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Desvendando processos atuais e históricos dos peixes migradores e sedentários: uma abordagem genômica, filogeográfica e genético-populacional entre as Bacias do Orinoco e Amazonas

Martinez, José Gregório 11 June 2015 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-02-02T14:09:59Z No. of bitstreams: 1 Tese - José Gregório Martinez.pdf: 10347168 bytes, checksum: 58aeb7407718fcc667bec49ca6080657 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-02-04T12:59:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - José Gregório Martinez.pdf: 10347168 bytes, checksum: 58aeb7407718fcc667bec49ca6080657 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-02-04T13:04:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - José Gregório Martinez.pdf: 10347168 bytes, checksum: 58aeb7407718fcc667bec49ca6080657 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-04T13:04:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - José Gregório Martinez.pdf: 10347168 bytes, checksum: 58aeb7407718fcc667bec49ca6080657 (MD5) Previous issue date: 2015-06-11 / Não informada / The Amazon and Orinoco rivers have the greatest diversity of fish fauna of the planet, which is estimated between 1300 - 3000 species. Much of this diversity is shared between them, but to respect there are no solid studies to support the spatial boundaries, time nor the mode of interaction of the ichthyofauna between the two river systems, preventing lay the scientific justification for its correct use for fishing and prioritization of conservation areas. In order to know the evolutionary history and current and historical population relationship between the shared fish fauna for the basins, in addition to the spatial configuration of its conservation units, a phylogeographic and population genomic/genetic approach was performed using eight species of highly exploited fish as model: Five migratory species (Brachyplatystoma rousseauxii, Colossoma macropomum, Piaractus brachypomus, Pseudoplatystoma metaense/P. tigrinum, Pseudoplatystoma orinocoense/P. punctifer) and three sedentary species (Nannostomus unifasciatus, Paracheirodon axelrodi, Pterophyllum altum). For that, the study was conducted in four stages, two for create some genomics tools for the analysis, and two in which was applied genetic and/or genomic tools to answer the initial population questions. First, it was standardized and characterized a methodology for genomic libraries construction for SNPs discovery and de novo genotyping in non-model species. Second, in order to verify the reproducibility and efficiency of the method in sequence tags discovery, genotyping, and utility for SNPs primer design, was used individuals of B. rousseauxii and C. macropomum as model. Third, mtDNA (Cytochrome oxidase I and Region control) and nuDNA (Glycosyltransferase and 6 alpha heavy chain of cardiac myosin) sequences were used to population genetic and phylogeographic analyzes in order to test the hypothesis of current and historical connectivity between basins. Fourth, the conservation units were defined (Evolutionary Significantly Units - ESUs, Adaptive Units - AUs and Management Units - MUs) including new evidence as multilocus analysis (Species trees), ecological data (pH and pluviosity) and genomic data. As a result, we obtained a compatible and efficient method for sequence reads production in IonTorrent PGM. The method was effective for tags discovery (18772-22476), de novo SNPs genotyping (268-398 SNPs) and for primer design in flanking regions of SNPs (23-39 SNPs). Population analysis showed a strong structure for all species between basins, but not within theme (except for sedentary fish). Of the eight species studied, only P. orinocoense/P. punctifer showed evidence of recent gene flow between basins, through the Casiquiare. Nevertheless, for all species, the nuDNA showed strong biological groups sharing between basins, suggesting that the divergence between these is recent. Coalescent analysis showed that only N. unifasciatus populations of Orinoco and Amazon diverged in the Pliocene, while the rest of the species diverged in the Pleistocene. In any case, there was not concordance with the vicariance hypothesis between basins generated by the Vaupés Arch in the Middle Miocene. The genetic, genomic and ecological evidence permitted to determine ESUs and MUs, but not AUs to any species. In most migratory fishes, the basins constituted a single ESU with independents MUs (C. macropomum, P. metaense/P. tigrinum, P. orinocoense/P. punctifer), but only to B. rousseauxii and P. brachypomus each basin were independents ESUs. For sedentary fish, was observed a greater number of ESUs compared with migratory fishes, wherein at least one of these units is shared between basins, while others were exclusives. This study demonstrates that the basins of the Orinoco and Amazon possessed a historical connectivity until the very recent past, and even today keeps this connection condition for part of their fish fauna. / Os rios Amazonas e Orinoco possuem a maior diversidade de ictiofauna do planeta, a qual é estimada entre 1300 - 3000 espécies de peixes. Grande parte desta diversidade é compartilhada entre elas, mas à respeito não existem estudos robustos que sustentem os limites espaciais, temporais e nem o modo de interação desta ictiofauna entre os dois sistemas fluviais, impedindo assim definir as bases científicas que permitam orientar políticas para seu correto uso pesqueiro e priorização de áreas de conservação. Com o objetivo de conhecer a história evolutiva e relações populacionais atuais e históricas entre a ictiofauna compartilhada para as bacias, bem como a configuração espacial das suas unidades de conservação, foi realizada uma abordagem filogeográfica e genômico/genético-populacional utilizando oito espécies de peixes altamente explorados como modelo: cinco migradores (Brachyplatystoma rousseauxii, Colossoma macropomum, Piaractus brachypomus, Pseudoplatystoma metaense/P. tigrinum, Pseudoplatystoma orinocoense/P. punctifer) e três sedentários (Nannostomus unifasciatus, Paracheirodon axelrodi e Pterophyllum altum). Para tanto, o estudo foi realizado em quatro etapas, duas de criação de algumas ferramentas genômicas para as análises, e duas de aplicação de ferramentas genéticas e/ou genômicas para responder as perguntas iniciais. Primeiro, foi padronizada e caracterizada uma metodologia para o desenvolvimento de bibliotecas genômicas para a descoberta e genotipagem de novo de SNPs em espécies não-modelo. Segundo, para verificar a reprodutibilidade e eficiência do método na descoberta de tags de sequência, genotipagem de novo e desenho de primers em regiões flanqueadoras de SNPs, foi aplicado dito método utilizando como modelo às espécies B. rousseauxii e C. macropomum. Terceiro, foram utilizadas sequências de ADNmt (Citocromo oxidase I e Região controle) e ADNnu (Glycosiltransferase e Cadeia pesada 6 alfa da miosina do músculo cardíaco) para análises genético-populacionais e filogeográficos com o objetivo de testar a hipótese de conectividade atual e histórica entre bacias. Quarto, foram delimitadas as unidades de conservação (Unidades Evolutivas Significantes - ESUs, Unidades Adaptativas - AUs e Unidades de Manejo - MUs) incluindo novas evidências como análises multilocus (Species trees), dados ecológicos (pH e pluviosidade) e dados genômicos. Como resultado, obteve-se um método de desenvolvimento totalmente compatível e eficiente na produção de leituras em IonTorrent PGM. O método demonstrou eficácia na descoberta de tags de sequência (18772 – 22476), genotipagem de novo (268 – 398 SNPs) e desenho de primers em regiões flanqueadoras de SNPs (23 – 39 SNPs). As análises populacionais mostraram uma forte estrutura para todas as espécies entre bacias, mas não dentro destas (exceto para os peixes sedentários). Das oito espécies avaliadas, apenas P. orinocoense/P. punctifer apresentou evidências de fluxo gênico recente entre bacias, sendo através do Casiquiare. Apesar disso, para todas as espécies, o ADNnu mostrou um forte compartilhamento de grupos biológicos entre bacias, sugerindo que a divergência entre estas é recente. As análises de coalescência mostraram que apenas as populações de N. unifasciatus do Orinoco e Amazonas divergiram no Plioceno, enquanto que o resto das espécies divergiu no Pleistoceno. Em qualquer caso, não coincidindo com a hipótese de vicariância entre bacias, gerada pelo Arco do Vaupés no Médio Mioceno. As evidências genéticas, genômicas e ecológicas permitiram delimitar ESUs e MUs, mas não AUs para nenhuma espécie. Na maior parte dos migradores as bacias constituíram uma única ESU com MUs independentes (C. macropomum, P. metaense/P. tigrinum, P. orinocoense/P. punctifer), mas só para B. rousseauxii e P. brachypomus cada bacia constituiu uma ESU independente. Para os peixes sedentários foi observado um maior número de ESUs comparado com os migradores, sendo que pelo menos uma destas unidades foi compartilhada entre bacias, enquanto que outras foram exclusivas. Este estudo demonstra que as bacias do Orinoco e Amazonas possuíram uma conectividade histórica até um passado muito recente, ao ponto de hoje se manter esta condição de conexão para parte da sua ictiofauna.
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Ecologia de peixes estuarinos-recifais e caracterização ambiental dos estuários de Pernambuco

PAIVA, Andréa Carla Guimarães de 31 January 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T22:57:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1434_1.pdf: 5888658 bytes, checksum: b32c91ffd8a924864565969e6d6066e6 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A comunidade de peixes nos estuários é constituída por espécies migrantes marinhas e de água doce, que usam esses ecossistemas como áreas de alimentação ou para a reprodução, além das residentes, que passam todo o seu ciclo de vida nesse ambiente. O presente estudo teve como objetivos: (1) avaliar se a diversidade da ictiofauna do rio Formoso varia entre as zonas estuarinas superior, média e inferior, e entre os períodos seco e chuvoso; identificar as espécies de peixes recifais que utilizam o estuário do rio Formoso como área de refúgio e de berçário natural; (2) descrever a distribuição espacial dessa ictiofauna nas estações chuvosa e de estiagem; verificar se houve diferenças espaciais e temporais nas categorias tróficas; (3) compilar as informações existentes na literatura sobre os estuários e a ictiofauna de Pernambuco; caracterizar os principais fatores fisiográficos das áreas estuarinas e as ações antrópicas por elas sofridas; validar os nomes científicos das espécies de peixes que vivem nesses estuários, identificando a sua distribuição. Para o estudo da ictiofauna no estuário do rio Formoso foram feitas coletas bimestrais com rede-de-arrasto tipo mangote. Para a análise dos estuários e da ictiofauna de Pernambuco foram compilados dados de livros, artigos científicos, monografias, dissertações e teses, além da utilização das imagens obtidas através do aplicativo Google Earth para a caracterização dos estuários. No estuário do rio Formoso foram analisados 5.475 indivíduos, pertencentes a 78 espécies e 39 famílias. Carangidae e Gerreidae tiveram a maior riqueza específica, enquanto Clupeidae, Engraulidae e Gerreidae a maior abundância. A maior diversidade ocorreu na zona estuarina superior, e a maior abundância, na zona estuarina média. O tipo de sedimento foi determinante na distribuição espacial da ictiofauna. Entre as espécies dominantes (89%), destaca-se Rhinosardinia amazonica (36%). As espécies mais abundantes ocorreram entre um regime de salinidade de mesohalino (5-18) a euhalino (30-40), sugerindo uma relativa capacidade de regulação osmótica. A maioria da ictiofauna do estuário do rio Formoso é predadora (75%) e com hábito alimentar carnívoro de 2ª. ordem (37,5%). A percentagem de espécies associadas a ambientes recifais foi de 51,3%, sendo 39,2%, 54,2% e 66,7% nas zonas superior, média e inferior, respectivamente. Entre essas espécies, Eucinostomus melanopterus, E. gula e Sphoeroides testudineus destacaram-se, nessa ordem, como as mais abundantes no estuário superior; S. greeleyi, E. melanopterus e Lutjanus synagris, no médio; e E. gula e Albula vulpes, no inferior. A zona superior do estuário é provavelmente a mais produtiva devido a sua maior complexidade morfológica, a maior abundância de Rhizophora mangle (abrigo e refúgio para vários peixes) e ao sedimento lamoso. A ictiofauna do estuário do rio Formoso recebe influência direta dos recifes e da região costeira, entre Sirinhaém e Tamandaré, proporcionando uma maior representatividade de peixes recifais. A maioria das espécies encontra-se em ecofase jovem, evidenciando a importância das águas rasas deste estuário tropical como criadouro natural e abrigo para vários peixes de importância ecológica e econômica. Em Pernambuco foi possível identificar 17 estuários e constatar que a ictiofauna é pouco estudada. As maiores concentrações de trabalhos ocorreram no complexo estuarino de Itamaracá e no estuário do rio Formoso. Para algumas áreas não existem informações sobre comunidade de peixes. Para os estuários de Pernambuco foram listadas 200 espécies de peixes válidas, sendo 32% delas associadas a recifes. Citharichthys spilopterus e Poecilia vivipara foram classificadas como muito freqüentes. As famílias Carangidae, Gerreidae, Ariidae e Haemulidae foram as mais especiosas. Atualmente, as áreas estuarinas de Pernambuco estão em acelerado processo de degradação devido principalmente aos aterros, despejos de esgotos domésticos e industriais, desenvolvimento urbano, viveiros de carcinicultura e construção/ampliaçao de portos em prol do crescimento econômico. Diante desse contexto, torna-se necessário que os órgãos de fomento à pesquisa em Pernambuco estimulem o estudo nessas áreas, imprescindíveis para o desenvolvimento e reprodução de várias espécies de peixes, e conseqüente aumento na captura por pesca
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Ecologia da assembléia de peixes da zona de arrebentação da praia de Jaguaribe, Itamaracá, Pernambuco

SANTANA, Fábio Magno da Silva 31 January 2013 (has links)
Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-05T13:37:46Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE CORRIGIDA.pdf: 2316079 bytes, checksum: 0dbae4408b3ae73ab30f608cdf868de6 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-05T13:37:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE CORRIGIDA.pdf: 2316079 bytes, checksum: 0dbae4408b3ae73ab30f608cdf868de6 (MD5) Previous issue date: 2013 / FACEPE / As zonas costeiras são áreas de transição ecológica que possibilitam uma ligação entre o ecossistema terrestre e marinho, através de trocas genéticas e de biomassa, caracterizandoas como biologicamente diversificados. Dentre estes ecossistemas, encontram-se as zonas de arrebentação, definidas como ambientes dinâmicos, caracterizados pela turbulência e alta energia do movimento de ondas, marés e correntes. São consideradas como parte integrante da antepraia, que é a porção submersa do perfil de praia, estendendo-se da linha de arrebentação, ou primeira linha de quebra das ondas, até o limite inferior da face praial. A presente tese teve como objetivos: I. Caracterizar a ictiofauna da zona de arrebentação da praia de Jaguaribe, Itamaracá-PE, identificando as espécies residentes e seu uso sazonal; II. Compilar dados para gerar a lista da ictiofauna da zona de arrebentação da costa brasileira e inferir as principais diferenças ecológicas na estrutura da comunidade íctica nas regiões analisadas; e III. Verificar a influência do período (diurno e noturno) e da lua (nova e crescente) na riqueza de espécies de peixes da zona de arrebentação da Praia de Jaguaribe (Ilha de Itamaracá, PE) e verificar a variação interanual da riqueza dessas espécies. Para as análises da estrutura e ecologia da ictiofauna da zona de arrebentação da praia de Jaguaribe (PE) e os fatores (lua e período do dia), foram feitos arrastos com rede do tipo picaré, com malha entrenós de 5 mm, numa faixa de 50 m de praia definidos, entre os anos de 2005 a 2008. Para a compilação de dados sobre a composição da assembleia de peixes das zonas de arrebentação do litoral brasileiro foram utilizados artigos científicos publicados sobre composição de comunidades de peixes em zonas de arrebentação em qualquer localidade brasileira. Foi coletado entre março de 2006 e fevereiro de 2007 um total de 6.407 exemplares pertencentes a 35 famílias e 90 espécies. Sete espécies foram residentes anuais (Anchoa tricolor, Anchoviella lepidentostole, Bairdiella ronchus, Larimus breviceps, Lycengraulis grossidens, Polydactylus virginicus e Pomadasys corvinaeformis), três residentes apenas durante a estiagem (Conodon nobilis, Lile piquitinga e Menticirrhus americanus) e duas (C. spixii e N. usta) residentes exclusivamente na época chuvosa. Durante os 3 anos de coletas foram observadas 140 espécies de peixes para a zona de arrebentação de Jaguaribe e constatado que o período do dia e a fase da lua afetam de maneira relevante a riqueza e a abundância de sua ictiofauna. Existe também uma importante variação interanual nas assembléias e é possível obter uma amostragem adequada da comunidade de peixes na zona de surfe com 12 meses de amostragem, desde que as diferentes combinações de período do dia e fase da lua sejam incluídas na amostragem.. Para todo o litoral brasileiro foram compilados 22 artigos científicos sobre distribuição de peixes nas zonas de arrebentação do Brasil e registradas 239 espécies pertencentes a 71 famílias de peixes. As 15 famílias mais especiosas representaram aproximadamente 60% do total de espécies validadas. Os resultados encontrados confirmam a importância da zona de arrebentação para as espécies que habitam este ambiente em diferentes fases do seu ciclo de vida, que o ambiente ainda é pouco estudado e sofre variações de acordo com as estações do ano, luas e período do dia.
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Análise da comunidade de peixes e da teia trófica de um trecho do rio corrente - go / Analysis of the fish and the trophic web of an stretch of the river current - go

ALOÍSIO, Gustavo Ribeiro 18 July 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T16:22:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao gustavo ecologia.pdf: 424080 bytes, checksum: 7e5bf6f85b7e240bad0dbc7566e17266 (MD5) Previous issue date: 2006-07-18 / In this work, fishes of Corrente river, affluent of Paranaíba River (Paraná basin, Brazil), were studied. Five surveys in the period of June of 2003 had been carried out until June of 2005. The sampling was executed in 8 points distributed in the stream, riverbed and lagoon. In each point had been used a set of gillnets with different mesh size (between 12 and 60mm opposite knots). The nets were inspected in the morning and the end of the day. The results had shown that 8 species were captured and the most abundant specie is Astyanax altiparanae; Shannon-Wienner index demonstrated diversity low; Morisita index indicated that there are high similarity between river, stream and lagoons; all species reproduce in the rainy season with exception of the Brycon nattereri; it is demonstrated the existence of piscivores species, herbivores, insectivores and detritus feeders. / Neste estudo da ictiofauna realizado no rio Corrente, afluente do rio Paranaíba-bacia do Paraná, nos municípios de Aporé, Serranópolis e Itarumã (Sudoeste Goiano). Foram realizadas cinco coletas no período de junho de 2003 a junho de 2005. A amostragem foi executada em 8 pontos distribuídos no leito do rio, córregos e remansos marginais, em cada ponto foram utilizadas dezesseis redes de espera divididas em duas estações, com as seguintes malhas (entre nós opostos): 12, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60mm. As redes eram vistoriadas no período da manhã e no final do dia. Os resultados mostraram que foi capturado 8 espécies e a mais abundante é o Astyanax altiparanae, o índice de Shannon- Wienner demonstrou baixa diversidade, o índice de Morisita indicou que há uma alta similaridade entre rio, córrego e remansos; E a reprodução aconteceu praticamente toda no período chuvoso com exceção do Brycon nattereri que se reproduziu no período da seca; a avaliação dos hábitos alimentares demonstrou a existência de espécies piscívoras, herbívoras, detritívoras e insetívoras, que ocorre para 3 espécies.
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Ecologia trófica das principais espécies de peixes do Rio Paraíba do Sul na área de influência do Aproveitamento Hidrelétrico Simplício durante o período pré-represamento

Rodrigues, Daniela 29 October 2013 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-09-06T11:42:22Z No. of bitstreams: 1 danielarodrigues.pdf: 2011372 bytes, checksum: 5d6e7fd740f12ba0e65a06a68be21941 (MD5) / Approved for entry into archive by Diamantino Mayra (mayra.diamantino@ufjf.edu.br) on 2016-09-06T11:57:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 danielarodrigues.pdf: 2011372 bytes, checksum: 5d6e7fd740f12ba0e65a06a68be21941 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-06T11:57:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 danielarodrigues.pdf: 2011372 bytes, checksum: 5d6e7fd740f12ba0e65a06a68be21941 (MD5) Previous issue date: 2013-10-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O presente trabalho traz uma descrição da ecologia trófica das principais espécies de peixes do Rio Paraíba do Sul, na região do Aproveitamento Hidrelétrico (AHE) Simplício Queda Única no período anterior à formação do reservatório e levando-se em conta possíveis alterações sazonais. Foram selecionadas 13 espécies principais que, embora representem apenas 20,6% da riqueza de espécies, em termos de biomassa e abundância de indivíduos, constituem 84,2 e 74,1%, respectivamente. As coletas foram realizadas de novembro de 2009 a novembro de 2011. As guildas tróficas foram identificadas através de uma Análise de Correspondência e a sobreposição de nicho calculada entre os pares de espécies. Para as espécies separadamente, a ecologia alimentar foi descrita através da importância proporcional dos itens consumidos (método volumétrico), amplitude de nicho e estratégias alimentares. Para avaliação de possíveis variações sazonais na dieta, foram comparados os períodos seco (abril a outubro) e chuvoso (novembro a março). Foi possível diferenciar o agrupamento das espécies, no espaço da dieta, em cinco guildas alimentares: detritívora, herbívora, invertívora, onívora e piscívora; no entanto, nem todas diferiram significativamente entre si. Os peixes consumiram mais itens alóctones durante a estação de chuvas, mas diferenças sazonais significativas nas dietas foram encontradas somente para as espécies Astyanax gr A. bimaculatus, O. hepsetus e P. fur. O grande consumo de insetos, inclusive por espécies reconhecidamente piscívoras (O. hepsetus e P. squamosissimus) pode ser um indicativo de que altas densidades deste item estejam disponíveis no ambiente. Para as espécies com mais de 10 indivíduos coletados na mesma localidade e campanha (considerada como uma população), foi calculado o grau de especialização individual (EI). A EI ficou entre média e alta, o que indica variação intrapopulacional da dieta. A maioria das espécies mostrou oportunismo no consumo de recursos. O Rio Paraíba do Sul já é bastante impactado no trecho estudado, por estar localizado em área urbana, o que foi refletido na dieta de diversas espécies através do consumo de materiais de origem antrópica (e.g. plásticos). O oportunismo pode favorecer seu ajuste e permanência no local após a formação do reservatório. No entanto, somente projetos continuados de monitoramento poderão descrever as respostas reais destas espécies, bem como as alterações que ocorrerão na estrutura trófica do reservatório, conforme descrito em outros estudos em diversas bacias brasileiras. / We herein describe the feeding ecology of the main fish species of the Paraíba do Sul River, during the dry and rainy seasons, previously to its impoundment by the Simplício Hydroelectric Dam. A total of 13 species were selected. Although representing only 20.6% of species richness in the area, they correspond to 84.2% and 74,1% of all individuals in terms of biomass and abundance, respectively. Sampling was conducted between November 2009 and November 2011. Trophic guilds were assigned through a Correspondence Analysis. Pairwise feeding overlap was calculated. The feeding ecology of each species was described through the proportional importance of condumed items (volumetric method), niche width and feeding strategies. Seasonal variations were evaluated through comparisons between the dry (April to October) ad rainy (November to March) seasons. Species were grouped into five guilds in the diet space: detritivores, herbivores, invertivores, omnivores and piscivores; however, most groups did not differ significantly. Overall, fishes consumed more allochthonous material during the rainy season, but seasonal differences in diet were statistically significant only for Astyanax gr A. bimaculatus, O. hepsetus e P. fur. The consumption of large amounts of insects, also by species recognized as piscivores, (O. hepsetus e P. squamosissimus) might indicate high availability in the river. For species with more than 10 individuals collected at the same site and field trip (considered herein as a population), we calculated the degree of individual specialization (IS). Is achieved intermediate and high values, indicating intrapopulational variation. Most species showed opportunism. The River Paraíba do Sul is highly impacted in the studied area, mainly because of urbanization, which was reflected in the diet of several species through the consumption of materials of anthropic origin (e.g. plastic). The overall opportunism of fish species might favor their adjustment and permanence after reservoir formation. Nevertheless, the actual responses of these species as well as alterations in the trophic structure caused by the impoundment will only be detected through long-term projects for monitoring, as described in several studies in other impounded Brazilian basins.
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Introdução de espécies, estrutura dos habitats e padrões de diversidade da ictiofauna em ecótonos do reservatório do Broa, SP / Introduction of species, habitats structure and diversity patterns of the Broa reservoir ichthyofauna in ecotones

Marinelli, Carlos Eduardo 23 August 2002 (has links)
A influência da estrutura ambiental sobre os padrões de diversidade da ictiofauna de ecótonos são analisados para o reservatório do Broa, bacia do rio Tietê (22º10\'S; 47º54\'W). Paralelamente, são avaliadas as alterações na composição dessa comunidade entre 1985 e 2000. Constituída por 24 espécies (sete ordens e 12 famílias de peixes) e com um alto nível de diversidade (1,99 bits./ind.), a ictiofauna estudada não apresentou variação espacial ou temporal na abundância de suas espécies. Os padrões de baixa captura e freqüência das quatro espécies introduzidas, parecem não evidenciar risco potencial de impacto negativo aos estoques hospedeiros. Determinadas principalmente pelo fluxo d\'água e estado trófico, as variáveis ambientais evidenciaram as alterações estruturais a que ecótonos estudados vêm sendo submetidos. Apesar da ausência de variação significativa entre a estrutura da ictiofauna de zonas de transição e bancos de macrófitas, perante a sazonalidade, essas taxocenoses apresentaram distintos padrões de composição, estabilidade e variação estrutural. Bancos de macrófitas tornam a área alagada mais heterogênea, constituindo comunidades com maior riqueza e diversidade de espécies, sendo drasticamente afetadas pela sazonalidade. Entre as espécies constantes, 90% estiveram ordenadas junto aos bancos de macrófitas, onde variações na disponibilidade de recursos críticos (p.e. alimentação e abrigo) segregam nas sazonalmente, enquanto fluxo d\'água e estado trófico são os gradientes determinantes dos habitats de abundância predominante das espécies. / The influence of environmental aspects on diversity patterns for the ichthyofauna of ecotones were analyzed for the Broa reservoir, Tiete river basin (22º10\'S; 47º54\'W). Alterations in the ichthyofauna composition have also been analyzed considering the period from 1985 and 2000. This fauna constituted by 24 species (seven orders and 12 families) and a high diversity (1,99 bits/ind.), showed no spacial or temporal variations in species abundance. The pattern of low capture and frequency of four species introduced in inchangeable, not pointing out to the risk of a potential negative impact over the native species. Determined mainly by the inflow and trophic condition, the environmental variables show clearly the structural alterations that these ecotones studied have been undergoing. Although there was no significant seasonal variation between the ictiofauna structure of the transitional zones and macrophytes banks, these taxocenoses presented a distinct composition pattern, stability and structural variation. Macrophytes banks increase the environmental heterogeneity of wetland areas, resulting communities with high species diversity, being drastically affected by seasonality. Between the constant species 90% ordained along macrophytes banks, variations on the availability of critical resources (f.e. food and shelter) cause for the seasonal segregation of these species, inflow and trophic condition were the determinant gradients on the principal habitats occupied by the species.
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A ictiofauna agregada a um sistema de piscicultura em tanques-rede na represa oligotrófica de Chavantes (médio rio Paranapanema, SP/PR) : composição de espécies e atributos ecológicos /

Nobile, André Batista. January 2010 (has links)
Orientador: Edmir Daniel Carvalho / Banca: Gilmar Bastos Santos / Banca: Ana Paula Vidotto Magnoni / Resumo: A criação de peixes em gaiolas ou tanques-rede iniciou-se há mais de 50 anos, no Delta do rio Mekong. Atualmente, este tipo de cultivo está se expandido em represas brasileiras, tendo como modelo a espécie não nativa Tilápia-do-Nilo (Oreochromis niloficus). Contudo os impactos decorrentes desta atividade sobre a ictiofauna são pouco conhecidos. Sendo assim, o objetivo deste trabalho é caracterizar a estrutura e composição das assembléias de peixes agregadas ao sistema de piscicultura e do respectivo trecho controle e, com base em atributos ecológicos, inferir possíveis impactos destes sistemas sobre a ictiofauna residente da represa de Chavantes. Para tal foram realizadas coletas, com redes de espera, nos meses de outubro e dezembro de 2007 na área onde seriam instalados os tanques-rede (pré- Tanque) e no período de abril/2008 a março/2009 (pós-Tanque), ao redor dos tanquesrede (TR) e em um trecho controle (CT) - sem interferência deste sistema. Entre os períodos pré-TR e TR foram encontradas diferenças com relação à composição de espécies e às médias de captura em número e biomassa. Entre os trechos TR e CT, o primeiro foi responsável por mais de 75% das capturas em abundância e biomassa. Foram observadas diferenças na composição das espécies, porém os trechos apresentaram similaridade ictiofaunística média (Jaccard = 0,73 e Morisita-Horn = 0,43). Não foram encontradas grandes diferenças com relação aos demais índices ecológicos, porém, o TR apresentou menor diversidade e riqueza de espécies e maior dominância. Assim reforçamos a idéia de que os sistemas de tanques-rede exercem forte atratividade sobre os peixes, causando agregações ao seu redor, resultando em re-estruturação da ictiofauna, pois favorecem as espécies oportunistas que se ajustam mais facilmente às novas condições resultantes das atividades deste empreendimento... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Fish farming in cages or net pens began more than 50 years in the Mekong Delta. Currently, this type of cultivation is expanding in the Brazilian reservoirs having as a model the non-native specie nile-tilapia (Oreochormios niloticus) However it's impacts on the fish fauna are poorly known. The present study seeks to defining the structure and composition of fish assemblages aggregated to that system and and its stretch control and, based on ecological attributes identify potential impacts caused by fish farming system on the on the resident fish fauna existing at the chavantes damo In order to attend that purpose it was used gill nets to collect samples in October and December of 2007 from the area where the net-pens would be installed (pre-tank) and from April of 2008 through March of 2009 (post-tank) around the cages (TR) and from a control section (CT) not influenced by the fish farming system. As a result, differences concerning species' composition and average catch in abundance and biomass were found between the pre-TR and TR periods. Comparing to the CT strecht, the TR stretch presented more than 75% of the catch in number of biomass. Differences relating to the species compositions were also found. However the stretchs presented similar average of fish fauna (Jaccard = 0.73 and Morisita-Horn = 0.43). There was no major difference concerning other ecological index, however, TR had lower diversity and species richness and higher dominance. Hence, it is reinforced the idea that systems of cages exert a strong attraction for fish, causing aggregations around the cages, resulting in restructuring of the fish fauna, for they benefit those opportunistic species witch adjust more easily to the new conditions caused by that kind cultivation. Yet, one must pay attention to the issues of non-native species that can cause significant impacts. Since this study was accomplished during... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Ictiofauna associada a bancos de podostemaceae no complexos de cachoeiras de Dardanelos, rio Aripuanã - MT

Flausino Junior, Nelson 22 February 2008 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2015-11-06T19:52:13Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_ Nelson Flausino Junior.pdf: 2527818 bytes, checksum: a6392b78c0a73436c6c9ce813db8892e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-06T19:52:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_ Nelson Flausino Junior.pdf: 2527818 bytes, checksum: a6392b78c0a73436c6c9ce813db8892e (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2008-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study presents a characterization of fish fauna associated with Podostemaceae banks in the Dardanelles complex of waterfalls on the river Aripuanã, Aripuanã, MT. The forragemento tactics were studied, diet, trophic structure and spatial and temporal variations of the fish assemblage associated with podostemáceas banks. A discussion of patterns of use of space and the possible occurrence of sharing food resources is presented. / O presente estudo apresenta uma caracterização da ictiofauna associada aos bancos de Podostemaceae no complexo de cachoeiras de Dardanelos no rio Aripuanã, Aripuanã, MT. Foram estudadas as táticas de forragemento, dieta, estrutura trófica e variações espaciais e temporais das assembleias de peixes associados aos bancos de podostemáceas. Uma discussão sobre padrões de uso do espaço e a possível ocorrência de partilha de recursos alimentares é apresentada.
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Efeitos da poluição crônica e aguda sobre a composição da ictiofauna do Rio dos Sinos, RS, BRASIL

Costa, Patrícia Fernandes da 30 October 2009 (has links)
Submitted by Nara Lays Domingues Viana Oliveira (naradv) on 2015-06-16T13:52:54Z No. of bitstreams: 1 PatriciaCostaBiologia.pdf: 61233 bytes, checksum: 22d13bd6e3b6610817a793613276d93b (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-16T13:52:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PatriciaCostaBiologia.pdf: 61233 bytes, checksum: 22d13bd6e3b6610817a793613276d93b (MD5) Previous issue date: 2009-10 / UNISINOS - Universidade do Vale do Rio dos Sinos / O escoamento de efluentes domésticos e industriais nos sistemas hídricos pode afetar a composição das espécies de peixes nas comunidades. No Rio Grande do Sul, o Rio dos Sinos concentra, na região da planície, uma grande quantidade de indústrias coureiro calçadistas, metalúrgicas, têxteis e petroquímicas. Considerando a descarga contínua de efluentes no Rio dos Sinos e a ausência de conhecimentos das respostas das comunidades ictiícas diante de impactos dessa proporção, os objetivos do presente estudo foram: (1) Verificar os efeitos da poluição crônica sobre a composição e a diversidade das comunidades em uma escala temporal de aproximadamente dez anos (2) Averiguar os efeitos da poluição aguda em uma escala espacial, comparando um trecho afetado com outro não afetado pela mortalidade de aproximadamente 100 toneladas de peixes em outubro de 2006. As amostragens foram realizadas sazonalmente no período de setembro de 2007 a março de 2009, em seis locais do Rio dos Sinos: Fraga, Caraá, Parobé, São Leopoldo, Sapucaia do Sul e Canoas. Nas localidades de Fraga, Caraá, Parobé e São Leopoldo as coletas foram realizadas nos pontos idênticos aos do levantamento histórico de dez anos atrás. A metodologia aplicada consistiu em uma bateria de sete redes de espera e pesca elétrica. Um total de 8481 foi amostrado no presente estudo, pertencentes a sete ordens, 21 famílias e 68 espécies. A riqueza e a CPUE apresentaram diferenças significativas entre o estudo atual e o histórico. O trecho afetado pela mortalidade de peixes apresentou valores significativamente mais elevados de riqueza e de CPUE do que, o trecho não afetado. Em virtude dos resultados obtidos no presente estudo foi verificado que o aumento da riqueza e a diminuição da CPUE dos pontos em comum com o estudo histórico não estiveram relacionados com a proporção de espécies resistentes e sensíveis, mas sim com interações ecológicas. A poluição aguda e a crônica influenciaram temporal e espacialmente, respectivamente a composição das espécies. Entretanto, o Rio dos Sinos, após anos de exposição a poluentes de diversas origens ainda consegue manter condições favoráveis ao estabelecimento de muitas espécies. Entretanto, devido à descarga contínua de efluentes, muitas destas espécies poderão ser eliminadas, acarretando em uma diminuição profunda em sua diversidade.
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Descrição cariótica e novas ocorrências de cromossomos supranuméricos em Moenkhausia Eigenmann, 1903 (Characiformes: Characidae) /

Nascimento, Cristiano Neves do. January 2015 (has links)
Orientador: José Carlos Pansonato Alves / Banca: Orlando Moreira Filho / Banca: Patrícia Elda Sobrinho / Resumo: O mapeamento cromossômico de sítios de DNA repetitivo vem sendo realizado em vários estudos citogenéticos em peixes e tem permitido uma melhor caracterização da biodiversidade e evolução genômica da ictiofauna Neotropical. Dentre as diversas espécies de peixes distribuídas nesta importante área geográfica, podemos destacar o gênero Moenkhausia, um dos mais especiosos grupos de peixes da família Characidae. Do ponto de vista citogenético, este gênero demonstra variação do número diploide de 48 a 50 cromossomos, bem como a presença de microcromossomos B descritos para diferentes espécies/populações. No entanto, estudos citogenéticos de espécies de Moenkhausia coletadas em riachos de cabeceira da bacia Amazônica e bacia do Alto rio Paraguai ainda são incipientes, bem como os estudos relativos à distribuição de DNAs repetitivos nos genomas de diferentes espécies de Moenkhausia. Neste sentido, o presente trabalho teve como objetivo a caracterização cariotípica de Moenkhausia cosmops, M. cf. forestii, M. cf. nigromarginata, M. oligolepis e Moenkhausia sp. coletadas em diferentes rios e riachos de cabeceira da bacia Amazônica e bacia do Alto rio Paraguai. Todas as espécies foram analisadas através de técnicas citogenéticas clássicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela impregnação por Nitrato de Prata e bandamento C) e molecular (hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 5S e 18S, histona H1, snDNA U2 e sequências teloméricas (TTAGGG)n). Todas as espécies/populações analisadas apresentaram 2n=50 cromossomos, porém com fórmulas cariotípicas distintas entre elas. O bandamento C revelou um padrão de bandas heterocromáticas similar entre essas espécies, exceto em M. cf. nigromarginata. A impregnação por Nitrato de Prata evidenciou Ag-RONs simples em todas as espécies analisadas. A FISH utilizando o DNAr 18S como sonda confirmou os resultados obtidos com o Nitrato de Prata e... / Abstract: The cytogenetic mapping of repetitive DNA has been applied in several studies in fish, which allowed a better characterization about the biodiversity and genomic evolution of Neotropical ichthyofauna. Among the several fish species living in this area, the genus Moenkhausia, one of the specious groups inside Characidae, is remarkable. From a cytogenetic point of view, this genus show variations in diploid numbers of 48 to 50 chromosomes, as well as the occurrence of B chromosomes in different species/populations. However, cytogenetic studies in Moenkhausia collected at different rivers from the Amazon and Upper Paraguay River basins are scarce, as well as studies investigating the chromosomal distribution of repetitive DNAs in different species. In this sense, the present study aimed to characterize the karyotypes of Moenkhausia cosmops, M. cf. forestii, M. cf. nigromarginata, M. oligolepis and Moenkhausia sp. collected at different sites in the Amazon and Upper Paraguay River basins. All species were analyzed using classical (conventional staining with Giemsa, localization of NORs by impregnation with Silver nitrate and C-banding) and molecular (fluorescent in situ hybridization with 5S and 18S rDNA, H1 histone, U2 snDNA and telomeric sequences (TTAGGG)n probes). All the herein analyzed species showed 2n=50 chromosomes, with different karyotype formulas. C-banding evidenced similar patterns of heterochromatin distribution in all species, except in M. cf. nigromarginata. Silver nitrate staining evidenced simple Ag-NORs in all species and FISH with 18S rDNA probes confirmed these results e revealed additional sites in M. oligolepis. The 5S rDNA was interstitially located in multiple sites in all species. Notably, both ribosomal sites were found in synteny in one population of M. oligolepis. The H1 histone sites were co-located in a single pair with 18S rDNA and the U2 snDNA was located at multiple sites in all species. Additionally, the ... / Mestre

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