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Estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça avaliadas por ultrassom, com ênfase na gordura intramuscular, em bovinos Nelore / Estimation of genetic parameters for carcass traits measured by ultrasound, with emphasis on intramuscular fat, in Nellore

Matarim, Danielle Leal 07 July 2015 (has links)
Este trabalho foi desenvolvido visando a estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia em bovinos da raça Nelore. Foram analisadas as informações de 13.256 animais, machos e fêmeas, com idade entre 10 e 25 meses, provenientes de cinco propriedades distintas, pertencentes ao programa de melhoramento genético da Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). As características de carcaça avaliadas por ultrassonografia foram área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), espessura de gordura na garupa (EGG), percentagem de gordura intramuscular (PGIM), além do peso na data da avaliação e das estimativas do peso e da percentagem da porção comestível (PESPC e PERPC, respectivamente). Foram estimadas a herdabilidade, correlações genéticas e fenotípicas, além da tendência genética observada no período avaliado. As herdabilidades observadas foram de moderada magnitude (0,18 a 0,37), suportando a recomendação de seleção para as características de carcaça. As correlações da gordura intramuscular com as demais variáveis foram, em sua maioria, próximas de zero, com exceção para as correlações com a área de olho de lombo e com o peso da porção comestível, cujos valores negativos devem ser considerados nos critérios de seleção. O efeito da idade sob as características permite afirmar que as avaliações por ultrassonografia podem ser obtidas em idade precoce. Os resultados indicaram ainda que a inclusão das DEPs de carcaça tem proporcionado melhorias na área de olho de lombo e nas espessuras de gordura, no entanto a percentagem da gordura intramuscular e o rendimento dos cortes cárneos não apresentaram progresso uniforme na população e período avaliados. / This work was developed aiming to estimate genetic parameters for carcass traits obtained by ultrasound in Nelore cattle. The information of 13,256 animals were analyzed, male and female, with ages between 10 and 25 months, from five distinct properties, belonging to the genetic improvement program of the Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). The carcass characteristics evaluated by ultrasonography were: rib eye area (REA), subcutaneous back fat thickness (BF), rump fat thickness (RF), percentage of intramuscular fat (IMF), also the weight on the valuation date, estimates of weight and percentage of retail product. Heritability, genetic and phenotypic correlations were estimated, in addition to the genetic tendency observed during the study period. Observed heritability had moderate magnitude (0,18 to 0,37), corroborating the selection recommendation for carcass traits. The percentage of intramuscular fat correlations with other features were mostly close to zero, except for correlations with the loin eye area and the weight of retail product, whose negative values should be considered in the selection criteria. The effect of age on the observed features suggest that the ultrasound evaluation can be held at an early age. The results also indicated that the inclusion of expected progeny differences (EPDs) has provided improvements in REA and BF, however the intramuscular fat and yield of meat cuts showed no uniform progress in the population and the evaluated period.
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Análises quantitativas aplicadas à seleção e acasalamento de búfalos na Amazônia Oriental

AGUIAR, Juliana Flor de 06 July 2010 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2014-02-07T18:17:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_AnalisesQuantitativasAplicadas.pdf: 698852 bytes, checksum: 333d9c3a9b8826f02936d7cd9456492c (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-02-27T12:10:24Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_AnalisesQuantitativasAplicadas.pdf: 698852 bytes, checksum: 333d9c3a9b8826f02936d7cd9456492c (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-27T12:10:24Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_AnalisesQuantitativasAplicadas.pdf: 698852 bytes, checksum: 333d9c3a9b8826f02936d7cd9456492c (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2010 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O trabalho aplica estudos de genética quantitativa aos registros de búfalos do Estado do Pará, gerando respostas auxiliares aos criadores para a seleção e acasalamento dos animais. A análise de pedigree para estudo da variabilidade genética nos rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético foi estimada por meio dos cálculos dos parâmetros baseados na probabilidade de origem de gene, coeficiente de endogamia, parentesco e intervalo médio entre gerações, pelo software PEDIG®; do número efetivo de fundadores (Nfun), número efetivo de ancestrais (Na) e intervalo de gerações pelo software PROB_ORIG.exe presente no pacote PEDIG®; do número efetivo de genomas remanescentes (Ng), calculado pelo software SEGREG.exe. Foram calculadas as estatísticas descritivas, a análise de variância e realizado o teste de Normalidade de Shapiro-Wilk por meio do pacote estatístico Statistical Analisys System. As estimativas de herdabilidade para a característica Peso ao Nascer (PN) foram obtidas por meio de inferência Bayesiana pelo programa GIBBS2F90.exe. Os valores genéticos foram obtidos por meio do programa BLUPF90.exe e a regressão das Diferenças Esperadas na Progênie sobre o ano de nascimento foi realizada pelo Excel for Windows para obtenção da tendência genética do PN. O Nfun foi igual a 28,6, o Na igual a 22,8, o Ng igual a 11,2, a razão Nfun/Na foi 1,25, indicando a diminuição do número de reprodutores ao longo dos períodos e a razão Ng/Nfun foi de 0,39. Apesar do intervalo de gerações de 12,5 anos, o número efetivo de gerações foi próximo a cinco. O número total de animais estudados considerados endogâmicos foi 33,4%, sendo a máxima encontrada de 40,8%, a média da endogamia entre os animais endogâmicos foi 10,4%, e o valor médio da endogamia no arquivo total foi 3,5%. O PN de bezerros bubalinos apresentou média e desvio padrão de 36,6 ± 4,7 kg. A característica PN não apresentou distribuição Normal, com valor de W=0,976271 e P<W=0,000, conforme mostrou o teste de normalidade de Shapiro-Wilk. O modelo considerado na Análise de Variância mostrou-se significativo a P<0,0001, onde 30% da variação existente no PN pode ser explicada pelos efeitos considerados no modelo, e os outros 70% correspondem a diferenças genéticas e ambientais não consideradas no estudo. Somente os efeitos de composição racial, sexo e ano de nascimento foram significativos (P<0,01) sobre a característica PN. A distribuição da estimativa de herdabilidade direta apresentou-se platicúrtica e com maior assimetria, tendo uma distribuição bimodal com a primeira moda próxima a 0,10 e a segunda próxima a 0,30; a materna apresentou-se trimodal, com picos bem próximos ao valor de 0,15 e outro menos evidente próximo a 0,20. A tendência genética do PN mostrou-se negativa (-0,008kg/ano), porém próxima a zero, ainda que a tendência fenotípica tenha sido positiva (0,156kg/ano). A adoção de acasalamentos otimizados com controle de parentesco seria uma saída para controlar endogamia e, consequentemente, a perda de variabilidade genética, que deve ser trabalhada com base nas estimativas de herdabilidade direta e materna. / This work applies studies of quantitative genetics to the buffalo registry for the Pará State (Brazil) and provides information that can assist farmers in animal mating and selection. For the study of genetic variability in the herds of Genetic Improvement Program, pedigree analysis was estimated with parameter calculations based on probability of gene origen, endogamy coefficient, kinship coefficient and average generation interval, using the PEDIG® software; effective number of founders (Nfun), effective number of ancestors (Na) and generation interval, using the PROB_ORIG.exe software, which is included in PEDIG®; and effective number of remaining genomes (Ng) was obtained with the SEGREG.exe software. Statistics descriptive and variance analysis were calculated, and the Shapiro-Wilk test for Normality was completed using the Statistical Analysis System package. The heritability estimates for Birth Weight (PN) were found through Bayesian inference with the GIBBS2F90.exe software. The genetic values were obtained using the BLUPF90.exe software, and the regression of Expected Progeny Differences for year of birth was determined by Excel for Windows to assess PN genetic trend. Nfun was 28.6, Na was 22.8, Ng was 11.2, the Nfun/Na was 1.25, showing a reduction in the number of reproducers across time, and the Ng/Nfun rate was 0.39. Despite the generation interval of 12.5 years, the maximum effective number of generations was five. In the study, total number of animals that were considered endogamous was 33.4%, and the highest endogamy was found to be 40.8%. Average coefficient of endogamy among endogamous animals was 10.4%, and the general mean was 3.5%. The PN of buffalo calves yielded an average and a standard deviation of 36.6 ± 4.7 kg. PN did not present Normal Distribution, W=0.976271 and P<W=0.000, according to the Shapiro-Wilk test for normality. The model that was considered for variance analysis was significative at P<0.0001, where 30% of the existing variance in PN can be accounted for by the effects considered in the model, and the remaining 70% correspond to genetic and environmental differences that were not taken into account in the study. Only the effects of racial composition, sex and year of birth were significative (P<0.01) on PN. The distribution of direct heritability estimates revealed platykurtic and greater asymmetry, with a bimodal distribution where the first mode was near 0.10, and the second near 0.30; maternal heritability estimate was trimodal, with peaks very close to 0.15 and other, less outstanding, near 0.20. PN genetic trend was negative (-0.008kg/year), near zero, although the phenotypic trend was positive (0.156kg/year). Optimized matings, with kinship control, might be a solution to monitor endogamy and, consequently, the loss of genetic variability, which must be explored and take into account the estimates for direct and maternal heritability.
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Parâmetros genéticos, tendências e resposta à seleção de características produtivas da raça Nelore na Amazônia Legal

SENA, Josynélia do Socorro da Silva 22 July 2011 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2014-02-07T18:16:41Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ParametrosGeneticosTendencias.pdf: 743274 bytes, checksum: 9fe14ce1bc82378bf759e2f200955a29 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2014-02-27T12:40:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_ParametrosGeneticosTendencias.pdf: 743274 bytes, checksum: 9fe14ce1bc82378bf759e2f200955a29 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-02-27T12:40:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_ParametrosGeneticosTendencias.pdf: 743274 bytes, checksum: 9fe14ce1bc82378bf759e2f200955a29 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2011 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos (herdabilidades e correlações), efeitos não genéticos, tendência genética e resposta à seleção para as características de crescimento (pesos padronizados aos 120, 210 e 450 dias) e características reprodutivas (idade ao primeiro parto e perímetro escrotal aos 450 dias) de machos e fêmeas, da raça Nelore criados na Amazônia Legal. O arquivo de dados analisado consistia em 211.744 registros de animais da raça Nelore, participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN- Nelore Brasil), nascidos no período de 1995 e 2008, distribuídos em rebanhos localizados nos estados do AC, MA, MT, PA, RO e TO. A consistência dos dados, as análises descritivas, de variância e de escolha do modelo para cada uma das características foram realizadas utilizando-se o software Statistical Analysis System. As estimativas de média e desvio padrão foram de 122,919,0; 179,628,1; 262,445,5; 227,229,2; 37,14,7, respectivamente para as características de P120, P210, P450, PE450 e IPP. As herdabilidades para P120 foram de 0,24; 0,21 e 0,36, para h²d, h²m e h²t, respectivamente; para P210 foram de 0,29; 0,16 e 0,45, para h²d, h²m e h²t, respectivamente e para P450, PE450 e IPP, foram de 0,48; 0,49 e 0,22, respectivamente. As correlações genéticas entre os pesos variaram de 0,51 a 0,78, entre os pesos e PE450 variaram de 0,26 a 0,46, entre os pesos e a IPP foram baixas e negativas e entre PE450 e IPP foi nula. Em todas as características estudadas, os progressos genéticos foram superiores aos fenotípicos, com exceção à IPP. Os resultados de resposta à seleção variaram de 0,27 a 0,11 kg/ano; 0,49 a 0,20 kg/ano; 1,32 a 0,53 kg/ano; 0,08 a 0,03 cm/ano e 0,06 a 0,02 dias/ano para P120, P210, P450, PE450 e IPP, respectivamente. Portanto, todas as características estudadas podem ser utilizadas como critério de seleção, objetivando melhorar a produtividade. / The objectives of this study were to estimate genetic parameters (heritabilities and correlations), non-genetic effects, genetic tendency and response to selection for growth (standardized weights at 120, 210 and 450 days) and reproductive traits (age at first calving and scrotal perimeter to 450 days) of Nelore males and females raised in Amazon region. Database consisted of 211,744 records of Nelore cattle, participants in the Genetic Improvement Program of Nelore (PMGRN Nelore-Brazil). The consistency of the data, descriptive analysis of variance and model selection for each trait were performed using Statistical Analysis System. The estimated mean and standard deviation were 122.9 19.0, 179.6 28.1, 262.4 45.5, 227.2 29.2, 37.1 4.7, respectively for P120, P210, P450, PE450 and IPP. The heritabilities for P120 were 0.24, 0.21 and 0.36 for h²d, h²m and h²t , respectively, for P210 were 0.29, 0.16 and 0.45 h²d, h²m e h²t , respectively and P450, PE450 and IPP, were 0.48, 0.49 and 0.22, respectively. The genetic correlations between weights ranged from 0.51 to 0.78, among PE450, and weights ranged from 0.26 to 0.46, among IPP and weights were low and negative, and between IPP and PE450 was null. In all traits, the genetic gains were higher than phenotypic, except for IPP. The results of response to selection ranged from 0.27 to 0.11 kg / year, from 0.49 to 0.20 kg / year, from 1.32 to 0.53 kg / year, from 0.08 to 0.03 cm / year and 0.06 to 0.02 days / year for P120, P210, P450, PE450 and IPP, respectively. Therefore, all traits can be used as selection criteria, in order to improve productivity.
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Estimativas de parâmetros genéticos em populações segregantes de amendoim

LUZ, Lucas Nunes da 20 February 2009 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-20T16:33:34Z No. of bitstreams: 1 Lucas Nunes da Luz.pdf: 382023 bytes, checksum: 08d92e3154572bc09390dc2370ab2019 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T16:33:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lucas Nunes da Luz.pdf: 382023 bytes, checksum: 08d92e3154572bc09390dc2370ab2019 (MD5) Previous issue date: 2009-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The present work had for objective esteem the genetic parameters in hybrid populations of peanut for on characters the production, related to the peg and evaluate through the genotypic correlation and of the coefficient of path analysis contribution in the selection for production of pods per plant. One used F2 lines of a crossing between varieties BR 1 and advanced line CNPA 280 AM. The crossings had been carried through in house of vegetation of the UFRPE and gotten lines F 1 inbreeding. The F2 lines had been cultivated in field in the cities of Abreu e Lima and GoianaPE, in regimen of dry land, the period of May the Agost in 2008. The adoptedexperimental delineation was blocks to random with 3 blocks. The reproductive efficiency (EF1 and EF2), the total number of pegs (NGT), the number of pegs in first part of the plant (NGTI), the height of the main stem (AHP) and the number of pods (NVP) for plant had been evaluated. The data had been processed by applicatory the computational SAS assuming a mixing model. The estimates of the genetic parameters had been gotten by method RELM (Restricted Maximum Likelihood) and the individual genotypics values predicted by BLUP (Best Linear Unbiased Prediction). The environment variance was biggest the genotypic, in all the describers in the two studied environments. The magnitude of the heritability for all the describers was environments enters low and medium, indicating bigger perspective of selection in post generations. The magnitude of the heritability all the describers in the two studied environments showed enters low and medium, indicating bigger perspective of selection in post generations. The lines L.8 e L.11 showed biggest level of reproductive efficiency, more than hability for transform pegs in mature pods. The describers NGTI offers to greater possibility of selection for production of pods. / O presente trabalho teve por objetivo estimar os parâmetros genéticos em populações segregantes de amendoim para caracteres ligados a produção, associados ao ginóforo e avaliar via correlação genotípica e coeficiente de trilha os de maior contribuição na seleção para produção de vagens por planta. Foram utilizados progênies F2 de um cruzamento entre as variedades BR 1 e a linha avançada CNPA 280 AM, que possuem: alta capacidade produtiva e floração concentrada na base da planta com alta eficiência reprodutiva, respectivamente. Os cruzamentos foram realizados em casa de vegetação da UFRPE, sendo as progênies F 1 obtidas postas para autofecundar. As progênies F2 foram cultivadas em campo nos municípios de Abreu e Lima e GoianaPE, em regime de sequeiro, noperíodo de maio a agosto de 2008. O delineamento experimental adotado foi blocos ao acaso com 3 blocos. A colheita procedeu-se em média aos 90 dias após o plantio. Foram avaliadas a eficiência reprodutiva (EF1 e EF2), o número total de ginóforos (NGT), o número de ginóforos no terço inferior da planta (NGTI), a altura da haste principal (AHP) e o número de vagens por planta (NVP). Os dados foram processados pelo aplicativo computacional SAS assumindo um modelo misto. As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas pelo método RELM (Restricted Maximum Likelihood) e os valores genotípicos individuais preditos pelo método BLUP (Best Linear Unbiased Prediction). A variância ambiental foi superior as demais para todos os descritores nos dois locais estudados. A magnitude da herdabilidade para todos os descritores situou-se entre baixa e mediana, indicando maior perspectiva de seleção em gerações posteriores. Os maiores valores genotípicos individuas foram obtidos para o descritor NGTI. A predição dos valores genéticos individuais obtidos BLUP auxilia melhor na seleção das linhagens deamendoim no inicio do melhoramento do que as estimativas de herdabilidade, para os descritores estudados. As linhagens L.8 e L.11, apresentaram os melhores níveis de eficiência reprodutiva EF1 e EF2, se mostrando mais aptas a transformar ginóforos em vagens maduras. Pela análise de trilha, observa-se que o descritor número de ginóforos no terço inferior da planta oferece maior possibilidade de seleção para produção de vagens.
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Variabilidade genética e caracterização agronômica de progênies de alface tolerantes ao calor / Genetic variability and agronomic characterization of heat tolerant Lettuce progenies

SOUZA, Maria da Conceição Martiniano de 20 February 2006 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-20T17:53:07Z No. of bitstreams: 1 Maria da Conceicao Martiniano de Souza.pdf: 1639350 bytes, checksum: 3a120f3ded9338ab0be766edfe082cfe (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T17:53:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria da Conceicao Martiniano de Souza.pdf: 1639350 bytes, checksum: 3a120f3ded9338ab0be766edfe082cfe (MD5) Previous issue date: 2006-02-20 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The objective of this work was to estimate the genetic variability and the correlations between agronomic characters in thirteen progenies F7 of lettuce, and in the genitors: Verdinha, Regina and Tinto, and in the cultivars Luisa and Baba de Verão. The experiment was conducted in Vitória de Santo Antão – PE, in the period from September to December of 2005. The experimental design was random blocks, with three replicates. The following characteristics were evaluated: number of leaves – NF, plant fresh weight – PFP, plant diameter – DP, leaves fresh weight - PFF, stem length – CC and bolting PEND. The analysis of variance was highly significant (p <0, 01), by the F test, for all studied characteristics showing that the treatments significantly differed between themselves. In the grouping of the averages by the Scott-Knott test at 5% probability, for all characteristics evaluated, the treatments were united into two distinct groups, with the exception of DP, where the cv. Tinto was situated alone in a third group. The genetic variance was higher for all characteristics evaluated and the heritability higher than 50% shows that there was influence of the environment for all the characters. All the variables showed values ofgenetic and environmental variation coefficients (CVG/CVE) near or higher than unity, except for the character PFF, whose value was 0,78. When bolting was correlated to the other characteristics, the results obtained were significant and positive for most of the combinations, considering the genetic correlations. Under the experimental conditions of this experiment, the progeny 76 had better performance, which, although showing a commercial performance slightly lower than the control, to the genitors and even from other progenies, it stood out in relation to the limiting factors such as stem length and bolting. The genetic variances of all variables were superior to the environmental variances for the evaluated characters. / O objetivo deste trabalho foi estimar a variabilidade genética e as correlações entre caracteres agronômicos em 13 progênies F7 de alface, e nos genitores: Verdinha, Regina e Tinto, e nas cultivares Luisa e Babá de Verão. O experimento foi conduzido em Vitória de Santo Antão – PE, no período de setembro a dezembro de 2005. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, com três repetições. Foram avaliadas as seguintes características: número de folhas - NF, peso fresco da planta – PFP, diâmetro da planta - DP, peso fresco das folhas – PFF, comprimento do caule - CC e pendoamento – PEND. A análise de variância foi altamente significativa (p < 0,01), pelo teste F, para todas as características estudadas, demonstrando que os tratamentos diferiram significativamente entre si. No agrupamento das médias pelo teste de Scott-Knott a 5% de probabilidade, para todas as características avaliadas, os tratamentos foram reunidos em dois grupos distintos, exceto para DP, onde a cv. Tinto se posicionou isoladamente em um terceiro grupo. A variância genética foi superior para todas as características avaliadas e a herdabilidade acima de 50% mostra que houve influência do ambiente para todos os caracteres. Todas as variáveis apresentaram valores de coeficientes de variação genética e ambiental (CVG/CVE) próximos ou superiores à unidade, exceto para o caráter PFF, cujo valor foi de 0,78. Quando se correlacionou pendoamento com as demais características, os resultados obtidos foram significativos e positivos para a maioria das combinações, considerando-se as correlações genéticas. Nas condições desse ensaio, destacou-se a progênie 76, que embora tenha apresentado uma performance comercial levemente inferior às testemunhas, aos genitores e até mesmo a outras progênies, destacou-se no tocante aos fatores limitantes como comprimento de caule e pendoamento. As variâncias genéticas de todas as variáveis foram superiores às variâncias ambientais, para os caracteres avaliados.
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Avaliação de progênies da fase inicial T1, para indicação de genitores elites de cana-de-açúcar para Pernambuco

MORAES, Mário Ferreira de 13 May 2008 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-21T13:04:47Z No. of bitstreams: 1 Mario Ferreira de Moraes.pdf: 411584 bytes, checksum: e255f5dc11e6cca3b4de67ef281dbbb4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T13:04:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mario Ferreira de Moraes.pdf: 411584 bytes, checksum: e255f5dc11e6cca3b4de67ef281dbbb4 (MD5) Previous issue date: 2008-05-13 / In Brazil, there are several programs of genetic improvement for sugarcane (Saccharum spp.), which most of them use the phenotypical or massal selection in T1 phase. These programs show relative success, once quantitative genetical studies indicate that the massal selection in T1 phase shows low efficiency. So, many researches were done in order is find new methods to increase the efficiency of the selection in its various phases. In this context distinguishes the selection by families in progenies in T1 phase. Therefore, the objective of this work was to evaluate the agroindustrial performance and to analyze the magnitude of some genetical parameters in families of progenies in T1 phase of sugarcane within the sugarcane plantation microregions from North Forest and North Coast of the state of Pernambuco. Experimental works in cane-plant were developed during the agricultural year of 2006/2007 at the Central Olho d’Água mill, located at the North Forest of Pernambuco, municipal district of Camutanga (07°24’ S, 35°28’W) and São José mill, located at the North Coast of Pernambuco, municipal district of Igarassu (08°45’S, 35°00’W). The adopted experimental delineation was the randomized blocks, with 5 of them, using 37 and 24 treatments for the experiments conducted at North Forest and North Coast, respectively. The experimental unit was represented by three furrow of 6 m each, spaced by 1,30 m with tem seedlings per furrow, spaced by 06 m within the furrow, totalizing 30 seedlings per parcel, making a total area of parcel of 23,4 m2. The harvest was made in the 10th month after the transplantation where were evaluated the variables: sugarcane tons per hectare (STH), pol tons per hectare (PTH), fiber (FB), corrected pol % (CPP), purity (PTY), brix (BX), total retrievable sugar (TRS). In the experiment conducted at North Forest, the over topping progenies of the crossings were: RB 865230 X RB 855035, TUC 77-42 X RB 83102, Co 434 X RB 946915, RB 972551 X CP 69-1062, RB 855063 X IAC 87-3396, RB 855035 X RB 865230, RB 915141 X RB 855322, RB 855035 X RB 72454, RB 83102 X TUC 77-42, IAC 87-3396 X RB 855063, SP 71-6949 X RB 83102, RB 72454 X TUC 71-7 e SP 71-6949 X TUC 71-7 for all studied variables. There was genetical variability among the progenies for all variables, but the h2 m estimations were expressive for the variablies PTH, STH, CPP and BX indicating the possibility of the success in the selection of these variables. While the experiment conducted at North Coast, the progenies of the crossings over topped were RB 855035 X RB 72454; H 64-1881 X F-150; RB 865230 X RB 855035; TUC 71-7 X RB 72454; RB 855035 X RB 865230 e RB 72454 X TUC 71-7 for the variables PTH, STH, CPP, BX e TRS. The result of these genetical analyses indicated the existence of genetical variability among the progenies of the crossings for all evaluated variables, but the h2 m estimations were elevates for the variables PTH, STH, CPP, BX and TRS, indicating the possibility of success in the selection of these variables. / No Brasil, há vários programas de melhoramento genético para a cana-deaçúcar (Saccharum spp.), sendo que a maioria deles utiliza a seleção fenotípica ou massal na fase T1. Estes programas apresentam sucesso relativo visto que estudos de genética quantitativa indicaram que a seleção massal na fase T1 apresenta baixa eficiência. Deste modo, diversas pesquisas têm sido realizadas na busca de novos métodos para aumentar a eficiência de seleção nas suas diversas fases. Nesse contexto, destaca-se a seleção por famílias em progênies na fase T1. Por conseguinte, objetivou-se avaliar a performance agroindustrial e analisar a magnitude de alguns parâmetros genético em famílias na fase T1 de cana-de-açúcar nas microrregiões canavieiras da Mata Norte e Litoral Norte do Estado de Pernambuco. Os trabalhos experimentais, em cana-planta, foram desenvolvidos durante o ano agrícola de 2006/2007 nas Usinas Central Olho D’Água, localizada na Zona da Mata Norte de Pernambuco, município de Camutanga (07°24’S e 35°28’W) e na Usina São José, localizada no Litoral Norte de Pernambuco, município de Igarassu (8º 45’S e 35º 00’W). O delineamento experimental adotado foi o de blocos casualizados, com 5 blocos, utilizando-se 37 e 24 tratamentos para os experimentos conduzidos na Zona da Mata Norte e no Litoral Norte de Pernambuco, respectivamente. A unidade experimental foi representada por três sulcos de 6 m, espaçados de 1,30 m com dez plântulas por sulco, espaçados de 0,6 m, totalizando 30 plântulas por parcela, perfazendo uma área total da parcela de 23,4 m2. O corte foi realizado no décimo mês após o transplantio, quando foram avaliadas as variáveis: tonelada de cana por hectare (TCH), tonelada de pol por hectare (TPH), Fibra (FB), pol % corrigida (PCC), pureza (PZA), Brix (BX), açúcar total recuperável (ATR). No experimento conduzido na Zona da Mata Norte destacaram-se as progênies dos cruzamentos: RB 865230 X RB 855035, TUC 77-42 X RB 83102, Co 434 X RB 946915, RB 972551 X CP 69-1062, RB 855063 X IAC 87-3396, RB 855035 X RB 865230, RB 915141 X RB 855322, RB 855035 X RB 72454, RB 83102 X TUC 77-42, IAC 87-3396 X RB 855063, SP 71-6949 X RB 83102, RB 72454 X TUC 71-7 e SP 71-6949 X TUC 71-7 para todas as variáveis estudadas. Houve variabilidade genética entre as progênies para todas as variáveis avaliadas, sendo que as estimativas de h2 m foram expressivas para as variáveis TPH, TCH, PCC e BX indicando a possibilidade de êxito na seleção dessas variáveis. Enquanto que no experimento conduzido no Litoral Norte destacaram-se as progênies dos cruzamentos: RB 855035 X RB 72454; H 64-1881 X F-150; RB 865230 X RB 855035; TUC 71-7 X RB 72454; RB 855035 X RB 865230 e RB 72454 X TUC 71-7 para as variáveis TPH, FB, PZA e BX. O resultado das análises genéticas indicou a existência de variabilidade genética entre as progênies dos cruzamentos para todas as variáveis avaliadas, sendo que as estimativas de h2 m foram elevadas para as variáveis TPH, TCH, PCC, BX e ATR, indicando a possibilidade de êxito na seleção dessas variáveis.
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Caracterização morfológica e molecular em genótipos de coentro ( Coriandrum sativum L.) e estudo da variabilidade genética em progênies de meios irmãos na cultivar Verdão.

MELO, Roberto de Albuquerque 17 August 2007 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-21T16:01:30Z No. of bitstreams: 1 Roberto de Albuquerque Melo.pdf: 4133229 bytes, checksum: 12298bb37ac0b402ede66a8d0330cb4b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T16:01:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Roberto de Albuquerque Melo.pdf: 4133229 bytes, checksum: 12298bb37ac0b402ede66a8d0330cb4b (MD5) Previous issue date: 2007-08-17 / A large number of producers are involved in the cultivation of coriander(Coriandrum sativum L.) throughout the year in Brazil, making it a crop of social and economic importance. In order to preserve traditional varieties, it is necessary to harvest and conserve them as well as characterize them both morphologically as well as molecularly so that information may be obtained regarding diversity.Throughout nearly the entire Northeast Region, the Verdão variety is used. Genetic variability studies on coriander are important for the proper planning of genetic improvement programs. The aim of the present study for objectives to characterize morphological and molecular genotypes of coriander, to study the genetic similarity between them and to quantify the genetic variability of variety Verdão,through the evaluation of offspring from half-siblings, for agronomic characters. The following 10 varieties of coriander were used: Americano, Asteca, HTV-9299, Palmeira,Português, Santo, Supéria, Tabocas, Tapacurá and Verdão; as well as 55 offspring from half-siblings of the Verdão variety. Differences between varieties were identified through morphological characteristics. Genetic similarity between varieties was estimated based on both morphological characteristics and ISSR molecular markers. Two dendrograms were generated from the data, with the formation of two distinct clusters in each dendrogram. The ratio between the genetic variation and environmental coefficients (CVg/CVe) regarding the number of bolted plants was 0.27, indicating that selection for bolting presents more favorable conditions in terms of immediate genetic gains. / Um grande número de produtores está envolvido com o cultivo do coentro (Coriandrum sativum L.) durante todo o ano, tornando-a uma cultura de importância social e econômica. Para conservar as cultivares tradicionais é necessário não só efetuar o seu recolhimento e conservação, mas também caracterizá-las morfologicamente e molecularmente para que se obtenha informações sobre a diversidade existente. Praticamente, em toda a região Nordeste utiliza-se a cultivar Verdão. Estudos da variabilidade genética do coentro são importantes, tendo em vista o melhor planejamento de programas de melhoramento genético. Este trabalho tem por objetivos caracterizar morfologicamente e molecularmente genótipos de coentro, estudar a similaridade genética entre eles e quantificar a variabilidade genética da cultivar Verdão, através da avaliação de progênies de meios irmãos, para caracteres agronômicos. Foram utilizados neste estudo, dez cultivares de coentro, dentre eles, Americano,Asteca, HTV-9299, Palmeira, Português, Santo, Supéria, Tabocas,Tapacurá e Verdão e 55 progênies de meios irmãos de coentro cv. Verdão. Baseados nos caracteres morfológicos foram identificados diferenças entre as cultivares. A similaridade genética entre as cultivares foi estimada com base nos caracteres morfológicos e marcadores moleculares de ISSR. Através dos dados moleculares e morfológicos foram gerados dois dendrogramas, onde houve a formação de dois agrupamentos para cada um. Para a razão entre os coeficientes de variação genético e ambiental (CVg/CVe) para número de plantas pendoadas foi de 2,07, indicando que a seleção para pendoamento apresenta as condições mais favoráveis em termos de ganhos genéticos imediatos.
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Interação híbridos de pimentão (Capsicum annuum L.) por sistemas de cultivo

PIMENTA, Samy 24 February 2012 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-21T17:52:25Z No. of bitstreams: 1 Samy Pimenta.pdf: 1905032 bytes, checksum: 1c5ddcfa4def3c2237835c46f3e2fc4e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T17:52:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Samy Pimenta.pdf: 1905032 bytes, checksum: 1c5ddcfa4def3c2237835c46f3e2fc4e (MD5) Previous issue date: 2012-02-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The present study aimed to estimate genetic parameters and predict the genotypic values for different characters involved in commercial sweet pepper hybrids, verifying the adaptability and genotypic stability in the conventional tillage and organic, in order to identify the best performing hybrids for each type of system. The experiments were conducted at the Experimental Station of Luiz Jorge Gama Wanderley - IPA, located in the Greater Region Mata, in Vitoria de Santo Antão - PE, from October 2010 to March 2011. Seven commercial hybrids were evaluated in two cropping systems. The experimental design was randomized blocks with seven treatments, six replications and plots consisting of eight useful plants. There are evaluated the following agronomic variables: total weight of fruits (MTF), total number of fruits (NTF), average length of fruit (CMF), average fruit diameter (MFD), number of locules of the fruit (NL) and thickness middle pericarp (PE). The estimation of genetic parameters and prediction of genotypic values were performed in mixed models via REML / BLUP, using the statistical model and software SELEGEN 21 for individual analysis and the statistical model 151 for the joint analysis of the systems. Selection index based on the sum of the ranks or index Mulamba and Mock (IMM) were used. All characters showed good accuracy in the three tests performed. In conventional systems it was found that the estimates of measure heritability were high for hybrid characters NTF and MTF, ranging from 0.69 to 0.80. For the other traits the average heritability was considered very high, above 90% for CMF, DMF and EP and 89% for the NL character. From the selection index obtained the classification of hybrids with improved performance, the hybrid Solario (Clause), followed by the Atlantis hybrid (Topsed), with absolute sum values equivalent to 10 and 14, respectively. In the organic, system considering the estimates heritability of the average genotype (h2mc), it appears that these were high for the characters TFP and NF respectively, ranging from 0.61 to 0.70. For the others characters evaluated, h2mc was considered high, above 90% for CMF, DMF and EP and 89% for the NL character. Hybrids 1, 5, 7 and 6 showed genotypic values above the average for the characters NTF. For TFP, the hybrids 7, 1, 5 and 2, showed production above the average in this system. By using IMM it was obtained the order of the hybrids with best performance in this system. The Atlantis hybrid (Topsed) and Solario (Clause), with the same sum values, were considered the best ares. In the analysis of two systems the heritability of average genotype (h2mg) was below 80% only for the character NTF, some characters had h2mg close to 100% as CMF and DMF, 99.1% and 98.3% respectively. The genetic correlation between the performance of hybrid systems shows high values of magnitude, indicating that the interaction genotype x systems is low. The hybrid had genotypic effect predicted above average were: for NTF 1, 5, 7 and 6; 7 and 1 to MTF; CMF for 4, 5, 1, 3 and 6 for DMF 7 and 2; to NL 7, 4, 6 and 1, for the hybrid EP 7 and 2. Through IMM, Atlantis hybrid (Topsed) followed by Solario (Clause), got the best selection considering values for all traits, besides good adaptability and stability, and thus can be given for any of the cropping systems of this work. / O presente estudo teve como objetivo estimar os parâmetros genéticos e predizer os valores genotípicos envolvidos para diferentes caracteres de híbridos comerciais de pimentão, verificando a adaptabilidade e estabilidade genotípica nos sistema de cultivo convencional e orgânico, a fim de identificar os híbridos de melhor desempenho para cada tipo de sistema. Os experimentos foram conduzidos na Estação Experimental Luiz Jorge da Gama Wanderley - IPA, localizada na Mesorregião da Mata Pernambucana, em Vitória de Santo Antão PE, no período de outubro de 2010 a março de 2011. Avaliaram-se sete híbridos comerciais em dois sistemas de cultivo. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados, com sete tratamentos, seis repetições e parcela útil constituída por oito plantas. Avaliaram-se as seguintes variáveis agronômicas: massa total de frutos (MTF); número total de frutos (NTF); comprimento médio dos frutos (CMF); diâmetro médio dos frutos (DMF); número de lóculos do fruto (NL) e espessura média do pericarpo (EP). A estimação de parâmetros genéticos e predição dos valores genotípicos foram realizadas na metodologia dos modelos mistos via procedimento REML/BLUP, empregando o software SELEGEN e o modelo estatístico 21 para as análises individuais e o modelo estatístico 151 para a análise conjunta dos sistemas. Foi empregado o índice de seleção baseado na soma dos postos ou índice de Mulamba e Mock (IMM). Todos os caracteres apresentaram boa acurácia nas três análises realizadas. No sistema convencional constatou-se que as estimativas de herdabilidade média dos híbridos foram altas para os caracteres NTF e MTF, variando de 0,69 a 0,80. Para os demais caracteres avaliados a herdabilidade média foi considerada muito alta, acima de 90% para CMF; DMF e EP e 89% para o caráter NL. A partir do índice de seleção obteve-se a classificação dos híbridos com melhor desempenho, sendo o híbrido Solario (Clause), seguido do híbrido Atlantis (Topsed), com valores absolutos de soma equivalentes a 10 e 14 respectivamente. No sistema orgânico, considerando as estimativas de herdabilidade da média de genótipo (h2mc), verificou-se que estas foram altas para os caracteres MTF e NF respectivamente, variando de 0.61 a 0.70. Para os demais caracteres avaliados a h2mc foi considerada alta, acima de 90% para CMF; DMF e EP e 89% para o caráter NL. Os híbridos 1, 5, 7 e 6 apresentaram valores genotípicos acima da média para os caracteres NTF. Já para MTF, foram os híbridos 7, 1, 5 e 2, apresentaram produção acima da média neste sistema. Através do uso IMM obteve-se a ordem dos híbridos com melhor desempenho neste sistema, sendo os híbridos Atlantis (Topsed) e Solario (Clause), apresentando os mesmos valores de soma, considerados os de melhor desempenho . Na análise conjunta dos dois sistemas a herdabilidade da média de genótipo (h2mg) foi abaixo de 80% apenas para o caráter NTF, alguns caracteres apresentaram h2mg próximas de 100% como CMF e DMF, 99,1% e 98,3%, respectivamente. A correlação genotípica entre o desempenho dos híbridos para os sistemas mostra valores de alta magnitude, indicando que a interação genótipos x sistemas é baixa. Os híbridos que obtiveram efeito genotípico predito acima da média foram: 1, 5, 7 e 6 para NTF; 7 e 1 para MTF; 4, 5, 1, 3 e 6 para CMF; 7 e 2 para DMF; 7, 4, 6 e 1 para NL; os híbridos 7 e 2 para EP. Através do IMM, o híbrido Atlantis (Topsed) seguido do Solario (Clause), obteve os melhores valores para seleção considerando todos os caracteres avaliados, alem de boa adaptabilidade e estabilidade, podendo assim serem indicados para qualquer um dos sistemas de cultivo deste trabalho.
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Endogamia, componentes da vari?ncia e heterose em caracteres agron?micos em milheto perola (Pennisetum glaucum, (L) R. Brown) / Inbreeding, components of variance and heterosis of agronomics characters of pearl millet (Pennisetum glaucum, (L) R. Brown)

Soares, Elizene Damasceno Rodrigues 25 July 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-28T14:58:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2005-Elizene Damasceno Rodrigues Soares.pdf: 4704353 bytes, checksum: 834cc93f8312128fc3208fb557e53976 (MD5) Previous issue date: 2005-07-25 / Funda??o Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / This work was divided in two chapters. Chapter had as objective to evaluate the effect of inbreeding and to estimate genetic parameters using free pollination (S0) and of self pollination (S1) progenies, in a pearl millet population originated from a bulk obtained by the mixture of three cultivar, Souna III, HKP and Guerguera. Chapter II had as objective to study general (GCA) and specific (SCA) combination ability and reciprocal effects using the methodology proposed by Griffing (1956), and the effect of heterosis by the methodology proposed by Gardner and Eberhart (1966) in a diallel cross among six pearl millet cultivar: SOUNA III, HKP and GUERGUERA, (African origin) and BRS 1501, BN2 and IAPAR (Brazilian origin). In chapter one, fifty plants from the bulk were used to obtain S0 (open pollination) and S1 (self pollination) families. The 100 families were evaluated in a triple latice 10x10. Results indicate that there was significant mean depression (P <0,01) for all characters, except for the number of leaves and angle of the second leaf. Four families that jointly presented the characters for grain yield and biomass simultaneously with low depression were selected. The mean heritability estimated was larger in S1 families for all the characters, except for diameter of the stem. The individual heritability presented the smaller values in S1. The variance components D1 and D2 presented high values for all the characters, and all D1 estimates were negatives. Simulations of the quadratic components of the genetic variance (additive variance, dominance variance, D1, D2 and H2) and for genetic progress, with different self pollination rates, showed that, for all characters, estimates practically did not vary up to a rate of 10% of self pollination. In chapter II, the results indicated that HKP, Guerguera and BRS 1501 had the largest values for GCA for the characteristics of biomass. Considering the values of CGC and CEC, the most promising combinations were: IAPAR x BRS 1501, mainly because CEC and Guerguera x Souna III, that had high values of CGC and CEC. HKP, Guerguera and BRS 1501 had the largest values of CGC for panicle length, BRS 1501, Guerguera and Souna III had the largest values of CGC for panicle diameter, traits that compose grain yield. For grain yield, considering the values of CGC and CEC, the most promising combinations were: GUERGUERA X BRS 1501 and SOUNA III X BRS 1501. For these progenitors, heterosis for biomass and grains yield was not significant. However, heterosis was significant for plant height, stem diameter, leaves number, leaf length, which influence on the biomass production, and in the characters panicles length and diameter, which are component of grains yield. / Esse trabalho foi dividido em dois cap?tulos. O Cap?tulo I teve como objetivo avaliar o efeito da endogamia e estimar par?metros gen?ticos utilizando prog?nies de poliniza??o livre (S0) e de autofecunda??o (S1), em uma popula??o de milheto p?rola proveniente de um composto obtido pela mistura das cultivares Souna III, HKP e Guerguera. O Cap?tulo II teve como objetivo avaliar a capacidade geral de combina??o (CGC), capacidade espec?fica de combina??o (CEC) e o efeito rec?proco (ER) no cruzamento dial?lico atrav?s da metodologia proposta por Griffing (1956), e estudar o efeito da heterose pela metodologia proposta por Gardner e Eberhart (1966). Para isso, utilizaram-se seis cultivares de milheto p?rola: Souna III, HKP e Guerguera, (origem africana) e BRS 1501, BN2 e IAPAR (origem brasileira). Quanto ao cap?tulo I, cinq?enta plantas tomadas ao acaso da popula??o base foram utilizadas para obten??o das fam?lias S0 e S1. As 100 fam?lias foram avaliadas em um l?tice triplo 10x10. Os resultados indicaram que houve depress?o m?dia significativa (P < 0,01) para todos os caracteres, exceto para o n?mero de folhas e ?ngulo da 2? folha. Foram selecionadas quatro fam?lias que agregaram simultaneamente os caracteres produ??o de gr?os e de palhada que apresentaram m?dias desejadas e como baixa depress?o. As estimativas de herdabilidade ao n?vel de m?dias foram maiores nas fam?lias S1 para todos os caracteres, exceto para di?metro do colmo. J? as estimativas das herdabilidades individuais apresentaram os valores na S1 menores. Os componentes de vari?ncia D1 e D2 apresentaram valores altos para todos os caracteres, sendo as estimativas do D1 todas negativas. Simula??es efetuadas dos componentes quadr?ticos da vari?ncia gen?tica (&#963;2A, &#963;2D, D1, D2 e H2 ) e para progresso gen?tico em fun??o de diferentes taxas de autofecunda??o, mostraram que para todos os caracteres as estimativas praticamente n?o variaram at? uma taxa de autofecunda??o igual a 10%. Quanto ao cap?tulo II, os resultados indicaram que HKP, Guerguera e BRS 1501 tiveram os maiores valores para CGC para as caracter?sticas que comp?em a massa seca. Considerando os valores da CGC e CEC, as combina??es mais promissoras foram: IAPAR x BRS 1501, que se destacou principalmente devido ? CEC e Guerguera x Souna III, que teve valores altos para CGC e CEC. HKP, Guerguera e BRS 1501 tiveram os maiores valores para CGC para comprimento da pan?cula, BRS 1501, Guerguera e Souna III tiveram os maiores valores para CGC para di?metro da pan?cula, caracter?sticas que comp?em a produ??o de gr?os. Considerando os valores da CGC e CEC, as combina??es mais promissoras para produ??o de gr?os foram: Guerguera x BRS 1501 e Souna III x BRS 1501. Para os progenitores estudados, a heterose para os caracteres massa seca e produ??o de gr?os n?o foi significativa. Por?m, foi significativa nos caracteres altura da planta, di?metro do colmo, n?mero de folhas, comprimento da folha, os quais influem na produ??o de massa seca, e nos caracteres comprimento e di?metro das pan?culas, os quais s?o componentes da produ??o de gr?os. Portanto, ? poss?vel direcionar o melhoramento do milheto para a forma??o de h?bridos. Palavras chaves: Endogamia, componentes da vari?ncia, herdabilidade, milheto p?rola.Esse trabalho foi dividido em dois cap?tulos. O Cap?tulo I teve como objetivo avaliar o efeito da endogamia e estimar par?metros gen?ticos utilizando prog?nies de poliniza??o livre (S0) e de autofecunda??o (S1), em uma popula??o de milheto p?rola proveniente de um composto obtido pela mistura das cultivares Souna III, HKP e Guerguera. O Cap?tulo II teve como objetivo avaliar a capacidade geral de combina??o (CGC), capacidade espec?fica de combina??o (CEC) e o efeito rec?proco (ER) no cruzamento dial?lico atrav?s da metodologia proposta por Griffing (1956), e estudar o efeito da heterose pela metodologia proposta por Gardner e Eberhart (1966). Para isso, utilizaram-se seis cultivares de milheto p?rola: Souna III, HKP e Guerguera, (origem africana) e BRS 1501, BN2 e IAPAR (origem brasileira). Quanto ao cap?tulo I, cinq?enta plantas tomadas ao acaso da popula??o base foram utilizadas para obten??o das fam?lias S0 e S1. As 100 fam?lias foram avaliadas em um l?tice triplo 10x10. Os resultados indicaram que houve depress?o m?dia significativa (P < 0,01) para todos os caracteres, exceto para o n?mero de folhas e ?ngulo da 2? folha. Foram selecionadas quatro fam?lias que agregaram simultaneamente os caracteres produ??o de gr?os e de palhada que apresentaram m?dias desejadas e como baixa depress?o. As estimativas de herdabilidade ao n?vel de m?dias foram maiores nas fam?lias S1 para todos os caracteres, exceto para di?metro do colmo. J? as estimativas das herdabilidades individuais apresentaram os valores na S1 menores. Os componentes de vari?ncia D1 e D2 apresentaram valores altos para todos os caracteres, sendo as estimativas do D1 todas negativas. Simula??es efetuadas dos componentes quadr?ticos da vari?ncia gen?tica (&#963;2A, &#963;2D, D1, D2 e H2 ) e para progresso gen?tico em fun??o de diferentes taxas de autofecunda??o, mostraram que para todos os caracteres as estimativas praticamente n?o variaram at? uma taxa de autofecunda??o igual a 10%. Quanto ao cap?tulo II, os resultados indicaram que HKP, Guerguera e BRS 1501 tiveram os maiores valores para CGC para as caracter?sticas que comp?em a massa seca. Considerando os valores da CGC e CEC, as combina??es mais promissoras foram: IAPAR x BRS 1501, que se destacou principalmente devido ? CEC e Guerguera x Souna III, que teve valores altos para CGC e CEC. HKP, Guerguera e BRS 1501 tiveram os maiores valores para CGC para comprimento da pan?cula, BRS 1501, Guerguera e Souna III tiveram os maiores valores para CGC para di?metro da pan?cula, caracter?sticas que comp?em a produ??o de gr?os. Considerando os valores da CGC e CEC, as combina??es mais promissoras para produ??o de gr?os foram: Guerguera x BRS 1501 e Souna III x BRS 1501. Para os progenitores estudados, a heterose para os caracteres massa seca e produ??o de gr?os n?o foi significativa. Por?m, foi significativa nos caracteres altura da planta, di?metro do colmo, n?mero de folhas, comprimento da folha, os quais influem na produ??o de massa seca, e nos caracteres comprimento e di?metro das pan?culas, os quais s?o componentes da produ??o de gr?os. Portanto, ? poss?vel direcionar o melhoramento do milheto para a forma??o de h?bridos.
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Herdabilidade e Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) de atividade física autorreportada: uma investigação de famílias brasileiras / Heritability and Genome-Wide Association Study of self-reported physical Activity: a brazilian family-based investigation.

Leite, Jean Michel Rocha Sampaio 09 August 2019 (has links)
O advento das tecnologias de sequenciamento de DNA e sua revolução na ciência tem gerado uma quantidade imensa e sem precedentes de informações moleculares. Assim, estudos atuais em diversas áreas objetivam principalmente analisar a associação entre centenas a milhões de variantes genéticas e fenótipos de interesse. Dentre essas variações moleculares, destaque tem sido dado aos SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) e CNVs (variações no número de cópias), os quais têm sido implicados na variabilidade e manifestação de diversos fenótipos, incluindo os relacionados à atividade fisica e desempenho esportivo. No Brasil, algumas iniciativas têm trazido luz à contribuição genética nessas características, como o Projeto Atletas do Futuro e o Projeto Corações de Baependi. Considerando a alta miscigenação que caracteriza a população brasileira, a qual traz grandes desafios, e levando em conta que este último estudo é pioneiro em considerar a estrutura familiar com uma riqueza de informações moleculares e fenotípicas única, nosso objetivo neste trabalho é, fazendo uso desses dados, investigar o papel de variantes genéticas, em particular SNPs e CNVs, na manifestação de comportamentos sedentários e no engajar em atividade física leve, moderada e intensa, verificando a possível existência de heterogeneidades relativamente ao sexo dos indivíduos. As informações referentes a SNPs e CNVs são provenientes do Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 que, após processamento e limpeza, consiste de um número final de cerca de 843.039 SNPs e 8.974 CNVs. Dados fenotípicos de atividade física e sedentarismo para 760 indivíduos foram derivados do questionário IPAQ-SF e ajustados por uma medida de gasto energético de equivalentes metabólicos de tarefa (METs). A análise descritiva dessas variáveis mostrou uma prevalência de atividade física de 55,3%, sendo maior para homens que para mulheres. Além disso, utilizando os modelos lineares mistos poligênicos e a abordagem de componentes de variância, estimamos a herdabilidade (h2) desses fenótipos obtendo valores de 0,21, 0,11, 0,22 e 0,28 para atividade física total, leve, moderada-vigorosa e sedentarismo, respectivamente. Foi identificado heterogeneidade em relação ao sexo, em geral com h2 de homens sendo maiores que a de mulheres. O mapeamento gênico (GWAS) de SNPs e CNVs identificou potenciais picos de associação sob a correção de Bonferroni e sob um critério mais flexível, especialmente nos cromossomos 3, 5 e 6. Essas variantes carecem ainda de informação quanto às suas funções biológicas, as quais podem ser melhor compreendidas através de procedimentos de anotação usando bases de dados como o SCAN. / The onset of DNA sequencing technologies and its revolution in Science generates an unprecedent and large amount of molecular information. Thus, the current studies in multiple areas aim to evaluate the association between hundreds to thousands of genetic variants and phenotypes of interest. Among these variants, the ones that have received most of the focus are Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and Copy Number Variations (CNVs), which have been implicated in the variability and manifestation of multiple phenotypes, including the ones related to physical activity and sports performance. In Brazil, some initiatives have brought light to the genetic contribution in these features, such as the project Atletas do Futuro and the project Corações de Baependi. The later is a pioneer study that considers the pedigree structure of a highly admixed population with a unique and rich amount of molecular and phenotypic information. Thus, our role is to investigate the role of genetic variants, in particular SNPs and CNVs, in the manifestation of sedentary behaviour and practice of light, moderate and vigorous physical activity, checking for the existence of heterogeneity related to sex. SNP and CNV information was acquired through the Affymetrics TM 6.0 SNP Array, processed and cleaned, leading to a final number of 843,039 SNPs. and 8,794 CNVs. Sedentarism and physical activity data of 760 individuals were gathered through the IPAQ-SF and adjusted by a measure of metabolic energy cost named metabolic equivalent tasks (METs). The descriptive analysis showed a total physical activity prevalence of 55.3% and mens one was higher than womens. In addition, using linear mixed polygenic model and the variance components approach, we estimated the heritability of these phenotypes obtaining the values 0.21, 0.11, 0.22 e 0.28 for total, weak, moderate-vigorous physical activities and sedentary behaviour, respectively. There was sex-related heterogeneity in the h2, with men having higher estimates than women for most of the evaluated phenotypes. In addition, GWAS of SNPs and CNVs showed several potential candidate markers, especially after using a more flexible significance criteria. These markers were present mainly in chromosomes 3, 5 and 6, and their possible biological functions remain to be clarified through annotation procedures, using databases such as SCAN.

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