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Consideraciones a tomar en cuenta para evitar complicaciones en el trasplante de microbiota fecal / Considerations should be taken into account to avoid complexities in the transplantation of fecal microbiotaLara, Adriana, Espadín, Carlo 01 January 2019 (has links)
Carta al Editor / Revisión por pares
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Transplante de microbiota em modelo experimental murino de enterocolite neonatalPrado, Christian January 2017 (has links)
Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde da Universidade do Extremo Sul Catarinense - UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Mestre em Ciências da Saúde. / A enterocolite necrosante é uma doença grave que acomete neonatos prematuros, provocando necrose parcial ou completa da parede gastrointestinal. Seu tratamento é realizado com antibióticos, nutrição parenteral, suporte avançado de vida, e em parte significante dos casos também cirurgia. A despeito do desenvolvimento tecnológico em terapia intensiva neonatal, persiste causando mortalidade elevada, com até 50% de óbitos nos pacientes que necessitaram de tratamento cirúrgico. A microbiota intestinal tem um papel importante no desenvolvimento da doença, principalmente quando alterada, apresentando predomínio de bactérias patogênicas, ao que é chamado desbiose. Na busca de novas opções de tratamento, foi pesquisado se o transplante de microbiota de um doador saudável adulto previne, ou diminui, a resposta inflamatória em um modelo murino experimental de enterocolite necrosante. O experimento utilizou 71 ratos Wistar, divididos da seguinte forma: um rato adulto doador das fezes para o experimento, 10 ratos controle de 3 dias de vida amamentados por sua progenitora (grupo controle = GC), 20 ratos Sham submetidos a indução de enterocolite necrosante, (grupo sham = GS), 20 ratos que receberam transplante de microbiota antes da indução (transplante de microbiota pré = TMPE) e 20 ratos que receberam o transplante de microbiota após a indução (transplante de microbiota pós = TMPO). A indução da enterocolite seguiu metodologia já descrita, que envolve alimentação por fórmula artificial, hipotermia, hipóxia e administração de endotoxina por via oral. O transplante de microbiota foi realizado através da admistração de 100μL da solução contendo 3x108 células, provenientes das fezes do rato doador adulto. Foram analisados a resposta inflamatória aguda através das dosagens dos níveis de TNF-α, IL-1β e IL-6, a presença de dano oxidativo pelas técnicas de TBARS e carbonil. A presença de dano nitrosativo por Western blotting de 3-nitrotirosina. A avaliação do grau de lesão histológica na mucosa intestinal foi realizada através de escore desenvolvido por Caplan et al. Este escore varia de 0, que equivale a mucosa normal, até 4, o qual representa lesão transmural. O GS teve aumento significativo em relação ao GC dos níveis de TNF-α, IL-1β e IL-6, na atividade da mieloperoxidase e equivalente MDA, e na de dosagem 3-nitrotirosina (p<0,05). O TMPE teve redução significativa em relação ao GS em relação aos níveis de de TNF-α, IL-1β e IL-6 na atividade da mieloperoxidase e equivalente MDA, e na de dosagem 3-nitrotirosina (p<0,05). O TMPO teve redução significativa em relação ao GS em relação aos níveis de IL-6 , equivalente MDA, e na de dosagem 3-nitrotirosina (p<0,05). Não houve variação significativa entre os grupos em relação a carbonilação de proteínas. No escore histológico de lesão intestinal, o GS apresentou valores maiores que os outros grupos, variando entre 1 e 3 (p<0,05). Os espécimes do GC, TMPE e TMPO apresentaram predominantemente escore 0, equivalente a mucosa normal, desta forma, sem diferença significativa entre si. O transplante de microbiota apresentou potencial terapêutico para o tratamento de enterocolite necrosante, principalmente na prevenção, quando realizada precocemente, no modelo experimental de indução da doença.
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Towards the development of pro and prebiotics against cryptosporidiosis /Oliveira, Bruno César Miranda. January 2019 (has links)
Orientador: Katia Denise Saraiva Bresciani / Resumo: A criptosporidiose, uma das principais causas de diarreia infantil, é causada por parasitos do Filo Apicomplexa pertencentes ao gênero Cryptosporidium. A falta de medicamentos eficazes está motivando pesquisas para desenvolver tratamentos alternativos. Para este objetivo, o impacto dos probióticos no curso da criptosporidiose foi investigado. A microbiota intestinal nativa de camundongos imunossuprimidos livres de patógenos específicos foi inicialmente esgotada com antibióticos administrados por via oral. Um produto probiótico comercialmente disponível destinado ao consumo humano foi subsequentemente adicionado à água potável. Os camundongos foram infectados com oocistos de Cryptosporidium parvum. Em média, os camundongos tratados com probiótico desenvolveram uma infecção mais grave. Os probióticos alteraram significativamente a microbiota fecal, mas não foi observada associação direta entre a ingestão de bactérias probióticas e sua abundância na microbiota fecal. Esses resultados sugerem que os probióticos alteram indiretamente o microambiente intestinal ou o epitélio intestinal de maneira a favorecer a proliferação de C. parvum. / Abstract: Cryptosporidiosis, a leading cause of infant diarrhea, is caused by apicomplexan parasites classified in the genus Cryptosporidium. The lack of effective drugs is motivating research to develop alternative treatments. To this aim, the impact of probiotics on the course of cryptosporidiosis was investigated. The native intestinal microbiota of specific pathogen-free immunosuppressed mice was initially depleted with orally administered antibiotics. A commercially available probiotic product intended for human consumption was subsequently added to the drinking water. Mice were infected with Cryptosporidium parvum oocysts. On average, mice treated with probiotic developed a more severe infection. The probiotics significantly altered the fecal microbiota, but no direct association between ingestion of probiotic bacteria and their abundance in fecal microbiota was observed. These results suggest that probiotics indirectly altered the intestinal microenvironment or the intestinal epithelium in a way that favors proliferation of C. parvum. / Doutor
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Análise da diversidade da microbiota fecal de lactentes durante o primeiro ano de vida utilizando biblioteca 16S RNA / Analysis of the diversity of fecal microbiota of infants during the first year living library using 16S RNAOliveira, Fernanda Filomena de 28 March 2011 (has links)
A microbiota intestinal humana desempenha papel essencial no organismo saudável, pois sintetiza vitaminas, influencia no desenvolvimento e maturação do sistema imune da mucosa intestinal, além de exercer importante função protetora, competindo por nutrientes e receptores com bactérias patogênicas. A colonização desta microbiota se inicia na criança recém-nascida e alcança estabilidade em torno do segundo ano de vida, com consequência para a saúde da criança e do adulto. As diferenças na composição da microbiota estão relacionadas a diferentes níveis de contaminação ambiental e de diferentes fatores endógenos. O objetivo do nosso estudo foi analisar a microbiota fecal de crianças com idade entre 2 dias a 1 ano de idade, que vivem em baixas condições socioeconômicas em São Paulo, Brasil. Foram coletadas amostras de fezes de crianças saudáveis, nos seguintes pontos pós-nascimento: 2º e 7º dias, 1 mês, 3 meses, 6 meses e 1 ano de vida. O DNA bacteriano foi extraído diretamente a partir das amostras de fezes e as bibliotecas 16S rRNA foram construídas utilizando 2 iniciadores bactéria-específicos. Os clones foram selecionados aleatoriamente, parcialmente sequenciados e analisados com base em bibliotecas de gene 16S rRNA. Os principais grupos filogenéticos identificados foram Escherichia, Clostridium, Streptococcus e Bacteroides, do 1º ao 30º dia de vida. A partir do 3º mês, Streptococcus e bactérias não cultiváveis, além do gênero Escherichia, ganharam relevância na microbiota. Estes dados, em conjunto com as informações nutricionais, intercorrências clínicas e ambientais, sugerem a influência da contaminação ambiental e interpessoal no aumento da complexidade na composição da microbiota fecal. Essa abordagem molecular permitiu a análise da microbiota fecal do grupo selecionado, encontrando perfil bacteriano diferente do que é descrito nos países desenvolvidos. / The human intestinal microbiota plays essential role in healthy body since it synthesizes vitamins, influences on the development and maturation of the immune system of the intestinal mucosa. Furthermore, it also plays an important protective function competing for nutrients and receptors with pathogenic bacteria. The colonization of this microbiota starts in the newborn child and achieves stability around the second year of life, with consequence for the health of children and adults. The differences in the microbiota composition are related to different levels of environmental contamination and different endogenous factors. The aim of our study was to analyze the fecal microbiota of children ranging from 2º days to 1º year old living in low socioeconomic status in São Paulo, Brazil. We collected fecal samples of healthy children at the following points after birth: 2º e 7º days, 1 month, 3 months, 6 months and one year of life. Bacterial DNA was extracted directly from stool samples, and the 16S rRNA libraries were made using 2 bacterium-specific primers. The clones were randomly selected, and partially sequenced and analyzed based on 16S rRNA libraries. The main phylogenetic groups identified were Escherichia, Clostridium, Streptococcus, Bacteroides ranging from the 1º to 30º days of life. From the third month Streptococcus and uncultured bacteria, and, besides, Escherichia gender gained relevance in the microbiota. These data together with nutritional information, environmental and clinical intercurrents suggest the influence of interpersonal and environmental contamination in the increase of complexity in fecal microbiota composition. This molecular approach allowed the fecal microbiota analysis. This bacterial profile is different from described in developed countries.
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Consequências do uso de soro de leite de cabra sobre parâmetros bioquímicos, morfologia e microbiota fecal de ratas e filhotes jovens alimentados com dieta ocidentalizada desde a vida perinatalPAULINO, Barbara Costa 20 May 2016 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-03-29T14:52:20Z
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Dissertação_BARBARA COSTA PAULINO_Agosto2016.OFICIAL.pdf: 2162827 bytes, checksum: e76b8cfadd5a941840853d352a5bc159 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-29T14:52:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2
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Dissertação_BARBARA COSTA PAULINO_Agosto2016.OFICIAL.pdf: 2162827 bytes, checksum: e76b8cfadd5a941840853d352a5bc159 (MD5)
Previous issue date: 2016-05-20 / CNPQ / A dieta ocidentalizada, rica em lipídeos, açúcar, sódio e alimentos processados e ultra
processados tem sido apontada como um dos mais relevantes fatores associados ao excesso de
peso/obesidade, comorbidades e distúrbios fisio-metabólicos observados em estudos
epidemiológicos e experimentais em animais. O objetivo do presente estudo foi investigar os
efeitos do soro de leite de cabra sobre o estado nutricional, microbiota, histologia intestinal e
parâmetros bioquímicos de ratas e filhotes alimentados com dieta ocidentalizada. Foram
utilizados 8 machos e 24 fêmeas da linhagem Wistar (da colônia do Departamento de
Nutrição da Universidade Federal de Pernambuco) para o acasalamento dos animais. Ratas
gestantes foram divididas em quatro grupos experimentais de acordo com a dieta: Controle ou
Ocidentalizada e a suplementação ou não com soro de leite de cabra. Evolução ponderal e
consumo alimentar das ratas seguiram por todo experimento. Ao desmame, as ratas e metade
da prole de machos de cada ninhada foram eutanasiados para análise dos parâmetros
bioquímicos, histologia intestinal, micro-organismos fecais. Metade dos filhotes foi submetida
aos mesmos acompanhamentos e eutanasiados aos 45 dias de vida. A suplementação com soro
de leite de cabra modificou poucos parâmetros nas ratas com exceção da alteração da
quantidade de lactobacilos totais, que nos grupos controles com solução salina apresentaram
uma média de 7,34±0,08 log.UFC/g-1 e 6,43±0,31 log.UFC/g-1 e no suplementado 7,79±0,30
log.UFC/g-1 e 6,94±0,45 log.UFC/g-1 para ratas com dieta ocidentalizada e padrão,
respectivamente. Nos filhotes, a suplementação com soro de leite de cabra promoveu redução
no ganho de peso e dos depósitos de gordura abdominal, alteração bioquímica, aumentou em
15% a contagem de lactobacilos e em 13% as enterobactérias. Além disso, minimizou o
desgaste de células intestinais, limitando o processo inflamatório observado nos alimentados
com dieta ocidentalizada. Dessa forma, pode-se sugerir que o soro de leite teve potencial
efeito na microbiota fecal e morfologia intestinal, e que esses efeitos parecem depender da
idade e do período de suplementação. / The westernized diet rich in fat, sugar, sodium and processed foods and processed ultra has
been identified as one of the most important factors associated with overweight / obesity,
comorbidities, and physiological and metabolic disorders observed in epidemiological and
experimental studies in animals. The aim of this study was to investigate the effects of serum
of goat milk on the nutritional status, microbiota, intestinal histology and biochemical
parameters of rats and offispring fed westernized diet. Were used 8 male and 24 female
Wistar (the colony of the Department of Nutrition at the Federal University of Pernambuco)
for mating of animals. Pregnant rats were divided into four groups according to the diet:
control or Westernized and supplemented or not with serum from goat milk. weight gain and
food consumption of rats followed throughout the experiment. At weaning, rats, half male
offspring in each litter were sacrificed for analysis of biochemical parameters, intestinal
histology, faecal micro-organisms. Half of the pups was subjected to the same
accompaniments and euthanized at 45 days of life. Supplementation with goat whey modified
few parameters in rats with the exception of changing the amount of total lactobacilli that in
control groups with saline had a mean of 7,34 ± 0,08 log.UFC/g-1 and 6, 43 ± 0,31 log.UFC/g1
and supplemented 7,79±0,30 log.UFC/g-1 and 6,94 ± 0,45 log.UFC/g-1 to rats with
westernized diet and standard, respectively. In puppies, supplementation with goat whey
promoted reduction of 200% in weight gain and deposits of abdominal fat, biochemical
change, increased by 15% to lactobacillus count and 13% enterobacteria. In addition,
minimized wear of intestinal cells by limiting the inflammatory process observed in fed
westernized diet. Thus, it can be suggested that the whey had potential effect on fecal
microbiota and intestinal morphology, and that these effects appear to depend on the age and
supplementation period.
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Análise da diversidade da microbiota fecal de lactentes durante o primeiro ano de vida utilizando biblioteca 16S RNA / Analysis of the diversity of fecal microbiota of infants during the first year living library using 16S RNAFernanda Filomena de Oliveira 28 March 2011 (has links)
A microbiota intestinal humana desempenha papel essencial no organismo saudável, pois sintetiza vitaminas, influencia no desenvolvimento e maturação do sistema imune da mucosa intestinal, além de exercer importante função protetora, competindo por nutrientes e receptores com bactérias patogênicas. A colonização desta microbiota se inicia na criança recém-nascida e alcança estabilidade em torno do segundo ano de vida, com consequência para a saúde da criança e do adulto. As diferenças na composição da microbiota estão relacionadas a diferentes níveis de contaminação ambiental e de diferentes fatores endógenos. O objetivo do nosso estudo foi analisar a microbiota fecal de crianças com idade entre 2 dias a 1 ano de idade, que vivem em baixas condições socioeconômicas em São Paulo, Brasil. Foram coletadas amostras de fezes de crianças saudáveis, nos seguintes pontos pós-nascimento: 2º e 7º dias, 1 mês, 3 meses, 6 meses e 1 ano de vida. O DNA bacteriano foi extraído diretamente a partir das amostras de fezes e as bibliotecas 16S rRNA foram construídas utilizando 2 iniciadores bactéria-específicos. Os clones foram selecionados aleatoriamente, parcialmente sequenciados e analisados com base em bibliotecas de gene 16S rRNA. Os principais grupos filogenéticos identificados foram Escherichia, Clostridium, Streptococcus e Bacteroides, do 1º ao 30º dia de vida. A partir do 3º mês, Streptococcus e bactérias não cultiváveis, além do gênero Escherichia, ganharam relevância na microbiota. Estes dados, em conjunto com as informações nutricionais, intercorrências clínicas e ambientais, sugerem a influência da contaminação ambiental e interpessoal no aumento da complexidade na composição da microbiota fecal. Essa abordagem molecular permitiu a análise da microbiota fecal do grupo selecionado, encontrando perfil bacteriano diferente do que é descrito nos países desenvolvidos. / The human intestinal microbiota plays essential role in healthy body since it synthesizes vitamins, influences on the development and maturation of the immune system of the intestinal mucosa. Furthermore, it also plays an important protective function competing for nutrients and receptors with pathogenic bacteria. The colonization of this microbiota starts in the newborn child and achieves stability around the second year of life, with consequence for the health of children and adults. The differences in the microbiota composition are related to different levels of environmental contamination and different endogenous factors. The aim of our study was to analyze the fecal microbiota of children ranging from 2º days to 1º year old living in low socioeconomic status in São Paulo, Brazil. We collected fecal samples of healthy children at the following points after birth: 2º e 7º days, 1 month, 3 months, 6 months and one year of life. Bacterial DNA was extracted directly from stool samples, and the 16S rRNA libraries were made using 2 bacterium-specific primers. The clones were randomly selected, and partially sequenced and analyzed based on 16S rRNA libraries. The main phylogenetic groups identified were Escherichia, Clostridium, Streptococcus, Bacteroides ranging from the 1º to 30º days of life. From the third month Streptococcus and uncultured bacteria, and, besides, Escherichia gender gained relevance in the microbiota. These data together with nutritional information, environmental and clinical intercurrents suggest the influence of interpersonal and environmental contamination in the increase of complexity in fecal microbiota composition. This molecular approach allowed the fecal microbiota analysis. This bacterial profile is different from described in developed countries.
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Avaliação dos efeitos digestivos, fermentativos e imunológicos de leveduras (Saccharomyces cerevisiae) inativadas e enriquecidas em meio de cultura em dietas para gatos adultos / Effects of increasing levels of yeast (Saccharomyces cerevisiae) on digestibility, fecal fermentation and immunological parameters in diets for adult catsMatheus, Laura Fantucci de Oliveira 19 August 2016 (has links)
As leveduras Saccharomyces cerevisiae são consideradas importantes matérias primas na nutrição animal pela sua capacidade prebiótica. Os prebióticos são compostos não digeridos pelo organismo animal, mas que são fermentados pelos microrganismos do trato gastrintestinal, cujos produtos são capazes de prover benefícios ao hospedeiro. A fermentação depende de fatores como: substrato utilizado para o seu crescimento, método de fermentação, modo e condição de secagem e idade das células. Assim, os processos produtivos modernos têm como intuito a produção de leveduras com elevado potencial prebiótico. Este estudo objetivou avaliar os efeitos de teores crescentes de leveduras com metabólitos ativos (LSC; baseada na fermentação de substratos específicos) na digestibilidade aparente dos nutrientes da dieta, microbiota e produtos da fermentação fecal e parâmetros imunológicos de gatos adultos. Foram utilizados 27 gatos adultos, idade média de 9,44±5,35 anos, machos e fêmeas, sem raça definida e saudáveis. Os animais foram distribuídos em delineamento em blocos casualizados (idade), constituído de três tratamentos experimentais, denominados: DC (dieta controle), LSC 0,3 (dieta controle com 0,3% de leveduras com metabólitos ativos) e LSC 0,6 (dieta controle com 0,6% de leveduras com metabólitos ativos). Os resultados obtidos foram analisados através do programa computacional Statistical Analysis System (SAS Institute Inc., 2004), sendo considerados significativos valores de p<0,05 e as médias comparadas pelo teste de Tukey. Verificou-se que a inclusão do aditivo alterou apenas a digestibilidade aparente da fibra bruta, da matéria mineral e energia metabolizável (p<0,05). Já em relação aos produtos da fermentação e microbiota das fezes, observou-se redução em ácido lático (p=0,0040) e Clostridium perfringens (p=0,0226) com a inclusão do prebiótico e diminuição do ácido isovalérico (p=0,0144) no tratamento LSC 0,3. Pode-se concluir que o aditivo, nos teores de inclusão avaliados, parece apresentar potencial prebiótico em relação aos produtos da fermentação e microbiota fecal / Saccharomyces cerevisiae yeast are considered important raw materials in animal nutrition due their prebiotic capacity. Prebiotics are compounds not digested by animal organism, but are fermented by microorganisms in the gastrointestinal tract, which products are capable of providing benefits to the host. The fermentation depends on factors such as: substrate used for growth, fermentation method, way and drying condition and age of the cells. Thus, modern production processes have the objective of producing yeast with high prebiotic potential. This study aimed to evaluate the effects of increasing levels of yeast with active metabolites (LSC) based on the fermentation of specific substrates on apparent digestibility of diet nutrients, microbiota and fecal fermentation products and immunological parameters in adult cats. Twenty seven male or female cats with mean weight of 4.19 ± 0.83kg and mean age of 9.44 ± 5.35 years were used and distributed in an unbalanced randomized block design (age), consisting of three experimental treatments, DC (control diet), LSC 0.3 (control diet with 0.3% yeast with active metabolites) and LSC 0.6 (control diet with 0.6% yeast with active metabolites). The results were analyzed using the computer program Statistical Analysis System (SAS Institute Inc., 2004), with significance level of p<0.05 and the averages compared by Tukey test. The inclusion of the additive only changed the apparent digestibility of crude fiber and mineral content (p<0.05). Regarding the fermentation products and microbiota of feces, there was a reduction in lactic acid (p=0,0040) and Clostridium perfringens (p=0,0226) with inclusion of prebiotic and decreased of isovalerate (p=0,0144) in the LSC 0.3 treatment. It can be concluded that the additive, in the levels of inclusion assessed, seems to have prebiotic potential on fecal fermentation products and microbiota
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Uso da biblioteca genômica RNAr 16S como ferramenta para o estudo da microbiota fecal humana / Using the genomic library 16S rRNA as a tool to study of human fecal microbiota.Machado, Juliana Bannwart de Andrade 09 October 2013 (has links)
A microbiota intestinal é um ecossistema complexo que geralmente vive em harmonia com seu hospedeiro. É essencial para o desenvolvimento e funcionamento adequado do sistema imunológico da mucosa durante o início da vida, um processo que atualmente é conhecido por ser importante para a imunidade de adultos. A microbiota intestinal compreende aproximadamente 1000 espécies, das quais 80% não são cultiváveis. Tendo em vista a importância de se conhecer a microbiota humana e a utilização da ferramenta da construção da biblioteca genômica RNAr 16S ser relativamente recente, esse estudo tem como objetivo analisar diferentes protocolos para avaliar o uso desta ferramenta para o estudo da microbiota intestinal humana. Para a realização dos ensaios experimentais, o DNA extraído de fezes de seis crianças, em diferentes faixas etárias, foi utilizado para a criação de um pool, o qual foi utilizado nos ensaios de PCR. As bibliotecas RNAr 16S foram construídas utilizando 2 pares de iniciadores bactéria-específicos 27F-1492R e 63F-1387R, variando o tempo de desnaturação inicial de cada reação de amplificação do gene RNAr 16S entre 5 e 10 minutos, e 1 par de iniciadores 341F-518R. Os clones foram selecionados aleatoriamente, parcialmente sequenciados e analisados com base em banco de dados do gene RNAr 16S. A diversidade da microbiota foi menor quando os iniciadores 63F-1387R foram utilizados, em comparação aos resultados dos iniciadores 27F-1492R, no entanto, apenas o par de iniciadores 63F-1387R identificou Bifidobacterium sp., gênero importante para o desenvolvimento da microbiota intestinal humana. Não houve diferenças significativas na diversidade quando o tempo de desnaturação inicial da reação de PCR foi estendido para 10 minutos. Com o uso do par de iniciadores 341F-518R mostrou uma diversidade satisfatória, uma maior riqueza, quando comparada com os outros pares de iniciadores e detectou a presença de Bifidobacterium sp. Os dados obtidos sugerem que mais de um par de iniciadores deve ser empregado para o estudo da microbiota fecal quando se utilizar a biblioteca de RNAr 16S como ferramenta. / The intestinal microbiota is a complex ecosystem that usually lives in harmony with its host. It is essential for the development and proper functioning of the mucosal immune system during beginning of the life, a process that is currently known to be important for overall immunity of adults. The intestinal microbiota comprises about 1000 species, 80% of which are not cultivable. Given the importance of understanding the human microbiota and that the use of the tool library construction genomic 16S rRNA is relatively recent, this study aims to analyze different protocols to evaluate the use of this tool to study of the human intestinal microbiota. To perform the experimental tests, the DNA extracted from feces of six children, in different age groups, was used for the creation of a pool, which was used in the PCR assays. The 16S rRNA libraries were constructed using 2 pairs of primers specific-bacterium 27F-1492R and 63F-1387R, varying the denaturation time of each initial amplification reaction between 5 and 10 minutes, and the pair of primers 341F - 518R.The clones were randomly selected, partially sequenced and analyzed based on database 16S rRNA gene. The diversity of the microbiota was lower when the primers 63F - 1387R were used when compared with the results of the primers 27F - 1492R. However, only the pair 63F - 1387R was able to identified Bifidobacterium spp., important genus for the development of the microbiota from human gut. No significant differences in diversity were observed when the time of initial denaturation of the PCR reaction was extended to 10 minutes. By using the pair of primers 341F - 518R a satisfactory diversity, with detection of Bifidobacterium spp., and greater richness were observed, compared with the other pairs of primer. The data suggests that more than one pair of primers should be used for the study of fecal microbiota when using the library of 16S rRNA as a tool.
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Avaliação dos efeitos digestivos, fermentativos e imunológicos de leveduras (Saccharomyces cerevisiae) inativadas e enriquecidas em meio de cultura em dietas para gatos adultos / Effects of increasing levels of yeast (Saccharomyces cerevisiae) on digestibility, fecal fermentation and immunological parameters in diets for adult catsLaura Fantucci de Oliveira Matheus 19 August 2016 (has links)
As leveduras Saccharomyces cerevisiae são consideradas importantes matérias primas na nutrição animal pela sua capacidade prebiótica. Os prebióticos são compostos não digeridos pelo organismo animal, mas que são fermentados pelos microrganismos do trato gastrintestinal, cujos produtos são capazes de prover benefícios ao hospedeiro. A fermentação depende de fatores como: substrato utilizado para o seu crescimento, método de fermentação, modo e condição de secagem e idade das células. Assim, os processos produtivos modernos têm como intuito a produção de leveduras com elevado potencial prebiótico. Este estudo objetivou avaliar os efeitos de teores crescentes de leveduras com metabólitos ativos (LSC; baseada na fermentação de substratos específicos) na digestibilidade aparente dos nutrientes da dieta, microbiota e produtos da fermentação fecal e parâmetros imunológicos de gatos adultos. Foram utilizados 27 gatos adultos, idade média de 9,44±5,35 anos, machos e fêmeas, sem raça definida e saudáveis. Os animais foram distribuídos em delineamento em blocos casualizados (idade), constituído de três tratamentos experimentais, denominados: DC (dieta controle), LSC 0,3 (dieta controle com 0,3% de leveduras com metabólitos ativos) e LSC 0,6 (dieta controle com 0,6% de leveduras com metabólitos ativos). Os resultados obtidos foram analisados através do programa computacional Statistical Analysis System (SAS Institute Inc., 2004), sendo considerados significativos valores de p<0,05 e as médias comparadas pelo teste de Tukey. Verificou-se que a inclusão do aditivo alterou apenas a digestibilidade aparente da fibra bruta, da matéria mineral e energia metabolizável (p<0,05). Já em relação aos produtos da fermentação e microbiota das fezes, observou-se redução em ácido lático (p=0,0040) e Clostridium perfringens (p=0,0226) com a inclusão do prebiótico e diminuição do ácido isovalérico (p=0,0144) no tratamento LSC 0,3. Pode-se concluir que o aditivo, nos teores de inclusão avaliados, parece apresentar potencial prebiótico em relação aos produtos da fermentação e microbiota fecal / Saccharomyces cerevisiae yeast are considered important raw materials in animal nutrition due their prebiotic capacity. Prebiotics are compounds not digested by animal organism, but are fermented by microorganisms in the gastrointestinal tract, which products are capable of providing benefits to the host. The fermentation depends on factors such as: substrate used for growth, fermentation method, way and drying condition and age of the cells. Thus, modern production processes have the objective of producing yeast with high prebiotic potential. This study aimed to evaluate the effects of increasing levels of yeast with active metabolites (LSC) based on the fermentation of specific substrates on apparent digestibility of diet nutrients, microbiota and fecal fermentation products and immunological parameters in adult cats. Twenty seven male or female cats with mean weight of 4.19 ± 0.83kg and mean age of 9.44 ± 5.35 years were used and distributed in an unbalanced randomized block design (age), consisting of three experimental treatments, DC (control diet), LSC 0.3 (control diet with 0.3% yeast with active metabolites) and LSC 0.6 (control diet with 0.6% yeast with active metabolites). The results were analyzed using the computer program Statistical Analysis System (SAS Institute Inc., 2004), with significance level of p<0.05 and the averages compared by Tukey test. The inclusion of the additive only changed the apparent digestibility of crude fiber and mineral content (p<0.05). Regarding the fermentation products and microbiota of feces, there was a reduction in lactic acid (p=0,0040) and Clostridium perfringens (p=0,0226) with inclusion of prebiotic and decreased of isovalerate (p=0,0144) in the LSC 0.3 treatment. It can be concluded that the additive, in the levels of inclusion assessed, seems to have prebiotic potential on fecal fermentation products and microbiota
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Ocorrência de Escherichia coli comensal e diarreiogênica na microbiota fecal de crianças com e sem diarréia aguda e seu perfil de susceptibilidade a antimicrobianosGarcia, Patrícia Guedes 20 November 2009 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-03-29T19:15:57Z
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Previous issue date: 2009-11-20 / Diarréia aguda é um problema de saúde pública, causa importante de morbidade e mortalidade, sobretudo, em países em desenvolvimento. A etiologia das doenças diarréicas é variada e entre os patógenos bacterianos destacam-se as linhagens diarreiogênicas ou patotipos de Escherichia coli. Foi investigada a ocorrência de E. coli comensal ou diarreiogênica em 141 amostras fecais de crianças de zero até cinco anos de idade de origem comunitária em Juiz de Fora, MG. Dos espécimes, 84 foram provenientes de doadores com manifestação clínica de diarréia aguda (CD) e 57 de doadores clinicamente saudáveis, sem diarréia (SD). Após identificação e caracterização microbiana, foi determinado o seu perfil de susceptibilidade a antimicrobianos. As linhagens bacterianas foram identificadas fenotípica e genotipicamente por métodos bioquímicos clássicos e moleculares, respectivamente, e a caracterização dos patotipos de interesse no trato gastrintestinal foi feita por metodologia molecular. O perfil de susceptibilidade a antimicrobianos foi determinado pelo método de Kirby-Bauer, segundo recomendações do CLSI (2007). Considerando-se todo o grupo amostral, 136 linhagens de E. coli foram recuperadas de fezes CD (36,8% diarreiogências) e 84 de fezes SD (30,9% diarreiogênicas). A confirmação da identificação bioquímica por metodologia molecular mostrou uma correlação de 97,3% entre as duas metodologias. E. coli enteroagregativa (EAEC) foi o patotipo mais freqüentemente recuperado no grupo CD (16,2%) e o único isolado no grupo SD (30,9%). E. coli enteropatogênica (EPEC) atípica foi o segundo patotipo mais isolado no grupo CD (10,3%), seguido de E. coli produtora de toxina Shiga (STEC) (7,4%) e E. coli enterotoxigênica (ETEC) (2,9%). Nenhuma linhagem de EPEC típica e E. coli enteroinvasiva (EIEC) foi recuperada. A investigação do perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos demonstra elevada resistência a fármacos, como ampicilina, tetraciclina e sulfametoxazol-trimetoprim, enquanto que resistência intermediária foi observada contra a ampicilina/sulbactam, cefalotina, tetraciclina e amicacina e gentamicina. Os antimicrobianos mais eficazes foram ceftazidima, ceftriaxona, imipenem e piperacilina/tazobactan, para os quais não foi verificada resistência bacteriana. A diferenciação entre os patotipos de E. coli é de grande importância, uma vez que estes microrganismos estão implicados em diarréias agudas em
crianças e, quase sempre, necessitarão de tratamento medicamentoso. De maneira geral, nossos resultados indicam a relevância da participação de agentes bacterianos diarreiogênicos na gênese da diarréia aguda na infância, em crianças de 0 a 5 anos. A alta resistência a antimicrobianos observada em nosso trabalho suscita uma ampla discussão sobre uso indiscriminado/indevido de antibióticos e os riscos inerentes da automedicação. / Acute diarrhea is a public health problem, important cause of morbidity and mortality, especially in developing countries. The etiology is varied and considering the bacterial pathogens, the diarrheagenic Escherichia coli pathotypes are among the most important. In this study we have investigated the occurrence of commensal or diarrheagenic E. coli in 141 fecal samples from children of zero to five years of age in Juiz de Fora, MG. Of the specimens, 84 were obtained from clinically injured donors with acute diarrhea (CD) and 57 from clinically healthy donors without diarrhea (SD). After microbial identification and characterization the bacterial antimicrobial susceptibility patterns were determined. The bacterial strains were phenotipically and genotipically indentified by conventional biochemical methods and molecular approach, respectively. The E. coli pathotypes were also genetically characterized by molecular methodology. The antimicrobial susceptibility patterns were determined by the Kirby-Bauer method, according to the CLSI guidelines (2007). Considering all fecal specimens, 136 E. coli strains were isolated and identified (36.8%, CD) and 84 (30.9%, SD). Confirmation of identification by molecular approach showed 97,3% of correlation between the two methodologies. Enteroaggregative E. coli (EAEC) was the most frequently recovered pathotype identified in the acute diarrhea group (16.2%) whereas the only recovered pathotype identified in the feces from healthy donors (30.9%). Enteropathogenic E. coli (EPEC) was the second most isolated pathotype group (10.3%), followed by STEC (7.4%) and ETEC (2.9%). No typical EPEC or EIEC strains were recovered. The antimicrobial susceptibility patterns shown high antimicrobial resistance rates against ampicillin, tetracycline, and sulfamethoxazole-trimethoprim. Intermediary resistance was observed against ampicillin/sulbactam, cefalotin, tetracycline, amikacin and gentamicin. The most effective antimicrobials were ceftazidime ceftriaxone, imipenem and piperacillin/tazobactam, for which no bacterial resistance was observed. The differentiation between the diarrheagenic E. coli pathotypes is of great importance, since they are involved in acute diarrheal diseases in children and, almost often will require antimicrobial chemotherapy. Overall, our results may indicate the importance of the bacterial agents in the etiology of diarrheic diseases in childhood, mainly
considering children of 0 to 5 years. The high antimicrobial resistance observed in our study raises a broad discussion on the indiscriminate or improper use of antimicrobials, besides the risks of self-medication.
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