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A Bacia Sedimentar do Abunã está localizada junto à calha do Rio Madeira, no estado de Rondônia - Brasil, e caracteriza-se por um relevo plano, resultante de processos de acumulação de sedimentos fluviais ao longo do Quaternário. Dentro desse contexto, há nos últimos anos um aumento de trabalhos publicados, relatando as características paleoambientais e paleoclimáticas dessa região. O presente estudo tem como objetivo descrever a morfologia foliar e realizar o reconhecimento taxonômico de quatro folhas fósseis coletadas no afloramento Estaca 93 (09°16'25.05"S; 64°38'16.87"W), no canteiro de obras da Usina Hidroelétrica de Jirau (UHE). As amostras passaram por preparação curatorial prévia, sendo que foram numeradas e embaladas com filme PVC e colocadas em moldes de parafina. A datação para a camada da qual provém o material aqui analisado, já foi apresentada em trabalhos anteriores, apresentando idade de ±43.500 A.P. Os espécimes foram fotografados e os padrões de venação redesenhados. O reconhecimento taxonômico foi realizado com base na chave de identificação de angiospermas seguindo o detalhamento proposto pelo Manual de Arquitetura Foliar, sendo que também foram comparados com representantes da flora amazônica atual através de consulta a bibliografia específica. A partir da presença de elementos típicos foi possível registrar a ocorrência de duas famílias sendo elas: Chrysobalanaceae, por meio de venação primária pinada e secundária semicraspedódroma, venação oposta e alterna na mesma folha determinando o registro de um novo morfogênero e morfoespécie, aqui temporariamente denominado de Morfotipo 02; Calophyllaceae, com venações secundárias numerosas, paralelas entre si, preenchendo todo o campo foliar, definindo a descrição de uma nova morfoespécie para gênero Calophyllum, aqui temporariamente denominada Calophyllum sp1. A presença dessas famílias indica similaridade com a flora atualmente estabelecida na região, possibilitando ainda a inferência de um paleoclima muito similar ao existente. Deste modo, esta descoberta corrobora aos estudos anteriores que postulam a presença de uma floresta tipicamente tropical já estabelecida desde pelo menos ±43.500 anos, correspondentes ao Pleistoceno Superior. / The Sedimentary Basin of Abunã is located near the channel of the Madeira River, in the state of Rondônia - Brazil, and is characterized by a flat relief, resulting from accumulation processes of fluvial sediments along the Quaternary. Within this context, there has been an increase in published works in recent years, reporting the paleoenvironmental and paleoclimatic characteristics of this region. The present study aims to describe the leaf morphology and taxonomic recognition of four fossils leaves collected in the outcrop Stake 93 (09 ° 16'25.05 "S; 64 ° 38'16.87" W) at the construction site of the Hydroelectric Power Plant Jirau (UHE). The samples were submitted to a previous curatorial preparation and were numbered and packed with PVC film and placed in paraffin molds. The date for the layer from which the material analyzed here has been presented, has already been presented in previous works, presenting an age of ± 43,500 A.P. The specimens were photographed and the venation patterns redesigned. The taxonomic recognition was made based on the key of identification of angiosperms following the detail proposed by the Manual of Leaf Architecture, being also that were compared with representatives of the current Amazonian flora through consultation the specific bibliography. From the presence of typical elements it was possible to record the occurrence of two families: Chrysobalanaceae, primary vein of pinnate and secondary semicraspedodromous, opposite venation and alternating in the same leaf, determining the registration of a new morphogen and morphospecies, Temporarily referred to as of Morphotype 02; Calophyllaceae, with numerous secondary venations, parallel to each other, filling the entire foliar field, defining the description of a new morphospecies for the genus Calophyllum, here temporarily termed Calophyllum sp1. The presence of these families indicates similarity with the flora currently established in the region, making possible the inference of a paleoclimate very similar to the existing one. Thus, this finding corroborates previous studies that postulate the presence of a typically tropical forest already established since at least ± 43,500 years, corresponding to the Late Pleistocene.

This dissertation presents a comprehensive study on the origin and evolutionary relationships of the species of Bursera in Cuba, Hispaniola, Jamaica and the Bahamas. The goals of the first chapter were to test monophyly of the group, revisit a recent transfer of two species of Bursera to Commiphora, and place recently discovered mainland species using the reconstructed phylogenies. Additionally, divergence estimations using fossils were used as independent tests of several hypotheses regarding the arrival of the modern biota to the Greater Antilles and Bahamas (GAB). I conclude that all endemic taxonomic entities of the genus in this region belong to Bursera subgen. Bursera but that two separate lineages colonized the GAB via dispersal. The genus diversified during the Middle Miocene to Pliocene, and the data corroborate several paleogeographic events during that interval. The second chapter presents informative characters from leaf anatomy and leaf architecture for the 14 endemic species of Bursera distributed in the GAB. There is evidence for some evolutionary tendencies in the group, among them a trend toward small, simple, amphistomatic and unifacial leaves, character states for which ecological correlates can now be studied. Morphological and anatomical evidence corroborates phylogenetic results in suggesting that a population of B. glauca in Cuba is a new species. Finally, the third chapter constitutes the first taxonomic account and description of all known endemic species of Bursera in the region and reflects the results of the previous chapters. The primary results are as follows: (1) a new species from eastern Cuba, B. yaterensis, is described; (2) five species of Commiphora are returned to Bursera; (3) B. nashii is treated as conspecific with B. glauca; and (4) B. ovata is treated as conspecific with B. trinitensis. A dichotomous key is provided using mostly vegetative characters due to the frequent lack of adequate reproductive material and the relative uniformity of most floral and fruit characters. Each species description includes leaf architecture (morphology and venation pattern) and anatomy, introducing characters that could and should be used for describing and distinguishing other Bursera in Meso- and South America as well as for African Commiphora.

O cultivo in vitro de células, tecidos e órgãos vegetais, iniciado no começo do século XX, propiciou avanços no conhecimento científico e biotecnológico. O processo de regeneração in vitro depende tanto das condições de cultivo quanto da base genética dos explantes utilizados. Alguns autores postulam que a regeneração pode ser dividida em etapas e o balanço entre hormônios vegetais é responsável por determinar o destino dos explantes (e.g. formação de raízes, gemas ou calos). Em estudo realizado anteriormente, foi constatada a alta capacidade de regeneração de gemas caulinares adventícias in vitro do mutante Mouse-ears, que apresenta folhas com maior complexidade. Diante disso, neste trabalho outros mutantes que afetam a arquitetura foliar, como entire, procera, clausa, potato-leaf e Mouse-ears, foram avaliados ex vitro e in vitro, no \"background\" da cultivar Micro-Tom (MT). A caracterização fenotípica dos genótipos demonstrou que as mutações estudadas afetam vários outros aspectos do desenvolvimento, além das folhas. Muitas das diferenças observadas ex vitro, são em parte devidas à transição de estágio vegetativo para reprodutivo. Ao analisarmos os resultados de regeneração in vitro (formação de gemas caulinares e raízes adventícias; e crescimento de calos), nota-se que a capacidade organogenética de cada mutante não tem correlação com o grau de complexidade foliar, mas sim com tipo de mutação envolvida. Análises morfológicas de eventos in vitro e ex vitro quanto à formação de gemas caulinares adventícias e do meristema apical caulinar, respectivamente, denotam que ocorrem tanto similaridades quanto disparidades entre os dois processos. Os resultados indicam que provavelmente os mutantes entire (respota constitutiva a auxina por perda de função de um AUX/IAA) e Mouse-ears (super expressão do gene KNOX TKN2) atuam na etapa de indução de raízes e gemas, respectivamente, no processo de regeneração in vitro. Em contra partida, procera (resposta constitutiva a giberelina) atuaria na etapa de aquisição de competência ou retardo do desenvolvimento pós-indução. Além disso, TKN2 demonstrou ter um importante papel na formação de gemas caulinares adventícias in vitro. As vias para a formação de orgãos ex vitro (e.g. folhas, raízes, gemas axilares etc.) são diferentes da in vitro. Apesar disso, vários genes e moléculas recrutados em uma via de desenvolvimento ex vitro podem interferir na organogênese in vitro. / The in vitro culture of plant cells, tissues and organs, started at the beginning of the 20th century, has been leading to scientific and biotechnological advances ever since. The process of in vitro regeneration depends on the growth conditions as well as the genotype of the explant. Several authors postulated that regeneration can bedivided into steps and that the hormonal balance will determinate the fate of the explant (e.g. formation of roots, shoots or callus). In a previous study, it was found that the mutant Mouse-ears, which exhibits a more complex leaf architecture, has high capacity of shoot regeneration. Hence, in the present work others mutants affecting leaf architecture such as entire, procera, clausa, potato-leaf and Mouse-ears were measured ex vitro and in vitro in the MT background. These assessments aimed to investigate if there are similarities in organogenesis between in vitro and ex vitro. The phenotypic characterization of the genotypes showed that these mutations affect several aspects of plant development and not only the leaf architecture. Many differences observed ex vitro are in part due to the transition from vegetative to reproductive phase. When analyzing the results of in vitro regeneration (formation of adventitious shoots and roots; and callus growing) it is noticed that the organogenetic capacity of each mutant have no correlation with the degree of leaf complexity but with the type of mutation involved. Morphological analysis of in vitro and ex vitro events, such as formation of adventitious shoots and shaping of shoot apical meristem, respectively, denotes similarities and divergences between the processes. The results indicate that probably the mutants entire (constitutive response to auxin due to a loss-of-function in an AUX/IAA) and Mouse-ears (overexpression of a KNOX TKN2) act at the induction step of root and shoot, respectively, in the in vitro regeneration process. On the other hand, procera (constitutive response to gibberellin) acts at the competence step or the arrest of the development after induction. Furthermore, TKN2 showed an important role in the formation of in vitro adventitious shoots. The pathways for ex vitro organ formation (e.g. leaf, root, axillary buds, etc.) are different from that for in vitro. Nevertheless, genes and molecules recruited in the pathway of ex vitro development may interfere in the in vitro organogenesis.

O cultivo in vitro de células, tecidos e órgãos vegetais, iniciado no começo do século XX, propiciou avanços no conhecimento científico e biotecnológico. O processo de regeneração in vitro depende tanto das condições de cultivo quanto da base genética dos explantes utilizados. Alguns autores postulam que a regeneração pode ser dividida em etapas e o balanço entre hormônios vegetais é responsável por determinar o destino dos explantes (e.g. formação de raízes, gemas ou calos). Em estudo realizado anteriormente, foi constatada a alta capacidade de regeneração de gemas caulinares adventícias in vitro do mutante Mouse-ears, que apresenta folhas com maior complexidade. Diante disso, neste trabalho outros mutantes que afetam a arquitetura foliar, como entire, procera, clausa, potato-leaf e Mouse-ears, foram avaliados ex vitro e in vitro, no \"background\" da cultivar Micro-Tom (MT). A caracterização fenotípica dos genótipos demonstrou que as mutações estudadas afetam vários outros aspectos do desenvolvimento, além das folhas. Muitas das diferenças observadas ex vitro, são em parte devidas à transição de estágio vegetativo para reprodutivo. Ao analisarmos os resultados de regeneração in vitro (formação de gemas caulinares e raízes adventícias; e crescimento de calos), nota-se que a capacidade organogenética de cada mutante não tem correlação com o grau de complexidade foliar, mas sim com tipo de mutação envolvida. Análises morfológicas de eventos in vitro e ex vitro quanto à formação de gemas caulinares adventícias e do meristema apical caulinar, respectivamente, denotam que ocorrem tanto similaridades quanto disparidades entre os dois processos. Os resultados indicam que provavelmente os mutantes entire (respota constitutiva a auxina por perda de função de um AUX/IAA) e Mouse-ears (super expressão do gene KNOX TKN2) atuam na etapa de indução de raízes e gemas, respectivamente, no processo de regeneração in vitro. Em contra partida, procera (resposta constitutiva a giberelina) atuaria na etapa de aquisição de competência ou retardo do desenvolvimento pós-indução. Além disso, TKN2 demonstrou ter um importante papel na formação de gemas caulinares adventícias in vitro. As vias para a formação de orgãos ex vitro (e.g. folhas, raízes, gemas axilares etc.) são diferentes da in vitro. Apesar disso, vários genes e moléculas recrutados em uma via de desenvolvimento ex vitro podem interferir na organogênese in vitro. / The in vitro culture of plant cells, tissues and organs, started at the beginning of the 20th century, has been leading to scientific and biotechnological advances ever since. The process of in vitro regeneration depends on the growth conditions as well as the genotype of the explant. Several authors postulated that regeneration can bedivided into steps and that the hormonal balance will determinate the fate of the explant (e.g. formation of roots, shoots or callus). In a previous study, it was found that the mutant Mouse-ears, which exhibits a more complex leaf architecture, has high capacity of shoot regeneration. Hence, in the present work others mutants affecting leaf architecture such as entire, procera, clausa, potato-leaf and Mouse-ears were measured ex vitro and in vitro in the MT background. These assessments aimed to investigate if there are similarities in organogenesis between in vitro and ex vitro. The phenotypic characterization of the genotypes showed that these mutations affect several aspects of plant development and not only the leaf architecture. Many differences observed ex vitro are in part due to the transition from vegetative to reproductive phase. When analyzing the results of in vitro regeneration (formation of adventitious shoots and roots; and callus growing) it is noticed that the organogenetic capacity of each mutant have no correlation with the degree of leaf complexity but with the type of mutation involved. Morphological analysis of in vitro and ex vitro events, such as formation of adventitious shoots and shaping of shoot apical meristem, respectively, denotes similarities and divergences between the processes. The results indicate that probably the mutants entire (constitutive response to auxin due to a loss-of-function in an AUX/IAA) and Mouse-ears (overexpression of a KNOX TKN2) act at the induction step of root and shoot, respectively, in the in vitro regeneration process. On the other hand, procera (constitutive response to gibberellin) acts at the competence step or the arrest of the development after induction. Furthermore, TKN2 showed an important role in the formation of in vitro adventitious shoots. The pathways for ex vitro organ formation (e.g. leaf, root, axillary buds, etc.) are different from that for in vitro. Nevertheless, genes and molecules recruited in the pathway of ex vitro development may interfere in the in vitro organogenesis.

Submitted by Richardson Barbosa Gomes da Silva (richardsonunesp@gmail.com) on 2017-05-29T13:50:49Z No. of bitstreams: 1 Tese Richardson Barbosa Gomes da Silva.pdf: 3182502 bytes, checksum: 8fa9597a7aad6e3e72ed5c66cdde181e (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-31T16:32:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_rbg_dr_bot.pdf: 3182502 bytes, checksum: 8fa9597a7aad6e3e72ed5c66cdde181e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-31T16:32:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_rbg_dr_bot.pdf: 3182502 bytes, checksum: 8fa9597a7aad6e3e72ed5c66cdde181e (MD5) Previous issue date: 2017-03-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Em muitos viveiros, a experiência pessoal dos viveiristas é o principal método utilizado para determinar quando e quanto tempo irrigar. Os viveiros produzem diversas espécies simultaneamente numa mesma área. Entre as espécies, há muita variação na arquitetura foliar, especificamente nos ângulos foliares. A falta de conhecimento sobre a lâmina adequada e como os ângulos foliares afetam a interceptação e captura da água, limitam a eficiência da irrigação e, consequentemente, a qualidade das mudas florestais. Este estudo teve como objetivo avaliar se o ângulo foliar das mudas de nove espécies florestais nativas e as lâminas de água aplicadas no viveiro afetam a qualidade morfológica, fisiológica e nutricional das mudas; a fração de lixiviação e a condutividade elétrica da solução lixiviada; e a qualidade morfológica das plantas após o plantio em vaso. As avaliações foram realizadas ao final do ciclo de produção de cada espécie no viveiro, através das variáveis: altura da parte aérea, diâmetro do colo, massa seca aérea, radicular e total, índice de qualidade de Dickson, área de projeção da copa, conformação do sistema radicular, potencial hídrico foliar, índice SPAD, transpiração diária, teores dos pigmentos foliares clorofila a, b, carotenoides e antocianinas, fração de lixiviação, condutividade elétrica da solução lixiviada e acúmulo nutricional. A qualidade morfológica das plantas após o plantio em vaso foi avaliada em intervalos de 30 dias, durante 120 dias, através das variáveis altura da parte aérea e diâmetro do colo. Aqui mostramos que, nas espécies com ângulos foliares maiores, a aplicação de lâminas menores resulta em mudas com maior qualidade. Nas espécies com ângulos menores, é necessária a aplicação de lâminas maiores, exceto quando a área de projeção da copa é pequena. A partir desse conhecimento, o ângulo foliar poderá começar a ser adotado entre os critérios para agrupar as espécies no viveiro, a fim de que a irrigação praticada evite o desperdício de água e fertilizantes, bem como aumente a qualidade morfológica, fisiológica e nutricional das mudas florestais. / In many nurseries, the personal experience of nurseries is the primary method used to determine when and how much time to irrigate. Nurseries produce several species simultaneously in the same area. Among the species, there is much variation in foliar architecture, specifically in the leaf angles. The lack of knowledge about the proper water depth and how the leaf angles affect the interception and capture of water, limit irrigation efficiency and consequently seedlings quality. The objective of this study was to evaluate if the leaf angle of nine species of tree seedlings and the water depths applied in the nursery affect the morphological, physiological and nutritional seedlings quality; the leaching fraction and the electrical conductivity of the solution leached; and the morphological quality of the plants after planting in pot. The evaluations were performed at the end of the production cycle of each species in the nursery, through the following variables: height, stem diameter, shoot, root and total dry mass, Dickson quality index, crown projection area, conformation root system, leaf water potential, SPAD index, daily perspiration, leaf chlorophyll a, b, carotenoids and anthocyanins, leaching fraction, electrical conductivity of the solution leached and nutritional accumulation. The morphological quality of the plants after planting was evaluated at intervals of 30 days, during 120 days, through the variables height of and stem diameter. Here we show that, in species with larger leaf angles, the application of smaller water depths results in seedlings with higher quality. In species with smaller angles, it is necessary to apply larger water depths, except when crown projection area of seedling is small. From this knowledge, leaf angle can begin to be adopted among the criteria to group the species in the nursery, so that the irrigation practiced avoids the waste of water and fertilizers, as well as increase the morphological, physiological and nutritional tree seedlings quality. / FAPESP: 2013/17447-8