Les particules fines atmosphériques (PF) sont capables de pénétrer dans les poumons où certains composés transportés peuvent interagir avec les cellules pulmonaires et atteindre la circulation sanguine. L'exposition aux PF affecte particulièrement les populations sensibles telles que les personnes agées. Cette thèse s'inscrit dans une démarche d'identification des effets des PF sur les lymphocytes T humains (LT) tout en visant à déterminer des biomarqueurs liés à l'exposition et à évaluer la variation de la réponse cellulaire en fonction de l'âge. Des LT ont été isolés de prélèvements sanguins de 91 volontaires appartenant à trois classes d'age (20-30, 45-55, 70-85 ans) puis exposés ex vivo pendant 72h à 45 µg/µl de PF collectées à Dunkerque. Les étapes d'isolement, purification et activation des LT ont d'abord été optimisées. Suite à la caractérisation de la population échantillonnée, une population d'étude homogène a été sélectionnée ( 10 sujets / classe d'âge). Nous avons mis en évidence une induction génique d'enzymes impliquées dans l'activation métabolique des HAP identifiés dans l'échantillon de PF. La caractérisation du profil des Lt a permis de proposer un profil mixte Th1/Th2 causé par l'exposition. L'étude transcriptomique des miARN a mis en évidence une surexpression de miR-124-3p impliqué dans la régulation de plusieurs fonctions au niveau du système immunitaire et de miR-1290 impliqué dans plusieurs types de cancer. Quant à l'influence de l'âge, une surexpression des gènes codant pour les enzymes antioxydantes (NQO1 et HMOX1), une augmentation de la concentration des cytokines (IL-4 et IL-13) ainsi qu'une modification du profil d'expression de certains miARN ont été notées chez les sujets les plus âgés. / Atmospheric fine particulate matter (FP) are able to enter the lungs where some compounds can interact with lung cells and reach the bloodstream . Exposure to FP affects in particular susceptible populations such as the elderly. This thesis is part of a project aiming to identify the effects of FP on human T lymphocytes (LT) while attempting to determine biomarkers related to exposure and to evaluate the variation of the cellular response as a function of age. LT were isolated from blood samples of 91 volunteers belonging to three age groups (20-30, 45-55, 70-85 years) then exposed ex vivo for 72h to 45 µg/µl of FP collected in Dunkirk. The steps of isolation, purification and activation of LT were first optimized. Following the characterization of the sampled population, a homogeneous study population was selected (10 subjects/age class). We have demonstrated an induction of the genes coding for the enzymes involved in the metabolic activation of PAH identified in the PF sample. Characterization of the LT profile made it possible to propose a mixed th1/th2 profile cause by the exposure. Teh transcriptomic study of miRNAs revealed an overexpression of miR-124-3p involved in the regulation of several functions in the immune system and miR-1290 involved in several types of cancer. As for the influence of age, overexpression of the genes coding for the antioxidant enzymes (NQO1 and HMOX1), an increase in the concentration of cytokines (IL-4 and IL-13) as well as a modification of the expression profile of some miRNAs were noted on the elderly.

Le système immunitaire humain est majoritairement commandé par les cellules dendritiques et les lymphocytes T auxiliaires. Lorsque les cellules dendritiques détectent un pathogène, elles vont instruire les lymphocytes T auxiliaires afin qu’ils adoptent le phénotype approprié à la menace rencontrée. Les lymphocytes T auxiliaires peuvent être divisés en plusieurs sous-populations, caractérisées par la production de cytokines spécifiques. Chaque sous-population de lymphocyte T auxiliaire possède des fonctions propres et est impliquée dans l’élimination de pathogènes distincts. Si les réponses des lymphocytes T auxiliaires ne sont pas finement régulées, ils peuvent devenir pathogéniques, et dans ce cas, considérés comme cibles potentielles pour des thérapies. Dans ce contexte, j’ai concentré mon travail de doctorat sur l’étude de la diversité des sous- populations de lymphocytes T auxiliaires et de leur régulation. Premièrement, j’ai démontré que les cellules dendritiques activées par la TSLP sont capables d’induire la polarisation de lymphocytes T folliculaires. Ensuite, j’ai participé à la construction d’un modèle mathématique capable de prédire la réponse lymphocytaire T auxiliaire en fonction de signaux dérivés des cellules dendritiques. Ce modèle nous a permis d’identifier un rôle spécifique pour l’IL-12p70, dépendant du contexte IL-1, dans l’induction d’IL-17F sans IL-17A. Enfin, j’ai monitoré huit populations de lymphocytes T auxiliaires et folliculaires dans le sang périphérique de patients atteints de dermatite atopique traités par Dupilumab, une immunothérapie ciblant la sous-unité alpha du récepteur de l’IL-4 et j’ai pu montré que la diminution du pourcentage de lymphocytes Th17 correlait avec l’amélioration du score clinique EASI. Globalement, mon travail sur la diversité de phénotypes Th apporte une ressource mécanistique importante, avec une potentielle application en immunothérapie. / Human immunity is essentially driven by dendritic cells and T helper cells. When dendritic cells detect a pathogen, they will instruct T helper cells to adopt the adapted phenotype for the specific threat encountered. T helper cells are subdivided in multiple subsets, characterized by particular sets of cytokines. Each T helper subset has specific functions and is involved in the clearance of distinct pathogens. If T helper responses are not precisely regulated, they can become pathogenic, in this case T helper pathways can be considered as potential targets for therapy. In this context, I focused my PhD work on studying T helper cell subset diversity and regulation. First, I demonstrated the ability of TSLP-activated dendritic cell to induce T follicular helper cell polarization. Then I participated in building a mathematical model capable of predicting T helper cell response to dendritic-cell derived signals. This model allowed us to identify the specific role of IL-12p70, in an IL-1 context, to induce IL-17F without IL-17A. Finally, I monitered eight T helper and T follicular helper cell populations in peripheral blood from atopic dermatitis patients treated with Dupilumab, an immunotherapy targeting the IL-4 receptor alpha subunit, and was able to show a correlation between decrease of Th17 cell percentage and improvement of EASI clinical score. Overall, my work on Th phenotype diversity provides key mechanistic insight with potential application in immunotherapy.

Soybean oil (SBO), menhaden fish oil (FO), chicken fat (CF) or hydrogenated soybean oil (HSBO) were incorporated at 5% of the total diet to study changes in the immunological status of both Japanese quail (JAP) and Bobwhite quail (BOB). The SBO diet, in which 66% of the total fatty acids were polyunsaturated fatty acids (PUFA), was rich in linoleic acid (LA 18:2 n-6), alpha-linolenic acid (ALA 18:3 n-3) and low in saturated fatty acid (SFA). The FO diet which contained about 50% PUFA, had only 40% n-6 fatty acids and 8% n-3 PUFA. The trans fatty acid isomers and other monounsaturated fatty acids (MUFA) were high in the HSBO diet. The diet containing CF provided a relatively balanced fatty acid composition with 18% SFA, 31% MUFA and 50% PUFA. Plasma fatty acid and hepatic fatty acid profiles consistently reflected their respective dietary lipid treatments. There were no differences in the fatty acid profile between blood and liver within respective dietary treatments in the two species. Dietary fatty acids had no effect on antibody titers against sheep red blood cells (SRBC) at 1, 2 and 8 months following the start of dietary lipid treatment in JAP. However, female JAP fed FO had a significantly (p< 0.05) higher antibody production compared to the other dietary lipid treatments at 4 months following the start of fatty acids supplementation. BOB fed either FO or SBO diets had a higher immunoglobulin G production compared to birds fed the CF diet. The total antibody titer was significantly higher in BOB fed SBO compared to CF. Dietary fatty acids had a significant effect on cell-mediated immunity (CMI) as accessed by toe web thickness 24 hours post intradermal injection of phytohemagglutinin-P (PHA) in both JAP and BOB. In general, birds fed a FO diet had a significantly higher CMI response than those fed HSBO. A diet high in n-3 PUFA increased the index of cutaneous basophil hypersensitivity (CBH), while the high trans fatty acid isomers suppressed the CBH response. By observing a CBH response over a 72-hour period in JAP, it was concluded that quail fed CF or SBO had a different peak response time (12 hours post PHA challenge) and amplitude compared with those fed FO or HSBO (24 hours post PHA challenge). Phagocytic ability was not affected by dietary lipid treatments in BOB while the quail fed FO diet had a faster carbon clearance rate. The FO fed JAP had a significantly higher response (p< 0.05) to concanavalin A ensiformis (CONA) compared to HSBO fed birds. There was no difference in B lymphocyte proliferation stimulated by lipopolysacchride (LPS) in female JAP, whereas it was significantly higher in male JAP fed SBO compared to those fed FO and HSBO. Phorbol 12-myristate 13-acetate/ionomycin calcium salt (PMA/ION) was used to nonspecifically stimulate cell proliferation by increasing chromosome mitosis. Dietary FO or HSBO suppressed cell proliferation stimulated by PMA/ION. However, JAP fed SBO or CF had a significantly higher PMA/ION stimulated lymphocyte proliferation compared those fed FO or HSBO. In male BOB, the FO fed birds had the highest response to all mitogens. In contrast, female BOB did not show any dietary effects by lymphocyte proliferation. Consistent with JAP, BOB fed HSBO had depressed lymphocytes proliferation in response to various mitogens stimulation. In general, female birds had a higher plasma total protein (PTP) and lower pack cell volume (PCV) compared to their males counterparts in both BOB and JAP. In summary, in in vivo experiments, feeding a diet high in menhaden fish oil that is rich in n-3 PUFA enhanced the CMI. There was a minimal effect on antibody production caused by feeding n-3 PUFA in JAP since a significant treatment effect was only found at one sampling period, while BOB were more sensitive to dietary lipid manipulation and had a higher antibody production with SBO or FO treatments. Dietary lipids exerted different effects in the two species in in vitro experiments. While both BOB and JAP fed FO had higher lymphocyte proliferation to CON A mitogen compared to those fed HSBO, only male BOB showed a higher proliferation to LPS. Feeding HSBO that contained a higher content of trans fatty acid isomers, MUFA, but lower PUFA content resulted in the lowest lymphocyte proliferation to various mitogens in both BOB and JAP. / Ph. D.

Chronic kidney disease (CKD) is associated with a complex state of immune dysfunction characterised by immune depression, which predisposes CKD patients to infections, and by immune activation resulting in inflammation, which is associated with cardiovascular disease among these patients. It has been suggested that regular moderate exercise may enhance immune function and exert anti-inflammatory effects. However, such effects are still unclear in CKD. Therefore, we investigated the effects of acute and regular (1-month and 6-months) moderate intensity aerobic exercise (walking) on measures of immunity and inflammation in pre-dialysis CKD patients. A single bout of walking exercise induced an overall immune and inflammatory response that was comparable to that observed in healthy individuals, with no indication of harmful effects to patients underlying state of immune dysfunction. Acute exercise induced a normal pattern of mobilisation of immune cells. Concerning immune cell function, acute exercise had no effect on T lymphocyte and monocyte activation, while it actually improved neutrophil responsiveness to a bacterial challenge in the recovery period. In addition, acute exercise induced a systemic anti-inflammatory environment, evidenced by the marked elevation in plasma IL-10 levels after exercise, which was most likely mediated by the observed increase in plasma IL-6 levels. Regular walking exercise exerted anti-inflammatory effects, with no apparent detrimental effects to patients immune and inflammatory status. Regular exercise led to improvements in the systemic inflammatory status (ratio of pro-inflammatory IL-6 to anti-inflammatory IL-10 cytokine levels) that were accompanied, and most likely mediated, by the observed down-regulation of T lymphocyte (only evident at 6-months) and monocyte activation. In addition, a reduction in IL-6 production in PBMC and whole blood cultures was also observed (only assessed at 1-month). Regular exercise had no effect on circulating immune cell numbers and neutrophil degranulation responses. These findings provide compelling evidence that walking exercise is safe from an immune and inflammatory perspective and has the potential to be an effective anti- inflammatory therapy in pre-dialysis CKD patients.

Le rejet d’allogreffe dépend de la reconnaissance d’antigènes d’histocompatibilité étrangers par le système immunitaire du receveur. En l'absence de thérapies immunosuppressives, la réaction inflammatoire éventuelle conduit à la destruction rapide du tissu transplanté. Le rôle critique joué par les lymphocytes T CD4+ dans le rejet aigu d'allogreffe est bien établi. Cependant, les contributions respectives des lymphocytes CD4+ Th1 et Th2 dans la réaction de rejet sont controversées. Alors que le rôle des cellules Th1 dans la pathogénèse du rejet est bien établi, l'hypothèse que les cellules Th2 favorisent l'acceptation de la greffe est invalide puisque ces cellules sont capables de déclencher des voies alternatives de rejet. En effet, la fonction effectrice des lymphocytes Th2 a été démontrée dans beaucoup de modèles de rejet de greffe ou de tumeur, et dans la maladie du greffon contre l'hôte. Les caractéristiques principales du rejet de type Th2 sont sa dépendance envers la production d'IL-4 et d'IL-5, le recrutement d'éosinophiles au site du rejet, et son inhibition par les lymphocytes T CD8+ alloréactifs. Les éosinophiles activés exercent leur activité cytotoxique par la libération de plusieurs molécules cytotoxiques comme l’EDN, l’ECP, la MBP et l’EPO. Ces molécules sont probablement responsables de la capacité des éosinophies à affecter la perméabilité vasculaire et à induire des dégâts tissulaires dans les organes rejetés. L'interleukine 9 (IL-9) est une cytokine produite par les lymphocytes T qui joue un rôle important dans les voies effectrices Th2. Dans la littérature, l’IL-9 est fortement associée au développement de l’éosinophilie tissulaire. Dans notre première étude, nous avons analysé le rôle joué par l'IL-9 dans le rejet d'allogreffe bm12 par des souris B6 (pour C57BL/6), un modèle dans le lequel une simple disparité au niveau de la molécule du CMH de classe II favorise une réaction inflammatoire de type Th2. Dans ce modèle, de faible alloantigénicité, les greffes cardiaques bm12 survivent presque indéfiniment dans les receveurs B6 (>60 jours). Nos expériences ont été conçues afin de savoir si l’expression de l’IL-9 au niveau de la greffe pouvait modifier la survie de greffes cardiaques exprimant les alloantigènes bm12. Nous avons ainsi montré que la production locale d’IL-9 induit le rejet des allogreffes cardiaques exprimant l’alloantigène I-Abm12 (survie <30jours). Aucun des organes transgéniques pour l’IL-9 n’a survécu plus de 30 jours alors que des greffes non transgéniques ne furent pas rejetées (>50 jours). L’analyse histologique des allogreffes cardiaques transgéniques pour l’IL-9 montre une infiltration cellulaire dense du myocarde. La composante principale de cet infiltrat est la présence de nombreux éosinophiles. Pour étudier la contribution des cytokines de type Th2, comme l’IL-4 et l’IL-5, dans le rejet des cœurs transgéniques pour l’IL-9, nous avons sélectivement bloqué ces cytokines lors du processus de rejet. Le traitement avec des anticorps neutralisant l’IL-4 bloque complètement le rejet induit par l’IL-9 et permet la survie à long terme des allogreffes cardiaques. Au point de vue de l’histologie ces greffes ne montrent ni infiltration leucocytaire ni artériopathie. Afin de déterminer si l’infiltration éosinophilique induite par l’IL-9 provient de l’activité directe de l’IL-9 ou est le résultat de la sécrétion d’IL-5, un traitement avec un anticorps anti-IL-5 a été appliqué aux receveurs d'allogreffe cardiaque. Ce traitement augmente la survie de la majorité des allogreffes et modifie de manière marquée la composition de l’infiltrat cellulaire en prévenant le recrutement des éosinophiles. De manière intéressante, les cœurs transgéniques pour l’IL-9 qui survivent indéfiniment après le traitement anti-IL-5 arborent une importante fibrose. A la différence du cœur bm12, la peau bm12 greffée sur un receveur B6 subit un rejet rapide et l'histologie des greffes rejetées révèle la présence d'infiltrats denses à éosinophiles. Notre laboratoire a montré que ce processus de rejet est dirigé par les lymphocytes T CD4+ alloréactifs et que les souris B6 déficientes pour l'IL-5 et la voie de cytotoxicité Fas/Fas-L sont incapables de rejeter des peaux bm12. Nos premiers résultats laissaient supposer un rôle pour l'IL-9 dans notre modèle de rejet de greffes en disparité des molécules du CMH de classe II: premièrement, nous avions observé la production d'IL-9 par les lymphocytes T de type Th2 alloréactifs et deuxièmement, l'ARNm d'IL-9 était fortement exprimé au niveau des allogreffes de peaux rejetées. C’est pourquoi, la survie de peaux bm12, déficientes pour la molécule Fas, greffées sur des receveurs B6 déficients pour l'IL-9 (B6.IL-9-/-) a été comparée avec celle de peaux transplantées sur des receveurs B6. Nous avons montré que, comme les souris B6 normales, les animaux B6.IL-9-/- rejettent leur greffe dans les 15 jours. Donc, contrairement à l'IL-5, l'IL-9 n'est pas essentielle pour le rejet de peau dirigé par les cellules T CD4+ de type Th2 dans notre modèle de disparité des molécules du CMH de classe II. Néanmoins, les allogreffes de peaux, dans notre modèle de disparité des molécules du CMH de classe II, contiennent moins d’éosinophiles lorsqu’elles sont rejetées par des receveurs déficients pour la synthèse d’IL-9 (IL-9-/-). En plus du modèle bm12, nous avons également observé un rôle de l’IL-9 dans un autre modèle de rejet Th2. Il a été montré par notre laboratoire que le rejet d’allogreffes cardiaques Balb/c complètement incompatibles par des souris receveuses B6.CD8-/- est caractérisé par le recrutement d’éosinophiles dans l’organe rejeté (106). Dans celui-ci, l’ARNm de l’IL-9 est présent pendant le rejet, de même que l’IL-4 et l’IL-5 et les greffes rejetées par des receveurs IL-9-/- contiennent moins d’éosinophiles par rapport à des receveurs contrôles. Les mécanismes par lesquels l’IL-9 induit le recrutement des éosinophiles ne sont pas complètement connus. L’IL-5 est considérée comme la cytokine clé pour le développement de l’éosinophilie. De plus, le rejet aigu des cœurs transgéniques pour l’IL-9 est caractérisé par une infiltration massive d'éosinophiles et est inhibé lors de la neutralisation de l'IL-5. Nous avons entrepris la seconde étude pour investiguer le lien fonctionnel entre l’IL-9 et l’IL-5 dans le rejet d’allogreffe, ce qui permettra de mieux comprendre le recrutement des éosinophiles par l’IL-9. Bien que le rejet ne soit pas inhibé par le manque d’IL-9, les allogreffes rejetées par les souris déficientes en IL-9 contiennent moins d’éosinophiles par rapport à des souris contrôles et présentent une production plus faible d’IL-5 par les cellules T alloréactives. De manière intéressante, la production optimale d’IL-5 après une stimulation allogénique requiert un récepteur à l’IL-9 (IL-9R) fonctionnel sur les cellules répondeuses. De plus, l’infiltration d’éosinophiles induite par l’IL-9 est absente dans des peaux transplantées sur des receveurs déficients pour le récepteur de l’IL-9. Finalement, la production d’IL-5 par des cellules T CD4+ stimulées par l’anti-CD3 est abolie par la neutralisation de l’IL-9. En conclusion, nous pouvons dire que l'IL-9 est capable d'induire un rejet de type Th2, caractérisé par une forte infiltration d’éosinophiles et une dépendance à l'IL-5 et à l'IL-4. Notre étude montre également que l’IL-9 peut agir directement sur les cellules T CD4+ pour induire leur capacité à sécréter de l’IL-5. Cependant, l’IL-9 n’est pas indispensable au processus de rejet Th2 et il est probable que lorsque l’IL-9 est bloquée d'autres cytokines soient capables de compenser son absence. Notre étude permet une meilleure compréhension des voies complexes du recrutement des éosinophiles.

Les lymphocytes T CD4 (LT CD4) jouent un rôle central dans la régulation des réponses immunitaires vis-à-vis des agents infectieux et des vaccins. Cependant, leur différenciation in vivo est encore mal comprise et les caractéristiques des LT CD4 capables de persister à long terme tout en assurant une réponse immunitaire protectrice sont mal définies. L’approfondissement de ces connaissances est indispensable pour le développement de nouveaux vaccins. Pour approcher cette question, nous avons utilisé deux approches expérimentales. La première est un suivi de la différenciation des LT CD4 au cours de la réponse immune primaire chez des sujets vaccinés contre l’hépatite B ; la deuxième est la caractérisation phénotypique et fonctionnelle des LT CD4 mémoires antigène(Ag)-spécifiques pendant la phase d’état. Cette analyse a été réalisée au sein des LT CD4 spécifiques d’Ag vaccinaux, l’Ag de surface du virus de l’hépatite B (HBs) et la toxine tétanique (TT), ainsi que ceux spécifiques des Ag du cytomégalovirus (CMV). Les LT CD4 Ag-spécifiques ont été mis en évidence par cytométrie de flux après marquage intracytoplasmique du ligand du CD40 (CD40L) exprimé en réponse à une stimulation de courte durée par l’Ag. Des expériences basées sur la stimulation par la toxine du syndrome du choc toxique et le marquage du segment Vbeta2 du récepteur des LT ont démontré la bonne sensibilité et spécificité de cette méthode. Le suivi de la réponse primaire chez 11 donneurs jusqu’à plus d’un an après immunisation par le vaccin anti-hépatite B a permis d’établir un modèle de différenciation des LT CD4 Ag-spécifiques in vivo chez l’homme. Nous avons mis en évidence des LT CD4 spécifiques d’un nombre limité de peptides immunodominants de la protéine HBs suggérant une réponse de type oligoclonale. Grâce à l’utilisation d’un cytomètre neuf couleurs, nous avons mené une analyse détaillée de l’hétérogénéité de la population mémoire HBs-spécifique. L’expression du CCR7 permet de distinguer des cellules de type mémoire centrale (LTCM, CCR7+) et effectrice (LTEM, CCR7-) se distinguant notamment par leur capacité à migrer vers les ganglions lymphatiques ainsi que par leurs propriétés fonctionnelles. Nous avons montré l’existence de ces deux sous-populations au sein des cellules HBs-spécifiques mais par opposition à leur définition initiale, ces LTCM sont capables de produire des cytokines effectrices. La proportion importante de LTCM exprimant le Ki67 témoigne d’une activité proliférative persistante in vivo et suggère la capacité de ces cellules à s’auto-renouveler et éventuellement à alimenter le pool des LTEM. La proportion importante de LTCM exprimant la chaîne alpha du récepteur à l’IL-7 (CD127) suggère que ces cellules sont sensibles aux signaux émanant de l’IL-7, une cytokine dont le rôle dans le maintien de la mémoire lymphocytaire T est connu. Compte tenu de la relevance potentielle de ces caractéristiques uniques pour le développement de vaccins et de l’accumulation de travaux montrant l’avantage sélectif des LTCM à conférer une immunité protectrice, nous avons focalisé la dernière partie de ces recherches sur cette sous-population. Une étude transversale des LTCM spécifiques de plusieurs types d’Ag (éliminés (HBs et TT) ou persistants (CMV)) a été menée. Nos résultats montrent une hétérogénéité, variable selon l’Ag, de la capacité de ces cellules à produire des cytokines effectrices et de leur phénotype de différenciation. Cette donnée nouvelle soulève la possibilité que les LTCM soient hétérogènes dans leur capacité à conférer une immunité protectrice. L’acquisition du marqueur KLRG1 par une fraction des LTCM s’associe à une capacité accrue à produire des cytokines effectrices et à une expression élevée du CD127. La possibilité que ces cellules soient particulièrement aptes à conférer une immunité protectrice et durable est discutée, tout comme les mécanismes menant à leur génération et l’intérêt de ces connaissances pour la conception de nouveaux vaccins.

Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

B-lymphocytes have traditionally been thought to contribute to immunity and autoimmune disease through terminal differentiation into plasma cells that secrete antibody. However, studies in mice and recent clinical studies have demonstrated that genetically altered B-cell function and B-cell-targeted therapies can significantly affect autoimmune diseases that were predominantly thought to be T-cell-mediated. B-cell depletion in mouse models of disease has also led to the identification of alternative B-cell effector functions that regulate normal immune responses and autoimmune disease. This review highlights multiple B-cell effector mechanisms, including the promotion of cellular immunity, the negative regulation of immune responses, and the production of pathogenic antibodies. / Dissertation

The C-type lectin CD161 is expressed by a large number of T lymphocytes, with approximately a quarter of both T cell receptor (TCR)&alpha;&beta;+ and TCR&gamma;&delta;+ T cells expressing this marker. Within CD8+ T cells, a large proportion of these are comprised of Mucosal Associated Invariant T (MAIT) cells, a novel innate-like lymphocyte subset characterised by expression of a semi-invariant TCR together with high levels of CD161 (CD161++). These cells display a phenotype reflective of type 17 CD4+ helper T cells (Th17), which are also hallmarked by CD161 expression. Both MAIT and Th17 cells arise from preprogrammed progenitors, identifiable within umbilical cord blood by expression of CD161. Thus, CD161 appears to identify cells of a pre-determined and distinct phenotype. Whether this reflects a common transcriptional programme, developmentally induced within these cells, and further whether this extends to other CD161 positive T cells, was examined here by mRNA microarray analysis. This analysis identified a shared transcriptional signature and common innate-like function of all CD161 expressing T lymphocytes, and independent of TCR expression or lineage. Furthermore, a population of CD8+ T lymphocytes expressing lower levels of CD161 which overlap phenotypically with CD161++CD8+ MAIT cells was identified by both mRNA microarray analysis and mass cytometry (CyTOF); the CD161+CD8+ T cell population. TCR repertoire analysis, flow cytometry and cell culture experiments were utilised to investigate the origin of this subset, and its phenotype and function in both health and disease investigated in depth. This revealed a pre-programmed, tissue-resident memory population with potent effector functions. Both CD161++ MAIT and CD161+CD8+ T cells expressed high levels of the drug efflux pump MDR1, previously described to confer drug resistance to certain malignant cells. The significance of expression of this pump was hence investigated to determine its potential affect on the success of a variety of clinical therapies.

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.