Inaug.-diss.-Bern. / "Literaturangaben" ; p. 31.

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Submitted by Hiolanda Rêgo (hiolandar@gmail.com) on 2013-08-14T20:09:15Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Miriam Flores.pdf: 1077091 bytes, checksum: b0adcded73dce2647872382d21f4a4be (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-14T20:09:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_ICS_ Miriam Flores.pdf: 1077091 bytes, checksum: b0adcded73dce2647872382d21f4a4be (MD5) / FAPEX;CNPq / Corynebacterium pseudotuberculosis is the etiologic agent of caseous lymphadenitis (CLA), a chronic disease that affects goats and sheep, characterized by granuloma formation in subcutaneous and internal lymph nodes. CLA causes significant economic losses in commercial goat herds; the best procedure to avoid spread of this disease is elimination of infected animals. Secreted antigens from T1 strain bacteria grown in brain heart infusion (BHI) broth were tested in an indirect ELISA system to determine if this system could be used to identify specific immunoglobulins against C. pseudotuberculosis. The electrophoretic profile of the BHI antigen was analyzed, as well as the recognition pattern by CLA infected sheep sera. The ELISA results were compared to Multiplex PCR assay and IFN-gamma production. The ELISA was able to discriminate between negative and positive animals, with a sensitivity of 89% and a specificity of 99%, and a large difference between positive and negative optical density values. When this assay was compared with other immunological and molecular methods, it was found only two discrepant results among thirty-two samples. We concluded that an ELISA using secreted antigens from C. pseudotuberculosis T1 strain growth in BHI broth culture would be a reliable tool for the serodiagnosis of caseous ymphadenitis in sheep. / Salvador

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No / Background: Ethiopia has an extremely high rate of extrapulmonary tuberculosis, dominated by tuberculous lymphadenitis (TBLN). However, little is known about Mycobacterium tuberculosis complex (MTBc) lineages re-sponsible for TBLN in Southwest Ethiopia.Methods:A total of 304 MTBc isolates from TBLN patients in Southwest Ethiopia were genotyped primarily by spoligotyping. Isolates of selected spoligotypes were further analyzed by 15-loci mycobacterial interspersed repetitive unit–variable number tandem repeat (MIRU-VNTR) (n = 167) and qPCR-based single nucleotide polymorphism (n = 38). Isolates were classified into main phylogenetic lineages and families by using the re-ference strain collections and identification tools available at MIRU-VNTRplus data base. Resistance to rifampicin was determined by Xpert MTB/RIF. Results: The majority of isolates (248; 81.6%) belonged to the Euro-American lineage (Lineage 4), with the ill-defined T and Haarlem as largest families comprising 116 (38.2%) and 43 (14.1%) isolates respectively. Of the T family, 108 isolates were classified as being part of the newly described Ethiopian families, namely Ethiopia_2(n = 44), Ethiopia_3 (n = 34) and Ethiopia_H37Rv-like (n = 30). Other sub-lineages included URAL (n = 18), S(n = 17), Uganda I (n = 16), LAM (n = 13), X (n = 5), TUR (n = 5), Uganda II (n = 4) and unknown (n = 19).Lineage 3 (Delhi/CAS) was the second most common lineage comprising 44 (14.5%) isolates. Interestingly, six isolates (2%) were belonged to Lineage 7, unique to Ethiopia. Lineage 1 (East-African Indian) and Lineage 2(Beijing) were represented by 3 and 1 isolates respectively.M. bovis was identified in only two (0.7%) TBLN cases. The cluster rate was highest for Ethiopia_3 isolates showing clonal similarity with isolates from North Ethiopia. Lineage 3 was significantly associated with rifampicin resistance. Conclusions: In TBLN in Southwest Ethiopia, the recently described Ethiopia specific Lineage 4 families were predominant, followed by Lineage 3 and Lineage 4-Haarlem. The contribution of M. bovis in TBLN infection is minimal. / This work was supported by the Mycobacteriology Unit of Instituteof Tropical Medicine, Antwerp, Belgium and interuniversity coopera-tion between Jimma University and Flemish Universities (VLIR-OUSproject).

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Zielstellung: Ziel dieser kumulativen Dissertationsarbeit war die vergleichende Untersuchung der Wirtsantwort in verschiedenen Mauslinien nach Infektion mit Streptobacillus (S.) moniliformis und Rodentibacter (R.) pneumotropicus mit Anzeigeparametern für die Klinik, die Pathologie und die Immunantwort. Es sollten neue erregerspezifische enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA) evaluiert und durch die Bestimmung der Immunglobulin G (IgG)-Subklassen mausstammspezifische Unterschiede in der Immunantwort aufgezeigt werden. Darüber hinaus waren Sentinelsysteme zu bewerten. Material und Methoden: Es wurden BALB/c und C57BL/6-Mäuse intranasal mit S. moniliformis- oder R. pneumotropicus infiziert und mit Kontaktsentinels vergesellschaftet. Zusätzlich wurde benutzte Einstreu der Infektionskäfige auf Käfige mit nichtinfizierten CD1-Mäusen (Einstreu-Sentinels) übertragen. Die Infektionsgruppen wurden über 4 Wochen, die Sentinels mindestens 7 Wochen alle 12 Stunden klinisch untersucht und die Verläufe dokumentiert. Am Ende der Experimente bzw. bei Erreichen spezifischer Abbruchkriterien wurden die Mäuse tierschutzgerecht euthanasiert und definierte Organproben für pathohistologische und bakteriologische Untersuchungen gewonnen. Die Erreger wurden dabei massenspektrometrisch sowie mittels polymerase chain reaction (PCR) differenziert und in Proben des Respirationstraktes quantitativ erfasst. Erregerspezifische Antikörper wurden in tracheonasaler Spülflüssigkeit und im Serum in eigens etablierten ELISA‘s auf Basis von Ganzzellextrakten bestimmt. Weiterhin erfolgte die Messung des Verhältnisses der IgG-Subtypen IgG1 und IgG2 im ELISA. Ergebnisse: Der Infektionsversuch mit S. moniliformis bestätigte mit einer Mortalität von 75% die bekannte hohe Infektionsanfälligkeit der C57BL/6-Mäuse im Gegensatz zu BALB/c, die keine Krankheitsanzeichen entwickelten. Die wichtigsten pathologischen Manifestationen waren eitrig-nekrotisierende Lymphadenitiden und Pneumonien in Verbindung mit der Reisolation des Infektionsstammes. Mithilfe des etablierten ELISA‘s gelang der Nachweis erregerspezifischer IgG-Antikörper im Serum der Tiere beider Linien. Bei den Kontaktsentinels konnte, bis auf eine Ausnahme, weder kulturell, noch serologisch eine Infektion nachgewiesen werden. Gleiches gilt für alle Einstreu-Sentinels. Molekularbiologisch wurde aber Erreger-DNA in den Lungen der Sentinels festgestellt. Die Infektion mit einem R. pneumotropicus Stamm, welcher genotypisch positiv für alle drei bekannten RTX-Toxine dieses Erregers war, führte zu einer unerwartet hohen Morbidität und Mortalität in beiden Mauslinien. In frühzeitig euthanasierten Tieren beider Linien konnten katarrhalisch-eitrige bis nekrotisierende Bronchopneumonien sowie eine Dissemination des Belastungsstammes in zahlreiche innere Organe nachgewiesen werden. In überlebenden Tieren beider Linien wurde eine deutliche Kolonisation respiratorischer Schleimhäute mit dem Belastungsstamm trotz z.T. hoher mukosaler IgA-Spiegel und Serokonversion im Blut nachgewiesen. Überlebende C57BL/6 Mäuse zeigten eine signifikant niedrigere Bakterienlast in inneren Organen als BALB/c Mäuse. In allen Kontaktsentinels, aber nicht in einem einzigen Einstreu-Sentinel, konnte kulturell und indirekt serologisch eine Infektion mit R. pneumotropicus nachgewiesen werden. Die Bestimmung der IgG-Subklassen in den Seren der C57BL/6-Mäuse beider Infektionsstudien ergab eine Verschiebung des Verhältnisses IgG2/IgG1 von unter 0,8 vor zu über 1,6 nach Infektion. Dies weist auf eine T-Helferzell (Th) 1-dominierte Immunantwort hin. BALB/c-Mäuse behielten dagegen ein Verhältnis unter 0,8 auch nach der Infektion bei, sodass auf eine Th2- Antwort zu schließen war. Schlussfolgerungen: Sowohl für S. moniliformis als auch für R. pneumotropicus konnten Tiermodelle mit diversen Anzeigeparametern etabliert werden, welche für Folgestudien zur Pathogenese oder Immunprophylaxe genutzt werden können. Für beide Erreger wurden neue sensitive und spezifische ELISA-Protokolle in die Diagnostik eingeführt. Kontaktsentinels, aber nicht Einstreu-Sentinels, sind gut geeignet, um R. pneumotropicus-Infektionen nachzuweisen. Die beobachtete stammspezifische Klinik, Pathologie und Immunantwort der C57BL/6-Mäuse nach experimenteller S. moniliformis-Infektion sprach für eine pathologische Th1-Immunantwort. Im Gegensatz dazu war im R. pneumotropicus – Infektionsversuch die Th1-Immunantwort der C57BL/6-Mäuse mit einer effektiveren Reduktion des Erregers in inneren Organen assoziiert. Die unerwartet hohe Morbidität und Mortalität im R. pneumotropicus –Infektionsversuch weist auf eine besonders hohe Virulenz des eingesetzten Stammes hin, sodass in dieser Arbeit erstmalig ein septikämischer Verlauf in Wildtyp-Mäusen nach intranasaler R. pneumotropicus-Infektion nachgewiesen werden konnte.:Inhaltsverzeichnis (I) Abkürzungsverzeichnis (III) 1 Einleitung (1) 2 Literatur (3) 2.1 Streptobacillus moniliformis (3) 2.1.1 Allgemeine Charakteristika (3) 2.1.2 Differenzierung von Streptobacillus spp.(4) 2.1.3 Serologische Methoden zum indirekten Nachweis einer Streptobacillus moniliformis - Infektion (5) 2.1.4 Epidemiologie der durch Streptobacillus moniliformis hervorgerufenen Zoonose (6) 2.1.5 Klinik und Pathologie der Streptobacillus moniliformis-Infektion bei Nagetieren (8) 2.1.6 Klinik und Pathologie der Streptobacillus moniliformis-Infektion in Menschen und anderen Nebenwirten (9) 2.1.7 Pathogenese und Virulenzfaktoren (10) 2.1.8 Prävalenz in Nagern (11) 2.1.9 Sanierung Streptobacillus moniliformis infizierter Nagetierbestände und Prävention (12) 2.2 Rodentibacter (R.) pneumotropicus und heylii (Pasteurella (P.) pneumotropica Biotyp Jawetz und Heyl) (14) 2.2.1 Allgemeine Charakteristika (14) 2.2.2 Ursprüngliche Einteilung in Biotypen und Reklassifikation zu Rodentibacter spp. (14) 2.2.3 Differenzierung von Rodentibacter spp. (15) 2.2.4 Serologische Methoden zum indirekten Nachweis einer Rodentibacter- Infektion (15) 2.2.5 Übertragung (15) 2.2.6 Klinik und Pathologien der Rodentibacter-Infektion in Nagern (16) 2.2.7 Pathogenese und Virulenzfaktoren (18) 2.2.8 Prävalenz (19) 2.2.9 Sanierung Rodentibacter pneumotropicus infizierter Nagetierbestände und Prävention (20) 2.3 Mäuse als Versuchstiere (22) 2.3.1 Inzucht-Stämme (22) 2.3.1.1 Merkmale, Verwendung und Historie der BALB/c-Wildtypmäuse (22) 2.3.1.2 Merkmale, Verwendung und Historie der C57BL/6-Wildtypmäuse (23) 2.3.1.3 Unterschiede der Immunreaktionen in C57BL/6- und der BALB/c- Mäusen (23) 2.3.2 Auszucht-Stämme (24) 2.3.2.1 Merkmale, Verwendung und Historie der CD1-Wildtypmäuse (24) 2.4 Gesundheitsmonitoring in Labortierhaltungen (25) 2.4.1 Empfehlungen der Federation of Laboratory Animal Science Associations (FELASA) (25) 2.4.2 Sentinelsysteme für das Gesundheitsmonitoring in Labormausbeständen (26) 3 Publikationen (28) 3.1 Fornefett J, Krause J, Klose K, Fingas F, Hassert R, Eisenberg T, Grunwald T, Müller U, Schrödl W, Baums CG. Comparative analysis of clinics, pathologies and immune responses in BALB/c and C57BL/6J mice infected with Streptobacillus moniliformis. Microbes and Infection. 2018;20(2):101-110 (28) 3.2 Fornefett J, Krause J, Klose K, Fingas F, Hassert R, Benga L, Grunwald T, Müller U, Schrödl W, Baums CG. Comparative analysis of humoral immune responses and pathologies of BALB/c and C57BL/6 wildtype mice experimentally infected with a highly virulent Rodentibacter pneumotropicus (Pasteurella pneumotropica) strain. BMC Microbiology. 2018;18(1):45 (39) 4 Übergreifende Diskussion (51) 5 Zusammenfassung (59) 6 Summary (61) 7 Literaturverzeichnis (63) 7.1 Fachliteratur (63) 7.2 Internet (76) 7.3 Gesetzestexte (78) Anhang (79) i Ergänzende Abbildungen (79) ii Ergänzendes Material zu 3.1 “Comparative analysis of clinics, pathologies and immune responses in BALB/c and C57BL/6J mice infected with Streptobacillus moniliformis” (81) iii Ergänzendes Material zu 3.2 “Comparative analysis of humoral immune responses and pathologies of BALB/c and C57BL/6 wildtype mice experimentally infected with a highly virulent Rodentibacter pneumotropicus (Pasteurella pneumotropica) strain” (83) Liste mit weiteren Veröffentlichungen Danksagung / Objective: Aim of this cumulative doctoral thesis was the comparative analysis of the host response in different mice strains infected with Streptobacillus (S.) moniliformis and Rodentibacter (R.) pneumotropicus with readout parameters for clinics, pathology and immune response. New pathogen specific enzyme linked immunosorbent assay’s (ELISA) were evaluated. Differentiation of immunoglobulin (Ig) G subclasses was conducted to reveal differences in the immune response between the two mice strains. Furthermore, sentinel systems were assessed. Materials and methods: BALB/c and C57BL/6 mice were infected intranasally with S. moniliformis or R. pneumotropicus and housed together with contact sentinels. Soiled bedding from infection cages was transmitted to cages with uninfected CD1 mice (bedding sentinels). Infection groups were observed for 4 weeks, sentinels for at least 7 weeks and the clinical course was documented. At the end of the experiments or when predefined termination criteria were reached, animals were humanely killed. Predefined organ samples were collected for pathohistological and bacteriological screenings. Pathogens were differentiated via mass spectrometry and via polymerase chain reaction (PCR). The specific bacterial load was quantified in samples of the respiratory tract. Pathogen-specific antibodies were detected in tracheonasal lavages and sera using newly established ELISAs based on whole cell extracts. Determination of the ratios of the IgG subtypes (IgG1 to IgG2) was conducted using ELISAs. Results: The S. moniliformis experiment confirmed the known high susceptibility of C57BL/6 mice with a mortality of 75%. This was in contrast to BALB/c, which developed no signs of illness. The major pathologies were purulent-necrotizing inflammations of the lymph nodes and the lung associated with detection of the challenge strain. Specific IgG-antibodies were detected in sera of both mice strains by the newly established ELISAs. In contact and bedding sentinels the infection was not detected by culture or indirectly by serology, except for one contact sentinel. However, pathogen DNA was detectable in the lungs of these animals via PCR. The infection with the R. pneumotropicus strain, which is genotypically positive for all 3 known RTX toxins of this pathogen, leaded to an unexpected high morbidity and mortality in both mice strains. In early losses a catharal-purulent to necrotizing bronchopneumonia as well as dissemination of the challenge strain in various inner organs was recorded. Efficient colonization of the respiratory mucosa through the challenge strain was detected in survivors of both lines despite high mucosal IgA levels and seroconversion in the blood. Surviving C57BL/6 mice showed a significant lower bacterial burden in inner organs than BALB/c. All contact sentinels were culturally and serologically positive for R. pneumotropicus infection in contrast to all bedding sentinels. Differentiation of IgG subclasses in sera of C57BL/6 mice of both experiments revealed a shift of the IgG2/IgG1 ratio from 0.8 prior to infection to 1.6 post infection suggesting a T helper (Th) 1-prone immune response. BALB/c mice remained under 0.8 after infection indicating a Th2-prone immune response. Conclusions: New animal models with various readout parameters were established for both S. moniliformis and R. pneumotropicus. These models can be used in future studies on pathogenesis and immunoprophylaxis. Sensitive und specific ELISA-protocols were established for both pathogens. Contact sentinels but not bedding sentinels are appropriate for detection of R. pneumotropicus-infections. The observed distinct clinic, pathology and immune response of C57BL/6 mice experimentally infected with S. moniliformis indicated on the one hand a pathological Th1 immune response. On the other hand, the Th1 response of C57BL/6 mice to R. pneumotropicus infection was associated with a more efficient clearance of the challenge strain in internal organs. The unprecedented high morbidity and mortality in the R. pneumotropicus experiment indicates high virulence of this strain. Accordingly, this work revealed for the first time septicaemia in wildtype mice after intranasal R. pneumotropicus-infection.:Inhaltsverzeichnis (I) Abkürzungsverzeichnis (III) 1 Einleitung (1) 2 Literatur (3) 2.1 Streptobacillus moniliformis (3) 2.1.1 Allgemeine Charakteristika (3) 2.1.2 Differenzierung von Streptobacillus spp.(4) 2.1.3 Serologische Methoden zum indirekten Nachweis einer Streptobacillus moniliformis - Infektion (5) 2.1.4 Epidemiologie der durch Streptobacillus moniliformis hervorgerufenen Zoonose (6) 2.1.5 Klinik und Pathologie der Streptobacillus moniliformis-Infektion bei Nagetieren (8) 2.1.6 Klinik und Pathologie der Streptobacillus moniliformis-Infektion in Menschen und anderen Nebenwirten (9) 2.1.7 Pathogenese und Virulenzfaktoren (10) 2.1.8 Prävalenz in Nagern (11) 2.1.9 Sanierung Streptobacillus moniliformis infizierter Nagetierbestände und Prävention (12) 2.2 Rodentibacter (R.) pneumotropicus und heylii (Pasteurella (P.) pneumotropica Biotyp Jawetz und Heyl) (14) 2.2.1 Allgemeine Charakteristika (14) 2.2.2 Ursprüngliche Einteilung in Biotypen und Reklassifikation zu Rodentibacter spp. (14) 2.2.3 Differenzierung von Rodentibacter spp. (15) 2.2.4 Serologische Methoden zum indirekten Nachweis einer Rodentibacter- Infektion (15) 2.2.5 Übertragung (15) 2.2.6 Klinik und Pathologien der Rodentibacter-Infektion in Nagern (16) 2.2.7 Pathogenese und Virulenzfaktoren (18) 2.2.8 Prävalenz (19) 2.2.9 Sanierung Rodentibacter pneumotropicus infizierter Nagetierbestände und Prävention (20) 2.3 Mäuse als Versuchstiere (22) 2.3.1 Inzucht-Stämme (22) 2.3.1.1 Merkmale, Verwendung und Historie der BALB/c-Wildtypmäuse (22) 2.3.1.2 Merkmale, Verwendung und Historie der C57BL/6-Wildtypmäuse (23) 2.3.1.3 Unterschiede der Immunreaktionen in C57BL/6- und der BALB/c- Mäusen (23) 2.3.2 Auszucht-Stämme (24) 2.3.2.1 Merkmale, Verwendung und Historie der CD1-Wildtypmäuse (24) 2.4 Gesundheitsmonitoring in Labortierhaltungen (25) 2.4.1 Empfehlungen der Federation of Laboratory Animal Science Associations (FELASA) (25) 2.4.2 Sentinelsysteme für das Gesundheitsmonitoring in Labormausbeständen (26) 3 Publikationen (28) 3.1 Fornefett J, Krause J, Klose K, Fingas F, Hassert R, Eisenberg T, Grunwald T, Müller U, Schrödl W, Baums CG. Comparative analysis of clinics, pathologies and immune responses in BALB/c and C57BL/6J mice infected with Streptobacillus moniliformis. Microbes and Infection. 2018;20(2):101-110 (28) 3.2 Fornefett J, Krause J, Klose K, Fingas F, Hassert R, Benga L, Grunwald T, Müller U, Schrödl W, Baums CG. Comparative analysis of humoral immune responses and pathologies of BALB/c and C57BL/6 wildtype mice experimentally infected with a highly virulent Rodentibacter pneumotropicus (Pasteurella pneumotropica) strain. BMC Microbiology. 2018;18(1):45 (39) 4 Übergreifende Diskussion (51) 5 Zusammenfassung (59) 6 Summary (61) 7 Literaturverzeichnis (63) 7.1 Fachliteratur (63) 7.2 Internet (76) 7.3 Gesetzestexte (78) Anhang (79) i Ergänzende Abbildungen (79) ii Ergänzendes Material zu 3.1 “Comparative analysis of clinics, pathologies and immune responses in BALB/c and C57BL/6J mice infected with Streptobacillus moniliformis” (81) iii Ergänzendes Material zu 3.2 “Comparative analysis of humoral immune responses and pathologies of BALB/c and C57BL/6 wildtype mice experimentally infected with a highly virulent Rodentibacter pneumotropicus (Pasteurella pneumotropica) strain” (83) Liste mit weiteren Veröffentlichungen Danksagung

Thesis (PhD (Pathology. Anatomical Pathology))--University of Stellenbosch, 2009. / Dissertation presented for a PhD degree in anatomical pathology at Stellenbosch University. / ENGLISH ABSTRACT: Expediting a diagnosis of tuberculosis in children, particularly those who are immunocompromised due to HIV/AIDS, is essential, as they are vulnerable to develop severe forms of disease due to their immature or compromised immune systems. A significant percentage of children (8 to 10%) with TB have TB lymphadenitis, in isolation, or in combination with other disease manifestations. Fine needle aspiration biopsy (FNAB) is a simple and minimally invasive procedure well tolerated by children. It may be performed as an outpatient procedure by clinicians as well as nurses, and excellent results can be achieved with training in the correct procedure. The aim of this dissertation was to demonstrate that FNAB may contribute significantly to the diagnosis of mycobacterial lymphadenitis, with particular reference to children TB suspects. We first established that TB lymphadenitis is a common clinical problem in children in TB endemic areas and that FNAB is an efficient simple and effective diagnostic modality in children with peripheral lymphadenopathy. We then proceeded to document the diagnostic yield and time to diagnosis of FNAB compared to conventional laboratory specimens collected in children. We investigated the value of additional diagnostic modalities such as autofluorescence in improving the ability of cytology to make a definitive diagnosis of mycobacterial infection based on cytomorphology and identification of the organism. In countries where organisms such as Mycobacterium bovis BCG and nontuberculous mycobacteria are prevalent, culture with subsequent speciation is essential. The amount of material harvested during FNAB is minuscule, and requires immediate bedside inoculation for optimal yields. We developed an inexpensive and effective transport medium to facilitate mycobacterial culture from FNAB, even if this is collected at an outside facility. It is ideally suited for use in clinics and rural hospitals as it is stable at room temperature, maintains viability of the organism for seven days, and the closed lid format reduces contamination. Mycobacterial culture even using liquid-based media, takes up to 6 weeks, and this delay is unacceptable particularly in children. We developed a Nucleic Acid Amplification Technique (NAAT) using High Resolution Melt Analysis and applied this novel technique to FNAB specimens submitted in transport medium. Although sensitivity remained suboptimal, the technique is highly specific, simple and rapid. Its use could be incorporated into routine microbiology laboratories, to assist with rapid diagnosis while cultures are pending. We collected a solid body of evidence, which will promote the use of FNAB in suspected mycobacterial lymphadenopathy, particularly in children in resource-limited countries. The utilisation of the diagnostic methods identified will expedite speciation and allow early and appropriate initiation of therapy. This is in keeping with Millennium Development Goal 6: to combat TB by early detection of new cases and effective treatment. / AFRIKAANSE OPSOMMING: Kinders met tuberkulose (TB), en veral diegene met gekompromiteerde immuniteit as gevolg van MIV/VIGS, het ‘n verhoogde neiging om ernstige siektebeelde te ontwikkel vanweë hul onvolwasse of gekompromiteerde immuunsisteme. ‘n Spoedige diagnose van TB in kinders is dus noodsaaklik. ‘n Betekenisvolle persentasie van kinders (8 tot 10%) met TB het TB limfadenitis met of sonder meegaande ander siekteverskynsels. Fynnaaldaspirasiebiopsie (FNAB) is ‘n eenvoudige en minimale indringende prosedure wat geredelik deur kinders aanvaar word. Geneeshere en verpleegkundiges wie toepaslike opleiding in die uitvoering van FNAB ontvang het, kan die prosedure op buitepasiënte uitvoer en uitstekende resultate behaal. Die doel van hierdie studie was om aan te toon dat FNAB betekenisvol kan bydra tot die diagnose van mikobakteriële limfadenitis in veral kinders met vermoedelike TB. Daar was eerstens bevestig dat TB limfadenitis ‘n algemene kliniese probleem is in kinders in TB endemiese areas en dat FNAB ‘n doeltreffende, eenvoudige en effektiewe diagnostiese modaliteit is in kinders met perifere limfadenopatie. Vervolgens was FNAB se diagnostiese opbrengs en die tydsverloop tot diagnose vergelyk met dié van konvensionele laboratoriummonsters wat in kinders verkry word. Die bydrae van verdere diagnostiese modaliteite soos outofluoressensie tot ‘n verbetering in sitologie se rol in die diagnose van mikobakteriële infeksie, soos gebaseer op sitomorfologie en identifisering van organismes, is ondersoek. In lande waar organismes soos Mycobacterium bovis BCG en nie-tuberkuleuse mikobakterië heersend is, is kultuur en spesiebepaling noodsaaklik. Die hoeveelheid materiaal wat met FNAB verkry word is baie min en vereis onmiddellike okulasie vir die beste resultate. Tydens hierdie studie is ‘n goedkoop en effektiewe vervoermedium ontwikkel om mikobakteriële kultuur van FNAB verkreë monsters te fasiliteer, selfs al is die monster vanaf ‘n buite fasiliteit bekom. Die vervoermedium is baie geskik vir gebruik in klinieke en plattelandse hospitale. Dit is stabiel by kamertemperatuur, handhaaf lewensvatbaarheid van organismes vir sewe dae, en die geslote dekselformaat verminder kontaminasie. Mikobakteriële kultuur neem tot ses weke, selfs met die gebruik van vloeistofgebaseerde mediums. Sodanige vertraging in die diagnose is veral in kinders onaanvaarbaar. Tydens hierdie studie is ‘n Nukleïnsuur Amplifikasietegniek ontwikkel deur die aanwending van Hoë Resolusie Smeltanalise en is hierdie nuwe tegniek toegepas op FNAB verkreë monsters wat in die vermelde vervoermedium versamel was. Alhoewel sensitiwiteit nie optimaal was nie, is die tegniek baie spesifiek, eenvoudig en vinnig. Dit kan in roetine mikrobiologie laboratoriums gebruik word om vinnige diagnose te bewerkstellig terwyl daar gewag word vir die kultuur se resultaat. Hierdie studie bied omvattende bewys ter ondersteuning van die gebruik van FNAB in veral kinders met vermoedelike mikobakteriële limfadenopatie in lande met beperkte hulpbronne. Die toepassing van die diagnostiese metodes wat in hierdie studie identifiseer is sal spesiebepaling bespoedig en vroegtydige en toepaslike behandeling verseker. Dit stem ooreen met Millennium Ontwikkelingsdoelwit 6: om TB te beveg deur vroeë opsporing van nuwe gevalle en effektiewe behandeling.