The current thesis reviews a cross-section of studies dealing with several problems of systematics of the mayfly (Ephemeroptera) family Baetidae. It is based on classic morphological characters as well as molecular-based methods in order to solve specific taxonomic problems and reconstruct phylogenetic relationships within the selected taxa.

The presented thesis deals with the evolution of the social parasitism of Phengaris (Maculinea) butterflies. It consists of three related problems: I) The phylogeny of Glaucopsyche section (Lepidoptera: Lycaenidae: Polyommatinae) {--} the social parasitism occured only once in the Glaucopsyche section. II) The conditions in which the social parasitism of Phengaris evolved {--} the process was probably facilitated by unique species composition of the myrmecofauna of the biotopes inhabited by the ancestor of Phengaris. III) The host specificity of Phengaris {--} today{\crq}s view on the host specificity of Phengaris is poorly supported.

This thesis investigates the systematics, biogeography, and diversification dynamics of a large and ecologically important insect group in SE Asia and the Indo-Pacific region: the ants. This study utilizes a multidisciplinary framework to elucidate the evolutionary history of selected ant clades with the overall aim to shed light on similar ecological and evolutionary processes intervening in ant diversity.

O gênero Tapirus (Perissodactyla, Tapiridae) é de origem holártica e entre o Mioceno e Plioceno final é amplamente distribuído na América do Norte, Europa e Ásia. Os tapires aparecem na América do Sul após a formação do Istmo de Panamá, durante o Grande Intercâmbio Biótico Americano, Pleistoceno inicial - médio. Neste trabalho, é revisado o material tipo das espécies atribuídas ao gênero na América do Sul; descrito material inédito proveniente da Venezuela e Brasil; realizado estudo comparativo morfológico e morfométrico; e proposto hipóteses quanto à origem e filogenia dos tapires na América do Sul. A partir da revisão das espécies de Tapirus do Quaternário da América do Sul, foi possível considerar válidas as espécies: T. greslebini, T. rioplatensis, e T. mesopotamicus (todas para a Argentina); T. oliverasi (Uruguai); T. tarijensis (Bolívia); T. cristatellus e T. rondoniensis (Brasil). A análise morfométrica permitiu estabelecer dois morfótipos para as espécies fósseis sulamericanas com base no tamanho do dentário. Um morfótipo que está dentro da variação de tamanho de T. terrestris, constituído pelas espécies T. rondoniensis e T. mesopotamicus, e outro, um morfótipo maior, com tamanho superior ao máximo de variação encontrado em T. terrestris, como T.tarijensis, T. rioplatensis, T. greslebini, e alguns espécimes de T. cristatellus. O gênero Tapirus apresentou-se como um clado monofilético, sendo Nexuotapirus marslandensis seu táxon-irmão. Os tapires sulamericanos não formam um clado monofilético, sendo T. pinchaque o grupo-irmão dos demais tapires sul-americanos atuais e fósseis, bem como das formas derivadas norte-americanas; e T. cristatellus seria o táxon irmão do clado T. indicus + T. bairdii +T. polkensis + T. lundeliusi + T. haysii + T. veroensis. O resultado da análise filogenética sugere uma relação próxima entre os tapires sul-americanos e T. webbi, o que corrobora a hipótese de um evento de dispersão da América do Norte para a América do Sul durante o Mioceno. Por outro lado, nossos dados indicam um segundo evento de dispersão da América do Sul para a América do Norte, possivelmente a partir de uma forma proximamente relacionada a T. cristatellus, que teria dado origem às formas derivadas do sudoeste da América do Norte. / The genus Tapirus (Perissodactyla, Tapiridae) is of Holarctic origin and between the Miocene and late Pliocene is widely distributed in North America, Europe and Asia. Tapirs appeared in South America after the formation of the Isthmus of Panama, during the Great American Biotic Interchange, early – middle Pleistocene. In this work is reviewed the type specimen of the species assigned to the genus in South America; described new material from Venezuela and Brazil; conducted comparative morphological and morphometric study; and proposed hypotheses regarding the origin and phylogeny of South American tapirs. Based on the review of the species of Tapirus of Quaternary from South America, could be considered as valid species: T. greslebini, T. rioplatensis, and T. mesopotamicus (all from Argentina); T. oliverasi (Uruguay); T. tarijensis (Bolivia); T. cristatellus and T. rondoniensis (Brazil). Morphometric analysis allowed us to establish two morphotypes for the South American fossil species based on the size of the teeth. A morphotype which is within the size variation of T. terrestris, comprising the species T. rondoniensis and T. mesopotamicus, and another, larger one morphotype, much larger than the maximum of variation found in T. terrestris, as T. tarijensis, T. rioplatensis, T. greslebini, and some specimens of T. cristatellus. The genus Tapirus appeared as a monophyletic clade and Nexuotapirus marslandensis as its sister taxon. The South American tapirs do not constitute a monophyletic clade, since T. pinchaque is the sister group of other extant and fossil South American tapirs, and of the forms derived from North American; and T. cristatellus would be the sister taxon of the clade T. indicus + T. bairdii +T. polkensis + T. lundeliusi + T. haysii + T. veroensis. The result from phylogenetic analysis suggests a close relationship between the South American tapirs and T. webbi, which supports the hypothesis of a dispersal event from North America to South America during the Miocene. Moreover, our data indicate a second dispersal event from South America to North America, possibly from a form closely related to T. cristatellus, which would have resulted to the derived forms of southeast North America.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-02T11:56:44Z No. of bitstreams: 1 RAFAEL.pdf: 2923056 bytes, checksum: ed2c8fd6018c384a933ac0da4bea2317 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-26T18:15:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RAFAEL.pdf: 2923056 bytes, checksum: ed2c8fd6018c384a933ac0da4bea2317 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-26T18:15:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RAFAEL.pdf: 2923056 bytes, checksum: ed2c8fd6018c384a933ac0da4bea2317 (MD5) / CAPES, FAPESB, CNPq / A revisão da família Hylidae realizada recentemente (2005) teve como base principalmente caracteres moleculares e examinou 228 das 860 espécies conhecidas para a referida família. Os autores apontaram lacunas deixadas em seu trabalho, entre elas uma carência de teste de monofilia para o possível clado de Dendropsophus decipiens. Com o objetivo de testar a monofilia do grupo de D. decipiens e explorar seu relacionamento interno realizei uma análise filogenética usando uma abordagem morfológica com 82 caracteres de morfologia externa e esqueleto cranial das formas adultas e larvares de 31 táxons. Foi obtida uma árvore mais parcimoniosa apenas de 470 passos, valores de suporte alto para o grupo de D. decipiens (também para os outros grupos incluídos na análise) e baixos para as relações entre os grupos. A monofilia do grupo de Dendropsophus decipiens é suportada com base em oito sinapomorfias (2 da larva e 6 do adulto) e a hipótese de relacionamento entre as espécies obtida é (D. berthalutzae (D. haddadi (D. decipiens, D. oliveirai))). Dos caracteres apontados para definir formalmente o grupo apenas a posição de início da nadadeira dorsal na junção do corpo com a cauda e coloração da cauda congruem com as sinapomorfias aqui encontradas. Da discussão que historicamente envolve a diferenciação do grupo de D. decipiens em relação ao grupo de D. microcephalus, aqui é observado que as diferenças refletem o caráter único do girino deste último grupo de espécies. Com base nos resultados obtido aqui recomendo o reconhecimento do grupo de D. decipiens como unidade independente do grupo de D. microcephalus. Uma descrição do girino de D. haddadi é provida. / Salvador

Four groups of equids, "Anchitheriinae," Merychippine-grade Equinae, Hipparionini, and Equini, coexisted in the middle Miocene, and only the Equini remains after 16 million years of evolution and extinction. Each group is distinct in its occlusal enamel pattern. These patterns have been compared qualitatively but rarely quantitatively. The processes controlling the evolution of these occlusal patterns have not been thoroughly investigated with respect to phylogeny, tooth position, and climate through geologic time. I investigated two methods of quantitative analysis, Occlusal Enamel Index for shape and fractal dimensionality for complexity. I used analyses of variance and an analysis of co-variance to test hypotheses of process. Results suggest that enamel shape was controlled by phylogeny, tooth position, and climate. The lower taxonomic levels are shown to have a strong effect on complexity, suggesting behavior is driving complexity rather than overarching phylogenetic constraint.

Os lagostins de água doce sulamericanos (Família Parastacidae) são representados por três gêneros: Parastacus Huxley, 1879, Samastacus Riek, 1971 and Virilastacus Hobbs, 1991. Esse grupo é distribuído no Sul do Brasil (Rio Grande do Sul and Santa Catarina), Uruguai, Argentina e Chile. Os objetivos dessa tese foram revisar a taxonomia do gênero Parastacus e investigar a sua monofilia e relações filogenéticas entre suas espécies e entre os outros gêneros sulamericanos. Para esse propósito, várias coleções e museus ao redor do mundo foram analisados (Brasil, Argentina, Uruguai, Chile, Estados Unidos, Alemanha, Holanda, Inglaterra e França) em adição a coletas realizadas entre Março de 2013 a Setembro de 2016. Os espécimes foram analisados em estereomicroscópio e os desenhos foram preparados com auxílio de camara lucida. Para as análises genéticas, uma abordagem multigênica foi utilizada com dois marcadores mitocondriais (Cox1 e 16S) e um nuclear (28S). A análise filogenética foi realizada por Inferência Bayesiana e a distância genética p também foi calculada. Adicionalmente, o risco de extinção foi assessado para algumas espécies de acordo com o sub-critério B1 da IUCN que leva em consideração a estimativa da Área de Extenção de Ocorrência. Oito espécies foram redescritas: Parastacus brasiliensis (von Martens, 1869), P. defossus Faxon, 1898, P. laevigatus Buckup & Rossi, 1980, P. pilimanus (Von Martens, 1869), P. pugnax (Poepigg, 1835), P. promatensis Fontoura & Conter, 2008 e P. varicosus Faxon, 1898. Um novo gênero foi proposto para alocar a espécie P. nicoleti (Philippi, 1882) que também foi redescrita. Treze novas espécies foram descritas. Assim como, chaves de identificação, descrições, diagnoses, sinonímias e mapas de distribuição foram providos. As árvores filogenéticas resultantes corroboraram com a monofilia de Parastacus e do clado sulamericano, além de dar suporte para o estabelecimento de um novo gênero e novas espécies. Com essa tese, o aumento da riqueza específica para Parastacus é de mais de 150% e as novas informações sobre habitat e distribuição trarão suporte para futuros estudos de conservação e manejo. / South American freshwater crayfish (Family Parastacidae) are represented by three genera: Parastacus Huxley, 1879, Samastacus Riek, 1971 and Virilastacus Hobbs, 1991. This group is distributed in Southern Brazil (Rio Grande do Sul and Santa Catarina), Uruguay, Argentina and Chile. The goals of this thesis is to review the taxonomy of the genus Parastacus and to investigate the monophyly and phylogenetic relationships within Parastacus and among South American crayfish genera. For this purpose, several collections and museums around the world were analyzed (Brazil, Argentina, Uruguay, Chile, United States of America, Germany, Netherlands, England, and France) in addition to collectings carried out from March 2013 to September 2016. Specimens were analyzed under a stereomicroscope and drawings were prepared with the aid of a camara lucida. For genetic analysis, a multigenic approach was used with two mitochondrial (Cox1 and 16S) and one nuclear (28S) markers. Phylogenetic analysis were performed with Bayesian Inference and genetic p-distances were also calculated. In addition, the extinction risk was assessed according to the sub-criterion B1 of IUCN that estimates the Extent of Occurrence (EOO) for some species. Eight species are redescribed: Parastacus brasiliensis (von Martens, 1869), P. defossus Faxon, 1898, P. laevigatus Buckup & Rossi, 1980, P. pilimanus (Von Martens, 1869), P. pugnax (Poepigg, 1835), P. promatensis Fontoura & Conter, 2008 and P. varicosus Faxon, 1898. A new genus is proposed to encompass the species P. nicoleti (Philippi, 1882) and this species is also redescribed. In addition, 13 new species are described. Identification keys, descriptions, diagnoses, synonymies and distribution maps of the genera and species are provided. Phylogenetic trees corroborated the monophyly of Parastacus and the South American crayfish clade, and give support for the establishment of a new genus and new species. With this thesis, the increase in specific richness for Parastacus is more than 150% and new information about habitat and distribution will bring support for future conservation and management studies.

This thesis contributes to the knowledge of the species diversity of the Crenicichla lacustris sp. group in the La Plata River basin with description of three new species. Speciation mechanisms within two different species flocks from the middle Paraná/Iguazu and Uruguay Rivers were studied with a phylogenomic approach applying a novel genotyping method based on a Double-Digest Restriction site Adjacent DNA (ddRAD) sequencing. Our results support a repeated origin of morphological species being evolved several times sympatrically and independently in different drainages. A considerable role of hybridization/introgression as an evolutionary force was also proposed. The thesis further uncovers biogeographic aspects of the southern part of Brazilian shield and adjacent coastal rivers.

Over the last few decades there has been a confusion in the classification system of organisms with the development of molecular and genetic methods. Life is currently perceived from a different perspective than in the past due to different methods, and old, standard systems have significantly changed as a result of such alteration. As a consequence, it is harder and harder to distinguish which taxonomic changes are caused by objectively better recognition of biodiversity and which seem to be only subjective opinions of particular taxonomists. Results show a significant growth in the number of genuses in observed families of frogs (Anura) in the aforementioned period (2000-2017) while the research efforts of taxonoms were proved to be the most relevant factors causing such increase in diversity with respect to genuses.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-03-04Bitstream added on 2014-06-13T20:43:04Z : No. of bitstreams: 1 castanhole_mmu_dr_sjrp.pdf: 1206486 bytes, checksum: c2670f2f722ece441455142300124430 (MD5) / O presente trabalho teve por objetivo principal contribuir com informações relevantes a cerca de espécies pertencentes a percevejos aquáticos e cigarrinha das pastagens neotropicais brasileiras. As relações filogenéticas entre espécies das famílias Belostomatidae, Gelastocoridae, Gerridae, Notonectidae e Veliidae (Heteroptera) e Cercopidae (Auchenorrhyncha) vêm sendo bastante discutidas, devido ao grande número de espécies pertencentes a esses dois grupos, quanto a sua monofilia e proximidade entre os táxons. Neste trabalho, foram realizadas análises de variabilidade genética, composição nucleotídica e relacionamentos filogenéticos baseada em aspectos citogenéticos (número de autossomos, sistema cromossômico do sexo, presença ou ausência de m cromossomos e cromossomos Y), ecológicos (habitat e hábito alimentar), moleculares (marcadores COI, 16S e 28S) e morfológicos (morfologia dos testículos) combinados e separadamente. Por meio das análises foi possível verificar que os táxons estudados de Cercopidae (Cicadomorpha, Auchenorrhyncha) e das infraordens Gerromorpha e Nepomorpha de Heteroptera apresentaram se monofiléticos. Diante dos relacionamentos observados, foi possível propor também, que o estado ancestral para o sistema cromossômico do sexo foi o X0, enquanto que para o número de autossomos não foi possível estabelecer quais eventos estão ocorrendo, se de fissão ou fusão. Os resultados apresentados são de grande importância em virtude da escassez de dados de percevejos aquáticos e cigarrinha das pastagens,principalmente em análises combinadas, contendo dados moleculares, citogenéticos, ecológicos e morfológicos. Porém, ainda é necessária a análise de um maior número de táxons e de regiões gênicas para corroborar tais achados / The present study aimed at contributing with relevant information about the species of aquatic bugs and spittlebugs in Brazilian neotropical pastures. Phylogenetic relationships among species of the families Belostomatidae, Gelastocoridae, Gerridae, Notonectidae and Veliidae (Heteroptera) and Cercopidae (Auchenorrhyncha) have been widely discussed, due to the large number of species belonging to these two groups, as their monophyly and closeness among taxa. In this study, we performed analyzes of genetic variability, nucleotide composition and phylogenetic relationships based on cytogenetic aspects (number of autosomes, sex chromosome system, presence or absence of m-chromosomes and Y chromosomes), ecological (habitat and feeding habits), molecular (COI, 16S and 28S markers) and morphological (morphology of the testes) combined and separately. Through the analysis we found that the taxa studied to Cercopidae (Cicadomorpha, Auchenorrhyncha) and infraorders Gerromorpha and Nepomorpha of Heteroptera showed up monophyletic. Given the observed relationships, it was also possible to propose that the ancestral state for the sex chromosome system was the X0, while the number of autosomes was not possible to establish which events are occurring fission or fusion. The results presented are of great importance due to the scarcity of data from aquatic bugs and spittlebugs, mainly in combined analyzes, data containing molecular, cytogenetic, morphological and ecological. However, it is still necessary to analyze a greater number of taxa and gene regions to corroborate these findings