Resumo: Baseado nas informações geradas após o seqüenciamento do genoma, foi desenvolvido uma série de meios de cultura de composição definida (XDM1, XDM2, XDM3, XDM4 e XDM5). Portanto, um dos objetivos do presente trabalho foi estabelecer a curva de crescimento da X. fastidiosa no meio definido XDM2. Foi utilizada a estirpe 9a5c de X. fastidiosa mantida nesse mesmo meio de cultura. A medida da taxa de crescimento bacteriano foi realizada através de leituras de densidade óptica durante dezesseis dias com intervalos de 48 horas. A avaliação da viabilidade celular foi realizada através da contagem de unidade formadora de colônia (UFC) por diluição seriada. As duas avaliações apresentaram uma alta correlação (R2= 0,91) verificada através de regressão exponencial. O início da fase estacionária foi obtido após 10 dias de crescimento. De posse dos dados de UFC, foi possível calcular o tempo de geração da X. fastidiosa no meio XDM2, de aproximadamente 21 horas. Comparando o tempo de geração obtido na curva de crescimento em meio PW (11,37h), foi comprovado que a bactéria apresenta um crescimento mais rápido em meio PW do que no meio definido XDM2. Outro aspecto interessante revelado no estudo do genoma funcional da X. fastidiosa está relacionado à expressão de genes associados à patogenicidade. O principal mecanismo de patogenicidade é a formação de biofilme no xilema da planta hospedeira conduzindo ao bloqueio dos vasos do xilema. Análise da expressão diferencial de genes desse fitopatógeno em condição de virulência e durante a formação do biofilme revela padrões de genes associados à adaptação e competitividade no ambiente do hospedeiro. Esses genes possivelmente são ativados no biofilme maduro e são essenciais para sua manutenção na planta. Além disso, sabe-se que bactérias que formam biofilme apresentam resistência crescente a compostos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Based on informations generated after the genome sequencing, a series of culture media of defined composition were developed (XDM1, XDM2, XDM3, XDM4 e XDM5). Therefore, one of the objectives of the present work was to establish the growth curve of X. fastidiosa in the defined medium XDM2. For this, we utilized the 9a5c strain of X. fastidiosa maintained in this medium. The measurement of the bacterial growth rate was done by optical density analysis during sixteen days with intervals of 48 hours. The evaluation of cellular viability was carried out counting the colony units forming (CFU) by serial dilution. Both evaluations presented a high correlation (R2 = 0,91) verified by exponential regression. The beginning of the stationary phase was observed after ten days of growth. With the data of CFU, it was possible to calculate the generation time of X. fastidiosa in XDM2 medium, estimated to be of approximated 21 hours. Comparing the generation time obtained for the growth curve in PW medium (11,37 hours), we proved that the bacteria grow faster in PW compared with the defined medium XDM2. Another interesting aspect reveled by the study of functional genome of X. fastidiosa is related to the expression of genes associated with pathogenicity. The main mechanism of its pathogenicity is the formation of a biofilm in the xylem of the host plant, causing the blockage of the xylem vessels. Analysis of the differential expression of genes of this phytophatogen in condition of virulence and during the biofilm formation reveals standards associated to adaptation and competition in the host environment. These genes are possibly activated in the mature biofilm and are essential for its maintenance in the plant. Besides, it is known that bacteria that form biofilm present elevated resistance to antimicrobial compounds while biofilm is structured, like antibiotics, heavy metals... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Marcos Antonio Machado / Coorientador: Alessandra Alves de Souza / Banca: Ivan Maia de Godoy / Banca: Henrique Ferreira / Mestre

Orientador: Rondinelli Donizetti Herculano / Banca: Marco Andrey Cipriani Frade / Banca: Aldo Eloizo Job / Resumo: A biomembrana de látex da seringueira (Hevea brasiliensis) tem sido utilizada como curativo para úlceras cutâneas e os estudos de sua utilização como sistema de liberação prolongada para carrear compostos bioativos capazes de acelerar e estimular o processo de cicatrização tecidual estão em ascendência. A cicatrização lenta caracteriza a cronicidade da lesão e se dá na ocorrência da ausência ou insuficiência do fechamento da ferida, excedendo o período fisiológico da cicatrização de 2 a 3 semanas. As razões para esta alteração são os distúrbios locais ou sistêmicos (DEALEY, 2008). O objetivo deste estudo foi avaliar a eficácia e segurança do tratamento das úlceras crônicas com a utilização da biomembrana de látex natural da seringueira Hevea brasiliensis incorporada com extrato de Stryphnodendron barbatimam Mart (barbatimão). Foram selecionados 45 pacientes com úlceras crônicas de diferentes etiologias com idade entre 35 e 90 anos, cadastrados no Sistema Único de Saúde (SUS) e em sua respectiva unidade de atendimento. Estes sujeitos foram divididos em três grupos de 15 indivíduos cada e foram tratados por um período mínimo de 30 dias que se iniciou em abril de 2014, sendo apresentados como: grupo teste G1- Biomembrana de látex natural incorporada com extrato de barbatimão, tendo ocorrido 1 exclusão; grupo controle G2- Biomembrana de látex natural, tendo ocorrido 7 exclusões; e grupo controle G3- extrato de barbatimão, tendo ocorrido 10 exclusões. Além dos curativos, foram realizadas coleta de amostras para semeadura em meios seletivos, demonstrando que mesmo com a presença de microrganismos não houve interferência na cicatrização. Os curativos realizados com biomembrana incorporada apresentaram melhores resultados na cicatrização, além de controle e até redução da colonização microrgânica ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Latex biomembrane derived from the (Hevea brasiliensis) rubber tree has been used as dressing for cutaneous ulcers and studies on its utilization as an extended liberation system to carry bioactive compounds capable of accelerating and activating the process of tissue wound healing, are increasingly being undertaken. The slow healing features the chronicity of the wound and it occurs in the wound closure absence or failure, exceeding the physiological healing period of 2 to 3 weeks. The reasons for such change are local and systemic disorders. This study was carried out to assess the effectiveness and safety of chronic ulcer treatment by using the natural latex biomembrane derived from the Hevea brasiliensis rubber tree incorporated with the Stryphnodendron barbatimam Mart (barbatimão) extract. In the research 45 patients were selected, they were suffering from chronic ulcers of different etiologies, age between 35 and 90, registered in the National Health System (SUS) and under the care of their respective health care unit. Those subjects were divided into three groups comprising 15 patients each who were treated along a minimum period of 30 days which began in April 2014, and they were characterized as G1 test group- natural latex biomembrane combined with barbatimão extract, with 1 exclusion; G2- natural latex biomenbrane, with 7 exclusions; and G3- barbatimão extract, with 10 exclusions. Besides the dressings, sample collections were carried out for sowing in selective environments, showing that despite the presence of microorganisms there was no interference in wound healing. The dressings made from combined biomembrane yielded better results not only in wound healing, but also in controlling and reducing microorganism colonies, in comparison with the other control groups. The results found surely provide subsidies for future ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Luis Henrique Zanini Branco / Banca: Marli de Fátima Fiore / Banca: Célia Leite Sant'Anna / Resumo: As Cyanobacteria são dominantes em diversos tipos de ambientes, são especialmente bem distribuídas e abundantes em ambientes terrestres e possuem importante função ecológica no ecossistema. Em ambientes aerofíticos, atuam como colonizadores primários e na economia na produção de compostos de interesse industrial como auxinas, antivirais, antifúngicos, antibacterianos, biofertilizantes, entre outros. Atualmente, para o estudo de cianobactérias tornou-se importante o cultivo laboratorial para que se consiga biomassa e controle de contaminantes. Porém, são escassos os trabalhos sobre o cultivo, em particular das Nostocales com ramificações verdadeiras, e vários dos poucos existentes relatam tentativas frustradas na obtenção de cultivos específicos demonstrando a forte resistência destes organismos ao crescimento em condições laboratoriais. Os resultados presentemente obtidos indicaram que in vitro as Nostocales com ramificações verdadeiras seguem as mesmas características de crescimento quando em hábitat natural: crescimento lento, baixa taxa de colonização e competição. Dentre as variações testadas, a diluição de 2:1 (tanto líquido quanto sólido) foi considerada a melhor concentração do meio de cultivo e a agitação em shaker resultou em melhorias para o crescimento. A realização ou não de repicagens não foi suficiente para o estabelecimento de coleções, pois estes organismos não resistem a muitos meses sob condições de cultura. O teste de antibióticos para o controle de contaminantes mostrou-se ineficiente e, portanto, não foi possível estabelecer quantidade segura para o seu emprego. As pesquisas em relação ao cultivo destes organismos são ainda muito escassas. Neste estudo pôdese indicar um conjunto de condições de crescimento mais favoráveis para estes organismos, mas para um melhor estabelecimento das condições ainda são necessários estudos mais abrangentes e aprofundados. / Mestre

Orientador: Fernando Carlos Pagnocca / Banca: Sandra Regina Ceccato Antonini / Banca: Vanderlei Geraldo Martins / Resumo: Polybia ignobilis é uma vespa social que apresenta uma alimentação variável e inespecífica, consumindo outros insetos, pedaços de animais mortos, néctar, polpa de madeira e água. Dentro do ninho ocorre a trofalaxia, onde o alimento é distribuído entre os indivíduos da colônia através de secreção labial, podendo ocorrer entre adulto e larva ou apenas entre adultos, propiciando a dispersão de micro-organismos. A associação entre leveduras e insetos pode ser considerada transitória, onde os insetos podem atuar como vetores na dispersão desses micro-organismos sem benefício nutricional; por outro lado, também pode ser considerada como uma associação benéfica, onde o inseto utiliza as leveduras como complemento alimentar. O presente estudo teve como objetivos: caracterizar a comunidade de leveduras associadas à P. ignobilis; verificar se há relação entre a distribuição das leveduras nas diferentes castas da vespa e contribuir com a formação de um banco temático de leveduras isoladas de insetos sociais. Indivíduos do ninho de P. ignobilis e amostras de mel foram coletados no campus da UNESP - Rio Claro. O isolamento e identificação das estirpes foi feita de acordo com a metodologia clássica descrita em YARROW (1998). Foram isoladas 167 estirpes, sendo 59 do primeiro ninho e 108 do segundo. Após uma seleção baseada em análises morfológicas, bioquímicas e perfil de bandas de microsatélites (MSP-PCR) estirpes representativas de cada grupo, bem como as estirpes únicas foram identificadas pelo sequênciamento da região D1/D2 do rDNA 26S. Os resultados revelaram a prevalência no primeiro ninho dos gêneros Candida, Cryptococcus, Hanseniaspora e Rhodotorula, compreendendo 45% do total das estirpes, sendo as espécies mais freqüentes Candida azyma, Candida chrysomelidarum, Cryptococcus liquefaciens e Rhodotorula mucilaginosa. No segundo ninho, as espécies... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Polybia ignobilis is a social wasp that features a variable and unspecific alimentation, eats other insects, bits of dead animals, nectar, wood pulp and water. Inside the nest occurs trofalaxis, where food is distributed among individuals of the colony through labial secretion, it can occur between adult and larva or adults only, being vectors in the dispersion of microorganisms. The association between yeasts and insects can be considered temporary, where the insects serve as vectors in the dispersal of these micro-organisms without nutritional benefit; on the other hand, can also be regarded as a beneficial association, where the insect uses the yeasts as a food supplement. This present study aimed to characterize the yeast community associated with P. ignobilis; verify whether exists a relation between the distribution of yeasts in different varieties of wasp and contribute to the formation of a thematic database of yeasts isolated from social insects. Individuals from the nest of P. ignobilis and honey samples were collected on the campus of UNESP - Rio Claro. The isolation and identification of strains was made according to classical methodology described in YARROW (1998). We isolated 167 strains, 59 and 108 of the first and second nest. After a selection based on morphological, biochemical and microsatellite band profiles (MSP-PCR) representative strains of each group as well as unique strains were identified by sequencing the D1/D2 region of 26S rDNA. The results revealed the prevalence in the first nest of Candida, Cryptococcus, Hanseniaspora and Rhodotorula, comprising 45% of all strains, being the most frequent species Candida azyma, Candida chrysomelidarum, Cryptococcus liquefaciens and Rhodotorula mucilaginosa. In the second nest of the species that prevailed were Aureobasidium pullulans, Meyerozyma guillermondii. Some strains may constitute new... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-17T12:13:37Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1732607 bytes, checksum: 17fd4bd61d72d0dd64ab43b1b834f386 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T12:13:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1732607 bytes, checksum: 17fd4bd61d72d0dd64ab43b1b834f386 (MD5) Previous issue date: 2012-09-25 / O eucalipto ocupa posição de destaque no setor florestal brasileiro em razão do rápido crescimento e adaptabilidade às diversas condições edafoclimáticas e das características tecnológicas da madeira. Entretanto, as respostas da planta à adição de nitrogenados em florestas continuam sucitando questionamentos. A estratégia de estudo considerando o balanço energético do sistema solo-planta pela existência de um “nitrostato” que controla as entradas e saídas do nitrogênio representa modelo a ser validado para otimizar a produtividade com economia na fertilização nitrogenada em florestas da região tropical. Assim, o presente trabalho teve como objetivo determinar a influência da interrupção do fluxo de fotoassimilados da parte aérea para a rizosfera pelo anelamento de árvores sobre a estrutura da comunidade microbiana do solo e nitrogênio mineral. O estudo foi conduzido em duas fases de crescimento pós-plantio em florestas de eucalipto na região do Vale do Rio Doce, Minas Gerais, Brasil, áreas sob domínio do Bioma Mata Atlântica. Os maiores teores de carbono orgânico total do solo, 3,95 dag kg -1 em floresta com 18 meses de desenvolvimento pós-plantio e 3,62 dag kg -1 na com 72 meses, ocorreram no período chuvoso. Os teores de NH 4+ em torno de 27 mg kg -1 de solo seco, e os de NO 3- em torno de 40 mg kg -1 de solo seco, foram maiores durante os períodos úmidos e correspondentes a aproximadamente duas vezes os valores do período seco. Já valores de respiração no solo foram maiores na época seca. O índice de diversidade de Shanon (H) variou de 1,7 a 3,5 considerando os domínios, Bacteria, Archaea e Eukarya nas duas fases de crescimento pós-plantio e mostrou que a fase de crescimento não afetou a diversidade microbiana. A avaliação dos perfis de eletroforese em gel com gradiente desnaturante (DGGE) revelou pelo método de agrupamento médio entre grupos (UPGMA) a tendência de agrupamento dos perfís das amostras coletadas na rizosfera, donde se inferiu a existência de capacidade da planta de moldar a estrutura da comunidade microbina na rizosfera e rizoplano. A variação dos perfis de DGGE dentro de gradiente sazonal mostrou que o aporte de fotoassimililados para a rizosfera e a umidade determinam a estrutura da comunidade microbiana em solos sob florestas plantadas de eucalipto. / Eucalyptus are fast growing woody plants with the ability to adapt when exposed to different edaphoclimatics conditions and with woody technological characteristics that make them important players in the brazilian forest sector. However, the plant responses to the nitrogen additions continue raising questions. The strategy of study considering the soil-plant energetic balance by the existence of a nitrostat represents a model to be validated in order to optimize the productivity by saving in the nitrogen fertilization in tropical forests. This work aimed to evaluate the effect of the photoassimilates flow from aerial part of the plants by girdling the eucalyptus trees in the soil microbial community structure and in the mineral nitrogen. The study was performed in two distinct growth stages of two post-planting growth stage in Eucalyptus forests in the Vale do Rio Doce area, Minas Gerais state, Brazil, dominated by Atlantic Forest biome. The highest total organic carbon content, 3.95 dag kg-1 in forests with 18 months of post- planting development and 3.62 dag kg-1 in those with 72 months, were found during the rainy season. The NH4+ content around 27 mg kg-1 in the dry soil, and the N03+ content around 40 mg kg-1, were higher during the wet season and about twice the amount found during the dry season. The Shanon (H)diversity index ranged from 1.7 to 3.5 considering the Bacteria, Archaea and Eukarya domains and showed no effect of growth stage in the microbial diversity. Clustering analysis by the method of Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) of the Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) profiles revealed that samples from rhizosphere grouped together, showing that plants have the ability to recruit a specific microbial community in the rhizosphere and in the rhizoplane. Changes in the DGGE profiles within a seasonal gradient point out that the input of photoassimilates to the rhizosphere and the moisture determine the microbial community structure in soil under Eucalyptus forests. / Resumo em inglês do arquivo PDF difere da versão impressa. Resumo em inglês do PDF foi substituído pelo resumo em inglês escaneado da versão impressa. Foi enviada somente 1 (uma) cópia da versão impressa pela Secretaria do curso.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-12-21T11:38:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 4243684 bytes, checksum: f5b9f5d1f1542cc767288674a7a4710f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-21T11:38:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 4243684 bytes, checksum: f5b9f5d1f1542cc767288674a7a4710f (MD5) Previous issue date: 2017-09-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As culturas probióticas estão disponíveis para o consumidor, principalmente, em produtos lácteos. Contudo o interesse pela incorporação destes micro-organismos em outras bases alimentares é crescente. As matrizes vegetais são boa alternativa para a incorporação destes micro-organismos, no entanto é necessário o desenvolvimento de diferentes técnicas para inserir as bactérias probióticas em vegetais. Esta pesquisa objetivou desenvolver revestimento comestível a base de pectina de baixa metoxilação para veicular micro-organismos probióticos em cenoura e goiaba minimamente processadas. Na primeira etapa do estudo, foi produzido o revestimento a base de pectina de baixa metoxilação, sendo os tratamentos controle e adicionados de bactérias probióticas (Lactobacillus acidophilus LA3, Lactobacillus plantarum (CH6072 e L286), Lactobacillus paracasei BGP1, Lactobacillus acidophilus LA3 em combinação com Lactobacillus plantarum (CH6072 e L286), Lactobacillus acidophilus LA3 em combinação com Lactobacillus paracasei BGP1 e Lactobacillus plantarum (CH6072 e L286) em combinação com Lactobacillus paracasei BGP1). Os revestimentos comestíveis foram avaliados quanto à sua estabilidade microbiológica (viabilidade e resistência às condições gastrointestinais simuladas in vitro das culturas probióticas e atividade antimicrobiana frente à Listeria innocua ATCC33090 e Escherichia coli ATCC11229), física (viscosidade, cor, índice de brancura e turbidez) e química (pH) durante 12 dias de armazenamento. Na segunda etapa do estudo, avaliou-se a aplicação do revestimento comestível em cenoura e goiaba minimamente processadas e a estabilidade dos produtos obtidos armazenados a 4 °C. Cenoura e goiaba minimamente processadas contendo os revestimentos comestíveis foram avaliadas quanto a qualidade microbiológica, viabilidade e resistência às condições gastrointestinais in vitro dos probióticos, microscopia eletrônica de varredura (MEV), perda de massa, firmeza, composição da cor, pH, acidez total titulável e teor de sólidos solúveis totais. O revestimento comestível apresentou-se como bom carreador de bactérias probióticas, além de alguns tratamentos apresentarem atividade antimicrobiana. A adição de bactérias probióticas ao revestimento comestível alterou (p<0,05) pH, cor, índice de brancura e turbidez. As bactérias probióticas apresentaram-se viáveis quando os revestimentos comestíveis foram adicionados as cenoura e goiaba minimamente processadas. A MEV mostrou que as bactérias probióticas apresentaram-se bem distribuídas por toda a superfície da cenoura e goiaba minimamente processadas revestidas. A adição do revestimento cometível às fatias de cenoura e goiaba minimamente processadas não alterou (p>0,05) a qualidade microbiológica e as características físicas e químicas dos produtos avaliados. Portanto, o revestimento comestível a base de pectina de baixa metoxilação contendo bactérias probióticas é uma boa alternativa para veicular estes micro-organismos, através dos vegetais minimamente processados, até o consumidor. / The probiotic cultures are available for the consumer especially in dairy products. However, the interest by the incorporation of these microorganisms in other food bases is growing. The vegetables matrices are a good alternative for the incorporation of these micro-organisms, it is necessary to the development of different techniques to deliver the probiotic bacteria to vegetables. The objective of this research was to develop low methoxylated pectin based edible coating to deliver probiotic microorganisms to minimally processed carrots and guavas. In the first stage of the study, low methoxylation pectin edible coating was produced, control treatment and addition of probiotic bacteria (Lactobacillus acidophilus LA3, Lactobacillus plantarum (CH6072 e L286), Lactobacillus paracasei BGP1, Lactobacillus acidophilus LA3 in combination with Lactobacillus plantarum (CH6072 e L286), Lactobacillus acidophilus LA3 in combination with Lactobacillus paracasei BGP1 e Lactobacillus plantarum (CH6072 e L286) in combination with Lactobacillus paracasei BGP1). The edible coatings were evaluated for their microbiological stability (viability and resistance to simulated in vitro gastrointestinal conditions of probiotic cultures and antimicrobial activity against Listeria innocua ATCC33090 and Escherichia coli ATCC11229), physical (viscosity, color, whiteness index and turbidity) and chemical (pH) for 12 days storage. In the second stage of the study, were evaluated the application of the edible coating in minimally processed carrots and guavas and the stability of the obtained products stored at 4 ° C. Minimally processed carrots and guavas containing the edible coatings were evaluated for microbiological quality, viability and resistance in vitro gastrointestinal conditions of probiotics, scanning electron microscopy (SEM), loss of mass, firmness, color composition, pH, titratable total acidity and total soluble solids content. The edible coating presented as a good carrier of probiotic bacteria, in addition to some treatments presenting antimicrobial activity. The addition of probiotic bacteria to the edible coating altered (p<0.05) pH, color, whiteness index and tubidity. Probiotic bacteria were viable when edible coatings were added to minimally processed carrots and guavas. SEM showed that probiotic bacteria were well distributed throughout the surface of minimally processed coated carrot and guava. The addition of the edible coating minimally processed carrot and guava did not modify (p> 0.05) the microbiological quality and the physical and chemical characteristics of the evaluated products. Therefore, the low methoxylation pectin edible coating containing probiotic bacteria is a good alternative for transference these microorganisms through minimally processed vegetables to the consumer.

SILVA, Valéria Maria Araújo. Facilitação pode incrementar a capacidade de adaptação de actinobactérias e rizóbios "in vitro". 2016. 89 f. Dissertação (Mestrado em ecologia e recursos naturais)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2016. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-07-28T16:41:56Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_vmasilva.pdf: 1606701 bytes, checksum: fe47fb5ee02d36bddccb38ea078f8a37 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-08-02T14:41:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_vmasilva.pdf: 1606701 bytes, checksum: fe47fb5ee02d36bddccb38ea078f8a37 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-02T14:41:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_tese_vmasilva.pdf: 1606701 bytes, checksum: fe47fb5ee02d36bddccb38ea078f8a37 (MD5) Previous issue date: 2016 / The natural environment is marked by an intricate network of biotic interactions that shape the structure of ecological communities. The presence of positive ecological interactions between microbial populations in soils semiarid regions, has great importance in structuring the local soil microbiota. In this work, actinomycetes strains of rhizobia and coming from rhizosphere of Park National Ubajara-CE, were evaluated for the ability to grow through cooperative metabolic mechanisms. Of the 27 evaluated actinomycetes, 22 showed compatibility with rhizobia. The strains UB-05, UB-07, UB-08, UB-11 and UB-21 stood out in facilitating tests for amylase and cellulase. The metabolic activity of actinomycetes helped the development of rhizobia strains. / O ambiente natural é marcado por uma intrincada rede de interações bióticas que moldam a estrutura das comunidades ecológicas. A presença de interações ecológicas positivas entre populações microbianas em solos de regiões semiáridas, possui grande relevância na estruturação da microbiota do solo local. Neste trabalho, cepas de actinobactérias e rizóbios oriundas de solo rizosférico do Parque Nacional de Ubajara-CE, foram avaliadas quanto à capacidade de crescerem através de mecanismos metabólicos cooperativos. Das 27 actinobactérias avaliadas, 22 apresentaram compatibilidade com rizóbios. As cepas UB-05, UB-07, UB-08, UB-11 e UB-21, destacaram-se nos ensaios de facilitação para amilase e celulase. A atividade metabólica de actinobactérias auxiliou o desenvolvimento das cepas de rizóbios.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-07-27T11:31:42Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 991628 bytes, checksum: be2f658b43f3b706acbad16e7537bd31 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-27T11:31:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 991628 bytes, checksum: be2f658b43f3b706acbad16e7537bd31 (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A Agroecologia é uma forma de orientar as diferentes estratégias de desenvolvimento rural sustentável, avaliando as potencialidades dos sistemas agrícolas, através de perspectivas social, econômica e ecológica.Sistemas agrícolas que promovam a manutenção ou o aumento das populações microbianas benéficas do solo trazem muitas vantagens tanto para o ambiente quanto para a produção agrícola. Logo é importante buscar práticas agrícolas que visem à conservação dos microrganismos no solo.Diversas práticas e processos contribuem para o aumento e preservação da diversidade microbiana benéfica do solo, tais como a rotação de cultura, plantio direto, o consórcio, adubação verde, adubação orgânica, uso de cobertura morta e os sistemas agroflorestais (SAF).A avaliação das características microbiológicas do solo nos SAF é importante para a compreensão mais aprofundada de sua interferência positiva no solo, refletindo aspectos bioquímicos relacionados com a ciclagem e disponibilização de e com a dinâmica da matéria orgânica. Dessa forma este trabalho que teve foco de estudo o SAF composto por cafeeiros e macaubeiras, onde os objetivos principais foram: avaliar o crescimento vegetativo de cafeeiro sem consórcio com a macaúba em diferentes distâncias das árvores e avaliar as características químicas, a diversidade das comunidades microbianas do solo em cafeeiros consorciados com macaubeiras. / Agroecology is a way of guiding the different strategies of sustainable rural development, assessing the potential of agricultural systems, through social, economic and ecological perspectives. agricultural systems that promote the maintenance or increase in beneficial microbial populations Soil bring many benefits to both the environment and to agricultural production. Logo is important to seek agricultural practices aimed at conservation of soil microorganisms. Several practices and processes contribute to the increase and preservation of beneficial microbial diversity of the soil, such as crop rotation, tillage, the consortium, green manure, organic manure, mulch use and agroforestry systems (SAF). The evaluation of microbiological characteristics of the soil in the SAF is important for better understanding of their positive interference in the soil, reflecting biochemical aspects of cycling and availability of and the dynamics of organic matter. Thus this work was study focused on the SAF consists of coffee and macaubeiras, where the main objectives were to evaluate the vegetative growth of coffee plants in consortium with macaúba at different distances from the trees and evaluate the chemical characteristics, the diversity of microbial communities soil in coffee trees mixed with macaubeiras.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-09-05T12:12:19Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1636988 bytes, checksum: 82f0e2495b29689e04e4a8d2ad963aa3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-05T12:12:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1636988 bytes, checksum: 82f0e2495b29689e04e4a8d2ad963aa3 (MD5) Previous issue date: 2015-07-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O petróleo é a principal fonte de energia no Brasil, onde o consumo de óleo continua subindo desde 2013, atingindo atualmente 2.2% do total de energia consumida no mundo. A descoberta recente de petróleo nas baias do Espirito Santo, Campos e Santos, pode representar uma excelente oportunidade para atender as demandas energéticas nacionais. Entretanto, a exploração de petróleo oferece riscos a microbiota e toda a vida marinha. Microrganismos são responsáveis pela ciclagem de nutrientes, podem degradar compostos orgânicos recalcitrantes e muitas espécies são reportadas como sensíveis à contaminação por hidrocarbonetos do petróleo. Esse trabalho teve o objetivo de avaliar as alterações na comunidade microbiana em solos sob a contaminação por petróleo e avaliar os efeitos do Co-produto de biodiesel (BCP) como um agente protetor da microbiota do solo perante a adição de petróleo. Foram utilizados solos da Ilha da Trindade, e da estação de pesquisa Highfield no Rothamsted Research, UK. Foram montados microcosmos com 20 gramas de solo e os tratamentos utilizaram petróleo intemperizado. Os solos foram incubados a 26° C com correção da umidade para cerca de 60% da capacidade de retenção de água dos solos. Foi utilizada a medição de evolução de CO2 para avaliar a atividade do solo, durante o período de incubação, e a extração de DNA genômico do solo, ao final do período de incubação, para avaliar as mudanças nas comunidades microbianas dos tratamentos e controles. O DNA foi submetido para o sequenciamento de amplicons de 16S rDNA para a avaliação de Bacteria e Archaea e de amplicons da região ITS1 para a avaliação de Fungos utilizando a plataforma Illumina HiSeq. Foi feita a comparação das diversidades alpha e beta e análise das alterações taxonômicas. Essa tese está dividida em dois capítulos. O primeiro descreve os efeitos do petróleo nas comunidades microbianas do solo da Ilha da Trindade. No segundo capítulo foi testado o efeito protetor do BCP sobre a microbiota dos solos da Ilha da Trindade, do campo Bare Fallow e do campo Grassland do Rothamsted Research contra a adição de óleo. O petróleo teve um grande efeito negativo sobre a diversidade microbiana da Ilha da Trindade, mas não mudou a diversidade microbiana dos solos agrícolas do Rothamsted. A comparação taxonômica mostrou aumento do filo Actinobacteria, mudanças em várias classes de Proteobacteria e redução da classe Nitrosphaerales do filo Archaea. Esse é o primeiro esforço para aquisição de conhecimento sobre o efeito da contaminação de solos de uma ilha oceânica brasileira com petróleo. Essa informação é importante para guiar qualquer futura estratégia de biorremediação que se faça necessária. / Crude oil is still the dominant energy source in Brazil where oil consumption keeps rising since 2013, reaching nowadays 2.2% of the world‟s energy consumption. A recent discovery of crude oil reservoirs at the Espirito Santo, Campos and Santos basins, can represent an excellent opportunity to meet the country‟s economic and energetic demands. However, offshore exploration offers risks to the microbiota and the whole sea life. Microbes are responsible for nutrient cycling can degrade recalcitrant organic compounds and several species have been reported as sensitive to petroleum hydrocarbons. This work aimed to evaluate microbial community shifts in soils under crude oil contamination and assess the effects of Biodiesel co-product (BCP) as a protecting agent of soil microbiota under crude oil addition. We used soils from the Trindade Island and from the Highfield research station at Rothamsted Research, UK. We assembled microcosms of 20 grams and contaminated the soils using weathered crude oil. Soils were incubated at 26° C with moisture correction to ca. 60% water holding capacity. We used CO2 evolution measurements to evaluate soil activity, during the incubation, and soil genomic DNA extraction, at the end of incubation period, to evaluate microbial community changes from treatments and controls. DNA was submitted to amplicon sequencing of 16S rDNA for Bacteria and Archaea and the ITS1 region for Fungi using Illumina MiSeq platform. We compared alpha and beta-diversity and taxonomic shifts. This thesis is divided in two chapters. The first describes the effects of crude oil on Trindade Island‟s soil microbial communities. In the second chapter we tested the protective effects of BCP on Trindade Island, Rothamsted‟s Bare Fallow and Grassland soils, against the amendment with crude oil. Crude oil had a major negative effect on microbial diversity for Trindade Island, but didn‟t change the diversity of Rothamsted agricultural soils. Taxonomy comparisons showed rise of the Actinobacteria phylum, shifts in several Proteobacteria classes and reduction of the Archaea class Nitrososphaerales. This is the first effort in acquiring knowledge concerning the effect of crude oil contamination in soils of a Brazilian oceanic island. This information is important to guide any future bioremediation strategy that can be required.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:50Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-19. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:55Z : No. of bitstreams: 1 000856531_20180401.pdf: 178192 bytes, checksum: 5fe4091ff282788eb99786be5db51eb4 (MD5) Bitstreams deleted on 2018-04-02T12:47:07Z: 000856531_20180401.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-04-02T12:47:58Z : No. of bitstreams: 1 000856531.pdf: 1016357 bytes, checksum: 391d3a986bfc56d254337889ab8e974e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / É sabido que grande parte da produção primária global ocorre nos oceanos, e que um problema fundamental é entender como os organismos usam este carbono e quais são os padrões das variações espaço-temporais do carbono e do fluxo de energia. Deste modo, o interesse no ciclo do carbono vem aumentando nos últimos anos devido ao aumento recente de problemas mundiais, tais como mudanças climáticas e antropização de zonas costeiras. A alça microbiana conduz energia e carbono por meio das bactérias, para os níveis tróficos superiores, além de promover a assimilação de elementos inorgânicos biologicamente importantes, como nitrogênio e fósforo, em matéria orgânica na coluna d'água, elementos estes que são de extrema importância biológica. O presente estudo teve por objetivo estudar a estrutura e o funcionamento da alça microbiana nos sedimentos da Baía do Araça, quantificar seus elementos, verificar as flutuações nas densidades e correlacionar com outros fatores analisados, tais como contaminantes metálicos, matéria orgânica e hidrocarbonetos. Foram coletadas amostras de sedimento em 37 pontos, divididos em duas regiões (entremarés e sublitoral), durante o período de um ano. As amostras foram analisadas quanto a granulometria, conteúdo de matéria orgânica, carbonos orgânicos totais, hidrocarbonetos, além da análise dos componentes microbiológicos. Foi observado que as maiores densidades de microrganismos foram observadas na região do sublitoral. Houve uma correlação negativa entre as densidades de bactérias heterotróficas e nano flagelados, podendo indicar bacterivoria. As variações de matéria orgânica ao longo do estudo afetaram diretamente as populações de bactérias heterotróficas / It is known that great part of the global primary occurs in the oceans, and a problem is to understand how the organisms use this carbon, what are the patterns of the spatial-temporal variations of carbon and of the energy flow. Thus, the interest in the carbon cycle is increasig in recent years due to the increase of global problems, such as climate change and the increase of population in coastal areas. The microbial loop leads energy and carbon, by bacteria, to the other trophic levels, and it also promotes the assimilation of inorganic elements biologically relevants, such as nitrogen and phosphorus, in organic matter in the water column, which are extremely biologically importants. This study aims to analyze the structure and the functioning of the microbial loop, quantifying its elements, check the densities variations and correlate with other analyzed factors, such as metal contaminants, organic matter and hydrocarbons. Sediment samples were collected at 37 points, divided into two regions (intertidal and subcoastal), during the period of one year. The samples were processed for granulometric analyzis, organic matter, total organic carbons, hydrocarbons, and microbiological components. It was observed that the highest densities of microrganisms were at the subcoastal region. There was a negative correlation between the densities of heterotrophic bacteria and nanoflagellates, which may indicate bacterivory. Variations of organic matter throughout the study directly affected the heterotrophic bacteria populations