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Identifica??o gen?tica e estudos populacionais utilizando microssat?lites (STR) em equinos, bovinos e caninos dom?sticos provenientes do Uruguai, Paraguai e Brasil

Gastaldo, Andr? Zoratto 21 March 2017 (has links)
Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-30T18:31:20Z No. of bitstreams: 1 TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf: 1361129 bytes, checksum: dbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-30T18:31:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf: 1361129 bytes, checksum: dbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-30T18:31:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_ANDRE_ZORATTO_GASTALDO_COMPLETO.pdf: 1361129 bytes, checksum: dbc7c8c4f5ab004118129ecf678044b8 (MD5) Previous issue date: 2017-03-21 / The evolution in human identification through the study of genetic markers STR (Short Tandem Repeats) induced and propitiated the growth also of animal genetic identification. However, contrary to what occurs in the human domain, animal molecular identification still lacks validation of analysis systems and population studies to be considered reliable to the degree required. Only recently the International Society for Animal Genetics (ISAG) has recommended STR markers suitable for individual discrimination in domestic animal species. Accurate animal genetic identification is sought to provide entities, associations, breeders and owners in general with assurances that their animals are in fact derived from reliable breeders. Only reliable and authentic genealogical records will ensure, for example, efficiency in genetic breeding processes. Even though it is a promising area, there are currently only two options in the market for commercial kits for animal genotyping. But its use has been deferred by specialized laboratories in the field, which end up preparing their own identification panels, using the recommended genetic markers to meet their local demands more specifically. However, if the frequencies of the alleles present in these genetic markers in the study population are not known and the real power of discrimination that they provide is not estimated, the analyzes performed and the results obtained may generate misleading or imprecise interpretations. In the present study, three panels of STR genetic markers were used with all loci recommended by ISAG, capable of identifying equine, bovine and canine individuals. Allelic frequencies and other parameters such as heterozygosity, polymorphism information content, power of exclusion and power of discrimination were obtained from significant samples in breeds present in Rio Grande do Sul (Southern Brazil), Uruguay and Paraguay, to be used in the practice of animal genetics for identification purposes. In addition, comparative population studies within and among breeds were also carried out, in order to evaluate the genetic diversity of the animal populations studied. / O avan?o da identifica??o molecular humana pelo estudo dos marcadores gen?ticos STR (Short Tandem Repeats) induziu e propiciou o crescimento tamb?m da identifica??o gen?tica animal. Contudo, ao contr?rio da ?rea humana, a identifica??o molecular animal ainda carece de valida??es dos sistemas de an?lise e de estudos populacionais para que seja considerada fidedigna no grau que se necessita. Apenas recentemente a ISAG (International Society for Animal Genetics) recomendou marcadores STR adequados para discrimina??o individual em esp?cies de animais dom?sticos. A identifica??o gen?tica animal exata e precisa ? buscada para fornecer, a entidades, associa??es, criadores e propriet?rios em geral, garantias de que seus animais s?o, de fato, oriundos de reprodutores confi?veis. Apenas registros geneal?gicos fidedignos e aut?nticos garantir?o, por exemplo, efici?ncia nos processos de melhoramento gen?tico. Mesmo sendo uma ?rea promissora, neste momento h? somente duas op??es no mercado de kits comerciais para genotipagem animal. Mas seu uso tem sido preterido por laborat?rios do ramo, os quais acabam preparando seus pr?prios pain?is (in house) de identifica??o, utilizando os marcadores gen?ticos recomendados para atender suas demandas locais de forma customizada. Contudo, se n?o forem conhecidas as frequ?ncias dos alelos presentes nestes marcadores gen?ticos na popula??o em estudo e n?o for estimado o real poder de discrimina??o que estes fornecem, as an?lises realizadas e os resultados obtidos poder?o gerar interpreta??es equivocadas ou imprecisas. No presente trabalho, foram utilizados tr?s pain?is de marcadores gen?ticos STR com todos os loci recomendados pela ISAG, capazes de identificar indiv?duos equinos, bovinos e caninos. Frequ?ncias al?licas e outros par?metros como heterozigosidade, conte?do de informa??o de polimorfismo, poder de exclus?o e de discrimina??o foram obtidos a partir de amostras significativas em ra?as presentes no Rio Grande do Sul/Brasil, no Uruguai e no Paraguai, para que sejam usados na pr?tica da gen?tica animal com fins de identifica??o. Al?m disso, estudos populacionais comparativos dentro e entre ra?as tamb?m foram realizados, com o intuito de avaliar a diversidade gen?tica das popula??es animais estudadas.
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Identificação molecular e análise filogenética de amostras de Cannabis apreendidas pela Polícia Civil do Estado do Espírito Santo

Gonçalves, Fernando Colnago 30 June 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8966_Dissertação_Fernando Colnago20150826-123156.pdf: 3408650 bytes, checksum: 8e6f48a8678d513330c4dbecc0a5c9bb (MD5) Previous issue date: 2015-06-30 / Popularmente conhecida como maconha, a Cannabis sativa é a mais usada de todas as drogas ilícitas e seu comércio, em conjunto com outras drogas, é uma das atividades criminosas que mais consomem recursos públicos e está intimamente associado aos homicídios. No Estado do Espírito Santo (ES), 70% dos homicídios tem relação com o tráfico de entorpecentes, apresentando atualmente o segundo maior índice dos país. A despeito da atuação policial, não existem estudos detalhados sobre plantio, distribuição e consumo de Cannabis no Brasil, de uma forma geral, sabe-se apenas que a maior parte da droga é produzida no Paraguai ou cultivada dentro do próprio país e acredita-se que o Paraguai seja responsável pelo abastecimento das regiões sul, sudeste e centro-oeste do Brasil. A identificação genética de Cannabis apreendidas pela Polícia Civil pode auxiliar na determinação geográfica de plantios e possíveis rotas do tráfico, informação essencial para a ação da polícia no combate ao tráfico de drogas. Com objetivo de caracterizar as amostras de Cannabis apreendidas pela Polícia Civil do ES e verificar correlações que pudessem indicar origens comuns, foram analisados 18 loci STR de 165 amostras oriundas de 71 dos 78 municípios do Estado. Foram encontrados 89 alelos, variando de 2 (loci A501 e 9269) a 12 alelos (locus A301). Os loci H06 e A305 apresentaram 3 alelos cada e o locus B05 apresentou 4 alelos, similar ao encontrado em amostras do Paraguai. Os dados alélicos dos loci A305, B05 e H06 sugerem que a região sudeste do Brasil pode estar sendo abastecida por Cannabis de origem Paraguaia. Também foi verificado que 4 alelos apareceram apenas nas amostras 176 e 230. A amostra 230 era proveniente de uma apreensão realizada na cidade de Aracruz, onde a Polícia verificou a ligação do proprietário com o tráfico internacional de entorpecentes, e demonstrou ser geneticamente mais próxima de amostras da Alemanha, sugerindo que sua matriz tem origem no exterior podendo, dentre outras possibilidades, ter chegado ao ES através do tráfico pela internet. Os resultados obtidos fornecem mais informações a respeito da maconha comercializada no Brasil, podendo ser utilizados em estudos futuros para elaboração de um banco de dados baseado em STR para aplicação forense / Popularly known as marijuana, Cannabis sativa is the most used of all illicit drugs and, with other drugs, its trade is one of the criminal activities that most consume public resources and is closely related to homicides. In the Espírito Santo State (ES), 70% of homicides is related to drug trafficking, currently presenting the second highest rate in the country. Despite the police action, there is no detailed studies of planting, distribution and Cannabis consumption in Brazil, in general, we only know that most drug is produced in Paraguay or grown within the country and it is believed that Paraguay is responsible for supplying the Brazil’s south, southeast and centerwest region. Genetic analysis of Cannabis seized by the police can assist in determining, geographically, plantations and possible routes of trafficking, essential information for police’s action in drug trafficking combat. In order to characterize the Cannabis samples seized by the police at ES and verify correlations that could indicate common origins, we analyzed 18 STR loci in 165 samples from 71 of 78 municipalities in the State. We have found 89 alleles ranging from 2 (A501 loci and 9269) to 12 alleles (A301 locus). The loci H06 and A305 presented each, 3 alleles and the locus B05, 4 alleles, similar to that found in Paraguayan samples. The allelic data of loci A305, B05 and H06 suggest that Brazil 's southeast region can be being supplied by Paraguayan Cannabis. We also found four alleles that appeared only in samples 176 and 230. Sample 230 was seized in Aracruz city, where the police found owner's connection with international trafficking, and demonstrated to be genetically nearest to German samples, suggesting a foreign origin what could be explained by internet trafficking. The obtained results provide more information about marijuana’s market in Brazil and could be used in future studies to develop a STR database for forensic application.
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Estimativa das frequências alélicas dos15 marcadores autossômicos STR CODIS da população goianiense do Brasil Central

Ferreira, Lindomar Valentim 13 May 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lindomar Valentin Ferreira.pdf: 1215853 bytes, checksum: 2cb0836a827c452d5ca06c97f0d59f35 (MD5) Previous issue date: 2011-05-13 / The population genetics aims to study the allelic and genotypic frequencies in populations and the mechanisms that these frequencies change over generations. This study aims to estimate and compare the allele frequencies of 15 autosomal STR markers, sheets of 501 tests the genetic link in 986 individuals in the population of Goiânia-Goiás. The markers that showed higher numbers of alleles were D18S51 and Penta E with 20 to 19. The marker that had allele frequency was higher for the TPOX 8 allele. Other statistical parameters analyzed demonstrated high PIC, PD and PE for the marker Penta E. Analysis of allele frequencies obtained in this study were statistically compared with populations of five regions of Brazil, by Student's t test, not intra-population differences were observed (p> 0.05). In this context, the genetic database based on the values of the allele frequencies of the population of Goiânia, can be used in testing the genetic link, as well as in studies of human identification, due to the similarities observed in other Brazilian populations. / A genética de populações visa o estudo das frequências alélicas e genotípicas em populações e os mecanismos capazes de mudar estas frequências ao longo das gerações. Essa pesquisa tem como objetivo estimar e comparar as frequências alélicas de 15 marcadores autossômicos STR, de 501 planilhas de exames de vínculo genético em 986 indivíduos da população de Goiânia-Goiás. Os marcadores que apresentaram maiores números de alelos foram o D18S51 com 20 e o Penta E com 19. O marcador que teve maior frequência alélica foi o TPOX para o alelo 8. Outros parâmetros estatísticos analisados caracterizaram elevados PIC, PD e PE para o marcador Penta E. As análises das frequências alélicas obtidas neste estudo foram comparadas estatisticamente com populações de cinco regiões brasileiras, pelo teste t Student, e não foram verificadas diferenças intra populacionais significativas (p>0,05). Neste contexto, o banco de dados genéticos baseado nos valores das frequências alélicas da população de Goiânia, pode ser utilizado em testes de vínculo genético, assim como em estudos de identificação humana, devido às semelhanças verificadas com outras populações brasileiras.

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