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Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD

SILVA, Denise de Santana 23 January 2009 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-20T13:53:01Z No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T13:53:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5) Previous issue date: 2009-01-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Heliconias are the most cultivated flowers in tropical floriculture of the Brazil northeast, due to its characteristics like beauty, exotic, exuberant colors and rusticity, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense. The present study had how objective to determine the genetic diversity existing between the isolates of F. oxysporum f. sp. cubense collected in heliconia and banana through the ITS region of rDNA using ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis), markers like RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). In the ARDRA analysis products amplified by ITS1 and ITS4 primers were digested by restriction enzymes Hae III, Xho I, Hind III and Eco IV by 37ºC. But only enzyme Hae III showed to be efficient a molecular marker, to analysis genetic diversity of F. oxysporum f. sp. cubense to RAPD marker was realized the Polymerase Chain Reaction (PCR) using tenoligonucleotides follow arbitrary up, only seven oligonucleotides generated a total 44 bands polymorphic with fragments varying from 100 pb to 700 pb. The two techniques used in the study genetic diversity showed high genetic variability of fungal, don’t related to with geographical region where were colleted the isolates. / As helicônias são as flores mais cultivadas dentro da floricultura tropical no Nordeste brasileiro, devido a características como beleza, exoticidade, cores exuberantes e rusticidade, porém a produção de várias espécies vem sendo afetada pela murcha de fusário, causada pelo fungo de Fusarium oxysporum f. sp. cubense. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a diversidade genética existente entre os isolados de F.oxysporum f. sp. cubense, coletados em helicônias e bananeiras através da análise da região ITS do rDNA utilizando ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis) e marcadores do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Para a amplificação da região do rDNA, foram utilizados os primers ITS1 e ITS4 que foram digeridos pelas enzimas de restrição Hae III, Xho I, Hind III e Eco IV a 37ºC. Porém apenas a enzima Hae III, neste trabalho mostrou ser um marcador molecular eficiente,utilizada na técnica de ARDRA para estudos de diversidade genética dos isolados. Para o marcador RAPD realizou-se a Polymerase Chain Reaction (PCR) utilizando-se dez oligonucleotídeos de seqüência arbitrária, onde apenas sete oligonucleotídeos geraram um total de 44 bandas polimórficas com fragmentos que variaram de 100pb a 700pb. As duas técnicas utilizadas no estudo de diversidade genética evidenciaram alta variabilidade genética do fungo, não relacionada com as regiões geográficas onde foram coletados os isolados.
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Seleção para resistência à murcha-de-fusário em genótipos de algodoeiro

MACHADO, Litervaldo Pereira 26 February 2008 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:35:35Z No. of bitstreams: 1 Litervaldo Pereira Machado.pdf: 672024 bytes, checksum: 9d3735863709f5a0cf0be5231401e55c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:35:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Litervaldo Pereira Machado.pdf: 672024 bytes, checksum: 9d3735863709f5a0cf0be5231401e55c (MD5) Previous issue date: 2008-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The cotton wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum is one of the most important cotton diseases of the world. This disease is potentially destructive and had caused losses to cotton farms in the main cotton growing area in Brazil. The use of resistant cultivars is the main recommended practice to manage fusarium cotton wilt. In this study is described a simple, precise, and fast method to screen cotton germplasm for wilt resistance. By employing this method was identified new resistance sources of cotton genotypes to fusarium cotton wilt, as the genotypes FM 993, Stoneville LA 887, CNPA GO 2002-3778, and HS 26 among 64 accessions inoculated with a Brazilian pathogen population sample. / A murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f.sp. vasinfectum, é uma das principais doenças do algodoeiro em todo o mundo. Apesar da baixa incidencia da doença no cerrado, principal região produtora do Brasil, a murcha-de-fusário tem preocupado os produtores de algodão na região em virtude de ser potencialmente destrutiva. A tática de manejo da doença mais desejável é o uso de cultivares resistentes. Neste trabalho desenvolveu-se um método para seleção de genótipos de algodoeiro, que consistiu no plantio de sementes de algodoeiro em bandejas de plástico para germinação, que foram dispostas em casa-de-vegetação climatizada. As células das bandejas foram preenchidas com vermiculita esterilizada, e em cada célula foi plantada uma semente. Aos 5 e 7 dias após o plantio, depositou-se, em cada célula, uma suspensão de esporos. Foram testados 64 genótipos de algodoeiro com intuito de avaliar a sua resistência à murcha-de-fusário. O uso desse método possibilitou a identificação de novas fontes com alta resistência a murcha-de-fusário, como os genótipos FM 993, Stoneville LA 887,CNPA GO 2002-3778 e HS 26.
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Caracterização de solos da Região Agreste de Pernambuco quanto a supressividade à murcha-de-fusário do tomateiro

MACHADO, André Luiz Menezes 05 July 2012 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-17T12:44:24Z No. of bitstreams: 1 Andre Luiz Menezes Machado.pdf: 1193901 bytes, checksum: 3958c2853de30c17420bd30e2a594162 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T12:44:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Andre Luiz Menezes Machado.pdf: 1193901 bytes, checksum: 3958c2853de30c17420bd30e2a594162 (MD5) Previous issue date: 2012-07-05 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Tomato (Lycopersicon esculentum) crop yield has been limited by Fusarium wilt occurrence in the State of Pernambuco, Brazil. This disease, caused by Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici, drastically reduces the harvest period due to the early fruit fall. This work aimed to analyze the intensity of Fusarium wilt in tomato planted in 47 soil samples from the Agreste region of Pernambuco and to determine factors which could be related to either soil suppressivenes or conduciveness to this disease/pathogen. Bioassays were carried out using tomato (Santa Clara cv.) planted in artificially infested and non-infested soils, aiming to verify the existence of suppressive and conducive soils to the disease. In order to characterize factors which could be related to these phenomena, the samples were submitted to analysis for determination of field capacity, permanent wilting point, clay, silt and sand percentages (physical characteristics), macronutrients, microbialcarbon, carbon from organic matter and total nitrogen levels (chemical characteristics) and population levels of Fusarium oxysporum, Trichoderma spp., Bacillus spp. and Pseudomonas spp. of fluorescent group in the soils (microbiological characteristics). Then the influence of these factors upon each other as well as on the incidence of the disease was verified. Fusarium wilt was positively correlated (r = 0,32) to soil C/N ratio in the first bioassay, however the disease was negatively correlated (r = -0,35) to Ca level in the soil, for the second one, both artificially infested with the pathogen. CAF-1 and CAF-16 samples were considered suppresive, while CAF-2 and SAI-2 were conducive. Infested and non-infested bioassays were related to each other pointing out the occurrence of suppressiveness in the soils No significant correlations (P=0,05) between disease levelsand physical, chemical or microbiological soil characteristics were observed. Furtherstudies must be carried out to characterize soils suppressiveness and conduciveness to Fusarium wilt of tomato in the Agreste region, in order to effectivelly contribute for the development of an integrated disease management / No Estado de Pernambuco, a produtividade da cultura do tomateiro (Lycopersicon esculentum) tem sido limitada devido à ocorrência da murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici, que reduz drasticamente o período de colheita pela queda prematura dos frutos. O presente trabalho teve como objetivos analisar a intensidade da murcha-de-fusário em plantas de tomateiro cultivadas em 47 amostras de solos da região Agreste de Pernambuco e determinar os possíveis fatores associados à supressividade ou conducividade desses solos à doença. Foram realizados bioensaios com plantas de tomateiro (cv. Santa Clara) cultivadas nos solos com e sem infestação artificial com o patógeno, sendo constatada a existência de solos supressivos e conducivos à doença. Visando caracterizar os possíveis fatores envolvidos nesses fenômenos, os solos foram submetidos a análises para determinação das características físicas (capacidade de campo,ponto de murcha permanente e teores de areia, silte e argila), químicas (quantificação de macronutrientes, carbono microbiano, carbono orgânico total e nitrogêncio total) e microbiológicas (levantamento populacional de Fusarium oxysporum, Trichoderma spp., Bacillus spp. e Pseudomonas spp. do grupo fluorescentes). Foi analisada a interrelação entre os fatores e a influência sobre a supressividade e/ou conducividade desses solos à murcha-de-fusário. A incidência da doença se correlacionou positivamente (r = 0,32) com a relação C/N, no primeiro plantio, e negativamente (r = -0,35) com os teores de Ca no solo, no segundo plantio, ambos com infestção artificial. Os solos CAF-1 e CAF-16 foram considerados supressivos, enquano CAF-2 e SAI-2 foram conducivos. Os plantios com esem infestação correlacionaram-se, indicando a supressividade nos solos analisados. Não foram constatadas correlações significativas (P=0,05) dos níveis de doença com as demaiscaracterísticas químicas, físicas e microbiológicas dos solos. Novos estudos devem ser realizados para a caracterização dos mecanismos de supressividade ou conducividade dos solos da região Agreste à murcha-de-fusário do tomateiro, visando contribuir efetivamente para o manejo integrado da doença
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Supressividade de um solo a murcha-de-fusário do caupi e influência da doença no rendimento da cultura

ELOY, Arlinda Pereira 14 March 2003 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-21T12:45:37Z No. of bitstreams: 1 Arlinda Pereira Eloy.pdf: 539902 bytes, checksum: b58cec9ba237d600ff69b073b4bcf24c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T12:45:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arlinda Pereira Eloy.pdf: 539902 bytes, checksum: b58cec9ba237d600ff69b073b4bcf24c (MD5) Previous issue date: 2003-03-14 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum, reduces cowpea yield in Northeastern Brazil. This work aimed to characterize the nature and ability to transfer cowpea Fusarium wilt suppressiveness of a soil; to analyze populational dynamic of F. oxysporum f. sp. tracheiphilum and others soilborne microorganisms in two soils with different levels of suppressiveness, as well as to determine the relation of disease severity and the reductions of yield in cowpea seeds, in two plant seasons. In the nature and transfer of suppressiveness analyses the two soils samples used were previously classified as suppressive (CAC) and conducive (GOI) to cowpea Fusarium wilt, and did not slown indigenous populations of Fusarium oxysporum. When the samples were infested with the pathogen and sown with BR 17 Gurguéia (highly susceptible) and IPA 206 (moderately susceptible) cowpea cultivars, total populations of both fungi and bacteria, and Bacillus spp. were higherin rhizosphere of the suppressive soil samples than in the conducive ones. The suppressiveness was not related to a suppressive effect on the pathogen population. Soil sterilization did not change the suppressive capability, pointing out its abiotic origin. The ability suppressiveness transfer to a conducive soil was demonstrated only. In the suppressive soil, a significant influence of pH levels on Fusarium wilt severity was verified, which decreased in increasing pH. The inoculum density alone did not determine the severity of Fusarium wilt on plants cultivated in both soils, due to the influence of the efficiency of the inoculum, which was significantly lower in the suppressive soil. Aiming to determine the linkage of disease severity to the reduction of cowpea seed yield, cultivated during two different period of time, an essay was carried out using plots artificially infested with the pathogen. The first planting was made in April 2002, while the second one in October, in thesame year. At the harvest, yield for each plot was determined through the total weight of seed per plant. After harvesting the severity of Fusarium wilt was evaluated in all plants. There was no significant correlation between inoculum densities of the pathogen that was present in the soil before planting and the disease severity. The yield in the first planting period was higher than in the second one, in non-infested plots, what may have been due to the water stress to which the plants were submitted right before the blossom.Differences between the severity average levels and yield losses were not verified for both essays. Fusarium wilt severity ranged between 3.2 and 93.3%, while the yield losses ranged between 2.2 and 98.1%. / A murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. tracheiphilum, é responsável por grandes reduções de rendimento na cultura do caupi no Nordeste brasileiro. O trabalho teve como objetivos caracterizar a natureza e a capacidade de transferência de supressividade de um solo à murcha-de-fusário do caupi, analisar a dinâmica populacional de F. oxysporum f. sp tracheiphilum e outros microrganismos em dois solos com diferentes níveis de supressividade, bem como determinar a relação entre a severidade da doença e as reduções no rendimento de sementes de caupi em duas épocas de cultivo. Na análise da natureza e transferência da supressividade foram utilizadas amostras de dois solos, classificados previamente como supressivo (CAC) e conducivo (GOI) à murcha-de-fusário do caupi, nos quais não foram detectadas populações autóctones de F. oxysporum. Quando os solos foram infestados com o patógeno e semeados com as cultivares de caupi BR 17Gurguéia (altamente suscetível) e IPA 206 (moderadamente suscetível), as populações de fungos totais, bactérias totais e Bacillus spp. foram maiores na rizosfera no solo supressivo que no conducivo. A supressividade à doença não foi relacionada com um efeito supressivo sobre a população do patógeno. A esterilização não alterou a capacidade supressiva do solo, indicando sua natureza abiótica, bem como foi comprovada a capacidade de transferência da supressividade para o solo conducivo. Somente no solo supressivo foi constatada influência significativa dos níveis de pH na severidade da murcha-de-fusário, que decresceu proporcionalmente à elevação do pH. A eficiência do inóculo do patógeno foi significativamente inferior no solo supressivo. A análise da relação entre a severidade da doença e as reduções no rendimento de sementes de caupi cultivado em duas épocas, foiconduzida em parcelas artificialmente infestadas com o patógeno, em dois períodos de cultivo, sendo o primeiro plantio realizado em abril de 2002 e o segundo em outubro do mesmo ano. Na fase de colheita de cada época de plantio, foi determinado o rendimento por parcela, representado pelo peso total de sementes por planta. Após a colheita, a severidade da murcha-de-fusário foi avaliada em todas as plantas. Não foram constatadas correlações significativas entre as densidades de inóculo do patógeno detectadas nas parcelas antes do plantio e os níveis de severidade da doença. Nas parcelas não infestadas pelo patógeno, o rendimento no primeiro plantio foi superior ao do segundo plantio, o que pode ter sido conseqüência do estresse hídrico a que as plantas foram submetidas na fase de pré-floração. As reduções no rendimento de sementes foram influenciadas significativamente pelos níveis de severidade da doença. Não foram constatadas diferenças entre os níveis médios de severidade da doença e de perdas de rendimento nos dois períodos de cultivo. A severidade da murcha-de-fusário variou entre 3,2 e 93,3%, enquanto as perdas de rendimento entre 2,2 e 98,1%.
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Reação de genótipos de tomateiro às raças 2 e 3 de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici / Reaction of tomato genotypes to races 2 and 3 of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici

SOUZA, Leonardo Tavares de 18 February 2009 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:51:26Z No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza (1).pdf: 547012 bytes, checksum: 3ce24d8a338d375481b7eaa6393560c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:51:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leonardo Tavares de Souza (1).pdf: 547012 bytes, checksum: 3ce24d8a338d375481b7eaa6393560c4 (MD5) Previous issue date: 2009-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, is an important disease of tomato (Solanum lycopersicon L.) in Northeastern Brazil. Order to select genotypes with potential for use in the disease management, 60 strains were evaluated (F7 generation) from the crossing of access BHRS-2, 3 and Viradoro cultivar in relation to isolates from the physiologic races 2 and 3 of F. oxysporum f. sp. lycopersici. Seedlings 21 days old were inoculated using the method of cutting the roots and soak in the suspension of conidia of the pathogen. The evaluation was performed after 21 days, with the scale of grades ranging from 1 to 5. The genotypes were grouped into five classes of reaction. Most genotypes (73.3%) behaved as highly resistant to the race 2 isolate, while 45.0% were classified as susceptible and 28.3% as highly susceptible to the race 3 isolate. Only the L-1 strain showed high resistance reaction to both isolates. The stability of this line of resistance was evaluated on five isolates ofeach race (2 and 3). The line L-1 showed high levels of resistance to all race 2 isolates, therefore indicating high stability of resistance. However, for race 3 isolates, this strain showed three distinct classes of reaction, ranging from highly resistant to susceptible, indicating instability of resistance to this race. / A murcha-de-fusário, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, é uma importante doença do tomateiro (Solanum lycopersicon L.) no Nordeste brasileiro. Visando selecionar genótipos com potencial de utilização no manejo da doença, foram avaliadas 60 linhagens (geração F7) oriundas do cruzamento entre o acesso BHRS-2,3 e a cultivar Viradoro, em relação a isolados das raças fisiológicas 2 e 3 de F. oxysporum f. sp. lycopersici. Mudas com 21 dias de idade foram inoculadas pelo método do corte de raízes e imersão na suspensão de conídios do patógeno. A avaliação foi realizada após 21 dias, com o auxílio de escala de notas de 1 a 5, para agrupamento dos genótipos em cinco classes de reação. A maioria dos genótipos (73,3%) se comportou como altamente resistente ao isolado da raça 2, enquanto 45,0% foram classificados como suscetíveis e 28,3% como altamente suscetíveis ao isolado da raça 3. Somente a linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência aos dois isolados de ambas as raças. A estabilidade da resistência dessa linhagem foi avaliada em relação a cinco isolados de cada raça (2 e 3) do patógeno. A linhagem L-1 apresentou reação de alta resistência a todos os isolados da raça 2, evidenciado estabilidade da resistência. No entanto, em relação aosisolados da raça 3, essa linhagem apresentou três classes de reação distintas, variando de altamente resistente a suscetível, indicando instabilidade da resistência à essa raça.
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Uso de características espectrais para detecção precoce da antracnose e murcha-de-fusário em feijoeiro-comum / Use of spectral characteristics for early detection of anthracnose and fusarium wilt in common beans

Prado, Eduardo Vicente do 21 December 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-07-08T13:23:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 552394 bytes, checksum: 546f7fbd0d9e3696eb5deef8aa13a64c (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-08T13:23:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 552394 bytes, checksum: 546f7fbd0d9e3696eb5deef8aa13a64c (MD5) Previous issue date: 2015-12-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho pretende testar a hipótese de que é possível detectar precocemente doenças fúngicas em feijoeiro, utilizando reflectâncias foliares. Para isso, foram feitas análises diárias do comportamento espectral de folhas infectadas com os fungos Colletotrichum lindemuthianum ou Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, causadores da antracnose e murcha-de-fusário, respectivamente, construção de classificadores baseados em redes neurais artificiais para detecção de folhas infectadas, teste de modelos existentes (índices de vegetação) e seleção de comprimentos de onda mais representativos para a detecção das folhas infectadas e nível de conídios por mililitros, utilizando análise por componentes principais. Foram implantados dois experimentos em casa de vegetação. Os dois experimentos (um de antracnose e um de murcha-de-fusário) foram instalados em casa de vegetação, em Viçosa, Minas Gerais. As cultivares de feijão foram Rudá (carioca), RBS Supremo (preto) e Vermelhinho (vermelho). Nestes experimentos, as concentrações de conídios/mL foram: para a antracnose [zero (controle), 1,2 x 10 4 (baixa), 1,2 x 10 5 (média) e 1,2 x 10 6 (alta) conídios/mL]; e para a murcha-de-fusário [zero (controle), 1,0 x 10 4 (baixa), 1,0 x 10 5 (média) e 1,0 x 10 6 (alta) conídios/mL]. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado (DIC), com seis repetições para cada doença. Cada experimento foi repetido duas vezes. Medidas de reflectância hiperespectral foram obtidas por espectrorradiômetro com resolução de 1nm. A faixa útil de leitura utilizada foi entre 400 e 900 nm. Para as medidas das reflectâncias foliares utilizou-se uma sonda de contato, que possui uma lâmpada de halogênio integrada de 100 W, que foi ligada 90 minutos antes de cada coleta de dados para sua estabilização. A calibração do espectrorradiômetro utilizando a referência do branco, com placa de Spectralon, foi feita no início de cada coleta de dados e depois a intervalos regulares de 15 minutos. O tempo de medida de cada leitura foi ajustado para 544 ms, sendo que cada coleta de reflectância, em cada folha, foi a média de 10 leituras efetuadas pelo espectrorradiômetro. As severidades da antracnose e da murcha-de-fusário foram avaliadas, diariamente, por interpretação visual por pesquisador experimentado nesta atividade. Dos dados de reflectância foram retiradas cinco bandas espectrais: azul (440 – 510 nm), verde (520 – 590 nm), vermelho (630 – 685 nm), red edge (690 – 730 nm) e infravermelho próximo (760 – 850 nm). Análise por componentes principais foi aplicada aos dados dessas cinco bandas para uma redução da dimensão dos dados originais, com o primeiro componente principal de cada banda espectral foram gerados os valores dos escores, que serviram como vetores de entrada da rede neural artificial. A acurácia da classificação foi feita pelo índice Kappa. A discriminação das folhas infectadas e sadias obteve índice Kappa de 0,36 a 0,53 e exatidão global de 81,3% a 85,4%, um dia após a inoculação do fungo C. lindemuthianum e três dias antes dos primeiros sintomas da doença tornarem-se visíveis. Medidas de reflectâncias e índices de vegetação provenientes de reflectâncias hiper e multiespectrais foliares foram utilizados nos dois experimentos. Os índices de vegetação utilizados foram NDVI, DVI, GNDVI, MCARI, RDVI e TCARI. O classificador mais eficiente utilizou o índice DVI multiespectral como variável de entrada e dois neurônios na camada escondida. Esse classificador obteve coeficiente Kappa de 0,32 e exatidão global de 79,3%. O classificador detectou a antracnose três dias antes que os primeiros sintomas característicos se tornassem visíveis. Os resultados indicaram que o uso de dados hiperespectrais não apresentou melhora significativa na classificação, quando comparado com dados multiespectrais. O classificador não detectou folhas infectadas com o fungo F. oxysporum f. sp. phaseoli precocemente. O classificador se mostrou eficiente na discriminação, depois que os primeiros sintomas se tornaram visíveis. O classificador obteve coeficiente Kappa de 0,21 na classificação um dia após o surgimento dos primeiros sintomas característicos da doença. Os resultados nos dois experimentos indicaram que as mudanças nas respostas espectrais, relacionados com cada doença, são dependentes do comprimento de onda. O método de seleção de variáveis baseado em análise por componentes principais e os índices de vegetação com base em medidas hiperespectrais apresentaram melhor desempenho. A região espectral do red edge apresentou os comprimentos de onda que melhor discriminaram folhas infectadas para ambas as doenças. Os resultados das combinações dos índices DVI com GNDVI, MCARI ou TCARI mostraram maior sensibilidade na detecção de folhas infectadas e níveis de severidade para as duas doenças. / This paper aims to test the hypothesis that it is possible to detect early fungal diseases in bean plants using leaf reflectance. We made daily analysis of the spectral behavior of the leaves infected with Colletotrichum lindemuthianum or fungi Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli, causing anthracnose and fusarium wilt, respectively, construction of a classifier based on artificial neural networks for the detection of infected leaves, test existing models (Vegetation Index) and selecting the most representative wavelengths for the detection of infected leaves and severity level using principal component analysis. Two experiments were implanted in a greenhouse. The two experiments (one of anthracnose and a wilt fusarium) were installed in a greenhouse, located on the premises of the Agricultural Research Corporation of Minas Gerais - EPAMIG, Regional Unit Epamig Zona da Mata (UREZM) and on the premises of the Federal University of Viçosa (UFV), in Viçosa, Minas Gerais. The bean cultivars used in both experiments were Rudá (carioca trade group), RBS Supremo (black trade group) and Vermelhinho (red trade group). In these experiments, th three concentrations of conidia/mL were to anthracnose [zero (control), 1.2 x 10 4 (low), 1.2 x 10 5 (medium) and 1.2 x 10 6 (high) conidia/mL]; and for Fusarium wilt [zero (control), 1.0 x 10 4 (low), 1.0 x 10 5 (medium) and 1.0 x 10 6 (high) conidia / mL]. The experimental design was completely randomized (DIC), with four treatments and six repetitions for each disease. Each experiment was repeated twice. Hyperspectral reflectance measurements were obtained by spectroradiometer with a resolution of 1 nm. Useful range of used reading was between 400 and 900 nm. For reflectance measurements of leaf used a contact probe, which features an integrated halogen lamp of 100 W, which was connected 90 minutes before each data collection for stabilization. The calibration of the spectroradiometer using the white reference plate with Spectralon, was taken at the beginning of each data collection and later at regular intervals of 15 minutes. The measuring time for each reading was set to 544 ms, and each collection reflectance in each leaf was the average of 10 readings performed by the spectroradiometer. The severities of anthracnose and fusarium wilt were evaluated, daily, for visual interpretation by researcher experienced in this activity. From the reflectance data were taken five spectral bands: blue (440 - 510 nm), green (520 - 590 nm), red (630 - 685 nm), red edge (690 - 730 nm) and near infrared (760 - 850 nm). Principal component analysis was applied to the data of these five bands for a reduction in the size of the original data, with the first principal component of each spectral band were generated the score values, which served as input vectors of artificial neural network. The classification accuracy was taken by Kappa index. The discrimination of infected and healthy leaves obtained Kappa index 0.36 to 0.53 and overall accuracy of 81.3% to 85.4%, a day after the inoculation of the fungus C. lindemuthianum and three days before the first symptoms of disease become visible. Reflectance measurements and vegetation indices from hyper and multispectral reflectance leaf were used in both experiments. Vegetation indices used were NDVI, DVI, GNDVI, MCARI, RDVI and TCARI. The most efficient classifier used the DVI multispectral index as input variable and two neurons in the hidden layer. This classifier obtained Kappa coefficient of 0.32 and overall accuracy of 79.3%. The classifier detected anthracnose three days before the first characteristic symptoms become visible, for the three cultivars. The results indicated that the use of hyperspectral data showed no significant improvement in ranking when compared with multispectral data. The classifier does not detect the leave infected with the fungus F. oxysporum f. sp. phaseoli early. The classifier was efficient in discrimination after the first symptoms become visible. The classifier obtained Kappa coefficient value of 0.21 in the classification one day after the appearance of the first symptoms characteristic of the disease. The results of the two experiments indicated that the changes in spectral responses, associated with each disease, are dependent on the wavelength. The variable selection method based on principal component analysis and vegetation indices based on hyperspectral measurements showed better performance. The spectral region of red edge presented wavelengths that best discriminated infected leaves of both diseases. The results of the combinations of the indices DVI with DVI, MARI or TCARI showed greater sensitivity in detecting infected leaves and severity levels for the two diseases.
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Murcha de Fusarium em Heliconia spp.: ocorrência, variabilidade e resistência genética em espécies ornamentais cultivadas em Pernambuco, Alagoas e Sergipe

CASTRO, Neilza Reis 22 February 2017 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-24T15:23:14Z No. of bitstreams: 1 Neilza Reis Castro.pdf: 808047 bytes, checksum: 0e860ed49b31ae3ea85bc00fa7f214bd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-24T15:23:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Neilza Reis Castro.pdf: 808047 bytes, checksum: 0e860ed49b31ae3ea85bc00fa7f214bd (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Heliconias are flowers most cultivated inside world floriculture tropical in Brazil northeast, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f.sp. cubense. The present study had as objective to verify disease occurrence, to evaluate inoculation methods, characterize isolates considering morphology, aggressivety and genetical diversity, identify resistance sources, to verify efficiency of fungical filtrate in distinction of resistance and susceptibility and, at the end, involvement of structural mechanisms in pathogen-host interaction. The disease occurrence was evaluated in 28 farms at Pernambuco, Alagoas and Sergipe, Brazil. After isolates obtaintion, were tested inoculation methods by injection on bottom of pseudo stem, “meia lua” method, depositing inoculants around plant and “dipping”, where roots are wounded, immersed in suspension and replanted after. The plants were evaluated by external and internal symptoms, considering disease index with variation of 1 to 6. For morphological characters, isolates were incubated for five days in microculture, after observed with optical microscopy. Micro and macroconidia were measured by micrometric lents, with increase of 40X. The aggressivity of isolates was determined colony disks in stems of H. psittacorum cv. Alan carle detached and perfured. Stems were incubated in humid chamber during five days. The evaluation was according with vascular darking in stem diameter and was based in index disease with notes variation of 1 a 4. Genetical diversity was verified bymolecular analysis and vegetative compatibility agroupment technique. For molecular analysis, it was realized Polymerase Chain Reaction (PCR) using 37 oligonucleotides of Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) and eletrophoretical run in agarosis gel (2%). Binary data were analyzed by GENES 2.0 program. VCG was determined by nit mutants obtaintion, by complete medium (CM), potato-dextrose-clorate (PDC) and minimum medium (MM) sequence. For groupment formation Mutants were pared for complementary test by observation of heterocarion. For identification of resistance sources, 12 species of heliconia were inoculated by injection with isolate considering higher aggressivity and, after 40 days were done evaluations based on disease index. Fungical extract was obtained after fungus incubation during 24 days in Czapek medium, being used concentrations of 25, 50, 75 and 100%. Aliquots of 1mL were deposited on detached leaves of resistant plants of Heliconia psittacorum cv. Golden Torch, and of susceptible H.psittacorum cv. Alan Carle. Leaves inoculated were in humid chamber condition for 24, 48 and 72 hours. Structural mechanisms involved in interaction were observed by histological cuts on roots of used species at resistance sources studies and treatments wereinoculated and no inoculated with F.oxysporum f.sp. cubense. It was observed Fusarium wiltoccurrence in 88% of farms of tropical flowers production, where were obtained 31 isolates of F. oxysporum f.sp. cubense. Injection method showed be more efficient, with characteristics disease symptoms in lower time interval, at 36 days. Macroconidia showed variation of 25,56 μm x 3,7 μm to 33,92 μm x 3,39 μm and microconidia variation of 6,23 μm x 2,01 μm to 10,3 μm x 3,35 μm, dimension obtained for conidia were with variation for specie. It was observed distinction of three groups for aggressivity, where 15 isolates were considered intermediary aggressivity, eight lower aggressivity isolates. Methods used for genetical diversity showed genetical variability. At molecular analysis was formed five groups considering a genetical distance of 70% and genetical similarity varying of 0,51 to 0,94. At VCG study was observed formation of three groups, but 71% of isolates did not belong none group. Both of techniques determined high genetical diversity and not geographical correlation among isolates of the same area. Species H. bihai, H. psittacorum cv. Golden Torch, H. psittacorum cv. Golden Torch Adrian, H. rostrata, H. stricta Capri, H. psittacorum cv. Sassy and H. caribea were considered resistant to Fusarium wilt. Species moderally resistant were H. latispatha and H. wagneriana. Heliconia. psittacorum cv.Alan Carle and H. chartacea cv. Sexy Pink were susceptible while H. stricta Fire Bird was highly susceptible. Fungical filtrate concentrate in 50 % was the mostefficient of resistance distinction and susceptibility on cultivars. In structural mechanisms it was observed that there is not relation between diameter and lignification of celular wall with pathogen resistance, because in some resistant species did not show increase of diameter or lignin accumulation. / As helicônias são as flores mais cultivadas dentro da floricultura tropical no Nordeste brasileiro, porém sua produção vem sendo afetada pela murcha de fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f.sp. cubense. O presente estudo objetivou verificar a ocorrência da doença, avaliar métodos de inoculação, caracterizar os isolados quanto a morfologia, agressividade e diversidade genética, identificar fontes de resistência, verificar a eficiência do filtrado fúngico na distinção de resistência e suscetibilidade e, por fim, o envolvimento de mecanismos estruturais na interação patógeno-hospedeiro. A ocorrência da doença foi avaliada em vinte e oito propriedades nos estados de Pernambuco, Alagoas e Sergipe. Após a obtenção dos isolados, foram testados os métodos de inoculação de injeção na base do pseudocaule, método de “meia lua”, depositando-se o inóculo em torno da planta e “dipping”, onde as raízes das plantas são feridas, imersas na suspensão e depois replantadas. As plantas foram avaliadas pelos sintomas internos e externos, com base em escala de notas que variavam de 1 a 6. Para os caracteres morfológicos, os isolados foram incubados por cinco dias em microcultura e, em seguida, observados com auxílio de microscópio ótico. Os macroconídios e os microconídios foram medidos através da lente micrométrica com aumento de 40X. A agressividade dos isolados foi determinada por inoculação de discos de colônia em colmos de Heliconia psittacorum cv. Alan carle destacados e perfurados. Os colmos foram incubados sob condição de câmara úmida por cinco dias. A avaliação foi de acordo com o escurecimento vascular no diâmetro do colmo e baseou-se na escala denota variando de 1 a 4. A diversidade genética foi verificada através da análise molecular e da técnica de grupamento de compatibilidade vegetativa (VCG). Para análise molecular, realizou-se a Polymerase Chain Reaction (PCR) utilizando-se trinta e sete oligonucleotídeos de Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) e a corrida eletroforética em gel de agarose (2%). Os dados binários foram analisados pelo programa Genes 2.0. O VCG foi determinado através da obtenção de mutantes nit, pelas seqüências nos meios completo (MC), batata-dextrose-clorato (BDC) e meio mínimo (MM). Para a formação de grupamentos, os mutantes foram pareados para o teste de complementariedade através da observação da formação do heterocárion. Na identificação de fontes de resistência, doze espécies de helicônia foram inoculadas por injeção com o isolado considerado de maior agressividade e após quarenta dias foram feitas as avaliações baseada na escala de notas. O filtrado fúngico foi obtido após o cultivo do fungo por vinte e quatro dias em meio Czapeksendo utilizadas as concentrações de 25, 50, 75 e 100%. Alíquotas de 1 mL foram depositadas sobre a superfície de folhas destacadas das plantas resistentes de Heliconia psittacorum cv.Golden torch, e das suscetíveis H. psittacorum cv. Alan carle. As folhas inoculadas ficaram em condição de câmara úmida por 24, 48 e 72 horas. Os mecanismos estruturais envolvidos na interação foram observados por cortes histológicos nas raízes das espécies utilizadas no estudo de fontes de resistência e os tratamentos foram inoculados e não inoculados com F. oxysporum f.sp. cubense. Foi constatada a ocorrência da murcha de fusário em 88% das propriedades visitadas, de onde foram obtidos trinta e um isolados do fungo. O método de injeção mostrou ser o mais eficiente, apresentando os sintomas característicos da doença em menor intervalo de tempo, aos trinta e seis dias. Os macroconídios apresentaram variação de 25,56 μm x 3,7 μm a 33,92 μm x 3,39 μm e os microconídios a variação de 6,23 μm x 2,01 μm a 10,3 μm x 3,35 μm. Observou-se a distinção de três grupos quanto à agressividade, onde quinze isolados foram enquadrados com de agressividade intermediária, oito foram de maior agressividade e oito foram de menor agressividade. As técnicas utilizadas no estudo de diversidade genética apresentaram alta variabilidade genética. Na análise molecular formaram-se cinco grupos considerando uma distância genética de 70% e uma dissimilaridade genética variando de 0,51 a 0,94. No estudo de VCG observou-se a formação de três grupos, porém 71% dos isolados não fizeram parte de nenhum grupo. Ambas as técnicas determinaram uma alta diversidade genéticae a não correlação geográfica entre os isolados pertencentes a uma mesma região. As espécies Heliconia bihai, H. psittacorum cv. Golden Torch, H. psittacorum cv. Golden Torch Adrian, H. rostrata, H. stricta cv. Capri, H. psittacorum cv. Sassy e H. caribea foram consideradas resistentes à murcha de fusário. As espécies moderadamente resistentes foram H. latispatha e H. wagneriana. Heliconia psittacorum cv. Alan Carle e H. chartacea cv. Sexy Pink foram as suscetíveis enquanto que a H. stricta cv. Fire Bird foi altamente suscetível. O filtrado fúngico concentrado em 50% foi o mais eficiente na distinção de resistência e suscetibilidade nas cultivares. Na avaliação dos mecanismos estruturais observou-se que não há relação entre a espessura e lignificação da parede celular com a resistência ao patógeno, pois em algumas espécies resistentes não constatou-se o aumento de espessura ou acúmulo de lignina.
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Controle físico e biológico de Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi em gengibre / Physical and biological control of Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi in ginger

Domingues, Fernanda 19 April 2006 (has links)
O Amarelo ou Murcha de Fusarium, causado por Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi vem assumindo grande importância na cultura do gengibre devido à ausência de métodos eficientes de controle. Com os objetivos de testar a termoterapia associada ao tratamento químico e biológico para a obtenção de rizomas-semente sadios e avaliar a indução de supressividade do solo a Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi com a incorporação de casca de camarão, seis ensaios foram conduzidos. Para o tratamento térmico, foram utilizados rizomas infectados, com aproximadamente 5cm de comprimento. As relações tempo-temperatura utilizadas foram: 45°C por zero, 60, 120 e 180 minutos e 50°C por zero, dez e 20 minutos (ensaio 1 e campo); 50°C por zero, 30 e 60 minutos e 55°C por zero, 10 e 20 minutos (ensaio 2); 50, 55 e 60ºC por zero, 10 e 20 min (ensaio 3). As caldas para tratamento térmico foram constituídas por água, solução de tiofanato metílico e caldo fermentado por Bacillus subtilis. No experimento em laboratório, os rizomas foram inoculados artificialmente. Após uma semana, receberam o tratamento térmico a 45º C por 60, 120 e 180 minutos e a 50ºC e 55ºC por 10e 20 minutos. Após a termoterapia, segmentos de rizoma foram plaqueados, sendo avaliados pela contagem dos segmentos que apresentavam o crescimento do patógeno. Na coleta, foram avaliadas altura, peso da matéria fresca da parte aérea e produção, e realizado o plaqueamento da parte aérea, raiz e rizoma. Para verificar a possibilidade do uso de casca de camarão, o solo foi infestado com o isolado patogênico. Após uma semana, houve a incorporação da casca de camarão ao solo nas concentrações de 0; 2,5; 5; 7,5; 10; 15 e 20% (v/v). A população de Fusarium do solo e a comunidade de actinomicetos foram avaliadas semanalmente por diluição em série e plaqueamento. Após oito semanas da incorporação, foi realizado o plantio de um rizoma-semente de gengibre por vaso. Na coleta, a avaliação foi realizada da mesma maneira que para termoterapia. Através de todos os resultados obtidos nos cinco ensaios de termoterapia, verificouse a possibilidade de utilização da técnica com sucesso no auxílio ao controle da doença. As melhores combinações tempo/temperatura foram a 45ºC pelo tempo de 120 minutos ou a 55ºC por 20 minutos em todas as caldas. No teste com o uso da casca de camarão, houve uma diminuição da população de Fusarium e aumento da comunidade de actinomicetos nos solos que receberam a incorporação de casca. A adição de casca de camarão ao solo permite o plantio do gengibre em locais onde o patógeno esteja presente. / Yellow or Fusarium Wilt, caused for Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi comes assuming great importance in the culture of the ginger due to absence of efficient methods of control. With the objectives to test the thermotherapy associated with the chemical and biological treatment for the healthy attainment of ginger-seed and to evaluate the induction of soil suppressiveness to Fusarium oxysporum f. sp. zingiberi with the incorporation of shrimp peel, six experiments had been lead. For the thermal treatment, infested rhizome had been used, with approximately 5cm of length. The used relations time-temperature had been: 45°C for zero, 60, 120 and 180 minutes and 50°C for zero, ten and 20 minutes (experiment 1 and field); 50°C for zero, 30 and 60 minutes and 55°C for zero, 10 and 20 minutes (experiment 2); 50, 55 and 60ºC for zero, 10 and 20 min (experiment 3). Solutions for thermal treatment had been constituted by water, solution of thiophanate methylic and broth leavend for Bacillus subtilis. In the experiment in laboratory, rhizomes had been inoculated artificially. After one week, they had received the thermal treatment 45º C for 60, 120 and 180 minutes and 50ºC and 55ºC for 10 and 20 minutes. After the thermal treatment, segments of rhizomes had been placed in plates, being evaluated for the counting of the segments that presented the growth of the pathogen. In the collection, height, weight of the aerial part and production had been evaluated, and carried through plating of the aerial part, root and rhizome. To verify the possibility of the use of shrimp peel, the soil was infested with isolated the pathogenic one. After one week, had the incorporation of the peel of shrimp to the soil in the concentrations of 0; 2,5; 5; 7,5; 10; 15 and 20% (v/v). The population of Fusarium of the soil and the community of actinomycetes had been evaluated weekly by dilution in series and placed in plates. After eight weeks of the incorporation, the plantation of one rizome-seed of ginger for vase was carried through. In the collection, the evaluation was carried through in the same way that for thermotherapy. Through all the results gotten in the five experiments of thermotherapy, it was verified successfully possibility of use of the technique in the aid to the control of the illness. The best combinations time/temperature had been 45ºC for the time of 120 minutes or 55ºC per 20 minutes in all solutions. In the test with the use of the shrimp peel, it had a reduction of the population of Fusarium and increase of the community of actinomycetes in the soil that had received the incorporation from peel. The addition of peel of shrimp to the soil allows the plantation of the ginger in places where the pathogen is present.
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Caracterização de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. lactucae das regiões sul e sudeste do Brasil e identificação de acessos resistentes de alface / Characterization of Brazilian isolates of Fusarium oxysporum f. sp. lactucae and evaluation of lettuce accessions for resistance

CABRAL, Cléia Santos 17 February 2012 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-17T15:25:38Z No. of bitstreams: 1 Cleia Santos Cabral.pdf: 1106804 bytes, checksum: 14447df94770ff469bfc234136893b59 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T15:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cleia Santos Cabral.pdf: 1106804 bytes, checksum: 14447df94770ff469bfc234136893b59 (MD5) Previous issue date: 2012-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Fusarium wilt, caused by Fusarium oxysporum f. sp. lactucae (FOLac), is an important disease of lettuce in the world. This disease was reported in Brazil, recently. From 2008 to 2011 the laboratories of Plant Pathology of Embrapa Hortaliças (Embrapa Vegetable Crops), Sakata Seeds Sudamerica and Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (INCAPER) collected some FOLac isolates in states from the Southern and the Southeastern regions of Brazil. The isolates were identified as F. oxysporum by the morphological characteristics of conidia and conidiophores. Isolates were inoculated on lettuce plants, cultivars Elisa, Vera, and Red Salad Bowl, conditions in a greenhouse. Isolates were also inoculated on plants of others Asteraceae species (Cichorium endivia, Cichorium intybus, Sonchus oleraceus, Emilia sonchifolia, Bidens pilosa e Tagetes erecta) and others botanical families as (Solanum lycopersicum, Capsicum annuum, Nicotiana tabacum, Gossypium hirsutum, Phaseolus vulgaris e Ocimum basilicum). Lettuce cultivars Elisa and Vera were suscetible to all isolates while the cultivar Red Salad Bowl was resistant. All isolates were reisolated from diseased plants fulfilling the Koch‟s postulates. Others plant species were not susceptible to any isolate, proving that isolates belong to the species F. oxysporum f. sp. lactucae. The isolates were also inoculated in a differential set of cultivars comprising: „Patriot‟ (Susceptible to all races), „Costa Rica No. 4‟ (resistant to race 1) and „Banchu Red Fire‟ (resistant to race 2). Cultivars „Patriot‟ and „Banchu Red Fire‟ were susceptible while „Costa Rica No. 4‟ was resistant, confirming that all the isolates were race 1. Molecular analysis using a primer specific to race 1 isolates was performed using F. oxysporum f. sp. lycopersici (FOL) raça 3 and a non-pathogenic isolate as negative controls. DNAs of FOLac isolates were amplified by PCR and those of the negative controls were not, confirming the specificity of the primers and the presence of only the race 1 of FOLac in Brazil. In addition, it was used the Translation elongation factor 1-α region (tef-1α) for phylogenetic analysis between FOLac isolates races 1 and 2 and isolates of F. oxysporum. Comparison of the sequences obtained with the tef-1α confirmed the polyphyletic origin of the forma specialis lactucae and also showed a greater genetic variability among Brazilian isolates of FOLac race 1compared with isolates of the same race available in GenBank. After the isolates characterization, it was made a screening of 102 accessions for resistance to the isolate Fus-173 and it was selected 47 as highly resistant. After this, the selected genotypes were evaluated for the stability of resistance in three additional assays, using different FOLac race 1 isolates. In all three assays it was used a highly susceptible cultivar (Regina) as susceptible control. In the first assay, carried out in October 2011, it were used the isolates Fus-202 and Fus-205. In the second assay, carried out in November 2011, it were used the isolates Fus-219 and Fus-222. In the third assay, carried out in December 2011, it were used the isolates (Fus-207, Fus-209 e Fus-220). Inoculation was performed on 25 days old seedlings on greenhouse conditions. Seedlings were inoculated by cutting their roots and emerging them in spore suspension of pathogen. Evaluation was carries out 30 days after inoculation, using a grade scale varying from 0 (heath plants) to 4 (dead plants). Data were transformed in Disease Index (DI) submitted to a variance analysis and the media were compared by the Tukey‟s test (5%). Thirty two accessions were identified as having broad spectrum of resistance to different pathogen isolates in the four inoculation seasons. / A murcha de fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. lactucae (FOLac) é uma das doenças mais importantes da alface. Esta doença foi relatada recentemente no Brasil. Nos anos de 2008 a 2011 foram coletados isolados de FOLac nos Laboratórios de Fitopatologia da Embrapa Hortaliças, Sakata Seed Sudamerica Ltda e do Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural (Incaper). Estes eram provenientes de todos os estados das Regiões Sul e Sudeste do Brasil. A identificação foi feita observando-se as características morfológicas de conídios e conidióforos. Os isolados foram inoculados em plantas das cultivares Elisa, Vera e Red Salad Bowl, em condições de casa de vegetação. Os mesmos também foram inoculados em plantas de outras espécies de Asteraceae (Cichorium endivia, Cichorium intybus, Sonchus oleraceus, Emilia sonchifolia, Bidens pilosa e Tagetes erecta) e de outras famílias (Solanum lycopersicum, Capsicum annuum, Nicotiana tabacum, Gossypium hirsutum, Phaseolus vulgaris e Ocimum basilicum). Os isolados foram identificados como Fusarium oxysporum. As cultivares Elisa e Vera foram suscetíveis a todos os isolados e a Red Salad Bowl foi resistente. Efetuou-se o re-isolamento do patógeno, completando-se assim os Postulados de Koch. Nenhuma outra espécie de planta foi suscetível ao patógeno, confirmando a identificação como F. oxysporum f. sp. lactucae. Em seguida, os isolados foram avaliados quanto a sua virulência numa série de cultivares diferenciadoras de raças: Patriot (suscetível), Costa Rica No. 4 (resistente à raça 1) e Banchu Red Fire (resistente à raça 2). As cultivares Patriot e Banchu Red Fire comportaram-se como suscetíveis a todos os isolados, enquanto a cultivar Costa Rica No. 4 comportou-se como resistente. Concluiu-se que os isolados avaliados são da raça 1 de FOLac. Adicionalmente, foi feito um teste com primers específicos para a raça 1 de FOLac, utilizando como controles um isolado de F. oxysporum f. sp. lycopersici (FOL) raça 3 e um isolado não patogênico de F. oxysporum. O fragmento de DNA foi amplificado por PCR para os isolados de FOLac e não foi amplificado para o isolado de FOL e nem para o isolado não patogênico de F. oxysporum. Este resultado confirma a especificidade desse par de primers e a presença apenas da raça 1 de FOLac no Brasil. Além disso, foi utilizada a região do fator de elongação da tradução (tef-1α) para análise filogenética entre os isolados FOLac raças 1 e 2 e isolados de F. oxysporum. Comparação das seqüências obtidas com o tef-1α confirmou a origem polifilética da forma specialis lactucae e também observou-se uma maior variabilidade genética entre os isolados brasileiros de FOLac raça 1 comparados com isolados da mesma raça disponíveis no GenbanK. Posteriormente, 102 acessos (cultivares comerciais ou linhagens) foram avaliados, visando identificar fontes de resistência a FOLac e analisar a estabilidade da resistência de acessos promissores a diferentes isolados do patógeno. Inicialmente foi feita uma seleção preliminar, utilizando um isolado do patógeno (Fus-173). Em seguida, quarenta e sete acessos altamente resistentes mais uma testemunha suscetível (Regina), identificados na seleção preliminar, foram reavaliados para estabilidade da resistência ao FOLac raça 1, utilizando os isolados (Fus-202 e Fus-205) no mês de Outubro de 2011; isolados (Fus-219 e Fus-222) no mês de Novembro de 2011 e isolados (Fus-207, Fus-209 e Fus-220) no mês de Dezembro de 2011. A inoculação foi realizada em condições de casa de vegetação, pelo método de corte das raízes e imersão na suspensão de conídios do patógeno. A avaliação foi realizada após 30 dias, com auxílio de escala de notas variando de 0 (planta sadia) a 4 (planta morta). Os dados obtidos foram transformados em índice de doença (ID) e submetidos a uma análise de variância e comparação de médias pelo teste de Tukey (5%). Foram identificados trinta e dois acessos apresentando amplo espectro de resistência aos diferentes isolados do patógeno nas quatro épocas de inoculação.
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Resistência de acessos de quiabeiro à murcha-de-fusário / Identification of okra accessions with resistance to Fusarium wilt

AGUIAR, Frederick Mendes 24 February 2011 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-10T15:46:17Z No. of bitstreams: 1 Frederick Mendes Aguiar.pdf: 412210 bytes, checksum: 4f5f91c02dea9d844bac53a51c2cafa0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-10T15:46:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Frederick Mendes Aguiar.pdf: 412210 bytes, checksum: 4f5f91c02dea9d844bac53a51c2cafa0 (MD5) Previous issue date: 2011-02-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Okra is a vegetable crop with high nutritional value, being a rich source of vitamins and mineral salts. Fusarium wilt (caused by Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum – FOV) is one of the major field diseases of okra in tropical areas. In the present work, 53 okra accessions and the commercial cultivar Santa Cruz 47 were evaluated aiming to identify sources of resistance to Brazilian FOV isolates and to study the resistance stability of the selected accessions to different pathogen isolates. An initial screening was carried out with only one FOV isolate (Fus-194). In the second assay, thirty-three accessions identified in the first screening were re-evaluated in two assays (in two different seasons) using two FOV isolates (Fus-194 and Fus-201). The resistance evaluation was carried out with 21 day-old plantlets, using the root-dipping inoculation procedure, utilizing a spore suspension of 1x106 conidia/mL. The evaluation was done using a disease severity grade system with grades ranging from 0 to 4. These grades were used to generate a disease index that was employed for clustering the accessions according to their reaction to FOV. In the evaluation carried out in August (average temperature of 19,8°C) only 12 out the 32 accessions (i.e. 37%) were rated as having high to intermediate resistant response to Fus-194 isolate. Only 28% of the accessions were classified within the high to intermediate resistance cluster when using the Fus-201 isolate. In the assay carried out in October (higher temperatures) 72% of the accessions were classified as resistant and intermediate resistant to Fus-194 isolate, whereas 32% were resistant to isolate Fus-201. Our results indicated that the Fus-201 isolate was more aggressive than Fus-194. Comparative analysis of the assays indicated that the overall aggressiveness of the isolates was higher in August than in October assay. The accessions BR-2399 and BR-1449 as well as the commercial cultivar Santa Cruz 47 were the most promising accessions displaying higher levels of stable resistance against the two Brazilian FOV isolates.Okra is a vegetable crop with high nutritional value, being a rich source of vitamins and mineral salts. Fusarium wilt (caused by Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum – FOV) is one of the major field diseases of okra in tropical areas. In the present work, 53 okra accessions and the commercial cultivar Santa Cruz 47 were evaluated aiming to identify sources of resistance to Brazilian FOV isolates and to study the resistance stability of the selected accessions to different pathogen isolates. An initial screening was carried out with only one FOV isolate (Fus-194). In the second assay, thirty-three accessions identified in the first screening were re-evaluated in two assays (in two different seasons) using two FOV isolates (Fus-194 and Fus-201). The resistance evaluation was carried out with 21 day-old plantlets, using the root-dipping inoculation procedure, utilizing a spore suspension of 1x106 conidia/mL. The evaluation was done using a disease severity grade system with grades ranging from 0 to 4. These grades were used to generate a disease index that was employed for clustering the accessions according to their reaction to FOV. In the evaluation carried out in August (average temperature of 19,8°C) only 12 out the 32 accessions (i.e. 37%) were rated as having high to intermediate resistant response to Fus-194 isolate. Only 28% of the accessions were classified within the high to intermediate resistance cluster when using the Fus-201 isolate. In the assay carried out in October (higher temperatures) 72% of the accessions were classified as resistant and intermediate resistant to Fus-194 isolate, whereas 32% were resistant to isolate Fus-201. Our results indicated that the Fus-201 isolate was more aggressive than Fus-194. Comparative analysis of the assays indicated that the overall aggressiveness of the isolates was higher in August than in October assay. The accessions BR-2399 and BR-1449 as well as the commercial cultivar Santa Cruz 47 were the most promising accessions displaying higher levels of stable resistance against the two Brazilian FOV isolates. / O quiabo é uma hortaliça de alto valor alimentício e uma importante fonte de vitaminas e sais minerais. Dentre os problemas fitossanitários que ocorrem no quiabeiro, a murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum (FOV) é uma das mais importantes por proporcionar grandes perdas na produção. Este trabalho objetivou avaliar, em condições de casa de vegetação, a cultivar comercial Santa Cruz 47 e uma coleção de 53 acessos de quiabeiro, visando identificar fontes de resistência a FOV e analisar a estabilidade da resistência de acessos promissores a diferentes isolados do patógeno. Inicialmente foi conduzida uma triagem utilizando um único isolado de FOV (Fus-194). Em uma segunda etapa, trinta e dois acessos obtidos na primeira etapa, foram reavaliados para resistência ao FOV utilizando dois isolados (Fus-194 e Fus-201), em duas épocas do ano. A inoculação foi realizada em mudas com 21 dias após semeadura, pela imersão das raízes em suspensão de conídios (1x106 conídios/mL) do patógeno. A avaliação da severidade da doença foi realizada usando uma escala de notas, variando de 0 a 4. As notas foram transformadas em índice de doença (ID) e agrupadas em classes de acordo com a reação da doença. Na segunda etapa do trabalho realizado no mês de agosto de 2010 (temperatura média de 19,8°C), dos 32 acessos avaliados, 12 (37%) foram considerados altamente resistentes a medianamente resistentes ao Fus-194. Para o isolado Fus-201 apenas 28% foram classificados dentro dessas duas classes. No ensaio realizado no mês de outubro (temperatura média de 25°C) referente à segunda etapa desse trabalho, 72% dos acessos foram considerados medianamente a altamente resistentes ao Fus-194. Neste ensaio, 32% dos acessos foram resistentes ao isolado Fus-201. Os resultados demonstraram uma maior agressividade do isolado Fus-201 em relação ao isolado Fus-194. Os níveis de agressividade dos isolados testados foram maiores no ensaio realizado no mês de agosto do que em outubro. Os acessos BR-2399, BR-1449 e a cultivar Santa Cruz 47 apresentaram resistência estável aos dois isolados do patógeno tanto na etapa preliminar, quanto nas duas épocas de avaliação da segunda etapa do trabalho.

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