Propõe-se analisar teoricamente a instabilidade disruptora que ocorre em plasmas confinados em Tokamaks, investigando-se a influencia de campos helicoidais ressonantes em seu equilíbrio. Para isso, considerou-se a superposição do campo magnético do plasma em equilíbrio MHD estático com o campo associado às ressonâncias, levando-se em conta a geometria toroidal do Tokamak. Devido a falta de simetria, as linhas do campo magnético total resultante desta superposição devem formar superfícies magnéticas apenas em algumas regiões do plasma. Usando o método da media, foram obtidas (analiticamente) funções de superfícies aproximadas que contem, em torno das regiões de ressonância do plasma, as linhas deste campo magnético total. Verificou-se que estas superfícies aproximadas têm estruturas de ilhas magnéticas. / It is proposed to analyse theoretically the disruptive instability that occurs in confined plasmas in Tokamaks, through investigation of the influence of resonant helical fields on their equilibrium. With this aim, a superposition of the magnetic field of the plasma in static MHD equilibrium with the field associated with the resonances is considered, taking into account the toroidal geometry of the tokamak. Due to the lack of symmetry, the lines of the total magnetic field resulting from this superposition must form magnetic surfaces only around some regions of the plasma. Using the averaging method, functions of approximate magnetic surfaces are obtained (analitically) around the regions of resonances of the plasma (they contain the lines of this total magnetic field). It was verified that these approximate surfaces have structures of magnetic islands.

Neste trabalho, consideramos os efeitos de um campo magnético ressonante externo sobre o plasma confinado em um tokamak. Este campo magnético pode ser produzido quer por condutores helicoidais ou por um limitador magnético caótico. O principal propósito desse campo magnético ressonante é criar uma região de linhas de força caóticas na borda da coluna de plasma que pode melhorar o confinamento do plasma. O campo magnético de equilíbrio foi obtido resolvendo-se a equação de GRAD-SHAFRANOV em um sistema de coordenadas intrinsecamente toroidal (as coordenadas polares toroidais). Obtivemos o campo magnético, gerado pelos condutores helicoidais, através da solução explícita da equação de LAPLACE no mesmo sistema de coordenadas. A partir desse campo magnético, tomando o termo de mais baixa ordem, obtivemos analiticamente um mapa estroboscópico simplético para um conjunto de anéis limitadores magnéticos caóticos. Calculamos esse mapa estroboscópico simplético usando uma formulação hamiltoniana e adotando a. ação dos limitadores magnéticos caóticos como uma sequência de pulsos do tipo função delta. Com esse mapa estroboscópico simplético, caracterizamos algumas ilhas magnéticas ressonantes e a transição para um regime de caos global através da superposição das mesmas. Usamos esse mapa estroboscópico simplético para estudar o transporte das linhas de força na borda da coluna de plasma. A perda de linhas de força caóticas, que atingem a parede interna do tokamak, segue uma distribuição de POISSON. Calculamos, ainda, o número médio de voltas, ao redor da câmara de vácuo, necessárias para que uma linha de força caótica atinja a parede da câmara. / In this work, we have considered the effects of an external resonant magnetic field on the plasma confined in a tokamak. This resonant field can be produced by helical windings or by a chaotic magnetic limiter. The main purpose of this resonant magnetic field is to create a region of chaotic field lines at the edge of the plasma that can improve the confinement of the plasma. The equilibrium tokamak field was obtained by solving the GRAD-SHAFRANOV equation in an intrinsically toroidal coordinate system (the toroidal polar coordinates). We have obtained the magnetic field which has been generated by helical windings through an explicit solution of the LAPCACE equation in the same coordinate system. From this magnetic field, taken in its lowest order, we have analytically obtained a sympletic stroboscopic map for a set of chaotic magnetic limiters. We have calculated this sympletic stroboscopic map by using a Hamiltonian formulation and by supposing the action of the chaotic magnetic limiters as a sequence of delta-function pulses. With this sympletic stroboscopic map we have characterized some resonant magnetic islands and the onset of global chaos through their overlap. We have used this sympletic stroboscopic map in order to study the transport of the field lines at the edge of the plasma. The loss of chaotic field lines that reach the inner wall of the tokamak follows a POISSON distribution. We have also calculated the average number of toroidal turns for a chaotic field line to reach the inner wall of the tokamak.

Este trabalho é uma contribuição para um maior conhecimento da fauna através do inventário de Squamata e do estudo cromossômico de algumas espécies do continente e ilhas do Município de Cananéia, litoral sul do Estado de São Paulo. Ilhas estudadas: Ilha do Bom Abrigo, Ilha de Cananéia e Ilha do Cardoso. A amostragem de fauna de Squamata foi efetuada através de um gradiente altitudinal do nível do mar até cerca de 300 m, durante 30 meses, outubro de 2003 a abril de 2006. Foram utilizados os seguintes métodos de amostragem: procura limitada por tempo, coleta em estrada, coleta de terceiros, armadilhas de interceptação e queda. No continente e nas ilhas foram coletadas 25 espécies de serpentes, sete espécies de lagartos e uma espécie de anfisbena. Pesquisas em coleções herpetológicas e em trabalhos científicos acrescentaram oito espécies de serpentes e uma espécie de lagarto. O Município de Cananéia portanto tem como inventário geral a listagem de 33 espécies de serpentes, oito espécies de lagartos e uma espécie de anfisbena. Listas de espécies são apresentadas para cada ilha: Ilha do Bom Abrigo com duas espécies de serpentes e uma espécie de lagarto; Ilha de Cananéia, com 20 espécies de serpentes, três de lagartos e uma de anfisbena; Ilha do Cardoso, com 22 espécies de serpentes, seis de lagartos e uma de anfisbena. No Município de Cananéia, em todas as áreas estudadas, as serpentes Liophis miliaris e Bothrops jararacussu e o lagarto Enyalius iheringii apresentaram um maior número de indivíduos coletados. Nas coletas da Ilha de Cananéia as espécies de serpentes mais comuns foram Liophis miliaris e Sibynomorphus neuwiedi e a espécie de lagarto Hemidactylus mabouia. As espécies mais comuns na Ilha do Cardoso foram as serpentes Bothrops jararacussu e Spilotes pullatus e o lagarto Enyalius iheringii. Nenhuma das curvas de rarefação feitas para os métodos de amostragem atingiram a assíntota. Os estudos cromossômicos, em coloração convencional, foram feitos em cinco espécies de lagartos e uma espécie de anfisbena. Os cariótipos das espécies Colobodactylus taunayi e Diploglossus fasciatus foram descritos pela primeira vez. Os cariótipos descritos para espécies em populações de ilhas não apresentaram diferenças no número e na morfologia dos cromossomos em relação às espécies de populações do continente. / This study is a contribution to the knowledge of the fauna inventory and of the chromosomes of snake, lizard, and amphisbaenian species of continental and insular areas of Cananéia, the southern littoral of the state of São Paulo. Three islands were studied: Bom Abrigo, Cananéia, and Cardoso. Sampling of Squamata fauna was carried out for altitudes from sea level up to about 300 meters from October 2003 to April 2006. Sampling methods used: time limited search, road samplings, population donations, and pit falls. Both on the continent and the islands, 25 snake, 7 lizard, and one amphisbaenian species were collected. Herpetological collections and the scientific literature were surveyed and contributed with eight more snake and one lizard species. Both continental Cananéia and the islands had a general inventory of 33 snake, 8 lizard and one amphisbaenian species. A general species list was drawn up as well as one for each of the three islands studied: Bom Abrigo with two snake and one lizard species; Cananéia Island with 20 snake, three lizard and one amphisbaenian species and Cardoso with 22 snake , 6 lizard and one amphisbaenian species. In the studied areas, the most common snake species were Liophis miliaris and Bothrops jararacussu and the most common lizard species was Enyalius iheringii. On the island of Cananéia, Liophis miliaris and Sybinomorphus neuwiedi were the most sampled snake species and Hemidactylus mabouia, the most sampled lizard species. Bothrops jararacussu and Spilotes pullatus and the lizard Enyalius iheringii were the most commonly collected on Cardoso Island. The rarefaction curves for the methods used for our samples did not reach an asymptote. Chromosomal studies on five lizard species and one amphisbaenian species were carried out. Conventional staining was used in the cytological preparations. The karyotypes for the species Colobodactylus taunayi and Diploglossus fasciatus were described for the first time. There are no differences in the karyotype descriptions in the number and morphology of the chromosomes for the continental and island populations studied.

A poluição por poluentes orgânicos persistentes (POPs) é um tema de considerável importância com relação à conservação de aves marinhas e de seus habitats. A Reserva Biológica do Atol das Rocas (AR) e o Arquipélago de Trindade e Martin Vaz (AT) abrigam grandes populações de aves marinhas no Brasil. As ilhas oceânicas brasileiras podem ser consideradas áreas remotas e preservadas, devido a sua distância do continente. Entretanto, essas regiões também estão sujeitas à influência desses agentes antrópicos oriundos das regiões costeiras. No presente estudo amostras de fígado de seis espécies de aves marinhas do AR e do AT foram analisadas para presença de POPs (PCBs, pesticidas organoclorados e PBDEs) e para isótopos estáveis (13C e 15N). PCBs (3,37 a 189), DDTs (0,5 a 23,1), HCB (0,31 a 12,3) e HCHs (<0,31 a 7,60) foram os compostos predominantes (valores em ng g-1 em massa úmida). A análise de isótopos estáveis contribuiu para esclarecer a relação dos valores de concentração de POPs com os hábitos de forrageio, dieta, distribuição espacial e estágio de vida dos indivíduos em estudo. Correlações significativas entre &#948;15N e os poluentes sugere, em certo grau, uma considerável variação no perfil qualitativo dos PCBs associada ao nível trófico e ao efeito de transporte atmosférico como fonte de introdução desses contaminantes a esses organismos. Os dados de POPs e isótopos mostraram que aves que ocupam posições tróficas maiores tendiam a apresentar também maiores concentrações de contaminantes, assim como perfis qualitativos com predominância de contaminantes mais bioacumulativos. / Pollution persistent organic pollutants (POPs) is an issue of considerable importance with regard to the conservation of seabirds and their habitats. The Rocas Atoll Reserve (AR) and the Trindade e Martin Vaz Archipelago (AT) houses a large population of seabirds in Brazil. Brazilian oceanic islands could be considered as remote and preserved zones, due to its distance from the coast. However, this regions are subjected to the influence of these anthropogenic agents that arising from continental zones. In the present study, liver samples were collected from six seabird species from AR and AT and analysed for the presence of persistent organic pollutants (POPs: PCBs, organochlorine pesticides and PBDEs) and stable isotopes (13C and 15N). PCBs (3.37 to 189), DDTs (0.5 to 23.1), HCB (0.31 to 12.3) and HCHs (<0.31 to 7.60) were the predominant compounds (mean values in ng g-1 wet weight).The stable isotope analysis revealed the relationship of POP levels with foraging, diet, special distribution and living habits of the studied species. Significant correlations found between &#948;15N and POPs suggests, to some extent, that such considerable variation in qualitative PCB levels associated with the trophic level and to the long-range atmospheric transport. POPs level and stable isotope data showed that seabirds that occupy higher trophic positions trend to show the highest POPs levels, as well as, showed the predominance of the most bioaccumulative contaminants on the respective qualitative profiles.

Submitted by Priscila Oliveira (priscila.b.oliveira@ufes.br) on 2016-07-11T18:56:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação de Mestrado_Laura Silveira Vieira.pdf: 5771317 bytes, checksum: ea1b4e05c2f2e96127db3a82d1034d99 (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-07-12T13:34:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação de Mestrado_Laura Silveira Vieira.pdf: 5771317 bytes, checksum: ea1b4e05c2f2e96127db3a82d1034d99 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T13:34:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação de Mestrado_Laura Silveira Vieira.pdf: 5771317 bytes, checksum: ea1b4e05c2f2e96127db3a82d1034d99 (MD5) / Sistemas recifais são feições comuns ao longo de muitos litorais tropicais modernos e as evidências de suas ocorrências durante diferentes níveis do mar têm sido muito estudadas por todo o mundo. A Plataforma de Abrolhos (Brasil) engloba o mais importante sistema de recifes de coral no Atlântico Sul apresentando altos níveis de endemismo, baixa diversidade e morfologia única de crescimento (formações recifais conhecidas como "chapeirões"). O desenvolvimento recifal na plataforma se dá pela presença de dois arcos recifais rasos paralelos à costa, além de recifes afogados ao longo das porções centro-norte e sul da mesma. O principal objetivo deste estudo é investigar o registro geológico do processo evolutivo holocênico de dois ambientes recifais na região da Plataforma de Abrolhos. Para isso foram sondados dois recifes submersos com seus topos a 4 e 15 metros de profundidade, chamados respectivamente de recifes “Shallow Water” (SW) e “Deep Water” (DW), onde foram coletados oito testemunhos distribuídos nas direções vertical (a partir do topo recifal) e horizontal (perpendiculares às paredes do recife). Os testemunhos coletados tiveram recuperação variando entre 0,70 e 2,03 metros de comprimento. Foram observadas significativas formações de corais e de algas (espécies de corais como Mussismilia harttii., Millepora sp., Siderastrea sp., Porites sp., Favia sp. e Madracis sp.; e espécies de algas calcárias como Hydrolithon sp., Lithophyllum kotschyanum, Lithophyllum sp., Amphiroa sp., Mesophyllum erubescens e Sporolithon episporum). No entanto, verificou-se que os organismos mais abundantes na edificação recifal foram os briozoários da família Schizoporellidae. Grandes formações de briozoários incrustantes foram descritas em todos os testemunhos, compreendendo cobertura superior a 15% na superfície longitudinal dos mesmos e podendo alcançar cobertura de até 52,9% em dois deles. Porém, briozoários foram mais representativos nos testemunhos do recife “DW”. Contraditoriamente, a fraca concorrência espacial identificada nos briozoários incrustantes pode ser a explicação para a maior ocorrência destes organismos nos testemunhos do recife “DW”, onde organismos zooxantelados e fortes concorrentes espaciais em ambiente com grande incidência de radiação solar não conseguem se desenvolver. Datações utilizando radiocarbono evidenciaram que o recife “DW” é mais antigo que o recife “SW”, bem como um maior acúmulo recifal (e principalmente no topo recifal) no recife “SW” nos últimos mil anos. Pela presença de corais zooxantelados e algas características de ambientes rasos, sugere-se que toda a estrutura recifal analisada se desenvolveu em ambiente de baixa profundidade (< 30 metros) na plataforma continental. / Coral Reef systems are common features throughout many modern tropical coastal zone and the evidence of their occurrence during different sea levels have been studied worldwide. The Abrolhos Shelf (Brazil) encompasses the most important coral reef system in the South Atlantic showing high levels of endemism, low diversity and unique growth (locally known as “chapeirões”). The reef system along the shelf is characterized by shallow reef arcs parallel to the coast, and “give-up” reefs throughout the north-central and southern shelf. The main objective of this study is to investigate the geological record showing the Late Holocene evolution of two submerged pinnacles in the Abrolhos Shelf. Herein, two submerged pinnacles were drilledwith their tops at 4 and 15 m below sea level, called "Shallow Water Reef" (SW) and "Deep Water Reef" (DW). A total of eight cores were collected. Vertical (top down) and horizontal (perpendicular to the pinnacle wall) cores were recovered, ranging from 0.70 to 2.03 m in length. Significant coralgal framework was observed in the cores (corals such species as Mussismilia harttii., Millepora sp., Siderastrea sp., Porites sp., Favia sp. and Madracis sp.; and coralline algae such species as Hydrolithon sp., Lithophyllum kotschyanum, Lithophyllum sp., Amphiroa sp., Mesophyllum erubescens and Sporolithon episporum). However, we found that by far the most abundant framebuilding component were Schizoporellidae bryozoans. Extensive encrusting bryozoans were identified in all cores comprising between 15 - 52,9% of 2D areas. Bryozoans were most representative in the "DW" cores. Paradoxically, the poor spatial competition of encrusting bryozoans must be the explanation for the bryozoan dominance in the "DW" cores, which hermatypic corals can not develop. Radiocarbon dates indicate that the "DW" reef is older than the "SW" reef as well as higher reef accumulation rates occur in the past thousand years is in the "SW" reef. The results show that the both reefs have been developed in a shallow shelf environment (<30 meters depth)

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-12T15:18:47Z No. of bitstreams: 1 618229.pdf: 11857723 bytes, checksum: 066ae99ab0cd60f237bc22b342b09d5b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-12T15:18:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 618229.pdf: 11857723 bytes, checksum: 066ae99ab0cd60f237bc22b342b09d5b (MD5) Previous issue date: 2003-04 / CAPES / Uma questão cada vez mais importante em recifes de coral de todo o mundo é o efeito dos sedimentos terrígenos sobre a biota recifal. O estudo teve por objetivo avaliar comunidades coralíneas sujeitas a diferentes condições de sedimentação no Banco dos Abrolhos. Os recifes internos do Banco apresentaram, quase sempre, taxas de sedimentação maiores que as dos recifes externos. As taxas de deposição na maioria dos recifes foram maiores no inverno-primavera e, na maioria das vezes, associadas à frequência de ventos de mais de 15 nós, provenientes de NE-E ou S. Isto e a observação de que a composição de radioisótopos no sedimento não variou entre as estações sugerem uma influência importante da ressuspensão no regime de sedimentação. As comunidades coralíneas não apresentaram relação direta com a taxa de deposição de sedimentos. No entanto, observou-se que, na maioria dos casos, recifes com alta cobertura de Palythoa caribaeorum também apresentaram alta deposição de sedimentos. Houve uma relação inversa entre cobertura de P. caribaeorum e cobertura coralínea. Apesar disso, recifes com comunidades e deposições de sedimento diversas apresentaram altas taxas de recrutamento de corais, e mesma incorporação de radioisótopos do sedimento pelo coral Mussismilia braziliensis. O recrutamento de hidrocorais apresentou correlação positiva com a abundância de adultos destes organismos, enquanto não foi observada esta relação entre recrutas e adultos de escleractíneos. Fatores relacionados à sedimentação, como a abundância de P. caribaeorum ou luz, podem estar influenciando indiretamente na estruturação das comunidades de corais. A ocorrência de comunidades diferentes em situações aparentemente semelhantes sugere que a estrutura das comunidades deve responder a uma complexa interação de fatores bióticos e abióticos, incluindo a ocorrência de eventos estocásticos. / The effects of terrigenous sediments upon coral reefs are major concern all over the world. The aim of this study is to evaluate coral communities at different sediment settings at the Abrolhos Bank. Most reefs closer to shore presented higher sediment deposition rates than reefs farther from mainland. Deposition rates were, in most cases, higher at winter-spring and, usually, associated with the frequency of NE-E or S winds with speeds higher than 15 knots. This and the absence of differences in radioisotope composition of sediments in different seasons suggest an important influence of resuspention on the sedimentation regime. Coral communities showed no direct relation with sediment deposition. However, in most cases, reefs with high Palythoa caribaeorum cover also presented high sediment deposition rates. There was an inverse relation between P. caribaeorum abundance and coral cover. Nevertheless, reefs with different communities and sediment deposition rates presented high coral recruitment, and similar radioisotope assimilation by the coral Mussismilia braziliensis. Recruitment of hydrocorals presented a positive correlation with adult hydrocoral abundance, while scleractinian corais recruitment did not present the same pattern. Factors related to sedimentation, such as P. caribaeorum abundance or light, may be indirectly influencing the structure of coral communities. The occurence of different communities in apparently similar situations suggests these communities may respond to complex interactions of biotic and abiotic features, including the occurrence of stochastic events.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:53:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 9391655 bytes, checksum: a8ab2eac1fae078c826bf566567e9ee1 (MD5) Previous issue date: 2008-02-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Oceanic islands are breeding places for several migratory species of birds whose their excrements are deposited on to the surface, besing subject to phosphatization. The occurrence of phosphatization has been related to specific environmental conditions and, for this reason, it is capable to indicate past environmental changes, associated to climate, oceanic currents, sea level changes, amongst others. Besides, it has strong influence in nutrients cycling and biological productivity of adjacent sea. Despite that, litte is known about this process, and how it can affect the formation of insular soils. Based on that, this work aimed at characterizing the phosphatization in São Pedro and São Paulo Archipelagos (ASPSP) and Fernando de Noronha (AFN), more specifically in Belmonte and Rata Islands, respectively. Samples of rocks and soils were collected in those two islands, and were submitted to chemical, physics, and microscopic analyses. The rocks were also submitted to total elements chemical analyses, X-Ray diffraction and scanning electronic microscopy. Six products of phosphatization were observed in ASPSP. Phosphates rocks were characterized by the accumulation and/or interaction of P- rich solutions with the substrate. Among them, it thick phosphates crusts occur on milonitizaded peridotites, phosphates espeleotems on the borders and inner fractures. Also we find phosphates filling out weathering fractures or constituting framboidals coats on their borders, as well as rich greenish phosphate crusts with Ni and Cr, guano and ornitogenic soils. The latter is represented by a Lithosol with high P content and fragmentary lithic character. In Rata Island, Noronha Arquipelago, we identified sloping Neosols, associates with calcarenites dissolution, whose physical and chemical properties indicate signs of pedogenetic evolution, and Cambisols in the rest of the island. These Cambisols are originated from calcarenites and basalts under low weathering degree. Phosphatization of these soils was processed in past conditions, under vanying humid to arid conditions. Colluviation processes mixed to phosphatizaded carbonatic san with a Al-P coating. Through this, it is observed a variscitization of P-Ca fragments, constituting P-Al oolitic aggregates. / A utilização das ilhas oceânicas por diversas espécies migratórias de aves faz com que estes animais depositem seus excrementos sobre seus substratos, fosfatizando-os. A fosfatização tem sua ocorrência relacionada a condições ambientais específicas e, por isso, é capaz de revelar evidências de mudanças ambientais pretéritas, associadas ao clima, correntes oceânicas, mudanças do nível do mar, entre outras. Além disso, exerce forte influência na ciclagem de nutrientes e na produtividade biológica das áreas marinhas adjacentes. Mesmo assim, pouco se conhece sobre este processo e como ele pode afetar a formação de solos insulares. Diante disso, este trabalho objetivou caracterizar a fosfatização nos Arquipélagos de São Pedro e São Paulo (ASPSP) e Fernando de Noronha (AFN), mais especificamente nas ilhas Belmonte e Rata, respectivamente. Foram coletadas amostras de rochas e solos fosfatizados nos dois arquipélagos. Os solos foram submetidos a análises químicas, físicas e microscópicas. As rochas, por sua vez, foram submetidas a análises químicas de elementos totais, Difração de Raio-X, microscopia eletrônica de varredura e microssondagens. No ASPSP foram observados seis produtos da fosfatização. As rochas fosfatizadas compreendem tipos ou feições que se caracterizam pela acumulação e/ou interação de soluções ricas em fósforo com o embasamento (rochas ultramáficas infracrustrais). Dentre tais feições, destacam-se crostas fosfáticas espessas sob peridotitos milonitizados, espeleotemas ou florescências de fosfatos nas bordas e interior de fraturas, formas de fosfatos percolados preenchendo fraturas intemperizadas ou constituindo revestimento framboidais em suas bordas, crostas esverdeadas ricas em P, Ni e Cr, guano e solos ornitogênicos, sendo o último um perfil de Neossolo Litólico com altos teores de P e caráter lítico fragmentário. Na Ilha Rata, AFN, são encontrados Neossolos nas baixadas, associados a um relevo ruiniforme proveniente da dissolução de calcarenitos, cujas propriedades físicas e químicas indicam sinais de sua evolução pedogenética, e Cambissolos no restante da Ilha. Os Cambissolos são originados de arenitos carbonáticos e de lavas ankaratríticas e se apresentam mais intemperizados. A fosfatização destes solos se processou em condições pretéritas, onde, numa fase mais árida, processos de coluvionamento misturaram à matriz carbonática, já fosfatizada, sedimentos aluminosos também fosfatizados. O que se observa, a partir disso, é a variscitação dos fragmentos de P-Ca constituindo agregados oolíticos de P-Al.

Submitted by Mariângela Bueno Cordeiro Maldonado null (maribuenocordeiro@hotmail.com) on 2017-09-01T02:02:20Z No. of bitstreams: 1 TESE DE DOUTORADO 2017 - Mariangela Maldonado .pdf: 1446039 bytes, checksum: 2e08a41374d1ed14783e9142f58bdec8 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-09-01T13:59:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 maldonado_mbc_dr_araca.pdf: 1446039 bytes, checksum: 2e08a41374d1ed14783e9142f58bdec8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-01T13:59:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 maldonado_mbc_dr_araca.pdf: 1446039 bytes, checksum: 2e08a41374d1ed14783e9142f58bdec8 (MD5) Previous issue date: 2017-08-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo desse estudo foi identificar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) potencialmente sujeitos a controle epigenético exercido por metilação do DNA via seus envolvimentos na criação, remoção ou deslocamento de sítios CpG (meSNPs) e a partir de tal identificação criar um banco de dados para meSNPs, bem como determinar a possível associação desses marcadores com ilhas CpG (CGIs) e com o perfil metilacional de tecidos submetidos ao ensaio de recuperação de ilhas CpG metiladas combinado com plataformas de sequenciamento de nova geração (MIRA-seq) em bovinos. Usando as variantes anotadas para os SNPs identificados no Run5 do projeto 1000 Bull Genomes e a sequência genômica bovina de referência UMD3.1.1, identificamos e anotamos 12.836.763 meSNPs de acordo com o padrão de variação criado por cada SNP em um sítio CpG. Também analisamos a distribuição genômica desses meSNPs, sendo a maioria deles localizados em regiões intergênicas (68,00%) e intrônicas (26,32%). Globalmente, os meSNPs representam 22,53% dos 56.969.697 SNPs descritos na base de dados e 12,35% deles estão localizados em CGIs. Comparando o número observado com o número esperado de meSNPs nas CGIs e nos tecidos submetidos ao MIRA-seq, verificamos um enriquecimento médio (P<0,01) para meSNPs de 2,47 vezes em CGIs relaxadas e 1,90 vezes em CGIs rigorosas. Nos tecidos, o enriquecimento foi de 1,52 vezes em longissimus dorsi e 2,09 vezes em intestino delgado. Dez meSNPs com metilação diferencial, sendo 1 em longissimus dorsi e 9 em intestino delgado, causaram uma alteração na sequência genômica, a qual está associada ao fenótipo de eficiência alimentar em bovinos. / The aim of this study was to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) potentially subject to epigenetic control exerted by DNA methylation via their involvement in creating, removing or displacement CpG sites (meSNPs) and from this identification create a database for meSNPs, as well as to determine its possible association with CpG islands (CGIs) and the methylation profile of tissues submitted to the methylated-CpG island recovery assay combined with next generation sequencing platforms (MIRA-seq) in cattle. Using the variant annotations for SNPs identified in Run5 of the 1000 bull genomes project and the UMD3.1.1 bovine reference genome sequence assembly, we identified and classified 12,836,763 meSNPs according to the pattern of variation caused at the CpG site. We have also analyzed the genomic distribution of the meSNPs, with the majority being located in intergenic regions (68.00%) and then in introns (26.32%) and the remainder distributed among proximal promoters (3.93%), coding regions (1.27%), untranslated regions (UTRs) (0.29%), non-coding RNAs (0.11%) and splice regions (0.08%). Overall, meSNPs represent 22.53% of 56,969,697 SNPs described in the database of which 12.35% are located in CGIs. Comparing the observed number with the expected number of meSNPs in the CGIs and tissues submitted to the MIRAseq we found a mean enrichment (P<0.01) for meSNPs of 2.47 times in the relaxed CGIs and 1.90 times in the strict CGIs. In the tissues the enrichment was of 1.52 times in ribeye and 2.09 times in small intestine. Ten meSNPs, differing in methylation status, 1 in ribeye and 9 in small intestine, caused an alteration in the genomic sequence which is associated with a feed efficiency phenotype in cattle. / FAPESP: 2015/20557-5 / FAPESP: 2016/07584-6

Submitted by Emanuel Varela Cardoso (emanuel.varela@ufcg.edu.br) on 2018-05-15T18:12:29Z No. of bitstreams: 1 EWERTON VÔLNEY DA SILVA COSTA – DISSERTAÇÃO (PPGMET) 2015.pdf: 5145716 bytes, checksum: 472ebd5a74a9a155a582c84c559c918d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-15T18:12:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EWERTON VÔLNEY DA SILVA COSTA – DISSERTAÇÃO (PPGMET) 2015.pdf: 5145716 bytes, checksum: 472ebd5a74a9a155a582c84c559c918d (MD5) Previous issue date: 2015-08-27 / Capes / O crescimento desenfreado das cidades é um problema decorrente do aumento da população, causando inúmeras complicações para a sociedade e meio ambiente, como por exemplo, poluição, assoreamento de rios, desmatamento, alterações no clima local ou regional. O aumento da temperatura está diretamente ligado ao crescimento urbano, sendo influenciado pelo alto índice de construções, poluição, redução da vegetação e impermeabilização do solo, ocasionando problemas para a saúde dos habitantes e um desconforto térmico, gerando as chamadas ilhas de calor urbano (ICU). O estudo tem como objetivo identificar áreas propícias para a formação das ICU, caracterizar as mudanças do uso e ocupação do solo sobre a temperatura, estimar o saldo de radiação e os índices de vegetação (NDVI), água (NDWI) e área construída (NDBI) no período entre 1985 e 2007 em Londrina/PR. Foram gerados diagramas de dispersão com o intuito de analisar as relações entre os índices e a temperatura. Durante esse período, a vegetação e as áreas de solo exposto perderam espaço para a malha urbana, que apresentou um crescimento superior a 17%. A temperatura mínima encontrada na zona urbana com o passar dos anos fica cada vez mais elevada, em 1985 apresentou 22,4°C, já em 2007 apresentou 26,3°C, um aumento de aproximadamente 4°C. A temperatura na malha urbana também se apresentou mais elevada em comparação com as outras classes, chegando a marcar mais de 8°C em comparação com a vegetação densa. As temperaturas mais altas se apresentam nas regiões de solo exposto, estradas e alta densidade de edificações e as menores temperaturas foram identificadas nos corpos hídricos. A relação entre temperatura e os índices, indicou que quanto maior a temperatura, menor os valores de NDVI e NDWI. Já o NDBI, apresentou valores maiores à medida que a temperatura aumenta. / The rampant growth of cities is a problem due to increased population, causing numerous complications for society and the environment, such as pollution, silting of rivers, deforestation, changes in local or regional climate. The temperature rise is directly linked to urban growth, being influenced by the high number of buildings, pollution, reduction of vegetation and soil sealing, causing problems for the health of inhabitants and thermal discomfort, generating the so-called urban heat islands (ICU ). The study aims to identify areas suitable for the formation of the ICU, to characterize the changes of land use and occupation over temperature, estimate the net radiation and the vegetation index (NDVI), water (NDWI) and building area (NDBI ) between 1985 and 2007 in Londrina / PR. Scatter plots were generated in order to analyze the relationship between the indexes and the temperature. During this period, vegetation and bare soil areas lost space to the urban fabric, which showed a growth of 17%. The minimum temperature found in the urban area over the years becomes increasingly higher in 1985 showed 22.4 ° C in 2007 showed 26.3 ° C, an increase of about 4 ° C. The temperature in the urban also showed the highest in comparison with the other classes, reaching scores more than 8 ° C as compared with dense vegetation. The higher temperatures present in the soil exposed areas, roads and buildings high density and lower temperatures have been identified in water bodies. The relationship between temperature and indices indicated that the higher the temperature, the lower the NDVI values and NDWI. Since the NDBI, had larger values as the temperature increases.

Plantas com o tipo fotossintético CAM podem suportar condições de baixa disponibilidade de água através de um sistema de concentração de gás carbônico que aumenta a eficiência de uso da água através de uma fixação inicial do CO2 durante a noite, em condições de baixo déficit de pressão de vapor entre a folha e a atmosfera. Esse processo favorece a ocupação de regiões áridas e de sítios onde a água pode se tornar rapidamente indisponível. A ocorrência desse tipo fotossintético abrange uma grande amplitude de táxons, incluindo a família Bromeliaceae. Entre as espécies de Bromeliaceae que apresentam CAM encontra-se Dickya tuberosa, uma espécie que apresenta uma grande abundancia nos afloramentos rochosos associados ao monumento natural da Pedra Grande - Atibaia - SP. Nesse local, D. tuberose apresenta um papel relevante na vegetação associada à superfície de rocha exposta como componente essencial das comunidades denominadas \"ilhas de vegetação\". As condições predominantes no afloramento rochoso da Pedra Grande são de grande escassez de solo e água, além de extrema exposição. As variações na disponibilidade de água no afloramento rochoso seriam devidas, entre outras causas, ao tamanho das ilhas de solo onde D. tuberose ocorre e as características de declividade e orientação da vertente da superfície rochosa onde a ilha esta instalada. A partir das observações no ambiente natural, pergunta-se se os padrões de assimilação em D. tuberose relacionados ao CAM apresenta variações associadas as características das ilhas de solo onde ocorre. Para investigar esta relação, plantas de D. tuberose foram estudadas em campo e em condições semi-controladas em casa de vegetação. A técnica utilizada para caracterização dos padrões de CAM foi a de titulação da acidez do mesofilo. Tanto em grupos experimentais submetidos a períodos distintos de suspensão da rega como em amostras obtidas diretamente do campo, observam-se padrões de variação da acidez que podem ser associados a variações no suprimento hídrico. As variações foram caracterizadas através da diferença na acidez entre o inicio da manha e o final da tarde. A redução na amplitude da variação coincidiu com a intensidade da restrição no suprimento hídrico. Entretanto, a variação foi associada a redução do valor da acidez no final do dia, o que estaria associado a uma redução na recaptura do CO2 durante o período de iluminação. A maior influencia detectada nas plantas em campo foi a umidade relativa do ar. Conjectura-se um papel da assimilação de água através das folhas de D. tuberose como um atributo essencial a ocupação do substrato rochoso na Pedra Grande - Atibaia / Plants with crassulacean acid metabolism are able to support conditions of low availability of water through a carbon dioxide concentration system which increases the efficiency of use of water through an overnight CO2 fixture under low deficit of vapor pressure between the leaf and the atmosphere. This process favors the occupation of arid regions and places where water can quickly become unavailable. The occurrence of this type photosynthetic covers a wide range of taxa, including the Bromeliaceae family. Among the species of Bromeliaceae presenting CAM is Dickya tuberose, a species that has a great abundance on rocky outcrops associated with natural monument of Pedra Grande - Atibaia - SP. At this site, D. tuberose has a role in vegetation associated with surface rock exposed as an essential component of communities called \"vegetation islands\". The conditions prevailing in the rocky outcrop of Pedra Grande are of great scarcity of land and water, and extreme exposure. The variations in water availability in rocky outcrop would be due, among other reasons, the size of the islands where vegetation D. tuberose occurs and the characteristics of inclination and orientation of the slope of the rocky surface where the island is installed. From the observations in the natural environment, wonders whether the patterns of assimilation in D. tuberose related to CAM presents variations associated characteristics of vegetation islands where it occurs. To investigate this relationship, plants of D. tuberose were studied in field and semi-controlled conditions in a greenhouse. The technique used to characterize patterns of CAM was the titration acidity of the mesophyll. In both experimental groups undergoing different periods of suspension of irrigation as in samples obtained directly from the field, there are patterns of variation in acidity that may be associated with variations in water supply. The changes were characterized by the difference in acidity between the early morning and late afternoon. The reduction in amplitude of the variation coincided with the intensity of the restriction in water supply. However, the variation was associated with reduced acidity value at the end of the day, which would be associated with a reduction in the recapture of CO2 during the illumination period. The major influence detected on plants in the field was the relative humidity. It is conjectured a part of the assimilation of water through the leaves of D. tuberose as an essential attribute of the occupation of substrate in Pedra Grande - Atibaia