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O objetivo deste estudo foi avaliar se a estrutura da comunidade da meiofauna, das famílias e dos gêneros de Nematoda apresentam alterações devido à atividade antrópica na área próxima a Estação Antártica Brasileira (CF), em comparação com um controle (BP). A densidade média (ind.10cm-²) da meiofauna total variou entre 7028 (? 1529) e 16245 (? 12282) nos 20-30 m e entre 1569 (? 928) e 7088 (? 10338) nos 50-60 m, corroborando os valores altos já descritos para a zona rasa antártica. Nematoda foi dominante (>90%), seguido de Nauplii e Copepoda. 65 gêneros e 3 subfamílias de Nematoda foram encontrados, pertencentes a 24 famílias. Daptonema, Halailamus, Dichromadora, Sabatieria, Aponema e Sphaerolaimus foram dominantes nas duas profundidades, mas tiveram densidades mais altas nos 20-30 m relacionadas à maior biomassa de clorofila a. Não foram identificadas alterações na estrutura da comunidade da meiofauna, das famílias ou gêneros de Nematoda que pudessem ter sido causados por impacto antrópico. Porém, a riqueza e a diversidade das famílias e dos gêneros de Nematoda foram menores em CF, o que sugere um possível impacto, sendo importante a continuidade do monitoramento e a inclusão de outras áreas de referência. O nível taxonômico de família foi o mais apropriado para um estudo de monitoramento da zona costeira rasa antártica, visando o melhor custo-benefício. / The aim of this study was to verify if meiofauna, Nematoda family and genera community structure show modification caused by human activities at the Brazilian Antarctic Station (CF), in relation to a reference area (BP). Mean meiofauna densities ( ind.10 cm-²) ranged from 7028 (? 1529) to 16245 (? 12282) at 20-30 m and from 1569 (? 928) and 7088 (? 10338) at 50-60 m, being high as already described for the Antarctic coastal zone. Higher densities at 20-30m were correlated to more chlorophyll a and sand. Nematoda were dominant (>90%) followed by Nauplii and Copepoda. 65 genera and 3 subfamilies of Nematoda were found, belonging to 24 families. Daptonema, Halailamus, Dichromadora, Sabatieria, Aponema and Sphaerolaimus were dominant at both depths, but had higher densities at 20-30 m, which were correlated to higher chlorophyll a biomasses. Analysis for all levels of taxonomic resolution, separated the samples between depths, but not between areas, so differences caused by human impact were not detected. Number of genera ranged from 12 to 34 and diversity from 1.57 to 4.22 bits/ind, both being higher at 50-60m at BP, suggesting that an impact might have occurred, so monitoring should continue and be extended to other control areas. Identification of Nematoda to family level would be enough to evaluate environmental impact of the coastal antarctic zone.

Um importante componente dos ecossistemas marinhos bentônicos é a meiofauna, que apresenta altas densidades em sedimentos de plataforma continental e reflete rapidamente as condições ambientais prevalescentes. Dentre os organismos da meiofauna, o grupo mais abundante é Nematoda, altamente diverso e que pode ser utilizado, assim como a meiofauna, como ferramenta no monitoramento de impactos naturais e antropogênicos no ambiente. O presente trabalho está inserido no projeto institucional do Instituto Oceanográfico da USP denominado \"Dinâmica do Ecossistema de Plataforma da Região Oeste do Atlântico Sul\" (DEPROAS-PRONEX), que teve como objetivo geral o estudo dos mecanismos físicos que possibilitam a penetração sazonal da ACAS na plataforma continental e do impacto que essa penetração têm sobre os processos biológicos do ecossistema em duas áreas: ao largo de Cabo Frio e de Ubatuba. Os objetivos específicos deste estudo foram: Analisar a composição e estrutura da comunidade meiobentônica, em nível de grandes grupos, as associações das famílias e gêneros dos Nematoda nas plataformas interna e externa ao largo de Cabo Frio e Ubatuba, bem como suas relações com as variáveis ambientais, em especial com o tipo de sedimento, biomassa de fitopigmentos e características das massas d\'água. As coletas foram realizadas em duas profundidades (40 e 100 m), no verão e inverno de 2001 ao largo de Cabo Frio e inverno de 2001 e verão de 2002 em Ubatuba. Foi utilizado um amostrador tipo caixa, ou \"box-corer\", de 30 x 30 cm, em duplicata. Tubos amostradores de 4,9 cm2 de área superficial e 10 cm de altura foram utilizados para a coleta da meiofauna, em duplicata, por box-corer. A meiofauna foi triada e separada em grandes grupos e foram identificados cerca de 200 nematódeos por estação. As maiores densidades da meiofauna foram encontradas aos 40 m de Ubatuba no verão (2001,7±703,1) e aos 100 m de Cabo Frio no verão (1010,0±959,0), o que pode ter sido conseqüência do aumento da produção primária pelágica, devido à intrusão da ACAS, e sua sedimentação em Cabo Frio e Ubatuba, além do aporte terrígeno na plataforma interna de Ubatuba. A composição genérica dos Nematoda foi relacionada principalmente à granulometria. A plataforma interna de Cabo Frio, com sedimento arenoso e dinâmica constante, foi caracterizada pela dominância do gênero Daptonema (Xyalidae), enquanto que a externa no verão pelo gênero Aponema (Microlaimidae), associado aos fitodetritos e sedimentos finos, e no inverno Sabatieria (Comesomatidae) foi dominante. As estações de Ubatuba caracterizaram-se pelos gêneros Terschellingia (Linhomoeidae) e Sabatieria (Comesomatidae) na plataforma interna, no inverno e verão. Aos 100 m Desmoscolex (Desmoscolecidae) e Sabatieria (Comesomatidae) foram os gêneros mais abundantes no inverno e verão. As maiores diversidades de gêneros foram encontradas nas estações de Ubatuba, o que sugere que a diversidade esteja mais relacionada com sedimentos arenosos e heterogêneos. Quanto aos grupos tróficos, os depositívoros seletivos e não seletivos tiveram maior ocorrência nos locais de estudo. As análises multivariadas comprovaram que análise no nível de gêneros permitiu uma melhor caracterização ambiental das áreas de estudo, quando comparado às análises no nível de famílias ou grupos da meiofauna. / Meiofauna is an important component of the marine benthic ecosystem as its densities are usually high in continental shelf sediments and respond quickly to environmental changes. Nematoda is the dominant group among meiofauna organisms, is highly diverse and can be used, as well as meiofauna, as a tool for natural and anthropogenic impacts monitoring. This study is part of the institutional project \" Dynamic of the Continental Shelf Ecosystem of the South Atlantic West Region\". The objective of this project is to study the physics mechanisms that provide the South Atlantic Central Water (ACAS) penetration in the continental shelf and the impact that it causes on the biological processes in two locations: Cabo Frio and Ubatuba. The objectives of this study were: to analyze the composition and structure of the meiofauna community, the associations of families and genus of Nematoda on the inner and outer shelf of Cabo Frio and Ubatuba, as well as its relations to the environmental variables, especially with sediment grain size, phytopigments biomass and water masses characteristics. Samples were taken on two depths (40 and 100 m), in the summer and winter of 2001 in Cabo Frio and in the winter of 2001 and summer of 2002 in Ubatuba. Two 30 x 30 cm boxcorer were used, and from each one two samples were taken with a 4.9 cm2 superficial area and 10 cm height tube corer, for the meiofauna sampling. Meiofauna was separated in higher groups and 200 Nematoda were identified per station. The highest meiofauna densities were found on 40 m during summer in Ubatuba (2001.7±703.1) and on 100 m during summer in Cabo Frio (1010.0±959.0). These benthic responses could be a consequence of the increase of primary pelagic production, in consequence of the intrusion of SACW (South Atlantic Central Water), and its sedimentation in Cabo Frio and Ubatuba, as well as the terrigenous input on the Ubatuba inner shelf. The Nematoda genus composition was related mainly to sediment grain size. Cabo Frio inner shelf, with sandy sediments and constant dynamics was characterized by the dominance of the genera Daptonema (Xyalidae), while outer shelf in the summer in Cabo Frio by the genera Aponema (Microlaimidae), that was associated with phytodetritos and fine sediments. During winter Sabatieria (Comesomatidae) was dominant. Ubatuba stations were characterized by Terschellingia (Linhomoeidae) and Sabatieria (Comesomatidae) on the inner shelf, in summer and winter times. At 100 m depth Desmoscolex (Desmoscolecidae) and Sabatieria (Comesomatidae) were the most abundant genus during winter and summer. The highest genus diversities were observed in Ubatuba, which suggests that diversity may be related to sandy, heterogeneous sediments. Regarding the trophic groups, selective and non-selective deposit feeders were the most abundant on the study area. The multivariate analyses proved that analyses on a genus level allowed a better environmental characterization of the study area, when compared to analyses on the level of family or meiofauna groups.

Um importante componente dos ecossistemas marinhos bentônicos é a meiofauna, que apresenta altas densidades em sedimentos de plataforma continental e reflete rapidamente as condições ambientais prevalescentes. Dentre os organismos da meiofauna, o grupo mais abundante é Nematoda, altamente diverso e que pode ser utilizado, assim como a meiofauna, como ferramenta no monitoramento de impactos naturais e antropogênicos no ambiente. O presente trabalho está inserido no projeto institucional do Instituto Oceanográfico da USP denominado \"Dinâmica do Ecossistema de Plataforma da Região Oeste do Atlântico Sul\" (DEPROAS-PRONEX), que teve como objetivo geral o estudo dos mecanismos físicos que possibilitam a penetração sazonal da ACAS na plataforma continental e do impacto que essa penetração têm sobre os processos biológicos do ecossistema em duas áreas: ao largo de Cabo Frio e de Ubatuba. Os objetivos específicos deste estudo foram: Analisar a composição e estrutura da comunidade meiobentônica, em nível de grandes grupos, as associações das famílias e gêneros dos Nematoda nas plataformas interna e externa ao largo de Cabo Frio e Ubatuba, bem como suas relações com as variáveis ambientais, em especial com o tipo de sedimento, biomassa de fitopigmentos e características das massas d\'água. As coletas foram realizadas em duas profundidades (40 e 100 m), no verão e inverno de 2001 ao largo de Cabo Frio e inverno de 2001 e verão de 2002 em Ubatuba. Foi utilizado um amostrador tipo caixa, ou \"box-corer\", de 30 x 30 cm, em duplicata. Tubos amostradores de 4,9 cm2 de área superficial e 10 cm de altura foram utilizados para a coleta da meiofauna, em duplicata, por box-corer. A meiofauna foi triada e separada em grandes grupos e foram identificados cerca de 200 nematódeos por estação. As maiores densidades da meiofauna foram encontradas aos 40 m de Ubatuba no verão (2001,7±703,1) e aos 100 m de Cabo Frio no verão (1010,0±959,0), o que pode ter sido conseqüência do aumento da produção primária pelágica, devido à intrusão da ACAS, e sua sedimentação em Cabo Frio e Ubatuba, além do aporte terrígeno na plataforma interna de Ubatuba. A composição genérica dos Nematoda foi relacionada principalmente à granulometria. A plataforma interna de Cabo Frio, com sedimento arenoso e dinâmica constante, foi caracterizada pela dominância do gênero Daptonema (Xyalidae), enquanto que a externa no verão pelo gênero Aponema (Microlaimidae), associado aos fitodetritos e sedimentos finos, e no inverno Sabatieria (Comesomatidae) foi dominante. As estações de Ubatuba caracterizaram-se pelos gêneros Terschellingia (Linhomoeidae) e Sabatieria (Comesomatidae) na plataforma interna, no inverno e verão. Aos 100 m Desmoscolex (Desmoscolecidae) e Sabatieria (Comesomatidae) foram os gêneros mais abundantes no inverno e verão. As maiores diversidades de gêneros foram encontradas nas estações de Ubatuba, o que sugere que a diversidade esteja mais relacionada com sedimentos arenosos e heterogêneos. Quanto aos grupos tróficos, os depositívoros seletivos e não seletivos tiveram maior ocorrência nos locais de estudo. As análises multivariadas comprovaram que análise no nível de gêneros permitiu uma melhor caracterização ambiental das áreas de estudo, quando comparado às análises no nível de famílias ou grupos da meiofauna. / Meiofauna is an important component of the marine benthic ecosystem as its densities are usually high in continental shelf sediments and respond quickly to environmental changes. Nematoda is the dominant group among meiofauna organisms, is highly diverse and can be used, as well as meiofauna, as a tool for natural and anthropogenic impacts monitoring. This study is part of the institutional project \" Dynamic of the Continental Shelf Ecosystem of the South Atlantic West Region\". The objective of this project is to study the physics mechanisms that provide the South Atlantic Central Water (ACAS) penetration in the continental shelf and the impact that it causes on the biological processes in two locations: Cabo Frio and Ubatuba. The objectives of this study were: to analyze the composition and structure of the meiofauna community, the associations of families and genus of Nematoda on the inner and outer shelf of Cabo Frio and Ubatuba, as well as its relations to the environmental variables, especially with sediment grain size, phytopigments biomass and water masses characteristics. Samples were taken on two depths (40 and 100 m), in the summer and winter of 2001 in Cabo Frio and in the winter of 2001 and summer of 2002 in Ubatuba. Two 30 x 30 cm boxcorer were used, and from each one two samples were taken with a 4.9 cm2 superficial area and 10 cm height tube corer, for the meiofauna sampling. Meiofauna was separated in higher groups and 200 Nematoda were identified per station. The highest meiofauna densities were found on 40 m during summer in Ubatuba (2001.7±703.1) and on 100 m during summer in Cabo Frio (1010.0±959.0). These benthic responses could be a consequence of the increase of primary pelagic production, in consequence of the intrusion of SACW (South Atlantic Central Water), and its sedimentation in Cabo Frio and Ubatuba, as well as the terrigenous input on the Ubatuba inner shelf. The Nematoda genus composition was related mainly to sediment grain size. Cabo Frio inner shelf, with sandy sediments and constant dynamics was characterized by the dominance of the genera Daptonema (Xyalidae), while outer shelf in the summer in Cabo Frio by the genera Aponema (Microlaimidae), that was associated with phytodetritos and fine sediments. During winter Sabatieria (Comesomatidae) was dominant. Ubatuba stations were characterized by Terschellingia (Linhomoeidae) and Sabatieria (Comesomatidae) on the inner shelf, in summer and winter times. At 100 m depth Desmoscolex (Desmoscolecidae) and Sabatieria (Comesomatidae) were the most abundant genus during winter and summer. The highest genus diversities were observed in Ubatuba, which suggests that diversity may be related to sandy, heterogeneous sediments. Regarding the trophic groups, selective and non-selective deposit feeders were the most abundant on the study area. The multivariate analyses proved that analyses on a genus level allowed a better environmental characterization of the study area, when compared to analyses on the level of family or meiofauna groups.

O objetivo deste estudo foi avaliar se a estrutura da comunidade da meiofauna, das famílias e dos gêneros de Nematoda apresentam alterações devido à atividade antrópica na área próxima a Estação Antártica Brasileira (CF), em comparação com um controle (BP). A densidade média (ind.10cm-²) da meiofauna total variou entre 7028 (? 1529) e 16245 (? 12282) nos 20-30 m e entre 1569 (? 928) e 7088 (? 10338) nos 50-60 m, corroborando os valores altos já descritos para a zona rasa antártica. Nematoda foi dominante (>90%), seguido de Nauplii e Copepoda. 65 gêneros e 3 subfamílias de Nematoda foram encontrados, pertencentes a 24 famílias. Daptonema, Halailamus, Dichromadora, Sabatieria, Aponema e Sphaerolaimus foram dominantes nas duas profundidades, mas tiveram densidades mais altas nos 20-30 m relacionadas à maior biomassa de clorofila a. Não foram identificadas alterações na estrutura da comunidade da meiofauna, das famílias ou gêneros de Nematoda que pudessem ter sido causados por impacto antrópico. Porém, a riqueza e a diversidade das famílias e dos gêneros de Nematoda foram menores em CF, o que sugere um possível impacto, sendo importante a continuidade do monitoramento e a inclusão de outras áreas de referência. O nível taxonômico de família foi o mais apropriado para um estudo de monitoramento da zona costeira rasa antártica, visando o melhor custo-benefício. / The aim of this study was to verify if meiofauna, Nematoda family and genera community structure show modification caused by human activities at the Brazilian Antarctic Station (CF), in relation to a reference area (BP). Mean meiofauna densities ( ind.10 cm-²) ranged from 7028 (? 1529) to 16245 (? 12282) at 20-30 m and from 1569 (? 928) and 7088 (? 10338) at 50-60 m, being high as already described for the Antarctic coastal zone. Higher densities at 20-30m were correlated to more chlorophyll a and sand. Nematoda were dominant (>90%) followed by Nauplii and Copepoda. 65 genera and 3 subfamilies of Nematoda were found, belonging to 24 families. Daptonema, Halailamus, Dichromadora, Sabatieria, Aponema and Sphaerolaimus were dominant at both depths, but had higher densities at 20-30 m, which were correlated to higher chlorophyll a biomasses. Analysis for all levels of taxonomic resolution, separated the samples between depths, but not between areas, so differences caused by human impact were not detected. Number of genera ranged from 12 to 34 and diversity from 1.57 to 4.22 bits/ind, both being higher at 50-60m at BP, suggesting that an impact might have occurred, so monitoring should continue and be extended to other control areas. Identification of Nematoda to family level would be enough to evaluate environmental impact of the coastal antarctic zone.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:31:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_fernando_maia_filho.pdf: 887775 bytes, checksum: 3c3975ac6a38b09b73992b6becd71cd9 (MD5) Previous issue date: 2012-03-08 / The high prevalence of Toxocara canis in dogs, associated with environmental contamination and the resistance of eggs in the soil increase the exposure of humans front of the parasite. Moreover, the difficulties of implementation of control measures and disinfection, allied to the problems inherent to chemical control, justifying the need for alternative measures that assist in controlling parasitoses transmitted by the soil. Among these measures, we highlight the use of nematophagous fungi.This study had the objective of valuating the activity of in vitro ovicide of isolated fungi based on soil collected in public places in the city of Pelotas, RS, Brazil. Samples of soil from ten localities were sowed in agar water 2% with antibiotics and incubated at 25ºC for 21 days. The ovicide activity of the fungal isolates obtained was tested in vitro in five repetitions for each analyzed insulator. An mL of an embryonated egg suspension of Toxocara canis (103 eggs) was poured over the fungal cultures grown in agar water for 10 days. At intervals of 7, 14 and 21 days, 100 eggs were removed from each plaque and evaluated in optical microscopy. Acremonium spp., Aspergillus spp., Bipolaris spp., Fusarium spp., Gliocladium spp., Mucor spp. and Trichoderma spp. were isolated from the soil. In this order, a significant ovicidal type 3 effect was observed in Trichoderma spp., Fusarium complex solani and Acremonium spp.. Trichoderma spp. presented an ovicidal effect on the 14th day of fungus-egg interaction. The other fungal genera tested presented a type 2 effect. The results obtained showed the presence of nematophagous fungi parasites of eggs in soil in the Southern region of Brazil and demonstrated the ovicidal activity of Trichoderma spp. and Fusarium complex solani on T. canis eggs. / As altas prevalências de Toxocara canis em cães associada à frequente contaminação ambiental e a resistência dos ovos no solo, incrementam a exposição do homem à este parasito. Além disso, as dificuldades de implantação de medidas de controle e desinfecção, aliadas aos problemas inerentes ao controle químico, justificam a necessidade de medidas alternativas que auxiliem no controle das parasitoses transmitidas pelo solo. Dentre essas medidas, destaca-se a utilização de fungos nematófagos. O presente estudo objetivou avaliar a atividade ovicida in vitro de fungos isolados a partir de solos coletados em áreas públicas do município de Pelotas, RS, Brasil. Amostras de solo de dez locais foram semeadas em agar água 2% com antibióticos e incubadas a 25ºC por 21 dias. A atividade ovicida dos isolados fúngicos obtidos foi testada in vitro, em cinco repetições para cada isolado analisado. Um mL de uma suspensão de ovos embrionados de Toxocara canis (103 ovos) foi vertido sobre as culturas fúngicas crescidas em agar água por 10 dias. Em intervalos de 7, 14 e 21 dias, 100 ovos eram retirados de cada placa e avaliados em microscopia óptica. A partir do solo foram isolados Acremonium spp., Aspergillus spp., Bipolaris spp., Fusarium spp., Gliocladium spp, Mucor spp.e Trichoderma spp. Nesta ordem, efeito ovicida tipo 3 significativo foi observado em Trichoderma spp., Fusarium complexo solani e Acremonium spp.. Trichoderma spp apresentou efeito ovicida ao 14º dia de interação fungo-ovo. Os demais gêneros fúngicos testados apresentaram efeito tipo 2. Os resultados obtidos demonstram a presença de fungos nematófagos parasitos de ovos em solos da região sul do Brasil e evidenciam a atividade ovicida do gênero Trichoderma spp. e Fusarium complexo solani sobre ovos de T. canis.

Orientador: Alvimar José da Costa / Banca: Katia Denise Saraiva Bresciani / Banca: Welber Daniel Zanetti Lopes / Banca: Gilson Pereira de Oliveira / Banca: Carlos Noriyuki Kaneto / Resumo: As perdas potenciais pelas infecções por nematódeos em bovinos no Brasil foram estimadas em $7,1 bilhões por ano. Indiscutivelmente, deve-se fazer o uso criterioso das drogas disponíveis, assim como o desenvolvimento de novas formulações, para enfrentar a problemática da resistência anti-helmíntica. O método atualmente empregado para o teste de medicamentos é invasivo e, portanto, enfrenta dificuldades em se adequar aos novos modelos em bem-estar animal. Outras técnicas utilizadas são as contagens de ovos de nematódeos por grama de fezes (OPGs) pré e pós-tratamento, que apresentam resultados não confiáveis para este propósito. Com fins científicos, emprega-se a PCR convencional ou a PCR em tempo real, técnicas quali e semi- quantitativa, respectivamente. O objetivo deste estudo foi avaliar a relação entre a comunidade parasitária das larvas em terceiro estádio após coproculturas e a composição do bioma de nematódeos adultos presentes no trato gastrointestinal. As proporções das larvas foram avaliadas por meio da tradicional morfologia e o novo método de sequenciamento "Nemabioma", enquanto as contagens e classificações dos vermes adultos foram realizadas pelos clássicos métodos morfológicos. Neste experimento, utilizaram-se sete bovinos mestiços, naturalmente infectados, entre oito e 12 meses de idade. Contagens de OPG foram realizadas a cada dois dias, do 14 ao 28 dia do estudo. As culturas de larvas foram realizadas utilizando-se as amostras de fezes colhidas nos dias 14, 1... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The potential detrimental effects of cattle nematode infections in Brazil have been estimated at USD 7.1 billion a year. It is undeniable, the necessity of appropriate drug use and the development of new formulations, to face the problematic of anthelmintic drug resistance. The current method for testing new drugs is both invasive and represents threats against recent animal welfare models. Other approaches currently used are Fecal Egg Counts (FECs) pre and post treatment, which are not reliable. Occasionally, conventional and real-time PCR are employed, which are non-quantitative and semi-quantitative techniques respectively. The objective of this study was to evaluate the relationship between the parasite community present in cultured fecal samples, and the composition of adult worms present in the gastrointestinal tract. Species proportions in larvae were assessed with the traditional morphological analysis and a recently developed "Nemabiome" sequencing assay, while the adult species proportions were assessed with classical morphological approaches. To this end, an experiment using natural infected bovines was designed. Seven crossbred calves were selected from eight to 12 months of age. FECs were done every 2 days, from the 14th to the 28th day of the study. Cultures of larvae were performed using fecal samples extracted on days +14, +16, +20, +24 and +28. The L3's were always extracted after 10 days of culture. The animals were necropsied on day +28 for collection and s... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Thesis (M. Sc.)--University of Adelaide, 1984. / Includes bibliographical references (leaves 111-137).

Thesis (Ph.D.)--Tufts University, 2001. / Adviser: Juliet A. Fuhrman. Submitted to the Dept. of Biology. Includes bibliographical references (leaves 42-54). Access restricted to members of the Tufts University community. Also available via the World Wide Web;

Thesis (M.Sc. (Tropical Medicine))--Mahidol University, 1976.