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Clonagem e mapeamento molecular do gene de resistência ao Metolachlor em Saccharomyces cerevisiae / Cloning and molecular mapping of the Metolachlor resistance gene in Saccharomyces cerevisiae

Silva, Nirlei Aparecida 11 April 1995 (has links)
Este trabalho descreve a clonagem do gene de resistência ao Metolachlor em um plasmídio epissomal bifuncional (YEp 351), o qual pode ser utilizado como marcador seletivo dominante na transformação de Saccharomyces cerevisiae. Clones tranformantes selecionados diretamente em meio YEPD acrescido de 720 mg/L de Metolachlor, tiveram seu DNA genômico extraído e utilizado para transformar Escherichia coli a fim de amplificar e recuperar os plasmídios recombinantes. Outras linhagens de Saccharomyces foram também transformadas e foi possível observar que existe diferença entre linhagens quanto às suas capacidades de receber, manter e expressar DNA heterólogo, pois houve variação considerável nas suas eficiências de transformação. Vários métodos foram aplicados para obtenção do "cariótipo eletroforético” (este termo refere-se ao genoma de um dado organismo expresso em bandas cromossômicas) de Saccharomyces cerevisiae, dentre eles, o tratamento com acetato de lítio ganhou mais destaque. Empregando-se a técnica de eletroforese em campo pulsado e hibridização, foi possível mapear o gene de resistência ao Metolachlor no cromossomo XV da levedura, confirmando-se os dados de análise genética. / This work describes the cloning of the metolachlor resistance gene into an episomal bifunction plasmid (YEp 351) which can used as a dominant selective marker for Saccharomyces cerevisiae transformation. DNA of the transformed clones, directly selected onto YEPD medium added of 720 mg/l metolachlor, was used to transform Escherichia coli in order to amplify and recover recombinant plasmids. Other Saccharomyces strains were also transformed and as far as differences in receiving, maintaining and expression of the heterologous DNA is concerned, considerable variation in transformation was found them. Electrophoretic caryotyping (refers to an organism genome expressed in chromosomal bands) was performed in Saccharomyces cerevisiae according to different methods, and among them lithium acetate was the standing one. Pulsed field and hybridization were performed to map the metolachlor resistance gene into the yeast chromosome XV and these data were confirmed by genetical analysis.
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Comparação de métodos de mapeamento da distribuição espacial da infestação de plantas daninhas /

Salvador, André, 1976- January 2002 (has links)
Orientador: Ulisses Rocha Antuniassi / Resumo: A sociedade como um todo tem se preocupado com a contaminação do ambiente causada pelo uso de produtos químicos e muitas tentativas tem sido feitas para que se reduza a quantidade de herbicidas utilizada no controle de plantas daninhas. Há anos os produtores tem observado uma tendência de formação de manchas por várias espécies de plantas daninhas. A aplicação localizada é uma técnica que permite a variação da dose dos herbicidas de acordo com a variabilidade espacial dos alvos no campo. Dependendo do sistema adotado, mapas com a localização e características das plantas daninhas infestantes em um campo podem ser utilizados em aplicações localizadas de herbicidas. O objetivo deste trabalho foi comparar diferentes metodologias de mapeamento da distribuição espacial da infestação de plantas daninhas numa área de 3,9ha com milho em plantio direto sobre vegetação espontânea: mapeamento pelo caminhamento em grade de amostragem, mapeamento pelo caminhamento no contorno das manchas, mapeamento pelo deslocamento da colhedora no campo e mapeamento pela análise de imagens aéreas obtidas em baixa altitude de vôo. Para tanto foi utilizado um GPS de navegação para georreferenciar o perímetro das manchas localizadas na área. Uma grade de amostragem de 20x20m foi determinada com o uso de um DGPS, sendo amostradas a presença e porcentagem de cobertura em cada grade. A posição das plantas daninhas observadas durante a colheita foi georreferenciada com um DGP S conforme a plataforma da colhedora entrava ou saía de uma área de infestação. Diferentes tipos de câmeras foram utilizadas na obtenção das imagens da área sobrevoada por uma aeronave a uma altura de 300 a 500 m do solo. Marcas de referência foram colocas em 20 dos 101 pontos de coordenadas conhecidas que formavam a grade de amostragem para permitir o georreferenciamento das imagens... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: Society has been concerned with the environmental contamination caused by chemicals and attempts have been made to reduce herbicide weed control. Farmers have experienced for years that there is a tendency of a range of weed species to occur in patches. Patch spraying is a technique to minimize inputs of herbicides by applying it according to the weed patch position. Maps showing location and characteristics of weed infestation across the field can be used for patch spraying. Four different approaches for collecting georeferenced weed information to create weed maps were studied along the cycle of a corn crop in a no-tillage field of 3.9ha: manual surveying by field walking in sample grids, manual surveying by field walking at patch perimeters, manual surveying from the combine during the harvest and the use of low altitude aerial image analysis. The weed patches perimeter were georeferenced by walking with a GPS. A regular 20x20m grid sampling was established in the field with a DGPS and weed presence and percentage of coverage were determined at every grid point. Weed patches at the harvest time were georeferenced from the combine using a DGPS to record the patch position as the combine header passed through the patches. Different cameras were used to obtain images from an airplane flying 300 to 500 m above the ground level. Visible objects were placed at 20 of the 101 DGPS georeferenced grid points for afterwards image analysis using a Geographical Information System. Maps of weeds presence and position were generated with Idrisi32. The results showed that sampling percentage of coverage at grid was efficient to describe the spatial distribution of broadleaf weeds, even when it was present all over the area. The perimeter survey result to be an efficient method to map perennial weeds, mainly grass weeds. Digitalized images obtained from standard... (Complete abstract, click electronic address below). / Mestre
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Construção de um mapa comparativo preliminar do cromossomo 6 do búfalo de rio (Bubalus bubalis) utilizando um painel de células somáticas hídricas irradiadas /

Stafuzza, Nedenia Bonvino. January 2007 (has links)
Orientador: Maria Elisabete Jorge Amaral / Banca: Eliana Morielle Versute / Banca: Humberto Tonhati / Resumo: Nesse trabalho apresentamos o primeiro mapa comparativo do cromossomo 6 do búfalo de rio (BBU6), desenvolvido a partir da utilização de um painel de células somáticas híbridas irradiadas búfalo-roedor com fragmentação de 5000 rads. O mapa preliminar construído é composto por 33 marcadores, os quais estão ordenados em dois grupos de ligação compostos por 12 microssatélites, 19 genes codificantes e duas ESTs. A freqüência de retenção observada entre os marcadores variou de 14.4% a 40%. A ordem dos marcadores dentro dos grupos de ligação do BBU6, em sua maioria, é consistente com o mapa RH bovino. Esse mapa preliminar do BBU6 é um ponto de partida para comparar a ordem dos genes entre as espécies, fornecendo uma oportunidade para estudar micro-arranjos nesse cromossomo, além de possibilitar a clonagem posicional em búfalo de rio. / Abstract: We present the first radiation hybrid map of BBU6 developed from a recently constructed river buffalo whole-genome radiation hybrid panel (BBURH5000). The preliminary map contains 33 cattle-derived markers, including 12 microsatellites, 19 coding genes and two ESTs, distributed in two linkage groups. The retention frequency of individual markers ranged from 14.4% to 40.0%. Most of the marker order within the linkage groups is consistent with the cattle RH maps. This preliminary BBU6 RH map is the starting point for comparing gene order between both species, presenting opportunity for examination of micro-rearrangements of these chromosomes and, thereby enhancing the possibility of positional candidate cloning in river buffalo. / Mestre
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Isolamento de sequências repetitivas do genoma de espécies do gênero Ancistrus (Siluriformes: Loricariidae) /

Silva, Keteryne Rodrigues da. January 2016 (has links)
Orientadora: Patricia Pasquali Parise-Maltempi / Banca: Diogo Cavalcanti Cabral de Mello / Banca: Luciana Bolsoni Lourenco Morandini / Resumo: O DNA pode estar organizado no genoma em sequências de cópias únicas e em sequências que se repetem várias vezes, denominadas sequências repetitivas. Estas sequências são constituídas basicamente por repetições em tandem (satélites, minissatélites e microssatélites) ou dispersas (transposons ou retrotransposons), e parecem estar envolvidas em diversos eventos celulares importantes, como por exemplo nos processos de replicação do DNA, de recombinação, de expressão gênica e de evolução dos cromossomos, auxiliando na manutenção e propagação do material genético celular. Em nível cromossômico parecem ser responsáveis por proporções significativas das variações cariotípicas observadas em diversos grupos. O gênero Ancistrus (Siluriformes, Loricariidae) apresenta atualmente 68 espécies nominais, e uma enorme quantidade de espécies ainda não identificadas. Alguns trabalhos vêm utilizando sequências repetitivas também em análises citogenéticas e moleculares para identificação de cromossomos homólogos e marcadores cariotípicos interessantes que podem auxiliar os trabalhos de identificação de espécies. Apesar de serem amplamente estudadas em diversos organismos, há ainda muito a ser entendido sobre essas sequências e sua organização no genoma. Este trabalho teve como objetivo isolar sequências repetitivas no genoma de espécies de Ancistrus, afim de encontrar possíveis marcadores para o gênero, que pudessem contribuir para o entendimento da taxonomia deste grupo, bem como auxiliar no entendimento do processo de evolução dos cromossomos sexuais dessas espécies. Dentre as sequências isoladas está um transposon da família TC1/mariner que se mostrou presente em todos os cromossomos das espécies analisadas e dois DNAs satélites que se apresentam acumulados em regiões centroméricas de alguns ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: DNA may be organized in the genome as single copy sequences and as sequences that are repeated several times, called repetitive sequences. These sequences are basically constituted by tandem repeats (satellites, minisatellites and microsatellites) or scattered (transposons and retrotransposons), and seem to be involved in important cellular events such as, DNA replication process, recombination, gene expression and chromosome evolution, assisting in maintenance and spread the genetic material of cells. At chromosome level, seems to be significant proportions of karyotypic variations observed in several groups. The genus Ancistrus (Siluriformes, Loricariidae) has, actually, 68 nominal species and several species not identified yet. Repetitive sequences have been used in molecular cytogenetic analysis for identification of homologous chromosomes and interesting karyotypic markers that can assist in species identification works. Despite being widely studied in several organisms, there is still much to be understood about these sequences and their organization in the genome. This study aimed to isolate repetitive sequences in the genome of Ancistrusspecies in order to find possible markers for the genus, which could contribute to the understanding of the taxonomy of this group and to the understanding of the process of evolution of sex chromosomes of these species. Among the isolated sequences, there is a family of TC1/mariner transposon that showed to be present in all the chromosomes of the analyzed species, and two satellites DNAs that have accumulated in centromeric regions. Thus, this study resulted in data that could be contribute to understanding the karyotype evolution of Ancistrus genus as well as providing more information ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Geologia e geoquímica da porção sul do Maciço Castelo-ES /

Meyer, Ana Paula. January 2017 (has links)
Orientador: Antenor Zanardo / Banca: Antonio Carlos Artur / Banca: Whashington Barbosa Leite Junior / Banca: Rômulo Machado / Banca: Silvio Roberto Farias Vlach / Resumo: O presente trabalho compreende os estudos de campo (mapeamento geológico), análises petrográficas e geoquímicas para as rochas da porção sul do Maciço Castelo (ES). O pluton Castelo é uma intrusão ígnea representante do magmatismo pós-colisional do Orógeno Araçuaí que aflora na região sul do Estado do Espírito Santo. O trabalho propõe o mapa geológico na escala de 1:50.000 para a porção sul do maciço e os resultados das análises petrográficas e geoquímicas, indicaram fontes diferentes para as rochas monzograníticas e monzodioríticas desta área. De acordo estas análises, os biotita monzogranitos são de origem crustal e os biotita- quartzo monzodioritos de origem mantélica. Os dados levantados no trabalho também demonstram evidências de mistura magmática entre as diferentes unidades mapeadas / Abstract: The present work includes the field studies (geological mapping), petrographic and geochemical analyzes for the rocks of the southern portion of the Castelo Maciço (ES). The Castelo pluton is an igneous intrusion representative of the post-collisional magmatism of the Araçuaí Orogen that emerges in the southern region of the State of Espírito Santo. The work proposes the geological map in the scale of 1: 50,000 for the southern portion of the pluton and the results of the petrographic and geochemical analysis indicated different sources for the monzogranitic and monzodioritic rocks of this area. According to these analyzes, the biotite monzogranites are of crustal origin and the biotite quartz monzodiorites of mantle origin. The data collected in the work also demonstrate evidence of magmatic mixing between the different mapped units / Doutor
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Caracterização ambiental da bacia hidrográfica do Córrego Rico, Jaboticabal - SP /

Rodrigues, Flávia Mazzer. January 2013 (has links)
Orientador: Teresa Cristina Tarlé Pissarra / Coorientador: Sérgio Campos / Banca: João Antônio Galbiatti / Banca: Maurício José Borges / Banca: Valdemir Antônio Rodrigues / Banca: Ellen Fittipaldi Brasilio Carrega / Resumo: Os estudos de caracterização, diagnóstico e prognóstico de bacias hidrográficas visando o manejo dos recursos naturais têm sido realizados para compreender e implantar práticas conservacionistas no sistema produtivo agrícola. A ocupação do meio é uma ação antrópica que ocorre ao longo dos anos, dado ao crescimento populacional e o conhecimento territorial é o primeiro passo para o planejamento ambiental. Este trabalho teve como objetivo principal caracterizar ambientalmente a bacia hidrográfica do Córrego Rico utilizando técnicas de geoprocessamento. Mapas da rede de drenagem, solos, uso e ocupação e declividade da área foram analisados utilizando técnicas estatísticas e sistema de informação geográfica. A divisão da bacia foi realizada em compartimentos hidrológicos e foram determinadas as principais características geomórficas. Nas áreas de preservação permanente foram identificadas as ocorrências de conflito de uso, tendo como referência a legislação ambiental. Os resultados analíticos obtidos refletiram características ambientais dos recursos hídricos, com sistema drenante de fluxo superficial na área para o Rio Mogi-Guaçú. No que refere a sua degradação ambiental, vem ocorrendo uma diminuição na cobertura vegetal original nos mananciais, causada pelo desmatamento da mata ciliar decorrente da expansão da área urbana, e um abandono destas áreas na área agrícola. Em algumas regiões ocorreram reflorestamentos, tanto nas nascentes como ao longo da rede de drenagem. A Bacia Hidrográfica do Córrego Rico apresenta uma área de 563,13 km2, e foi dividida em 25 compartimentos hidrológicos para o planejamento da implantação de práticas conservacionistas. As declividades predominantes foram de 3 a 8%, em 55,3% da área total, e o principal uso observado foi a cultura de... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The characterization, diagnosis and prognosis studies on watersheds aimed to manage the natural resource have been performed to understand and implement conservation practices on agricultural production system. The occupation is a means of human action that occurs over the years, due to population growth, and the land use and land use change knowledge is the first step to environmental planning. This study aimed to characterize the environment of the Córrego Rico watershed using geographic information system techniques. Maps of the drainage network, soils, land use and land use change and slope were analyzed using statistical techniques and geographic information system. The division of the basin was performed in hydrological areas and the main physical characteristics were determined. In the permanent preservation areas were identified areas of land use conflict, with reference to Brazilian environmental legislation. Analytical results reflected environmental characteristics of water resources, with the drainage system in the area flowing to the Rio Mogi Guaçú. In terms of its environmental degradation, there has been a decrease in vegetation cover in the watershed caused by deforestation of riparian vegetation due to the expansion of the urban area, and an abandonment of these areas was observed. In some regions reforestation occurred in both the springs and along the drainage network. The watershed has an area of 563.13 km2, and was divided into 25 hydrological areas for planning the conservation practices. The predominant slopes were 3 - 8%, in 55,3% of the total area, and the main use was sugar cane. The soils that predominate at the downstream area was Oxisoil and Ultisols at upstream region. Of the total area, 6.12% are occupied with permanent preservation area totalizing... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Os compartimentos da paisagem e a elaboração de uma matriz para o planejamento ambiental em uma bacia hidrográfica com uso intensivo da agricultura : bacia hidrográfica do Ribeirão Santa Gertrudes, Veríssimo-MG /

Campos, Carlos Alberto Araujo. January 2017 (has links)
Orientador: Marcílio Vieira Martins Filho / Coorientador: Renato Farias Valle Júnior / Banca: Teresa Cristina Tarle Pissarra / Banca: José Eduardo Pitelli Turco / Banca: Fabricio Anibal Corradini / Banca: Vera Lucia Abdala / Resumo: Os aspectos pertinentes ao uso dos recursos ofertados pelo meio natural têm sido alvo de diferentes abordagens, seja pela necessidade de aproveitamento ou pelas limitações à sua captação pelo homem. Sendo os elementos que compõem o meio físico passiveis de análises mais apuradas quanto ao seu manuseio, envolvendo técnicas que reduzam os impactos gerados pela sua exploração direta e indireta. A espacialização das informações obtidas de forma direta ou indireta, acerca dos recursos ofertados pelo meio físico, representa uma possibilidade de interação entre as fontes fornecedoras de recursos naturais e sua localização, sendo essa passível de ser mapeada e circunscrita na superfície terrestre. Essa espacialização gera uma poderosa ferramenta de gestão e planejamento das atividades antrópicas. A delimitação de compartimentos da paisagem a partir de unidades do modelado do relevo apresentou resultados satisfatórios quanto as estabilidades dos compartimentos analisados. Assim, a delimitação de compartimentos da paisagem na bacia hidrográfica do ribeirão Santa Gertrudes que se localiza entre os munícipios de Uberaba e Veríssimo, na região do Triângulo Mineiro no estado de Minas Gerais, com 321 Km2 de área e é tributária da margem direita do rio Uberaba, teve como proposta buscar, analisar e compreender a dinâmica interna da mesma e suas alterações em função da ocupação antrópica e das atividades decorrentes dessa forma de ocupação. O objetivo deste trabalho, foi determinar compartime... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Relevant aspects of the use of resources offered by the natural environment have been the subject of different approaches, either the need for exploitation or the limitations of uptake by man. The elements that compound the physical environment are subject of more accurate analysis regarding handling, involving techniques that reduce the impacts generated by your direct and indirect exploitation. The spatialization of information obtained directly or indirectly about the resources offered by the physical environment, what represents a possibility of interaction between the natural resources sources and location to be mapped and circumscribed on the Earth's surface. This spatialization generates a powerful management and planning tool of human activities. The Santa Gertrudes Creek watershed is located between the municipalities of Uberaba and Veríssimo, in the State of Minas Gerais, with 321 Km2 of area and is a right tributary of Uberaba River. It was proposed to search, analyze and understand the internal dynamics of the watershed and its changes as a function of human occupation and activities resulting from this form of occupation. The use of landscapes compartments from relief units enabled the development of an environmental matrix for land use, pointing potentialities and weaknesses. The aim of this work was the preparation of landscape compartments from the mapping of relief units, what subsidized the elaboration of maps of environmental potentialities and weaknesses for the watershed under study. To do so, maps of geology, slope, geomorphology, and land use have been drawn up and infiltration tests and particle size analysis of soils were performed. It is worth noting, that by using a geographic information system, the information was spatialized in thematic maps and the crossing of them within a multicri... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Mapeamento e expressão gênica associada à fase de aquisição de competência organogênica em tomateiro (Solanum lycopersicum L. cv Micro-Tom) / Mapping and gene expression associated with the process of organogenic competence acquisition in tomato (Solanum lycopersicum L. cv Micro-Tom)

Azevedo, Mariana da Silva 25 September 2012 (has links)
Dentre os fatores relacionados à capacidade superior de regeneração in vitro de Solanum peruvianum, está a presença do alelo dominante Rg1. O gene RG1, envolvido na formação de gemas caulinares a partir de raízes e outros explantes, foi mapeado no cromossomo 3 entre os genes BETA-CAROTENE HYDROXYLASE (CrtR-b) e PHYTOENE SYNTHASE (PSY1). Variações alélicas também são conhecidas para genes CrtR-b e PSY1. white flower (wf) é o alelo de CrtR-b que produz pétalas brancas e yellow flesh (r) é o alelo de PSY1 que produz frutos amarelos. Os alelos wf e Rg1 com r foram introgredidos na cultivar Micro-Tom (Solanum lycopersicum L). Através da transferência sequencial de explantes de SIM para MB e de RIM para SIM, verificou-se que MT-Rg1 reduz o tempo necessário para a indução de gemas em um dia (6 dias em SIM para MT), devido a redução no tempo necessário para a aquisição de competência em um dia (2 dias para MT). Foram obtidos 30 possiveis recombinantes advindos do cruzamento Rg1/rg1 Wf/wf x rg1/rg1 wf/wf, baseados nas características de pétala branca (efeito do alelo wf) e maior ramificação (efeito do alelo Rg1). Todos os possíveis recombinantes foram testados in vitro quanto à capacidade de formar gemas caulinares em SIM e raízes em RIM. Com isso, 7 linhagens recombinantes foram confirmadas e utilizadas para o mapeamento fino da região na qual o gene RG1 está localizado no cromossomo 3. Para o mapeamento foram testados marcadores do tipo CAPS e SCAR, sendo utilizado o DNA genômico extraído de S. pennellii, S. peruvianum, Micro- MsK, MT, MT-Rg1, MT-wf e das 7 linhagens recombinantes, constatando-se que alguns marcadores moleculares desenhados para S. pennellii podem ser utilizados para S. peruvianum. Estas análises também evidenciaram que o segmento de introgressão de MT-Rg1 está entre o marcador P5 e o gene CrtR-b, totalizando 136 genes, entre os quais GRAS 10 destacou-se como principal candidato para a função gênica de Rg1. Complementarmente, foi realizada a análise de RNA-Seq (plataforma SOLiD) para a identificação de genes diferencialmente expressos entre MT e MT-Rg1. Com isso, observou-se que existem mais genes regulados negativamente do que positivamente durante a aquisição de competência. Devido ao grande número de genes diferencialmente expressos, alguns parâmetros foram utilizados para classificar os genes que poderiam ser quantificados por qRT-PCR em um experimento de regeneração in vitro. Entre os 361 genes classificados, 5 foram selecionados para a quantificação de sua expressão. Destes 5 genes, GRAS 10 e Serine/threonine protein phosphatase 7 foram os que apresentaram-se mais positivamente expressos e aparentemente são os que estão mais intimamente ligados a fase de aquisição de competência. Como existem muitos genes GRAS, foi feita uma árvore filogenética para posicioná-lo e identificar genes homólogos a ele. Com base na análise filogenética foi possível identificar o gene GRAS 10 como homológo ao gene SCL8 já identificado em Arabidopsis. Porém, pouco se sabe a respeito de SCL8. Desse modo, ainda é necessário confirmar a identidade do gene RG1, o que possibilitará a compreensão do processo de aquisição de competência. / The dominat allele Rg1 is related to the greater in vitro regeneration capacity of Solanum peruvianum L. The Rg1 gene is required for shoot formation from roots and others explants and was mapped on chromosome 3 between BETA-CAROTENE HYDROXYLASE (CrtR-b) and PHYTOENE SYNTHASE (PSY1) genes. Allelic variants are also known for the genes CrtR-b and PSY1. white flower (wf) is the allele of CrtR-b that produces white petals and yellow flesh (r) is the allele of PSY1 that produces yellow fruits. The alleles wf and Rg1 with r were introgressed into the Micro-Tom cultivar (Solanum lycopersicum L). Through the sequential transfer of explants from SIM to BM and RIM to SIM, we found that MT-Rg1 reduces the time required for the induction of shoots in one day (6 days on SIM for MT), due the reduction of the time required for competence acquisition in one day (2 days to MT). It was obtained 30 putative recombinants from crossing Rg1/rg1 Wf/wf x rg1/rg1 wf/wf. The recombinant lines were scored based on the presence of white petals (wf allele\'s effect) and increased shoot branching (Rg1 allele\'s effect). All putative recombinant lines were tested in vitro for their capability to form shoots in SIM and roots in RIM. Thus, 7 recombinant lines were selected and used to fine mapping the region where RG1 gene is located. CAPS and SCAR markers designed to S. pennellii were tested to fine-mapping, using as template genomic DNA samples from S. pennellii, S. peruvianum, Micro-MsK, MT, MT-Rg1, MT-wf and the 7 recombinant lines. These results confirmed that the molecular markers designed for S. pennellii can be successfully used for S. peruvianum. These analyzes also suggest that the introgressed segment of MT-Rg1 is located between the P5 marker and the CrtR-b gene. Within this region, there are 136 genes, including the GRAS 10 gene whichis the main candidate to RG1 gene function. In addition, we performed RNA-Seq analysis (SOLiD platform) to identify genes differentially expressed in MT and MT-Rg1. It was observed more down-regulated than up-regulated genes in the competence acquisition stage. Due to the large number of differentially expressed genes, some parameters were used for selection of genes that would have their expression validated by qRT-PCR in an in vitro regeneration test. Five genes among 361 genes differentialy expressed were selected to test their expression. Of these 5 genes, GRAS 10 and Serine / threonine protein phosphatase 7 were the most up-regulate genes and showed to be closely related to the stage of competence acquisition. Since there are many GRAS genes, we performed a phylogenetic analysis to identify homologous genes. Based on the phylogenetic analysis, GRAS 10 was identified as homologous to SCL8, a gene already identified in Arabidopsis. However, little is known about SCL8. Thus, it is still necessary to confirm the RG1 gene identity. This approach will provide a better understanding of competence acquisition process.
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Correlação entre mapas de produtividade de grãos e fotografias aéreas convencionais 35 mm / not available

Araújo, João Célio de 29 January 2001 (has links)
Nos países desenvolvidos a agricultura de precisão vem ganhando espaço como uma alternativa de otimização da produção agrícola. No Brasil está apenas iniciando e a participação da pesquisa neste momento é fundamental para a tomada de decisão a respeito do seu emprego e técnicas a serem utilizadas para tornar esta tecnologia viável e rentável para as condições do nosso país. Este trabalho visou avaliar o potencial do emprego de fotografias aéreas coloridas 35 mm para diagnósticos de lavouras na determinação de variabilidade espacial para tratamentos localizados. Foi realizado em duas áreas piloto de agricultura de precisão, monitoradas intensivamente. As áreas são: área 1 - fazenda Lagoa Velha, Campos Novos Paulista, SP - talhão de 22 ha; área 2 - área de produção do Campus da USP, Pirassununga, SP - talhão de 17,1 ha. Dentre os vários dados obtidos nas áreas, como produtividade de milho e soja, propriedades físicas e químicas do solo, pragas, doenças e plantas invasoras, foram obtidas também fotografias aéreas coloridas no formato 35 mm. As fotografias receberam orientação por bandeiras georreferenciadas em solo com GPS, para a correção geométrica da imagem e, após selecionadas, foram digitalizadas por meio de scanner. As imagens assim tratadas e os mapas de produtividade foram trabalhados com os softwares"SSToolbox","Idrisi"e"Excel", onde foram analisadas as correlações entre o valor digital das imagens e a produtividade. As correlações para todas as áreas e todos os períodos analisados apresentaram valores baixos, havendo baixa correspondência entre os valores digitais das imagens e as produtividades das culturas / not available
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Mapeamento geológico e estrutural das Suítes Graníticas e Charnockí­tica na região SW de Ubatuba (SP) / Geological and Structural mapping of the granite and charnockite suites from the SW region of Ubatuba (SP)

Pires, André de Sousa 21 December 2017 (has links)
Este trabalho foi desenvolvido na região sudoeste de Ubatuba (SP), com realização de mapeamento geológico, análise estrutural, petrografia, análises químicas de rocha total e geocronologia U-Pb SHRIMP. Na área de estudo foram caracterizados o Granito Caçandoca, Granito Pico do Papagaio, Suíte Charnockítica Ubatuba e Quartzo-monzonito Ilha Anchieta, em contato com rochas predominantemente ortoderivadas do Complexo Costeiro. A Suíte Charnockítica Ubatuba foi subdividida em duas unidades de mapeamento por predominância, os mangeritos e os leucogranitos, e o Complexo Costeiro em quatro unidades de mapeamento. A estruturação do Complexo Costeiro e Granito Pico do Papagaio é predominantemente ENE-WSW coerente com o padrão regional, com o predomínio de foliações desenvolvidas no estado sólido no primeiro, e de fluxo ígneo no segundo. A Suíte Charnockítica Ubatuba e o Quartzo-monzonito Ilha Anchieta, além de parte do Granito Caçandoca mostram uma estruturação mais variada, mostrando foliações predominantemente de fluxo ígneo variando de NW a NS e NE, sugerindo-se que estejam mais relacionadas à colocação desses corpos, sin-cinematicamente às zonas de cisalhamento regionais. As relações de contato e as assinaturas químicas das unidades sugerem a cogeneticidade entre leucogranitos e mangeritos da Suíte Ubatuba, indicando ambientes pós-colisionais ou tardi-orogênicos para todas as rochas graníticas e charnockíticas da área de estudo, com tendência intermediária entre intraplaca e arco vulcânico, além de caráter predominantemente metaluminoso e álcali-cálcico, com tendências peraluminosa e cálcio-alcalina das rochas mais diferenciadas. As idades concordantes U - Pb sugerem um período entre 599 e 557 Ma para a cristalização destas unidades com possível manutenção de altas temperaturas. / This study was carried out in the southwestern region of Ubatuba (SP), with geological mapping, structural analysis, petrography, whole rock geochemical analysis and U-Pb geochronology. In the studied area was identified the Caçandoca Granite, Pico do Papagaio Granite, Ubatuba Charnockite Suite and Ilha Anchieta Quartz-Monzonite, in contact with the Costeiro Complex orthoderivated rocks. The Ubatuba Charnockite Suite was divided in two mapping units, the mangerites and the leucogranites, following a predominance criterion, and the Costeiro Complex was subdivided in five mapping units. The structural trends of the Costeiro Complex and Pico do Papagaio Granite are mostly ENE consistent with the regional pattern, with the predominance of solid state foliations in the first and igneous flow foliations in the second. The Ubatuba Charnockite Suite, the Ilha Anchieta Quartz-Monzonite and part of the Caçandoca Granite show a more varied structural trend, with magmatic flow foliations ranging from NW to NS and NE, suggesting a relationship with the plutons emplacement but sinkinematic with the regional shear zones. The contact relationships and chemical signatures suggest that the mangerites and leucogranites are comagmatic. The chemical signatures suggest for all the granite and charnockite rocks a predominantly metaluminous and alkali-calcic, with peraluminous and calc-alkalic tendencies, in a post-collisional or late-orogenic environment with an intraplate to volcanic arc intermediary trend. The U-Pb concordant ages suggest 599 to 557 Ma range for the crystallization of these rocks with possible high temperatures maintenance.

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