Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-08-08T13:00:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) tese_MariaSibaldo.pdf: 2571529 bytes, checksum: 0d9af192f329870166c194c53541ce82 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-08T13:00:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) tese_MariaSibaldo.pdf: 2571529 bytes, checksum: 0d9af192f329870166c194c53541ce82 (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / CAPEs / Os sistemas de recomendação fazem uso de algoritmos para facilitar a busca de itens de interesse do usuário. Esta tese apresenta uma solução para recomendação através do agrupamento em redes complexas, dado que este encontra padrões que beneficiam a recomendação. É utilizada a métrica de modularidade para auxiliar na divisão de uma rede em grupos e, com base nesse agrupamento, realizar recomendação. Assim, foram propostos dois métodos de recomendação baseados em modularidade, dois algoritmos de agrupamento e uma nova métrica de modularidade. O primeiro método proposto estima o peso da aresta entre dois elementos em uma rede bipartida (usuário e item) após a formação de grupos e faz uso das arestas do grupo do item. O método citado anteriormente serviu de inspiração para o segundo método, o qual faz uso das arestas entre grupos. Para este segundo método foram propostos dois algoritmos: AMV (Agrupamento com Movimento de Vértices), o qual realiza os agrupamentos com diversas métricas existentes; e o AMA (Agrupamento com Movimento de Arestas), o qual realiza agrupamentos apenas com a métrica proposta. O algoritmo AMA tem um tempo de processamento menor que o AMV. Com as observações realizadas na segunda proposta, uma nova métrica de modularidade foi elaborada para melhorar a recomendação. Esta modularidade possui maior valor quando os pesos dos relacionamentos entre os grupos são semelhantes. A primeira proposta se mostrou adequada para o problema e obteve o 6º lugar na competição do RecSys 2014. A segunda proposta obteve resultados comparativos equivalentes ao de métodos de recomendação no estado-da-arte. A métrica proposta mostrou-se adequada para a recomendação. / This thesis uses the modularity metric to assist in dividing a network into groups and, based on this grouping, apply recommendation procedure. We propose two methods of recommendation based on modularity, two grouping algorithm and also a new metric of modularity. The first method proposed estimates the rating between two nodes in a bipartite network after grouping it, for this estimation the item’s group is used. The first method was the inspiration for the second one: which uses the edges between groups to estimate the edges weight. Two algorithms were created for this second method: AMV (grouping with vertex movement), which can be used with different modularity metrics; and AMA (grouping with edges moviment), which makes use of the modularity metric proposed here and is faster than the previous one. A different modularity metric was proposed to improve the recommendation system. This modularity has greater value when the weights of relationships between groups are similar. The first proposal was adequate to the problem and obtained the 6th place in the RecSys Challenge 2014 competition. The second proposal has equivalent results compared to other recommendations methods in the state of the art. The experiments with the proposal metric showed that this metric is adequate to recommender systems.

Sistemas morfológicos quantitativos são descritos por medidas contínuas. A relação genética entre essas características dos indivíduos é representada pela matriz de covariância genética aditiva, a matriz G. Entender a evolução da matriz G, portanto, é de suma importância para compreender os padrões de diversificação encontrados na natureza. Neste trabalho estudamos modelos computacionais para a evolução de traços contínuos em populações naturais, sujeitas a variados tipos de seleção e condições internas, focando no problema da evolução dos padrões de integração e modularidade nessas populações. Testamos dois modelos com diferentes combinações de parâmetros em sua capacidade de reproduzir e elucidar padrões naturais. Seleção direcional correlacionada se mostrou uma força importante na criação desses padrões de covariação e a seleção estabilizadora correlacionada se mostrou fundamental para a manutenção desses padrões / Quantitative morphological systems are described by continuous measurements. The genetic relation between these characteristics of the individuals is represented by the genetic additive co-variance matrix, the G matrix. Understanding the evolution of the G matrix is, therefore, of paramount importance for proper interpretation of the patterns of diversification we observe in nature. In this work we study computational models for the evolution of quantitative traits in natural populations, subject to different natural selection and internal conditions, focusing on the problem of the evolution of the pattern of morphological integration and modularity. We test two models with different sets of parameters in their ability to reproduce and elucidate natural patterns. Directional correlated selection was necessary for the shaping of the patterns of morphological integration, and correlated stabilizing selection was fundamental to the maintenance of these patterns

[pt] Muitos problemas de modularidade de design de software estão relacionados à modularização inadequada de interesses importantes e que têm impacto sistêmico no design, tais como tratamento de exceção, distribuição e persistência. No entanto, a maioria das abordagens atuais de avaliação quantitativas não levam em conta os interesses que guiam o design, o que acaba fazendo com que o processo de avaliação de modularidade se torne deficiente. Portanto, existe a necessidade de abordagens de medição que promovam uma identificação mais efetiva dos problemas de modularidade relacionados a interesses transversais. Além disso, essa necessidade se torna ainda mais evidente à medida que surgem novas formas de decomposição de design, tais como desenvolvimento de software orientado a aspectos. Nesse contexto, essa tese tem o objetivo de definir e investigar uma nova abordagem de avaliação quantitativa de modularidade de design de software que promove o conceito de interesse a uma abstração de medição. Esse trabalho define uma abordagem de medição dirigida por interesse que inclui um conjunto de mecanismos para avaliação de modularidade de software desde o design arquitetural até o design detalhado. A abordagem sensível a interesse proposta é composta por: (i) um conjunto de métricas arquiteturais, (ii) um conjunto de métricas de design detalhado, (iii) um conjunto de regras heurísticas de design que dão apoio a interpretação das métricas, e (iv) uma ferramenta, chamada de COMET, que dá apoio tanto à notação quanto à medição dirigida por interesses de design arquitetural. A utilidade da técnica de medição dirigida por interesses proposta foi avaliada em uma série de estudos empíricos, onde a modularidade de designs convencionais e orientados a aspectos foram comparados. / [en] Several modularity problems in software designs are related to the inadequate modularization of key broadly-scoped concerns, such as exception handling, distribution, and persistence. However, most of the current quantitative assessment aproaches are not sensitive to concerns that drive the design, thereby leading to a number of shortcomings in the modularity evaluation process. Therefore, there is a need for measurement approaches that support a more effective identification of modularity anomalies related to crosscutting concerns. Also, this necessity becomes more apparent in an age that a number of different fomrs of design decompositions, such as aspect-oriented software development, are emerging. In this context, this thesis aims at investigating a novel approach for quantittative modularity assessment of software design by promoting the concept of concern as a measurement abstraction. Our concern-driven measurement approach encompasses a set of mechanisms for assessing software modularity from architectural to detailed design. The prposed concern-sensitive approach includes:(i) a suite of architectural metrics, (ii) a suite of detailed design metrics, (iii) a suite of design heuristic rules for supporting the interpretation of metrics in meaningful ways, and (iv) a tool, called COMET, that supports bots concern-drive notation and measurement of architectual designs. We evaluated the usefulness of our concern-oriented measurement techinique in a series of emprical studies, comparing the modularity of conventional and aspect-oriented software design.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-04-06T15:48:25Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese_Joel A Queiroz_PPGBV_2016.pdf: 1398066 bytes, checksum: 45a58588c174d510e8c470f8b7b11c79 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-06T15:48:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese_Joel A Queiroz_PPGBV_2016.pdf: 1398066 bytes, checksum: 45a58588c174d510e8c470f8b7b11c79 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / CNPQ / As espécies de plantas com flores de antese noturna e seus polinizadores, principalmente, morcegos e mariposas Sphingidae (mariposas de aparelho bucal longo e de hábito predominantemente noturno) foram estudadas no presente trabalho através de abordagens de teoria de redes complexas e de biologia floral (para três espécies de plantas: Encholirium spectabile (Bromeliaceae); e duas espécies de Ipomoea (Convolvulaceae). Entre janeiro/2011 e dezembro/2012 foram realizadas expedições mensais a um remanescente de Caatinga hiperxerófila situada no Nordeste do Brasil, para coleta de esfingofauna (com auxílio de armadilha luminosa) e de morcegos (com redes de neblina). A carga polínica presente no corpo desses polinizadores foi coletada e os tipos polínicos identificados e quantificados, sendo tais dados usados para construir matrizes qualitativas (presença/ausência) e quantitativas (frequência de individuos com pólen de determinada espécie de planta) para análise interanual de modularidade e robustez da rede de interações. Para as espécies E. spectabile, Ipomoea marcellia e I. aff. marcellia foram coletados dados de morfometria floral (comprimento e largura de corola), antese (início, término e duração total), atributos de néctar (volume, concentração, mg de açúcares, padrão de produção e efeito de remoção) e frequência de visitantes florais diurnos e noturnos. Para as espécies de Ipomoea a eficiência de morcegos e beija-flores foi estimada através de experimentos de exposição seletiva de flores. A rede de interações entre plantas e polinizadores noturnos foi formada por 24 espécies de plantas, 4 morcegos e 15 esfingídeos, sendo registradas 766 conexões totais. A rede apresentou estrutura modular de 0.36, sendo observados três módulos distintos: dois exclusivos de esfingídeos e um misto (morcegos + esfingídeos). No entanto, foi observada intensa frequência de conexões inter-módulos o que pode indicar uma fronteira não tão bem delimitada da guilda de plantas quiropterófilas. A rede apresentou robustez à extinção de espécies variável entre os dois anos de coleta, o que pode ser o resultado do menor tamanho (Rede2011: 42 espécies; Rede2012: 29 espécies) e menor quantidade de conexões (Rede2011: 573; Rede2012: 193) resgistrados no ano mais seco. As espécies E. spectabile, I. marcellia e I. aff. marcellia, de modo geral, apresentaram atributos de morfometria floral mais relacionados à quiropterofilia (polinização por morcegos). No entanto, a morfologia floral e períodos de antese e de disponibilidade de néctar prolongados para além da noite, possibilitaram a beija-flores acessarem néctar e transferirem, com certo grau de sucesso, pólen para o estigma, garantindo um serviço de polinização complementar. Esse sistema de polinização, denominado polinização mista, parece ser uma estratégia recorrente para algumas espécies de Caatinga primariamente relacionadas à polinização por morcegos, podendo garantir maior sucesso reprodutivo para tais plantas. / Plant species with nocturnal flowers and their pollinators, especially bats and hawmoths were studied in this work through complex networks theory approaches and floral biology (for three species of plants: Encholirium spectabile (Bromeliaceae), and two Ipomoea taxa (Convolvulaceae). Between January/2011 and December/2012 were carried out monthly mailings to a remnant of Caatinga hyperxerophilic located in northeastern Brazil, to moth collect (with aid of light trap) and bats (with mist nets). the pollen load present in the body of these pollinators were collected, identified, and quantified pollen types, and such data used to construct qualitative (presence / absence) and quantitative matrices (frequency of individuals with pollen) to analysis of modularity and robustness of network. To E. spectabile, Ipomoea marcellia and I. aff. marcellia were collected floral morphometry (length and width corolla), anthesis (start, end and total duration), nectar attributes (volume, concentration, sugars, pattern of production and removal effect) and frequency flower visitors day and night. To Ipomoea, bats and hummingbirds efficiency was estimated by experiments of selective exposure flowers. The mutualistc network plants and pollinators was formed by 24 plant species, 15 hawkmoths and 4 bats. It was recorded 766 connections. That network presented modular structure, 0.36, with three distinct modules: two exclusive hawkmoths and a mixed hawkmoths and bats). However, there was intense frequency of inter-module connections, which may indicate a boundary not as well defined Guild chiropterophilous plants. The network showed variable robustness between years (2011: Rplant = 0.96; Ranimal = 0.92; 2012: Rplant = 0:33; Ranimal = 0:33), which may be the result of the smaller size (2011: 42 species; 2012: 29 species) and fewer connections. E. spectabile, I. marcellia and I. aff. marcellia showed more attributes related to chiropterophily (pollinated by bats). However, the floral morphology and anthesis periods and prolonged nectar availability in addition to the night, made it possible to access hummingbirds nectar and transfer, with some degree of success, pollen to the stigma, ensuring a supplementary pollination service. This pollination system called mixed pollination, seems to be a recurring strategy for some species of Caatinga primarily related to pollination by bats and can ensure greater reproductive success for such plants.

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós–Graduação em Oceanografia Biológica, Instituto de Oceanografia, 2013 / Submitted by Cristiane Gomides (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2013-12-16T11:59:50Z No. of bitstreams: 1 rodrigo.pdf: 2838178 bytes, checksum: 0ed5e3967d18f3075d7e2c1c3f615170 (MD5) / Approved for entry into archive by Sabrina Andrade (sabrinabeatriz@ibest.com.br) on 2013-12-18T18:12:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rodrigo.pdf: 2838178 bytes, checksum: 0ed5e3967d18f3075d7e2c1c3f615170 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-12-18T18:12:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rodrigo.pdf: 2838178 bytes, checksum: 0ed5e3967d18f3075d7e2c1c3f615170 (MD5) Previous issue date: 2013 / Investigamos a estrutura social e padrões espaciais de uso da área por uma população de golfinhos, Tursiops truncatus, que habitam o estuário da Lagoa dos Patos e águas costeiras adjacentes, no sul do Brasil. Nós estimamos o índice de associação a partir de 102 indivíduos regularmente observados em 243 saídas de foto-identificação realizadas entre agosto de 2005 e outubro de 2012. As análises sociais e de rede, com a divisão proposta pela modularidade, indicou que esta população de botos é composta por três unidades sociais principais. Embora exista certa sobreposição espacial, houve distinção entre as zonas preferenciais de cada unidade. Uma das unidades esta fortemente associada com o estuário da Lagoa dos Patos, enquanto as outras duas ocuparam, respectivamente, as áreas marinhas adjacentes norte e sul. Dentro das unidades, as associações entre os indivíduos foram predominantemente de curta duração (dinâmica de fissão-fusão), embora tenham sido identificadas algumas associações de longa duração. Embora tenham ocorrido interações entre as unidades sociais, as associações foram rápidas e ocorreram apenas entre alguns indivíduos. A segregação destes indivíduos é motivada, pelo menos em parte, pelos padrões de associação entre os indivíduos e sua fidelidade a áreas específicas. Recomenda-se que as unidades sociais sejam a base para modelar a viabilidade e dinâmica intrapopulacional, bem como para investigação de padrões de fluxo gênico dentro e entre unidades sociais. / We investigated the social structure and spatial patterns of area usage by a population of bottlenose dolphins, Tursiops truncatus, inhabiting the Patos Lagoon estuary and adjacent coastal waters, in southern Brazil. We estimated the association index from 102 individuals regularly sighted in 243 photo-identification surveys carried out between August 2005 and October 2012. Social and network analyses, with the division proposed by modularity, indicated that this bottlenose dolphin population consists of three social units. Although some spatial overlap exists, preferred areas of each unit were distinct. One of the units was strongly associated with the Patos Lagoon estuary while the other two occupied, respectively, the southern and northern adjacent marine coasts. Within unit associations among individuals were predominantly of short duration (fission-fusion dynamics), though a few long-lasting bonds were detected. Although interactions between social units occurred, the associations were brief and occurred only among a few individuals. The segregation of these individuals is motivated, at least in part, by the bonding patterns among individuals and their fidelity to specific areas. It is recommended that the social units be the framework for modeling the intrapopulation dynamic and viability as well as for investigating patterns of gene flow within and between social units.

A Geração de Língua Natural (GLN) ocupa-se de atribuir forma lingüística a dados em representação não-lingüística (Reiter & Dale, 2000); a Realização Lingüística (RL), por sua vez, reúne as subtarefas da GLN estritamente dependentes das especificidades da língua-alvo. Este trabalho objetiva a investigação em RL, uma de cujas aplicações mais proeminentes é a construção de módulos geradores de língua-alvo na tradução automática baseada em transferência semântica. Partimos da identificação de três requisitos fundamentais para modelos de RL quais sejam generalidade, instanciabilidade e complexidade e da tensão entre esses requisitos no estado da arte. Argumentamos pela relevância da avaliação formal dos modelos da literatura contra esses critérios e focalizamos em modelos baseados em restrições (Schulte, 2002) como promissores para reconciliar os três requisitos. Nesta classe de modelos, identificamos o recente modelo de Debusmann (2006) Extensible Dependency Grammar (XDG) e sua implementação - o XDG Development Toolkit (XDK) - como uma plataforma especialmente promissora para o desenvolvimento em RL, apesar de jamais utilizada para tal. Nossas contribuições práticas se resumem ao esforço de tornar o XDK mais eficiente e uma formulação da disjunção inerente à lexicalização adequada à XDG, demonstrando suas potenciais vantagens numa sistema de GLN mais completo / Natural Language Generation (NLG) concerns assigning linguistic form to data in nonlinguistic representation (Reiter & Dale, 2000); Linguistic Realization (LR), in turn, comprises all strictly target language-dependent NLG tasks. This work looks into RL systems from the perspective of three fundamental requirements - namely generality, instantiability, and complexity and the tension between them in the state of the art. We argue for the formal evaluation of models against these criteria and focus on constraint-based models (Schulte, 2002) as tools to reconcile them. In this class of models we identify the recent development of Debusmann (2006) - Extensible Dependency Grammar (XDG) - and its implementation - the XDG Development Toolkit (XDK) - as an especially promising platform for RL work, in spite of never having been used as such. Our practical contributions comprehend a successful effort to make the XDK more efficient and a formulation of lexicalization disjunction suitable to XDG, illustrating its potential advantages in a full-fledged NLG system

Submitted by RENATO Kogeyama (rkogeyama@gmail.com) on 2018-10-19T21:14:30Z No. of bitstreams: 1 final_version.pdf: 1117817 bytes, checksum: f74b9b8398397e1c4fdc399a581996a8 (MD5) / Approved for entry into archive by ÁUREA CORRÊA DA FONSECA CORRÊA DA FONSECA (aurea.fonseca@fgv.br) on 2018-10-25T20:18:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 final_version.pdf: 1117817 bytes, checksum: f74b9b8398397e1c4fdc399a581996a8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-29T20:13:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 final_version.pdf: 1117817 bytes, checksum: f74b9b8398397e1c4fdc399a581996a8 (MD5) Previous issue date: 2018-08-20 / Literature on modularity acknowledges its relevance to innovation, but it rarely addresses the relationship between modularity and the structure of competition in technological markets. In this dissertation, I seek to extend received wisdom by shedding light on this relationship, and I find that modularity affects the structure of competition by shifting the locus of value capture. An empirical test provides evidence that interfaces are pivotal for prevalence in technological markets due to the network effects created by the use of modularization at the component level, on the design stage. Also, I demonstrate that the location of modularity asymmetrically affects the performance of firms. Firms which adopt modular components performs better than firms that adopt proprietary components when horizontal differentiation is more important than vertical differentiation. Lastly, I examine the effect of participation in Standard Setting Organizations to job mobility and I find an unexpected consequence of competition in technological markets: participation in the standardization effort may inadvertently lead firms to leak intellectual capital due increased job mobility of their inventors. / A literatura atual em modularidade reconhece sua relevância para a inovação, mas raramente discute a relação entre modularidade e a estrutura da competição em mercados tecnológicos. Nesta tese, eu busco expandir o conhecimento neste tema, e identifico que a modularidade afeta a estrutura da competição ao alterar o foco da captura de valor. Um teste empírico fornece evidências de que as interfaces são fundamentais na competição em mercados tecnológicos por causa dos efeitos de rede gerados a partir da modularização no nível do componente, na etapa de projeto. Além disso, eu demonstro que a localização da modularidade afeta assimetricamente o desempenho das empresas. As empresas que adotam componentes modulares obtêm desempenho superior que as empresas que adotam componentes proprietários quando a diferenciação horizontal é mais importante que a diferenciação vertical. Por último, eu examino os efeitos da participação em Organizações de Padronização na taxa de mudança de empregos, e encontro uma consequência inesperada da competição em mercados tecnológicos: a participação em processos de padronização de tecnologias pode inadvertidamente levar empresas a perder capital intelectual para a concorrência devido a um aumento da taxa de mudança de empregos de seus inventores.

A Geração de Língua Natural (GLN) ocupa-se de atribuir forma lingüística a dados em representação não-lingüística (Reiter & Dale, 2000); a Realização Lingüística (RL), por sua vez, reúne as subtarefas da GLN estritamente dependentes das especificidades da língua-alvo. Este trabalho objetiva a investigação em RL, uma de cujas aplicações mais proeminentes é a construção de módulos geradores de língua-alvo na tradução automática baseada em transferência semântica. Partimos da identificação de três requisitos fundamentais para modelos de RL quais sejam generalidade, instanciabilidade e complexidade e da tensão entre esses requisitos no estado da arte. Argumentamos pela relevância da avaliação formal dos modelos da literatura contra esses critérios e focalizamos em modelos baseados em restrições (Schulte, 2002) como promissores para reconciliar os três requisitos. Nesta classe de modelos, identificamos o recente modelo de Debusmann (2006) Extensible Dependency Grammar (XDG) e sua implementação - o XDG Development Toolkit (XDK) - como uma plataforma especialmente promissora para o desenvolvimento em RL, apesar de jamais utilizada para tal. Nossas contribuições práticas se resumem ao esforço de tornar o XDK mais eficiente e uma formulação da disjunção inerente à lexicalização adequada à XDG, demonstrando suas potenciais vantagens numa sistema de GLN mais completo / Natural Language Generation (NLG) concerns assigning linguistic form to data in nonlinguistic representation (Reiter & Dale, 2000); Linguistic Realization (LR), in turn, comprises all strictly target language-dependent NLG tasks. This work looks into RL systems from the perspective of three fundamental requirements - namely generality, instantiability, and complexity and the tension between them in the state of the art. We argue for the formal evaluation of models against these criteria and focus on constraint-based models (Schulte, 2002) as tools to reconcile them. In this class of models we identify the recent development of Debusmann (2006) - Extensible Dependency Grammar (XDG) - and its implementation - the XDG Development Toolkit (XDK) - as an especially promising platform for RL work, in spite of never having been used as such. Our practical contributions comprehend a successful effort to make the XDK more efficient and a formulation of lexicalization disjunction suitable to XDG, illustrating its potential advantages in a full-fledged NLG system