Orientador: Wanderley Dias da Silveira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T17:38:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Stehling_ElianaGuedes_D.pdf: 4279256 bytes, checksum: 060a8c82e3c0a43c76a25979525911e0 (MD5) Previous issue date: 2003 / Doutorado

Orientador: Anete Pereira de Souza / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T21:21:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paula_DeboraPires_D.pdf: 9756766 bytes, checksum: 96b35bf286242ed96ae379799d977a9a (MD5) Previous issue date: 2004 / Doutorado

Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T01:59:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sabha_Maricene_D.pdf: 7748224 bytes, checksum: 94bd8f8eb3f281211fe9f8362420a2fb (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: O fungo Crinipellis perniciosa Stahel (Singer), ataca tecidos meristemáticos do cacaueiro Theobroma cacao, causando anormalidades como hiperplasia e hipertrofia nos tecidos infectados, que resultam na doença conhecida como vassoura-de-bruxa. Nas regiões produtoras de cacau do Estado da Bahia, a vassoura-de-bruxa tem causado grandes danos econômicos e esforços têm sido deflagrados com o intuito de estabelecer um plano de controle da doença. O patógeno é pouco estudado e genes envolvidos na interação planta-patógeno e responsáveis pela patogenicidade são desconhecidos. O projeto genoma de C. perniciosa (www.lge.ibi.unicamp.br/vassoura) foi criado para auxiliar a elucidar os aspectos inerentes à patogenicidade e crescimento do fungo, que permitirão conhecer o organismo de forma global e assim ajudar a entender as estratégias que ele utiliza no ataque à planta. A compreensão desses mecanismos poderá definir os caminhos para controla-lo. O conhecimento do genoma não identificará, de imediato, os genes envolvidos com patogenicidade. Portanto, torna-se necessário complementar os dados do genoma com análise da expressão para determinar quando os diferentes genes são expressos. Uma das formas de analisar os mecanismos de fitopatogenicidade é identificar os genes diferencialmente expressos durante a interação planta-hospedeiro. A metodologia de microarray permite a análise da expressão de milhares de genes simultaneamente, possibilitando a identificação e verificação dos níveis de expressão sob diferentes condições. No presente trabalho, pretendeu-se identificar os mRNAs especificamente induzidos na fase saprotrófica do fungo C. perniciosa durante interação com extratos de frutos de T. cacao susceptível. Os resultados apresentados conclusivamente demonstram que o monitoramento comparativo de genes expressos diferencialmente, resultante da interação patógeno-hospedeiro, é uma estratégia viável para identificar respostas de genes no patosistema C. perniciosa - T. cacao. Além disso, este estudo relata melhorias na metodologia existente que contribuirão para projetos futuros nesta área de pesquisa / Abstract: The fungus Crinipellis perniciosa Stahel (Singer), attacks meristematic tissues of the cocoa tree Theobroma cacao, causing abnormalities like hyperplasia and hypertrophy in the infected tissues, which results in the disease known as witches¿ broom. In the cocoa producing regions in the State of Bahia, witches¿ broom has caused major economic loss and efforts have been made to establish a plan to control the disease. The pathogen is not well studied and genes involved in the hostplant interaction and responsible for pathogenicity are unknown. C. perniciosa genome project (www.lge.ibi.unicamp.br/vassoura) was created to help elucidate aspect inherent to fungal pathogenicity and growth, which will allow a better understanding of this organism in a global manner and thus help us to understand the strategies it uses to attack the plant. The comprehension of these mechanisms could help to define ways to control this pathogen. The knowledge of the genome sequence will not immediately identify the genes related to pathogenicity. Therefore, it is necessary to complement the genome data with expression analysis to determine when the different genes are expressed. One of the ways to analyze the mechanisms of phytopathogenicity is to identify differentially expressed genes during the host-plant interaction. Microarray methodology allows expression analysis of thousands of genes simultaneously, enabling the identification and verification of expression levels under different conditions. In this work, the objective was to identify mRNAs specifically induced in the saprotrophic phase of the fungus C. perniciosa during the interaction with extracts from susceptible T. cacao fruits. Results presented here conclusively show that comparative monitoring of differentially expressed genes, resulting from the host-plant interaction, is a viable strategy to identify gene responses in the C. perniciosa ¿ T. cacao pathosystem. Furthermore, this study reports improvements to the existing methodology that will contribute to future projects in this area of research / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:02:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O primeiro evento para a penetração em algumas espécies de Colletotrichum, inicia com a adesão do conídio e germinação na superfície da planta hospedeira, produzindo tubo germinativo e então formando o apressório, que penetra diretamente na cutícula. Estudos anteriores têm identificado em Colletotrichum gloeosporioides, genes denominados cap, que são unicamente expressos durante a formação do apressório depois de 4 horas de exposição do conídio à presença da cera da cutícula do abacate (Persea gratissima). O objetivo deste trabalho foi amplificar o gene da patogenicidade cap20 e analisar a variação deste gene intraespecificamente em isolados de C. gloeosporioides provenientes de diferentes hospedeiros. A variabilidade genética foi acessada usando marcadores de RFLPITS e intron (primer EI1) e pelo método de agrupamento UPGMA. Primers para o gene cap20 foram construídos a partir de seqüências selecionadas do GenBank (National Center of Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov) utilizando o programa Primer 3. A análise dos dendrogramas revelou que o marcador RFLP-ITS foi capaz de separar as espécies C. gloeosporioides, C. acutatum e C. sublineolum. Em outra mão, esses resultados também mostraram que o primer EI1 de Intron Splice Site evidenciou maior variabilidade genética que o RFLP-ITS, porém não separou as espécies. Os primers construídos nomeados P1 e P2 para o gene cap20 foram eficientes para amplificar C. gloeosporioides (exceto para cinco isolados de manga e um isolado de pimentão), C. boninense, C. dematium, C. capsici e C.gossypii var. cephalosporioides, mas não houve amplificação para C. graminicola, C. acutatum, C. sublineolum e C. coccodes, indicando que este gene pode apresentar diferenças na estrutura entre os isolados de C. gloeosporioides relacionada ao hospedeiro e que este gene também está presente nas outras espécies citadas de Colletotrichum. A digestão com a enzima MspI para os isolados de C. gloeosporioides que apresentaram amplificação não evidenciou diferenças na estrutura do gene cap20

Orientador: Urara Kawazoe / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-23T03:19:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moretti_MariaElianeBoock_M.pdf: 6658300 bytes, checksum: 84bc1e43c52f14e0aaf0a4748b6b938e (MD5) Previous issue date: 1997 / Resumo: Este trabalho teve como objetivos a obtenção de duas populações precoces de Eimeria maxima, sua caracterização quanto a patogenicidade e patologia e o estudo da sensibilidade desses isolados a oito medicamentos anticoccidianos de uso comercial freqüente na indústria avícola. Para a obtenção de isolados precoces, oocistos obtidos no campo (isolados "Cu" e "L") foram inoculados sucessivamente em aves sadias, para a coleta dos primeiros oocistos eliminados. Através desse processo foram feitas 14 passagens para o isolado E. maxima "Cu", obtendo-se a diminuição do período pré-patente para a eliminação dos primeiros oocistos, de 129h 45' para 114h 30'. Para o segundo isolado, foram realizadas 18 passagens, obtendo-se a redução do período pré-patente de 127h para 103h 30'. As gerações parenta I e precoce desses dois isolados foram comparadas quanto a patogenicidade, através da inoculação de oocistos em aves sadias, observando-se o ganho de peso, escore de lesão e produção de oocistos. No isolado "Cu" não foi observada diferença significativa entre as gerações parental e F10 porém, no isolado "L" houve diminuição da patogenicidade entre as gerações parental e F14. O estudo histopatológico não mostrou diferença nas lesões intestinais entre as duas gerações do isolado "Cu", mas houve diminuição das lesões na geração F14 do isolado "L" em relação à geração parenta!. O teste de sensibilidade mostrou que o isolado "Cu" foi sensível a quatro medicamentos e parcialmente resistente a outros quatro, avaliados através do índice anticoccidiano cujos parâmetros usados foram: percentagem de sobrevivência das aves inoculadas, escore de lesão intestinal, ganho de peso e produção de oocistos nas aves. O isolado "L" mostrou-se sensível apenas a um dos medicamentos testados, parcialmente resistente a quatro e resistente a três outros medicamentos. Os oocistos precoces obtidos no presente trabalho, parecem ter atingido uma estabilidade quanto ao período pré-patente no isolado "Cu", ao passo que o isolado "L" parece ainda não ter atingido uma estabilidade. No entanto, ambos os isolados apresentaram uma redução na produção de oocistos, quando comparados às respectivas gerações parentais. A confirmação da atenuação dessas gerações precoces, num estudo futuro, caracterizará os isolados como aceitáveis para o uso como vacinas vivas atenuadas, no controle da coccidiose aviária / Abstract: The objective of the present study was to obtain precocious lines from two field isolates of Eimeria maxima "Cu" and "L" as well as to compare the pathogenicity and pathology between parent and precocious lines of each isolate. Sensitivity tests of these isolates against eight most common anticoccidial drugs were performed to characterise the isolates. The precocious lines were obtained by repeated selection for the first oocysts to appear in the infected chickens. After 14 passages of E. maxima "Cu" oocysts in chickens, the pre-patent period for the first oocysts was reduced from 129h 45' to 114 hours and after 18 passages of E. maxima "L" oocysts in chickens this period was reduced from 127 to 103h 30'. The precocious line F10 was as pathogenic as the parent strain of E. maxima "Cu" while the precocious line F14 was less pathogenic than the parent strain of E. maxima "L" usíng as criteria weight gain, lesion score and oocyst production. The histopathologic observations for both isolates confirmed the degree of patogenicity of the isolates. The evaluation of the sensitivity tests of isolates "Cu" and "L" against eight drugs using the anticoccidial index as a criteria showed that E. maxima "Cu" was sensitive to four drugs and partially resistant to four others while E. maxima "L" was sensitive to one drug, partially resistant to four and resistant to three other drugs. Stability of precocious lines for pre-patent period of first oocysts in chickens seems to be reached for both strains studied by the observation in reduction of oocyst production when compared to the parent strains. The aUenuation of these precocious lines will be studied in future and once this character is confirmed the lines will be used as a vaccine for coccidiosis contraI / Mestrado / Parasitologia / Mestre em Ciências Biológicas

Este trabalho se propôs a comparar isolados de Colletotrichum da antracnose e da ramulose do algodoeiro. Sob o ponto de vista cultural, patogênico e serológico. Testes de avaliação de crescimento em meios mínimos ou em BDA com cloreto de trifenil tetrazólio e de sensibilidade a fungicidas mostraram que a ramulose e mais sensível ao cloreto de trifenil tetrazólio e ao Thiram, além de nutricionalmente deficiente. Testes de inoculação em sementes e em ápices destacados de algodoeiro cv.IAC 20 evidenciaram que isolados de Colletotrichum da ramulose são menos eficientes em causar "damping-off" do que os de antracnose mas os únicos capazes de causar necrose em ápices destacados de plantas jovens. Testes serológicos de dupla difusão em ágar e imunofluorescencia indireta feitos usando antissoro preparado contra conídios dos dois fungos, revelaram menor numero de antígenos miceliais em isolados da ramulose. Em vista das diferenças detectadas e os critérios taxonômicos vigentes, sugere-se que os isolados de Colletrichum da antracnose e da ramulose sejam considerados raças 1 e 2 respectivamente de Colletotrichum gloeosporioides f.Sp. Gossypii existindo a possibilidade da ocorrência de outras raças / not available

Foram realizadas comparacões morfológicas auxanográficas e patogênicas entre Colletotrichum gossypii e Colletotrichum gossypii var. Cephalosporioides. No aspecto morfológico foram estudados: o número de núcleos nos conídios, a morfologia de apressórios e o tamanho dos conídios. Quanto à auxanográfia foram estudados os requerimentos nutricionais. A patogenicidade foi avaliada em maçãs destacadas e em plântulas de dois cultivares de algodoeiro: Nu-15 (suscetível a ramulose) e IAC-17 (mais resistente a ramulose), através da inoculação dos fungos. Ambos fungos apresentam conídios uninucleados e apressórios morfologicamente semelhantes. Quanto ao tamanho de conídios os fungos são diferentes. O agente da ramulose pode apresentar conídios de comprimento maior que 16 µm enquanto que todos os conídios do agente da antracnose são menores que 16 µm. Também auxanograficamente os dois fungos são diferentes: o colletotrichum causador da ramulose e deficiente em asparagina ou ácido aspártico, enquanto que o causador da antracnose e auxoautotrófico para fatores de crescimento. Quanto a patogenicidade em maçãs destacadas de IAC-17 e em plântulas de Nu-15 e IAC-17 os fungos comportaram-se de maneira semelhante. Em maçãs destacadas do cultivar Nu-15 o fungo causador da antracnose foi mais patogênico que o causador da ramulose / Comparaisons among Colletotrichum gossypii and Colletotrichum gossypii var. cephalosporioides cultures in the morphological, auxanographic and pathogenic aspects were perfomed. The number of nuclei in the conidia, the morphology of the apressoria and the size of the conidia were evaluated in the morphological aspect. Nutritional requirements were studied in the auxanographic aspect. The pathogenicity was evaluated on detached bolls and seedlings of two cultivars of cotton plant: Nu-15 and IAC-17. Conidia of both fungi are uninucleated and the morphology of their appressoria is similar. Regarding the size of the conidia the fungi are different. The fungus responsible for the ramulosis can have conidia with a lenght larger than 16 µm while all the others conidia from the agent that produces anthracnosis are smoller than 16 µm. Auxanographically the two fungi are also different: The fungus responsible for the ramulosis is deficient in asparagin or aspartic acid, while the responsible for the anthracnosis is auxoautotrophic for gowth factors. The fungi were similar in pathogenicity in detached bolls of the IAC-17 and seedlings of Nu-15 and IAC-17 of cotton. The fungi were different in pathogenecity in detached bolls of Nu-15. The fungus responsible for the anthracnosis was more pathogenic than the responsible for the ramulosis in this cultivar

Neste estudo, 144 amostras de sementes de arroz oriundas de áreas de produção de sementes dos estados do Rio Grande do Sul, Santa Catarina e Goiás, cultivadas em três safras, foram analisadas quanto a presença de Fusarium. Colônias de espécies do complexo Fusarium graminearum (FGSC) foram identificadas em 43% das 110 amostras da safra 2011/12 com incidência média de 0,7% e colônias de outras espécies do gênero em 77% das amostras com incidência média de 3,6%. Quinze amostras com variada incidência de Fusarium, apresentaram concentração média da micotoxina deoxinivalenol (DON) de 5.750 μg/kg. Em uma coleção de 144 isolados purificados de Fusarium obtidos das sementes de arroz infectadas, foram identificadas, por métodos moleculares (genotipagem multilocus e similaridade com sequencias do gene TEF1-alfa), quatro complexos de espécies: F. fujikuroi (FFSC) F. chlamydosporum (FCSC), F. graminearum (FGSC) e F. incarnatum-equiseti (FIESC). Dentre os 96 isolados do FGSC, a espécie-genótipo tricoteceno predominante foi F. asiaticum-NIV (68/96), seguido de F. graminearum-15-ADON (14/96), F. cortaderiae-NIV (13/96) e um F. meridionale-NIV. Isolados de F. asiaticum oriundos do arroz e F. graminearum oriundos do trigo, quando cultivados em grãos de arroz, produziram a micotoxina predita pela genotipagem, NIV e 15-ADON, respectivamente No entanto os isolados de F. asiaticum do trigo produziram DON e seus acetilados, discordando da genotipagem (NIV). Nos ensaios de patogenicidade em plantas de arroz, o isolados de F. asiaticum do arroz mostraram-se mais agressivos do que F. asiaticum e F. graminearum do trigo. Já no trigo, os isolados F. asiaticum do arroz foram os menos agressivos. Esses resultados suportam a hipótese que adaptação ao hospedeiro pode influenciar na distribuição das espécies do complexo. Na análise de tricotecenos nas sementes dos ensaios de patogenicidade no arroz, somente os isolados de F. chlamydosporum produziram DON (800 a 900 μg/kg). Nas inoculações em trigo, somente os isolados F. asiaticum oriundo do trigo produziram a micotoxina nivalenol. Os resultados deste estudo contribuem para o aumento do conhecimento sobre a diversidade de espécies de Fusarium em arroz e alertam sobre a alta contaminação com tricotecenos por um complexo de espécies toxigênicas. / In this study, 144 samples of rice seeds obtained from seed-growing areas of the states of Rio Grande do Sul, Santa Catarina and Goiás, during three seasons, were assessed for the presence of Fusarium. Fungal colonies resembling species of the Fusarium graminearum species complex (FGSC) were identified in 43% of 110 samples from the 2011/12 season with mean incidence of 0,7%. Also, colonies of other species of the genus were found in 77% of the samples with mean incidence of 3,6%. Fifteen seed samples that showed various Fusarium incidence levels had high levels of deoxynivalenol (DON) mycotoxin (mean = 5.750 μg/kg) and its acetylates. In a collection of 144 purified isolates obtained from the infected seeds, 19 species grouped in four species complexes were identified using molecular analysis (multilocus genotyping targeting FGSC and sequences of TEF1-alfa): F. fujikuroi species complex (FFSC), F. chlamydosporum species complex (FCSC), F. graminearum species complex (FGSC) and F. incarnatum-equiseti species complex (FIESC). Among the four phylogenetic species-trichothecene genotype within the FGSC, F. asiaticum-NIV was the most prevalent (68/96), followed by F. graminearum-15-ADON (14/96), F. cortaderiae-NIV (13/96) and one F. meridionale-NIV. F. asiaticum isolates from rice and F. graminearum from wheat produced the same trichothecene predicted by the PCR assay, NIV and 15-ADON, respectively Nevertheless, F. asiaticum isolates from wheat did not produce NIV as predicted by the genotyping. In the pathogenicity assay in rice, F. asiaticum isolates from rice were more aggressive than F. asiaticum and F. graminearum isolates from wheat. In wheat, F. asiaticum from rice were the least aggressive isolates. The trichothecene analysis in seeds from the pathogenicity assays showed that only isolates of the FCSC produced DON (800 a 900 μg/kg). In wheat, only F. asiaticum from wheat produced NIV. Results of this study contributes to expand the knowledge on the diversity of Fusarium affecting rice seeds and raise concern about the high contamination of rice with trichothecenes possibly produced by a complex of toxigenic species. Also, it corroborates with the hypothesis that host preference possibly regulates distribution of species within the FGSC complex.

No presente trabalho faz-se uma revisão da literatura sobre pneumonia por Legionella pneumophila e se comparam estes dados com a série da autora, que se compõe de 10 casos esporádicos desta pneumonia, adquiridos na comunidade, ocorridos no perÍodo entre outubro de 1983 e maio de 1989. Todos os pacientes desta série eram do sexo masculino e de cor branca, com idade variando entre 36 e 71 anos. Os sintomas mais freqüentes foram febre alta, calafrios, cefaléia, tosse seca e mialgias. A hipótese diagnóstica baseou-se nos dados clínicos, radiológicos e laboratoriais. Em todos os casos o critério de comprovaçao diagnóstica foi a imunofluorescência indireta para Legionella. Salienta-se a importância do reconhecimento desta doença, que ainda apresenta um baixo Índice de suspeição em nosso meio. Procura-se tanto ressaltar os principais achados clínicos e radiológicos como também contribuir com orientações diagnósticas e terapêuticas. ApÓs a análise dos dados obtidos no trabalho, a autora concluiu que: 1. Os achados da série nao diferem daqueles descritos na literatura. 2. A casuística é restrita para o traçado de um perfil da doença no Rio Grande do Sul. 3. Quadros pneumônicos com má resposta clÍnica à penicilina ou derivados, associados a lesões radiolÓgicas com rápida mutabilidade, devem chamar a atenção para este diagnóstico. 4. A infreqüência deste diagnóstico em nosso meio deve-se ao baixo Índice de suspeição. Logo, a divulgação de informações sobre a doença pode resultar em substancial acréscimo ao registro de casos. / In the present work a review is made on the 1iterature about pneumonia by Legione11a pneumophi1a and the data are compared with the series presenteà by the author, composed of 10 sporadic cases of this pneumonia, acquired in the community, October, 1983 and May, 1989. between A11 the patients of this group were ma1e, caucasian, age varying from 36 to 71. The most frequent symptoms were high fever, chills, headache, dry cough and myalgia. The diagnostic hypothesis was baseà on laboratory, radiological and clinicai data. For all the cases, the criterion for diagnostic comprovation was indirect immunofluorescence for Legionella. The importance of the recognition of this disease s emphasized for it still shows a very low 1evel of suspicion in Rio Grande do Sul. The author looks for to ernphazise the main clinicai and radiological findings as well as contributes with diagnostics and therapeutical orientations. After the analysis of the data obtained in the present work the author concludes that: 1. The findings of this series does no differ from those described in the 1iterature. 2. The casuistic is too restricted to draw a profile of the disease in Rio Grande do Sul. 3. Pneumonias with bad clinicai response to penicillin or its derivatives, associated with radiologic lesions with rapid mutability shall call the attention for this diagnosis. 4. The low frequency of this diagnosis in our country is due to the low index of suspicion. Thus, the divulgation of information about the disease could result in substantial increase in the record of new cases.

Este trabalho foi conduzido com o objetivo de gerar dados de resistência a agentes antimicrobianos de Salmonella Enteritidis (SE) isoladas de amostras clínicas e do ambiente criatório de aves, nos anos de 1999, 2000 e 2001, de cortes de frango, no ano de 1996, ambos na região Sul, bem como de carcaças de frango, nos anos de 2004 e 2005, na região Nordeste, detectar mutação no gene gyrA da região determinante de resistência a quinolonas das cepas que apresentaram resistência ao ácido nalidíxico e fagotipá-las. Realizou-se também a ribotipagem de 28 cepas de SE isoladas de carcaças resfriadas de frango no ano de 2004, na região Sudeste. Cento e dezesete cepas de SE foram submeitdos foram submetidas a testes de sensibilidade a agentes antimicrobianos e os resultados indicaram que 84,6% (99/117) das cepas de Salmonella Enteritidis apresentaram resistência a um ou mais agentes antimicrobianos, sendo que o maior percentual está entre as cepas isoladas de carcaças resfriadas de frango, 100% (17/17), seguidas pelas isoladas de cortes de frango, 85,7% (18/21) e das de amostras clínicas e de ambiente criatório de aves, 81% (64/79). Cepas com diferentes níveis de resistência foram encontradas para ampicilina (0,8%), canamicina (1,7%), ciprofloxacina (1,7%), enrofloxacina (10,2%), gentamicina (14,5%), estreptomicina (16,2%), ácido nalidíxico (35,9%), nitrofurantoína (47%) e tetracicilna (59%). Nenhuma das 117 cepas de Salmonella Enteritidis foi resistente ao cloranfenicol, norfloxacina e polimixina B. Dentre as 99 amostras de SE que apresentaram resistência, 66,6% (66), foram resistentes a dois ou mais agentes antimicrobianos. Trinta e três cepas (33,3%), foram resistentes somente a um agente antimicrobiano, 16 a tetraciclina, 12 a nitrofurantoína, três ao ácido nalidíxico, uma a estreptomicina e uma a gentamicina. Para detectar mutação no gene gyrA da região determinante de resistência a quinolonas, 42 cepas de SE que apresentaram resistência ao ácido nalidíxico foram submetidas a reação em cadeia da polimerase e sequenciamento. Das 42 cepas, 30 (71,4%) apresentaram algum tipo de mutação no gene gyrA da região determinante de resistência a quinolonas. As alterações gênicas ocorreram nos aminoácidos dos codons Gly-81 (3,5%), Asp-82 (3,5%), Ser-83 (31%) ou Asp-87 (62%). As mutações continham alterações de Gly para Asp (n: 1) no codon 81, Asp para Asn (n: 1) no codon 82, Ser para Phe (n: 9) no codon 83 e Asp para Tyr (n: 9) ou Asn (n: 9) no codon 87. Uma amostra apresentou uma inclusão do aminoácido prolina entre os codons 56 e 57. A fagotipificação de 116 cepas de SE apresentou que 68,9% (80/116) pertencem ao fagotipo (FT) 4, 15,5% (18/116) ao FT 4a, 12,2% (14/116) ao FT 1, 0,9% (1/116) ao FT6, 0,9% (1/116) ao FT 6a, 0,9% (1/116) ao FT 7 e 0,9% (1/116) ao FT 7a. Quando leva-se em consideração a origem dos isolados, observamos que nas SE isoladas de amostras clínicas e ambientais criatório de aves, 56,4% pertencem ao FT 4, 21,8% ao FT 4a, 17,9% ao FT 1, 1,3% ao FT 6, 1,3% ao FT 6a e 1,3% ao FT 7a. Nas amostras isoladas de carne cortes de frango, o FT 4 predomina com 95,2% (20/21) e 4,8% (1/21), pertencem ao FT 7. Nos isolados de carcaças resfriadas de frango 94,1% são do FT 4 e 5,9% (1/17) do FT 4a. A caracterização por ribotipagem foi realizada utilizando-se o RiboPrinter® system (DuPont), e apresentou quatro diferentes ribotipos, sendo que o mais comum foi o 25-S-1 (82,1%), seguido pelo 29-S-5 (10,7%) e 28-S-5 e 38-S-3 com 3,5% cada um. Baseados nos dados do presente estudo, conclui-se que: houve uma elevada percentagem de cepas de Salmonella Enteritidis resistente a um ou mais agentes antimicrobianos, indicando que levantamentos contínuos são necessários na indústria avícola e que existe a necessidade de um uso responsável dos agentes antimicrobianos, baseado na compreensão da ecologia da resistência, da transmissão da bactéria resistente e de genes de resistência, da relação entre o uso do antibiótico e aumento da resistência e de um conhecimento de intervenções efetivas; Que assim como em outros trabalhos amostras de S. Enteritidis resistentes ao ácido nalidíxico, isoladas no Brasil, também apresentam mutação no gene gyrA, da região determinante de resistência a quinolonas; Que o FT 4 foi o predominante e que entre as cepas de S. Enteritidis isoladas de aves e de seu ambiente criatório existe uma maior diversidade de fagotipos quando comparada as isoladas de carcaças de frango; E que ao avaliarmos os dados gerados pela ribotipagem observamos um baixo grau de diversidade gênica entre as cepas de Salmonella Enteritidis utilizadas no presente estudo. / This work aimed to evaluate the antimicrobial resistance of Salmonella Enteritidis (SE) isolated from clinical and environmental poultry samples, during the years of 1999, 2000 and 2001, broiler chicken parts, in 1996, both in Southern Brazil, broiler chicken carcasses, during the years 2004 and 2005, in Northeastern Brazil, detect mutations in the gyrA gene from nalidixic acid resistant and identify their phage type. Also, 28 SE strains isolated during the year 2004 in Southeastern Brazil were characterized by ribotyping. The antimicrobial resistance test was performed using the disk diffusion method on Mueller-Hinton Agar. The results indicated that 84.6% (99/117) of SE strains were resistant to at least one of the antimicrobial agents tested. Resistance at different levels was found to ampicillin (0.8%), kanamycin (1.7%), cyprofloxacin (1.7%), enrofloxacin (10.2%), gentamycin (14.5%), streptomycin (16.2%), nalidixic acid (35.9%), nitrofurantoin (47%), and tetracycline (59%). None of the SE strains were resistant to chloramphenicol, norfloxacin and polimyxin B. Among the 99 SE strains showing resistance, 66.6% (66) presented multiple resistance, to two or more antimicrobial agents. Thirty-three strains (33.3%) were resistant to only one of the antimicrobial agents, 16 to tetracycline, 12 to nitrofurantoin, 3 to nalidixic acid, 1 to gentamycin, and 1 to streptomycin. Fourty-two nalidixic acid resistant strains were submited to PCR and sequencing to detect gyrA mutation genes. Thirty SE strains (71.4%) showed at least one mutation in gyrA genes of quinolone resistance determining region (QRDR), in the codons corrosponding to Gly-81 (3,5%), Asp-82 (3,5%), Ser-83 (31%) or Asp-87 (62%). These mutants contained a change from Gly to Asp (n: 1) at codon 81, Asp to Asn (n: 1) at codon 82, Ser to Phe (n: 9) at codon 83 and Asp to Tyr (n: 9) or Asn (n: 9) at codon 87. In one sample there was a Pro inclusion between the 56 and 57 codons. The phage typing of 116 SE isolates showed that 68.9% (80/116) belonged to the phage type (PT) 4, 15.5% (18/116) to the PT 4a, 12.2% (14/116) to the PT 1, 0.9% (1/116) to the PT 6, 0.9% (1/116) to the PT 6a, 0.9% (1/116) to the PT 7, and 0.9% (1/116) to the PT 7a. The ribotyping characterization was done using RiboPrinter® system (DuPont), and showed four different ribotypes. The most common ribotype was 25-S-1 (82.1%). The other ribotypes were 29-S-5 (10.7%), 38-S-3 (3.6%) and 28-S-5 (3.6%). In conclusion, the antimicrobial resistance levels presented here suggest a high occurrence of Salmonella Enteritidis strains resistant to at least one antimicrobial agent, indicating the need for continuous surveillance in the poultry industry, and the need for responsible use of antimicrobial agents in food animals, based on a understanding of the ecology of resistance, the transmission of both bacteria and resistance genes, the relationship between antimicrobial agents use and resistance amplification, and the knowledge of effective interventions. S. Enteritidis nalidixic acid resistant strains isolated in Southern and Northeastern Brazil showed mutation in the gyrA gene of QRDR. Phage type 4 was the most common isolated and among S. Enteritidis strains isolated from clinical and environmental poultry samples there were a higher phagetype diversity when compared with broiler chicken carcasses. The S. Enteritidis strains that were ribotyping showed a lower degree of genetic diversity.