Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000438209-Texto+Completo-0.pdf: 6947151 bytes, checksum: 0114d6e8bfccd4c5809c464a81794137 (MD5) Previous issue date: 2012 / Doradidae is a monophyletic family endemic to South America diagnosed by a unique synapomorphy among catfish and recognized by a combination of morphological characteristics. Species of the family posses a infranuchal scute which is a superficial platelike bone co-formed by the fusion of an expanded ossicle of the lateral line canal and an ossified ligament extending from beneath the posterior nuchal plate to the tip of the first rib. Most species are characterized by a well-developed cephalic shield, subterminal mouth, large exposed postcleithral process, sturdy serrated pectoral- and dorsal-fin spines, and dorsoventrally flattened bodies (Sabaj, 2002). It is a diverse family with 92 extant and one fossil species grouped into 32 genera. Phylogenetic studies of doradids have traditionally been based on morphological characters and only one work has been based on molecular characters, which conflicts with previous morphological results. The main goal of this study was to recover phylogenetic relationships of the entire Doradidae by the analysis of all the previously available data for Doradidae and newly gathered morphological and molecular data. 200 characters referring to external morphology, osteology, gonads, and swimbladder were reviewed from previous authors. 91 myological characters were analyzed and proposed here for the first time in a phylogenetic context. 3011 molecular characters were gathered correspondent to two mitochondrial genes (16s and co1) and one nuclear gene (rag1). Compiling a total of 3302 characters for 94 species. In order to achieve the main goal molecular and anatomical studies were performed separated. An only molecular analysis was carried out including 77 described and six undescribed species. The analysis was base on fragments of the mitochondrial 16s and co1 and the nuclear rag1. It was obtained an aligment of 3011 base pairs for 146 specimens of Doradidae and the outgroup Auchenipteridae and Aspredinidae. Data were analyzed using Maximum Parsimony, Maximum Likelihood, and Bayesian analyses. An anatomical study was also developed and is presented as a descriptive manuscript of the cranial and pectoral musculature of Doradidae. 61 species of Doradidae were examined including representatives of all the genera. 22 muscles were described referring to their ontogenetic origin, function, area of origin and insertion, and portions; in certain cases key aspect of each muscle were described. The analysis of the all the data together uncovered newly hypothesized relationships. Astrodoradinae is recovered as the most basal clade of the family. The monotypic Wertheimeria, Franciscodoras, and Kalyptodoras, endemic to the east-coast drainages of Brazil, are recovered as a clade. The monotypic Doraops and Centrochir, endemic to TransAndean drainages, are recovered as sister to widely distributed Pterodoras and Platydoras respectively. The Doradidae with fimbriate barbels and Oxydoras are recovered as a monophyletic group. The recently described Ossancora is not recovered as a monophyletic group. / Doradidae é uma família monofilética endêmica da América do Sul diagnosticada por uma única sinapomorfia entre os bagres e reconhecida por uma combinação de características morfológicas. Espécies da família possuem um escudo infranuchal, que é uma placa óssea superficial formada pela fusão dos ossículos expandidos da linha lateral e um ligamento ossificado que se estende desde a placa nucal posterior ate a ponta da primeira costela. A maioria das espécies são caracterizadas por ter uma placa cefálica bem desenvolvida, boca subterminal, processo poscleitral largamente exposto, acúleo peitoral e dorsal serrilhados e o corpo achatados dorsoventralmente (Sabaj, 2002). É uma família diversificada com 92 espécies, das quais uma é fóssil, agrupadas em 32 gêneros. Os estudos filogenéticos dos Doradidae têm sido tradicionalmente baseados em caracteres morfológicos e apenas um trabalho foi baseado em caracteres moleculares, os resultados desse trabalho são conflitantes com os resultados morfológicos. O objetivo principal deste estudo foi recuperar relações filogenéticas de Doradidae a traves da análise simultânea de todos os conjuntos de dados previamente disponíveis para a família Doradidae alem de dados morfológicos e moleculares propostos neste estudo. 200 caracteres, utilizados por outros autores, referentes à morfologia externa, osteologia, gônadas e bexiga natatória foram revisados. 91 caracteres miológicos foram analisados e propostos aqui pela primeira vez num contexto filogenético. 3011 caracteres moleculares foram obtidos de dois genes mitocondriais (16s e co1) e um gene nuclear (rag1). Foram compilados um total de 3302 caracteres para 94 espécies. Para atingir o objetivo principal estudos moleculares e anatômicos foram realizados por separado. Uma análise apenas molecular foi realizado com 77 espécies descritas e seis espécies não descritas. A análise foi baseada em fragmentos dos genes mitocondriais 16s e co1 e um gene nuclear rag1. Foi obtido um alinhamento de 3011 pares de bases para 146 espécimes de Doradidae e o grupo externo Auchenipteridae e Aspredinidae. Os dados foram analisados usando máxima parcimônia, máxima verossimilhança, e análises Bayesianas. Um estudo anatômico foi também desenvolvido e é apresentado como um manuscrito descritivo da musculatura peitoral e cranial de Doradidae. 61 espécies de Doradidae foram examinados incluindo representantes de todos os gêneros. 22 músculos foram descritos referindo-se a sua origem ontogenética, função, áreas de origem e de inserção, e porções, em alguns casos aspectos chave de cada músculo foram descritos. A análise simultânea de todos os dados disponíveis revelou interessantes hipóteses de relacionamentos. Astrodoradinae é recuperado como o clado mais basal da família. Os gêneros monotípicos Wertheimeria, Franciscodoras e Kalyptodoras, endémicos das drenagens da costa leste do Brasil, são recuperados como um clado. Os gêneros monotípicos Doraops e Centrochir, endêmicos das drenagens transandinas, são recuperados como grupo irmão dos gêneros amplamente distribuídos, Pterodoras e Platydoras respectivamente. Os gêneros de Doradidae com barbilhões ramificados e Oxydoras, são recuperados como um grupo monofilético. O gênero Ossancora, recentemente descrito, não e recuperado como um um grupo monofilético.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000398604-Texto+Completo-0.pdf: 11571612 bytes, checksum: 5daf16bb95ffcb098498d92af708d644 (MD5) Previous issue date: 2007 / Este trabalho contem informações extensivamente revisadas sobre a taxonomia e distribuição dos peixes-bruxa. Ele inclui todas as espécies nominais da família Myxinidae, a qual compreende 2 subfamílias, 6 gêneros e 69 espécies. Informações sobre cada espécies incluem: nomes válidos e descrições originais; sinônimos; material examinado; características diagnósticas; tamanho máximo; distribuição e habitat; interesse pesqueiro; observações (quando necessário); e nomes vernaculares. Pela primeira vez são apresentadas chaves de identificação e mapas de distribuição para todos os gêneros e espécies, observando-se ampliações na distribuição de muitas delas. As subfamília Paramyxininae Berg, 1947 e Quadratinae Wisner, 1999 são consideradas sinônimos júnior de Eptatretinae Bonaparte, 1850. O gênero Quadratus Wisner, 1999 é considerado sinônimo júnior de Paramyxine Dean, 1904. Uma espécie de Eptatretus e duas de Myxine são sinonimizadas. Duas novas espécies são descritas: Eptatretus lakeside Mincarone & McCosker, 2004, do Arquipélago de Galápagos, e Eptatretus goliath Mincarone & Stewart, 2006, da Nova Zelândia. A inclinação da curva acumulativa de diversidade temporal indica que o número de espécies de Myxinidae ainda está longe de ser conhecido. Cruzeiros de pesquisa direcionados a regiões pouco exploradas e o uso de novas tecnologias de coleta poderão revelar espécies ainda não descritas.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000448697-Texto+Completo-0.pdf: 1821163 bytes, checksum: 8ebb362c20f003840cd87e504cc220af (MD5) Previous issue date: 2013 / The genus monotypical Schizolecis was proposed by Britski & Garavello (1984), being Microlepidogaster guntheri Miranda Ribeiro, 1918 the type species. Its distribution occurs from the north of the state of Santa Catarina until the north of the state of Rio de Janeiro, Brazil, comprising several coastal river basins. Due to the act that the genus is widely distributed in such isolated river basins, it was suggested the possibility of more than one species being included in what today we know as Schizolecis guntheri. To test this hypothesis, the following morphometric analysis were performed: tradition biometry and comparision of the interval of proportions; multivariate analyses of Principal Components and Canonical Variables and multivariate analyses of geometric morphometry using Relative Warps. Perceptible differences were not found among the individuals of the populations analyzed of Schizolecis guntheri, being only detected a gender dimorphism among the samples from Baía da Ilha Grande, in the state of Rio de Janeiro. A taxonomic revision was performed, together with a redescription of the genus and species. According to the results, it is concluded that all populations in differents coastal river basins of the state of Santa Catarina until the state of Rio de Janeiro, are a single species Schizolecis guntheri. / O gênero monotípico Schizolecis foi proposto por Britski & Garavello (1984), com Microlepidogaster guntheri Miranda Ribeiro, 1918 a espécie-tipo. Sua distribuição ocorre do norte do estado de Santa Catarina até o norte do estado do Rio de Janeiro, Brasil, compreendendo diversas bacias hidrográficas costeiras. Devido ao fato do gênero estar amplamente distribuído em bacias hidrográficas isoladas, sugeriu-se que haveria a possibilidade de mais de uma espécie estar incluída no que hoje conhecemos como Schizolecis guntheri. Para testar essa hipótese, foram realizadas as seguintes análises morfométricas: biometria tradicional e comparação de intervalo de proporções; análises multivariadas de Componentes Principais e Variáveis Canônicas e análises multivariadas de morfometria geométrica utilizando Relative Warps. Não foram encontradas diferenças significativas entre os indivíduos das populações analisadas de Schizolecis guntheri, sendo detectado apenas um dimorfismo sexual entre os exemplares pertencentes à Baía da Ilha Grande, no estado do Rio de Janeiro. Foi realizada uma revisão taxonômica, juntamente com a redescrição de gênero e espécie. Conforme resultados, conclui-se que todas as populações nas diversas bacias hidrográficas costeiras, de Santa Catarina ao Rio de Janeiro, são uma única espécie, Schizolecis guntheri.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000438126-Texto+Completo-0.pdf: 8216166 bytes, checksum: 09a1819f75864391af4634c2bb50e051 (MD5) Previous issue date: 2012 / A taxonomic revision and phylogenetic analysis of the genus Dasyloricaria were performed. This group belongs to the catfish family Loricariidae, subfamily Loricariinae and its distribution is strictly Trans Andean. Within the loricariines, individuais in Das yloricaría can reach more than 20 cm of Standard Length. The taxonomic revision was based on 142 specimens of the main river basins of Colombia, Venezuela and Panama, from which were obtained rneasurements and counts. In this study are proposed as valid the species DasylorÊcaría jilarnentosa (Steindachner) from the upper, middie and lower Magdaiena River, lower Cauca River and Sinú River basin in Colombia, and the Maracaibo Lake basin m Venezuela, and Dasyloricaria latiura (Eigenmann & Vance) from the Atrato River basin in Colombia and Tuyra River basin m Panama, as well as a description of a new species, Dasyloricaria n. sp. , from the middie and upper portions of the Magdaiena River, Coiombia. Redescriptions of the previousiy described species and the description of the new species are presented, including diagnosis, color in alcohol, distribution, sexual dimorphism, comments on each species, and an identification key of the species. After the taxonomic revision, a phylogenetic analysis was conducted based on 187 morphological characters (osteology and extemal morphology) and 23 terminal taxa. Species belonging to five subfamilies of the Loricariidae were included:Dasyloricaria filarnentosa, D. latiura, Dasyloricaria n. sp, Rineloricaria strigilata, R. microlepidogaster, Spatuloricaria sp. Tocantins, Spatuloricaria sp. Xingu, Ixinandria steinbachi, Loricaria cataphracta, L. clavipinna, Pseudoloricaria sp. , Pseudoherniodon sp. , Loricariichthys anus, Hemiodontichthys acipenserinus, Harttia loricarformis, Siurisorna rostratum, S. robustum (Loricariinae), Hypostomus pyrineusi, Ancistrus reisi (Hypostominae), Eurycheilichthys pantherinus, Otocinclus xakriaba (Hypoptopomatmae), Neoplecostomus microps (Neoplecostominae), and Delturus brevis (Delturinae). Were obtained three equaily most parsimonious trees of 1006 steps each, consistency index of 0. 34 and retention index of 0. 52. Dasyloricaria was recovered as a monophyletic unit, presenting nine unique synapomorphies. Spatuloricaria is proposed as the sister group of Dasyioricaria. This ciade is supported by tbree unique synapomorphies, and was observed to be the most derived clade within the analysis. Rineloricariina sensu Isbrücker was not recovered as inonophyletic. Relationships between Rineloricaria and (Spatuloricaria + Dasyloricaria) vere not resolved, even when they were found related within the analysis. Harttiini is found as monophyletic, including the genera Harttia and Sturisoma. Also, both Loricariini and Loricariinae are recovered as monophyletic. / Foram realizadas a revisão taxonômica e uma análise filogenética do gênero Dasyloricaria. Este grupo de cascudos pertence à família Loricariidae, subfamília Loricariinae e a sua distribuição é estritamente Transandina. Dentro dos loricarineos, em Das yloricaria se encontram indivíduos que podem atingir mais de 20 cm de Comprimento Padrão. A revisão taxonômica foi baseada em 142 exemplares das principais bacias da Colômbia, Venezuela e Panamá, dos quais foram obtidas medidas e contagens. São propostas como válidas as espécies Dasyioncaria Jilamentosa (Steindachner) das porções alta, média e baixa do rio Magdalena, baixo rio Cauca e bacia do rio Sinú na Colômbia, e bacia do lago de Maracaibo na Venezuela, e Dasyloricaria latiura (Eigenmann & Vance) da bacia do rio Atrato na Colômbia e bacia do rio Tuira no Panamá, além da descrição de urna nova espécie, Dasyloricaria sp, nov. , da porção média e alta do rio Magdalena, na Colômbia. Foram realizadas as redescrições das espécies previamente descritas e a descrição da nova espécie, assim como diagnoses, coloração no álcool, distribuição, dimorfismo sexual, comentários em cada uma delas e uma chave de identificação das espécies.Posterior à revisão taxonômica, uma análise filogenética foi realizada. Esta análise foi conduzida a partir de 187 caracteres morfológicos (osteologia e morfologia externa) e 23 táxons terminais. Foram incluidas espécies pertencentes a cinco subfamílias de Loricariidae: Das loricaria filarnentosa, D. latiura, Dasyloricaria sp. nov. , Rineloricaria strigilata, R. microlepidogaster, Spatuloricaria sp. Tocantins, SpatuÍoricaria sp. Xingu, Ixinandria steinbachi, Loricaria cataphracta, L. ciavipinna, Pseudoíoricaria sp. , Pseudoherniodon sp. , Loricariichthys anus, Hemiodontichthys acipenserinus, Harttia loricarfrmis, Sturisoma rostratum, S. robustum (Loricariinae), Hypostornus pyrineusi, Ancistrus reisi (Hypostorninae), Eurycheilichthys pantherinus, Otocinclus xakriaba (Hypoptopomatínae), Neoplecostomus rnicrops (Neoplecostominae) e Delturus brevis (Delturinae).Foram obtidas três árvores igualmente parcimoniosas de 1006 passos, índice de consistência de 0,34 e índice de retenção de 0,52. Dasyloricaria foi recuperado corno um grupo monofiletico apresentando nove sínapomorfias exclusivas. Spatuloricaria é proposto ser o grupo irmão de Dasyloricaria. Este dado é suportado por três smapomorfias exclusivas, e é observado ser o agrupamento mais derivado dentro da análise. Rineloricarima sensu Isbrücker não foi recuperado como monofilético. As relações entre Rineloricaria e (Spatuloricaria + Dasylorícaria) não foram resolvidas, ainda quando foram achados próximos na análise. Harttiini foi encontrada monofiletica, incluindo os gêneros Harttia e Sturisoma. Igualmente, tanto Loricariini, como Loricariinae são recuperadas como monofiléticas.

Made available in DSpace on 2013-11-04T16:02:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000451889-Texto+Completo-0.pdf: 4456883 bytes, checksum: e742e45558fe54b9dfa42a4657b631fb (MD5) Previous issue date: 2013 / The phylogeny of the family Callichthyidae (Siluriformes) was investigated performing a Cladistic parsimony analysis under a Total Evidence approach. Characters explored are mainly based in osteology and molecular data of nuclear and mitochondrial genes. The ingroup included 131 terminals representing 111 species, the outgroup included 13 terminals representing 13 species including Copionodon as the rooting taxa. The phylogenetic analysis resulted in 89 most parsimonious trees which are summarized in a strict consensus cladogram; a new phylogenetic classification and the discussion of this paper are addressed based in this topology. The Total Evidence phylogenetic analysis corroborated the monophyly of the family Callichthyidae, subfamilies Callichthyinae and Corydoradinae, genera Callichthys, Dianema, Lepthoplosternum, Megalechis, and Scleromystax. However, the genera Aspidoras, Corydoras, and Hoplosternum are recovered nonmonophyletic. To reconcile this situation, a revalidation of the genera Hoplisoma and Gastrodermus is proposed to accommodate most species currently recognized in Corydoras. Aspidoras virgulatus and Corydoras lacerdai are transferred to Scleromystax to conceive their currently containing genera monophyletic. On the other hand, Hoplosternum is recovered paraphyletic. However, it was decided to hold making taxonomic changes at this moment until molecular dataset is completed for this genus, which is referred temporarily as “Hoplosternum”. Synapomorphies for each clade recovered and ranked in the phylogenetic classification are reported here, emphasizing their morphological diagnoses. Interrelationships between species and clades are discussed and compared with previous taxonomic and phylogenetic hypotheses. In addition, the taxonomy of Hoplisoma nattereri was reviewed in order to elucidate its synonymy and investigate the presence of cryptic diversity under this name. Hoplisoma nattereri and H. triseriatus are considered valid species. Geographic distribution for each species is also reported. Corydoras juquiaae is removed from the synonymy of Hoplisoma nattereri and transferred to Scleromystax juquiaae, new combination. Scleromystax prionotos is considered a junior synonym of S. juquiaae. All these species are illustrated in this paper. In addition, the original figure of S. juquiaae prepared but never published by Rudolph von Ihering is reproduced here. Phylogenetic relationships of Hoplisoma nattereri and H. triseriatus are discussed and also the morphometric and genetic distance of some of the populations sampled. / A filogenia da família Callichthyidae (Siluriformes) foi estudada realizando uma análise de Parcimônia Cladística sob uma abordagem de Evidência Total. Caracteres explorados foram principalmente baseados em osteologia e dados moleculares de genes nucleares e mitocondriais. O grupo interno incluiu 131 terminais representando 111 espécies; o grupo externo incluiu 13 terminais representando 13 espécies e incluindo Copionodon como o terminal de enraizamento da topologia. A análise filogenética resultou em 89 árvores mais parcimoniosas que foram resumidas em um cladograma de consenso estrito; com base nessa topologia, se propõe e discute uma nova classificação filogenética para Callichthyidae. A análise filogenética de Evidência Total corroborou o monofiletismo da família Callichthyidae, subfamílias Callichthyinae e Corydoradinae, gêneros Callichthys, Dianema, Lepthoplosternum, Megalechis e Scleromystax. No entanto, os gêneros Aspidoras, Corydoras e Hoplosternum foram recuperados nãomonofiléticos. Para conciliar esta situação, se propõe a revalidação dos gêneros Hoplisoma e Gastrodermus para acomodar a maioria das espécies atualmente reconhecidas em Corydoras. Aspidoras virgulatus e Corydoras lacerdai foram transferidas para Scleromystax e assim conceber esses gêneros como monofiléticos. Por outro lado, as espécies de Hoplosternum foram recuperadas como parafiléticas. No entanto, decidiu-se não fazer mudanças taxonômicas no momento até concluir a coleta de dados moleculares para este grupo, o qual é reconhecido temporariamente como “Hoplosternum”. Sinapomorfias para cada clado recuperado e proposto na classificação filogenética são aqui mostrados, enfatizando seus caracteres morfológicos diagnósticos. Inter-relações entre as espécies e clados são discutidas e comparadas com estudos taxonômicos e hipóteses filogenéticas anteriores. Adicionalmente, a taxonomia de Hoplisoma nattereri foi revisada a fim de elucidar sua sinonímia e investigar a presença de diversidade críptica sob este nome. Hoplisoma nattereri e H. triseriatus são consideradas espécies válidas. A distribuição geográfica para cada espécie é reportada. Corydoras juquiaae é removida da sinonímia de Hoplisoma nattereri e transferida para Scleromystax juquiaae, nova combinação. Scleromystax prionotos é considerada um sinônimo júnior de S. juquiaae. Todas estas espécies são ilustradas neste artigo. Também, a figura original de Corydoras juquiaae preparada, mas nunca publicada, por Rudolph von Ihering é aqui reproduzida. As relações filogenéticas de Hoplisoma nattereri e H. triseriatus foram discutidas como assim a sua morfometría e a distância genética de algumas das populações amostradas.

Made available in DSpace on 2014-07-25T02:01:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000459709-Texto+Completo-0.pdf: 3714065 bytes, checksum: 4fcd0f5d0579f7b7f442276742c97b5f (MD5) Previous issue date: 2014 / Previous phylogenetic analyses and the discovery of five new taxa of Hypoptotopomatini raised doubts concerning the relationships of the tribe. Therefore, in order to elucidate the phylogenetic relationships and to test the monophyly of Hypoptopoma and Nannoptopoma, and to test the position of Niobichthys and Otocinclus, the present study aims to provide an encompassing hypothesis of relationships among the Hypoptopomatini, comprising most species of Hypoptopoma, five new taxa and the other genera of the tribe. We analyzed a data matrix of 101 morphological characters, 82 of which from the literature and 19 new characters are suggested, with the inclusion of 65 terminals. The analyses were conducted using the heuristic searching algorithm of multiple “Random Addition Sequence (RAS)” followed by branch swapping with the algorithm “Tree Bissection and Reconnection (TBR)”. The analysis resulted in 64 maximally parsimonious trees of 443 steps, consistency index of 0. 34 and retention index of 0. 81. The 64 primary cladograms were then summarized in a strict consensus tree. The result confirms the monophyly of Hypoptopomatinae and Hypoptopomatini. The tribe comprises six known genera: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus and Oxyropsis and two new taxa. Additionally, Otocinclus is found to be the most basal member of the tribe; Acestridium and Niobichthys are sister to each other and closely related to a group formed by Nannoptopoma + New Taxa “A”, and New Taxa “B” + Oxyropsis + Hypoptopoma. Based on this framework on, changes to the classification and the taxonomy of the Hypoptopomatini are suggested. / A partir das diferentes análises filogenéticas previamente propostas e do conhecimento de cinco novos táxons pertencentes à Hypoptopomatini, surgiram questionamentos a respeito das relações de parentesco dentro da tribo. Assim, a fim de esclarecer as relações filogenéticas e testar o monofiletismo de Hypoptopoma, testar a hipótese de sinonímia de Nannoptopoma e Hypoptopoma, e testar as posições de Niobichthys e de Otocinclus, o estudo tem como objetivo apresentar uma hipótese de relações para Hypoptopomatini, incluindo a maioria das espécies de Hypoptopoma, cinco possíveis novos táxons e os demais gêneros da tribo. Foi construída uma matriz de 101 caracteres morfológicos, do quais 82 foram retirados da literatura e 19 novos propostos, analisados em 65 táxons terminais. Foram realizadas buscas heurísticas com o programa TNT através de múltiplos “Random Addition Sequences” seguida de rearranjos dos ramos “Tree Bissection and Reconnection”. Ao encontrar 64 árvores maximamente parcimoniosas com 443 passos, índice de consistência 0. 34 e índice de retenção 0. 81, essas árvores foram sumarizadas em um cladograma de consenso estrito. Os resultados encontrados corroboram a monofilia de Hypoptopomatinae e de Hypoptopomatini. A tribo é formada por seis gêneros já descritos: Acestridium, Hypoptopoma, Nannoptopoma, Niobichthys, Otocinclus e Oxyropsis; e por dois gêneros novos. Adicionalmente, demonstra-se que Otocinclus é o gênero mais basal da tribo; Acestridium e Niobichthys são grupos-irmãos, mais relacionados com um clado formado por dois grupos monofiléticos: Nannoptopoma + Novo Táxon “A”, e Novo Táxon “B” + Oxyropsis + Hypoptopoma. O conhecimento acerca das relações filogenéticas, da classificação e da taxonomia de Hypoptopomatini muda, sendo feitas sugestões para futuras mudanças nomenclaturais.

Made available in DSpace on 2014-08-13T02:01:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000460186-Texto+Completo-0.pdf: 4588179 bytes, checksum: 4532da491a69ae539a460cd8e0108839 (MD5) Previous issue date: 2014 / The genus Rineloricaria Bleeker (1862) currently comprises 65 valid species that are distributed from Panama in Central America to northern Argentina. Three Rineloricaria species are currently recorded from Peru: Rineloricaria lanceolata, with type locality in the district of "Xeberos" in the department of Loreto, R. morrowi and R. wolfei both species with type locality in the río Ucayali basin in the district Contamana. Peruvian Rineloricaria species are reviewed based on external morphology, osteological features and color pattern. Six species are recognized. The three species were validated and Rineloricaria morrowi and R. wolfei were redescribed. Rineloricaria lanceolata is differentiated by having irregular dark blotches on on all fins and two parallel bands on dorsum of head, by having a higher number of post-rostral plates and the anterior ventral margin of pectoral girdle straight; its distribution mainly comprises río Madre de Dios, río Amazonas and río Ucayali basins and their tributaries. Rineloricaria morrowi is distinguished by having five longitudinal lateral plate series, a dark line along both sides on ventral area of caudal peduncle, a dark spot at anal-fin unbranched ray base and a dark band at the distal region of the caudal; its distribution is restricted to the río Amazonas basin and tributaries. Rineloricaria wolfei, has four longitudinal lateral plate series, triangular head profile and wide dark brown stripe covering the first half of the caudal fin, fifth ceratobranchial pharyngeal tooth plate wider with globular shape (vs. fifth ceratobranchial pharyngeal tooth plate narrow with triangular shape), a set of plates between insertions of pelvic fins anterior to the posterior complex irregularly arranged in more than one row (vs. arranged in one row). Additionally, three new species were described: Rineloricaria sp."Loreto", distinguished by a strongly convex snout profile with naked snout tip area reduced to a narrow line and type locality at río Morona basin in Loreto State. Rineloricaria sp."Madre de Dios" is differentiated from all congeners except from R. fallax by having a conspicuous dar brown spot on nuchal plate (vs. nuchal plate without dark brown spot); it differs from R. fallax by having four longitudinal lateral plate series (vs. five longitudinal lateral plate series), having type locality in the quebrada Wiratkentsa in Loreto State. Rineloricaria sp."Pasco" is distinguished by having the naked area of snout tip as a globular protuberance and a narrow body, with type locality in Puerto Bermudez at Pasco State. Illustrations of species and osteological characters are presented. The diagnostic characters of the genus are discussed, as well as geographical distribution of Rineloricaria species occurring in Peru and its relationship with highly diverse areas in the Neotropics. / O gênero Rineloricaria Bleeker (1862) atualmente inclui 65 espécies válidas distribuídas desde o Panamá na América Central até o norte da Argentina. O Peru atualmente registra três espécies deste gênero: Rineloricaria lanceolata, com localidade tipo no distrito de “Xeberos” no departamento de Loreto, R. morrowi e R. wolfei ambas com localidade tipo na bacia do río Ucayali no distrito de Contamana. As espécies de Rineloricaria que ocorrem no Peru foram revisadas com base em características morfológicas externasassim como também osteológicas e o padrão de colorido, sendo reconhecidas seis espécies. As três espécies registradas foram validadas e Rineloricaria morrowi e R. wolfei foram redescritas. Rineloricaria lanceolata é diferenciada por possuir manchas escuras irregulares em todas as nadadeiras e duas faixas paralelas na região dorsal da cabeça, um maior numero de placas pós-rostrais e pela margem anterior do cleitro reta; sua distribuição compreende principalmente as bacias do río Madre de Dios, río Amazonas e río Ucayali e seus tributários. Rineloricaria morrowi se diferencia de seus congêneres por ter cinco series longitudinais de placas laterais e coloração ventral lateral do pedúnculo caudal, uma mancha escura na base do raio indiviso da nadadeira anal e uma banda escura na região distal da nadadeira caudal; sua distribuição está restrita a bacia do río Amazonas e tributários. Rineloricaria wolfei, possui quatro series longitudinais de placas laterais, perfil triangular da cabeça e uma barra marrom escura que cobre a primeira metade da nadadeira caudal, placas que se contatam com a margem anterior do complexo posterior de placas abdominais, entre a inserção das nadadeiras pélvicas, dispostas irregularmente ocupando mais de uma fileira (vs. placas organizadas em uma única fileira entre a inserção das nadadeiras pélvicas) e por possuir a placa dentígera ventral do quinto ceratobranquial expandida e com forma globular (vs. placa dentígera ventral do quinto ceratobranquial estreita e triangular). Adicionalmente foram descritas três novas espécies: Rineloricaria sp. “Loreto”, diferenciada pelo focinho fortemente convexo com região nua reduzida a uma linha e com localidade tipo na bacia do río Morona no departamento de Loreto; Rineloricaria sp. “Madre de Dios” diferenciada de todos os seus congêneres exeto de R. fallax por possuir uma mancha marrom escura na placa nucal (vs. ausência de mancha na placa nucal) e com localidade tipo na quebrada Wiratkentsa no río Marañón no departamento de Loreto; e Rineloricaria sp. “Pasco” diferenciada por possuir a ponta do focinho com região nua em forma de protuberância globular e corpo estreito, com localidade tipo na quebrada Ataz em Puerto Bermudez no departamento de Pasco. Ilustrações de todas as espécies e caracteres osteológicos analisados são apresentadas. Os caracteres diagnósticos do gênero são discutidos, como também a distribuição das espécies de Rineloricaria que ocorrem no Peru e sua relação com áreas de grande diversidade Neotropical.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000427068-Texto+Completo-0.pdf: 8347716 bytes, checksum: 26c36c058e667deb23fc44a8707abd13 (MD5) Previous issue date: 2010 / The Neotropical Loricariidae represents the most diverse catfish family (Order Siluriformes), comprising 716 valid species distributed in 96 genera. For this reason, Loricariidae is also one of the most taxonomic and phylogenetic complex families in the order. Hypoptopomatinae is a subfamily of the Loricariidae that includes above 100 species arranged in 19 genera. These fishes are generally known as "cascudinhos" and most are characterized by the reduced body size. Further on the valid species, Hypoptopomatinae includes a significant portion of undescribed diversity, which has been discovered in the recent past years. Most of these undescribed species are phenotypically similar to Microlepidogaster, Pseudotocinclus or Otothyropsis. In this study we analyzed a data matrix based on phylogenetic studies of previous authors, with the inclusion of 52 ingroup and six outgroup terminals. The analysis was conducted using the heuristic searching algorithm of multiple “Random Addition Sequence (RAS)” followed by branch swapping with “Tree Bissection and Reconnection (TBR)”. We also performed an implied weighting analysis implemented with “Parsimony Ratchet” and with a concavity constant of 3 (K = 3). The analysis of the 60 morphological characters using multiple TBR + TBR resulted in six maximally parsimonious trees of 319 steps, consistency index of 24 and retention index of 64. In the second analysis, conducted with implied weighting, one tree was obtained with fit= 25. 91063. The tree obtained with the weighted analysis had a better resolution than that with equal weighting of characters. The results of both analyses corroborate the monophyly of the Hypoptopomatinae and of the tribe Hypoptopomatini. In addition, the weighted analysis corroborated the monophyly of the tribe Otothyrini. The species of Microlepidogaster, although not found as clade, cluster in close proximity in the trees, indicating the need of a broader characters sampling. The species Otothyropsis "LG2", O."Canoinhas","Rio Verde", and "Tibaji" formed a clade with Otothyropsis marapoama, indicating their generic position as members of Otothyropsis. Pseudotocinclus is included within of a clade also containing Pseudotothyris + Otothyris, and Pseudotocinclus parahybae showing closer proximity to the clade formed by Pseudotohyris + Otothyris than to the other species of Pseudotocinclus. Finally, two new species were recognized and described, belonging the genera Microlepidogaster and Otothyropsis. / Loricariidae é a família mais diversa da Ordem Siluriformes, contendo 716 espécies válidas distribuídas em 96 gêneros. Por este motivo, Loricariidae é também uma das famílias de maior complexidade taxonômica e filogenética dentro da ordem. Hypoptopomatinae é uma subfamília que inclui mais de 100 espécies agrupadas em 19 gêneros. Estes peixes são geralmente conhecidos por “cascudinhos” e a maioria é caracterizada pelo tamanho reduzido. Além das espécies válidas conhecidas, Hypoptopomatinae possui um número significativo de espécies ainda não descritas, que vem sendo descobertas ao longo dos últimos anos. A maioria dessas espécies são fenotipicamente similares a Microlepidogaster, Pseudotocinclus e Otothyropsis. Foi analisada uma matriz de dados, baseada em estudos filogenéticos de autores prévios, com a inclusão de um total de 58 táxons terminais, sendo 52 considerados como grupo interno e seis como grupo externo. A análise filogenética utilizou o método de busca heurística através de múltiplos “Random Addition Sequences (RAS)” seguida de rearranjos dos ramos "Tree Bissection and Reconnection (TBR)". Também foi realizada uma análise com pesagem implícita de caracteres, implementada com “Parsimony Ratchet”, no programa TNT com uma constante de concavidade igual a 3 (K = 3). A análise de 60 caracteres morfológicos implementada com o algoritmo heurístico de múltiplo TBR + TBR resultou em seis árvores maximamente parcimoniosas com 319 passos, índice de consistência (CI) de 24 e índice de retenção (RI) de 64. Na segunda análise realizada com pesagem implícita foi encontrada uma árvore com fit = 25. 91063. A árvore resultante gerada na análise com pesagem implícita mostrou maior resolução do que aquela obtida na análise com pesos iguais. Os resultados obtidos das duas diferentes análises corroboram a monofilia da subfamília Hypoptopomatinae e da tribo Hypoptopomatini. Além disso, a análise com pesagem implícita encontrou suporte também para tribo Otothyrini. As espécies do gênero Microlepidogaster, apesar de não apresentarem-se como um clado, ocuparam posições sempre próximas entre elas, o que indica a necessidade de uma maior amostragem de caracteres. As espécies Otothyropsis "LG2", O."Canoinhas","Rio Verde" e "Tibaji" foram recuperadas agrupadas em um clado com Otothyropsis marapoama, indicando a alocação destas espécies também dentro desse gênero. Pseudotocinclus ficou agrupado juntamente aos gêneros Pseudotothyris e Otothyris, sendo Pseudotocinclus parahybae mais proximamente relacionado ao clado formado por Pseudotohyris + Otothyris do que as demais espécies de Pseudotocinclus. São reconhecidas e descritas duas novas espécies pertencentes aos gêneros Microlepidogaster e Otothyropsis.

Made available in DSpace on 2015-06-23T02:05:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000470920-Texto+Completo-0.pdf: 7438655 bytes, checksum: 1f769194e7be6d12d47277b9005a61f6 (MD5) Previous issue date: 2015 / The objective of this study was to model the habitat suitability for the bivalve Corbicula fluminea, and the fishes Pimelodus pintado, Parapimelodus nigribarbis and Loricariichthys anus in relation to environmental variables in Guaíba Lake, Rio Grande do Sul, Brazil. Guaíba Lake, a large water body beside Porto Alegre city with approximately 50 km long and 19 km wide at the widest point. It has north to south pollution gradient, different sediment characteristics and habitat configurations in its margins. Samples (n = 54) of C. fluminea were collected with Ekman dredge (10 subsamples, sampled area=2225 cm2) and the fish sampled with gill nets with different mesh sizes exposed during 20 hours at the same sampling points. We used Generalized Additive Models (GAM) to fit a model for C. fluminea abundances. The variables evaluated for the model fitting comprise the distance from streams and channels, the distance in meters from north to south, depth, water velocity, amount of thermotolerant coliform (TC) and sediment characteristics. The model selected for C. fluminea (r2 = 0. 55) used depth (p = 2-16) and the diversity sand grain sizes (p = 2. 52-15) as predictors. For fish modeling, three approaches were evaluated (GAM), Boosted Regression Trees (BRT) and Generalized Linear Modeling (GLM).GLM was the method more accurately among the three methodologies for the three species: P. pintado, r2 = 0. 60, Root Mean Squared Error (RMSE) = 4. 71; P. nigribarbis, r2 = 0. 84, RMSE = 6. 77; and L. anus, r2 = 0. 72, RMSE = 2. 40. The most important predictors in the model for P. pintado were related to the sediment and current speed. The model selected for P. nigribarbis had the most important variables: depth, distance from margins and CT. The adjusted model for L. anus had the most important predictors CT and distance from margins. The results suggest that the distribution of C. fluminea, P. pintado, P. nigribarbis and L. anus is not random, though structural and environmental predictors influence the habitat occupation of these organisms. Furthermore, the results show the spatial distribution of species assessed on a small-scale, concerning the majority of spatial distribution studies. Thus, the findings contribute to a better understanding of the autoecology for those species, allowing the prediction to future scenarios in Lake Guaíba, constituting as a tool for environmental management and conservation actions. / O objetivo deste estudo foi modelar a adequabilidade de hábitat para o bivalve Corbicula fluminea e os peixes Pimelodus pintado (pintado), Parapimelodus nigribarbis (mandi) e Loricariichthys anus (viola) em relação a variáveis ambientais no Lago Guaíba, Rio Grande do Sul,, Brasil. O Lago Guaíba é um grande corpo hídrico que banha a cidade de Porto Alegre com aproximadamente 50 km de comprimento e 19 km de largura no ponto mais largo, apresenta um gradiente de poluição de norte ao sul e diferentes características de sedimento e configurações de hábitat nas margens. As amostras (n=54) de C. fluminea foram coletadas com draga Ekman (10 sub-amostras, área total amostrada = 2,225 cm2) e os peixes amostrados com redes com diferentes tamanhos de malha por 20 horas nos mesmos pontos de amostragem. As variáveis avaliadas para o ajuste do modelo compreenderam medidas de distância da margem, distância de arroios e canais, distância em metros de norte a sul, profundidade, velocidade da água, quantidade de coliformes termo-tolerantes (CT) e características do sedimento. O modelo de distribuição usado para C. fluminea foi um Generalized Additive Models (GAM). O modelo selecionado para C. fluminea (r2 = 0. 55) usou profundidade (p = 2e-16) e a diversidade dos tamanhos dos grãos de areia (p = 2. 52- 15) como preditores. Para a modelagem dos peixes, três metodologias foram avaliadas (GAM), Boosted Regression Trees (BRT) e Generalized Linear Modeling (GLM). GLM foi o método com maior acurácia dentre as três metodologias para as três espécies: P. pintado, r2 = 0. 60, Root Mean Squared Error (RMSE) = 4,71; P. nigribarbis, r2 = 0,84, RMSE = 6. 77; e L. anus, r2 = 0,72, RMSE = 2,40. Os preditores mais importantes no modelo para P. pintado foram relacionados a profundidade, características do sedimento e velocidade de corrente. O modelo selecionado para P. nigribarbis teve como variáveis mais importantes: profundidade, distância dos tributários e CT. O modelo ajustado para L. anus teve como preditores mais importantes CT e distância das margens. Os resultados apresentados sugerem que a distribuição de C. fluminea, P. pintado, P. nigribarbis e L. anus não é aleatória e preditores estruturais e ambientais influenciam a ocupação de hábitat destes organismos. Além disso, os resultados apresentam a distribuição espacial para as espécies avaliadas em pequena escala, considerando a maioria dos estudos de distribuição espacial. Desta maneira, os achados contribuem para um melhor entendimento da autoecologia das espécies, permitindo a previsão de cenários futuros no Lago Guaíba, além de constituir uma ferramenta para gestores ambientais e ações conservacionistas.