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Pneumocystis sp. e circovirus (PCV2) em pulmões de suínos de abate, procedentes dos estados do Rio Grande do Sul e Mato Grosso e estudo das relações filogenéticas das amostras de pneumocystis sp.Sanches, Edna Maria Cavallini January 2006 (has links)
As doenças respiratórias constituem um sério problema em sistemas intensivos de criação de suínos, causando enormes prejuízos à industria suína no Brasil e no mundo. Estes prejuízos estão freqüentemente relacionados à redução de peso, mortalidade, maior predisposição a doenças entéricas, gastos com vacinas e medicamentos. Os distúrbios respiratórios em suínos são manifestados através de um complexo de doenças, com envolvimento de agentes virais, bacterianos e fúngicos. Dentre estes, a presença do circovírus (PCV2) e o Pneumocystis sp. começa a ser gradativamente caracterizada como uma associação entre um agente causador de imunossupressão e um organismo de ação oportunista. O trabalho objetivou diagnosticar Pneumocystis sp. através das técnicas de imunohistoquímica, Grocott e nested-PCR, em suínos abatidos nos Estados do Rio Grande do Sul (RS) e Mato Grosso (MT), diagnosticar a ocorrência de PCV2 na mesma população de suínos, verificar a associação entre Pneumocystis sp. e PCV2, e determinar as relações filogenéticas entre as amostras de Pneumocystis sp. O estudo avaliou um total de 591 pulmões, 297 com alterações macroscópicas (pneumonia) e 294 normais obtidos em frigoríficos. Foram analisados 292 pulmões procedentes do RS e 299 pulmões do MT Para diagnóstico do Pneumocystis sp. as amostras foram analisadas através das técnicas de Grocott, Imunohistoquímica e nested-PCR (mtLSU e mtSSU rRNA). Do total das amostras, 36,9% foram positivas para Pneumocystis. O índice de positividade para o vírus PCV2 foi de 32,7% na amostra total. Os resultados revelaram uma alta prevalência do vírus (PCV2) em pulmões sem lesões macroscópicas. A co-infecção (PCV2 e Pneumocystis sp.), foi detectada em 28,0% em 564 pulmões examinados. As análises das seqüências dos nucleotídeos dos produtos de PCR dos genes mtLSU e mtSSU do rRNA do Pneumocystis sp. nos pulmões analisados, sugerem a presença até o presente momento de 2 espécies diferentes de Pneumocystis no Brasil. Este estudo evidencia a ocorrência da co-infecção de dois agentes (Pneumocystis sp. e PCV2) em animais hígidos, fato que, indica a necessidade de planejamento e implementação de medidas de controle para melhorar a produtividade na suinocultura. / Respiratory diseases are a major problem in intensive systems of swine husbandry. They are a cause for high losses in the swine industry in Brazil and in the world. These losses are often related to weight reduction, mortality, higher vulnerability to enteric diseases, and expenses with vaccines and drugs. Respiratory diseases in swine appear through a complex of diseases, caused by virus, bacteria and fungi; among these, the porcine circovirus 2 (PCV2) and Pneumocystis sp., the former an agent which causes immunosupression and the latter an oportunistic microorganism. Both are being recognized as capable of being associated. The objectives of this study were to: identify Pneumocystis sp. through immunohystochemistry techniques, Grocott and nested-PCR in swine slaughtered in the States of Rio Grande do Sul and Mato Grosso (MT); investigate PCV2 in the same swine population; investigate the association between Pneumocystis sp. and PCV2, and establish a filogenetic relationship between isolated of Pneumocystis sp. The study was carried out with a total of 591 lungs, 297 with macroscopic alterations characteristic of pneumonia, and 294 normal lungs from the industry. 292 lungs came from RS and 299 lungs came from MT. In order, to diagnose Pneumocystis infection, samples were analysed through Grocott technique, immunohystochemistry and nested-PCR (mtLSU and mtSSU rRNA). Among all samples 36,9% were positive for Pneumocystis sp.. PCV2 virus was found in 37,2% of the samples. Results revealed a high prevalence of the PCV2 virus in lungs without macroscopic lesions. Co-infection (PCV2 and Pneumocystis sp.) was found in 28,0% of 564 lungs examined. So far, the analyses of the sequences of nucleotides from the products of PCR from the genes mtlSU rRNA and mtSSU rRNA from Pneumocystis obtained from the examined lungs suggest that, it is possible the existence of two different species of Pneumocystis in Brazil. This study shows co-infection by two agents (Pneumocysts sp. and PCV2) in apparently healthy animals. This fact points out the necessity planning and implementation of control measures in order to improve productiviy in swine husbandry and industry.
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Utilização da técnica de nanopartículas de ouro não modificada (AuNP) para detecção do agente da pleuropneumonia suína (Actinobaccilus pleuropneumoniae)Brandão, Laila Natasha Santos 05 March 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-03-05 / CAPES / A possibilidade de detecção de agentes patogênicos representou um grande passo para a ciência. O desenvolvimento e melhorias nas técnicas de diagnóstico como a técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), ao longo dos anos ainda requer infraestrutura laboratorial, apesar de sua sensibilidade e custo decrescente, investimentos em equipamentos e cuidados com fontes de contaminação externa. Técnicas que possam ser executas com facilidade e pouca mão de obra ou exigência de pessoas capacitadas, têm grande possibilidades de aplicabilidade. Neste estudo desenvolveu-se uma técnica de rápida execução e baixo custo, para detecção de um dos principais agentes causadores de pneumonias em granjas de suínos o Actinobaccilus pleuropneumoniae, com sensibilidade 93,8% e especificidade de 84,6% em amostras de pulmões com e sem lesão. O teste Kappa entre a PCR e nanopartícula de ouro foi 0,684 representando boa concordância. A técnica pode ser utilizada como alternativa aos testes convencionais, já que é de fácil e rápida execução e não exige infraestrututra e mão de obra especializada. / The possibility of detection of pathogens was a major step for science as a whole, developing and improving these techniques over the years to increase visibly. The development of the technique of Polymerase Chain Reaction ( PCR ) , although its sensitivity and decreasing cost over the years, it's still a handy little technique that requires laboratory infrastructure, high investments in equipment and care with sources of external contamination. Techniques that can be performed through the ease and little manpower or requirement of skilled people, always have great scope of applicability. This study develops a technique for quick and low- cost detection of a major causative agent of pneumonia in swine herds the Actinobaccilus pleuropneumoniae , with 93.8 % sensitivity and 84.6% specificity in samples of lungs with and without injury, the Kappa test between PCR and gold nanoparticle was 0,684 representing good agreement . The technique can be used as an alternative to conventional tests, since it is easy and quick to implement and does not require infrastructure and skilled labor.
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Fisioterapia respirat?ria em crian?as com pneumonia: revis?o sistem?ticaChaves, Gabriela Suellen da Silva 18 November 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-11-18 / Introduction: Pneumonia is an inflammatory lung disease and it is the greatest
cause of deaths in children younger than five years of age worldwide. Chest
physiotherapy is widely used in the treatment of pneumonia because it can help
to eliminate inflammatory exudates and tracheobronchial secretions, remove
airway obstructions, reduce airway resistance, enhance gas exchange and
reduce the work of breathing. Thus, chest physiotherapy may contribute to
patient recovery as an adjuvant treatment even though its indication remains
controversial. Objectives: To assess the effectiveness of chest physiotherapy
in relation to time until clinical resolution in children (from birth up to 18 years
old) of either gender with any type of pneumonia. Methods: We searched
CENTRAL 2013, Issue 4; MEDLINE (1946 to May week 4, 2013); EMBASE
(1974 to May 2013); CINAHL (1981 to May 2013); LILACS (1982 to May 2013);
Web of Science (1950 to May 2013); and PEDro (1950 to May 2013). We
consulted the ClinicalTrials.gov and the WHO ICTRP registers to identify
planned, ongoing and unpublished trials. We consulted the reference lists of
relevant articles found by the electronic searches for additional studies. We
included randomised controlled trials (RCTs) that compared chest
physiotherapy of any type with no chest physiotherapy in children with
pneumonia. Two review authors independently selected the studies to be
included in the review, assessed trial quality and extracted data. Results: Three
RCTs involving 255 inpatient children are included in the review. They
addressed conventional chest physiotherapy, positive expiratory pressure and
continuous positive airway pressure. The following outcomes were measured:
duration of hospital stay, time to clinical resolution (observing the following
parameters: fever, chest indrawing, nasal flaring, tachypnoea and peripheral
oxygen saturation levels), change in adventitious sounds, change in chest X-ray
and duration of cough in days. Two of the included studies found a significant
improvement in respiratory rate and oxygen saturation whereas the other
included study failed to show that standardised respiratory physiotherapy and
positive expiratory pressure decrease the time to clinical resolution and the
duration of hospital stay. No adverse effects related to the interventions were
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described. Due to the different characteristics of the trials, such as the duration
of treatment, levels of severity, types of pneumonia and the techniques used in
children with pneumonia, as well as differences in their statistical presentation,
we were not able to pool data. Two included studies had an overall low risk of
bias whereas one included study had an overall unclear risk of bias.
Conclusion: Our review does not provide conclusive evidence to justify the
use of chest physiotherapy in children with pneumonia due to a lack of data.
The number of included studies is small and they differed in their statistical presentation / Introdu??o: A pneumonia ? uma doen?a pulmonar inflamat?ria e apresenta-se
como uma das maiores causas de morte em crian?as menores de cinco anos
de idade em todo o mundo. Um recurso que ? amplamente utilizado no
tratamento da pneumonia ? a fisioterapia respirat?ria, uma vez que a aplica??o
de suas t?cnicas pode ajudar a eliminar as secre??es traqueobr?nquicas a fim
de reduzir a resist?ncia das vias a?reas, aumentar a troca gasosa e, assim,
diminuir o trabalho respirat?rio. Portanto, a fisioterapia respirat?ria pode
contribuir para a recupera??o do paciente como um tratamento adjuvante ao
tratamento cl?nico padr?o. Objetivos: avaliar a efetividade da fisioterapia
respirat?ria em rela??o melhora cl?nica em crian?as de ambos os sexos,
apresentando qualquer tipo de pneumonia. M?todos: nessa revis?o
sistem?tica foram pesquisadas as seguintes bases de dados: CENTRAL 2013,
Issue 4 , MEDLINE (1946 a maio semana 4, 2013) , EMBASE (1974 a maio de
2013) , CINAHL (1981 a maio de 2013) , LILACS (1982 a maio de 2013); Web
of Science (1950 a maio de 2013), Pedro (1950 a Maio de 2013); e o
ClinicalTrials.gov e a OMS ICTRP para identificar os ensaios cl?nicos previstos,
em andamento e in?ditos . Para a busca manual foram consultadas as listas de
refer?ncias de artigos relevantes encontrados pelas buscas eletr?nicas. Foram
inclu?dos ensaios cl?nicos randomizados (ECR) que, compararam t?cnicas de
fisioterapia respirat?ria combinadas ao tratamento cl?nico padr?o versus o
tratamento padr?o isolado. Dois revisores independentes selecionaram os
estudos a serem inclu?dos na revis?o e avaliaram a qualidade dos estudos e
extra?ram os dados. Resultados: Tr?s ECRs envolvendo 255 crian?as com
pneumonia foram inclu?dos na revis?o, as quais realizaram fisioterapia
convencional, press?o expirat?ria positiva e press?o positiva cont?nua nas vias
a?reas. Os principais desfechos avaliados foram: tempo de interna??o
hospitalar, melhora cl?nica (observando-se os seguintes par?metros: febre,
sinais de desconforto respirat?rio, taquipneia, dispneia e os n?veis de satura??o
perif?rica de oxig?nio), redu??o dos ru?dos advent?cios, melhora na radiografia
de t?rax e dura??o da tosse em dias. Dois dos estudos inclu?dos encontraram
uma melhora significativa na frequ?ncia respirat?ria e satura??o de oxig?nio.
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Enquanto no terceiro estudo inclu?do, a fisioterapia respirat?ria convencional
n?o se mostrou superior em rela??o ao tratamento cl?nico padr?o isolado para
a melhora cl?nica e tempo de interna??o hospitalar. Nenhum efeito adverso
relacionado ?s interven??es foi descrito. Devido ?s caracter?sticas diferentes
dos ensaios, tais como a dura??o do tratamento, os n?veis de gravidade dos
tipos de pneumonia e as t?cnicas utilizadas em crian?as com pneumonia, bem
como a diferen?as na apresenta??o de an?lise estat?stica, n?o fomos capazes
de combinar os dados em metan?lise. Dois estudos inclu?dos tiveram um baixo
risco de vi?s na maioria dos seus itens avaliados, enquanto que o terceiro
estudo obteve um risco de vi?s incerto. Conclus?o: Essa revis?o n?o fornece
evid?ncias conclusivas que justifiquem o uso ou n?o de fisioterapia respirat?ria
em crian?as com pneumonia, devido ? falta de dados consistentes dos estudos
inclu?dos e baixo poder amostral
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Isolamento de bacteriófagos líticos para Rhodococcus spSantos, Valesca Peter dos January 2016 (has links)
O Rhodococcus equi é uma das principais causas de pneumonia piogranulomatosa e linfadenite em potros de 1-6 meses de idade, resultando em alta morbidade e muitas vezes em óbito. Em propriedades endêmicas, a enfermidade é responsável por gerar altos custos para tratar e prevenir a doença. Com o objetivo de propor uma alternativa para o controle ambiental do Rhodococcus equi, foi aplicado um protocolo para isolamento de bacteriófagos. Foram isoladas 14 amostras de bacteriófagos, obtidas do ambiente de criação de cavalos. Estas apresentaram capacidade de lisar in vitro amostras de campo de Rhodococcus equi com diferentes intensidades. O resultado obtido nos possibilita sugerir que os fagos podem ser uma alternativa natural para a redução da bactéria no ambiente. / Rhodococcus equi is an important cause of pyogranulomatus pneumonia and lymphadenitis in foals 1-6 months of age, resulting in high morbidity and often mortality. In endemic properties, the disease is responsible for generating high costs to treat and prevent disease. In order to propose an alternative to the environmental control of Rhodococcus equi, a protocol for isolation of bacteriophages was applied. Fourteen bacteriophage samples were isolated obtained from horse breeding environment. They showed capacity to lyse in vitro Rhodococcus equi field samples with different sensitivities. The results obtained allows us to suggest the phage as a natural alternative to reducing R. equi population.
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O uso da hiperinsuflação com o ventilador mecânico como técnica de higiene brônquicaNaue, Wagner da Silva January 2015 (has links)
Base teórica: Muitos pacientes internados em Unidade de Terapia Intensiva (UTI) necessitam da instituição da ventilação mecânica invasiva (VM). Porém esta pode trazer efeitos deletérios como: alteração na higiene brônquica e pneumonia associada à ventilação mecânica (PAV). Devido a isso, faz-se necessária avaliação de técnicas de higiene brônquicas eficazes e o menos deletérias possíveis. Objetivos: Comparar a eficácia das técnicas em estudo: vibrocompressão (VB) (G1), hiperinsuflação com o ventilador mecânico (HMV) (G2) VB + HMV (G3) na quantidade de secreção aspirada (SEC), no tempo de VM, na incidência de PAV, na reintubação orotraqueal (Re-IoT) e na mortalidade de pacientes em VM. Método: Ensaio clínico randomizado, realizado no Centro de Terapia Intensiva do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA). Foram incluídos no estudo 93 pacientes (29 G1, 32 G2 e 32 G3) em VM por mais de 24 horas. Foram aplicadas as seguintes técnicas: aspiração isolada (ASP), VB, HMV e VB + HMV. Foram medidas as seguintes variáveis: frequência cardíaca (FC), frequência respiratória (FR), pressão arterial média (PAM), saturação arterial periférica de oxigênio (SpO2), pressão inspiratória de pico (PIP), volume corrente (VC), complacência dinâmica (Cdyn), peso da SEC; tempo de VM, Re-IoT, incidência de PAV e mortalidade na VM. Conclusão: O grupo 3 foi o único que apresentou aumento significativo da SEC, quando comparado à ASP (0,7 g (0,1-2,5) vs 0,2 g (0,0-0,6) – p = 0,006). Em comparação com os demais grupos, o grupo 2 apresentou aumento significativo na incidência de PAV (22% - p = 0,003) e Re-IoT (21,9% - p = 0,048), demonstrando assim, na amostra estudada, que VB + HMV é mais eficaz quanto à quantidade de SEC e exerce efeito protetor, juntamente com a VB, na incidência de PAV e Re-IoT. / Background: Many patients admitted to the Intensive Care Unit (ICU) require the institution of invasive Mechanical Ventilation (MV). However, this can bring harmful effects such as changes in mucociliary transport and cough capacity, leading to bronchial obstruction and Ventilator Associated-Pneumonia (VAP). Objective: To compare the efficacy of the techniques: Vibrocompression (G1), Hyperinflation with Mechanical Ventilation (G2) Vibrocompression + Hyperinflation with Mechanical Ventilation (G3) in the amount of Aspirated Secretions (AS), MV time, the incidence of VAP, Re-intubation tracheal (Re-IoT) and mortality of patients on MV. Method: Randomized clinical trial, conducted at the Intensive Care Unit, of the Hospital de Clinicas de Porto Alegre (HCPA). 93 patients were included in the study (29 G1, 32 G2 and 32 G3) in mechanical ventilation for more than 24 hours. The following techniques were applied: Isolated Aspiration (ASP), Vibrocompression (VB), Hyperinflation with Mechanical Ventilation (HMV) Vibrocompression + Hyperinflation with Mechanical Ventilation (HMV + VB). The following variables were measured: Heart Rate (HR), Respiratory Rate (RR), Mean Arterial Pressure (MAP), Peripheral Arterial Oxygen Saturation (SpO2); Peak Inspiratory Pressure (PIP), Tidal Volume (TV); Dynamic Compliance (Cdyn); weight of the AS; VM time; Re-IoT; VAP incidence and mortality in the VM. Conclusion: The HMV + VB (G3) was the only group that showed significant increase in the AS (0.7 g (0.1-2.5) vs 0.2 g (0.0-0.6) – p = 0.006) when compared to ASP. Compared with the other groups G2 showed a significant increase in the incidence of VAP (22% - p = 0.003) and Re-IoT (21.9% - p = 0.048). Thus demonstrating in the sample, which HMV + VB is more effective as the amount of secretion aspirated and has a protective effect, along with the VB, the incidence of VAP and Re-IoT.
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Achados clínicos e patológicos de sete surtos de Língua Azul em ovinos em 2014 no Rio Grande do Sul, Brasil / Clinical and pathological findings of seven outbreak of bluetongue in sheep during 2014 in Rio Grande do Sul, BrazilGuimarães, Lorena Lima Barbosa January 2015 (has links)
A infecção pelo Vírus da Língua Azul (VLA) ocorre em ruminantes domésticos e selvagens, preferencialmente, ovinos, bovinos e caprinos em regiões tropicais e temperadas onde há o vetor, mosquito do gênero Culicoides. O objetivo do trabalho é descrever os aspectos clínicos e anatomopatológicos de sete surtos de infecção pelo VLA em ovinos no Rio Grande do Sul, confirmados pelo isolamento viral e teste da RT-PCR. De janeiro a outubro de 2014 foram diagnosticados sete surtos de infecção pelo VLA em ovinos no estado do Rio Grande do Sul com histórico de mortalidade de ovinos nos municípios de Taquara (Propriedade A), Fazenda Vilanova (Propriedade B), Viamão (Propriedades C e F), Cachoeira do Sul (Propriedade D e E) e Venâncio Aires (Propriedade G). Os achados clínicos relacionavam-se com o sistema respiratório e locomotor. A taxa de mortalidade variou de 1,7 (4/230 ovinos) a 56% (28/50 ovinos). Realizou-se a necropsia de 10 ovinos e de um feto abortado por um dos ovinos submetidos à necropsia. As principais alterações observadas nos ovinos foram: hiperemia e conteúdo alimentar na cavidade nasal (7/10), pulmões aumentados de tamanho com intenso edema (6/10), consolidação pulmonar antero-ventral (5/10), hemorragias no coração (5/10), hemorragia da artéria pulmonar (4/10) e discreta dilatação e flacidez do esôfago (4/10). Os achados histológicos caracterizaram pneumonia aspirativa (3/10), rinite purulenta (1/10), necrose muscular do esôfago (8/10), hemorragias no coração (3/10), necrose de cardiomiócitos (2/10) e necrose do músculo serrátil cervical ventral (8/10). O feto não apresentou alterações macroscópicas e histológicas. Para confirmar a suspeita foram coletadas 20 amostras de sangue de ovinos doentes e recuperados, e de um bovino. A partir do teste da RT-PCR e isolamento viral confirmou-se o diagnóstico de infecção pelo vírus da língua azul nos sete surtos ocorridos em 2014 no Rio Grande do Sul. E, pela análise filogenética comprovou-se a participação do sorotipo 4 nas Propriedades D e B. / The infection by Bluetongue Virus (BTV) occurs in domestic and wild ruminants, including sheep, cattle and goats in the tropical and temperate regions where the vector is present Culicoides. The objective is describe the clinical and pathological aspects of seven outbreaks of infection by BTV in Rio Grande do Sul, confirmed by viral isolation and RT-PCR test. From January to October 2014 were diagnosed seven outbreaks of infection by BTV in sheep in the state of Rio Grande do Sul with a history of sheep mortality in the cities of Taquara (Propriedade A), FazendaVilanova (Propriedade B), Viamão (Propriedade C and F), Cachoeira do Sul (Propriedade D and E) and Venâncio Aires (Propriedade G). Clinical findings were related to the respiratory and locomotor system. The sheep mortality ranged from 1.7 to 56%. At necropsy the main changes observed in sheep were hyperemia and food content in the nasal cavity (7/10), increased lung size with marked edema (6/10), anterior-ventral pulmonary consolidation (5/10), bleeding heart (5 / 10), bleeding from the pulmonary artery (4/10) and mild swelling and sagging of the esophagus (4/10). Histological findings included aspiration pneumonia (3/10), purulent rhinitis (1/10), muscle necrosis of the esophagus (8/10), bleeding heart (3/10), cardiomyocyte necrosis (2/10) and cervical ventral serratus muscle necrosis (8/10). The fetus showed no macroscopic and histological changes. To confirm the suspicion were collected 20 blood samples from sick and recovered and sheep, and one cow. The RT-PCR test and virus isolation confirmed infection with bluetongue. For phylogenetic analysis of the virus serotype 4 was identified in the Propriedade B and D.
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Abordagem hierarquizada para a identificação de fatores associados à hospitalização por pneumonia, em menores de cinco anos de idade: estudo caso-controle / A hierarchized approach to the identification of the factors associated with hospitalization due to pneumonia in children under five years of age: a case-control studyJuliana Coelho Pina 11 February 2014 (has links)
Objetivos: Investigar os fatores associados à hospitalização por pneumonia, em crianças menores de cinco anos de idade, no município de Ribeirão Preto - SP. Métodos: Estudo epidemiológico com delineamento do tipo caso-controle de base hospitalar, com alocação de 345 casos e 345 controles. Fatores socioeconômicos, reprodutivos, ambientais, perinatais, nutricionais, relativos ao cuidado à criança e à morbidade prévia foram considerados variáveis explanatórias. Os dados foram coletados por meio da aplicação de um questionário pré-codificado que contemplou o elenco de variáveis do estudo, incluindo-se o Instrumento de Avaliação da APS - PCATool. Odds ratios (OR) brutos e ajustados, com respectivos intervalos de confiança (95%) foram calculados, aplicando-se a regressão logística multivariada e seguindo-se os pressupostos da abordagem hierarquizada, buscando-se um modelo explicativo que contemplasse as relações hierárquicas existentes entre as exposições e o desfecho, sendo as análises desenvolvidas no software STATA, versão 12.0. Resultados: Renda familiar superior a R$700,00 foi responsável por uma redução de 32% na chance de hospitalização das crianças por pneumonia (OR=0,68; IC95%=0,47-0,98). Paridade >=2 representou um expressivo aumento na chance de hospitalização (categoria 2 partos: OR=4,60, IC95%=2,18-9,72; categoria >=3 partos: OR=3,25, IC95%=1,55-6,81), enquanto o intervalo interpartal >=48 meses e o ganho de peso na gestação de 10 Kg ou mais apresentaram efeito protetor para o desfecho (OR=0,28, IC95%=0,14-0,56 e OR=0,68, IC95%=0,47-0,97, respectivamente). Frequência à creche foi responsável por um aumento de 67% na chance de hospitalização por pneumonia (OR=1,67, IC95%=1,16-2,41). As crianças desnutridas apresentam uma chance duas vezes maior de serem hospitalizadas pela doença (OR=2,53; IC=1,06-6,05) enquanto aquelas com excesso de peso apresentam uma redução de 63% nessa chance (OR=0,37; IC=0,14-0,99); no entanto, questiona-se a plausibilidade biológica desse efeito protetor. A situação vacinal não atualizada foi responsável por um aumento de quase 3 vezes na chance de hospitalização por pneumonia (OR=2,81; IC=1,76-4,49). As crianças que fizeram uso pregresso de medicamentos apresentaram uma chance 67% maior de serem hospitalizadas por pneumonia (OR=1,67; IC=1,00-2,78; p=0,049). Crianças com sibilância prévia apresentaram o dobro de chance de serem hospitalizadas pela doença (OR categoria 1 episódio = 2,13; IC95%=1,31-3,47; OR categoria >=3 episódios = 2,37; IC95%=1,35-4,15). A exclusão de pneumonias aspirativas dentre os casos pode ter contribuído para uma maior proporção de crianças com refluxo referido entre os controles, levando a uma associação inversa à esperada (efeito de proteção) entre refluxo gastroesofágico e hospitalização por pneumonia (OR=0,55; IC=0,31-0,99). Escores Essenciais da APS acima de 3,17 foram responsáveis por um efeito protetor em relação à hospitalização por pneumonia, reduzindo as chances de hospitalização em 43% (OR para a categoria >3,41 = 0,57; IC=0,32-0,99) a 50% (OR para a categoria >3,17 e <=3,41 = 0,50; IC=0,28-0,88). Conclusões: O modelo explicativo obtido pelo presente estudo é composto, em grande parte, por variáveis relacionadas ao cuidado à criança ou às características da mãe e da família. Considerando-se os procedimentos referentes ao planejamento do estudo, à execução da coleta de dados e às análises estatísticas empregadas, reitera-se a consecução de validade interna para o estudo, sendo possível afirmar que o modelo obtido é explicativo do fenômeno da hospitalização por pneumonia, na população estudada. / Objectives: To investigate the factors associated with hospitalization due to pneumonia in children under five years of age in the city of Ribeirão Preto - SP, Brazil. Methods: Epidemiological study with a hospital-based case-control design, including 345 cases and 345 controls. Socioeconomic, reproductive, environmental, perinatal, nutritional, childcare and previous morbidity factors were considered as explanatory variables. The data were collected through the application of a pre-coded questionnaire that addressed the study variables and included the Primary Care Assessment Tool - PCATool. Gross and adjusted odds ratios (OR) were calculated with their respective confidence intervals (95%), applying multivariate logistic regression in accordance with the premises of the hierarchized approach, looking for an explanatory model that considered the existing hierarchical relations between the exposures and the outcome. The analyses were developed in STATA software, version 12.0. Results: A family income superior to R$700 was responsible for a 32% reduction in children\'s chance of hospitalization due to pneumonia (OR=0.68; 95%CI=0.47-0.98). Parity>=2 represented a considerable increase in the chance of hospitalization (category 2 births: OR=4.60, 95%CI=2.18-9.72; category >=3 births: OR=3.25, 95%CI=1.55-6.81), while the inter-birth interval >=48 months and the weight gain of 10 Kg or more during pregnancy represented a protective effect against the outcome (OR=0.28, 95%CI=0.14-0.56 and OR=0.68, 95%CI=0.47-0.97, respectively). Attending kindergarten was responsible for a 67% increase in the chance of hospitalization due to pneumonia (OR=1.67, 95%CI=1.16-2.41). Malnourished children present twice as many chances of being hospitalized due to the disease (OR=2.53; CI=1.06-6.05), while children with overweight present a 63% reduction in that chance (OR=0.37; CI=0.14-0.99); the biological plausibility of this protective effect is questioned though. An outdated vaccine situation was responsible for almost three times as many chances of hospitalization due to pneumonia (OR=2.81; CI=1.76-4.49). Children with earlier medication use revealed a 67% higher chance of being hospitalized due to pneumonia (OR=1.67; CI=1.00-2.78; p=0.049). Children with earlier wheezing presented twice as many chances of being hospitalized due to the disease (OR category 1 episode = 2.13; 95%CI=1.31-3.47; OR category >=3 episodes = 2.37; 95%CI=1.35-4.15). The exclusion of aspiration pneumonias from the cases may have contributed to a greater proportion of children with reflux among the control, leading to an inverse association (protective effect) between gastroesophageal reflux and hospitalization due to pneumonia (OR=0.55; CI=0.31-0.99). Essencial Scores of PHC superior to 3.17 were responsible for a protective effect with regard to hospitalization due to pneumonia, reducing the chances of hospitalization by 43% (OR for the category >3.41 = 0.57; CI=0.32-0.99) to 50% (OR for the category >3.17 and <=3.41 = 0.50; CI=0.28-0.88). Conclusions: The explanatory model obtained in this study largely includes variables related to childcare or the mother\'s and family\'s characteristics. In view of the study planning and data collection procedures and the statistical analyses applied, the internal validity of the study is highlighted, based on which it can be affirmed that the obtained model explains the phenomenon of hospitalization due to pneumonia in the study population.
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Pneumocystis sp. e circovirus (PCV2) em pulmões de suínos de abate, procedentes dos estados do Rio Grande do Sul e Mato Grosso e estudo das relações filogenéticas das amostras de pneumocystis sp.Sanches, Edna Maria Cavallini January 2006 (has links)
As doenças respiratórias constituem um sério problema em sistemas intensivos de criação de suínos, causando enormes prejuízos à industria suína no Brasil e no mundo. Estes prejuízos estão freqüentemente relacionados à redução de peso, mortalidade, maior predisposição a doenças entéricas, gastos com vacinas e medicamentos. Os distúrbios respiratórios em suínos são manifestados através de um complexo de doenças, com envolvimento de agentes virais, bacterianos e fúngicos. Dentre estes, a presença do circovírus (PCV2) e o Pneumocystis sp. começa a ser gradativamente caracterizada como uma associação entre um agente causador de imunossupressão e um organismo de ação oportunista. O trabalho objetivou diagnosticar Pneumocystis sp. através das técnicas de imunohistoquímica, Grocott e nested-PCR, em suínos abatidos nos Estados do Rio Grande do Sul (RS) e Mato Grosso (MT), diagnosticar a ocorrência de PCV2 na mesma população de suínos, verificar a associação entre Pneumocystis sp. e PCV2, e determinar as relações filogenéticas entre as amostras de Pneumocystis sp. O estudo avaliou um total de 591 pulmões, 297 com alterações macroscópicas (pneumonia) e 294 normais obtidos em frigoríficos. Foram analisados 292 pulmões procedentes do RS e 299 pulmões do MT Para diagnóstico do Pneumocystis sp. as amostras foram analisadas através das técnicas de Grocott, Imunohistoquímica e nested-PCR (mtLSU e mtSSU rRNA). Do total das amostras, 36,9% foram positivas para Pneumocystis. O índice de positividade para o vírus PCV2 foi de 32,7% na amostra total. Os resultados revelaram uma alta prevalência do vírus (PCV2) em pulmões sem lesões macroscópicas. A co-infecção (PCV2 e Pneumocystis sp.), foi detectada em 28,0% em 564 pulmões examinados. As análises das seqüências dos nucleotídeos dos produtos de PCR dos genes mtLSU e mtSSU do rRNA do Pneumocystis sp. nos pulmões analisados, sugerem a presença até o presente momento de 2 espécies diferentes de Pneumocystis no Brasil. Este estudo evidencia a ocorrência da co-infecção de dois agentes (Pneumocystis sp. e PCV2) em animais hígidos, fato que, indica a necessidade de planejamento e implementação de medidas de controle para melhorar a produtividade na suinocultura. / Respiratory diseases are a major problem in intensive systems of swine husbandry. They are a cause for high losses in the swine industry in Brazil and in the world. These losses are often related to weight reduction, mortality, higher vulnerability to enteric diseases, and expenses with vaccines and drugs. Respiratory diseases in swine appear through a complex of diseases, caused by virus, bacteria and fungi; among these, the porcine circovirus 2 (PCV2) and Pneumocystis sp., the former an agent which causes immunosupression and the latter an oportunistic microorganism. Both are being recognized as capable of being associated. The objectives of this study were to: identify Pneumocystis sp. through immunohystochemistry techniques, Grocott and nested-PCR in swine slaughtered in the States of Rio Grande do Sul and Mato Grosso (MT); investigate PCV2 in the same swine population; investigate the association between Pneumocystis sp. and PCV2, and establish a filogenetic relationship between isolated of Pneumocystis sp. The study was carried out with a total of 591 lungs, 297 with macroscopic alterations characteristic of pneumonia, and 294 normal lungs from the industry. 292 lungs came from RS and 299 lungs came from MT. In order, to diagnose Pneumocystis infection, samples were analysed through Grocott technique, immunohystochemistry and nested-PCR (mtLSU and mtSSU rRNA). Among all samples 36,9% were positive for Pneumocystis sp.. PCV2 virus was found in 37,2% of the samples. Results revealed a high prevalence of the PCV2 virus in lungs without macroscopic lesions. Co-infection (PCV2 and Pneumocystis sp.) was found in 28,0% of 564 lungs examined. So far, the analyses of the sequences of nucleotides from the products of PCR from the genes mtlSU rRNA and mtSSU rRNA from Pneumocystis obtained from the examined lungs suggest that, it is possible the existence of two different species of Pneumocystis in Brazil. This study shows co-infection by two agents (Pneumocysts sp. and PCV2) in apparently healthy animals. This fact points out the necessity planning and implementation of control measures in order to improve productiviy in swine husbandry and industry.
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Achados clínicos e patológicos de sete surtos de Língua Azul em ovinos em 2014 no Rio Grande do Sul, Brasil / Clinical and pathological findings of seven outbreak of bluetongue in sheep during 2014 in Rio Grande do Sul, BrazilGuimarães, Lorena Lima Barbosa January 2015 (has links)
A infecção pelo Vírus da Língua Azul (VLA) ocorre em ruminantes domésticos e selvagens, preferencialmente, ovinos, bovinos e caprinos em regiões tropicais e temperadas onde há o vetor, mosquito do gênero Culicoides. O objetivo do trabalho é descrever os aspectos clínicos e anatomopatológicos de sete surtos de infecção pelo VLA em ovinos no Rio Grande do Sul, confirmados pelo isolamento viral e teste da RT-PCR. De janeiro a outubro de 2014 foram diagnosticados sete surtos de infecção pelo VLA em ovinos no estado do Rio Grande do Sul com histórico de mortalidade de ovinos nos municípios de Taquara (Propriedade A), Fazenda Vilanova (Propriedade B), Viamão (Propriedades C e F), Cachoeira do Sul (Propriedade D e E) e Venâncio Aires (Propriedade G). Os achados clínicos relacionavam-se com o sistema respiratório e locomotor. A taxa de mortalidade variou de 1,7 (4/230 ovinos) a 56% (28/50 ovinos). Realizou-se a necropsia de 10 ovinos e de um feto abortado por um dos ovinos submetidos à necropsia. As principais alterações observadas nos ovinos foram: hiperemia e conteúdo alimentar na cavidade nasal (7/10), pulmões aumentados de tamanho com intenso edema (6/10), consolidação pulmonar antero-ventral (5/10), hemorragias no coração (5/10), hemorragia da artéria pulmonar (4/10) e discreta dilatação e flacidez do esôfago (4/10). Os achados histológicos caracterizaram pneumonia aspirativa (3/10), rinite purulenta (1/10), necrose muscular do esôfago (8/10), hemorragias no coração (3/10), necrose de cardiomiócitos (2/10) e necrose do músculo serrátil cervical ventral (8/10). O feto não apresentou alterações macroscópicas e histológicas. Para confirmar a suspeita foram coletadas 20 amostras de sangue de ovinos doentes e recuperados, e de um bovino. A partir do teste da RT-PCR e isolamento viral confirmou-se o diagnóstico de infecção pelo vírus da língua azul nos sete surtos ocorridos em 2014 no Rio Grande do Sul. E, pela análise filogenética comprovou-se a participação do sorotipo 4 nas Propriedades D e B. / The infection by Bluetongue Virus (BTV) occurs in domestic and wild ruminants, including sheep, cattle and goats in the tropical and temperate regions where the vector is present Culicoides. The objective is describe the clinical and pathological aspects of seven outbreaks of infection by BTV in Rio Grande do Sul, confirmed by viral isolation and RT-PCR test. From January to October 2014 were diagnosed seven outbreaks of infection by BTV in sheep in the state of Rio Grande do Sul with a history of sheep mortality in the cities of Taquara (Propriedade A), FazendaVilanova (Propriedade B), Viamão (Propriedade C and F), Cachoeira do Sul (Propriedade D and E) and Venâncio Aires (Propriedade G). Clinical findings were related to the respiratory and locomotor system. The sheep mortality ranged from 1.7 to 56%. At necropsy the main changes observed in sheep were hyperemia and food content in the nasal cavity (7/10), increased lung size with marked edema (6/10), anterior-ventral pulmonary consolidation (5/10), bleeding heart (5 / 10), bleeding from the pulmonary artery (4/10) and mild swelling and sagging of the esophagus (4/10). Histological findings included aspiration pneumonia (3/10), purulent rhinitis (1/10), muscle necrosis of the esophagus (8/10), bleeding heart (3/10), cardiomyocyte necrosis (2/10) and cervical ventral serratus muscle necrosis (8/10). The fetus showed no macroscopic and histological changes. To confirm the suspicion were collected 20 blood samples from sick and recovered and sheep, and one cow. The RT-PCR test and virus isolation confirmed infection with bluetongue. For phylogenetic analysis of the virus serotype 4 was identified in the Propriedade B and D.
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Desenvolvimento de técnicas de pré-processamento de radiografias digitais de tórax infantil : uma abordagem orientada a segmentação para sistemas de diagnóstico assistido por computador / Development of digital chest x-ray preprocessing techniques : a segmentation-oriented approach to computer-aided diagnostic systemsFonseca, Afonso Ueslei da 27 March 2017 (has links)
Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-04-05T17:19:40Z
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Previous issue date: 2017-03-27 / According to the World Health Organization (WHO), more than 900,000 children, younger
than five years old, have died in 2015 due to pneumonia. Many of these deaths could
be avoided with earlier and more accurate diagnosis to provide proper medicine administration.
Chest radiography is one of the most recommended test by the WHO in order
to detect childhood pneumonia, and it is commonly used in computer aided diagnostic
(CAD) systems. A science role is to develop systems that require a more precise medical
diagnosis and treatment cost reducing, but mainly death rate decreasing. It is highlighted
that quality radiography demands equipments very well installed and calibrated and staff
trained to handle them. However, due limited budget resources, mainly in most vulnerable
areas, the image quality is significantly damaged, so turning the medical diagnosis harder.
Therefore, this work presents a method composed of a set of preprocessing techniques
for pediatric radiography. These techniques intend to have simple implementation and
low computational cost. The main goal of this work is to increase performance, accuracy
and robustness of CAD systems, to improve database standardization and also to collaborate
with the professionals training. Thus, techniques were developed, such as, visual
quality enhancement, removal of unnecessary or confidential information, reconstruction
of degraded areas due to the information removal, orientation correction and definition
of a region of interest. All techniques were evaluated using a children chest X-ray database
divided into three classes and results show significantly improve when compared to
methods presented in literature. We expect these contributions will assist to development
and improvement of new systems, construction of more standardized databases, staff training
and the development of new techniques. / Segundo a Organização Mundial de Saúde (OMS) mais de 900 mil crianças, menores de
cinco anos, foram a óbito em 2015, devido a pneumonia. Muitas dessas mortes poderiam
ser evitadas com um diagnóstico mais preciso, precoce e com correta administração de
medicamentos. A radiografia de tórax é um dos exames preconizados para detecção de
pneumonia pela OMS, sendo comumente usada em sistemas de diagnóstico assistido por
computador (CAD). Desenvolver sistemas que apoiem diagnóstico médico mais preciso,
reduzam custos de tratamento e principalmente diminuam o número de óbitos é um papel
da ciência. Destaca-se que radiografias de qualidade requerem equipamentos devidamente
instalados/calibrados e pessoal capacitado para opera-los. Todavia, dado os recursos
financeiros limitados, principalmente em áreas mais vulneráveis, a qualidade das imagens
fica significativamente comprometida, dificultando o trabalho de diagnóstico pelo médico.
Assim, este trabalho traz um método composto por técnicas de pré-processamento de
radiografias de tórax pediátricas. As técnicas foram idealizadas para serem de simples
implementação e baixo custo computacional. Os principais objetivos do trabalho são
promover ganho de performance, acurácia e robustez aos sistemas CAD, favorecer a
construção de bases de imagens padronizadas e além disso colaborar com o treinamento
de profissionais de saúde. Para atingir esses objetivos foram desenvolvidas técnicas de
melhoria da qualidade visual, remoção de informações desnecessárias ou confidenciais e
reconstrução das áreas degradadas decorrente da remoção dessas informações, correção
de orientação e definição de regiões de interesse. Esse método foi avaliado utilizando
uma base de radiografias de tórax infantil divida em três classes e resultados mostram
ganhos significativos em comparação a métodos presentes na literatura. Espera-se que
essas contribuições favoreçam o aperfeiçoamento de sistemas, construção de bases mais
padronizadas, treinamento de profissionais e surgimento de novas técnicas.
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