Orientador : Wesley Rodrigues Silva / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-01T00:07:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigues_FlavioHenriqueGuimaraes_D.pdf: 6782577 bytes, checksum: 3a5c8a62e81acbc4dc4bc13df3d72012 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: O lobo-guará (Chrysocyon brachyurus) é o maior canídeo da América do Sul. Característico de ambientes abertos, a espécie vem sofrendo com a transformação dos campos em áreas agrícolas e hoje, apesar de ainda ser amplamente distribuído, tem que lidar com as dificuldades de viver em ambientes fragmentados. A maioria das Unidades de Conservação do Cerrado é pequena e possivelmente não tem área suficiente para manter uma população saudável da espécie. Desta forma, é necessário conhecer a ecologia e comportamento de lobos-guarás nestas pequenas reservas, para melhor conservar a espécie. Este trabalho visa a levantar dados sobre a dieta, padrões de movimentação, variabilidade genética e fatores principais de risco para a população de uma pequena Unidade de Conservação do Cerrado, a Estação Ecológica de Águas Emendadas, Distrito Federal. Os resultados confirmam uma dieta variada, composta tanto por itens animais quanto por vegetais. A lobeira é o principal alimento, importante tanto em termos de freqüência quanto em biomassa. Outros itens, como pequenos mamíferos e tatus também foram importantes. A lobeira é também importante por suprir a necessidade de frutos na dieta dos lobos em tempos de escassez de frutos, prevenindo males que podem advir de uma dieta excessivamente protéica. Por outro lado, o lobo é o principal dispersor das sementes deste fruto, apesar de outras espécies também o consumirem e serem capazes de dispersar as sementes. As áreas de vida dos lobos foram grandes, e fêmeas tenderam a ter áreas maiores que os machos. O grande tamanho das áreas de vida e a característica territorial da espécie impede que grandes densidades populacionais sej am atingidas, tendo sido estimado no máximo cinco casais sejam residentes na região da Estação. Este número é pequeno para manter uma população viável a longo prazo e em virtude disso já detectei perda de variabilidade genética da população, se comparada a amostras obtidas de lobos de diferentes regiões. Também devido à grande área ocupada, os lobos são obrigados a sair constantemente da Unidade de Conservação para atender suas necessidades ecológicas, o que os toma susceptíveis a vários riscos, principalmente o de atropelamentos. Este, por sinal, foi a principal causa de mortalidade encontrada, responsável pela perda de aproximadamente o equivalente à metade da produção anual de filhotes (considerando uma média de dois filhotes). Transloquei três indivíduos de lobo-guará para testar esta ferramenta de manejo para manutenção da variabilidade genética da população. Nenhum dos três animais permaneceu na área por mais de três dias. Desta forma, os principais riscos para a população são: 1) a continuação do processo de isolamento da Estação, por aumento de áreas agrícolas e, principalmente, de áreas urbanas, com conseqüências na variabilidade genética (isolamento de outras populações) e na pressão direta sobre os indivíduos (diminuição de áreas úteis no entorno da Estação onde podem transitar, aumento de caça e invasão de animais domésticos); 2) a mortalidade por atropelamentos / Abstract: The maned wolf (Chrysocyon brachyurus) it is the largest canid of South Arnerica. Characteristic of open habitats, the species is threatened with the transformation of the fields in agricultural are as and, today, in spite of the wide distribution, they have to work with the difficulties of living in fragmented areas. Most of the Conservation Units of the Cerrado are small and possibly they don't have enough area to maintain a healthy population of the species. Therefore, it is necessary to know the ecology and behavior of maned wolves in these small reserves. The aim of this work is to obtain data on the diet, movement pattems, genetic variability and main factors of risk for the population of a small Conservation Unit of the Cerrado, the Águas Emendadas Ecological Station, Distrito Federal, Brazil. The results confirm a varied diet, composed of animal and vegetal items. The lobeira fruit is the main food of maned wolf, important as much in frequency as in weight. Other items, as small mammals and armadillos were also important. The lobeira is also important for supplying the need of fruits in the diet of the wolves in times of fruits shortage, preventing the threats of an excess of protein in the diet. On the other hand, the wolf is the main dispersor of the seeds of this fruit, despite it' s consuption by other species and their capability to disperse the seeds. The home ranges of the wolves were large, and females tended to have larger are as than the males. The great size of the home ranges and the territorial characteristic of the species disable that great densities are reached, and I estimate that at the most five couples are resident in the area of the reserve. This number is small to maintain a long term viable population and therefore we already detected a loss of genetic variability by the population, if compared with samples obtained of wolves from different areas. Also due to the large area, the wolves are forced to leave constant1y of the Conservation Unit to assist its ecological needs, what tums them susceptible to several risks. This was the main cause of mortality founded, responsible for the loss of approximately the equivalent of half of the annual production of cubs (considering an average of two cubs). I did, without success, translocation of three individuaIs to test this management toei for maintenance of the genetic variability of the population. None of the three animaIs stayed in the area for more than three days. Consequently, the main risks for the population are: 1) the continuation of the process of isolation of the reserve, for increase of agricultural areas and, mainly, of urban areas, with consequences to the genetic variability (isolation of other populations) and in the direct pressure on the individuaIs (decrease of useful are as in the surroundings of the Station where they can range, an increase of hunting and invasion of domestic animaIs); 2) road kills / Doutorado / Doutor em Ecologia

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-11-29Bitstream added on 2014-06-13T20:40:56Z : No. of bitstreams: 1 rochamendes_f_dr_rcla.pdf: 1399445 bytes, checksum: 1dbe830ff3efb283f51bde2137e50a23 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Existe um gradiente de cenários cuja composição, abundância e biomassa de animais podem estar praticamente intactas ou encontrar-se em seu maior grau de comprometimento (“síndrome de floresta vazia”). Em diversos níveis de defaunação, processos ecológicos podem ser interrompidos pela falta de interações, modificando a dinâmica do ambiente. Visto que a Floresta Atlântica ainda possui razoáveis extensões e diferentes situações no que diz respeito à composição mastofaunística, ela é um cenário interessante para o estudo da defaunação e suas implicações. Assim, o presente estudo caracterizou a comunidade de mamíferos em duas áreas geograficamente próximas desse bioma e avaliou os efeitos da defaunação sobre parâmetros e processos de estruturação de comunidades vegetais. Os resultados indicaram uma mastofauna semelhante em riqueza, mas com discrepância na abundância e biomassa das espécies. Diferenças nas abundâncias de alguns táxons, com destaque para o queixada (Tayassu pecari), tiveram efeitos significativos sobre a diversidade, biomassa e pisoteio de plântulas. A intensidade de pisoteio apresentou relação negativa com a defaunação, enquanto que a biomassa e a diversidade de plântulas foram maiores na área com menor biomassa animal. Embora tenha sido detectada a ação do queixada em aspectos da dinâmica populacional do palmito (Euterpe edulis), dentro do espaço e tempo amostral, não foram percebidas consequências drásticas em relação à abundância desse ungulado sobre as comunidades dessa palmeira. De maneira semelhante, a dispersão de sementes de indai-açu (Attalea dubia) não parece ser diretamente afetada pela abundância de mamíferos herbívoros, visto que o seu principal agente dispersor, o serelepe (Sciurus aestuans), não demonstra sofrer com a pressão... / There is a gradient of scenarios whose animals composition, abundance and biomass can be practically intact or with their greatest commitment degree (empty forest syndrome). In several defaunation levels, ecological processes can be interrupted by lack of interaction, changing the environment dynamics. Since the Atlantic Forest still has reasonable extensions and different fauna situations, it is a scenario interesting for the study of defaunation and its implications. Thus, this study characterized the mammal community in two areas geographically close in this biome, and assessed the defaunation effects on plant communities’ parameters and processes structuring. The results indicated that mammal communities are similar at the richness, but show discrepancies in abundance and biomass of the species. Differences in abundances of some taxa, especially the withe-lipped peccaries (Tayassu pecari), had significant effects on diversity, biomass and trampling of seedlings. The intensity of trampling showed negative relationship with defaunation, whereas the seedlings biomass and diversity were greatest where animal biomass is lower. Although the action of peccaries have been detected in some aspects of population dynamics of palm (Euterpe edulis), within the evaluated space and time, were not indicated drastic consequences in relation to the abundance of this ungulate on this palm communities. Similarly, the seeds dispersal of indaiaçu (Attalea dubia) does not appear to be directly affected by the abundance of herbivores larger, since their main dispersal agent, the squirrel (Sciurus aestuans), do not demonstrates to suffer from the pressure hunting in the biome. Even in small time scale, considering the natural cycles, once again was proven that mammals maintain a close relationship with several aspects of plant community... (Complete abstract click electronic access below)

El primer objectiu d'aquest estudi va ser determinar la presència de subpoblacions espermàtiques amb pautes específiques de motilitat en semen de cavall, porc i conill. Es va utilitzat per aquest fi l'anàlisi computaritzat de la motilitat espermàtica (CASA). L'optimització de les variables que millor expliquen el moviment espermàtic es va realitzar mitjançant una anàlisi d'agrupament de variables basat en l'estudi de la seva matriu de covariança. La investigació va demostrar que tres subpoblacions espermàtiques en semen de porc i quatre en semen de cavall i conill coexisteixen en els ejaculats. Es varen trobar diferències significatives (P <0.01) en la distribució d'aquestes subpoblacions en totes les espècies, sobretot en cavalls i conills. No obstant, no va existir una relació clara entre les subpoblacions espermàtiques i la fertilitat "in vivo" del semen. P'altra banda, l'estimació precisa sobre la capacitat fecundant de l'ejaculat de mamífers seria molt útil per l'optimizació de les tècniques de reproducció assistida. Amb aquest propòsit, es va plantejar el segon objectiu d'aquest estudi, que va ser determinar la possibilitat d'utilitzar la combinació matemàtica de varis paràmetres de qualitat seminal en semen de porc i conill, incloent el CASA. En porc, dos models matemàtics obtinguts per regressió logística varen seleccionar el test de resistència osmòtica, el test de resistència hiperosmòtica i la viabilitat espermàtica com els paràmetres que millor prediuen la taxa de concepció (P<0.05). No obstant, cap dels models fets per regressió lineal es va relacionar amb la prolificitat. En conill, les regressions logística i lineal van proporcionar dos models matemàtics significatius (P<0.05) que van seleccionar la viabilitat i les anormalitats espermàtiques amb els paràmetres de major predicció de la fertilitat i la prolificitat. En cavalls, els ejaculats amb almenys una fertilitat confirmada van presentar espermatozoides amb gran linealitat i progressivitat. A més, la totalitat de les mostres fèrtils presentaven un número total d'espermatozoides per ejaculat superior a 20 x 109. Les nostres observacions recolzen l'opinió de que la utilització predictiva dels resultats obtinguts en l'anàlisi de semen d'aquests mamífers pot aconseguir-se de forma raonable mitjançant l'aplicació dels anàlisis de regressió que permetin relacionar tots els paràmetres de qualitat avaluats en cada espècie. Així, la metodologia utilitzada explica sistemàticament la qualitat del semen de mamífers, a més de relacionar-la amb la taxa de concepció obtinguda després de la inseminació artificial i la prolificitat en els mamífers avaluats.Paraules claus: Anàlisi seminal en mamífers, Subpoblacions espermàtiques, Taxa de concepció, Tamany de la camada, Proves funcionals. / El primer objetivo de este estudio fue determinar la presencia de subpoblaciones espermáticas con pautas específicas de motilidad en semen de caballo, cerdo y conejo. Se utilizó para este fin el análisis computarizado de la motilidad espermática (CASA). La optimización de las variables que mejor explican el movimiento espermático se realizó mediante un análisis de agrupamiento de variables basado en el estudio de su matriz de covarianza. La investigación demostró que tres subpoblaciones espermáticas en semen de cerdos y cuatro en semen de caballo y conejo coexisten en los eyaculados. Se encontraron diferencias significativas (P<0.01) en la distribución de estas subpoblaciones en todas las especies, sobretodo en caballos y en conejos. Sin embargo, no existió una relación clara entre las subpoblaciones espermáticas y la fertilidad "in vivo" del semen. Por otra parte, la estimación precisa de la capacidad fecundante del eyaculado de mamíferos sería muy útil para la optimización de las técnicas de reproducción asistida. Con este propósito, se planteó el segundo objetivo de este estudio, que fue determinar la posibilidad de usar la combinación matemática de varios parámetros de calidad seminal en semen de cerdo y conejo, incluyendo el CASA. En cerdo, dos modelos matemáticos obtenidos por regresión logística seleccionaron el test de resistencia osmótica, el test de resistencia hiperosmótica y la viabilidad espermática como los parámetros que mejor predicen la tasa de concepción (P<0.05). Sin embargo, ninguno de los modelos hechos por regresión lineal se relacionó con la prolificidad. En conejo, las regresiones logística y lineal proporcionaron dos modelos matemáticos significativos (P<0.05) que seleccionaron la viabilidad y las anormalidades espermáticas como los parámetros de mayor predicción de la fertilidad y la prolificidad. En caballos, los eyaculados con al menos una fertilidad confirmada presentaron espermatozoides con gran linealidad y progresividad. Además, la totalidad de las muestras fértiles presentaban un número total de espermatozoides por eyaculado superior a 20 x109. Nuestras observaciones respaldan la opinión de que la utilización predictiva de los resultados obtenidos en el análisis de semen de estos mamíferos puede conseguirse en forma razonable mediante la aplicación de análisis de regresión que permitan relacionar todos los parámetros de calidad seminal evaluados en cada especie. Así, la metodología empleada explica sistemáticamente la calidad del semen de mamíferos, además de relacionarla con la tasa de concepción obtenida después de la inseminación artificial y la prolificidad en los mamíferos evaluados. Palabras claves: Análisis seminal en mamíferos, Subpoblaciones espermáticas, Tasa de concepción, Tamaño de la camada, Pruebas funcionales. / The first aim of this study was to test the presence of separate sperm subpopulations with specific motility characteristics in stallion, boar and rabbit ejaculates by using a computer-assisted semen analysis system (CASA). Sperm motility descriptors were analyzed thorough the clustering of variables based on a covariance matrix. This matrix selects the descriptors of sperm motility that better explain the spermatozoon kinetics. Sperm subpopulations were obtained by disjointing cluster analysis where the observations are divided into clusters by which each observation belongs to one specific cluster. This test showed that three separate sperm subpopulations with different motility characteristics in boar, and four in stallion and rabbit, coexist in the ejaculates. There were significant (P<0.001) differences in the distribution of these subpopulations among individuals in all of the studied species, but no clear relationship between motile subpopulation structure and fertility was obtained. A second aim of the study was to test the possibility for a precise estimation of the fertilizing ability of mammalian ejaculate based upon the results of semen analysis. For this purpose, we tested the mathematical combination of several parameters of the boar and rabbit semen quality analysis as predictive "in vivo" fertility tools The main mathematical relations utilized among parameters were logistic and linear regressions. In boar, two mathematical models obtained by logistic regression involving osmotic resistance test, hyperosmotic resistance test and viability of fresh samples, showed a significant (P<0.05) relationships between semen characteristics and conception rate. However, none of the obtained models produced a significant relation between semen characteristics and litter size. In rabbits, logistic and linear regression analysis rendered two mathematic, significant (P<0.05) models, with related some semen characteristic (sperm viability and abnormalities) with "in vivo" fertility and litter size. In stallion, the study of subpopulations in ejaculates which showed confirmed fertilizing capacity showed that these ejaculates had the majority of their motile spermatozoa included in a subpopulation with high progressiveness and low linear velocity. Moreover, all the ejaculates with proven fertility which have a total sperm count &#8805;20x109 spermatozoa/ ejaculate showed all of their motile sperm included in this subpopulation. Our results support that the use of the values obtained in a standard boar, rabbit and stallion semen quality analysis to predict life fertilizing ability of a single ejaculate can reasonably be achieved by applying logistic and linear regression analyses to the parameters included in this analysis. Thus, our methodology can explain in a systematic manner mammal semen quality, relating it to conception rate and litter size.Key words: Mammalian semen analysis, Sperm subpopulations, Conception rate, Litter size, Functionality tests.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-05-27Bitstream added on 2014-06-13T20:07:22Z : No. of bitstreams: 1 penna_mah_dr_rcla.pdf: 3149372 bytes, checksum: c0ff1245fef00ae9478342001dbbe584 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O estudo das características microscópicas dos pêlos de mamíferos tem sido desenvolvido com o propósito de utilizá-las como critério taxonômico, especialmente para a identificação de restos presentes em fezes, conteúdos estomacais e bolotas de regurgitação de predadores. Os pêlos são menos danificados no processo digestivo, e são freqüentemente a única prova para identificação da presa em estudos de hábito alimentar, já que ossos e dentes sofrem intensa fragmentação durante a mastigação apresentando baixo valor diagnóstico, portanto um conhecimento maior da estrutura do pêlo facilita esses estudos e oferece uma base para estudos mais completos de predação e seus efeitos sobre as espécies de presa. Assim, os objetivos do presente projeto foram o desenvolvimento de técnicas de preparação de lâminas de pêlos para coleções e observações diretas; o desenvolvimento de uma chave de identificação de alguns roedores de mata atlântica baseada em pêlos; e a análise morfométrica dos pêlos de algumas espécies de roedores para a comparação com dados biométricos. Foram desenvolvidas 3 novas técnicas para a preparação de lâminas para a observação da medula de pêlos e outras 3 para a observação do padrão cuticular. Essas técnicas proporcionam um maior índice de sucesso na preparação de lâminas, aumentando também a visibilidade dos padrões e consequentemente as possibilidades de pesquisas na área. / The mammal hair identification has been used across the world for studies in forensics, in the field of public health, in textile fibers research, and in mammals feeding ecology, being useful on the identification of leftovers on feces and stomach contents. Hairs are the less damaged structures by digestive processes and nonetheless are the only clue for the identification of the prey in studies of feeding ecology of predators, since bones and tooth suffer heavy damage during the chewing process, being of a low diagnostic value. These factors show the importance of a better knowledge of the hair structure for prey or predator ecology studies. Also the hair trapping and identification has a important value in animal research bioethics, since the mammal surveys can be developed with hair-traps or scats/pellets without any harm or interference for the animals which have no risk to get addicted to the bait, which usually bias surveys, and minimizing the stress for being caught. The aim of the present thesis were the development of better techniques for the preparation of hair plates for collections and direct observations; the development of a identification key for Rain Forest rodents; and the morphometrical analysis of those mammals hairs for further comparison and analysis with biometrical data. There were developed 6 new techniques, being 3 for medulla pattern observation, and another 3 for cuticular impressions. Those techniques showed a higher success index on plate preparation, enabling the development of high level research on this field.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6257.pdf: 24603104 bytes, checksum: 8e1cc27127817f4a53e04130a940aadb (MD5) Previous issue date: 2014-08-13 / Financiadora de Estudos e Projetos / The São Paulo State is suffering an urban and rural expansion that has been causing fragmentation and isolation of Cerrado domain in forest remaining. Most of these occupied areas in São Paulo State have put the vertebral animals, mainly the mammals, in danger. The aim of this study was do the mastofauna survey present in a forest fragment with 260 ha located in Ribeirão Bonito municipality in this State, relate this fauna with the vegetation that compose the forest fragment and collect biological data and information about mastofauna conservation. Were performed 33 field visits for the sampling and the methodology consisted in mammals observations and capture. The observations were made by active search, allowing research mammals of medium and large size, and the mammals capture utilized pitfall for small mammals study, both carried out in the period between February 20013 and January 2014. The studied fragment can be classified as a transition area among Cerradão and Semideciduous forest, where were identified 114 plant species. Were identified 16 species of non-flying mammals of various sizes, ranging from small to large, and grouped in 10 families (Didelphidae, Canidae, Felidae, Procyonidae, Dasypodidae, Cricetidae, Hydrochoerinae, Cervidae, Tapiridae and Atelidae) belonging to seven orders (Didelphimorphia, Carnivora, Cingulata, Rodentia, Artiodactyla, Perissodactyla and Primates). Among this species identified in the study area, highlight sensitive species to anthropic pressure like Tapirus terrestris e Lycalopex vetulus. Analysis showed influence of plant species composition and richness in the distribution of small mammals within the forest fragment studied. / O Estado de São Paulo está vivenciando uma expansão urbana e rural que vem fragmentando e isolando o domínio Cerrado em remanescentes florestais. No Estado de São Paulo a maioria destas áreas ocupadas tem posto em risco os animais vertebrados, principalmente os mamíferos. Este trabalho tem como objetivo realizar o levantamento da mastofauna presente em um fragmento florestal com 260 ha situado no Município de Ribeirão Bonito neste Estado, buscando relacioná-la com a vegetação que compõe o remanescente florestal e com o intuito de reunir dados biológicos e informações relativas a conservação da mastofauna. Este estudo realizou 33 visitas de campo para amostragem, com metodologia compondo-se de observações e captura de mamíferos As observações foram realizadas por meio de buscas ativas, permitindo pesquisar os mamíferos de médio e grande porte, e a captura de mamíferos utilizou armadilhas de queda para o estudo de pequenos mamíferos, ambas no período de fevereiro de 2013 a janeiro de 2014. O fragmento estudado pode ser classificado como pertencente a uma área de transição entre Cerradão e Floresta Estacional Semidecidual incluindo a identificação de 114 espécies vegetais. Foram identificadas 16 espécies de mamíferos não voadores de diversos tamanhos, variando de pequeno à grande porte e agrupados em 10 famílias (Didelphidae, Canidae, Felidae, Procyonidae, Dasypodidae, Cricetidae, Caviidae, Cervidae, Tapiridae e Atelidae), pertencentes à sete ordens (Didelphimorphia, Carnivora, Cingulata, Rodentia, Artiodactyla, Perissodactyla e Primates). Entre estas espécies identificadas na área de estudo, se destacam espécies sensíveis a pressões antrópicas como Tapirus terrestris e Lycalopex vetulus. As analises demonstraram influência da composição e riqueza de espécies vegetais na distribuição de pequenos mamíferos no interior do fragmento florestal estudado.

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-08-01Bitstream added on 2015-04-09T12:48:23Z : No. of bitstreams: 1 000814103.pdf: 1452849 bytes, checksum: f707e4a021ff215d257253f7436bc0c8 (MD5) / As relações evolutivas da Ordem Carnivora são extensivamente estudadas e contraditórias, principalmente entre os caniformes. Embora as filogenias baseadas em dados moleculares tenham feito uma contribuição importante, elas também podem ser comparadas a reconstruções usando outros tipos de caracteres, como comportamentais. O comportamento vem conquistando espaço no cenário da biologia evolutiva, e entre os comportamentos exibidos pelos animais, a autolimpeza se apresenta como uma boa fonte de caracteres filogenéticos. Este estudo teve como objetivo reconstruir uma filogenia das principais Famílias de carnívoros caniformes usando o comportamento de autolimpeza como caractere. Foi criada uma reconstrução filogenética por meio de caracteres moleculares como forma de comparação e evidência adicional. Nas análises comportamentais, excetuando-se os representantes dos grupos externos, uma grande politomia é o resultado para os demais terminais analisados. Os terminais dentro dessa politomia, no entanto, apresentam algumas relações interessantes e com grande sustentação em verificações de bootstrap e jackknife. Os resultados com dados moleculares, nos quais foram empregados setores específicos do gene citocromo b mostraram uma filogenia clássica da Subordem, exceto no que diz respeito à posição do representante da Família Canidae, mas com baixo suporte em verificação bootstrap em alguns ramos, exceto no que diz respeito à posição do representante da Família Canidae. A rápida radiação adaptativa, bem como especiação recente e grande diversidade ecológica dos grupos do estudo representam dificuldades ao se tentar estabelecer o exato relacionamento entre as espécies, independente dos dados biológicos utilizados para reconstrução filogenética. / The evolutionary relationships inside the Order Carnivora are extensively studied and sometimes contradictory, especially among caniforms. Although phylogenies based on molecular data have made a significant contribution, they can also be compared to reconstructions using other types of characters, such as the behavioral ones. Behavior has aided space on the current state of evolutionary biology, and among the various possible behaviors exhibited by animals, grooming is a very good source of phylogenetic characters. Grooming has stereotyped patterns and it has been shown that differences in patterns of grooming are observable between closely related species, which makes it a good source of phylogenetic characters. Thus this study aimed to reconstruct a phylogeny of the major families of caniforms carnivores using the grooming behavior as character. A molecular phylogenetic reconstruction was created for comparison and also as further evidence. In the behavioral reconstruction, except for the representatives of the external groups, it resulted a large polytomy. Terminals within this polytomy, however, present some interesting and highly bootstrap and jackknife supported associations. The results with molecular data, in which specific sectors of the cytochrome b gene were employed, showed a classical phylogeny of the suborder, except for the position of the Canidae‟s representative, but with low bootstrap support in most branches. Rapid adaptive radiation, recent speciation and great ecological diversity of the studied group turn difficult to establish the exact relationship between the terminals, independent of the biological data used.

Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2013-08-20T20:33:29Z No. of bitstreams: 1 DissertaçãoAlbérico.pdf: 527717 bytes, checksum: c1c13471f8f71bd123fccf10536eb114 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-08-23T22:05:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DissertaçãoAlbérico.pdf: 527717 bytes, checksum: c1c13471f8f71bd123fccf10536eb114 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-23T22:05:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissertaçãoAlbérico.pdf: 527717 bytes, checksum: c1c13471f8f71bd123fccf10536eb114 (MD5) / Fapesb, Projeto Manati / PETROBRAS, ERM do Brasil / Pouco se sabe a respeito de como mudanças evolutivas do repertório comportamental das espécies se relaciona com alterações de sua socialidade. Neste trabalho, comparamos a expressão de tipos de comportamentos sociais em três espécies de roedores do gênero Trinomys (T. yonenagae, T. iheringi denigratus e T. minor) e em Thrichomys apereoides e discutimos a evolução dessas características em Trinomys. Para cada espécie registramos de 8 a 12 encontros inter-sexuais de díades em uma arena neutra (50% entre machos e 50% entre fêmeas) e quantificamos a freqüência de exibição de comportamentos sociais afiliativos e agonísticos. Para detectar diferenças do repertório comportamental entre espécies e entre sexos, utilizamos uma análise de variância de dois fatores multivariada seguida por teste de comparações múltiplas, usando os tipos mais comuns de comportamentos. Interpretamos evolutivamente os dados de Trinomys com base na metodologia de polarização por comparação com o grupo externo (Thrichomys apereoides). Nossos resultados indicam que: (1) a maior socialidade de Trinomys yonenagae evoluiu através da perda e diminuição na freqüência de comportamentos agonísticos (comportamentos de locomoção para ataque e fuga e de luta), acompanhada do surgimento e aumento na freqüência de comportamentos afiliativos relacionados com coesão e estabilidade do grupo (comportamentos de limpeza social; de contato físico não-agressivo e potencial reconhecimento olfatório); (2) a menor afiliação em Trinomys minor está relacionada com a perda evolutiva de comportamentos e freqüências afiliativas (comportamentos de contato físico não agressivo e de potencial reconhecimento olfatório) e com o surgimento e aumento na freqüência de comportamentos agonísticos (comportamento de locomoção para ataque e fuga e exibição de agressividade sem contato). A afiliação intermediária de T. iheringi denigratus se deve ao fato dessa espécie ser mais tolerante a co-específicos do que Thrichomys apereoides (grupo externo) e Trinomys minor. / Salvador, Bahia

Resumo: A Floresta Atlântica é uma das maiores e mais importantes florestas tropicais do continente sul americano, mas é um dos mais ameaçados biomas do mundo devido a grande redução da cobertura vegetal. Essa destruição leva a fragmentação e perda de biodiversidade e aliado a isso temos que ordens como Rodentia e Didelphimorphia são pouco conhecidas. Alguns estudos mostram que a estrutura da vegetação leva a variação da diversidade e riqueza das espécies. Nesse contexto, o presente estudo descreve a estrutura da comunidade de pequenos mamíferos não-voadores na Reserva Natural Rio Cachoeira, município de Antonina (PR), em uma área de floresta ombrófila densa em três estágios sucessionais: capoeira, floresta primária e secundária. O estudo foi realizado no período de agosto de 2010 a julho de 2011, através da metodologia captura-marcação-recaptura. As capturas foram realizadas com 100 armadilhas de arame. Na capoeira foram utilizadas 20 armadilhas no solo e nas outras áreas 40, sendo 20 no solo e 20 no sub-bosque a uma altura de 1,5 a 2 metros. A isca utilizada foi banana caturra e emulsão de Scott. O esforço amostral foi de 5757 armadilhas - noite em 63 dias de atividades de campo. Foram realizadas 160 capturas de 74 indivíduos. Foram capturadas três espécies de marsupiais: Didelphis aurita, Gracilinanus microtarsus e Marmosa paraguayana. As espécies de roedores capturadas foram de Oligoryzomys nigripes, Akodon cursor, Sooretamys angouya, Delomys dorsalis e Euryoryzomys russatus. A maior riqueza total (6), maior riqueza no solo (6) e o maior índice de diversidade (0,6871) foram verificados na floresta primária. As espécies capturadas apenas na capoeira foram Oligoryzomys nigripes e Akodon cursor e neste setor foi encontrado a maior abundância (45,94% ), maior número de capturas (n = 72) e de indivíduos (n = 34). As espécies mais abundantes foram Oligoryzomys nigripes (n = 40,54%) e Gracilinanus microtarsus (n = 27,02%). Em junho ocorreu o pico das capturas com 35% do total. As capturas no sub-bosque representaram 53% na primária e 69% na secundária. Não houve captura de marsupial na capoeira, na secundária e na primária marsupiais representaram 89% e 69% das capturas. Roedores representaram 60,81% do total de capturas. O maior intervalo entre a primeira e última captura foi encontrado para um indivíduo de Gracilinanus microtarsus com de 125 dias, já para roedores o maior tempo foi de 52 dias para um indivíduo de Euryoryzomys russtaus. Não foi verificado uma diferença significativa na razão sexual para Marmosa paraguayana, entretanto, para Graciliannus microtarsus houve diferença. Mais de 90% dos marsupiais capturados foram adultos. Foi determinada a área de vida através do método do Mínimo Polígono Convexo sendo que para a espécie Akodon cursor foi de1800 m². A maior média (± desvio padrão) da área de vida foi de 2025 (± 954,59) m² para Gracilinanus microtarsus, assim como o maior volume em 3106,91 m³. Áreas com maior complexidade apresentam uma riqueza maior com captura de poucos indivíduos.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ecologia, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2009. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2010-03-05T19:21:47Z No. of bitstreams: 1 2009_AnaElisadeFariaBSchittini.pdf: 5318235 bytes, checksum: 61ad8288d6a579874552e2bc664cd6a5 (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-03-08T22:42:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_AnaElisadeFariaBSchittini.pdf: 5318235 bytes, checksum: 61ad8288d6a579874552e2bc664cd6a5 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-03-08T22:42:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_AnaElisadeFariaBSchittini.pdf: 5318235 bytes, checksum: 61ad8288d6a579874552e2bc664cd6a5 (MD5) Previous issue date: 2009-02-05 / O bioma Cerrado, a despeito de sua importância como hotspot para a conservação, tem sofrido perdas significativas de cobertura nativa nas últimas décadas. Tais perdas resultam em uma paisagem fragmentada, com consequências negativas para a manutenção da biodiversidade, em especial para a mastofauna de médio e grande porte (> 1kg). Devido à importância ecológica do grupo, associada à sensibilidade à perda e fragmentação de hábitats, o conhecimento científico, desde inventários básicos até a investigação dos processos que levam a perda de espécies, é necessário para orientar estratégias de conservação não apenas o grupo, mas toda a biodiversidade do bioma. Assim, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a comunidade de mamíferos de médio e grande porte no município de Água Boa-MT e avaliar os efeitos da estrutura e dinâmica da paisagem sobre esta comunidade. O levantamento geral da mastofauna foi realizado de junho/08 a janeiro/09 com 24 armadilhas fotográficas, distribuídas em oito sítios (três por sítio) distantes de pelo menos 2 km. No capítulo 1, foram listadas as espécies registradas e testada a representação da amostragem por meio de curvas de acumulação de espécies. Devido à diferença de esforço amostral entre sítios, as riquezas locais foram comparadas pela técnica de rarefação. Foram registradas 28 espécies para um esforço total de 3.302 armadilhas-dia. A amostragem mostrou-se representativa para a região, apesar de insuficiente para a riqueza local de alguns sítios. Comparado a outros levantamentos semelhantes no Cerrado, sendo a maior parte conduzida dentro de unidades de conservação, este estudo registrou a maior riqueza de mamíferos de médio e grande porte já encontrada. Isso sugere o potencial da região para a conservação da mastofauna do bioma, atentando ainda para a necessidade de estratégias de conservação por meio do manejo integrado de paisagens. No capítulo 2, foi testada a associação entre as variáveis biológicas riqueza (S), riqueza de carnívoros (Sc), frequência de registros de carnívoros (abundC) e frequência de registros de espécies de grande porte (abundG) e parâmetros da paisagem pretérita e recente, medidos com base em imagens de satélite de 1989, 2001 e 2007. Os parâmetros usados para descrever a paisagem foram: cobertura de mata (mata), cobertura de vegetação nativa (nat), densidade de borda (ed), perda de cobertura de 1989 a 2001 (perda89_01) , perda de 2001 a 2007 (perda01_07) e perda de cobertura de total (perda89_07). Esses parâmetros foram usados como variáveis explanatórias na construção de modelos conceituais (simples e compostos, lineares e nao-lineares) que explicassem as variáveis biológicas. O ajuste dos modelos aos dados biológicos foi testado segundo o Critério de Informação de Akaike (AIC), corrigido para amostras pequenas (AICc). Os resultados da seleção de modelos para explicar a variável riqueza, sugerem uma forte influência das matas de galeria na manutenção da mesma e um atraso de resposta aos efeitos de fragmentação, devido ao grande peso atribuído a uma variável da paisagem pretérita (ed89). Para Sc os modelos mais plausíveis, que incluem mata e heterogeneidade como importantes indicam que, possivelmente, as matas de galeria ajudam a manter a diversidade de presas e, consequentemente, a riqueza de carnívoros predadores. Por sua vez, a heterogeneidade da paisagem pode contribuir para a mortalidade de carnívoros, indiretamente, devido à facilitação da entrada de parasitas. O mesmo indício de atraso no tempo de resposta à fragmentação aparece para os carnívoros e este é ainda mais evidente para a frequência de registros do grupo (abundC). Concluiu-se assim que as matas de galeria desempenham um forte papel na manutenção da diversidade de espécies, mas a sua simples preservação parece ser insuficiente para a viabilidade das populações em longo prazo, uma vez que, os efeitos da configuração espacial das porções de hábitat, representada aqui pela densidade de borda, parece já surtir efeitos negativos nas populações, embora ainda não tenha resultado em perda de espécies. Esta, no entanto, pode acontecer no futuro, caso os efeitos da perda de hábitat e alteraçõe na estrutura da paisagem não sejam mitigados. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Despite its importance as a conservation hotspot, the Brazilian Cerrado, has been increasingly destroyed in the last few decades. The resulting fragmented landscape has negative impacts over biodiversity, especially for medium and large sized mastofauna (> 1kg). Because of medium and large sized mammals´ vulnerability to habitat loss and fragmentation, and theirs ecological importance, scientific knowledge, from basic assessment to the investigation of processes that lead to the species loss, is needed not only to Cearrado‟s mastofauna, but also to the entire biome‟s biodiversity. This research aimed at the characterization of the medium and large size mammals‟ community in Água Boa, State of Mato Grosso, Brazil, and at the evaluation of the effects of landscape structure and dynamics on the community. The mastofauna survey was carried out from June/08 to January/09, and 24 camera traps were used, distributed in eight sites (three cameras for each site) with a minimum distance of 2km among them. In chapter 1, the species were recorded and the sampling representativeness was tested by the comparison of species accumulation curves. Due to the difference of sampling effort between sites, the local richness was compared each other through the rarefaction technique. We recorded 28 wild species and 4 exotic species of medium and large size mammals, for a sampling effort of 3.302 trap-days. The sample turned out to be representative of the entire region, but was insufficient for the local richness of some sites. This study registered the greatest richness of medium and large sized mammals so far, in comparison to similar surveys in the Cerrado, most of them carried out inside of conservation units. The results suggests the region has great importance for the conservation of the biome‟s mastofauna, which requires integrated landscape-level conservation strategies. In chapter 2, we tested the association between the biological variables: richness (S), carnivores‟ richness (Sc), frequency of carnivores‟ records (abundC) and frequency of large sized species‟ records (abundG) with parameters of the past and recent landscape, using satellite images of 1989, 2001 and 2007. The parameters used to describe the landscape were: riparian forest cover (mat), native cover (nat) and edge density (ed) measured for the three years and also native cover loss from 1989 to 2001 (perda89_01) and from 2001 to 2007 (perda01_07) and total loss in the period (perda89_07). These parameters were used as explanatory variables of conceptual models (simple and composites, linear and nonlinear) to explain the biological variables. The models‟ fit to the biological data were tested according to Akaike Information Criterion (AIC), adjusted for small samples (AICc). The results of the model selection used to understand richness, suggest a strong influence of the riparian forest on its maintenance and a time-lag response to the effects of fragmentation, due to the greater relevance assigned to the model using a past landscape variable (ed89). The most plausible models for Sc, those that consider riparian forest cover and landscape heterogeneity to be important, indicate that riparian forest could possibly support high prey diversity and, consequently, carnivorous predator diversity also high. In its turn, landscape heterogeneity can indirectly contribute to carnivore mortality, due to facilitation of parasite invasion. There is also some evidence of carnivore time-lag response to the fragmentation, which is even more evident for the frequency of carnivores‟ records (abundC). It can be concluded that the riparian forests play a role in the maintenance of the diversity of species, but its simple preservation seems to be insufficient for the long-term population viability, as the spatial configuration effect, represented by edge density, seems to have negative impact on the populations, even though there has not been any species loss yet. However, local extinction may happen in the future if the impacts of habitat loss and landscape structure changes were not mitigated.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2008. / Submitted by mariana castro (nanacastro0107@hotmail.com) on 2010-03-16T13:28:23Z No. of bitstreams: 1 2008_Monica Aragona.pdf: 1323213 bytes, checksum: 75f7e120976f264ec6a54e83ec1a088b (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-04-23T23:08:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_Monica Aragona.pdf: 1323213 bytes, checksum: 75f7e120976f264ec6a54e83ec1a088b (MD5) / Made available in DSpace on 2010-04-23T23:08:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_Monica Aragona.pdf: 1323213 bytes, checksum: 75f7e120976f264ec6a54e83ec1a088b (MD5) Previous issue date: 2008-03-31 / Os pequenos mamíferos não voadores foram estudados na Faz. Aparecida, município de Nossa Senhora do Livramento (16º14’19’’S e 56º22’51’’W), Pantanal de Poconé, MT, Brasil. Os objetivos foram descrever aspectos da história natural, da biologia reprodutiva e parâmetros populacionais de algumas espécies, além de descrever e comparar as comunidades de pequenos mamíferos em três hábitats florestais representativos da região. Ao todo três métodos de coleta foram usados para inventariar as espécies: transectos lineares, programa de monitoramento e coletas aleatórias. Os dois primeiros métodos usaram armadilhas do tipo Sherman e Gaiola de Gancho. Os transectos lineares foram montados em fisionomias abertas e fechadas, entre junho e agosto de 2005. Todos os animais capturados foram coletados para formar uma coleção de referência. O programa de monitoramento foi realizado mensalmente entre fevereiro de 2006 e agosto de 2007 (exceto janeiro e abril de 2007) em dez grades amostrais, de cem pontos cada, em três tipos de florestas localmente denominadas de cambarazal (3), landi (3) e cordilheira (3) e em uma área de campo de murundus. Cambarazais, landis e campos de murundus estão sujeitos à inundação sazonal, enquanto as cordilheiras permanecem secas o ano todo. Os indivíduos capturados no programa de monitoramento foram marcados com brincos numerados e soltos. O esforço de captura total foi de 41.837 armadilhas.noite e ao todo foram registradas 15 espécies: seis Didelphidae (Caluromys philander, Didelphis albiventris, Gracilinanus agilis, Micoureus demerarae, Monodelphis domestica, Philander opossum), oito Cricetidae (Calomys cf. callosus, Holochilus sciureus, Hylaeamys megacephalus, Necromys lasiurus, Oligoryzomys cf. fornesi, Oligoryzomys nigripes, Oecomys mamorae, Oecomys roberti) e um Echimyidae (Thrichomys pachyurus). Apenas duas espécies ocorreram nos três hábitats florestais (M. demerarae e G. agilis), três somente ocorreram em hábitats inundáveis (P. opossum, H. megacephalus e O. roberti) e seis espécies ocorreram em apenas um tipo de hábitat: C. philander e D. albiventris em landis, H. sciureus em cambarazal e N. lasiurus, O. nigripes e T. pachyurus em cordilheiras. As espécies registradas neste estudo representam 47% das espécies de pequenos mamíferos não voadores descritas para a planície pantaneira. A maioria dos marsupiais analisados apresentou o período reprodutivo entre o final da seca e durante o período de cheia, enquanto que a maioria dos roedores apresentou atividade reprodutiva o ano todo, sendo intensificada durante o mesmo período dos marsupiais. O desenho robusto do “software” MARK foi usado para analisar as populações de G. agilis, M. demerarae, M. domestica e O. roberti com o objetivo de testar a hipótese de interferência sazonal nos parâmetros sobrevivência, imigração e emigração das populações em função do hábitat: em hábitats inundáveis os parâmetros seriam diferentes na presença e ausência de lâmina d’água no solo; em cordilheiras a variação seria distinta para as três estações: cheia, vazante e seca. A hipótese foi corroborada para as populações em cordilheiras, mas para a maioria das espécies em hábitats inundáveis a hipótese não foi confirmada. A variação da densidade observada ao longo do programa de monitoramento apontou para um declínio populacional entre o final da vazante e início da seca, sendo mais bem explicada pela história de vida, recrutamento e biologia reprodutiva das espécies do que por interferência sazonal na dinâmica das populações. A estimativa de riqueza de espécies (Jackknife de 1a ordem) não atingiu a assíntota para nenhum dos três hábitats florestais. Uma ANOVA de duas-vias, realizada entre hábitats, entre estações e para a associação hábitat-estação, indicou que não houve diferença na média de riqueza de espécies para nenhum dos casos, não havendo também para a associação. Apesar da riqueza de espécies ser semelhante para os três hábitats, existe diferença na composição de espécies. O teste t aplicado aos índices de diversidade de Shannon-Weaver (H’) apontou que não há diferença na diversidade observada entre cambarazal e cordilheira, mas estes são significativamente maiores que a diversidade observada em landi. Os coeficientes quantitativo e qualitativo de Sorensen apontaram maior similaridade entre estações de um mesmo hábitat do que entre hábitats para uma mesma estação, indicando ainda maior similaridade entre os hábitats sujeitos à inundação. Os resultados deste estudo evidenciaram a importância dos três hábitats florestados para a manutenção da diversidade de pequenos mamíferos não voadores no Pantanal de Poconé. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The non-volant small mammals were studied at Fazenda Aparecida in the municipality of Nossa Senhora do Livramento, Pantanal of Poconé, MT, Brazil. The objectives of this study were to describe some aspects of natural history, reproductive biology, populations parameters of some species, as well as describe and compare communities of small mammals in three forest habitats representative of the region. In all, three collecting methods were used to survey the species: linear transects, monitoring program and random collections. The first two methods used Sherman and hookcage traps. Linear transects were set in diverse open and closed physiognomies, between June and August 2005, and all captured animals were collected in order to form a reference collection. The monitoring program was carried out monthly between February 2006 and August 2007 (except January and April 2007) in ten sample grids, with one hundred trapping points in each grid, in three types of local forest denominated as cambarazal (3), landi (3) and cordilheira (3) and in an area of campo de murundus (1). Cambarazal, landi and campo de murundus are subject to seasonal inundation whereas the cordilheiras remain dry year round. Individuals captured during the monitoring program received a numbered ear tag and were released. Total capture effort was 41,837 traps.night and 15 species were registered: six Didelphidae (Caluromys philander, Didelphis albiventris, Gracilinanus agilis, Micoureus demerarae, Monodelphis domestica, Philander opossum), eight Cricetidae (Calomys cf. callosus, Holochilus sciureus, Hylaeamys megacephalus, Necromys lasiurus, Oligoryzomys cf. fornesi, Oligoryzomys nigripes, Oecomys mamorae, Oecomys roberti) and one Echimyidae (Thrichomys pachyurus). Only two species were captured at all three forest habitats (M. demerarae e G. agilis), three were only captured at flooded habitats (P. opossum, H. megacephalus e O. roberti) and six species were captured in only one habitat: C. philander and D. albiventris in landis, H. sciureus in cambarazal, and N. lasiurus, O. nigripes, and T. pachyurus in cordilheiras. The species registered in this study represent 47% of non-volant small mammals species described for the Pantanal floodplain. Most of analyzed marsupials presented reproductive period between the end of dry season and during flooded season, while most of rodents’ species presented reproductive activity throughout the year, with an intensification of reproductive efforts in the same period described for marsupials. The robust design from MARK software was used to analyze G. agilis, M. demerarae, M. domestica and O. roberti populations. The objective was to test the hypothesis of seasonal interference on survival, immigration and emigration parameters as a function of the habitat: at flooded habitats these parameters would be different at presence and absence of water in the ground; in cordilheiras the variation would be distinct for three seasons: flooded, water leaving, and dry. The hypothesis was corroborated by the populations in cordilheiras, but for most species at flooded habitats the hypothesis was not confirmed. Density variation observed throughout the monitoring program pointed out to a population decline between the end of water leaving and the beginning of dry seasons, being better explained by life history, recruitment and reproductive biology of the species than by seasonal interference on population dynamics. The species richness estimation (1st order Jackknife) did not reach an asymptote for any forest habitats. A two-way ANOVA performed between habitats, between seasons, and for habitat-season association did not detect differences in species richness average, even habitatseason association. Although species richness was similar for the three habitats, there were differences in the composition of species. The test t applied to the Shannon-Weaver (H’) diversity index indicated that there were no differences in the observed diversity between cambarazal and cordilheira, but these were significantly higher than the diversity observed in landi. Qualitative and quantitative Sorensen’s coefficients pointed to a higher similarity between seasons of the same habitat than between habitats in the same season. The coefficients also showed more similarity between seasonal flooded habitats. The results of this study make evident the importance of those three forest habitats for maintaining the diversity of non-volant small mammal of the Pantanal of Poconé.