Made available in DSpace on 2014-12-05T18:36:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) grazielle_ramos_ipec_mest_2012.pdf: 383287 bytes, checksum: 3c3578e405f892ac11309dda1394b446 (MD5) Previous issue date: 2014-10-07 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas, Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Introdução: Eventos adversos a medicamentos (EAM) são frequentes em meio hospitalar, principalmente em pacientes em terapia intensiva, com consequências diretas no tempo de internação, mortalidade e custos hospitalares. Pacientes com infecções graves tais como HIV/SIDA e criticamente doentes, possuem risco elevado de EAM devido à necessidade de terapias com múltiplos fármacos o que predispõe a interações medicamentosas. A investigação de potenciais interações medicamentosas (PIMs) e de EAMs a elas relacionados podem ser ferramentas úteis para a avaliação do risco a que estes pacientes estão expostos. Objetivo: Analisar e classificar as PIMs e os EAMs em pacientes com HIV/SIDA criticamente enfermos. Métodos: Estudo descritivo retrospectivo, com revisão dos prontuários de pacientes com HIV/SIDA internados no Centro de Terapia Intensiva do Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas- Fiocruz, no período de 10/2006 a 10/2008, avaliando as PIMs e EAMs associadas às mesmas O estudo foi realizado em duas fases. Na primeira, as PIMs foram identificadas e classificadas segundo as bases de dados Drugs.com e Micromedex, comparando-se o grau de concordância através do índice kappa. Na segunda fase, foi realizada a busca em prontuário dos EAMs associados às PIMs identificadas pela base Micromedex. Os EAMs observados foram classificados segundo a causalidade. Resultados: Foi observada maior frequência de PIMs moderadas, de mecanismo farmacocinético, tempo de aparecimento do evento tardio e com bom nível de evidência. A concordância entre as bases de dados segundo a gravidade e mecanismo de ação foi considerada moderada (kappa=0,43) e substancial (kappa=0,61) respectivamente. Dentre as PIMs identificadas, 9% resultaram em eventos adversos, incluindo falhas terapêuticas e reações adversas. Houve predomínio das reações adversas de causalidade possível e que afetam o sistema gastrointestinal Dos pares de fármacos envolvidos, destaca-se o Omeprazol x Fluconazol, representando 16% (5/29) das interações relacionadas aos EAM identificados e cujo uso recomenda vi monitorização do paciente. Conclusão: Os resultados deste estudo demonstram que há alta frequência de PIMs nas prescrições de pacientes criticamente enfermos com HIV/SIDA. A difusão do conhecimento para a equipe multiprofissional sobre os fatores de risco associados às interações medicamentosas e eventos adversos assim como o monitoramento destes, pode constituir um importante instrumento na prevenção de problemas relacionados a medicamentos, garantindo a segurança do paciente / Introduction: Adverse drug events (ADE) ar e common in hospitals, especially in patients in intensive care, with direct c onsequences on the length of stay, mortality and hospital costs. Patients with severe infect ions such as HIV / AIDS and critically ill, have high risk of ADE due to the need for multiple drug therapy which predisposes to drug interactions. The investigation of po tential drug-drug inte ractions (DDIs) and ADEs related to them can be useful tools for assessing the risk that these patients are exposed. Objective: To analyze and cla ssify the DDIs and the ADEs in patients with HIV / AIDS critically ill. Methods: Retrospective descriptive study with retrospective chart review of patients with HIV / AIDS admitted to the Intensive Care Unit of the Clinical Research Institute Evandro Chagas -Fiocruz, in the period 10/2006 10/2008, evaluating the DDIs and ADEs a ssociated with the same. The study was conducted in two stages. At firs t, the PIMs were identifi ed and classified according to the database Micromedex and Dr ugs.com, comparing the deg ree of agreement using the Kappa index. In the se cond phase, the search was conducted in the medical records of ADEs associated with DDIs id entified by Micromedex. Results: It was observed a higher frequen cy of moderate DDIs, pha rmacokinetic mechanism, delayed onset time and good scientific doc umentation. The agreement between the databases according to the severity and mechanism of action was considered moderate (kappa = 0.43) and su bstantial (kappa = 0.61) respectively. Among the identified DDIs, 9% result ed in adverse events, including adverse reactions and therapeutic failures. There was a predominance of adverse reactions of causality possible that affect the gastrointestinal system. Between pairs of drugs involved, stands out Omeprazole/Fluconazol e, representing 16% (5/29) of interactions related to EAM identified and whose use is re commended patient monitoring. Conclusion: The results of this study dem onstrate that there is a hi gh frequency of DDIs in the prescriptions of critically ill patients with AIDS. The di ffusion of knowledge to the multidisciplinary team about the risk fact ors associated with DDIs and ADEs as well as monitoring of these may constitute an important tool in preventing drug-related problems, ensuring patient safety

Made available in DSpace on 2014-12-05T18:40:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 fernanda_mariz_ioc_mest_2002.pdf: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 1_fernanda_mariz_ioc_mest_2002.pdf: 397710 bytes, checksum: c5806b803bc46b6c3532cd3281026b69 (MD5) Previous issue date: 2014-11-18 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A doença de Chagas, cujo agente etiológico é o Trypanosoma cruzi, é considerada uma parasitose endêmica que acomete mais de 18 milhões de indivíduos na América Latina. Uma parte destes apresenta acometimento do sistema nervoso central e periférico. Vem sendo descrito, durante a fase aguda da doença, um intenso infiltrado inflamatório em regiões do tecido nervoso. Entretanto, os mecanismos envolvidos no aporte de células T e nas interações celulares neste tecido permanecem pouco esclarecidos. Assim, utilizamos neste trabalho um modelo in vitro visando estudar as interações entre células T de camundongos na fase aguda de infecção e células neuronais, exemplificadas por uma linhagem de neuroblastoma murino (N2a), e por neurônios do córtex cerebral oriundos de cultivo primário. Em particular, procuramos avaliar as interações mediadas por elementos de matriz extracelular (ECM), os quais sabidamente são capazes de interferir com os eventos de migração celular Inicialmente, observamos que células N2a e neurônios de cultivo primário expressam constitutivamente proteínas de ECM (laminina, fibronectina e colágeno tipo IV), cuja presença é aumentada na vigência de infecção in vitro pelo T. cruzi. Também pudemos notar aumento na adesão de células T às células N2a quando estas são infectadas in vitro e/ou quando os linfócitos T são oriundos de animais infectados. Este fenômeno é mediado, pelo menos em parte, por elementos de ECM, visto que pôde ser bloqueado por anticorpos antifibronectina, antilaminina e anticolágeno tipo IV. Nossos resultados indicam que ligantes e receptores de ECM encontram-se envolvidos na interação células T/células neuronais, a qual pode ocorrer após a infecção experimental pelo T. cruzi / Chagas disease, caused by the protozoan Trypanosoma cruzi , is an endemic parasitic disease affecting more than 18 million individuals in Latin America. Part of these patients develop symptoms related to the disorders in the pe ripheral and central nervous system. It has been described, during the acute phase of the d isease, an intense inflammatory infiltrate in the nervous tissue, but the mechanism (s) driving T cells to this tissue remain(s) to be clarified. We used an in vitro model to study the interactions between T cells derived T. cruzi -infected mice and neurons, herein exemplified by t he N2a murine neuroblastoma cell line, as well as by a brain cort ex-derived primary culture of murine neurons. In particular, we looked for extracellular matrix (ECM)- mediated interactions, known to affect T cell migration. We first showed that N2a cells and the primary cult ures of neurons constitutively express the ECM proteins, laminin, fibronectin and collagen type IV and that such an expression is upregulated upon T. cruzi infection in vitro . Moreover, adhesion of peripheral T cells was enhanc ed (as compared to non- infected conditions) when N2a cells were infected in vitro , or when T cells were derived from T. cruzi infected mice. This likely represents an ECM- medi ated event since it could be partially inhibited with anti-ECM antibodies. In conclusion, our results indicate that ECM ligand s and receptors are involved in the T cell/neuronal interactions that may occur following T. cruzi infection

Submitted by Nuzia Santos (nuzia@cpqrr.fiocruz.br) on 2015-04-16T17:01:19Z No. of bitstreams: 1 Tese_ClaudiaMaríaRíosVelásquez.pdf: 10298436 bytes, checksum: a818292b9ed3715f2201a29b38afb273 (MD5) / Approved for entry into archive by Nuzia Santos (nuzia@cpqrr.fiocruz.br) on 2015-04-16T17:01:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_ClaudiaMaríaRíosVelásquez.pdf: 10298436 bytes, checksum: a818292b9ed3715f2201a29b38afb273 (MD5) / Approved for entry into archive by Nuzia Santos (nuzia@cpqrr.fiocruz.br) on 2015-04-16T17:01:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_ClaudiaMaríaRíosVelásquez.pdf: 10298436 bytes, checksum: a818292b9ed3715f2201a29b38afb273 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-16T17:01:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_ClaudiaMaríaRíosVelásquez.pdf: 10298436 bytes, checksum: a818292b9ed3715f2201a29b38afb273 (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil / A malária é um problema de saúde pública. O Brasil é o país sul-americano que mais casos aporta todo ano, a maioria deles ocorridos na região Amazônica. Até o presente não há nenhuma vacina eficaz contra a malária. O controle dessa doença baseia-se principalmente no combate vetorial. Um dos desafios atuais é encontrar novas moléculas úteis para bloquear a transmissão da malária no vetor, sendo necessário para isso conhecer a biologia da interação entre os parasitos e seus hospedeiros. A maioria dos grupos de pesquisa utiliza como modelos de laboratórios combinações não naturais de Anopheles – Plasmodium. Neste trabalho foi avaliada a suscetibilidade ao P. vivax em espécies Amazônicas de Anopheles, fêmeas de Anopheles darlingi, An. albitarsis s.l., An. nuneztovari s.l. e An. triannulatus s.l. e An. aquasalis foram infectadas com P. vivax utilizando um sistema de infecção experimental por membrana artificial. Todas as espécies de Anopheles estudadas foram suscetíveis à infecção por P. vivax, porém a taxa de infecção e o numero de oocistos variaram significativamente entre elas. An. aquasalis (Spearman rho = 0.255, n = 386, p < 0.01) e An. darlingi (rho = 0.518; n = 54, p < 0.01) mostraram uma correlação positiva entre o número de gametócitos e o número de oocistos formados. Também foi avaliada a via JAK/STAT de resposta imune em A. aquasalis, durante a fase tardia da infecção, e em A. darlingi, no início da infecção. A expressão dos genes STAT, PIAS e NOS foi avaliada por q-PCR. Em An. aquasalis a expressão dos genes estudados foi induzida a partir de 8 dPI (PIAS e NOS) e 12 dPI (STAT), e começou a diminuir aos 14dPI, provavelmente indicando a indução transitória desses genes na fase tardia da infecção. Em An. darlingi não foi observada a ativação dessa via imune durante a fase inicial da infecção com P. vivax. Estudos futuros devem ser realizados para saber de que forma os genes regulados pela via JAK/STAT podem modular o desenvolvimento do P. vivax em An. aquasalis, e outras vias de sinalização devem ser estudadas na resposta de An. darlingi à infecção pelo Plasmodium. / Malaria is a public health concern. Brasil is the Latin American country with the higher number of cases registered, the most in the Amazon Region. Actually, there is not an effective vaccine against malaria and the disease control is based on vector control. New challenges include finding new molecules to block malaria transmission, making necessary to know the mechanisms involved in the Plasmodium – Anopheles interactions. The most studies have used laboratory parasite – vector pairs which does not resemble natural parasite – hst interactions. The goals of this work were 1) to compare the susceptibility of five Amazonian Anopheles mosquito species to Plasmodium vivax, and 2) to evaluate JAK/STAT immune pathway during the late-phase of A. aquasalis infection and the early phase of A. darlingi. To evaluate the P. vivax mosquito susceptibility we fed by membrane feeding assays field populations of Anopheles darlingi, An. albitarsis s.l., An. nuneztovari s.l. and An. triannulatus adult females and, An. aquasalis from colony. All the Anopheles species were susceptible to P. vivax infection, although the infection rate and oocyst numbers were significantly different among them. There was a positive correlation between the density of gametocytes and the infection rate in An. aquasalis (Spearman rho = 0.255, n = 386, p < 0.01) and An. darling (rho = 0.518; n = 54, p < 0.01). Anopheles aquasalis had high infection intensity, showing that the An. aquasalis - P. vivax pair is a feasible laboratory model. To evaluate the expression of STAT, PIAS and NOS in An. aquasalis and An. darlingi was used qPCR method. In An. aquasalis the studied genes were induzed since 8 dPI (STAT) and 12 dPI (both PIAS and NOS), and was diminishing at 14dPI, probably indicating that JAK/STAT activation in later phases of P. vivax infection is transient. In An. darlingi the genes STAT, PIAS and NOS were no expressed during the early phase of the infection with P. vivax. The role of JAK/STAT pathway, in later stages of P. vivax infection of An. darling, remains to be investigated.

MOURÃO, Marco Antônio Nogueira. Características morfo-fisiológicas como determinantes da capacidade de manutenção de territórios em machos de Macrothemis imitans (Odonata: Libellulidae). 2012. 42 f. Dissertação (Mestrado em ecologia e recursos naturais)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2012. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-05-24T18:31:42Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_manmourao.pdf: 300407 bytes, checksum: 735ced5ccba6e12b3788158e01a5bb8c (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-05-27T20:40:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_manmourao.pdf: 300407 bytes, checksum: 735ced5ccba6e12b3788158e01a5bb8c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-27T20:40:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_manmourao.pdf: 300407 bytes, checksum: 735ced5ccba6e12b3788158e01a5bb8c (MD5) Previous issue date: 2012 / In many animal species, males fight for the possession of territories that increase their mating chances. The fighting behavior of males may range from conflicts without physical contact to disputes with injuries and possible deaths. There are three models aiming to explain the rules adopted by males to decide the winner of a contest: war of attrition (WOA), sequential assessment model (SAM) and cumulative assessment model (ACM). However, to be able to test these models it is necessary to identify male traits functionally related to fighting ability (RHP). In this sense, we used males of the dragonfly Macrothemis imitans to evaluate two hypotheses: 1) if contests occur with physical contact, traits related to the size define RHP and 2) if disputes occur without physical contact, traits which confer endurance define male RHP. We did field experiments during campaigns with two consecutive days. In each campaign we captured, marked, made behavioral observations and recaptured males that were defending a territorial site (resident males) and males that stablished territories in this sites after the experimental removal of the resident male (substitute males). After recapturing, we transported all males them to lab to measure total wing area, male fresh weight, muscle mass and fat content.The results indicated that resident males presented higher muscle mass and probably fat content than substitute males. Since disputes occurred with physical contact, these differences in muscle mass and fat content indicate that the functional relationship between fight behavior and traits linked to RHP should be rejected. Alternativelly, it is possible that the higher muscle mass confers higher ability to cause injuries or to avoid damage accrual. / Em muitas espécies animais, os machos brigam por territórios os quais aumentam as chances de cópulas. Os comportamentos de luta dos machos podem variar desde embates sem contato físico até lutas com injúrias e possíveis mortes. Existem pelo menos três modelos propostos para explicar as regras usadas pelos machos para decidirem o vencedor de um confronto territorial: Guerra de Atritos (GDA), Acesso Sequencial de Informações (ASI) e Acesso Cumulativo de Informações (ACI). Porém, para sermos capazes de testar tais modelos é necessário identificar primeiro quais traços dos machos determinam funcionalmente sua capacidade de luta (RHP). Para isso, usamos machos da libélula Macrothemis imitans para avaliar duas hipóteses: 1) se as brigas ocorrerem com contato físico, características ligadas ao tamanho determinarão o RHP e 2) se os machos não exibirem contato físico durante as brigas, características que conferem maior resistência determinarão o RHP. Realizamos coletas de campo em campanhas de dois dias seguidos. Nessas campanhas realizamos captura, marcação, observação comportamental e recaptura de duas categorias de machos: os que possuíam posse dos territórios (machos residentes) e os machos que ocuparam o local após a remoção experimental dos machos residentes (machos substitutos). Após a recaptura, levamos os machos residentes e substitutos para laboratório para realizar as medidas: área alar, peso fresco, massa muscular torácica e quantidade de gordura. Os resultados indicaram que os machos residentes apresentaram maior quantidade de massa muscular e possivelmente gordura do que os substitutos. Uma vez que as brigas ocorreram com contato físico, a maior quantidade de massa muscular e gordura dos machos residentes indica que a relação funcional entre comportamento de luta e traços determinantes do RHP deve ser rejeitada. Alternativamente, é possível que a maior quantidade de músculo proporcione maior desempenho para causar injúrias nos rivais ou evitar acúmulo acelerado de danos.

Submitted by Pós-Com Pós-Com (pos-com@ufba.br) on 2015-01-23T15:44:40Z No. of bitstreams: 1 Ana Terse Tavares Soares.pdf: 1715826 bytes, checksum: 6f44998db04a085de0a15317e6ee47d6 (MD5) / Approved for entry into archive by Vania Magalhaes (magal@ufba.br) on 2018-01-23T12:04:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Ana Terse Tavares Soares.pdf: 1715826 bytes, checksum: 6f44998db04a085de0a15317e6ee47d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-23T12:04:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Terse Tavares Soares.pdf: 1715826 bytes, checksum: 6f44998db04a085de0a15317e6ee47d6 (MD5) / Capes / As interações sociais que caracterizam a maioria dos processos em ambientes digitais compartilham algumas especificidades, principalmente uma alteração na auto-percepção dos participantes, um sentido de transparência do meio e uma sensação de afastamento no tempo e/ou no espaço a partir da realidade reproduzida ou simulada. Neste sentido, este trabalho opta por problematizar inicialmente a natureza da presença social em ambientes online – que indica a “sensação de estar junto com outro”, identificando quais as características sociais expansíveis aos sites de redes sociais sugerem presença social e consequentemente, como os usuários destes ambientes localizam-se/percebem "a si mesmo" e "outros" em interações mediadas. Problematizamos as acepções de presença - e suas variações conceituais existentes na literatura - a partir das experiências interacionais com uso da internet. Através de uma abordagem sociológica da copresença, nos interessou, a possibilidade de construir e compartilhar uma base teórica através do processo de interação social em ambientes mediados, que acolhesse este sentido como um fator determinante para este tipo deexperiência. Optamos pelo desenvolvimento de uma pesquisa fundamental, que buscou adicionar contribuições de novos saberes e novas abordagens no campo da Presença. Quanto à natureza da pesquisa, esta dissertação caracteriza-se como uma investigação básica, do tipo exploratória e aplicação de um modelo de análise utilizando a base metodológica proposta por Biocca e Harms (2002) para avaliar as medidas da presença social no Facebook. / Social interactions that characterize most of the processes in digital environments share some specifics, especially a change in self-perception of the participants, a sense of transparency in the middle and a sense of remoteness in time and / or space from the reality reproduced or simulated. In this sense, this paper chooses to initially discuss the nature of social presence in online environments - which indicates the "feeling of being together with others", identifying social characteristics expandable to social networking sites suggest social presence and consequently, how users these environments localized "yourself" and "others" in mediated interactions. We problematized the meanings of presence - and its variations existing conceptual literature -from the interactional experiences with internet use. Through a sociological approach of co-presence, the interest, the ability to build and share a theoretical basis through the process of social interaction in mediated environments that welcoming this sense as a determining factor for this type of experience. We opted for the development of fundamental research, which sought to add contributions to new knowledge and new approaches in the field of presence. The nature of the research, this thesis is characterized as basic research, exploratory type and application of an analytical model using the methodological basis proposed by Biocca and Harms (2002) to assess measures of social presence on Facebook.

Toxoplasma gondii é um parasito do filo Apicomplexa que infecta uma grande variedade de hospedeiros, incluindo os humanos. O parasito invade a célula hospedeira por penetração ativa, com a participação das proteínas de suas organelas secretoras durante esse processo. Até o momento, somente um número limitado de proteínas secretoras tem sido descoberto, além disso, as moléculas efetoras envolvidas na invasão e sobrevivência do parasito não estão completamente compreendidas. A osteopontina (OPN) é uma glicofosfoproteína adesiva secretada, multifuncional, que contém o domínio arginina-glicina-ácido aspártico (RGD) de ligação à integrina, que está envolvida em uma variedade de eventos fisiológicos e patológicos, incluindo sinalização e sobrevivência celular. Pela primeira vez, nós demonstramos pelas técnicas de imunofluorescência e imunocitoquímica ultraestrutural que há uma intensa marcação para uma proteína OPN-like nos grânulos densos de taquizoítos de T. gondii extracelulares. O western blotting e o RT-PRC confirmaram a expressão de OPN-like nos taquizoítos. Nossos resultados também mostram que após a invasão dos macrófagos, a proteína OPN-like está localizada na membrana do vacúolo parasitóforo. Esses dados sugerem que os grânulos densos secretam uma proteína OPN-like, e nós podemos especular que essa proteína participa durante o processo de interação do parasito com as células hospedeiras. . / Toxoplasma gondii is an apicomplexan parasite infecting a broad host range, including humans. The parasite invades host cell by active penetration with the participation of its secretory organelles proteins during this process. Until now, only a limited number of secretory proteins have been discovered, and the effectors molecules involved in parasite invasion and survival are not well understood. Osteopontin (OPN) is a multifunctional secreted adhesive glycophosphoprotein containing the arginine-glycine-aspartic acid (RGD) integrin-binding domain, which is involved in various physiological and pathological events including cell signaling and survival. For the first time we demonstrated by immunofluorescence and immunoelectron microscopy approaches that there is an intense labeling for an OPN-like protein in the dense granules of extracellular T. gondii tachyzoites. Western blotting and RTPCR confirmed this protein expression in tachyzoites. Our results also showed that after macrophage invasion the OPN-like protein is localized at the parasitophorous vacuole membrane. These data suggest that dense granules secrete an OPN-like protein, and we can speculate that this protein participates during the parasite interaction process with host cells.

Orientador: Prof. Dr. Luis Paulo Barbour Scott / Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2014. / A Tioredoxina (Trx) é uma proteína presente desde bactérias até humanos. Esta proteína multifuncional está relacionada a diversos processos como transcrição, apoptose, estresse oxidativo, etc. Seu principal papel é a redução de pontes dissulfeto de seus substratos. A Trx em humanos (hTrx) está relacionada a regulação de processos fisiológicos e doenças, incluindo câncer, doenças cardiovasculares e envelhecimento, o que a torna alvo de grande interesse para desenvolvimento de fármacos. Na tioredoxina citosólica e nuclear (hTrx1), apesar das cisteínas 62 e 69 estarem parcialmente enterradas, resultados experimentais mostraram que elas podem formar complexos covalentes com pequenas moléculas e até mesmo com proteínas. Devido a estes fatos, a descrição de sítios de ligação e de mecanismos de exposição das cisteínas pode contribuir na elaboração de estratégias e no design de fármacos. Com esta finalidade, foi empregada a Análise de Modos Normais (NMA) para investigar as mudanças conformacionais que levam à exposição das cisteínas e a exposição de regiões candidatas a sítios de ligação. Com a NMA foi possível identificar movimentos que levam a exposição de regiões hidrofóbicas e a exposição das cisteínas 62 e 69. Os resultados mostraram também a exposição de duas regiões hidrofóbicas, uma devida à abertura da hélice 3 e outra à abertura das hélices 2 e 4. Duas estruturas cristalográficas presentes no PDB, de mutantes da Trx, mostram a abertura da hélice 3, sugerindo esta como uma região para o design de inibidores. Os resultados mostram que este movimento pode ocorrer na estrutura nativa. A abertura das hélices 2 e 4 levou à exposição da região hidrofóbica, sugerindo esta como um novo local para o design de fármacos. A NMA se mostrou de grande valia para o estudo de sítios de ligação, sendo que os resultados apresentados estão de acordo com os dados experimentais. Os resultados do servidor web FTMAP reforçaram estas regiões hidrofóbicas como de interesse para o design de fármacos, uma vez que encontrou conjuntos de pequenos ligantes orgânicos nestas regiões. Os resultados de docking molecular de Fenotiazinas e Tiossemicarbazonas indicaram estas como bons compostos para testes in vitro. Os resultados do docking desses compostos nas estruturas geradas para o modo 16 e sítio H1H3 podem indicar o mecanismo da diminuição do número de grupos tióis livres através do bloqueio do acesso a Cys 69 e possível alteração da dinâmica da exposição da Cys 62. O resultado do virtual screening do sítio H1H3 com a biblioteca Diversity Set II sugeriu uma nova classe de compostos para testes in vitro. / Thioredoxin (Trx) is a protein that can be found from bacterias to human beings. This multifunctional protein is related to several processes, such as: transcription, apoptose, oxidative stresses, among others. The protein¿s main role is to reduce the substrate¿s disulfide bridges. Trx in human beings (hTrx) is related to physiological regulation processes and diseases - including cancer, cardiovascular diseases and aging - which makes this protein of great interest for drug development. Despite cysteines 62 and 69 being partially buried, nuclear and cytosolic thioredoxin (hTrx1) experimental results show that they can form covalent bonds with small molecules and even with proteins. Due to these facts, a description of the binding sites and cysteines exposure mechanisms can contribute in the elaboration strategy and drug design. For this purpose, Normal Modes Analysis (NMA) was applied in order to investigate conformational changes that expose cysteines and hydrophobic regions candidates to binding site. With NMA it was possible to identify motions that expose hydrophobic regions as well as cysteines 62 and 69. Results also show the exposure of two hydrophobic regions, one due to the opening of helix 3 and another one due to the opening of helices 2 and 4. Two crystallographic structures of mutants, found in the PDB database, showthe opening of helix 3, suggesting that this region is stable enough to be a target for inhibitors design. Results show that this motion can occur in the wild type structure. The opening of helices 2 and 4 lead to the exposure of the hydrophobic region, suggesting the region as a new site for drug design. NMA showed to be valuable in the study of binding sites, once results obtained are in accordance with experimental data. Results from the FTMAP web service reinforce these hydrophobic regions as interesting ones as sites for drug design, since clusters of small organic ligands were found in these regions. The Phenothiazines and Semithiocabazones molecular docking results indicate those compounds as good candidates for in vitro tests. The docking results in structures of mode 16 and binding site H1H3 can indicate the free thiol decrease mechanism through block access of Cys 69 and possible modification of Cys 62 exposure dynamic. Virtual screening results of H1H3 binding site with Diversity Set II compounds library suggested a new class of compounds for in vitro tests.

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:26:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-05-04. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:45:57Z : No. of bitstreams: 1 000842358_20160501.pdf: 688314 bytes, checksum: c0e58d7c09371b47da4b8dfd21b13c6b (MD5) Bitstreams deleted on 2016-05-04T13:08:28Z: 000842358_20160501.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-05-04T13:09:32Z : No. of bitstreams: 1 000842358.pdf: 2362291 bytes, checksum: 607ef5f590e4380cff19bf4d439fa958 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Introdução. O omeprazol é amplamente administrado e, na maioria das vezes, o uso é efetivo e seguro. No entanto, estudos avaliaram que o omeprazol foi o medicamento mais relacionado com a admissão hospitalar devido RAM. Tais RAM talvez possam ser explicadas devido ao uso abusivo ou prescrição irracional de omeprazol. Todavia, não foi avaliado o risco e o benefício do uso profilático do omeprazol, considerando o uso aprovado e o uso não aprovado, e as consequências para a segurança do paciente. Objetivo. Identificar e avaliar o risco de ocorrência de EAM e o benefício através da efetividade do uso profilático de omeprazol em pacientes internados. Método. Conduziu-se um estudo coorte observacional de agosto a outubro de 2013 e dezembro/2013 a maio/2014, no Hospital Estadual Américo Brasiliense. Os pacientes internados foram classificados em três grupos: a) uso de omeprazol profilático aprovado, b) uso de omeprazol profilático não aprovado; c) não uso de omeprazol. Foram excluídos os pacientes que fizeram uso de omeprazol não profilático. Os pacientes foram monitorados diariamente com auxílio do roteiro de investigação adequado previamente. Os dados foram tabulados segundo a presença ou ausência de efetividade e de eventos adversos nos três grupos. Resultados. Foram monitoradas 427 hospitalizações, sendo 136 expostos ao omeprazol profilático não aprovado e 52 expostos ao omeprazol profilático aprovado. Identificaram-se apenas dois casos de suspeita de inefetividade e 14 de eventos adversos. Observou-se diferença significativa na concentração sérica da creatinina e ureia para os pacientes que usavam omeprazol profilático aprovado. Conclusão. Há duas vezes mais pacientes expostos ao omeprazol profilático não aprovado comparado ao uso aprovado. Não houve associação do omeprazol profilático com fator de risco, no entanto, houve diferença significativa no... / Introduction. Omeprazole is a widely used drug; in most cases, it is effective and safe. However, studies have found omeprazole to be the drug most frequently related to hospital admissions due to adverse drug reactions (ADRs). The ADRs could have occurred as a result of abuse or irrational prescribing of omeprazole. Despite that possibility, the risks and benefits of prophylactic omeprazole considering the approved and off-label uses and the potential consequences for patient safety have not been assessed. Objective. To identify and assess the risk of adverse drug events and the benefit provided by the effective use of prophylactic omeprazole in hospitalized patients. Methods. This observational cohort study was conducted from August to October 2013 and December 2013 to May 2014 at the Américo Brasiliense State Hospital. The inpatients were classified into three groups: a) approved use of prophylactic omeprazole b) off-label use of prophylactic omeprazole, and c) not using omeprazole. Patients who used no prophylactic omeprazole were excluded. The patients were monitored daily with the aid of a pre-established research protocol. Data were tabulated according to drug effectiveness or ineffectiveness and presence of adverse events in the three groups. Results. A total of 427 hospitalized patients were monitored in the study. Of these, 136 patients were exposed to prophylactic omeprazole used off-label and 52 exposed to on-label use of prophylactic omeprazole. Two cases of suspected ineffectiveness and 14 adverse events were recorded. There was a significant difference in serum creatinine and urea for patients using on-label prophylactic omeprazole. Conclusion. There are twice as many patients using off-label prophylactic omeprazole as patients using it for approved indications. There was no association of prophylactic omeprazole with risk factors, but there was a significant difference in the increase in serum creatinine and urea for ... / FAPESP: 13/12681-2

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:34Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-24Bitstream added on 2014-06-13T20:07:33Z : No. of bitstreams: 1 fernandes_cl_me_ift.pdf: 1140774 bytes, checksum: c6027d2492ce8e805dd5508b5c94fb24 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Este trabalho apresenta um estudo de femtoscopia em colisões próton-próton (pp) a√s= 7 TeV realizado com o detector Compact Muon Solenoid no Large Hadron Collider. O estudo consiste na utilização do efeito Hanbury-Brown–Twiss (HBT) para a determinação das dimensões aparentes do estado final do sistema formado em colisões pp. Três análises são feitas, onde tais dimensões são determinadas (i) em termos de um parâmetro invariante 'R IND. inv' ; (ii) nas direções transversal e longitudinal ao feixe, 'R IND. T' e 'R IND L', respectivamente; (iii) nas direções ao longo do feixe, parametrizada por 'R IND long', e em duas direções transversais a ele, correspondentes a 'R IND out', e 'R IND side'. Obseva-se que as dimensões aparentes do sistema formado em tais colisões dependem da multiplicidade de partículas carregadas no evento e do momento médio do par de partículas utilizadas na implementação do efeito HBT / This work presents a femtoscopic study performed in proton-proton (pp) collisions at √s= 7 TeV with the Compact Muon Solenoid at the Large Hadron Collider. The study uses the Hanbury-Brown–Twiss (HBT) effect to estimate the apparent dimensions of the final-state sistem formed at pp collisions. Three analysis are presented, where such an apparent dimensions are determined (i) in tems of an invariant radius parameter, 'R IND. inv'; (ii) in the transversal and longitudinal directions with respect to the beam, 'R IND. T' and 'R IND L' and (iii) along three directions 'R IND out', 'R IND long' and 'R IND side'. It is observed that the apparent dimensions of the sistem formed in pp collisions depends on the charged multiplicity of the events and on the average momentum of the pair of particles used to implement HBT effect

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:16:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissRLR.pdf: 1879706 bytes, checksum: 7429ed68f36eaaee955f0556239e63cc (MD5) Previous issue date: 2004-04-30 / Financiadora de Estudos e Projetos / In this work we consider the problem of a three-level trapped ion inside a high- Q cavity. We study the process of phonon-foton-matter interaction mediated by a classical field. We are particularly interested in the engineering process of two excitation changes, phonons and/or photons, which result in squeezing of the cavity mode and/or the vibrational field. The adiabatic aproximation is employed to obtain simplified effective Hamiltonians. / Nesta dissertação abordamos o problema de um íon de três níveis armadilhado e inserido em uma cavidade com alto fator de qualidade. Desejamos estudar o processo de interação fônon-fóton-matéria, mediado por um campo clássico. Em particular, estaremos interessados na engenharia do processo de troca de duas excitações, fônon e/ou fóton, que resultam na compressão do modo da cavidade e/ou do modo de vibração do íon. Empregaremos a técnica de aproximação adiabática para a obtenção de Hamiltonianos efetivos simplificados.