The hepatitis delta virus (HDV), composed of ~1,700nt, is the smallest circular RNA pathogen known to infect humans. Understanding the mode of replication of HDV implies on investigating the host proteins that bind to its genome. The polypyrimidine tract-binding protein-associated splicing factor (PSF), an HDV interacting protein, was found to interact with the carboxy terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (RNAPII), and to facilitate the interaction of RNA transcripts with the CTD of RNAPII. Both PSF and RNAPII were found to interact with both polarities of the terminal stem loop domains of HDV RNA, which possess RNA promoter activity in vitro. Furthermore, PSF and RNAPII were found to simultaneously interact with HDV RNA in vitro. Together, the above experiments suggest that PSF acts as a transcription factor during HDV RNA replication by interacting with both the CTD of RNAPII and HDV RNA simultaneously. PSF knockdown experiments were performed to indicate that PSF is required for HDV RNA accumulation. Mutagenesis experiments of PSF revealed that HDV RNA accumulation might require the N terminal domain, and the RNA recognition motifs RRM1 and RRM2. I propose that the RRM1 and RRM2 domains might interact with HDV RNA, while the N-terminal domain might interact with the CTD of RNAPII for HDV RNA accumulation. Together, the above experiments provide a better understanding of how an RNA promoter might be recognized by RNAPII.

The hepatitis delta virus (HDV), composed of ~1,700nt, is the smallest circular RNA pathogen known to infect humans. Understanding the mode of replication of HDV implies on investigating the host proteins that bind to its genome. The polypyrimidine tract-binding protein-associated splicing factor (PSF), an HDV interacting protein, was found to interact with the carboxy terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (RNAPII), and to facilitate the interaction of RNA transcripts with the CTD of RNAPII. Both PSF and RNAPII were found to interact with both polarities of the terminal stem loop domains of HDV RNA, which possess RNA promoter activity in vitro. Furthermore, PSF and RNAPII were found to simultaneously interact with HDV RNA in vitro. Together, the above experiments suggest that PSF acts as a transcription factor during HDV RNA replication by interacting with both the CTD of RNAPII and HDV RNA simultaneously. PSF knockdown experiments were performed to indicate that PSF is required for HDV RNA accumulation. Mutagenesis experiments of PSF revealed that HDV RNA accumulation might require the N terminal domain, and the RNA recognition motifs RRM1 and RRM2. I propose that the RRM1 and RRM2 domains might interact with HDV RNA, while the N-terminal domain might interact with the CTD of RNAPII for HDV RNA accumulation. Together, the above experiments provide a better understanding of how an RNA promoter might be recognized by RNAPII.

The hepatitis delta virus (HDV), composed of ~1,700nt, is the smallest circular RNA pathogen known to infect humans. Understanding the mode of replication of HDV implies on investigating the host proteins that bind to its genome. The polypyrimidine tract-binding protein-associated splicing factor (PSF), an HDV interacting protein, was found to interact with the carboxy terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (RNAPII), and to facilitate the interaction of RNA transcripts with the CTD of RNAPII. Both PSF and RNAPII were found to interact with both polarities of the terminal stem loop domains of HDV RNA, which possess RNA promoter activity in vitro. Furthermore, PSF and RNAPII were found to simultaneously interact with HDV RNA in vitro. Together, the above experiments suggest that PSF acts as a transcription factor during HDV RNA replication by interacting with both the CTD of RNAPII and HDV RNA simultaneously. PSF knockdown experiments were performed to indicate that PSF is required for HDV RNA accumulation. Mutagenesis experiments of PSF revealed that HDV RNA accumulation might require the N terminal domain, and the RNA recognition motifs RRM1 and RRM2. I propose that the RRM1 and RRM2 domains might interact with HDV RNA, while the N-terminal domain might interact with the CTD of RNAPII for HDV RNA accumulation. Together, the above experiments provide a better understanding of how an RNA promoter might be recognized by RNAPII.

Positron emission tomography (PET) is a powerful and highly specialised imaging modality that has the inherent ability to detect and quantify changes in the bio-distribution of an intravenously administered radio-labelled tracer, through dynamic image acquisition of the system under study. By modelling the temporal distribution of the tracer, parameters of interest regarding specific biological processes can be derived. Traditionally parameter estimation is done by first reconstructing a set of dynamic images independently, followed by kinetic modelling, leading to parameters of reduced accuracy and precision. Furthermore only simple geometrical models are used during image reconstruction to model the mapping between the image space and the data space, leading to images of reduced resolution. This thesis attempts to address some of the problems associated with the current methodology, by implementing and evaluating new spatiotemporal image reconstruction strategies in oncology PET/CT imaging, with simulated, phantom and real data. More specifically this thesis is concerned with iterative reconstruction techniques, the incorporation of resolution recovery and kinetic modelling strategies within the image reconstruction process and the application of such methods in perfusion [15O]H2O imaging. This work is mainly based upon 2 whole body PET/CT scanners, the Siemens Biograph 6 B-HiRez and TruePoint TrueV, but some aspects of this work were also implemented for the High resolution research tomograph (HRRT).

Submitted by Maria Creuza Silva (mariakreuza@yahoo.com.br) on 2018-08-29T02:50:56Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Luis Andre S. Ferreira.pdf: 323744 bytes, checksum: 54f488ea4207be8367a0f750651dce4d (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Creuza Silva (mariakreuza@yahoo.com.br) on 2018-08-29T02:52:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Luis Andre S. Ferreira.pdf: 323744 bytes, checksum: 54f488ea4207be8367a0f750651dce4d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-29T02:52:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Luis Andre S. Ferreira.pdf: 323744 bytes, checksum: 54f488ea4207be8367a0f750651dce4d (MD5) / A mudança do modelo de atenção à saúde no Sistema Único de Saúde (SUS) vem sendo desenvolvida a partir de 1994 com a implantação do Programa de Saúde da Família, cujo objetivo central é reorganizar a atenção prestada nas unidades básicas de saúde. O PSF contempla a organização de uma equipe multiprofissional composta por médico, enfermeiro, odontólogo, auxiliares de enfermagem e odontologia, além de agentes comunitários, responsável pelo planejamento e execução das ações em um território definido. A prática da equipe pressupõe uma mudança significativa do objeto de conhecimento/intervenção, das tecnologias empregadas e da organização do processo de trabalho. A implementação dessa proposta exige a mudança do perfil ocupacional dos diversos profissionais e trabalhadores que atuam nas equipes, o que vem sendo buscada através do desenvolvimento de processos de capacitação e educação permanente. A experiência acumulada revela, entretanto, que isso é insuficiente para garantir a mudança das práticas das equipes, o que tem gerado propostas de incorporação da supervisão ao modelo organizacional e gerencial do PSF. A supervisão se apresenta, assim, como ”uma ferramenta do trabalho coletivo de natureza gerencial que se caracteriza como tecido conjuntivo ou argamassa ao articular os diversos momentos e trabalhos operacionalizados pelos variados agentes" (PEDUZZI & PALMA, 1996). O objetivo deste trabalho é descrever e analisar o processo de construção da supervisão das Equipes de Saúde da Família (ESF) e caracterizar as práticas de supervisão que vem sendo realizadas. Trata-se de um estudo de caso, realizado em um município do Nordeste brasileiro, selecionado em função da experiência acumulada com a implantação do PSF e da prática da supervisão. A metodologia empregada incluiu análise documental, aplicação de entrevistas aos diversos profissionais envolvidos na supervisão e observação direta de suas práticas durante o período da investigação. Os resultados apontam que a construção da supervisão derivou da necessidade identificada pela coordenação do Programa com o objetivo de apoiar o processo de reorganização das práticas dos diversos profissionais das ESF de modo a concretizar os princípios e diretrizes do Programa. Revela, ainda que a supervisão no município desenvolve desde o apoio a atividades político-gerenciais, a atividades voltadas à organização de serviços e implementação de práticas de saúde nas unidades, através da educação permanente, até a mediação estratégica entre as ESF e os canais institucionalizados de participação e controle social. Ou seja, essa prática apresenta características de uma supervisão em parceria, chamada por alguns autores de “convisão” (NUNES & BARRETO, 1999) e também é organizada de forma semelhante à proposta de supervisão matricial, ou apoio institucional sugerido por Campos (2002). É importante ressaltar que o razoável grau de institucionalização da supervisão das ESF no município estudado proporciona segurança e suporte necessário aos supervisores no desempenho de suas funções. O estudo revela, portanto, a importância da tomada de consciência por parte da equipe dirigente da SMS com relação ao significado estratégico da supervisão, o que permitiu a construção dessa prática, enquanto importante instrumento de gerenciamento do processo de trabalho das equipes de forma condizente com os princípios do SUS.

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9165_1.pdf: 369544 bytes, checksum: 1ad7fbda2920849dfc1abbc6c298a13c (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / As plantas medicinais sempre contribuíram para a cura ou melhoria das enfermidades que atingem a população, principalmente em países em desenvolvimento. São amplamente utilizadas no meio familiar, principalmente pelas mulheres, que podem deter um maior conhecimento, visto que são responsáveis pela saúde e alimentação da família. Este uso pode se dá no período gestacional para combater, auxiliar e aliviar os sintomas inerentes a gestação, sendo necessários estudos etnofarmacológicos para compreender esses usos. O objetivo deste estudo foi, principalmente, analisar o saber popular das gestantes que freqüentam as Unidades de Saúde da Família (USF), do IV Distrito Sanitário da Cidade do Recife/PE, sobre os riscos e efeitos tóxicos que pode haver ao utilizarem as plantas medicinais. Os dados foram coletados por meio de entrevistas estruturadas a partir de uma abordagem intencional. Participaram do estudo, 214 gestantes, maiores de 18 anos, com idade média de 25,5 anos, a grande maioria casadas com ensino médio completo, que não exercem atividades remuneradas e renda familiar abaixo de um salário mínimo (R$ 530,00 ou U$ 321,21). São gestantes multíparas, com 02 a 03 filhos em média, nascidos de parto normal e baixa taxa de aborto. Evidenciou-se que apesar da maioria conhecer alguma planta medicinal pouco menos da metade as utiliza. As plantas indicadas no uso em geral e que obtiveram os maiores valores de saliência foram: boldo (0,336), capim-santo (0,233), camomila (0,12), erva-cidreira (0,136), aroeira (0,136), erva-doce (0,114) e canela (0,107), onde as ervas medicinais se sobressaíram. Enquanto que no período gestacional, as principais plantas citadas, por percentual de indicação, foram: camomila (17,54%), erva doce (15,79%), boldo (14,04%), erva-cidreira (12,28%), canela (10,50%), capim-santo (7,02%), e hortelã (5,26%). As principais indicações para o uso em geral: calmante, dor de barriga, inflamação, cólica, tosse e febre e no período gestacional foi calmante, enjôo, dor na barriga, disenteria, dor, flatulência e inflamação. A parte das plantas mais utilizadas foi à folha no preparo dos chás, no qual a administração foi por via oral com uma freqüência de duas vezes ao dia. As contra-indicações no uso das plantas medicinais para a grande maioria das gestantes parece não existir. Em 1/3 das gestantes entrevistadas verificou-se que o uso de plantas não faz mal ao feto. Dentre as plantas contra-indicadas no período gestacional, as mais citadas foram: quebra-pedra, cabacinho, boldo, erva cidreira e espirradeira, podendo causar aborto, cólicas no bebê e até levar a morte. O repasse do conhecimento e a forma de adquirir a planta medicinal continuam sendo através da família, e num percentual muito pequeno pelo profissional de saúde, não tendo como saber a sua procedência e se está em condições favoráveis de uso, podendo levar a reações adversas. Ocorre a substituição da receita médica pela planta medicinal por um quantitativo significativo de gestantes, evidenciando o processo de automedicação. Observamos uma postura de risco quando mais da metade das gestantes disseram que as plantas medicinais não trazem risco à saúde, uma vez que nenhuma planta é isenta de toxicidade. As reações desagradáveis relatadas por uma minoria das gestantes no uso das plantas medicinais foram: sangramento, vômitos, aborto, diarréias e até reações que levaram a uma entrevistada a ir para uma unidade de tratamento intensivo. Há uma necessidade de maiores esclarecimentos às gestantes quanto à nocividade de algumas plantas no período gestacional

The hepatitis delta virus (HDV), composed of ~1,700nt, is the smallest circular RNA pathogen known to infect humans. Understanding the mode of replication of HDV implies on investigating the host proteins that bind to its genome. The polypyrimidine tract-binding protein-associated splicing factor (PSF), an HDV interacting protein, was found to interact with the carboxy terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (RNAPII), and to facilitate the interaction of RNA transcripts with the CTD of RNAPII. Both PSF and RNAPII were found to interact with both polarities of the terminal stem loop domains of HDV RNA, which possess RNA promoter activity in vitro. Furthermore, PSF and RNAPII were found to simultaneously interact with HDV RNA in vitro. Together, the above experiments suggest that PSF acts as a transcription factor during HDV RNA replication by interacting with both the CTD of RNAPII and HDV RNA simultaneously. PSF knockdown experiments were performed to indicate that PSF is required for HDV RNA accumulation. Mutagenesis experiments of PSF revealed that HDV RNA accumulation might require the N terminal domain, and the RNA recognition motifs RRM1 and RRM2. I propose that the RRM1 and RRM2 domains might interact with HDV RNA, while the N-terminal domain might interact with the CTD of RNAPII for HDV RNA accumulation. Together, the above experiments provide a better understanding of how an RNA promoter might be recognized by RNAPII.

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The limited spatial resolution in positron emission tomography (PET) images leads to difficulties to measure correct uptake in tumours. This is called partial volume effects (PVE) and can lead to serious bias, especially for small tumours. Correct uptake values are valuable for evaluating therapies and can be used as a tool for treatment planning. The purpose of this project was to evaluate two methods for compensating for PVE. Also, a method for tumour delineation in PET-images was evaluated. The methods were used on images reconstructed with two algorithms, VUE-point HD (VP HD) and VP SharpIR. The evaluation was performed using a phantom including fillable spheres which were used to simulate tumours of different sizes. The first method used for PVE compensation was an iterative deconvolution method which to some degree restores the spatial resolution in the images. The tumour uptake was measured with volumes of interest (VOIs) based on a percentage of the maximum voxel value. The second method was to use recovery coefficients (RCs) as correction factors for the measured activity concentrations. These were calculated by convolving binary images of tumours with the point spread function (PSF). The binary images were achieved both from computed tomography (CT) images and from PET images with a threshold method for tumour delineation. The threshold method was based on both tumour activity and background activity, and was also compared with a conventional threshold technique. The results showed that images reconstructed with VP SharpIR can be used for activity concentration measurements with good precision for tumours larger than 13mm diameter. Smaller tumours benefit from RCs correction. The threshold method for tumour delineation showed substantially better results compared to the conventional threshold method. / Den begränsade spatiella upplösningen i bilder från positronemissions-tomografi (PET) leder till svårigheter i att mäta korrekt upptag i tumörer. Detta kallas partiella volymseffekter (PVE) och kan leda till stora fel, speciellt för små tumörer. Korrekta upptagsvärden är värdefulla vid behandlingsutvärdering och kan användas som ett verktyg för att planera behandlingar. Syftet med detta projekt var att utvärdera två metoder för att kompensera för PVE. Även en metod för tumöravgränsning i PET-bilder utvärderades. Metoderna användes på bilder som rekonstruerats med två olika algoritmer, VUE-point HD (VP HD) och VP SharpIR. Utvärderingen utfördes med ett fantom med sfärer som fylldes med aktivitet och därmed simulerade tumörer av olika storlekar. Den första metoden för PVE-kompensation var en iterativ avfaltningsmetod som, i viss mån, återställer bildernas spatiella upplösning. Upptaget i tumörerna mättes som medelupptaget i s.k. ”volumes of interests” (VOI:ar) som baserades på andelar av maximala voxelvärdet. Den andra metoden byggde på användning av s.k. recovery coefficients (RCs) som korrektionsfaktorer för de uppmätta aktivitetskoncentrationerna. Dessa beräknades genom att falta binära bilder av tumörerna med punktspridningsfunktionen (PSF). De binära bilderna framställdes både från bilder tagna med datortomografi (computed tomography, CT) och från PET-bilder med en tröskelmetod för tumöravgränsning. Tröskelmetoden baserades både på aktiviteten i tumören och på bakgrundsaktiviteten. Den jämfördes också med en konventionell tröskelmetod. Resultaten visade att bilder som rekonstruerats med VP SharpIR kan användas för mätning av aktivitetskoncentration med god precision för tumörer större än 13mm diameter. För mindre tumörer är det bättre att använda RC:s. Tröskelmetoden för tumöravgränsning visade avsevärt bättre resultat jämfört med den traditionella tröskelmetoden.

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:38:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FabianaLS.pdf: 655458 bytes, checksum: e94bc91d973d0c27aac0a995d1542a52 (MD5) Previous issue date: 2004-05-14 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The model of attention to health has been suffering alterations due to the difficulty faced to put into practice its universal, democratic and institutional layout. Since the movement of Sanitary Reform, which focused in the demands of a new health context and the process of work in the area of health, one seeks uninterruptedly, to find a way which leads to the execution of the principles of SUS. Despite having tried, the model of Sanitary Vigilance centered within the work of a multi-professional team has shown fragmentation and little adequacy to the necessity of health in the population. Whilst inserting himself in the field of health, the psychology professional has taken with him his clinic way of attending to individuals being one more in the team to act in a de-contextualised and little critical way. In virtue of this framework, the Ministry of Health invests in the Family Health Program as a new guide in the health system, restructuring the basic attention at a new logic of action. In this way, the municipality of Natal-RN implants, in the year 2002, the PSF in the Northern Sanitary District, a context in which professional teams are created where there is not an inclusion of a psychologist. Consequently, this professional is excluded of his work space in the previous Basic Unities of Health. This piece of work constitutes in the investigation of the implementation and instrumentalization of the Northern Sanitary District PSF of Natal-RN, having as its objective to analyze the implications of this execution for the structuring of the health network services and more specifically the alterations that this implementation could be making to the practice of the Psychology Professionals, emphasizing its advances, obstacles and limitations. To make this work feasible it was necessary to search for data and information from the implementation and execution of the PSF in the DSN, carrying interviews from a semi-structured guide, with 21 institutional actors (members of the team, coordinators and directors of the unities and psychologists) / O modelo de aten??o ? sa?de vem sofrendo altera??es em face da dificuldade enfrentada para p?r em pr?tica seu desenho institucional universalista e democr?tico. Desde o Movimento da Reforma Sanit?ria, que p?s em pauta a exig?ncia de um novo contexto de sa?de e o pr?prio processo de trabalho em sa?de, busca-se, ininterruptamente, encontrar um caminho que leve ? efetiva??o dos princ?pios do SUS. Embora o modelo da vigil?ncia sanit?ria - centrada na atua??o de uma equipe multiprofissional - tenha tentado, mostrou-se fragmentado e pouco adequado ?s necessidade de sa?de da popula??o. Ao inserir-se no campo da sa?de, profissional de psicologia levou consigo seu modelo cl?nico de atendimento, sendo mais um - na equipe - a atuar de forma descontextualizada e pouco cr?tica. Em virtude dese quadro, o Minist?rio da Sa?de investe no Programa Sa?de da Fam?lia enquanto novo orientador do sistema de sa?de, resstruturando a aten??o b?sica sob uma nova l?gica de a??o. Nesse sentido, o munic?pio de Natal-RN, implanta, no ano de 2002, PSF no Distrito Sanit?rio Norte, contexto em que s?o criadas equipes de profissionais nas quais n?o h? inclus?o do psic?logo. Conseq?entemente, esse profissional ? exclu?do de seu espa?o de trabalho nas antigas Unidades B?sicas de Sa?de.Este trabalho constitui-se na investiga??o da implanta??o e instrumentaliza??o do PSF no Distrito Sanit?rio Norte de Natal-RN, tendo como objetivo analisar as implica??es dessa efetiva??o para a estrutura??o da rede de servi?os e mais especificamente as altera??es que essa implanta??o possa estar imprimindo ? pr?tica dos profissionais de Psicologia, destacando seus avan?os, entraves e limites. Para realizar tal estudo se fez neces?rio buscar dados e informa??es da implanta??o e efetiva??o do PSF no DSN, realizandoainda entrevistas, a partir de um roteiro semi-estruturado, com 21 atores institucionais (integrantes de equipes, coordenaodres e diretores de unidades de sa?de e psic?logos)