros genéticos associados a este período. Foram utilizados 11.018 controles leiteiros de 950 lactações de cabras pertencentes a rebanhos associados ao Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros (Capragene®). Os efeitos fixos utilizados nas análises foram de grupo de contemporâneos, sexo das crias, tipo de ordenha e manejo. Foram avaliados 18 modelos, com diferentes ordens, para verificar o melhor ajuste simultâneo das regressões para as trajetórias fixa e aleatórias (efeitos genéticos aditivos diretos, de ambiente permanente e residual). Para ajuste da regressão fixa, foram utilizados os polinômios ordinários e os polinômios ortogonais de Legendre, de segunda ordem. Para as regressões aleatórias, foram utilizados os polinômios ordinários, os polinômios ortogonais de Legendre e as funções b-spline, variando da segunda a quarta ordem. O modelo com os polinômios ortogonais de Legendre de segunda ordem para a parte fixa e as funções b-spline de quarta ordem para a parte aleatória foi o mais adequado para o ajuste dos dados analisados. Na trajetória fixa, este modelo estimou o pico de lactação entre 52-61 dias, com valor médio de 2,378 kg de leite/dia. A curva iniciou-se com uma produção média de 2,298 kg/dia, encerrando aos 305 dias com uma produção média de 0,758 kg/dia. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,294 ± 0,135 a 0,794 ± 0,075. Maior variabilidade genética foi estimada para os controles leiteiros intermediários na trajetória da curva de lactação, entre 79 e 180 dias, com maiores estimativas de herdabilidade. As correlações genéticas entre os controles variaram entre 0,551 ± 0,125 e 0,998 ± 0,001, como maiores valores para produções de leite em dias próximos e subsequentes, e tornando-se menores à medida que os controles se distanciavam. A variabilidade genética estimada indica que é possível modificar por seleção a curva de lactação das cabras Saanen da população estudada. Esta seleção deve ser realizada entre 79 e 180 dias de lactação, período posterior ao pico de lactação, entretanto onde se observaram as maiores herdabilidades. A seleção neste ponto permitirá alterações na curva como um todo, em função das respostas genéticas correlacionadas.

Submitted by MATOS MANUEL null (manuelsoaresvet@gmail.com) on 2016-04-26T17:37:57Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Matos .pdf: 874261 bytes, checksum: 81dba6df3e77ecf89b32f2fbdae6debf (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-04-28T18:52:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 manuel_m_me_dra.pdf: 874261 bytes, checksum: 81dba6df3e77ecf89b32f2fbdae6debf (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-28T18:52:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 manuel_m_me_dra.pdf: 874261 bytes, checksum: 81dba6df3e77ecf89b32f2fbdae6debf (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Com vista à padronizar as análises, os programas de melhoramento genético na pecuária de corte estabelecem determinadas idades nas quais os pesos são ajustados antes de serem avaliados e no processo de seleção, as estimativas de variabilidade genética aditiva são muito importante. Neste estudo propusemos estimar parâmetros genéticos para pesos ajustados a desmama (P205), ao 1 ano (P365) e sobreano (P550), peso metabólico ajustados (PMa205), ao 1 ano (PMa365), sobreano (PMa550) e peso metabólico real (PMr205), ao 1 ano (PMr365) e sobreano (PMr550), e estimar parâmetros genéticos para índice de kleiber (IK), ganho de peso diário (GPD) para entendimento das potenciais respostas à seleção e subsidiar a elaboração de estratégias de melhoramento. Análises genéticas foram realizadas em registros de animais do arquivo de dados com 36.505 animais pertencente à ABCZ (Associação Brasileira de Criadores de Zebu) sob dois modelos distintos. O modelo 1 incluiu o efeito genético aditivo direto e residual como aleatórios, além dos efeitos fixos do grupo de contemporâneos, definido pelas variáveis: fazenda de origem do animal junto ao criador, sexo, estação de nascimento, e o ano de nascimento, para características de pesos ajustados a P365, P550, peso metabólico ajustado PMa365, PMa550, peso metabólico real PMr365, PMr550 dias, ganho de peso GP205365, ganho de pesos GP365550, índice de Kleiber IK365 e índice de Kleiber IK550 dias. O modelo 2 incluiu, o efeito genético aditivo direto, materno, ambiente permanente materno e residual como aleatórios e os incluídos no modelo 1 (fixos) para características de P205, PMa205, PMr205, GPN205 e IK205. Para estimação de parâmetros genéticos foi utilizado o método de máxima verossimilhança restrita (REML) via software Wombat. A herdabilidade variou de 0,20 a 0,25 para P205 e P550; 0,16 a 0,20 para PMr205 e PMr550 e de 0,21 a 0,21 para PMa205 e PMa550 respectivamente. As correlações genéticas entre P205 com PMr205 e P205 com PMa205 são respectivamente 0,76 e 1. Para a correlação genética entre P550 e PMr550 e P550 com PMa550 foram 0,97 e 1. A correlação genética entre P205 e P550 foi 0,72, entre PMr205 e PMr550 foi 0,54 e para PMa205 e PMa550 foi de 0,71. As correlações genéticas entre P205 com PMa205 e P365 com PMa365 foram respectivamente 1,00 e 1,00. A herdabilidade variou de 0,24 ± 0,02 a 0,22 ± 0,02 para pesos ajustados, 0,26 ± 0,06 a 0,12 ± 0,03 para IK e 0,22 a 0,15 para GPD respectivamente. As correlações entre IK 205 e K550, IK365 e IK550, IK205 e IK365, IK205 e GPN205, IK205 e GP365550, IK365 e GP205365, IK550 e GP365550, IK205 e P205, IK550 e P550 foram 0,55, 0,09, -0,06, 0,98, 0,67, 0,95, 0,98, 0,96, 0,99 e 0,63 respectivamente. O peso metabólico ajustado e peso a idade-padrão demostram semelhanças entre estimativas de parâmetros genéticos, as herdabilidade e correlações genéticas não são a mesma característica quando se trabalha com o peso a idade padrão ou peso metabólico não ajustado e O Índice de Kleiber apresenta vantagens de ser utilizado como critério de seleção nos programas de melhoramento genético / In order to standardize the analysis, breeding programs in beef cattle establish certain ages in which the weights are adjusted before being evaluated, and in the selection process, the additive genetic variability estimates are very important. In this study, proposed to estimate genetic parameters for weights adjusted weaning (W205) to one year (W365) and yearling (W550), metabolic weight adjusted weaning (AMW205) to one year (AMW365) and yearling (AMW550) and weight real metabolic weaning (RMW205) to one year (RMW365) and yearling (RMW550) to estimate genetic parameters to Kleiber index (KI), avarage daily weight gained (ADWG), for more comprehensive understanding of potential responses to selection and to support the development of the breed improvement strategies and to demonstrate the consequences of the metabolic weight value, without any correction for age on the estimation of variance components and prediction of genetic values. Genetic analyzes were conducted on animals records of the data file with 36,505 animals belonging to ABCZ (Brazilian Association of Zebu Breeders) in two different models. Model 1 included direct additive genetic effect and residual as random, besides the fixed effects of contemporary group, defined by variables: the animal farm origin with the creator, sex, birth season, and year of birth, for features of W365, W550, AMW365, AMW550, RMW365 and RMW550, weight gain of WG205365; weight gain WG365550; Kleiber index KI365 and Kleiber index to KI550. Model 2 included the direct additive genetic effect, maternal, permanent maternal environment and residual as random and the included in the model 1 (fixed) for features W205, AMW205, RMW205, average daily gained weight from birth to weaning GWB205 and index Kleiber KI205 days. To estimate genetic parameters the restricted maximum likelihood method (REML) used Wombat software. The heritability ranges from 0.20 to 0.25 for W205 and W550; 0.16 to 0.20 for RMW205 and RMW550 from 0.21 to 0.21 for AMW205 and AMW550 respectively. Genetic correlations between W205 with RMW205 and W205 WITH AMW205 are respectively 0.76 and 1. For the genetic correlation between W550 and RMW550 and W550 with AMW550 were 0.97 and 1. The genetic correlation between W205 and W550 was 0.72, between RMW205 and RMW550 was 0.54 and for AMW205 and AMW550 was 0.71. Genetic correlations between W205 with AMW205 and W365 with AMW365 are respectively 1.00 and 1.00. Heritability ranges from 0,24 ± 0.02 to 0.22 ± 0.02 for adjusted weights 0.26 ± 0.06 to 0.12 ± 0.03 and KI to 0.22 to 0.15 ADWG, respectively. Correlations between KI 205 and KI550, KI365 and KI550, KI205 and KI365, KI205 and GWB205, KI205 and WG365550, KI365 and WG205365, KI550 and WG365550, KI205 and W205, KI550 and W550 were 0.55, 0.09, -0 06, 0.98, 0.67, 0.95, 0.98, 0.96, 0.99 and 0.63 respectively. Adjusted metabolic weight and the weight at standard age demonstrate similarities between estimates of genetic parameters, heritability and genetic correlations are not the same feature when working with the weight of the standard age or unadjusted metabolic weight. Kleiber Index has advantages of being used as selection criteria in genetic improvement programs / CNPq: 190843/2013-6

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-09-03Bitstream added on 2014-06-13T19:12:57Z : No. of bitstreams: 1 zuin_rg_me_jabo.pdf: 216391 bytes, checksum: a0e1c4fd33e27c06f5e9cb650e3c402f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Características de carcaça preditas por ultrassonografia foram incluídas nos programas de avaliação genética, uma vez que estas estão associadas à qualidade e rendimento de carcaça. Neste trabalho, os objetivos foram estimar os parâmetros genéticos e as tendências genéticas para área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EG) e espessura de gordura subcutânea de garupa (EGP8), peso corporal aos 210 (P210) e aos 365 (P365) dias de idade em bovinos da raça Nelore. Foram analisados dados de animais nascidos entre 1998 e 2008, oriundos de fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (Nelore Brasil). As estimativas dos componentes de (co) variância, dos parâmetros genéticos e valores genéticos para as características estudadas foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal multi-característica. Para as características de peso as estimativas de herdabilidade genética direta e materna foram: 0,26 ± 0,003 e 0,18 ± 0,01, para P210 e 0,39 ± 0,02 e 0,05 ± 0,01, para P365. As estimativas de herdabilidade para AOL, EG e EGP8 foram iguais a 0,28 ± 0,03; 0,21 ± 0,02; 0,25 ± 0,03, respectivamente. Mudanças significativas nos valores genéticos médios anuais das características de carcaça indicaram que estas estão sendo indiretamente influenciadas pelo índice de seleção aplicado para estes rebanhos / Carcass traits by ultrasound measurements were included in genetic evaluation programs because they are associated with carcass yield and quality. This study aimed to estimate genetic parameters and genetic trends for back fat thickness (BF), rump fat thickness (RF), rib-eye area (REA) and body weight at 210 (BW210) and 365 (BW365) days of age. It data from animals whose herds participating in the Nelore breeding program (Nelore Brasil) born between 1998 and 2008, were used. Genetic parameters, (co)variance components and breeding values were estimated for each trait, in multi traits analysis, using maximum restricted likelihood method. Heritability estimates were equal to 0.28 ± 0.03 (REA); 0.21 ± 0.02 (BF) and 0.05 ± 0.01 (RF). In the growth traits the direct and maternal heritability estimates were respectively 0.26 ± 0.003; 0.18 ± 0.01 for BW210 and 0.39 ± 0.021; 0.05 ± 0.010 for BW365. Significant changes in the annual breeding values indicated that the carcass traits are being indirectly influenced by the selection index

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-22Bitstream added on 2014-06-13T20:54:08Z : No. of bitstreams: 1 diaz_ips_me_jabo.pdf: 356345 bytes, checksum: ee2c6efe46fc9a07e0e4e240c9d1171f (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com o objetivo de estudar a interação genótipo – ambiente (IGA) no peso ao sobreano, foram utilizados 99.366 registros provenientes de diferentes rebanhos da raça Nelore de cinco estados brasileiros (São Paulo, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Goiás e Minas Gerais). Os dados são provenientes de animais nascidos entre 1991 a 2006 participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). As informações foram coletadas pelos próprios criadores, sendo posteriormente transferidas à Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP) e então incorporadas ao banco de dados. Neste estudo foram utilizados apenas os dados dos animais criados exclusivamente a pasto. Os componentes de (co)variância foram obtidos através de uma análise unicaracterística (onde considerou-se o peso como mesma característica em todos os estados) e multicaracterística (na qual considerou-se a expressão do peso em cada estado como uma característica distinta). As estimativas foram obtidas por meio de inferência bayesiana, e o modelo de análise incluiu os efeitos fixos de grupos de contemporâneos e, como aleatórios, os efeitos genético aditivo direto e residual. A interação genótipo - ambiente foi verificada através da correlação genética (rg). As interações foram consideradas importantes quando os valores de rg ficaram abaixo de 0,80. Posteriormente, verificou-se o efeito da interação sobre a seleção considerando uma análise uni ou multicaracterística. As estimativas de herdabilidade em Mato Grosso (0,39±0,03) e Mato Grosso do Sul (0,37±0,02) foram mais baixas que as encontradas em Goiás (0,51±0,02), São Paulo (0,44±0,02) e Minas Gerais (0,41±0,04). As correlações genéticas estimadas entre os pesos nos diferentes estados foram positivas... / The goal was to study genotype by environment interaction (GEI) for yearling weight. Records of 99,366 Nellore cattle from five Brazilian states (São Paulo, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Goias and Minas Gerais) were used. Animals were born between 1991 to 2006 belonging to the Nellore Cattle Breeding Program (NCBP). Information was collected by farmers then, was transferred to the National Association of Breeders and Researchers (NABR) and incorporated into the database. This study used only data from animals raised exclusively on pasture. The (co)variance components were obtained using univariate (considering record as same trait in all states) and multiple-trait models, considering record from each state as a different trait. Estimates were obtained by Bayesian inference. The model for yearling weight included genetic fixed factor of contemporary groups and random animal genetic and residual effects. The genotype environment interaction was verified by genetic correlation (rg), where values below 0.80 indicated important interaction. Subsequently, the effect of interaction was verified on the selection considering a univariate or multiple-trait models. The direct heritability estimates of yearling weight in Mato Grosso (0.39±0.03) and Mato Grosso do Sul (0.37±0.02) were lower than Goiás (0.51±0.02), São Paulo (0.44±0.02) and Minas Gerais (0.41±0.04). The acrossstates estimates of genetic correlations were positive and moderate (0.67 to 0.75) between the states Goiás and Mato Grosso, Goias and Minas Gerais, São Paulo and Minas Gerais, and between Mato Grosso do Sul and Minas Gerais. These estimates indicates that genotype by environment interactions are biologically important. These results show that the animals selected will not be the same depending of the considered state, reducing the response... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:54:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 393689 bytes, checksum: 76b78277f76d70442e3dd050c28c6dd2 (MD5) Previous issue date: 2009-01-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Data of 2,274 semen output from 200 sires, 7,055 measurements of age at first calving (AFC) from females and 141 measurements of scrotal circumference (SC) were used to determine genetic parameters for reproductive traits of males and females of Dairy Gyr breed. Were studied physical aspects such as volume (VOL), concentration (CONC), vigor (VIG), motility (MOT), and morphological aspects as major defects (MAD) and minor defects (MID). The statistic model for seminal traits included the fixed effect of AI company-year-season at semen output and age as covariate, with linear and quadratic effects. For scrotal circumference, the statistic model included the fixed effects of season and year of birth, age class at measurement and AI company. For AFC in females, the statistic model included herd- year-season of birth. The models also included the random effects of animal and residual, and permanent environment effect for seminal traits model. Covariance components were estimated by REML, in single trait analyses. The genetic trends for AFC were estimated by linear regression of the breeding values on year of birth of the animals. The estimates of heritability of seminal traits were low to moderate (0.03 to 0.27), the genetic correlations were low to high (0.01 to 0.88), and generally favorable. The SC presented favorable genetic correlation with seminal traits. The heritability for SC and AFC were, respectively, 0.37 and 0.22. The genetic trend were significant, with value estimated of -0.018 kg/year and shows that has not occurred genetic progress in this trait over the years studied. The genetic correlations between SC with volume, concentration, vigor, motility, major defects, minor defects, total defects, doses number, total number of feasible spermatozoid and AFC, were 0.33; 0.22; 0.91; 0.86; -0.07; -0.03; -0.04; 0.30; 0.23 and -0.37, respectively. Strategies should be set for seminal traits selection, toward gains in reproduction. The SC can be used for selection of higher quality semen in Dairy Gyr bulls. These results suggest that genetic gains should be realized in reproductive efficiency of females when bulls with greater SC were used in herds. / Informações de 2.274 coletas de sêmen de 200 touros, 7.055 medidas de idade ao primeiro parto (IPP) de fêmeas e 141 medidas de perímetro escrotal (PE) foram utilizadas para se determinar parâmetros genéticos para características reprodutivas de touros e vacas Gir Leiteiro. Foi também avaliada a tendência genética da IPP. Para os touros, foram avaliados aspectos físicos do sêmen tais como volume (VOL), concentração (CONC), vigor (VIG), motilidade (MOT), aspectos morfológicos como defeitos maiores (DMA) e menores (DME). O modelo estatístico usado para estudar as características do sêmen incluiu o efeito fixo de central-ano- época de coleta de sêmen e idade à coleta como covariável, com efeitos linear e quadrático. Para o PE, o modelo estatístico incluiu os efeitos fixos época e ano do nascimento, classe de idade à medição do perímetro e central de inseminação. Para IPP nas fêmeas, o modelo estatístico incluiu o efeito fixo rebanho-ano-estação de nascimento. Os modelos incluíram ainda os efeitos aleatórios de animal e residual, além do efeito aleatório de ambiente permanente para o modelo de características do sêmen. Os componentes de (co)variância foram estimados utilizando-se o método da máxima verossimilhança restrita, em análises uni-característica. As estimativas das tendências genéticas para a característica IPP foram obtidas por meio da análise de regressão dos valores genéticos sobre o ano de nascimento dos animais. As estimativas das herdabilidades das características do sêmen foram baixas a moderadas (0,03 a 0,27), as correlações genéticas entre estas características foram baixas a altas (0,01 a 0,88), e em geral favoráveis. O PE apresentou correlações genéticas favoráveis com as características do sêmen. As herdabilidades para PE e IPP foram, respectivamente, 0,37 e 0,22. A tendência genética para IPP apresentou-se significativa, com valor estimado de - 0,018 meses/ano, mostrando que praticamente não houve progresso genético nesta característica ao longo dos anos estudados. As correlações genéticas entre PE e volume, concentração, vigor, motilidade, defeitos maiores, menores, totais, número de doses, número total de espermatozóides viáveis e IPP, foram de 0,33; 0,22; 0,91; 0,86; -0,07; -0,03; -0,04; 0,30; 0,23 e -0,37, respectivamente. Desta forma, devem ser definidas estratégias de seleção das características de qualidade de sêmen, visando maior ganho em reprodução. O PE pode ser utilizado para a seleção de touros Gir Leiteiro de maior qualidade seminal. Esses resultados sugerem ainda melhorias na eficiência reprodutiva de fêmeas quando forem utilizados nos rebanhos touros com maiores PE.

Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-04-25T16:10:19Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Vania_Casari_Mussato.pdf: 1286922 bytes, checksum: 0057f368a3285e7a1e5ec62f97e96210 (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido não contém o certificado de aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão com o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-04-26T16:29:37Z (GMT) / Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-05-08T22:39:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Vania_Casari_Mussato.pdf: 1286922 bytes, checksum: 0057f368a3285e7a1e5ec62f97e96210 (MD5) dissertação_Vania_casari1.pdf: 1221552 bytes, checksum: 8063cdb0ce0e0bc36ba902406d97e5e8 (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: Foram submetidos 2 arquivos PDF’s, apenas 1 arquivo deve ser submetido. O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive os apêndices e anexos, se houver. Corrija estas informações e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-05-09T20:13:06Z (GMT) / Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-05-14T14:37:36Z No. of bitstreams: 1 DissertaçãoFinal_Vânia_Casari_Mussato.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-16T12:49:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 mussato_vc_me_jabo.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-16T12:49:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mussato_vc_me_jabo.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) Previous issue date: 2017-04-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / As medidas de temperamento possuem notória relevância econômica devido a sua associação com características de interesse produtivo. Essas medidas podem ser utilizadas como critérios de seleção de bovinos, requerendo identificação de fatores ambientais que as influenciem, assim como a verificação de variabilidade genética e a inter-relação destas com as demais características de interesse ao sistema de produção. O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos, fenotípicos e ambientais de quatro medidas de avaliação do temperamento de bovinos da raça Canchim. As medidas de temperamento utilizadas foram: tempo de saída (TS), escore composto de temperamento (ECT), escore total (ET) e reatividade (REAT). Neste trabalho foram analisadas 2090 informações de bovinos da raça Canchim provenientes da fazenda Canchim, pertencente à Embrapa Pecuária Sudeste, situada na cidade de São Carlos, SP. As características foram analisadas utilizando-se um modelo animal, por meio de análises bi-característica. Para todas as características, o grupo de contemporâneos (GC) foi formado por animais nascidos no mesmo ano e pertencentes ao mesmo sexo. As avaliações foram realizadas durante as fases de desmama, ano e sobreano. As medidas de temperamento apresentaram estimativas de herdabilidade que variaram de 0,07 (0,142) (TS na desmama) a 0,36 (0,240) (TS, ao sobreano). As baixas magnitudes das estimativas indicam que as características são influenciadas principalmente por práticas de manejo e pelas condições ambientais, sendo importante o conhecimento de tais fatores para ações de seleção. As estimativas de correlação genética foram maiores entre ETxREAT (1,00 no sobreano), enquanto entre ETxTS e REATxTS as estimativas foram de -0,26 e -0,43, respectivamente no sobreano. As correlações genéticas estimadas entre as medidas de temperamento sugerem que os mesmos conjuntos de genes aditivos atuam na determinação das diferentes medidas de temperamento. Os coeficientes de repetibilidade foram 0,34, 0,57 e 0,43 para as variáveis ET, REAT e TS, respectivamente. Os resultados demonstram que o temperamento pode vir a ser utilizado como critério de seleção visando obter animais mais dóceis. / Temperament is a trait of notable economic relevance, due to its association with management and productive trait, and can be used as a selection criterion of cattle, requiring identification of environmental factors that influence, as well as the verification of genetic variability and the interrelationship with the other characteristics of interest to the production system. The objective of this study was to estimate genetic, phenotypic and environmental parameters using four measures of temperament evaluated on Canchim cattle. The temperament measures used were: flight speed (TS), composite score of temperament (ECT), total score of temperament (ET) and reactivity (REAT). This study analyzed 2090 information of Canchim cattle from the Canchim farm belonging to Embrapa Pecuária Sudeste, located at São Carlos, SP. The temperament traits were analyzed using an animal model, through bi-trait analyzes. For all traits, the contemporaries group (CG) was formed by animals born in the same year and belonging to the same sex. The evaluations were carried out during the weaning, yearling and long yearling phases. The temperament measures showed heritability estimates ranging from 0,07 (0,142) (TS at weaning) to 0,36 (0,240) (TS at yearling) values of moderate to low magnitude that were influenced by management practices and environmental conditions, being important knowledge such factors for selection actions. The genetic correlation estimates were higher for ETxREAT (1.00 at long yearling), while for ETxTS and REATxTS they presented values of -0.26 and -0.43, respectively during long yearling. The estimated genetic correlations between the temperament measures suggest that the same sets of additive genes act to determine the different measures of temperament. The repeatability coefficients were 0.34, 0.57 and 0.43 for the ET, REAT and TS variables, respectively. The results show that temperament can be used as a selection criterion in order to obtain more docile animals.

Orientador: Ricardo da Fonseca / Resumo: Com vista à padronizar as análises, os programas de melhoramento genético na pecuária de corte estabelecem determinadas idades nas quais os pesos são ajustados antes de serem avaliados e no processo de seleção, as estimativas de variabilidade genética aditiva são muito importante. Neste estudo propusemos estimar parâmetros genéticos para pesos ajustados a desmama (P205), ao 1 ano (P365) e sobreano (P550), peso metabólico ajustados (PMa205), ao 1 ano (PMa365), sobreano (PMa550) e peso metabólico real (PMr205), ao 1 ano (PMr365) e sobreano (PMr550), e estimar parâmetros genéticos para índice de kleiber (IK), ganho de peso diário (GPD) para entendimento das potenciais respostas à seleção e subsidiar a elaboração de estratégias de melhoramento. Análises genéticas foram realizadas em registros de animais do arquivo de dados com 36.505 animais pertencente à ABCZ (Associação Brasileira de Criadores de Zebu) sob dois modelos distintos. O modelo 1 incluiu o efeito genético aditivo direto e residual como aleatórios, além dos efeitos fixos do grupo de contemporâneos, definido pelas variáveis: fazenda de origem do animal junto ao criador, sexo, estação de nascimento, e o ano de nascimento, para características de pesos ajustados a P365, P550, peso metabólico ajustado PMa365, PMa550, peso metabólico real PMr365, PMr550 dias, ganho de peso GP205365, ganho de pesos GP365550, índice de Kleiber IK365 e índice de Kleiber IK550 dias. O modelo 2 incluiu, o efeito genético aditivo direto, mater... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In order to standardize the analysis, breeding programs in beef cattle establish certain ages in which the weights are adjusted before being evaluated, and in the selection process, the additive genetic variability estimates are very important. In this study, proposed to estimate genetic parameters for weights adjusted weaning (W205) to one year (W365) and yearling (W550), metabolic weight adjusted weaning (AMW205) to one year (AMW365) and yearling (AMW550) and weight real metabolic weaning (RMW205) to one year (RMW365) and yearling (RMW550) to estimate genetic parameters to Kleiber index (KI), avarage daily weight gained (ADWG), for more comprehensive understanding of potential responses to selection and to support the development of the breed improvement strategies and to demonstrate the consequences of the metabolic weight value, without any correction for age on the estimation of variance components and prediction of genetic values. Genetic analyzes were conducted on animals records of the data file with 36,505 animals belonging to ABCZ (Brazilian Association of Zebu Breeders) in two different models. Model 1 included direct additive genetic effect and residual as random, besides the fixed effects of contemporary group, defined by variables: the animal farm origin with the creator, sex, birth season, and year of birth, for features of W365, W550, AMW365, AMW550, RMW365 and RMW550, weight gain of WG205365; weight gain WG365550; Kleiber index KI365 and Kleiber index to KI5... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Resumo: O objetivo deste trabalho foi estudar a variabilidade genética das características de carcaça obtidas por ultrassom e de escores visuais, bem como suas associações genéticas em bovinos da raça Nelore. Foram utilizados registros de 13.285, 13.061, 12.811, 3.484, 3.484, 3.483 e 3.303 animais, para área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EG), espessura de gordura subcutânea na garupa (EGP8), estrutura (E), precocidade (P), musculosidade (M) e umbigo (U), respectivamente. Considerou-se nas análises como o efeito fixo o grupo de contemporâneos, o efeito aleatório genético aditivo direto, além das covariáveis idade da vaca ao parto (efeitos linear e quadrático) e idade do animal (efeitos linear e quadrático), dependendo da característica. Foi utilizado como âncora nas análises 46.157 observações de peso padronizado aos 120 dias (P120). As estimativas dos componentes de (co)variâncias foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita aplicando um modelo animal em análise multicaracterística. As estimativas de herdabilidade para as características AOL, EG, EGP8, E, P, M e U foram de 0,33 ± 0,028, 0,24 ± 0,024, 0,28 ± 0,027, 0,24 ± 0,039, 0,38 ± 0,054, 0,29 ± 0,048 e 0,38 ± 0,063, respectivamente. As correlações genéticas entre os escores visuais e a área de olho de lombo foram positivas e moderadas, variando de 0,37 a 0,44. Estes valores indicam que a utilização da AOL como critério de seleção poderá produzir animais com maiores escores para essas características. As correlações entre P e M com as espessuras de gordura (EG e EGP8) apresentaram resultado semelhante. Entretanto, as correlações genéticas entre as espessuras de gordura e E variaram de -0,02 a 0,12. As correlações genéticas entre umbigo e estrutura, e umbigo e as características de carcaça indicam que as mesmas não são geneticamente associadas ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this work was to study the genetic variability for carcass traits obtained by ultrasound and visual scores traits, and their genetic relationship in Nelore cattle. A total of 13,285; 13,061; 12,811; 3,484; 3,484; 3,483 and 3,303 records of longissimus muscle area (LMA), backfat thickness (BF), obtained between the 12th and 13th ribs, rump fat thickness (RF), body structure score (E), precocity score (P), muscle score (M) and navel score (U) were utilized. The model included the fixed effect of contemporary group, the age of dam at calving and age of animal as covariable (linear and quadratic effects). The direct additive genetic effect was included as random effect in the model. The (co)variance components and genetic parameters estimates were obtained by the restricted maximum likelihood method, applying an animal model in multi-trait analyses. The heritability estimates for LMA, BF, RF, E, P, M and U were 0.33 ± 0.028, 0.24 ± 0.024, 0.28 ± 0.027, 0.24 ± 0.039, 0.38 ± 0.054, 0.29 ± 0.048 and 0.38 ± 0.063, respectively. The genetic correlation estimates between LMA with visual scores were positive and moderate, varying from 0.37 to 0.44. The genetic correlation estimates between backfat and rump fat with visual scores shown the same trend. However, the genetic correlation estimates between E with BF and RF were low, -0.02 to 0.12, respectively. These results shown that applying LMA as selection criteria will increase the visual scores. The genetic correlation estimates between U and E, and between U and carcass traits pointed out a weak relationship between these traits. Selection to improved carcass traits and E would not affect the navel score. Visual scores would not replace the carcass traits as selection criteria to improve the meat and carcass quality / Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Mestre