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Modelos de análise de dados de provas de ganho em peso de bovinos da raça Nelore

Oliveira Junior, Braz Costa de [UNESP] 31 July 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-31Bitstream added on 2014-06-13T18:54:04Z : No. of bitstreams: 1 oliveirajunior_bc_me_jabo.pdf: 377876 bytes, checksum: 959f8b30ee240eb826bbd8afca79e17a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / dados de prova de ganho em peso (PGP) em confinamento, visando aumento na resposta à seleção pela inclusão de informações de parentesco nas estimativas dos parâmetros genéticos, assim como na acurácia dos valores genéticos estimados e na classificação final dos animais. As características analisadas foram o peso ao final da PGP (P378), o ganho em peso após o período de adaptação (G112), um índice considerando P378 e G112 (IPGP), além do peso inicial e dois pesos intermediários. Foram utilizadas 18.825 mensurações de pesos de 4.758 animais. Os modelos de dimensão finita considerados incluíram os efeitos fixos de mês e ano de nascimento (1977 a 2006) e classe de idade da mãe ao parto (2 a ≥12 anos), além do efeito linear da idade do animal no início da PGP como covariável. Quanto aos efeitos genéticos, foram considerados dois modelos, um só com o efeito genético direto e outro incluindo o efeito de ambiente permanente materno. Os modelos de regressão aleatória incluíram, como aleatórios, os efeitos genéticos aditivos direto, de ambiente permanente direto e materno e, como fixos, os efeitos de grupo de contemporâneos, a classe de idade da vaca ao parto e o polinômio ortogonal de Legendre da idade do animal (regressão quadrática), como covariáveis. Para comparar os resultados obtidos pelos modelos de regressão aleatória, foram conduzidas análises multicaracterísticas. Um total de 13 modelos de regressão aleatória, aplicando polinômios de segunda a quinta ordem foram considerados para modelar os efeitos genéticos aditivos direto e de ambiente permanente direto e materno. O resíduo foi modelado considerando 1, 3, 4, 6 e 9 classes de variâncias. O modelo contendo 4 classes de variâncias foi o que melhor descreveu o comportamento da trajetória para o efeito... / This work was carried through with the objective of study different analysis forms of datasets regarding weight gain test (PGP) in feedlot, aiming improve in selection response through the inclusion of kinship information on estimates of genetic parameters, as well as in the estimated breeding values accuracy and in the final classification of the animals. We analyzed the characteristics weight at the end of PGP (P378), the weight gain after adaptation period (G112), an index considering P378 and G112 (IPGP), as well as the initial weight and two intermediate weights. 18,825 records of weights from 4.758 animals had been used. The considered models of finite dimension had included the fixed effects of year of birth (1977 to 2006) and cow age at birth class (2 ≥12 years), as well as the linear effect of the age of the animal at the PGP beginning as covariate. In spite the genetic analyses, we considered two models: one only with the direct genetic effect and another one including the maternal permanent environment effect. The random regression models included, as random, the additive direct genetic effect, the permanent direct and maternal environment effect, and, as fixed effects, the contemporary group, age of cow at birth class and the Legendre orthogonal polynomial of the animal age (quadratic regression), as covariates. In order to compare the achieved results for the models of random regression, we precede multicharacteristic analysis. A total of 15 models of random regression, applying polynomials of second to fifth order had been considered to fit the additive direct genetic effect and direct and maternal permanent environment effects. The residual was fitted considering 1, 3, 4, 6 and 9 variance classes. The model containing 4 variance classes was the ones that better described the trajectory... (Complete abstract click electronic access below)
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Estimativas de parâmetros genéticos para escores de avaliação visual, peso e perímetro escrotal à desmama de bovinos da raça Canchim

Barichello, Fabiana [UNESP] 23 February 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-23Bitstream added on 2014-06-13T18:29:31Z : No. of bitstreams: 1 barichello_f_me_jabo.pdf: 1755969 bytes, checksum: 58196e39638a27ecef91186ab15ab3eb (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Neste trabalho, avaliaram-se os efeitos de ano e época de nascimento, proprietário, sexo do bezerro, regime alimentar, idade do bezerro e idade da vaca ao parto e os efeitos aditivos direto e materno da raça Charolesa e heterótico materno entre as raças Charolesa e zebu sobre o peso (P225), o perímetro escrotal (PE) e os escores visuais de conformação frigorífica (CF), de umbigo (UM) e de pelagem (PEL) à desmama e estimaram-se parâmetros genéticos para essas características, utilizando-se dados de, respectivamente, 12.103, 5.278, 8.343, 9.111 e 7.986 animais Canchim nascidos de 1999 a 2005. Os resultados indicaram, em geral, efeitos significativos de todas essas fontes de variação sobre as características estudadas. Foram avaliados diferentes modelos estatísticos que incluíram, além de efeitos fixos, os efeitos aleatórios genéticos aditivos direto e materno e de ambiente permanente materno, em diferentes combinações, em análises feitas pelo método da máxima verossimilhança restrita. O modelo completo (efeitos genético aditivos direto e materno e de ambiente permanente) foi o mais adequado para P225, PE, CF e UM, e o modelo sem o efeito de ambiente permanente foi adequado para PEL. As estimativas de herdabilidade direta foram 0,17; 0,13; 0,20; 0,18 e 0,52 para P225, PE, CF, UM e PEL, respectivamente, indicando a possibilidade de se obter progresso genético para essas características, principalmente PEL. As correlações genéticas aditivas diretas entre as características foram, em geral, baixas, com exceção daquelas de P225 com PE (0,38) e CF (0,61), indicando que seleção para P225 proporcionará respostas correlacionadas em PE e CF. / Year and season of birth, herd, sex of calf, feeding regime, age of calf and age of dam effects, additive direct and maternal effects of the Charolais breed, and heterotic effects of the Charolais and Zebu breeds on weight (WW), scrotal circumference (SC) and visual scores for slaughter conformation (CON), sheath and navel (SN), and hair coat (HC) at weaning were evaluated, and genetic parameters for these traits were estimated, using data on, respectively, 12,103, 5,278, 8,343, 9,111 and 7,986 Canchim animals born from 1999 to 2005. The results, in general, indicated that all traits were affected by these genetic and non genetic effects. Statistical models, which included fixed effects and different combinations of additive direct, additive maternal, and permanent environmental random effects, in restricted maximum likelihood analyses, were evaluated. The complete model, with all three random effects, was the best one for WW, SC, CON and SN, and the model without the permanent environmental effect was adequate for HC. The direct heritability estimates were 0.17, 0.13, 0.20, 0.18 and 0.52 for WW, SC, CON, SN and HC, respectively, indicating that it is possible to obtain genetic progress for these traits by selection, mainly for HC. The additive direct genetic correlations among the traits were, in general, low, except for WW with SC (0.38) and CON (0.61), indicating that selection to improve WW should result in correlated response in SC and CON.
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Estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça avaliadas por ultrassom, com ênfase na gordura intramuscular, em bovinos Nelore / Estimation of genetic parameters for carcass traits measured by ultrasound, with emphasis on intramuscular fat, in Nellore

Danielle Leal Matarim 07 July 2015 (has links)
Este trabalho foi desenvolvido visando a estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça obtidas por ultrassonografia em bovinos da raça Nelore. Foram analisadas as informações de 13.256 animais, machos e fêmeas, com idade entre 10 e 25 meses, provenientes de cinco propriedades distintas, pertencentes ao programa de melhoramento genético da Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). As características de carcaça avaliadas por ultrassonografia foram área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), espessura de gordura na garupa (EGG), percentagem de gordura intramuscular (PGIM), além do peso na data da avaliação e das estimativas do peso e da percentagem da porção comestível (PESPC e PERPC, respectivamente). Foram estimadas a herdabilidade, correlações genéticas e fenotípicas, além da tendência genética observada no período avaliado. As herdabilidades observadas foram de moderada magnitude (0,18 a 0,37), suportando a recomendação de seleção para as características de carcaça. As correlações da gordura intramuscular com as demais variáveis foram, em sua maioria, próximas de zero, com exceção para as correlações com a área de olho de lombo e com o peso da porção comestível, cujos valores negativos devem ser considerados nos critérios de seleção. O efeito da idade sob as características permite afirmar que as avaliações por ultrassonografia podem ser obtidas em idade precoce. Os resultados indicaram ainda que a inclusão das DEPs de carcaça tem proporcionado melhorias na área de olho de lombo e nas espessuras de gordura, no entanto a percentagem da gordura intramuscular e o rendimento dos cortes cárneos não apresentaram progresso uniforme na população e período avaliados. / This work was developed aiming to estimate genetic parameters for carcass traits obtained by ultrasound in Nelore cattle. The information of 13,256 animals were analyzed, male and female, with ages between 10 and 25 months, from five distinct properties, belonging to the genetic improvement program of the Associação Nacional de Criadores e Produtores (ANCP). The carcass characteristics evaluated by ultrasonography were: rib eye area (REA), subcutaneous back fat thickness (BF), rump fat thickness (RF), percentage of intramuscular fat (IMF), also the weight on the valuation date, estimates of weight and percentage of retail product. Heritability, genetic and phenotypic correlations were estimated, in addition to the genetic tendency observed during the study period. Observed heritability had moderate magnitude (0,18 to 0,37), corroborating the selection recommendation for carcass traits. The percentage of intramuscular fat correlations with other features were mostly close to zero, except for correlations with the loin eye area and the weight of retail product, whose negative values should be considered in the selection criteria. The effect of age on the observed features suggest that the ultrasound evaluation can be held at an early age. The results also indicated that the inclusion of expected progeny differences (EPDs) has provided improvements in REA and BF, however the intramuscular fat and yield of meat cuts showed no uniform progress in the population and the evaluated period.
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Parâmetros genéticos para características de temperamento em bovinos da raça Canchim / Genetic parameters for temperament of Canchim cattle

Mussato, Vânia Casari [UNESP] 11 April 2017 (has links)
Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-04-25T16:10:19Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Vania_Casari_Mussato.pdf: 1286922 bytes, checksum: 0057f368a3285e7a1e5ec62f97e96210 (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido não contém o certificado de aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão com o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-04-26T16:29:37Z (GMT) / Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-05-08T22:39:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Vania_Casari_Mussato.pdf: 1286922 bytes, checksum: 0057f368a3285e7a1e5ec62f97e96210 (MD5) dissertação_Vania_casari1.pdf: 1221552 bytes, checksum: 8063cdb0ce0e0bc36ba902406d97e5e8 (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: Foram submetidos 2 arquivos PDF’s, apenas 1 arquivo deve ser submetido. O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive os apêndices e anexos, se houver. Corrija estas informações e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-05-09T20:13:06Z (GMT) / Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-05-14T14:37:36Z No. of bitstreams: 1 DissertaçãoFinal_Vânia_Casari_Mussato.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-16T12:49:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 mussato_vc_me_jabo.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-16T12:49:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mussato_vc_me_jabo.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) Previous issue date: 2017-04-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / As medidas de temperamento possuem notória relevância econômica devido a sua associação com características de interesse produtivo. Essas medidas podem ser utilizadas como critérios de seleção de bovinos, requerendo identificação de fatores ambientais que as influenciem, assim como a verificação de variabilidade genética e a inter-relação destas com as demais características de interesse ao sistema de produção. O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos, fenotípicos e ambientais de quatro medidas de avaliação do temperamento de bovinos da raça Canchim. As medidas de temperamento utilizadas foram: tempo de saída (TS), escore composto de temperamento (ECT), escore total (ET) e reatividade (REAT). Neste trabalho foram analisadas 2090 informações de bovinos da raça Canchim provenientes da fazenda Canchim, pertencente à Embrapa Pecuária Sudeste, situada na cidade de São Carlos, SP. As características foram analisadas utilizando-se um modelo animal, por meio de análises bi-característica. Para todas as características, o grupo de contemporâneos (GC) foi formado por animais nascidos no mesmo ano e pertencentes ao mesmo sexo. As avaliações foram realizadas durante as fases de desmama, ano e sobreano. As medidas de temperamento apresentaram estimativas de herdabilidade que variaram de 0,07 (0,142) (TS na desmama) a 0,36 (0,240) (TS, ao sobreano). As baixas magnitudes das estimativas indicam que as características são influenciadas principalmente por práticas de manejo e pelas condições ambientais, sendo importante o conhecimento de tais fatores para ações de seleção. As estimativas de correlação genética foram maiores entre ETxREAT (1,00 no sobreano), enquanto entre ETxTS e REATxTS as estimativas foram de -0,26 e -0,43, respectivamente no sobreano. As correlações genéticas estimadas entre as medidas de temperamento sugerem que os mesmos conjuntos de genes aditivos atuam na determinação das diferentes medidas de temperamento. Os coeficientes de repetibilidade foram 0,34, 0,57 e 0,43 para as variáveis ET, REAT e TS, respectivamente. Os resultados demonstram que o temperamento pode vir a ser utilizado como critério de seleção visando obter animais mais dóceis. / Temperament is a trait of notable economic relevance, due to its association with management and productive trait, and can be used as a selection criterion of cattle, requiring identification of environmental factors that influence, as well as the verification of genetic variability and the interrelationship with the other characteristics of interest to the production system. The objective of this study was to estimate genetic, phenotypic and environmental parameters using four measures of temperament evaluated on Canchim cattle. The temperament measures used were: flight speed (TS), composite score of temperament (ECT), total score of temperament (ET) and reactivity (REAT). This study analyzed 2090 information of Canchim cattle from the Canchim farm belonging to Embrapa Pecuária Sudeste, located at São Carlos, SP. The temperament traits were analyzed using an animal model, through bi-trait analyzes. For all traits, the contemporaries group (CG) was formed by animals born in the same year and belonging to the same sex. The evaluations were carried out during the weaning, yearling and long yearling phases. The temperament measures showed heritability estimates ranging from 0,07 (0,142) (TS at weaning) to 0,36 (0,240) (TS at yearling) values of moderate to low magnitude that were influenced by management practices and environmental conditions, being important knowledge such factors for selection actions. The genetic correlation estimates were higher for ETxREAT (1.00 at long yearling), while for ETxTS and REATxTS they presented values of -0.26 and -0.43, respectively during long yearling. The estimated genetic correlations between the temperament measures suggest that the same sets of additive genes act to determine the different measures of temperament. The repeatability coefficients were 0.34, 0.57 and 0.43 for the ET, REAT and TS variables, respectively. The results show that temperament can be used as a selection criterion in order to obtain more docile animals.
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Parâmetros genéticos em progênies de meio-irmãos para caracteres de emergência e crescimento inicial de Dipteryx alata Vogel e Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos em viveiro

Almeida, Bruna Cristina 26 February 2015 (has links)
Submitted by Valquíria Barbieri (kikibarbi@hotmail.com) on 2018-04-30T22:59:03Z No. of bitstreams: 1 DISS_2015_Bruna Cristina Almeida.pdf: 760741 bytes, checksum: 9cd1853b36925a6e0aa46652c5ac4c2b (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2018-05-16T14:57:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2015_Bruna Cristina Almeida.pdf: 760741 bytes, checksum: 9cd1853b36925a6e0aa46652c5ac4c2b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T14:57:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2015_Bruna Cristina Almeida.pdf: 760741 bytes, checksum: 9cd1853b36925a6e0aa46652c5ac4c2b (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / CAPES / O conhecimento da variabilidade genética através da mensuração de caracteres biométricos pode ser uma das alternativas para auxiliar em programas de conservação genética e também em programas de melhoramento florestal. No presente trabalho objetivou-se analisar e estimar parâmetros genéticos, correlações genéticas entre caracteres de emergência e crescimento inicial de D. alata e H. heptaphyllus, em viveiro. O delineamento para todos os experimentos foram de blocos ao acaso e 28 tratamentos. Para D. alata foram cinco plantas por parcela e cinco blocos e para H. heptaphyllus foram seis blocos e seis mudas por parcela. Aos 30 dias para emergência foram avaliadas porcentagem, tempo médio e índice de velocidade de emergência e para as mudas de D. alata (aos 30 dias) a sobrevivência; altura da parte aérea (cm); diâmetro do colo (cm).Após 140 dias foram avaliadas as seguintes variáveis: sobrevivência; altura da parte aérea (cm); comprimento da raiz (cm); diâmetro do colo (cm), massas secas (folhas, caule e raízes) (g) para H. heptaphyllus. Os caracteres foram analisados por meio da metodologia de modelos mistos, procedimento REML (Máxima Verossimilhança Restrita) / BLUP (Melhor Predição Linear não Viesada). Foram plicados aos testes de progênies de meios-irmãos, delineamento de blocos ao acaso, várias plantas por parcela, conforme o modelo um do software SELEGEN-REML/BLUP para as mudas de H. heptaphyllus e D. alata, para emergência foi utilizado o modelo 95. Os valores de herdabilidades individuais e médias de progênies, acurácia, os coeficientes de variação genética individual e experimental foram considerados altos para mudas de D. alata. Os valores de herdabilidades individuais e médias de progênies, acurácia seletiva obtidas foram de alta magnitude para maioria dos caracteres avaliados, os coeficientes de variação genética individual e experimental foram considerados altos para mudas de H. heptaphyllus. Os valores de herdabilidade individual e média de progênies, acurácia seletiva para caráter IVE foram de alta magnitude. Assim os resultados indicam que existe variabilidade genética para todos os caracteres avaliados para mudas de H. heptaphyllus e existe variabilidade genética para os caracteres IVE para emergência e altura da parte área para plântulas de D. alata. / Knowledge of the genetic variability by measuring biometric characters can be one of the alternatives to aid in genetic conservation programs and also in forest breeding programs. In the present study aimed to analyze and estimate genetic parameters, genetic correlations between emergency character and initial growth of D. alata and H. heptaphyllus in nursery. The design for all experiments were randomized blocks and 28 treatments. For D. alata were five plants per plot and five blocks and H. heptaphyllus were six blocks and six plants per plot. On 30 days for emergency were evaluated percentage, average time and emergence speed index and the seedlings of D. alata (30 days): suvirvor, shoot height (cm); stem diameter (cm). After 140 days the following variables were evaluated: survival; shoot height (cm); root length ( cm ); stem diameter (cm), dried mass (leaves, stems and roots) ( g ) for H. heptaphyllus. The characters were analyzed using mixed model methodology, REML (Restricted Maximum Likelihood)/BLUP (Best Linear Unbiased Prediction). It was applied to the test progenies of half- sib, design of randomized blocks, several plants per plot, according to the pattern 1 SELEGEN - REML / BLUP software for H. heptaphyllus and D. alata seedlings, was used for emergency model 95. Individual heritability values and medium progenies accuracy, the coefficients of individual and experimental genetic variation were considered high for D. alata seedlings. Individual heritability values and average of progenies, selective accuracy obtained was of high magnitude for most characters, the coefficients of individual and experimental genetic variation were considered high for H. heptaphyllus seedlings. The values of individual heritability and average of progenies, selective accuracy for IVE character were of the highest magnitude. Thus the results indicate that there is genetic variability for all traits for H. heptaphyllus seedlings and there is genetic variability for the IVE characters for emergency and height of the area for seedlings of D. alata.
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Estudo do peso metabólico e índice de Kleiber na estimação de parâmetros genéticos de características ponderais em uma população de bovinos de raça brahman

Manuel, Matos January 2016 (has links)
Orientador: Ricardo da Fonseca / Resumo: Com vista à padronizar as análises, os programas de melhoramento genético na pecuária de corte estabelecem determinadas idades nas quais os pesos são ajustados antes de serem avaliados e no processo de seleção, as estimativas de variabilidade genética aditiva são muito importante. Neste estudo propusemos estimar parâmetros genéticos para pesos ajustados a desmama (P205), ao 1 ano (P365) e sobreano (P550), peso metabólico ajustados (PMa205), ao 1 ano (PMa365), sobreano (PMa550) e peso metabólico real (PMr205), ao 1 ano (PMr365) e sobreano (PMr550), e estimar parâmetros genéticos para índice de kleiber (IK), ganho de peso diário (GPD) para entendimento das potenciais respostas à seleção e subsidiar a elaboração de estratégias de melhoramento. Análises genéticas foram realizadas em registros de animais do arquivo de dados com 36.505 animais pertencente à ABCZ (Associação Brasileira de Criadores de Zebu) sob dois modelos distintos. O modelo 1 incluiu o efeito genético aditivo direto e residual como aleatórios, além dos efeitos fixos do grupo de contemporâneos, definido pelas variáveis: fazenda de origem do animal junto ao criador, sexo, estação de nascimento, e o ano de nascimento, para características de pesos ajustados a P365, P550, peso metabólico ajustado PMa365, PMa550, peso metabólico real PMr365, PMr550 dias, ganho de peso GP205365, ganho de pesos GP365550, índice de Kleiber IK365 e índice de Kleiber IK550 dias. O modelo 2 incluiu, o efeito genético aditivo direto, mater... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In order to standardize the analysis, breeding programs in beef cattle establish certain ages in which the weights are adjusted before being evaluated, and in the selection process, the additive genetic variability estimates are very important. In this study, proposed to estimate genetic parameters for weights adjusted weaning (W205) to one year (W365) and yearling (W550), metabolic weight adjusted weaning (AMW205) to one year (AMW365) and yearling (AMW550) and weight real metabolic weaning (RMW205) to one year (RMW365) and yearling (RMW550) to estimate genetic parameters to Kleiber index (KI), avarage daily weight gained (ADWG), for more comprehensive understanding of potential responses to selection and to support the development of the breed improvement strategies and to demonstrate the consequences of the metabolic weight value, without any correction for age on the estimation of variance components and prediction of genetic values. Genetic analyzes were conducted on animals records of the data file with 36,505 animals belonging to ABCZ (Brazilian Association of Zebu Breeders) in two different models. Model 1 included direct additive genetic effect and residual as random, besides the fixed effects of contemporary group, defined by variables: the animal farm origin with the creator, sex, birth season, and year of birth, for features of W365, W550, AMW365, AMW550, RMW365 and RMW550, weight gain of WG205365; weight gain WG365550; Kleiber index KI365 and Kleiber index to KI5... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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AvaliaÃÃo genÃtica de caracterÃsticas produtivas e reprodutivas de animais da raÃa Girolando / Genetic evaluation of productive and reproductive characteristics of animals Girolando

Assis Rubens Montenegro 29 January 2013 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / In order to estimate genetic parameters and correlated response to first milk production at 305 days (P305), age at first calving (IPP), first calving interval (IDP) and projected production (PP) Girolando created in Brazil, analyzed 9,632 records of births collected in several Brazilian herds in the period 2000-2010. The production of milk in 305 days, age at first calving, first calving interval and projected productions were analyzed using an animal model in univariate and bivariate. For P305 and IDP, the model included the fixed effects of contemporary group (CG), season of calving and cow age in days as a covariate (linear and quadratic) and random direct genetic effect. For IPP, the model was formed by contemporary group, season of birth and random direct genetic effect. The GC for P305, IDP and PP was defined as herd and year of birth, and the IPP effects of herd and year of birth. Variance components were estimated by restricted maximum likelihood (REML). In the first experiment, genetic trends were estimated by linear regression analyzes of breeding values, weighted by the number of observations, depending on the year of birth of the animal. The relative efficiency of indirect selection was obtained by dividing the correlated response for reproductive traits when selection was practiced for milk production and genetic gain direct. In the second experiment, including the random effect of permanent environment for P305 and PP. The lactation projected were from of 151, 181, 211 and 241 days and files formed with three levels (10, 40, 70 and 100%) for milk accumulated at 305 days (P305) projected by lactation (PP), totaling 16 files. Groups were formed coincidence of bulls by their breeding values for each substitution level and data projection. The mean values and standard deviations for P305, IPP and IDP were 4003.80  1568.99 kg, 1071.40  182.52 days and 440.10  100.52 days, respectively. The estimated of heritability were 0.25, 0.20 and 0.03 for P305, IPP and IDP, respectively. The results suggest that the productions up to 305 days and age at first calving have additive genetic variability and can be used as selection criteria of Girolando breed. The genetic correlation between P305 and IDP was 0.13, between IPP and IDP, 0.18; between P305 and IPP, -0.59. The results indicate that the genetically superior animals for milk production are also earlier. However, the genetic gain for IPP will be greater if performed direct selection for the trait. Genetic trends for P305, IPP and IDP were 11.58 kg, -0.30 days and 0.02 days, respectively. The genetic gain IPP will be greater if performed direct selection for the trait. The increase of 257.0 kg of milk will result in 2.7 days more in the first calving interval. The estimate of herdabildiade (h Â) for P305 was 0.16. Already the PP showed h  average 0.15, varying between from 0.14 to 0.16. Genetic correlations between P305 and PP were all equal to unity. Selecting bulls 1% higher for P305 obtained coincidence of 80% except for PP15070% and PP150100%. For other levels of selection, the coincidences were higher varying from 82 to 100%. It was found that the use of lactation projected from 150 days is an effective methodology for the inclusion of analysis information. / Com o objetivo de estimar parÃmetros genÃticos e a resposta correlacionada para primeira produÃÃo de leite atà 305 dias (P305), idade ao primeiro parto (IPP), primeiro intervalo de partos (IDP) e produÃÃes projetadas (PP) da raÃa Girolando criada no Brasil, foram analisados 9.632 registros de partos coletados em vÃrios rebanhos brasileiros no perÃodo de 2000 a 2010. A produÃÃo de leite em 305 dias, idade ao primeiro parto, primeiro intervalo de parto e produÃÃes projetadas foram analisadas por meio de modelo animal em anÃlises uni e bicaracterÃsticas. Para P305 e IDP, o modelo incluiu os efeitos fixos de grupo de contemporÃneos (GC), Ãpoca de parto e idade da vaca em dias como co-variÃvel (regressÃo linear e quadrÃtica) e o efeito aleatÃrio genÃtico direto. Para a IPP, o modelo foi formado por grupo de contemporÃneos, Ãpoca de nascimento e o efeito aleatÃrio genÃtico direto. O GC para P305, IDP e PP foi definido como rebanho e ano de parto, e para IPP os efeitos de rebanho e ano de nascimento. Os componentes de variÃncia foram estimados pelo mÃtodo de mÃxima verossimilhanÃa restrita (REML). No primeiro experimento, as tendÃncias genÃticas foram calculadas por anÃlises de regressÃo linear dos valores genÃticos, ponderados pelo nÃmero de observaÃÃes, em funÃÃo do ano de nascimento dos animais. A eficiÃncia relativa da seleÃÃo indireta foi obtida pela divisÃo da resposta correlacionada para as caracterÃsticas reprodutivas, quando a seleÃÃo foi praticada para produÃÃo de leite e o ganho genÃtico direto. No segundo experimento, foi incluindo o efeito aleatÃrio de ambiente permanente para P305 e PP. Foram projetadas lactaÃÃes a partir de 151, 181, 211 e 241 dias e formados arquivos com nÃveis de substituiÃÃo (10, 40, 70 e 100%) das produÃÃes de leite acumulada atà 305 dias (P305) pelas lactaÃÃes projetadas (PP), totalizando 16 arquivos. Foram formados grupos de coincidÃncia dos touros pelos seus valores genÃticos para cada nÃvel de substituiÃÃo e data de projeÃÃo. Os valores das mÃdias e dos desvios padrÃes para P305, IPP e IDP foram 4003,80 Â1568,99 kg, 1071,40 Â182,52 dias e 440,10 Â100,52 dias, respectivamente. As estimativas de herdabilidade obtidas foram 0,25, 0,20 e 0,03 para P305, IPP e IDP, respectivamente. Os resultados sugerem que a produÃÃes em atà 305 dias e idade ao primeiro parto possuem variabilidade genÃtica aditiva, podendo ser utilizadas como critÃrio de seleÃÃo da raÃa Girolando. A correlaÃÃo genÃtica entre P305 e IDP foi 0,13; entre IDP e IPP, 0,18; entre P305 e IPP, -0,59. Os resultados indicam que os animais superiores geneticamente para produÃÃo de leite sÃo tambÃm mais precoces. Entretanto, o ganho genÃtico para IPP serà maior se for realizada a seleÃÃo direta para a caracterÃstica. As tendÃncias genÃticas para P305, IPP e IDP foram 11,58 kg, -0,30 dias e 0,02 dias, respectivamente. O ganho genÃtico para IPP serà maior se for realizada a seleÃÃo direta para a caracterÃstica. O acrÃscimo de 257,0 kg de leite resultarà em 2,7 dias a mais no primeiro intervalo de parto. A estimativa da herdabildiade (hÂ) para P305 foi de 0,16. Jà as PP apresentaram h mÃdia de 0,15, variando entre 0,14 a 0,16. As correlaÃÃes genÃticas entre P305 e PP foram todas igual a unidade. Selecionando 1% dos touros superiores para P305 obteve coincidÃncia de 80% exceto para PP15070% e PP150100%. Para os demais nÃveis de seleÃÃo, as coincidÃncias foram maiores variando de 82 atà 100%. Constatou-se que a utilizaÃÃo de lactaÃÃes projetadas a partir de 150 dias à uma metodologia eficiente na inclusÃo de informaÃÃes para anÃlise.
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Genetic study â quantitative performance Santa InÃs sheep breed in agricultural fairs / Estudo genÃtico â quantitativo do desempenho de ovinos da raÃa Santa InÃs em exposiÃÃes agropecuÃrias

Anderson AntÃnio Carvalho Alves 04 December 2015 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O objetivo no presente estudo foi avaliar a natureza genÃtica da habilidade de um animal se classificar entre os trÃs primeiros colocados em categorias de idade (HAB3) e de sua pontuaÃÃo total obtida (PTO) em campeonatos de julgamento realizados em diferentes exposiÃÃes agropecuÃrias. Foram utilizados dados pertencentes à AssociaÃÃo Brasileira de Santa InÃs (ABSI), referentes a eventos ocorridos entre os anos de 2012 e 2014. Avaliou-se a HAB3 para animais entre 4 e 36 meses, distribuÃdos em 16 categorias, de acordo com sua idade, e a PTO, considerando-se todos os campeonatos individuais disputados durante a exposiÃÃo, onde os animais pertencentes atà a 4 categoria de idade (4 a 8 meses) competiram dentro de categorias e em campeonatos subsequentes para definiÃÃo do CampeÃo Ovino do Futuro, e animais confirmados (acima de 8 meses) disputaram a premiaÃÃo mÃxima de Grande CampeÃo da RaÃa. Os arquivos finais continham 3.180 registros de classificaÃÃo (HAB3) referentes a 1.896 animais e 4.383 informaÃÃes referentes Ãs pontuaÃÃes obtidas (PTO) por 2.170 animais. O arquivo de genealogia incluiu 4069 animais. Os componentes de variÃncia foram estimados em modelo animal de limiar para a caracterÃstica HAB3 e linear para PTO, mediante anÃlise bayesiana, utilizando-se o Amostrador de Gibbs. As mÃdias a posteriori para a herdabilidade e repetibilidade foram, respectivamente, 0,10  0,07 e 0,57  0,11 para HAB3 e 0,12  0,04 e 0,31  0,02 para PTO. Os baixos valores de herdabilidade relatados para estas caracterÃsticas revelam uma forte influÃncia de fatores ambientais, tais como o tratamento oferecido a estes animais. Os valores estimados para repetibilidade sugerem correlaÃÃo alta entre as classificaÃÃes dos animais, o que implica que animais classificados entre os trÃs primeiros colocados nas categorias de idade, tendem a ter desempenho semelhante em competiÃÃes subsequentes. No entanto, para a pontuaÃÃo total obtida, o desempenho observado apresenta moderada confianÃa de se repetir ao longo do tempo. Conclui-se que a seleÃÃo e o uso de reprodutores que obtiveram bons desempenhos em competiÃÃes de julgamento nÃo apresentam grandes garantias que seus filhos tenham a mesma capacidade. / The aim in this study was to evaluate the genetic nature of the ability of an animal to rank among the top three on age categories (HAB3) and its total score (PTO) on trial championships held in different agricultural fairs. Records belonging to the Brazilian Association of Santa InÃs (ABSI) and related to fairs that occurred between the years 2012 and 2014 were used. We evaluated the HAB3 for animals between 4 and 36 months, divided into 16 categories according to their age, and the PTO, considering all individual championships performed during the agricultural fair, where the animals belonging until the 4th age category (4-8 months) competed in categories and in subsequent championships to define the Future Sheep Champion, and confirmed animals (over 8 months) competed for the top award of the Great Breed Champion. The final data files contained 3,180 placing records (HAB3) for 1,896 animals and 4,383 information on the obtained scores (PTO) for 2,170 animals. The pedigree file included 4,069 animals. Variance components were estimated fitting threshold and linear animal models for ABI3 and TS, respectively, by Bayesian analysis using the Gibbs sampler. The posterior means of heritability and repeatability were, respectively, 0.10  0.07 and 0.57  0.11 for HAB3 and 0.12  0.04 and 0.31  0.02 for PTO. Low heritability values reported for these traits reveal a strong influence of environment factors, such as the treatment offered to the animals. The repeatability values suggest high correlation between the animal classifications, implying that animals ranked in the top three in the categories of age, tend to have similar performance in subsequent competitions. However, for the total score, the observed performance has moderate confidence be repeated over time. We conclude that the selection and use of rams who achieved good performances in trial competitions feature no major guarantees that their offspring have the same capacity.
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AvaliaÃÃo genÃtica da curva de lactaÃÃo de cabras saanen utilizando modelos de regressÃo aleatÃria / Genetic evaluation of goat milk production of saanen using random regression models

Tyssia Nogueira Maciel dos Santos 28 November 2014 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O objetivo deste estudo foi realizar uma avaliaÃÃo genÃtico-quantitativa da curva de lactaÃÃo atà 305 dias de cabras da raÃa Saanen, avaliando distintos modelos de regressÃo aleatÃria para o melhor ajuste das trajetÃrias fixa e aleatÃrias desta curva, e assim estimar as covariÃncias e parÃmetros genÃticos associados a este perÃodo. Foram utilizados 11.018 controles leiteiros de 950 lactaÃÃes de cabras pertencentes a rebanhos associados ao Programa de Melhoramento GenÃtico de Caprinos Leiteiros (CaprageneÂ). Os efeitos fixos utilizados nas anÃlises foram de grupo de contemporÃneos, sexo das crias, tipo de ordenha e manejo. Foram avaliados 18 modelos, com diferentes ordens, para verificar o melhor ajuste simultÃneo das regressÃes para as trajetÃrias fixa e aleatÃrias (efeitos genÃticos aditivos diretos, de ambiente permanente e residual). Para ajuste da regressÃo fixa, foram utilizados os polinÃmios ordinÃrios e os polinÃmios ortogonais de Legendre, de segunda ordem. Para as regressÃes aleatÃrias, foram utilizados os polinÃmios ordinÃrios, os polinÃmios ortogonais de Legendre e as funÃÃes b-spline, variando da segunda a quarta ordem. O modelo com os polinÃmios ortogonais de Legendre de segunda ordem para a parte fixa e as funÃÃes b-spline de quarta ordem para a parte aleatÃria foi o mais adequado para o ajuste dos dados analisados. Na trajetÃria fixa, este modelo estimou o pico de lactaÃÃo entre 52-61 dias, com valor mÃdio de 2,378 kg de leite/dia. A curva iniciou-se com uma produÃÃo mÃdia de 2,298 kg/dia, encerrando aos 305 dias com uma produÃÃo mÃdia de 0,758 kg/dia. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,294  0,135 a 0,794  0,075. Maior variabilidade genÃtica foi estimada para os controles leiteiros intermediÃrios na trajetÃria da curva de lactaÃÃo, entre 79 e 180 dias, com maiores estimativas de herdabilidade. As correlaÃÃes genÃticas entre os controles variaram entre 0,551  0,125 e 0,998  0,001, como maiores valores para produÃÃes de leite em dias prÃximos e subsequentes, e tornando-se menores à medida que os controles se distanciavam. A variabilidade genÃtica estimada indica que à possÃvel modificar por seleÃÃo a curva de lactaÃÃo das cabras Saanen da populaÃÃo estudada. Esta seleÃÃo deve ser realizada entre 79 e 180 dias de lactaÃÃo, perÃodo posterior ao pico de lactaÃÃo, entretanto onde se observaram as maiores herdabilidades. A seleÃÃo neste ponto permitirà alteraÃÃes na curva como um todo, em funÃÃo das respostas genÃticas correlacionadas. / The aim of this study was to perform a genetic-quantitative evaluation of the lactation curve up to 305 days of Saanen goats, fitting different random regression models to the best fit on the fixed and random trajectories of this curve and thus estimate the (co) variances and genetic parameters associated to this period. 11,018test-day milk yieldof 950 goats belonging to herds supported by the Dairy Goats Breeding Program (CaprageneÂ) were used. The fixed effects used in the analysis were contemporary group, sex of offspring, type of milking and management. 18 models with different orderswere evaluated, to verify the simultaneous best fit of the regressions for the fixed and random trajectories (direct additive genetic, permanent environmental and residual effects). Ordinary orthogonal polynomials and Legendre polynomials, of second order were used to fit the fixed regression. Ordinary polynomials, orthogonal Legendre polynomials and B-spline functions, ranging from second to fourth order, were used for fit the random regressions. The model with orthogonal Legendre polynomials of second order to the fixed part and the b-spline function of fourth order for the random part was the most suitable for the fitting of the data analyzed. In fixed path, this model estimated peak lactation between 52-61 days, with an average of 2.378 kg of milk / day. The curve began with an average yield of 2.298 kg / day, ending 305 days with an average yield of 0.758 kg / day. Heritability estimates ranged from 0.294  0.135 to 0.794  0.075. Greater genetic variability was estimated for the intermediate test-day yields in the trajectory of the lactation curve, between 79 and 180 days, with higher heritability estimates. Genetic correlations among the test-day yields ranged from 0.551  0.125 and 0.998  0.001, with higher values between milk yield in the next and subsequent days, and becoming smaller as the distanceamong the test-day yield increase. The estimated genetic variability indicates that it is possible to modify the lactation curve of Saanen goats of the study population. The selection should be performed between 79 and 180 days of lactation, after the peak of lactation, however where the greatest heritabilities were observed period. The selection on this point will change the curve as a whole on the basis of correlated genetic responses.
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Simulação de dados visando à estimação de componentes de variância e coeficientes de herdabilidade / Simulation of data aiming at the estimation of variance components and heritability

Angela Mello Coelho 03 February 2006 (has links)
A meta principal desse trabalho foi comparar métodos de estimação para coeficientes de herdabilidade para os modelos inteiramente ao acaso e em blocos casualizados. Para os dois casos foram utilizadas as definições de coeficiente de herdabilidade (h2) no sentido restrito, dadas respectivamente, por h2=4 σ2t/(σ2+σ2t) e h2=4 σ2t/(σ2+σ2t+σ2b). . Portanto, é preciso estimar os componentes de variância relativos ao erro experimental (σ2) e ao efeito de tratamentos (σ2t) quando se deseja estimar h2 para o modelo inteiramente ao acaso. Para o modelo para blocos casualizados, além de estimar os últimos dois componentes, é necessário estimar o componente de variância relativo ao efeito de blocos (σ2b). Para atingir a meta estabelecida, partiu-se de um conjunto de dados cujo coeficiente de herdabilidade é conhecido, o que foi feito através da simulação de dados. Foram comparados dois métodos de estimação, o método da análise da variância e método da máxima verossimilhança. Foram feitas 80 simulações, 40 para cada ensaio. Para os dois modelos, as 40 simulações foram divididas em 4 casos contendo 10 simulações. Cada caso considerou um valor distinto para h2, esses foram: h2=0,10; 0,20; 0,30 e 0,40; para cada um desses casos foram fixados 10 valores distintos para o σ2, a saber: σ2=10; 20; 30; 40; 50; 60; 70; 80; 90; 100. Os valores relativos ao σ2 foram encontrados através da equação dada para os coeficientes de herdabilidade, sendo que, para o modelo em blocos casualizados, foi fixado σ2b=20 para todas os 40 casos. Após realizadas as 80 simulações, cada uma obtendo 1000 conjunto de dados, e por conseqüência 1000 estimativas para cada componente de variância e coeficiente de herdabilidade relativos a cada um dos casos, foram obtidas estatísticas descritivas e histogramas de cada conjunto de 1000 estimativas. A comparação dos métodos foi feita através da comparação dessas estatísticas descritivas e histogramas, tendo como referência os valores dos parâmetros utilizados nas simulações. Para ambos os modelos observou-se que os dois métodos se aproximam quanto a estimação de σ2. Para o delineamento inteiramente casualizado, o método da máxima verossimilhança forneceu estimativas que, em média, subestimaram os valores de σ2t, e por conseqüência, tendem a superestimar o h2, o que não acontece para o método da análise da variância. Para o modelo em blocos casualizados, ambos os métodos se assemelham, também, quanto à estimação de σ2t, porém o método da máxima verossimilhança fornece estimativas que tendem a subestimar o σ2b, e e por conseqüência, tendem a superestimar o h2, o que não acontece para o método da análise da variância. Logo, o método da análise da variância se mostrou mais confiável quando se objetiva estimar componentes de variância e coeficientes de herdabilidade para ambos os modelos considerados. / The main aim of this work was to compare methods of estimation of heritability for the 1- way classification and the 2-way crossed classification without interaction. For both cases the definition of heritability (h2) in the narrow sense was used, given respectively, by h2=4σ2t/(σ2+σ2t) e h2=4σ2t/(σ2+σ2t+σ2b). Therefore, there is a need to estimate the components of variance related to the residual (σ2) and the effect of treatments (σ2t) in order to estimate (h2) for the 1-way classification. For the 2-way classification without interaction, there is a need to estimate the component of variance related to the effect of blocks (σ2b) as well as the other two components. To achieve the established aim, a data set with known heritability was used, produced by simulation. Two methods of estimation were compared: the analysis of variance method and the maximum likelihood method. 80 simulations were made, 40 for each classification. For both models, the 40 simulations were divided into 4 different groups containing 10 simulations. Each group considered a different value for h2 (h2=0,10; 0,20; 0,30 e 0,40) and for each one of those cases there were 10 different values fixed for) σ2 (σ2=10; 20; 30; 40; 50; 60; 70; 80; 90; 100). The values for σ2t were found using the equations for the heritability, and for the 2-way crossed classification without interaction, σ2b=20 for all the 40 cases. After the 80 simulations were done, each one obtaining 1000 data sets, and therefore 1000 estimates of each component of variance and the heritability, descriptive statistics and histograms were obtained for each set of 1000 estimates. The comparison of the methods was made based on the descriptive statistics and histograms, using as references the values of the parameters used in the simulations. For both models, the estimates of σ2 were close to the true values. For the 1-way classification, the maximum likelihood method gave estimates that, on average, underestimated the values of σ2t, and therefore the values of h2. This did not happen with the analysis of variance method. For the 2-way crossed classification without interaction, both methods gave similar estimates of σ2t, although the maximum likelihood method gave estimates that tended to underestimate σ2b and therefore to overestimate h2. This did not happen with the analysis of variance method. Hence, the analysis of variance method proved to be more accurate for the estimation of variance components and heritability for both classifications considered in this work.

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