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Caracterização da diversidade genetica em plantas citricas, palmeiras e brassicas atraves de isoenzimas e RAPD

Sawazaki, Haiko Enok 28 February 1996 (has links)
Orientador: Ladaslav Sodek / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-21T00:59:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sawazaki_HaikoEnok_D.pdf: 11307939 bytes, checksum: f7d33caedc7a92c8cac710c0e2d968ac (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Estudou-se, mediante polimorfismo enzimático em gel de poliacrilamida e polimorfismo de DNA baseado na amplificação de segmentos de DNA ao acaso denominado RAPD, a variabilidade genética em citros, palmeiras e couve. Em citros, as espécies e cultivares de laranja doce Hamlim, Natal, Valência, Pêra, Baianinha (C. sinensis); laranja azeda (C. aurantim); tangerinas clementina, sunki, cleópatra e poncã (C. Clementina, sunki, reshni, reticulata); lima da pérsia (C. limettioides); limão galego (C. aurantifolia); limão-cravo (C. limonia) e trifoliata (Poncirus trifoliata). Em palmeiras, as espécies e ecótipos de açaí (E. oleracea) itajobi, pariquera, danilo; juçara (Euterpe edulis); euterpe Tadeu; híbrido açaí x juçara; pupunhas yurimaguas, benjamim Constant, branca uma, t2s1, EEU, ceplac 10, Walter (Bactris gasipae); dendê hermes (Elaeis guineensis); gariroba (Syagrus oleraceae).Em couve as variedades de couve manteiga ribeirão pires 2620; 1811; roxa; são roque; gigante 915; 916; crespa piracicaba; ribeirão pires 2446, crespa capão bonito; tupi; jundiaí; Mococa; são josé; roxa monte alegre; verde escura. Os extratos de folhas foram analisados para as isoenzimas de malato desidrogenase (MDH), enzima málica (ME), leucinoaminopeptidase (LAP), glutamato oxaloacetato transaminase (GOT), fosfoglucoisomerase (PGI), fosfoglucomutase (PGM), isocitrato desidrogenase (IDH), peroxidase (PRX), esterase (EST), e para os marcadores RAPD utilizando os quarenta primers do kit A e B da Operon Technologies. Verificou-se grande variabilidade genética interespecífica, comprovada pelos dendrogramas UPGMA, para citros, e palmeiras couve, com reconhecimento de híbridos nas palmeiras, porém nenhum polimorfismo entre os cultivares de laranjas doces. Foram observadas bandas além das referidas pela literatura em gel de amido. As relações filogenéticas entre as espécies e cultivares ficaram de acordo com a literatura existente. Foi comprovada a maior eficácia dos marcadores RAPD em relação aos de isoenzimas ,pois possibilita facilmente a análise de grande número de marcadores genéticos, de especial interesse nos casos em que as isoenzimas não expressam interesse nos polimorfismo / Abstract: Genetic diversity was studied by means of polymorphism using polyacrilamide gel electrophoresis a DNA polymorphism assay based on the amplification of random DNA segments denominated RAPD, for citrus, palm and cabbage plants. The following citrus species were analyzed: sweet orange (C.sinensis), Hamlin, Natal, Valencia, Pera and Baianinha; clementine, sunki, cleopatra and mandarin tangerines (C. clementina, C .sunki, C .cleopatra, C. reticulata); Palestine lime (C. limettioides); West Indian lime (C.aurantifolia); Rangpur lime (C.limonia) ; Sour orange (c. aurantium) ; citron (C. medica) and Poncirus trifoliata. For palms species the following were studied: Euterpe oleracea varieties, , açaí, açaí itajobi, pariquera, danilo; Euterpe edulis varieties, juçara; euterpe tadeu; hybrids from E. edulis x E.oleracea; Syagrus oleracea var gariroba; Elaeis guineensis var dendê hermes; Bactris gasipae, varieties E.E.U., t2s1, branca una, uurimaguas, ceplac 10, benjamim contant and walter. For cabbage, fifteen varieties of Campinas Agronomic Institute were studied. Citrus, palm and cabbage leaf extracts were analysed for isozymes of malate dehydrogenase (MDH) , malic enzyme (ME) , leucine aminopeptidase (LAP), glutamate oxaloacetate transaminase isomerase (GOT), phosphoglucose isomerase (PGI), phosphoglucose mutase (PGM), isocitrate dehydrogenase (IDH) , peroxidase (PRX) and esterase (EST). Polymorphism was also investigated by the RAPD technique using forty primers obtained from Operon Technologies. Interespecific differences were observed in citrus, palms and cabbage as well as distinctive patterns for palm hybrids; on the other hand, no variation between intraespecific C. sinensis cultivars was observed. Some bands were observed in addition to those cited in the literature where starch gel electroporesis was used for enzymatic polymorphism. The conclusions with regard to polymorphic patterns obtained using the RAPD technique confirmed those observed with isozymes, with the advantages of its greater efficiency and ability to process a large number of samples / Doutorado / Doutor em Ciências Biológicas
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Variabilidade isoenzimática de 200 acessos de mandioca (Manihot esculenta Crantz) / not available

Betânia Lúcia Rocha Cabral 25 April 2001 (has links)
A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma espécie amplamente cultivada no Brasil, possuindo grande variabilidade para caracteres morfológicos, e elevada adaptação a climas e solos diferentes. A avaliação da variabilidade genética através da técnica de eletroforese de isoenzimas é bastante empregada em espécies vegetais. Os acessos mantidos em bancos de germplasma constituem um importante recurso genético para futuros trabalhos de melhoramento, porém é necessário conhecer-se as características peculiares de cada acesso. O estudo da variabilidade genética em bancos de germoplasma contribui para o conhecimento do genótipo de cada acesso, além de identificar materiais duplicados, o que reduz o custo com a manutenção do germoplasma. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética de 200 acessos de mandioca através de oito sistemas isoenzimáticos [fosfatase ácida (ACP), leucina aminopeptidase (LAP), glucose-6-fosfato desidrogenase (G6PDH), malato desidrogenase (MDH), xiquimato desidrogenase (SKDH), enzima málica (ME), glutamato desidrogenase (GDH) e isocitrato desidrogenase (IDH)] e verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Para a avaliação isoenzimática dos acessos de mandioca utilizou-se folhas tenras (recém-expandidas) e, como meio de suporte, gel de amido de milho a 12% de concentração. Os acessos foram agrupados de acordo com o local de origem, obtendo-se desta forma sete grupos: 1-Amazonas, 2-Amapá, 3-Bahia, 4-Pará, 5-Rondônia, 6-Diversos, incluindo-se neste grupo os acessos que apresentavam-se em pequena quantidade por local de origem (um ou no máximo dois indivíduos), e 7- Acessos sem origem, incluindo-se neste grupo os acessos que não apresentavam local de origem definida. Cada sistema apresentou um loco polimórfico. O número médio de alelos por loco variou de 2,3 a 2,5. A heterozigosidade média observada variou de 0,381 a 0,615 e a esperada de 0,479 a 0,559. A variabilidade genética dentro dos grupos foi maior que a variabilidade entre os grupos para todos os oito locos analisados, com valores médios entre grupos (GST) de 0,049 e dentro de grupos (HS) de 0,482. Através da análise de similaridade genética, utilizando-se o índice de Jaccard, foi confeccionado um dendrograma para cada grupo de acessos, observando-se grande variabilidade genética entre os acessos avaliados. Os dendrogramas foram comparados a uma planilha contendo os 200 acessos agrupados de acordo com a semelhança de seus genótipos para os oito locos avaliados, com a finalidade de verificar a existência de possíveis acessos duplicados. Os dendrogramas mostraram a presença de 11 pares de acessos repetidos. Destes, somente três pares de acessos apresentaram similaridade para os oito locos analisados, os quais podem ser considerados como possíveis materiais duplicados / not available
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Detecção do polimorfismo genetico de Streptococcus mutans isolados de individuos livres de carie (CPOD=0)

Rosa, Rosimeire Takaki 14 December 2001 (has links)
Orientador : Reginaldo Bruno Gonçalves / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-01T00:30:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rosa_RosimeireTakaki_M.pdf: 2559685 bytes, checksum: 43d521518e2961f1a362b4f397ea0a89 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: A presente pesquisa teve por objetivo analisar a variabilidade infraespecífica de cepas de Streptococcus mutans isoladas de indivíduos livres de cárie. Foram coletadas amostras de saliva total não estimulada, placa dental e de dorso de língua de indivíduos que apresentavam índice CPOD igual a zero. Após dispersão e diluição seriada das amostras, alíquotas de cada diluição foram inoculadas em meio Mitis Salivarius Bacitracina Agar (MSB). Após incubação em estufa de pC02 10% a 37°C, foram isoladas do meio colônias com morfologia típica de estreptococos, para posterior identificação por provas bioquímicas. As amostras foram incubadas em caldo de Infusão de Cérebro e Coração (BHI), centrifugadas e lavadas, sendo os sedimentos obtidos submetidos ao processo de extração das proteínas intracelulares. Os extratos protéicos foram separados por eletroforese em gel de amido e corados especificamente para a detecção do polimorfismo isoenzimático. Os géis foram analisados através dos sistemas enzimáticos: leucina aminopeptidase (LAP), manitol 1-fosfato desidrogenase (MIP), manose fosfato isomerase (MPI), nucleosídio fosforilase (NSP), fenilalanil leucina peptidase (PLP) e transaminase glutâmico-oxalacética (GOT). A análise comparativa dos perfis da eletroforese de isoenzimas (Multilocus Enzyme Electrophoresis-MLEE) dos isolados, acessada pela soma de todos sistemas enzimáticos, permitiu observar a ocorrência de dois ou mais clones de S. mutans nos diferentes sítios nestes voluntários. Os resultados obtidos mostram que pode ser encontrado mais de um tipo genético de S. mutans colonizando os diferentes sítios em um mesmo indivíduo / Abstract: The current research had as aim to analyze the infra-specific variability of Streptococcus mutans strains obtained from caries-free individuals. Non-stimulated whole saliva, dental biofilm and tongue dorsum samples were collected from subjects with DMFT = O. After dispersing and decimal dilutions, aliquots from each dilution were inoculated in Mitis Salivarius Bacitracin (MSB) agar plates, in duplicate. After growing at pCO2 100,/0 and 37°C, it was taken some S. mutans suspect colonies that were biochemically identified. S. mutans-positive colonies were grown in Brain Heart Infusion (BHI) broth, they were centrifuged and washed. The pellets were submitted to cell disruption and protein extraction. Protein extracts were separated by starch gel electrophoresis and specifically stained in order to obtain the isoenzymic polymorphism. The gels were analyzed for enzymatic systems: leucine amino peptidase (LAP), mannitol-l-phosphate dehydrogenase (MIP), mannose phosphate isomerase (MPI), nucleoside phosphorylase (NSP), phenylalanyl leucine peptidase (PLP) e glutamic-oxalacetic transaminase (GOT). The comparative analysis of MLEE profiles assessed by the sum of all enzymatic systems allowed the observation of occurrence of one or more S. mutans dones, varying in the different intra oral sites among these volunteers. The obtained results showed that it may be found more than one genetic type of such S. mutans colonizing different sites in a same subject / Mestrado / Mestre em Biologia e Patologia Buco-Dental
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Aplicação de técnicas de analise multivariada e eletroforese de isoenzimas em estudos de relações fenéticas do gênero Laelia seção Parviflorae / Application of multivariate analysis techniques and isozyme electrophoresis in studies of phonetic relationships in the genus Laelia section Parviflorae

Resende, Rosangela Maria Simeao 07 June 1991 (has links)
Neste trabalho foram utilizados alguns métodos de analise multivariada aplicados a taxonomia numérica e analise eletroforética de isoenzimas com o objetivo de estabelecer as relações fenéticas entre onze espécies do gênero Laelia seção Parviflorae. Os estudos relativos a divergência morfológica entre as onze espécies para os treze caracteres avaliados permitiram concluir que dos processos multivariados utilizados, as medidas de dissimilaridade baseadas na distancia generalizada de Mahalanobis e agrupamento pelo método do vizinho mais próximo, e analises de variáveis canônicas foram os mais eficientes no estabelecimento de grupos e subgrupos e da relação entre estes. Desta forma, o primeiro grupo subdividiu-se em 4 subgrupos e o segundo grupo constituiu-se apenas pela espécie L. Cinnabarina, isolada das demais. Padronizou-se a técnica de eletroforese de isoenzimas para os sistemas GOT, este MDH, para as espécies em estudo. Observou-se uma grande homologia interespecífica quanto aos fenótipos isoenzimáticos, concordando com os resultados obtidos pela analise multivariada de caracteres morfológicos / This work used multivariate methods applied to numerical taxonomy, and isozyme el ectrophoretical analysis to determine the phenetics relationships among eleven species of the genus Laelia section Parviflorae. The studies of morphological divergence among the 11 species for the thirteen traits evaluated indicate that, among the multivariate procedures used, the dissimilarity measures based on Mahalanobis distance with clustering by single-linkage method, as well as canonical analysis were the most efficient methods to determine groups and sub-groups, and the relationships among them. The first group was divided in four subgroups: one composed by L. crispilabia, L. caulescens, L. flaya and L. milleri; other by L. esalqueana and L. lucasiana; another by L. longipes; L. briegeri and L. crispata; and the last by L. mixta. The second group comprised by only L. cinnabarina that was markedly isolated of the others in alI the multivariate analysis. The procedure to discard redundant traits indicated that labellum length, sepal length, sepal width, lateral sepal length, column length and column width, to be most important for interspecific genetic divergence, labellum length being the most important of alI. Isozyme electrophoresis techniques was standardized for glutamate oxaloacetate transaminase (GOT) , esterase (EST) and malate dehydrogenase (MDH) for the species of the genus in study. The evaluation of seven species this systems monomorphism for GOT and revealed EST, and a intraspecific a intraspecific polymorphism in MDH, as welI a great interspecific homology ta isozyme phenotypes, in agreement with results obtained by multivariate analysis of morphological traits. The results support the hypothesis of recent evolution in this section. Future research on inferences of origin and evolutionary processes in these species are suggested
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Caracterização isoenzimática e diversidade de etnovariedades de mandioca (manihot esculenta Crantz) / not available

Faraldo, Maria Inez Fernandes 05 June 1995 (has links)
O objetivo principal deste trabalho foi a caracterização e quantificação da variabilidade isoenzimática observada no germoplasma de mandioca (M. esculenta) na agricultura autóctone do sul do estado de São Paulo. A técnica utilizada foi a de eletroforese de isoenzimas em gel de penetrose 30 à 13%. Foram determinados e estudados 12 locos isoenzimáticos, sendo 9 polimórficos, pertencentes a cinco sistemas: malato desidrogenase (MDH - E.C. 1.1.1.37), leucina aminopeptidase (LAP - E.C. 3.4.11.1), xiquimato desidrogenase (SKDH - E.C. 1.1.1.25), alfa-esterase (Alfa-EST - E.C. 3.1.1.1) e aspartato aminotransferase (AAT - E.C. 2.6.1.1). O sistema da peroxidase (PER - E. C. 1. 1 1 .1.7) foi descartado por não apresentar polimorfismo de bandas. O polimorfismo isoenzimático observado nas populações estudadas é função da distribuição geográfica, uma vez que as populações do Litoral sul de São Paulo apresentam maior variabilidade que as populações do Vale do Ribeira. Nas análises dos dados foram estimados os parâmetros de variabilidade entre e dentro de populações, índice de similaridade genética pelos métodos de"Simple Matching"e"Jaccard", obtendo feno gramas pelo método de agrupamento U.P.G.M.A. (Unweighted pair-group method average), entre outros. O sistema de agricultura autóctone praticado pelos agricultores das comunidades negras e caiçaras matem e amplifica o nível de variabilidade intraespecífica, através de processos de hibridação introgressiva, troca de material entre agricultores, fluxo gênico, recombinação, introdução de variedades novas e mutação. Entre as principais conclusões destacam-se as seguintes: Os parâmetros de heterozigosidade média estimados demostraram altos níveis de variação genética para as roças de mandioca (Ho=O,242), sendo superiores à média de dados observados na literatura (Ho=O,225). Os resultados mostraram maior grau de variabilidade dentro das roças, sendo a roça 1 (roça Pedrinhas-1) a mais polimórfica (75,0% de variabilidade ). A diversidade intraespecífica está diretamente relacionada com a estrutura sócio-cultural do local. As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos, sendo que a de número 27 (Gema de ovo) formou um único grupo. As etnovariedades pertencentes às populações do litoral apresentaram maior variabilidade do que as populações do vale. Nas análises dos dados foram estimados os parâmetros de variabilidade entre e dentro de populações, índice de similaridade genética pelos métodos de"Simple Matching"e"Jaccard", obtendo fonogramas pelo método de agrupamento U.P.G.M.A., entre outros. As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos. O sistema AAT mostrou-se um bom marcador bioquímico para a identificação das etnovariedades. Parâmetros heterozigosidade média estimados demonstraram altos níveis de variação genética para as roças de mandioca (Ho=0,242), sendo superiores ao da literatura (Ho=0,225). A diversidade intraespecífica está diretamente relacionada com a estrutura sócio-cultural-local . As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos, sendo que a de número 27 (Gema de ovo) formou um único grupo. Dados de isoenzimas servem para auxiliar os melhoristas nas estratégias de melhoramento genético da mandioca nas roças de agricultura autóctone, no sentido de detectar a distribuição da variabilidade genética presente nas populações. / not available
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Biologia da conservação da reófita Dyckia brevifolia Baker (Bromeliaceae), Rio Itajaí-Açu, SC

Rogalski, Juliana Marcia January 2007 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-23T11:22:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 246205.pdf: 14530401 bytes, checksum: 583659e70642e6324d5b10900b31c74b (MD5) / A ocorrência de espécies reófitas está vinculada à presença de corredeiras nos rios. Devido à perda destes hábitats, principalmente pela construção de represas, e a inexistência de estudos com reófitas, a geração de dados é imprescindível para dar embasamento à conservação deste grupo. Assim, o presente estudo objetivou gerar informações sobre a reófita Dyckia brevifolia Baker (Bromeliaceae), bem como propor estratégias para sua conservação. A determinação da distribuição geográfica da espécie foi feita por meio de caminhamento ao longo das margens do Rio Itajaí-Açu, Santa Catarina, Brasil. Para caracterizar sua estrutura demográfica foi realizado um censo em 12 locais, onde as rosetas foram classificadas quanto ao seu estádio de desenvolvimento (plântulas, imaturas ou reprodutivas). As rosetas também foram classificadas em isoladas ou agrupadas. Em cinco locais foi avaliada a emissão clonal e a mortalidade de indivíduos, exceto plântulas. Para caracterizar o sistema reprodutivo foram conduzidos cinco tratamentos: agamospermia, autopolinização espontânea, autopolinização manual, polinização cruzada e controle. As características florais, a produção de néctar e os visitantes florais também foram estudados. A caracterização da diversidade genética (oito populações) e da taxa de cruzamento (quatro populações) foi feita através de marcadores alozímicos. A extensão de ocorrência de D. brevifolia corresponde a cerca de 80 km ao longo do Rio Itajaí-Açu, desde Lontras até Blumenau. Porém, as populações são disjuntas e nos 12 locais estudados sua área de ocupação correspondeu a menos de um hectare, o que se deve a alta seletividade ambiental apresentada pela espécie. O número de rosetas por local variou de 204 a 7.185, havendo uma correlação positiva entre a área ocupada pela espécie e o número total de rosetas (r = 0,82; p<0,05). A densidade média encontrada foi de 3,5 rosetas por m2 (s ± 1,9). Apenas 2,4% das rosetas ocorreram isoladas e 97,6% ocorreram agrupadas, em 2.254 grupos. Nos 12 locais avaliados foram registradas 30.443 rosetas, destas 1.789 (5,9%) eram plântulas, 24.426 (80,2%) eram imaturas e 4.228 (13,9%) eram reprodutivas. A taxa média de mortalidade foi de 5,3%. As plântulas corresponderam, em média, a 3,7% dos indivíduos, enquanto os clones a 6%. A propagação vegetativa foi considerada a principal forma de recrutamento. Cada inflorescência apresentou, em média, 60,4 flores (s ± 14,5; n = 30) e 58,3 frutos (s ± 13,3; n = 30), sendo a relação fruto/flor de 0,97. O número médio de sementes por fruto foi de 129,6 (s ± 24,3; n = 90). A abertura das flores ocorreu no sentido da base para o ápice da inflorescência e o número de flores abertas/dia por inflorescência foi, em média, de 6,8 (s ± 1,2; n = 30). Suas flores apresentaram antese ao longo do dia e duração de um dia e meio. Com relação ao sistema reprodutivo, os resultados indicaram que D. brevifolia é autocompatível e que a agamospermia pode ocorrer. O volume e a concentração médios do néctar (n = 30) foram de 30,5µl e de 25,7%, respectivamente. O beija-flor Amazilia versicolor Vieillot e as abelhas Xylocopa brasilianorum Linnaeus e Bombus spp. foram considerados os principais polinizadores de D. brevifolia. A taxa de cruzamento foi de 8,2%, indicando que a espécie é predominantemente autógama. Com relação à diversidade genética, as populações apresentaram, em média, 1,4 alelos por loco, 27% de polimorfismo e heterozigosidade esperada foi de 0,067, em 13 locos analisados. O valores médios encontrados para a relação e para a diversidade genotípica foram de 0,22 e 0,612, respectivamente. As populações a jusante no Rio Itajaí-Açu apresentaram os maiores índices de diversidade, o que foi atribuído à hidrocoria visto que o rio apresenta fluxo unidirecional. Grande parte da diversidade genética está distribuída entre suas populações ( =0,376) e a espécie apresenta, ainda, alelos raros e exclusivos. Com a construção da represa da Hidrelétrica Salto Pilões, Lontras, algumas populações poderão ser atingidas, sendo recomendada a conservação ex situ. Desta forma, no percurso de ocorrência da reófita D. brevifolia, a instalação de outras hidrelétricas não é recomendada, pois poderia inviabilizar a conservação in situ desta espécie.
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Caracterização isoenzimática e diversidade de etnovariedades de mandioca (manihot esculenta Crantz) / not available

Maria Inez Fernandes Faraldo 05 June 1995 (has links)
O objetivo principal deste trabalho foi a caracterização e quantificação da variabilidade isoenzimática observada no germoplasma de mandioca (M. esculenta) na agricultura autóctone do sul do estado de São Paulo. A técnica utilizada foi a de eletroforese de isoenzimas em gel de penetrose 30 à 13%. Foram determinados e estudados 12 locos isoenzimáticos, sendo 9 polimórficos, pertencentes a cinco sistemas: malato desidrogenase (MDH - E.C. 1.1.1.37), leucina aminopeptidase (LAP - E.C. 3.4.11.1), xiquimato desidrogenase (SKDH - E.C. 1.1.1.25), alfa-esterase (Alfa-EST - E.C. 3.1.1.1) e aspartato aminotransferase (AAT - E.C. 2.6.1.1). O sistema da peroxidase (PER - E. C. 1. 1 1 .1.7) foi descartado por não apresentar polimorfismo de bandas. O polimorfismo isoenzimático observado nas populações estudadas é função da distribuição geográfica, uma vez que as populações do Litoral sul de São Paulo apresentam maior variabilidade que as populações do Vale do Ribeira. Nas análises dos dados foram estimados os parâmetros de variabilidade entre e dentro de populações, índice de similaridade genética pelos métodos de"Simple Matching"e"Jaccard", obtendo feno gramas pelo método de agrupamento U.P.G.M.A. (Unweighted pair-group method average), entre outros. O sistema de agricultura autóctone praticado pelos agricultores das comunidades negras e caiçaras matem e amplifica o nível de variabilidade intraespecífica, através de processos de hibridação introgressiva, troca de material entre agricultores, fluxo gênico, recombinação, introdução de variedades novas e mutação. Entre as principais conclusões destacam-se as seguintes: Os parâmetros de heterozigosidade média estimados demostraram altos níveis de variação genética para as roças de mandioca (Ho=O,242), sendo superiores à média de dados observados na literatura (Ho=O,225). Os resultados mostraram maior grau de variabilidade dentro das roças, sendo a roça 1 (roça Pedrinhas-1) a mais polimórfica (75,0% de variabilidade ). A diversidade intraespecífica está diretamente relacionada com a estrutura sócio-cultural do local. As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos, sendo que a de número 27 (Gema de ovo) formou um único grupo. As etnovariedades pertencentes às populações do litoral apresentaram maior variabilidade do que as populações do vale. Nas análises dos dados foram estimados os parâmetros de variabilidade entre e dentro de populações, índice de similaridade genética pelos métodos de"Simple Matching"e"Jaccard", obtendo fonogramas pelo método de agrupamento U.P.G.M.A., entre outros. As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos. O sistema AAT mostrou-se um bom marcador bioquímico para a identificação das etnovariedades. Parâmetros heterozigosidade média estimados demonstraram altos níveis de variação genética para as roças de mandioca (Ho=0,242), sendo superiores ao da literatura (Ho=0,225). A diversidade intraespecífica está diretamente relacionada com a estrutura sócio-cultural-local . As etnovariedades foram agrupadas em quatro grupos fenéticos, sendo que a de número 27 (Gema de ovo) formou um único grupo. Dados de isoenzimas servem para auxiliar os melhoristas nas estratégias de melhoramento genético da mandioca nas roças de agricultura autóctone, no sentido de detectar a distribuição da variabilidade genética presente nas populações. / not available
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Hibridações interespecificas, intergenericas, intergrupais, intersubtribais, intertribais e intersubfamiliares de citrus e generos relacionados

Bordignon, Rita 20 July 2018 (has links)
Orientador: Herculano Penna Medina Filho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-20T11:36:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bordignon_Rita_M.pdf: 3668712 bytes, checksum: 80ba358d5e97e3a5a0db034ae0cba0d7 (MD5) Previous issue date: 1995 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas
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Análises isoenzimáticas, moleculares e ultraestruturais em camarões dulcícolas do gênero Macrobrachium /

Lopes, Alessandro Garcia. January 2014 (has links)
Orientador: Carlos Roberto Ceron / Banca: Ana Maria Bonetti / Banca: Lilian Madi Ravazzi / Resumo: Os camarões do gênero Macrobrachium (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae), encontrados em ambientes de água doce, são amplamente distribuídos pelas regiões tropicais e subtropicais do mundo, inclusive em locais próximos ao litoral. Algumas espécies desse gênero, como por exemplo M. rosenbergii, apresentam valor econômico, sendo cultivadas e comercializadas como alimento. Na região Noroeste do Estado de São Paulo, são encontradas as espécies classificadas como M. amazonicum e M. jelskii, as quais são espécies exóticas de camarões dulcícolas recentemente introduzidas e amplamente disseminadas em reservatórios de usinas hidrelétricas desta região. Essas espécies possuem hábitos crípticos e noturnos, sendo predadores de larvas de peixes e também presas de peixes adultos e outros organismos. M. amazonicum e M. jelskii apresentam grande similaridade interespecífica em termos de caracteres morfológicos, o que pode dificultar a classificação taxonômica desses organismos. O objetivo deste estudo foi conduzir análises morfométricas, ultraestruturais, isoenzimáticas e moleculares em M. amazonicum e M. jelskii, na tentativa de obter-se novos dados para distinguí-los. Os camarões foram coletados das populações dos reservatórios de Sales/SP e Mendonça/SP. As análises morfométricas englobaram as medidas do télson, dos espinhos caudais internos e do rostro. As análises por microscopia eletrônica de varredura foram realizadas nas estruturas do télson, nos espinhos caudais internos e no apêndice masculino. As análises isoenzimáticas, realizadas por eletroforese em gel de poliacrilamida, abrangeram as enzimas álcool desidrogenase, octanol desidrogenase, glicose-6-fosfato desidrogenase, lactato desidrogenase, amilase e esterases do hepatopâncreas e tecido muscular. Análises moleculares envolveram a amplificação do espaçador intergênico interno ITS-1 (Internal Transcribed Spacer 1) do rDNA. Os fragmentos ... / Abstract: Prawns of the genus Macrobrachium (Crustacea, Decapoda, Palaemonidae) can be found in freshwater environments, widely distributed throughout tropical and subtropical regions of the world, including regions near the coast. Some species of this genus, for example Macrobrachium rosenbergii, present economic value, which are reared and traded as food. In the northwest region of São Paulo State two exotic freshwater prawn species are found, classified as M. amazonicum and M. jelskii, which were recently introduced to the aquatic reservoirs of hydroelectric power plants and then, disseminated throughout reservoirs in this region of the State. These species have cryptic and overnight habits, being predators of fish larvae and also being prey to adult fishes and other organisms. M. amazonicum and M. jelskii present high rates of interspecific similarity in terms of morphological characters, which are generally used to distinguish them, what may induce mistakes in taxonomic identification. The objective of this study was to conduct morphometric, ultrastructural, isoenzymatic and molecular analyses of M. amazonicum and M. jelskii, in order to obtain more data about their differentiation. The prawns were collected in reservoirs of Sales/SP and Mendonça/SP. Morphometric analyses were performed involving the structures of telsons, internal caudal spines and rostrums. Scanning electron microscopy analyses were performed on structures of telsons, internal caudal spines and male appendices. Isoenzymatic analyses by polyacrylamide gel electrophoresis included the enzymes alcohol dehydrogenase, octanol dehydrogenase, glucose-6-phophate dehydrogenase, lactate dehydrogenase, amylase and esterases of hepatopancreas and muscle tissue. Molecular analyses were performed by amplification and sequencing of ITS-1(Internal Transcribed Spacer 1) intergenic spacer from rDNA. The amplificated fragments were used for analyzing length polymorphism restriction fragments ... / Mestre
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An?lise do crescimento, diferencia??o celular e perfil isoenzim?tico de um isolado de tripanosomat?deo obtido de Megaselia scalaris Loew, 1866 (D?ptera, Phoridae) / Analysis of growth, cell differentiation and isoenzyme profile of an isolated trypanosomatid obtained Megaselia scalaris Loew, 1866 (Diptera, Phoridae)

Lima , Nathanielly Rocha Casado de 30 March 2011 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-09-28T15:23:40Z No. of bitstreams: 1 2011 - Nathanielly Rocha Casado de Lima.pdf: 972650 bytes, checksum: 29dba077fa4bb5ed1cb4977f2f174d44 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-28T15:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 - Nathanielly Rocha Casado de Lima.pdf: 972650 bytes, checksum: 29dba077fa4bb5ed1cb4977f2f174d44 (MD5) Previous issue date: 2011-03-30 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The Trypanosomatidae family includes parasites of a wide variety of vertebrates, invertebrates (mainly insects), plants and some species of protozoa. In this study, an isolate was obtained by feces culturing of the intestinal tract of Megaselia scalaris Loew, 1866 (Diptera, Phoridae). The original isolate and its clones (obtained by flow cytometry) were deposited in the ?Trypanosomatids Collection of the Instituto Oswaldo Cruz. These clones were characterized by different approaches I in comparison with the reference species of different genera. Its growth has been studied in LIT medium (with 10 or 20% fetal bovine serum) modified according to the requirement. The number of cells per microliter was estimated at 24 h intervals between 48-144 h. Giemsa-stained smears (after acid hydrolysis) were prepared in order to study cell differentiation and morphology of the forms. The isozyme analysis was performed using the following systems: GPI, PGM, 6PGDH, ME, IDH, MDH, ACON, FUM, MPI and HK. Data from this analysis were processed and analyzed numerically using the computacional Jaccard coefficient and UPGMA algorighm. The result set of this study suggest that: (1) The strain of M. scalaris showed 70% similarity with Herpetomonas megaseliae, (2) This isolate showed the exclusive presence of promastigotes in any analysis of the growth curve as expected for the genus Leptomonas, however the forms exhibited high polymorphism. Additional studies using molecular tools will be realized / A fam?lia Trypanosomatidae inclui parasitas de uma grande variedade de vertebrados, invertebrados (principalmente insetos), plantas e algumas esp?cies de protozo?rios. No presente trabalho, um isolado foi obtido por coprocultivo de trato intestinal de Megaselia scalaris Loew, 1866 (Diptera, Phoridae). O isolado original e seus clones (obtidos por citometria de fluxo) foram depositados na "Cole??o de Tripanosomat?deos do Instituto Oswaldo Cruz". Estes clones foram caracterizados por diversas abordagens em compara??o com esp?cies de refer?ncia de diferentes g?neros. Seu crescimento foi estudado em meio LIT (com 10 ou 20% de soro fetal bovino) modificado, de acordo com o n?vel de exig?ncia. O n?mero de c?lulas por microlitro foi estimado em intervalos de 24 h, entre 48-144 h. Esfrega?os corados pelo Giemsa (ap?s hidr?lise ?cida) foram preparados visando estudos de diferencia??o celular e morfometria das formas encontradas. A an?lise de isoenzimas foi realizada utilizando-se os seguintes sistemas: GPI , PGM, 6PGDH, ME, IDH, MDH, ACON, FUM, MPI e HK. Os dados desta an?lise foram processados numericamente e submetidos ? an?lise computacional utilizando-se o coeficiente de Jaccard e o algoritmo UPGMA. O conjunto de resultados deste trabalho sugere que: (1) O isolado de M. scalaris apresentou similaridade de 70% com Herptomonas megaseliae; (2) Esse isolado revelou a presen?a exclusiva de promastigotas em toda an?lise da curva de crescimento, como esperado para o g?nero Leptomonas, entretanto as formas exibiram grande polimorfismo. Estudos complementares utilizando ferramentas moleculares ser?o realizados.

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