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Produtividade, estabilidade e adaptabilidade em progênies de eucalyptus urophylla s.t. blake

Pupin, Silvelise [UNESP] 25 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:35Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-25Bitstream added on 2014-11-10T11:58:16Z : No. of bitstreams: 1 000794025.pdf: 1017175 bytes, checksum: e7bc2664afedf811d52d39bdcd7fd841 (MD5) / A predição de ganhos genéticos em programas de melhoramento nem sempre é compatível com os observados na prática. Isso se deve principalmente à interação dos genótipos com os ambientes (G´A). O objetivo deste trabalho foi conhecer a variação genética, avaliar a significância da G´A e estudar simultaneamente a produtividade, estabilidade e adaptabilidade em cinco testes de progênies de Eucalyptus urophylla, localizados em Anhembi-SP, Itatinga-SP, Itamarandiba-MG, Uberaba-MG e Selvíria-MS. Os caracteres avaliados foram: altura de planta, diâmetro a altura do peito, volume de madeira e sobrevivência. Os parâmetros genéticos e componentes de variância foram obtidos pelo procedimento REML/BLUP e as metodologias MHPRVG (Média Harmônica da Performance Relativa dos Valores Genéticos) e AMMI (Additive Main effects and Multiplicative Interaction) foram utilizadas para estudo da produtividade, estabilidade e adaptabilidade. Os indivíduos apresentaram bom crescimento. Detectou-se variação genética para os caracteres e a interação G´A foi significativa. As metodologias permitiram identificar progênies produtivas, estáveis e adaptadas. Os parâmetros de MHVG, PRVG e MHPRVG foram eficientes como critérios para seleção de genótipos de E. urophylla e o modelo AMMI permitiu uma análise bastante visual do comportamento dos genótipos nos gráficos biplot’s / Prediction of genetic gains in breeding programs are not always compatible with those observed in practice and this is mainly due to the interaction of genotypes with environments (G´E). The aim of this study was to investigate the genetic variation, evaluate the significance of G´E and study the productivity , stability and adaptability simultaneously in five progeny trials of Eucalyptus urophylla, located at Anhembi-SP, Itatinga-SP, Itamarandiba-MG, Uberaba-MG and Selvíria-MS. The characters were: height, diameter at breast height, volume and survival. The genetic parameters and variance components were estimated by REML/BLUP procedure and methodologies HMRPGV (Harmonic Mean Relative Performance of Genetic Values) and AMMI (Additive Main effects and Multiplicative Interaction) were used to study the productivity, stability and adaptability. Individuals showed good growth. We detected genetic variation for characters and G´E interaction was significant. The methods allowed to identify productive, stable and adapted progenies. Parameters HMGV, RPGV and HMRPGV were efficient as standard for selection of genotypes of E. urophylla and the AMMI model allowed a very visual analysis of the behavior of genotypes in biplot’s graphics
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Caracterização de Híbridos Simples Experimentais de Milho (Zea Mays L.) /

Ferreira, Vitor Guerra. January 2015 (has links)
Orientador: João Antonio da Costa Andrade / Banca: Mario Luiz Teixeira da Moraes / Banca: Liliam Silvia Candido / Resumo: Sendo uma planta originária das Américas, o cultivo de milho ocorre em todo território brasileiro, sendo que na maioria das regiões é realizado em duas épocas: primeira safra ou safra de verão e segunda safra ou safrinha. Embora o rendimento médio de milho no Brasil ainda seja considerado baixo em comparação com diversos países, tecnologias como o desenvolvimento de cultivares híbridas proporcionou aos produtores uma evolução considerável de rendimento. Entretanto, para que os níveis de rendimento possam continuar evoluindo gradativamente, o processo de obtenção de novas cultivares é continuamente executado pelos melhoristas. No caso do milho, os híbridos simples estão avançando rapidamente sobre os demais tipos de híbridos (triplos e duplos), em reconhecimento ao seu alto potencial de rendimento em cultivos tecnificados. O objetivo deste estudo foi identificar no final do processo completo da formação de híbridos, aqueles mais promissores e com características agronômicas de um híbrido moderno, entre 36 híbridos simples provenientes de linhagens de origem braquítica e de porte mais elevado. Os híbridos experimentais e mais seis testemunhas, foram avaliados em blocos casualizados com quatro repetições, na fazenda experimental da UNESP em Selvíria-MS em quatro épocas: primeira safra 2012/13 (primeira época), segunda safra 2012/2013 (segunda época), primeira safra 2013/14 (terceira época) e segunda safra 2013/2014 (quarta época). Foram avaliados os caracteres dias para florescimento feminino, altura de plantas, altura de espigas, comprimento de espigas, diâmetro de espigas, prolificidade, acamamento mais quebramento e rendimento de grãos. Para os híbridos comuns em todas as épocas, foi realizada uma análise de estabilidade e adaptabilidade de rendimento, pelo método de Herberhart e Russel (1966). Com base nas análises individuais e de estabilidade e... / Abstract: Being a plant of the Americas, maize cultivation occurs throughout Brazil, and in most regions is carried out in two seasons: first crop or summer crop and second crop. Although the average of grain yield of maize in Brazil is still considered low, technologies such as the development of hybrid cultivars gave the producers a considerable increase of grain yield. However, so that grain yield can continue to evolve gradually, the process of obtaining new cultivars runs continuously by breeders. For maize, the single-cross hybrids are advancing rapidly over other types of hybrid (triple and double) in recognition of its high yield potential in technified crops. The objective of this study was to identify, at the end of the complete process of hybrids formation, those most promising and with agronomic characteristics of a modern hybrid, between 36 single-cross hybrids obtained from brachytic inbred lines and not brachytic inbred lines. The experimental hybrids and six checks were evaluated in a randomized block design with four replications, in Selvíria- MS in four seasons: 2012/13 first crop (season 1), 2012/2013 second crop (season 2), 2013/14 first crop (season 3) and 2013/2014 second crop (season 4). The evaluated traits were days to silking, plant height, ear height, ear length, ear diameter, prolificacy, lodged and broken plants and grain yield. For common hybrids in every season, an analysis of stability and adaptability for grain yield was carried out by the regression method of Heberhart and Rusell. Based on the individual and stability and adaptability analysis, there were identified the following hybrids with potential for evaluations in official testing for both first and second crop: IVF1-6/IVD1-3, 8F/9D, 8F/6D, IVF1- 5/IVD1-8, 5F/9D and 10F/9D. All showed good average for grain yield, stability and responded to the improvement of the environment, of which the first three are early. The ... / Mestre
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Herdabilidade em caracteres de crescimento de populações fragmentadas da espécie arbórea copaifera langsdorffii (fabaceae) /

Kubota, Thaisa Yuriko Kuboyama. January 2014 (has links)
Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Banca: Rinaldo Cesar de Paula / Resumo: O conhecimento sobre o potencial evolutivo das populações naturais é fundamental para garantir a sobrevivência das espécies. A estimativa da herdabilidade é necessária para analisar quanto da variação fenotípica de caracteres estão sobre controle genético. O objetivo desse estudo foi investigar o controle genético de caracteres de crescimento nas fases iniciais de desenvolvimento de populações fragmentadas de Copaifera langsdorffii, utilizando marcadores microssatélites. Para tanto, foram utilizadas duas populações de C. langsdorffii, uma localizada no parque municipal em São José do Rio Preto (SJRP) e uma na Estação Ecológica de Assis (EEA), ambas no Estado de São Paulo, Brasil. O modelo para estimar o coeficiente de herdabilidade consiste no método de regressão de uma medida de similaridade fenotípica e uma estimativa de parentesco entre pares de indivíduos, executado no programa Mark. Ambos coeficientes de parentesco e herdabilidade foram estimados para três classes de distância (10, 20 e 30 m) dentro das populações. As estimativas de herdabilidade foram baixas (máximo de 0,146) para todos os caracteres, variando entre valores positivos para os indivíduos regenerantes da população SJRP e entre negativos a positivos para os juvenis da população EEA. Em termos evolutivos, estes resultados indicam poucas chances de alterar a média populacional dos caracteres estudados pela seleção natural, sendo os efeitos ambientais aleatórios mais fortes para alterar esta média. Este resultado, associado à tendência observada de redução no coeficiente de herdabilidade para altura entre indivíduos regenerantes para indivíduos juvenis também indica que este controle genético reduz com o desenvolvimento das plantas, ou seja, a seleção natural em populações naturais é mais forte em fases iniciais de desenvolvimento das plantas. Em suma, os resultados sugerem que não existem diferenças nos níveis de ... / Abstract: The knowledge about the evolutionary potential of natural populations is critical to ensure the survival of the species. Heritability estimates are necessary to analyze how much of the phenotypic variation of traits are about genetic control. The aim of this study is to investigate the genetic control of growth traits in the initial phases of developing fragmented populations Copaifera langsdorffii, using microsatellite markers. Therefore, two populations of C. langsdorffii were used a municipal park located in São José do Rio Preto (SJRP) and at Assis Ecological Station (AES), both in the state of São Paulo, Brazil. The model to estimate the heritability coefficient is the method of regression of a measure of phenotypic similarity and an estimate of kinship between individuals, run the Mark programs. The coefficients of relatedness and heritability were estimated for three classes of distance (10, 20 and 30 m) within populations. Estimates of heritability were low (maximum 0.146) for all traits, ranging from positive values for regenerating individuals of the population SJRP and from negative to positive for the juvenile population AES. In evolutionary terms, these results indicate little chance of changing the population mean of the characters studied by natural selection, with the strongest environmental random effects to change this average. This result, coupled with the trend of reduction in the coefficient of heritability for height between regenerating juveniles individuals indicates also that the genetic control reduces the development of plants, in other words, natural selection in natural populations is stronger in the early stages of plant development. In short, the results suggest that there are no differences in the levels of heritability between the two populations and that the heritability for growth traits is low in both populations / Mestre
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Expressão de genes relacionados à qualidade da carne do músculo longissimus dorsi em Nelore (Bos indicus) e canchim (5/8 Bos taurus x 3/8 Bos indicus) /

Giusti, Juliana. January 2011 (has links)
Resumo: Todas as características de um organismo vivo são controladas pela expressão de genes específicos, e na qualidade da carne não é diferente. O presente estudo teve como objetivo correlacionar a expressão dos genes μ-Calpaína (CALP 1), m-Calpaína (CALP 2), Calpastatina (CAST), Tireoglobulina (TG), Diacilglicerol aciltransferase 1 (DGAT1) e a Leptina (LEP) com a qualidade da carne do Longissimus dorsi em dois grupos genéticos: Nelore (Bos indicus) e Canchim (5/8 de Bos taurus x 3/8 Bos indicus) em dois períodos (carne não maturada e com sete dias de maturação), e utilizá-la como marcador genético. Foram analisados 30 touros jovens, 15 Nelore e 15 Canchim, todos mantidos nas instalações do confinamento experimental da FMVZ-UNESP Botucatu, recebendo a mesma dieta e mesmo manejo. Alcançando peso de 370 kg e espessura de gordura de cobertura de 4 mm, foram abatidos e amostras do músculo Longissimus dorsi foram coletadas para análises de: lipídeos totais (LT), força de cisalhamento (FC), índice de fragmentação miofibrilar (MFI) e análise da expressão gênica por RT-qPCR. Entre as características de qualidade da carne, LT e MFI0 apresentaram diferença entre as raças (P<0,01), sendo MFI0 superior no Canchim e LT no Nelore. Quanto à expressão gênica, as CALPs não mostraram expressão diferencial entre os grupos (P>0,05), assim como DGAT1, TG e LEP. CAST foi mais expresso na raça Nelore (P<0,05). Quanto às correlações, foi observada apenas uma positiva entre DGAT1 e MFI0 (r=0,79, P<0,01) no Canchim. Diante dos resultados, sugere-se que a maior expressão de CAST no Nelore propiciou aos animais uma carne mais dura, quando comparados ao Canchim, e que a expressão gênica não pode ser usada como um marcador genético / Abstract: All the features of a living organism are controlled by the expression of specific genes, and the quality of the meat is no different. The present study was performed to correlate gene expression μ-calpain (CALP 1), m-calpain (CALP 2), calpastatin (CAST), thyroglobulin (TG), Diacylglycerol acyltransferase 1 (DGTA1) and leptin (LEP) with the meat quality of Longissimus dorsi muscle in two genetic groups: Nellore (Bos indicus) and Canchim (5/8 Bos taurus x 3/8 Bos indicus) in two periods, and use it as a genetic marker. We analyzed 30 young bulls, 15 and 15 Canchim Nellore. The animals were kept on the installation of the experimental confinement FMVZ-UNESP-Botucatu, receiving the same diet and management. When reached a weight of approximately 370 kg and a subcutaneous fat thickness of 4 mm, they were slaughtered and samples of the Longissimus dorsi muscle were collected for analysis of the: total lipids (TL), shear force (SF), myofibrillar fragmentation index (MFI) and analysis of gene expression by RT-qPCR. Among the characteristics of meat quality, LT and MFI0 showed differences between breeds (P<0,01), higher MFI0 in Canchim and LT higher in Nellore. Regarding gene expression, the CALPs showed no differential expression between groups (P>0.05), as well as DGAT1, TG, and LEP. CAST was more expressed in Nellore (P<0.05). Regarding the correlation was only observed a positive relationship between DGAT1 and MFI0 (r = 0.79, P <0.01) in Canchim. Considering the results, it is suggested that the increased expression of CAST in Nellore animals led to a tougher meat compared to Canchim, and that gene expression can not be used as a genetic marker / Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Coorientador: Maeli Dal Pai Silva / Banca: Simone Cristina Méo Niciura / Banca: Luiz Arthur de Loyola Chardulo / Mestre
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Potencial de linhagens experimentais de milho, oriundas de populações braquíticas, para produção de híbridos

Saito, Belisa Cristina [UNESP] 20 February 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-20Bitstream added on 2014-06-13T19:39:03Z : No. of bitstreams: 1 saito_bc_me_ilha.pdf: 507256 bytes, checksum: ea6f9059923c5803b9f14edcbbfe28c7 (MD5) / Muitos estudos para a escolha dos melhores genitores para a confecção de híbridos têm sido desenvolvidos, destacando-se o método dos cruzamentos dialélicos. Neste método, é possível avaliar as linhagens quanto a capacidades geral (CGC) e específica (CEC) de combinação. A CGC está relacionada ao comportamento médio da linhagem em combinações híbridas, principalmente devido aos efeitos aditivos dos genes; enquanto a CEC como o comportamento que leva certas combinações a serem superiores ou inferiores em relação à média dos cruzamentos, pela ação de genes dominantes ou de efeitos epístáticos. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi indicar linhagens com boa capacidade de combinação para confecção de híbridos simples e fazer a predição de híbridos triplos e duplos, adaptados a alta população de plantas, com o uso de dialelo parcial, a partir de seis linhagens braquíticas oriundas da população Isanão-VF1 e sete linhagens braquíticas oriundas da população Isanão- VD1. Para isso foi utilizado um dialelo parcial 6x7, avaliando-se os híbridos em safra normal e segunda safra, na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Unesp – Câmpus de Ilha Solteira. Os experimentos foram instalados em blocos casualisados em sistema de semeadura direta, com população de 80.000 plantas ha-1. Houve interação significativa entre CGC e safras, para rendimento de grãos (RG), apenas para as linhagens do Isanão-VD1, enquanto os caracteres altura de plantas (AP), altura de espigas (AE) e acamamento mais quebramento (ACQ) tiveram interação significativa para ambos os grupos de linhagens. Quanto à CGC cinco e seis linhagens destacaram-se, respectivamente para primeira e segunda safras, participando da maioria dos melhores híbridos. Considerando a CGC e CEC para maior RG, maior precocidade, menor AP e AE, foi possível... / Many studies to choose the best parents for making hybrids have been developed, specially the method of diallel crosses. This method allows the evaluation of lines for the effects known as general combining ability (GCA) and specific combining ability (SCA). The GCA is related to the average performance of lines in hybrid combinations and is due to the additive effects of genes; the SCA is the effect related to specific crosses and is attributed to non additive (dominance and epistasis) gene effects. In this sense, the objective of this study was the identification of parents (maize inbred lines) with high combining ability aiming at the development of outstanding hybrids. For this purpose, thirteen brachytic inbred lines of two populations (six from Isanão VF-1 and seven from Isanão VD-1) were crossed following the partial diallel (6 x 7) scheme. Crosses were evaluated in two crop seasons (regular crop and second crop) in the research station (Fazenda de Ensino e Pesquisa) of UNESP - Campus Ilha Solteira. The experiments were designed as randomized blocks under a population density of 80 M plants ha-1 with three replications. The interaction GCA x season was significant for yield only for lines of Isanão VD-1, while for the traits plant height, ear height and lodging the interaction GCA x season was significant for both groups of lines. For GCA, five and six outstanding lines were identified for the first and second crop season, respectively, for their participation in the best hybrids. When considering GCA and SCA for yield, earliness and small plant and ear height, it was possible to identify promising hybrids for the two seasons. The highest estimates of CGA effects indicated the highest predicted means for double and three-way crosses. The lines with... (Complete abstract click electronic access below)
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Análise genética de características de crescimento do Colossoma macropomum e identificação de novos promotores de crescimento muscular utilizando como espécie modelo Oncorhynchus mykiss

Mello, Fernanda de January 2014 (has links)
Resumo não disponível
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Parâmetros genéticos para características lineares de tipo e produtivas em vacas da raça holandesa no Brasil / Genetic parameters for linear type and yield traits in holstein cows in brazil

Campos, Rafael Viegas January 2012 (has links)
O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos e fenotípicos para 21 características lineares de tipo bem como a pontuação final e as características de produção de leite (PL), gordura (PG) e proteína (PP) em rebanhos de bovinos leiteiros da raça holandesa no Brasil. Os 18,5 mil registros utilizados neste estudo foram coletados por técnicos da Associação Brasileira de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa entre os anos 1994 e 2004. As estimativas dos componentes de (co)variância e dos parâmetros genéticos e fenotípicos das características foram realizadas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivações por meio de modelos animal multicaráter. O processamento das análises com 22 características avaliadas simultaneamente foi realizado no Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho, São Paulo, através do ambiente operacional SGI Altix – 1350. As estimativas de herdabilidade para as características lineares de tipo variaram de 0,09 e 0,39 e para as PL, PG e PP variaram entre 0,17 e 0,24 indicando haver variabilidade genética aditiva suficiente para que ganhos genéticos moderados possam ser obtidos por seleção. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada, entretanto, as correlações genéticas variaram entre -0,44 e 0,85. As estimativas de correlações genéticas entre as características lineares de tipo com as características produtivas (PL, PG e PP) foram em geral de baixa magnitude. O antagonismo genético indesejável entre algumas características de tipo e produtivas deverá ser levado em consideração no momento da seleção, uma vez que a seleção para características produtivas pode levar à deteriorização de algumas características conformacionais. Quando o objetivo de seleção for melhorar as características lineares de tipo, a pontuação final poderá ser utilizada como critério de seleção por estar correlacionada geneticamente e de forma moderada com a maioria das características Entretanto, ao selecionar as vacas de maior pontuação final não se deve esperar aumento significativo no volume de PL, PG e PP, sendo a utilização de índices de seleção uma ferramenta indicada para o processo de seleção genética dos animais. / The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic parameters for 21 linear type traits over the final score and milk yield traits (MY), fat (FY) and protein (PP) in herds of Holstein dairy cattle in Brazil. The 18,500 records used in this study were collected by staff of the Brazilian Association of Cattle Breeders of Holstein between 1994 and 2004. Estimates of (co)variance and genetic and phenotypic parameters were determined by the method of maximum likelihood derivative-free restricted through multiple trait animal models. The analyses were processed in Sao Paulo through the operating environment SGI Altix - 1350 provided by the National Center for High Performance. The heritability estimates between linear type traits ranged between 0.09 and 0.39 and between PL, PG and PP between 0.17 and 0.24 indicating there sufficient genetic variability to obtain moderate genetic gains by selection. The phenotypic correlations between linear type traits were generally positive and of moderate magnitude, however, genetic correlations varied widely between -0.44 and 0.85 indicating that some could be excluded from the classification linear system currently adopted by the ABCBRH. Estimates of genetic correlations between linear type traits and yield traits (PL, PG and PP) were generally of low magnitude. The genetic antagonism between some type traits and yield should be taken into account at the time of selection, since, in many Brazilian herd, less productive cows are discarded. When the goal is to improve the selection of linear type traits the final score can be used as a selection tool to be genetically and correlated moderately with the most features, however, when the selection criterion is not the final score expect significant improvements in the characteristics of PL, PG and PP, with the use of selection indices indicated a tool for the process of genetic selection of animals.
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Melhoramento genético por meio de hibridizações interespecíficas no grupo plicatula - gênero Paspalum / Genetic improvement through interspecific hybridizations in Group Plcatula – Genus Paspalum

Pereira, Emerson André January 2013 (has links)
O êxito na seleção de plantas geneticamente superiores está diretamente relacionado à existência de variabilidade genética apresentada naturalmente ou artificialmente. No entanto, o melhoramento de espécies apomíticas é dificultado pela impossibilidade de ocorrer a união de gametas com plantas deste modo de reprodução. Por outro lado, a utilização de plantas sexuais compatíveis a cruzamentos com plantas apomíticas, podem gerar novas combinações gênicas e indivíduos com alta heterose podem ser selecionados já na primeira geração para lançamento como novas cultivares. A descoberta de plantas diplóides sexuais em populações naturais de Paspalum plicatulum e a posterior duplicação das mesmas possibilitaram um grande universo no desenvolvimento de novos genótipos a partir de cruzamentos entre espécies relacionadas. O objetivo do trabalho foi de: (i) avaliar a produção de forragem de genótipos nativos superiores de espécies do gênero Paspalum; (ii) caracterizar a estabilidade e adaptabilidade de produção destes genótipos; (iii) estimar através de técnicas da genética quantitativa, a herdabilidade e a associação entre caracteres de importância forrageira; (iv) obter variabilidade genética por meio de hibridizações interespecíficas, utilizando genótipos superiores nativos de P. lepton e de P. guenoarum como genitores masculinos (apomíticos) e um genótipo de P. plicatulum como genitor feminino (sexual); (v) analisar as progênies superiores quanto ao modo de reprodução selecionando plantas estáveis reprodutivamente para lançamento como cultivares e as de reprodução sexual para novos cruzamentos. Os genótipos das espécies de P. lepton e P. guenoarum apresentam variabilidade genética em caracteres de interesse forrageiro, bem como desempenho variável de acordo com o local e o ano de cultivo. A produção de matéria seca total e de folhas são os caracteres que mais contribuem para a detecção da variabilidade genética observada, independentemente do ano de avaliação. O ganho genético na produção de folhas se mostra eficiente via seleção indireta pela matéria seca total, caráter de alta herdabilidade e de mais fácil seleção e aferição. Houve ampla variabilidade nos caracteres ligados a produção de forragem e alguns híbridos apresentaram heterose para a maioria dos caracteres analisados. A maioria das progênies selecionadas apresentaram a apomixia como modo de reprodução, o que potencializa o lançamento como cultivar. Já as plantas sexuais superiores serão usadas para recombinação com os melhores híbridos para obtenção de novas constituições genéticas. Os dendrogramas obtidos em nível de campo e de DNA foram capazes de discriminar os genótipos e podem auxiliar na orientação em novas hibridizações com plantas sexuais compatíveis. Houve pouca variabilidade na composição química entre os genótipos. Mais estudos deverão ser realizados para viabilizar o desenvolvimento de cultivares no uso em pastagens naturais, assim como no emprego como pastagens cultivadas. / The successful selection of genetically superior plants is directly related to the existence of natural or artificial genetic variability. However, the breeding of apomictic species is hampered by the inability of the union of gametes with plants of this mode of reproduction. In another hand, the use of sexual plants compatible to crosses with apomictic plants can generate new genetic combinations, and individuals with high heterosis can be selected on the first generation and releasae as new cultivars. The discovery of sexual diploid plants in natural populations of Paspalum plicatulum and their subsequent duplication to do possible the development of new genotypes from crosses between closely related species. Thus, this study aimed to: (i) evaluate the forage yield of superior genotypes of native species of Paspalum, (ii) characterize the stability and adaptability of production of these genotypes; (iii) estimate using techniques of quantitative genetics, the heritability and its association between important forage characters; (iv) get a genetic variability through interspecific hybridization, using superior genotypes of native P. lepton and P. guenoarum as male parents (apomictic) and one genotype of P. plicatulum as female parent (sexual); (v) analyze the superior progenies to reproduction, selecting plants reproductively stable for releasing as cultivars and, of sexual reproduction for new crossings. The genotypes of the species P. lepton and P. guenoarum take a genetic variation in their traits of interest forage; furthermore, their performance depend of location and year of cultivation. The total dry matter production and leaf are the traits that most contribute to the detection of genetic variability, independent of the year of evaluation. The genetic gain in leaf production is efficient to indirect selection for total dry matter; this character present high heritability and, easier selection and estimation. There was wide variability in characters linked to forage production and some hybrids showed heterosis for most traits analyzed. Moreover, most of the selected progenies showed apomixis as reproductive mode, which enhances the release as cultivar. The sexual plants should be used for recombination with the best hybrids to get new genetic constitutions. The dendrograms obtained through field and DNA characteristics were able to discriminate genotypes and could help to get new sexual hybridizations with compatible plants. A little variability in chemical composition between genotypes was observed. Thus, more studies should be conducted to enable the development of cultivars to use on native rangelands, even as the employment as pastures.
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Modelo bioeconômico e índices de seleção em bovinos da raça Aberdeen Angus / Bioeconomic model and selection indices in aberdeen angus beef cattle

Campos, Gabriel Soares January 2013 (has links)
Foi desenvolvido um modelo bioeconômico para calcular valores econômicos para caracteres dos objetivos de seleção em sistemas de produção de ciclo completo e propor índices de seleção econômicos com base nos critérios de seleção utilizado no programa de melhoramento da raça Aberdeen Angus no estado do Rio Grande do Sul. As informações de parâmetros biológicos e econômicos utilizados nos cálculos são provenientes das propriedades, de outros estudos e do programa de melhoramento da raça - PROMEBO. Foram usadas planilhas Excel para o desenvolvimento do modelo. Os valores econômicos foram estimados para os objetivos de seleção de sistemas de produção de ciclo completo, sendo estes o número de bezerros desmamados (NBD) e peso ao abate (PA). Para avaliar o impacto das mudanças no desempenho dos caracteres sobre o lucro total do sistema de produção, os valores iniciais dos caracteres foram aumentados em 1%. Os caracteres são expressos em reais por unidade de mudança no caráter e foram calculados na base vaca/ano. Os valores econômicos para NBD e PA foram respectivamente R$ 6,65 e R$ 1,43. A partir das matrizes de (co)variância genética entre os objetivos e os critérios de seleção foram calculados ponderadores econômicos para os critérios de seleção utilizados no PROMEBO, estes são os seguintes: peso (P) a desmama (D) e ao sobreano (S), conformação (C), precocidade (G) e musculatura (M) a desmama e ao sobreano e perímetro escrotal (PE). Os ponderadores econômicos para PD, CD, GD e MS foram positivos e variarem de 2,61 a 0,62 reais. Para PS, CS, GS, MS e PE os ponderadores variaram de 1,40 a 0,004 reais. O índice de seleção a desmama alocaria 44,77% de ênfase para PD, 14,24% para CD, 30,36% para GD e 10,63% para MD. O índice de sobreano daria ênfase de 77,61% para PS, 4,99% para CS, 11,09% para GS, 6,10% para MD e 0,22% para PE. O caráter que mais impactou economicamente o sistema de produção de ciclo completo usando pastagem foi o reprodutivo, NBD, já o PA teve importância econômica positiva no sistema de produção, indicando que a seleção para esses caracteres aumentará a lucratividade do sistema. Os ponderadores econômicos para os caracteres ponderais e escores visuais de C, P e M e PE foram positivos indicando que esses caracteres podem ser usados na seleção dos animais que irão contribuir para incrementar a lucratividade do sistema de produção. / We developed a bio-economic model to estimate economic values for traits of breeding goals in production systems and propose full cycle economic selection indexes based on the criteria selection used in the breeding program Aberdeen Angus breed in the state of Rio Grande do Sul. Biological and economics information parameters used in the calculations are derived from the properties of other studies and the breeding program of the breed - PROMEBO. Excel spreadsheets were used for model development. Economic values were estimated for the purposes of selection of complete cycle systems production, the number of weaned calves (NCW) and slaughter weight (SW). In order to assess the impact of changes in the performance of the characters on the overall profitability of the production system, the initial values of the characters were increased by 1%. The characters are expressed in Real(R$) per unit change in character, and were based on cow / year. The economic values for NCW and SW were respectively R$ 6,65 and R$ 1,43. From the matrix of (co)variance components, between the objectives and the criteria of selection, we have calculated economic weights for selection criteria used in PROMEBO as the following: weight (W) weaning (W) and yearling (Y), conformation (C), precocity (P) and muscle (M) and weaning and yearling scrotal circumference (SC). The economic weights for WW, CW, PW and MW were positive and ranged from 2,61 to 0,62 reais. PY, CY, GY, MY and SC the weight ranged from 1,40 to 0,004 reais. The weaning selection index allocates 44.77% of emphasis for PW, 14.24% for CW, 30.36% to 10.63% for GW and MW. The index for yearling give emphasis 77.61% for PY, 4.99% for CY, 11.09% for GY, 6.10% to 0.22% for MY and SC. The character that most impacted economically production system complete cycle using grazing was the reproductive NCW. The SW had positive economic importance in the production system, indicating that selection for these characters increase the profitability of the system. The economic weights for traits and visual scores by weight for C, P and M and SC were positive, indicating that these characters can be used in the selection of animals that will contribute to increase the profitability of the production system.
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Diversidade genética e acurácia da informação genômica em bovinos de corte / Genetic diversity and accuracy of genomic information in beef cattle

Brito, Fernanda Varnieri January 2011 (has links)
Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.

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